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大豆中4个NIN转录因子的生物信息学及表达分析吴军;察艳艳;李霞;高亢【期刊名称】《华北农学报》【年(卷),期】2022(37)S01【摘要】为了明确大豆中4个参与豆科植物由根瘤菌侵染到根瘤形成和固氮的所有生物过程,并整合结瘤和结瘤自调控信号动态控制根瘤数目的核心转录因子(NIN)基因异同及其在植物生长过程中的作用,利用生物信息学的方法,对大豆4个GmNINs基因进行了系统进化、蛋白序列分析及基因序列和启动子分析,并利用Real-time PCR进行了组织表达模式验证。
结果表明,大豆中4个GmNINs蛋白均属于豆类植物中特异的NIN蛋白家族,定位在细胞核,序列相似,且均具有多个磷酸化位点,蛋白核心三级结构类似而在转角处有较大区别。
以上结果说明,大豆4个GmNINs蛋白可能在核心功能上是冗余的,而又在具体的表达模式上具有差异性。
对GmNINs基因ATG上游-3 kb启动子序列分析表明,GmNINs启动子序列中除NBS、CYC元件外,还含有如ABRE、DRE1等多种与逆境和激素响应相关的元件。
转录组分析及Real-time PCR结果显示,4个GmNINs基因均在根瘤中高表达,并受到高氮环境抑制;均可不同程度的响应高盐与干旱胁迫,其中GmNIN2a与GmNIN2b在响应非生物胁迫上较GmNIN1a与GmNIN1b更加敏感与显著,可能在植物响应非生物胁迫的过程中发挥着重要作用。
综上所述,结果揭示了GmNINs 除了调控大豆结瘤及根瘤数目外,还参与了大豆根系响应非生物胁迫的过程,这一调节机制的发现为选育优质高产大豆新品种提供关键线索。
【总页数】9页(P26-34)【作者】吴军;察艳艳;李霞;高亢【作者单位】华中农业大学植物科学技术学院【正文语种】中文【中图分类】S565.03;Q78【相关文献】1.苹果bZIP转录因子家族生物信息学分析及其在休眠芽中的表达2.苹果NLP(Nin-Like Protein)转录因子基因家族全基因组鉴定及表达模式分析3.大豆中3个Dof转录因子的生物信息学及表达分析4.大豆转录因子GmVOZ1的生物信息学及干旱胁迫表达分析5.基于生物信息学分析E74样转录因子3在卵巢浆液性囊腺癌中的表达及作用机制因版权原因，仅展示原文概要，查看原文内容请购买。
胸腺上皮细胞发育分化的信号通路研究进展①陈昌蓉宋银宏（三峡大学医学院病原与免疫学系，感染与炎症损伤研究所，宜昌443002）中图分类号R392.12文献标志码A文章编号1000-484X（2021）09-1144-05［摘要］胸腺微环境是决定T细胞增殖、分化和选择性发育的重要条件。
胸腺上皮细胞（TECs）是胸腺微环境最重要的组分。
已有研究报道调控TECs发育分化的相关信号通路，本文从细胞内分子NF-κB及其信号通路、细胞外信号分子Bmp、Wnt、Shh、FGF及其相应信号通路和其他类信号通路RA、Notch等3个方面阐述了不同的信号通路对TECs发育分化的作用。
明确以上信号通路对TECs作用，将有助于寻找合适靶点促进退化TECs的增殖，从而促进衰老胸腺的重建。
［关键词］胸腺上皮细胞；发育；分化；信号通路Research progress on signaling pathway involved in development and differenti-ation of thymic epithelial cellsCHEN Chang-Rong，SONG Yin-Hong.Department of Etiology and Immunology，Medical College of China Three Gorges University，Institute of Infection and Inflammation，Yichang443002，China［Abstract］Thymic microenvironment is an important condition