RIP实验

RNA互作分子分析技术系列（一）：RIP实验方法为方便广大同行交流，公众号近期将陆续推出有关RNA互作分子研究技术的系列文章，本期将介绍最常见的实验技术：RIP。

RIP （RNA Immunoprecipitation）是研究RNA-蛋白相互作用的重要实验，主要是通过抗蛋白的抗体进行免疫共沉淀，然后分析相互作用的RNA分子。

有关RIP的实验技术方法文章挺多的，研究论文就更多了，这也说明RIP实验的重要性。

下面我们主要参考一篇方法学的文章，详细分析RIP实验的原理和操作方法。

该文章是2016年9月23日发表于Methods in Molecular Biology杂志的一篇方法学文章，通讯作者为意大利”ABT”- CNR遗传与生物物理研究所的Maria R. Matarazzo教授[1]。

材料与试剂准备：（所有试剂均需用超纯水配制，试剂纯度级别不低于分析纯）PBS (pH7.4)；10×多聚体裂解液：1000 mM KCl, 50 mM MgCl2 , 100 mM HEPES-NaOH pH 7, 5% NP-40。

室温放置，使用前用超纯水稀释至1×并添加1 mM DTT， 200 units/ml RNase OUT，EDTA-free 蛋白酶抑制剂Cocktail。

5×NT-2 buffer：250 mM Tris-HCl(pH7.4), 750 mM NaCl，5 mM MgCl2，0.25% NP-40。

4 °C保存，NET-2 buffer：用超纯水将NT-2 buffer稀释至1×，并添加20 mM EDTA (pH 8.0), 1 mM DTT, 200 units/ml RNase OUT。

甲醛溶液：50 mM HEPES-KOH, 100 mM NaCl, 1 mM EDTA,0.5 mM EGTA, 11 % 甲醛。

细胞裂解液：10 mM Tris-HCl (pH 7.4)，10 mM NaCl, 0.5 % NP-40。

一、实验目的1．掌握利用路由器划分子网的方法，并对路由器的各个接口设置IP地址。

2．掌握路由信息协议（RIP）的配置方式。

二、实验设备1．路由器、计算机、直通线、交叉线2．实验所用的拓扑图如图8-1所示。

图8-1 RIP路由拓扑三、实验步骤1．按照图8-1所示进行设备的连接和配置。

同理配置其他三个主机的IP地址、掩码和网关2．RouterA的基本配置如下：Router>enRouter#config tRouter(config)#int f0/0Router(config-if)#ip address 192.168.1.1 255.255.255.0 Router(config-if)#no shutdownRouter(config-if)#exitRouter(config)#int f0/1Router(config-if)#ip address 192.168. 2.1 255.255.255.0 Router(config-if)#no shutdownRouter(config-if)#endRouter#3．RouterB的基本配置如下：Router>enableRouter#config tRouter(config)#int f0/0Router(config-if)#ip address 192.168.2.2. 255.255.255.0 Router(config-if)#no shutdownRouter(config-if)#exitRouter(config)#int f0/1Router(config-if)#ip address 192.168.3.1 255.255.255.0Router(config-if)#no shutdownRouter(config-if)#endRouter#4. 测试PC1是否能互相Ping通pc3；（截图并说明原因）不能PING通，因为他的Destination host 没有reachable。

rip的实验方法和描述英文版【原创实用版4篇】目录（篇1）I.引言A.介绍rip实验的目的和背景B.阐述rip实验的重要性和意义II.rip实验方法A.介绍rip实验的设计和原理B.描述rip实验的实验步骤和操作流程C.说明rip实验的实验条件和限制III.rip实验结果A.展示rip实验的数据和分析结果B.分析rip实验的结果和意义C.讨论rip实验的局限性和不足IV.结论A.总结rip实验的主要结论B.强调rip实验的实践价值和启示C.指出rip实验的未来发展和改进方向正文（篇1）近年来，随着人工智能技术的不断发展，许多研究者开始关注深度学习在自然语言处理领域的应用。

其中，Rip实验是一种基于深度学习的文本分类方法，旨在提高自然语言处理的准确性和效率。

rip实验方法Rip实验的设计和原理基于深度学习的卷积神经网络（CNN）。

具体来说，Rip实验通过构建一个多层的CNN模型，对输入的文本数据进行特征提取和分类。

在实验过程中，Rip实验采用了大量的语料库数据，并利用反向传播算法进行训练和优化。

实验步骤和流程包括以下几个主要环节：1.数据准备：收集和清洗大量的语料库数据，并将其划分为训练集、验证集和测试集。

2.网络搭建：构建一个多层的CNN模型，并利用TensorFlow等深度学习框架进行训练和优化。

3.模型评估：利用测试集对模型进行评估，并计算模型的准确率、召回率和F1得分等指标。

4.结果分析：根据评估结果，分析模型的性能和局限性，并探讨改进方案。

目录（篇2）1.引言2.rip的实验方法3.rip的描述4.rip的应用5.结论正文（篇2）一、引言rip是一种新型的互联网协议，旨在提高网络传输的效率和安全性。

