第七章文摘型检索系统 PubMed

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2. PubMed的主题词检索是其最具特色的 功能之一，能保证较好的查准率及查准 率。主题词组配副主题词使检索结果更 为专指，限定在主要主题词检索能使结 果更准确。
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3.但是主题词检索也有一些固有的缺陷， 比如很多专指的概念没有相应的主题词， 一些新出现的概念要几年后才收录为主 题词这种情况下，不宜采用主题词检索， 采用字段限定检索等方法也能得到较好 的查准率。此外，主题词检索还可能会 漏掉一些最新的文献（in process citations），这也是需要注意的。
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Clinical Queries临床咨询
研究范畴:一般疾病的病因学、预后、
诊断、预防以及治疗 Finding Systematic Reviews：提供系统 评价、meta分析、临床试验综述临床指 南等循证医学文献信息的查找
Medical Genetics Searches
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4）应用MeSH主题词的Major Topic（主 要主题词）检索：
可以使检索结果更加准确。
点选Restrictions Search to Major Topic headings only，
限定检索结果为主要主题词。
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建立检索式
如果有多个主题词， 可以先分别对每个主题词进行检索， 再在高级检索的Search History中用检索 序号进行布尔逻辑运算； 也可以通过主题词检索页面的PubMed search 直接建立检索式
形变异词。 ▪ 截词功能只限于单词，对词组无效
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布尔检索
布尔运算符AND，OR，NOT必须大 写 从左至右进行布尔运算 以通过加圆括符改变运算顺序

hepatitis/dt 或 hepatitis/drug therapy
• 布尔逻辑表达式 vitamin c AND hepatitis/dt • 字段限制 hepatitis[titile] 或 zhang[au]
4、基本检索
作者检索：
格式：姓全称在前，名缩写在后。 例：检索Jim Smith发表的文章 检索词： Smith J 精确检索：在检索词加“Smith J”，避免 扩展检索（ Smith Ja）
MeSH 转换表 期刊转换表 短语转换表 作者索引表 将短语断开分别 查找 以单个词形式在所有字段查 找，然后做 AND 组配 主题词、文本词 （题名、文摘）
系统将关闭自动 术语转换功能
2-3 PubMed链接功能
• 链接相关文献 • 链接NCBI的其他数据库资源
• 链接外部资源
• 链接相关图书
meshmeshmesh转换表转换表主题词文本词主题词文本词题名文摘题名文摘期刊转换表期刊转换表短语转换表短语转换表作者索引表作者索引表将短语断开分别将短语断开分别查找查找以单个词形式在所有字段查以单个词形式在所有字段查找然后做找然后做andand组配组配系统将关闭自动系统将关闭自动术语转换功能术语转换功能2233pubmedpubmed????????ncbincbi22??支持布尔逻辑组配检索支持布尔逻辑组配检索pubmedpubmed22and
Summary显示字段： 题目、著者、文献出处
保存、输出
1. 点击所选文献左侧的复选框
2. 选择显示格式，点开 Send to 下拉选
项，选择输出方式
3. 按显示格式进行结果输出 文提供
记录标识注释
提供免费全文
7、其他检索功能：
Journal Database ：期刊浏览检索

显示格式
Summary(简要格式) Abstract（文摘格式） MEDLINE
保存格式
1.File(文件) 2.Format（格式）
检索策略的存储和调用
使用My NCBI(Cubby) 首先要登记注册 保存检索策略 定期浏览新的检索结果
注册或登录个人帐号
注册后的功能
保存、修改、 删除检索式
3.双引号：“ ”，表示对引号中的短语进行检索。 4.检索字段标识符：[tag]，tag为字段名称。 [ti]，[au]，[ta]，[so]，[la]，[pt]。
常用字段组成
标识符 字段名称
TI
Title
AU Author
AD Affiliation
AB Abstract
DP Publication Date
PubMed检索机制
1．自动截词转换匹配功能(Automatic Term Mapping) 对于输入的检索词，PubMed先按一定的词表顺序进行对照 匹 配 和 转 换 ， 再 进 行 检 索 。 词 表 匹 配 转 换 顺 序 是 ： MeSH 表 (MeSH table) 、 期 刊 刊 名 表 (Journal table) 、 作 者 索 引 (Author Index)、调查者表(Investigator table) 、所有字段（All Fields）。 如果在以上5个表中都找不到相匹配的词，PubMed将把短语分 开，以单词为单位，分别重复以上的过程，检索时各个词之间 是AND逻辑关系。 2．短语检索(Phrase Searching) 也可称为强迫词组检索，即，如果要将短语作为一个词组 进行检索，可用双引号“ ”将其引起来。如：“drug therapy” 作为词组进行检索的词，系统不进行自动转换匹配，也不进行 MeSH词的扩检。

发展历程
NLM早在1879年即开始编译医学文献的检索刊物 《医学索引》(Index Medicus ,IM)
从1964年起，采用计算机进行电子编辑和排版，在此 基础上开发了“医学文献分析与检索系统”(Medical Literature Analysis & Retrieval System)，即著名 的MEDLARS系统
MeSH转换表 Vitamin h→ "biotin"[MeSH Terms] OR "biotin"[All Fields] OR "vitamin h"[All Fields]
期刊转换表 new england journal of medicine → "N Engl J Med"[Journal] OR "new england journal of medicine"[All Fields]
临床查询（Clinical Queries）
Clinical Study Categories（临床研究类文献） Systematic Reviews（系统评价） Medical Genetics（医学遗传学）
MeSH: Clinical Queries
结果限定选项
直接以systematic review、Cochrane、meta-analysis、 Randomized Controlled Trial等为关键词进行检索
PubMed每条记录均有惟一的识别号 PMID(PubMed Unique Identifier) 。
❖ MEDLINE: PubMed主体部分，记录均标有 [PubMed-indexed for MEDLINE]