that determines to the proliferation，differentiation and selec⁃tive development of T cells.Thymus epithelial cells（TECs）are the most important components of the thymic microenvironment.Nowa⁃days the signaling pathways that regulate the development and differentiation of TECs has been clarified clearly.Here，the effects of different signaling pathways involved in the development and differentiation of TECs are illustrated.The signaling pathways include in⁃tracellular molecule NF-κB and its signaling pathway，the extracellular signal molecules Bmp，Wnt，Shh，FGF and their correspond⁃ing signaling pathways and other signaling pathways RA and Notch.Confirming the effects of these signaling pathways on TECs will contribute to finding the appropriate targets to promote the proliferation of degraded TECs and thus facilitating the reconstruction of the aging thymus.［Key words］Thymic epithelial cells；Development；Differentiation；Signaling pathway胸腺属于上皮-间质组织，分为皮质和髓质区，内含基质细胞和胸腺细胞［1］。
胚胎发育中微型RNA与转录因子的调控机制在胚胎发育阶段中，微型RNA（microRNA）和转录因子（transcription factors）都具有非常重要的调控作用。
微型RNA是一种含有约20到25个核苷酸的小分子RNA，能够干扰靶RNA在翻译或降解过程中的表现。
在胚胎发育过程中，微型RNA能够调控特定的基因，从而控制胚胎的分化、增殖、凋亡等过程。
而转录因子则是一类能够结合到基因DNA序列上，启动或抑制基因转录的蛋白质，同样是胚胎发育中的关键因子。
本文将就这两种生物分子在胚胎发育中的作用机制展开探讨。
1. 胚胎发育的三个阶段及相应的微型RNA与转录因子胚胎发育大致可分为早期、中期和晚期三个阶段。
在胚胎发育的三个阶段中，不同的微型RNA和转录因子发挥着不同的作用。
在胚胎发育的早期阶段，微型RNA和转录因子对于胚胎的正常发育至关重要。
具体来说，早期阶段主要发挥的是维持干细胞状态的重要功能。
在这个阶段，微型RNA主要是负责胚胎细胞发育的初始和维持干细胞状态的稳定。
其中包括了一些常见的微型RNA，如miR-290和miR-294等。
与之相应的，转录因子包括了多种类型，如Oct4、Sox2、Nanog等。
这些因子在胚胎干细胞的分化、增殖、凋亡等方面起到了关键的作用。
在胚胎发育的中期阶段，胚胎的器官系统开始成形，器官的原始形态逐渐出现。
微型RNA和转录因子的作用更加明显，这里有几个典型的例子。
（1）miR-1在鼠胚胎形态发生中起到了重要的作用。
研究发现，miR-1在肌肉发育中扮演着关键的角色，负责调节肌肉细胞增殖、分化和成熟。
这些过程需要微型RNA与一些转录因子如MyoD和Myogenin等一起协作完成。