rip协议是RIP协议的升级版，具有更快的收敛速度和更低的协议开销。

本文将介绍rip的实验方法和描述，并探讨其在网络传输中的应用。

二、rip的实验方法rip协议的实验方法包括网络模拟和实际测试两种。

西安电子科技大学计算机网络实验课程实验报告实验名称 RIP协议原理及配置通信工程学院班Array姓名学号同作者实验日期 2020 年 4 月 5 日一、实验目的1.1掌握动态路由协议的作用及分类1.2掌握距离矢量路由协议的简单工作原理1.3掌握RIP协议的基本特征1.4熟悉RIP的基本工作过程二、实验所用仪器（或实验环境）实验所使用软件为 Cisco Packet Tracer。

三、实验基本原理及步骤（或方案设计及理论计算）3.1动态路由协议概述路由协议是运行在路由器上的软件进程，与其他路由器上相同路由协议之间交换路由信息，学习非直连网络的路由信息，加入路由表。

并且在网络拓扑结构变化时自动调整，维护正确的路由信息。

图一动态路由协议前面提到，路由器之间的路由信息交换是基于路由协议实现的。

交换路由信息的最终目的在于形成路由转发表，进而通过此表找到一条数据交换的“最佳”路径。

每一种路由算法都有其衡量“最佳”的一套原则。

大多数算法使用一个量化的参数来衡量路径的优劣，一般说来，参数值越小，路径越好。

该参数可以通过路径的某一特性进行计算，也可以在综合多个特性的基础上进行计算，几个比较常用的特征是：n 路径所包含的路由器结点数（hop count）n 网络传输费用（cost）n 带宽（bandwidth）n 延迟（delay）n 负载（load）n 可靠性（reliability）n 最大传输单元MTU（maximum transmission unit）依据路由器间交换路由信息的内容及路由算法，将路由协议分为：距离-矢量路由协议和链路状态路由协议。

距离-矢量路由协议 ( 如RIP )定期广播整个路由信息易形成路由环路收敛慢链路状态路由协议（如OSPF）收集网络拓扑信息，运行协议算法计算最佳路由根本解决路由环路问题收敛快图二距离-矢量路由协议图二链路状态路由协议3.2RIP协议概述RIP（Routing Information Protocol）路由信息协议最早的动态路由协议，基于距离矢量算法实现使用UDP报文来交换路由信息以跳数多少选择最优路由RIPv1协议报文不携带掩码信息3.3路由回路及解决办法定义最大跳数水平分割（Split Horizon）毒性逆转（Poisoned Reverse）触发更新(Triggered Update)Hold－Down 定时器3.4RIP的配置关于RIP的配置步骤如下：开启RIP路由功能（路由进程）：Router(config)#router rip宣告相关网段：Router(config-router)# network network wildmask 请注意：掩码是用反码的形式。

RIP-1
1.R1上通过R2学习的路由条目4.4.4.4/32，修改metric为10（观察R1的路由表加载情况）
2.R1上通过R3学习的路由条目4.4.4.4/32，修改AD为121（观察R1的路由表加载情况）
3.R1上过滤通过R2学习的路由条目
4.4.4.4/32（观察R1的路由表加载情况）
4.R4上向R3发送路由更新时执行汇总：4.4.0.0/16（观察R3 R1 R2的路由表加载情况）RIP-2
全网运行ripv2
每台路由器配置一个32位的环回口
1.为节约链路带宽，R2 R3两台路由器的以太口都要求发送单播更新到R1
R3和R4之间仍为rip组播更新
2.R3、R4之间为广域网链路，需要启用ripv2 MD5认证（key=cisco）
3.要求R3收到R4的环回口路由为16位
4.要求R3学习到R4的环回口路由的metric为10
5.R4上需要同时兼容ripv1的路由收发
6.每台路由器都能学习到其他三台路由器的环回口路由，实现全网全通。

实验四配置RIP一、实验目标加深RIP协议原理的理解了解RIP实现运行的机制掌握RIP路由配置熟悉RIP路由维护二、实验描述及组网图通过配置Rip实现各个网段互通，在路由器上与主机相连的接口应用silent-interface 命令。

图 1-1二、实验过程实验任务一：配置RIPv1本实验主要通过在路由器上配置RIPv1协议，达到PC之间能够互访的目的。

通过本次实验，学院应该能够掌握RIP协议的基本配置。

步骤一:建立物理连接按照图1-1进行连接。

确保路由器配置为出示状态，如配置不符合要求，请学员在用户模式下查出设备中的配置文件，然后重启路由器以使系统采用缺省的配置参数进行初始化。

<RouterA>reset saved-configuration<RouterA>reboot步骤二：在PC和路由器上配置IP地址表1-1 IP地址列表按表1-1所示在路由器接口上配置IP地址。

