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第三章微生物的分类(1.0～1.5 学时)[内容提要]细菌的分类以种为根本单位，它的命名遵循“双名法“，用拉丁文。
什么是细菌的分类鉴定参照的标准，长期以来主要是依据其表型，目前则多考虑其种系发生关系，从基因水平进展分类，主要实行测定DNA 碱基〔G+C〕mol%值、核酸分子杂交及16S rRNA 寡核苷酸编目等方法，尤其以后者最为常用。
分类的方法除用传统的双歧检索条目法外，目前普遍承受数值分类方法。
《伯吉氏系统细菌学手册》及《伯吉氏细菌鉴定手册》建立了细菌分类的公认体系。
“国际系统细菌学杂志”反映分类的最争辩成果。
依据表型特征建立了一套动物致病菌检测程序，商品化的快速鉴定系统已应用于常规细菌学鉴定。
细菌作为自然界中的生物广泛存在，而且不断进化和进展，种类繁多，性质各异。
人类出于生疏自然的需要，对包括细菌在内的各种生物进展了分类和命名，并已形成了既定的体系和公认的准则。
将全部生物按其亲缘关系的亲疏和性状的相像程度，逐级归并划分为各种等阶的类群，建立起界(Kingdom)、门(Phylum)、纲(Class)、目(Order)、科(Family)、属(Genus)、种(Species)，以及有时在种下再分型(Type)的分类等阶。
在中间型过多而上述等阶不够用时，可曾设各级亚类，如亚门、亚纲、亚目、亚科、亚属、亚种和亚型等。
对整个生物的划分，有五界和六界划分两种观点，前者是将整个生物划分成动物界、植物界、真菌界、原核生物界和病毒界，而后者是将动物界中的原生动物另立一界，即原生生物界。
第一节细菌的分类地位细菌归属原核生物〔Procaryote〕界。
在原核生物中，细菌〔Bacteria，又称真细菌Eubacteria〕和古细菌〔Archaea〕是性质有别的两大类。
古细菌是一个独特的系统进化类别，其成员产甲烷、极端耐盐、高度嗜热，细胞壁组成与细菌不同。
这些极端微生物被认为是生物进化过程中的早期产物，因此称之为古细菌。