（2）miR-196 在胚胎中期阶段对神经纤维现象的出现起重要作用。
研究发现，miR-196通过调节某些转录因子的表达，然后最终影响神经纤维的生长及其靶蛋白的表达等。
另一方面，转录因子如Hoxa9和Hoxc8等能够与miR-196协同作用，从而控制胚胎中期的神经系统发育。
细胞周期调控中转录因子的功能与调控一、细胞周期调控概述细胞周期是细胞生长、分裂并最终形成两个遗传信息相同的子细胞的过程。
它包括间期和有丝分裂两个主要阶段。
细胞周期的精确调控对于维持细胞的正常功能和生物体的稳态至关重要。
转录因子在细胞周期的调控中扮演着核心角色，它们通过调控特定基因的表达来影响细胞周期的各个阶段。
1.1 细胞周期的基本阶段细胞周期的间期分为G1期、S期和G2期。
G1期是细胞生长的阶段，S期是DNA复制的阶段，而G2期是细胞准备进入有丝分裂的阶段。
有丝分裂是细胞分裂的过程，包括前期、中期、后期和末期。
1.2 转录因子在细胞周期中的作用转录因子是一类能够结合到DNA上的蛋白质，它们通过调控基因的转录来影响细胞周期的进程。
转录因子可以激活或抑制特定基因的表达，从而控制细胞周期相关蛋白的合成和降解。
二、转录因子在细胞周期调控中的功能转录因子通过多种机制参与细胞周期的调控。
它们可以作为细胞周期的正向或负向调控因子，影响细胞周期的启动、进行和终止。
2.1 转录因子作为正向调控因子正向调控因子促进细胞周期的进程。
例如，E2F家族转录因子在G1/S期转换中起着关键作用，它们通过激活S期所需的基因来推动细胞进入S期。
2.2 转录因子作为负向调控因子负向调控因子抑制细胞周期的进程。
例如，p53是一种肿瘤抑制因子，它可以在DNA损伤或细胞应激时阻止细胞周期的进行，从而防止损伤细胞的增殖。
2.3 转录因子在细胞周期中的相互作用转录因子之间存在复杂的相互作用网络。
例如，E2F转录因子的活性受到Rb蛋白的调控。
在G1期，Rb蛋白与E2F 结合，抑制其活性；而在S期，Rb蛋白发生磷酸化，释放E2F，从而激活S期相关基因的表达。
三、转录因子的调控机制转录因子的活性受到多种因素的调控，包括磷酸化、泛素化、乙酰化等。
这些调控机制影响转录因子的稳定性、亚细胞定位和DNA结合能力。
3.1 磷酸化调控磷酸化是一种常见的转录因子调控机制。
中国水产科学 2013年11月, 20(6): 1319−1327 Journal of Fishery Sciences of China综 述收稿日期: 2013−04−16; 修订日期: 2013−06−27.基金项目: 国家自然科学基金项目(31302202); 国家863计划项目(2012AA10A413); 辽宁省教育厅计划项目(L2013276); 现代农业产业技术体系建设专项资金资助项目(nycytx-50).作者简介: 毛明光(1982−), 男, 博士, 讲师. 从事鱼类免疫学研究. E-mail: mmg@ 通信作者: 雷霁霖, 中国工程院院士, 博士生导师. E-mail: leijilin@DOI: 10.3724/SP.J.1118.2013.01319重组激活基因(RAGs)功能机制及其在鱼类早期发育中的作用毛明光1, 雷霁霖1,2, 姜志强11. 农业部北方海水增养殖重点实验室 大连海洋大学, 辽宁 大连 116023;2. 中国水产科学研究院 黄海水产研究所, 山东 青岛 266071摘要: 在B 淋巴细胞和T 淋巴细胞的发育过程中, BCR 和TCR 基因座(Ig κ、Ig λ、Igh 、Tcr α、Tcr β、Tcr γ、Tcr δ)的可变区(V)、多样区(D)、链接区(J)发生V(D)J 重排, 该重排过程是在重组激活蛋白(RAG-1和RAG-2)的作用下完成的, V(D)J 重排机制使机体拥有庞大的抗体库, 以应对自然界中多元的病原微生物。
RAGs 结构分为核心区和非核心区, 核心区域发挥着重要的基因片段酶切功能, 而非核心区域的九聚体序列(nonamer)、锌指等结构具有调节V(D)J 重排的功能。