测试PC到网关的可达性,以RouterA为例C:\Documents and Settings\Administrator>ping 192.168.0.1Pinging 192.168.0.1 with 32 bytes of data:Reply from 192.168.0.1: bytes=32 time<1ms TTL=255Reply from 192.168.0.1: bytes=32 time<1ms TTL=255Reply from 192.168.0.1: bytes=32 time<1ms TTL=255Reply from 192.168.0.1: bytes=32 time<1ms TTL=255Ping statistics for 192.168.0.1:Packets: Sent = 4, Received = 4, Lost = 0 (0% loss),Approximate round trip times in milli-seconds:Minimum = 0ms, Maximum = 0ms, Average = 0ms再测试PC之间的可达性。

rna 免疫沉淀实验方案英文回答：RNA immunoprecipitation (RIP) is a widely used experimental technique to study RNA-protein interactions. It allows researchers to identify and characterize the RNA molecules that interact with specific proteins in cells. In this response, I will outline a general protocol for performing RIP experiments.1. Sample preparation:Collect cells or tissues and lyse them in a suitable lysis buffer.Sonicate the lysate to break open the cells and release the RNA-protein complexes.Centrifuge the lysate to remove cell debris and collect the supernatant.2. Antibody selection:Choose an antibody that specifically recognizes the protein of interest.Pre-clear the lysate by incubating it with proteinA/G beads to remove non-specific binding proteins.Add the antibody to the pre-cleared lysate and incubate overnight at 4°C with gentle rotation.3. Immunoprecipitation:Add protein A/G beads to the lysate-antibody mixture and incubate for a few hours at 4°C with gentle rotation.Centrifuge the mixture to collect the beads bound to the RNA-protein complexes.Wash the beads several times to remove non-specifically bound molecules.4. RNA isolation and analysis:Elute the RNA from the beads using an appropriate elution buffer.Purify the eluted RNA using phenol-chloroform extraction or a commercial RNA isolation kit.Perform downstream analysis, such as RT-PCR, microarray, or RNA sequencing, to identify the RNA molecules that were immunoprecipitated.RIP experiments can provide valuable insights into the RNA molecules that interact with specific proteins and their functional roles. For example, researchers have used RIP to identify the mRNA targets of RNA-binding proteins involved in post-transcriptional regulation. This information can help unravel the complex networks of RNA-protein interactions that govern cellular processes.中文回答：RNA免疫沉淀（RIP）是一种广泛应用的实验技术，用于研究RNA和蛋白质之间的相互作用。

实验五 RIP路由协议配置【实验目的】1．掌握RIP协议的工作原理。

2. 掌握RIP协议的配置方法。

【实验原理】1．路由信息协议RIP路由信息协议（Routing Information Protocol，RIP）是内部网关协议中最先得到广泛应用的协议。

RIP是一种基于距离向量的路由协议，其最大优点就是简单，开销小。

（1）距离RIP协议要求网络中每一个路由器都维护从它自己到每一个目的网络的距离记录，这个距离作为衡量路由优劣的度量值。

RIP中的“距离”也称为“跳数”，路由器到直连网络的距离定义为“0”，到非直连网络的距离定义为所经过的路由器的个数。

RIP规定，当距离等于16时，表示该目的网络不可达，所以RIP仅适用于小型网络。

（2）工作原理每个运行RIP协议的路由器都周期性地向其直接相连的邻居路由器发送自己完全的路由表的信息（路由信息是封装在RIP报文中发送的，主要包括目的网络，下一跳路由器，距离等信息），同时也从邻居路由器接收路由更新信息，并按照距离向量算法更新自己的路由表。

路由器刚开始工作时，仅知道自己的直连网络及其距离，接着路由器向邻居路由器交换并更新路由信息，经过若干次的更新后，所有的路由器最终都会知道到达本自治系统中任何一个网络的最短距离和下一跳路由器。

（3）距离向量算法邻居发来的路由更新报文中包括了很重要的信息：目的网络，其距离（即最短距离），下一跳地址。

RIP路由器必须根据更新报文和自己当前路由表的内容找出到每一个目的网络的最短距离和正确的下一跳。

这种更新算法称为距离向量算法。

对每一个相邻路由器发来的更新报文，进行以下步骤处理：○1对地址为X的相邻路由器发来的更新报文，先修改报文中的项目：“下一跳”均修改为X，“距离”均加1。

○2对修改后的报文的每一项（这里为了叙述清楚，用项目A来表示）进行以下处理：若本路由器路由表中没有项目A的目的网络，则把项目A添加到路由表中。

若本路由器中某个路由的目的网络和下一跳地址均与项目A相同，则用项目A的距离更新本路由。