RAGs 的功能在转录水平、染色体水平以及蛋白水平受到严格的时间和空间调控, 以保证B/T 细胞的正常发育。
随着国内外学者对哺乳动物RAGs 基因的结构与功能机制的深入研究, RAGs 也在淡水鱼和海水鱼中有了越来越多的报道。
细胞核受体和基因表达调控的分子机制细胞是生命体系中最基本的单位，其中细胞核是细胞最为重要的器官之一。
细胞核内的DNA和蛋白质共同构成染色体，继承了遗传信息。
然而，真核细胞中只有少数的基因会被不断地表达，而大多数的基因则只有在特定的环境下才会被激活或抑制，这是由基因表达的调控所引起的。
细胞核受体是一类结构和功能相似的蛋白质，是基因表达调控的关键因素之一。
在此，我们将详细地介绍细胞核受体及其对基因表达调控的分子机制。
一、细胞核受体的种类和特征细胞核受体是一类具有结构和功能相似的蛋白质，可以与特定的信号分子结合并调控基因的表达。
目前已经发现的细胞核受体种类繁多，其中包括雌激素受体、雄激素受体、甲状腺激素受体、维生素D受体等。
细胞核受体的结构通常由三部分组成，分别是N端的转录激活区域（TA）、中央的DNA结合区域和C端的激活或抑制区域。
其中DNA结合区域由两个锐锉形的结构域组成，可以与DNA中的特定序列结合，调控基因转录。
TA区域是细胞核受体与一系列共转录因子（如MED1、CBP等）结合的主要区域，可以在DNA区域上激活或抑制转录的过程。
而激活或抑制区域可以进一步与细胞核受体的激活情况相关联，影响细胞核受体的功能。
二、细胞核受体的活性调节机制细胞核受体灵活的激活状态和N-末端区域的多样性决定了细胞核受体的活性调节机制非常复杂。
目前主要有四种状态，分别是基础状态、配体激活状态、共激活状态和共抑制状态。
1.基础状态：指细胞核受体处于未激活状态，没有与信号分子或DNA结合，TA区域与共转录因子的结合也很少。
基础状态的细胞核受体是一种缓慢平衡的结构状态。
2.配体激活状态：指细胞核受体结合到信号分子后处于激活状态。
此时信号分子作为招募因子可以促使其他共转录因子结合到TA区域，改变细胞核受体的构象，从而增强细胞核受体与DNA 的结合能力，提高基因的表达水平。
3.共激活状态：指多种转录激活因子协同作用，提高细胞核受体的转录活性，进一步促使基因的表达水平提高。
Kruppel样因子15——多功能转录因子的功能研究李丽;朱伟;魏盟【摘要】Kruppel样因子15(KLF15)是Kruppel样转录因子家族中的一员.Kruppel样转录因子家族特征性结构是含有3个Kruppel样锌指结构,与DNA 的CACCC元件和富含GC区连接,从而调控转录激活或抑制.KLF15在许多生物过程中起重要作用,包括细胞的增殖、分化、发展和凋亡.研究证实,KLF15参与调节三大物质代谢:糖代谢、脂肪酸代谢、氨基酸代谢.在循环系统方面,KLF15过表达能够抑制心肌肥厚,而KLF15的缺乏会引起心力衰竭、主动脉瘤的产生.此外,KLF15在肾病、肾纤维化、骨骼肌脂质利用、昼夜节律等诸多方面起重要作用.随着对KLF15功能的认识越来越深入,KLF15有望成为有效治疗致死性疾病的新靶点.【期刊名称】《医学综述》【年(卷),期】2014(020)016【总页数】3页(P2916-2918)【关键词】Kruppel样因子15;糖异生;心脏;肾病【作者】李丽;朱伟;魏盟【作者单位】上海交通大学附属第六人民医院心内科,上海200233;上海交通大学附属第六人民医院心内科,上海200233;上海交通大学附属第六人民医院心内科,上海200233【正文语种】中文【中图分类】R541.4;R587.1Kruppel样因子15(Kruppel-like factor-15，KLF15)由KLF15基因表达，具有3个高度保守的锌指结构[1]。
研究证实,3个锌指结构具有核定位信号，使KLF15转入细胞核并与DNA的CACCC元件和富含GC区连接定位，而锌指结构2和3是KLF15进行核定位的必备条件[2]。
KLF15在组织器官中广泛表达，尤以心脏、肾、肝、脂肪细胞、骨骼肌为甚，KLF15的表达受许多物质的调控：激活的糖皮质激素受体、糖皮质激素信号、禁食等上调 KLF15表达，喂食、肥胖、白细胞介素17等抑制其表达[3]。
转录因子在细胞周期调控中的作用机制转录因子在细胞周期调控中的作用机制是一个复杂而精细的生物学过程。
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一、转录因子概述转录因子是一类能够结合到DNA上的蛋白质，它们在基因表达调控中扮演着至关重要的角色。
它们通过识别特定的DNA序列，调节下游基因的转录活性，从而影响细胞的生理状态和功能。
在细胞周期的调控中，转录因子的作用尤为关键，因为它们直接参与了细胞周期各个阶段的基因表达调控。
1.1 转录因子的功能转录因子的功能主要体现在它们能够激活或抑制特定基因的转录。
它们可以通过多种方式影响基因的表达，包括增强子结合、抑制子结合、染色质重塑等。
1.2 转录因子的分类转录因子可以根据其结构域、DNA结合特异性以及调控机制等不同特点进行分类。
常见的转录因子包括锌指蛋白、螺旋-环-螺旋蛋白、碱性亮氨酸拉链蛋白等。
二、细胞周期与转录因子细胞周期是细胞生长、分裂和再生的周期性过程，包括G1期、S期、G2期和M期。
转录因子在这一过程中发挥着核心作用，它们通过调控特定基因的表达，确保细胞周期的顺利进行。
2.1 细胞周期的各个阶段- G1期：细胞生长和准备DNA复制的阶段。
- S期：DNA复制发生的阶段。
- G2期：细胞继续生长并准备进入M期的阶段。
- M期：细胞分裂的阶段。
2.2 转录因子在细胞周期中的作用- 在G1期，特定的转录因子如E2F家族成员，通过激活DNA复制所需的基因，促进细胞进入S期。
- 在S期，转录因子如MYC，参与调控DNA复制和细胞周期蛋白的表达。
- 在G2期，转录因子如CDC25，通过激活细胞周期蛋白依赖性激酶，推动细胞进入M期。
- 在M期，转录因子如FOXM1，参与调控细胞分裂过程中的基因表达。
三、转录因子在细胞周期调控中的具体作用机制转录因子通过多种机制参与细胞周期的调控，包括直接结合DNA、与共激活因子或共抑制因子相互作用、以及通过表观遗传修饰影响基因表达等。
温度形态建成中关键转录因子PIF4所受调控的研究进展作者：张敏苏立新王昕来源：《安徽农业科学》2021年第20期摘要温度形态建成是非逆境高温引起的植物的一系列形态变化，是植物适应高温环境的重要机制。
PIF4是温度形态建成的正向调控因子，在温度形态建成中发挥着非常重要的调控作用。
因此在长期的自然选择过程中，植物进化出了复杂的调控PIF4活性的分子机制。
将从转录、蛋白质稳定性、与靶序列的结合强度和调控转录的活性4个方面来阐述调控PIF4活性的分子机制，并讨论了今后可能的研究方向。
关键词温度形态建成;PIF4;转录水平调控;蛋白质水平调控中图分类号 Q 945 文献标识码 A 文章编号 0517-6611（2021）20-0022-03doi：10.3969/j.issn.0517-6611.2021.20.006开放科学（资源服务）标识码（OSID）：Research Progress in the Regulation of Key Transcription Factor PIF4 in Thermomorphogenesis ZHANG Min， SU Li-xin， WANG Xin（College of Life Science and Bioengineering， Shenyang University， Shenyang， Liaoning 110044）Abstract Thermomorphogenesis is a series of plant morphological changes induced by nonstressful high temperature， which is an important mechanism of plant for adaption to high temperature. PIF4 is positive regulation factor of thermomorphogenesis， and plays a very important role in thermomorphogenesis. So in the long-term process of natural selection， plants have evolved complex molecular mechanism for regulating PIF4 activity. To address the molecular mechanism of regulating PIF4 activity， we reviewed transcription， protein stability， the bonding strength to target sequences and transcription activity of PIF4， and discussed the future possible research directions.Key words Thermomorphogenesis;PIF4;Transcription-level regulation;Protein-level regulation 基金项目国家自然科学基金项目（31600220）。
热休克转录因子1对视网膜色素上皮细胞抗氧化和抗衰老的调控作用蒋明君;尚国辉;张凤妍;殷凡响;薛梦姣;胡延忠;彭旭艳【期刊名称】《中华实验眼科杂志》【年(卷),期】2024(42)5【摘要】目的探讨热休克转录因子1(HSF1)对人视网膜色素上皮细胞(ARPE-19)抗氧化和抗衰老的作用。
方法利用成簇规律间隔短回文重复序列及相关蛋白9(CRISPR/Cas9)基因编辑技术敲除人ARPE-19细胞系中HSF 1基因,构建并获得2种HSF1缺失ARPE细胞株(ARPE/Hsf1-/-),分别命名为H8、H9细胞株。
取野生型、H8和H9细胞株,应用DHE探针染色结合流式分析技术测定细胞内活性氧簇(ROS)含量,应用流式细胞分析方法测定细胞周期;采用细胞计数试剂盒-8(CCK-8)法测定不同培养时间点细胞活力值;采用结晶紫染色实验测定细胞相对存活率;采用β-半乳糖苷酶(SA-β-gal)染色实验检测衰老细胞比率;采用Western blot法检测各细胞株中热休克蛋白(HSP)70、HSP27、聚集素(CLU)、p53、p21和白细胞介素(IL)-1β蛋白表达水平;采用实时荧光定量PCR法测定各细胞株中p53、p21、IL-6、IL-8、IL-1β、单核细胞趋化蛋白1(MCP1)mRNA表达水平。
比较各细胞株在不同热休克处理条件下和HSP90抑制剂IPI504处理下热休克反应相关蛋白相对表达量,比较各细胞株不同浓度H_(2)O_(2)处理后相对存活率,比较各细胞株经或未经ROS清除剂N-乙酰半胱氨酸(NAC)处理后p21蛋白相对表达量。
结果基因测序显示H8和H9细胞株成功携带突变基因,Western blot检测结果显示H8、H9细胞株不表达HSF1蛋白,HSF1在ARPE-19细胞中被成功敲除。
与野生型细胞株相比,H8、H9细胞株中的HSP70、HSP27、CLU蛋白相对表达水平显著降低,差异均有统计学意义(均P<0.05);各细胞株HSP90蛋白相对表达水平总体比较,差异无统计学意义(F=0.29,P>0.05)。
胶原蛋白肽链转录因子
胶原蛋白肽链是一种重要的蛋白质分子，它在人体中起着至关重要的作用。
它由许多氨基酸组成，以一种特定的方式排列，形成了一个复杂的链状结构。
这个结构决定了胶原蛋白肽链的性质和功能。
转录因子是一类蛋白质，它们可以结合到DNA上的特定区域，促进或抑制基因的转录过程。
转录因子在基因调控中起着重要的作用，可以影响细胞的发育、分化和功能。
胶原蛋白肽链与转录因子之间存在着密切的关系。
研究发现，转录因子可以调控胶原蛋白基因的表达，从而影响胶原蛋白肽链的合成。
同时，胶原蛋白肽链也可以影响转录因子的功能，通过与转录因子相互作用，调控基因的转录过程。
胶原蛋白肽链和转录因子之间的相互作用对于人体的健康和发育至关重要。
例如，在胚胎发育过程中，转录因子可以调控胶原蛋白基因的表达，从而影响胚胎的发育和器官的形成。
在成年人身体维持和修复过程中，胶原蛋白肽链的合成和转录因子的调控也起着重要的作用。
胶原蛋白肽链和转录因子还与许多疾病的发生和发展密切相关。
例如，某些疾病的发生与转录因子的突变或异常表达有关，这会影响胶原蛋白肽链的合成和功能。
研究发现，胶原蛋白肽链的异常合成和积累也与一些疾病的发生有关，如纤维化、骨质疏松等。
胶原蛋白肽链和转录因子之间存在着密切的关系，它们相互作用，共同调控基因的转录过程，影响人体的发育和健康。
进一步研究胶原蛋白肽链和转录因子的相互作用机制，有助于深入理解基因调控的机制，为预防和治疗相关疾病提供新的思路和方法。
转录因子的结构与功能区分析作者：李贺宋冰郑士梅等来源：《安徽农学通报》2013年第19期摘要：简单介绍了转录因子的结构与功能区，包括DNA结合区、转录调控区、核定位信号区和寡聚化位点，并就转录因子的应用和发展趋势做了初步的阐述。
关键词：转录因子；结构；功能区；分析中图分类号 Q789 文献标识码 A 文章编号 1007-7731（2013）19-23-02植物在生长发育过程中，能够感受到外界非生物胁迫、激素及体内细胞发育等信号的刺激，然后通过一系列的信号传递，激发转录因子与顺式作用元件（cis-acting element）相结合，并激活RNA聚合酶I转录复合物，从而启动特定基因的转录表达，最后通过基因编码的产物对外界信号做出反应，进而调节植物的生长及对外界刺激的适应[1]。
转录因子是生物体内直接结合或间接作用于基因启动子区域、形成具有RNA聚合酶活性的转录复合体的蛋白质因子，通过其调控基因的表达来影响生物的表型及对外界刺激的保护，从而完成了生物在转录水平的调控。
按功能可分为通用转录因子、序列特异性转录因子、辅助转录因子等。
而与RNA聚合酶Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ相对应的有3类转录因子，分别是TFⅠ、TFⅡ、TFⅢ。
锌指蛋白就是属于其中的TFⅢ型转录因子，它是生物中发现种类最多、研究较为广泛、在真核生物中具有重要调控作用的一类转录因子。
1 转录因子的结构与功能区通过对蛋白质的结构进行分析表明，典型的植物转录因子一般由DNA结合区（DNA-binding domain）、寡聚化位点（oligomerization site）、转录的调控区（transcription regulation domain）、细胞核定位信号区（nulcear localization signal，NLS）组成，这些功能区域决定了各个转录因子的具体功能[2]。
1.1 DNA结合区（DNA-binding domain） DNA序列中有许多具有重要作用的顺式作用元件，能够识别并与之结合的氨基酸序列就是转录因子的DNA结合区。
转录因子激活的基本模式
不同的转录因子通过不同的方式发挥作用，其中主要有以下五种方式。
1直接激活或抑制
许多转录因子与结合位点结合，然后直接与核心启动子的启动复合物相互作用。
如图1
图1直接激活或抑制
2非直接激活或抑制Ι
一些转录因子无法结合到DNA，必须通过蛋白—蛋白与其他转录因子相互作用后被带到转录模板，被VP16转录活化就是这种转录调节形式的一种例子，如图2
图2非直接激活或抑制Ι
3非直接激活或抑制Ⅱ
一些转录因子通过调控其他的DNA结合蛋白活性来发挥作用，如酵母同源异形盒蛋白α2就是以这种形式，如图3。
图3 非直接激活或抑制Ⅱ
4和5，诱导激活或抑制Ι和Ⅱ
转录因子通过激素激活（如类固醇受体家族转录因子）或翻译蛋白后修饰如磷酸化（如CREB 家族转录因子）来调节其他转录因子的活性来发挥作用，如图4和图5。
图4 诱导激活或抑制Ι
图5诱导激活或抑制Ⅱ
图1-5中的图标意义。
