32例智力低下发育迟缓患儿基因组拷贝数变异的分析
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cnas检测报告一、概述中医中的脉诊技术是判断疾病的重要工具之一,而现代医学则更注重通过生化检测来诊断疾病。
然而,脉象与生化指标之间存在着密切的联系,通过结合两种方法的检测结果,可以更准确地判断疾病的发生和发展趋势。
本文所涉及的检测方法为CNA(Copy Number Analysis),是一种基于高通量测序的检测方法,能够精准地检测出基因组中的拷贝数变异(Copy Number Variation,CNV),为临床诊断提供宝贵的参考。
二、CNA检测原理CNA检测利用高通量测序技术,获取样本DNA的测序数据,并通过比对参考基因组,确定每个基因的拷贝数变异情况。
通常,我们将样本基因组分段,分析每个基因组段内的拷贝数变异情况,从而确定基因组中存在的异常拷贝数变异。
三、CNA检测的应用1、儿童智力发育缓慢的检查智力发育是儿童成长过程中的一个重要方面,然而有些儿童在成长过程中智力发育较慢,严重的甚至会导致智力低下。
此时,家长需要对孩子进行全面的检查,包括CNA检测。
研究表明,孩子智力发育缓慢的原因之一是基因组中存在的拷贝数变异,通过CNA检测,可以发现这些变异,并进一步深入了解哪些基因拷贝数异常,从而为精确诊断提供支持。
2、临床肿瘤检测CNA检测在肿瘤的诊断、治疗和预后判断方面具有重要作用。
例如,恶性肿瘤细胞常常存在染色体的非整倍性,即某些区域的拷贝数异常。
通过CNA检测,可以确定染色体哪些区域存在异常拷贝数变异,为肿瘤的诊断和治疗提供重要参考。
3、遗传病检测CNA检测可以帮助医生诊断一些遗传性疾病。
许多遗传性疾病是由于某些基因的异常拷贝数变异导致的,例如唐氏综合症、苯丙酮尿症等。
因此,CNA检测可以确定哪些基因存在异常拷贝数变异,从而帮助医生诊断疾病,制定合理的治疗方案。
4、药物反应检测药物在人体内的代谢受到基因的影响。
不同人的基因组存在差异,会影响药物代谢过程中所涉及的酶活性、药物转运系统以及药物的靶标等,从而导致不同的药物反应。
新生儿2q37缺失伴4q部分三体全基因组拷贝数变异(CNVs)分析胡萍;杨琳;詹国栋;马端;黄国英;周文浩【期刊名称】《复旦学报(医学版)》【年(卷),期】2014(041)002【摘要】目的应用SNP芯片检测方法,对染色体结果为46,XX,add(2)(q37)的1例新生儿多发畸形患儿进行全基因组拷贝数变异(copy number variants,CNVs)的检测,分析其中罕见CNVs与表型的相关性.方法对于1例新生儿多发畸形病例,采用Affymetrix SNP芯片筛查全基因组CNVs,经过筛选得到罕见潜在致病性CNVs.将这些CNVs片段结合患儿的表型进行文献比对.结果本例患儿的主要表型包括:小耳畸形、外耳廓卷曲、小下颌、颈蹼、双手通贯掌、双足内翻、室间隔缺损、动脉导管未闭、卵圆孔未闭、肺动脉高压、二尖瓣狭窄、脊柱后凸畸形.本例患儿共得到潜在致病性CNVs片段4个,大小为4 282.936 kb~17 912.863 kb,集中在2号、4号染色体长臂,邻近合并后得到2个,分别为2q37.1~q37.3缺失和4q32.3~q35.2重复.文献回顾,发现本例患儿耳部、心脏、骨骼畸形等表型与2q37缺失综合征有关;而更多相应表型如耳部、下颌、颈部畸形和通贯掌、足内翻、心脏畸形、脊柱畸形则与4q部分三体综合征有交叉.结论本研究首次报道了1例罕见的2q37缺失综合征合并4q部分三体综合征的复杂染色体变异.【总页数】8页(P183-190)【作者】胡萍;杨琳;詹国栋;马端;黄国英;周文浩【作者单位】复旦大学附属儿科医院新生儿科-卫生部新生儿疾病重点实验室-上海市出生缺陷防治重点实验室上海201102;复旦大学附属儿科医院新生儿科-卫生部新生儿疾病重点实验室-上海市出生缺陷防治重点实验室上海201102;复旦大学附属儿科医院新生儿科-卫生部新生儿疾病重点实验室-上海市出生缺陷防治重点实验室上海201102;复旦大学基础医学院-分子医学教育部重点实验室上海200032;复旦大学附属儿科医院新生儿科-卫生部新生儿疾病重点实验室-上海市出生缺陷防治重点实验室上海201102;复旦大学附属儿科医院新生儿科-卫生部新生儿疾病重点实验室-上海市出生缺陷防治重点实验室上海201102【正文语种】中文【中图分类】R722.11;Q343.2+44【相关文献】1.5p部分单体3例全基因组拷贝数变异分析 [J], 杨琳;倪锦文;詹国栋;王慧君;陈超;黄国英;周文浩2.微阵列比较基因组杂交用于智力低下和发育迟缓伴2q37微缺失患儿的分子诊断[J], 刘安;胡平;马定远;周静;孟露露;孙云;惠伟戎;蒋涛;许争峰V-seq技术检测90例发育迟缓患儿基因组拷贝数变异的遗传学分析 [J], 冯宇;游石琼;卢洪涌;孙夏瑜;武坚锐;张玉萍;王振芳;薛慧琴4.2q37缺失合并4q部分三体综合征一例及临床基因芯片分析 [J], 谌燕;冯宗辉;张弦;易凤梅;李敏5.家族性多发畸形伴46,XX,t(4;13)及子代4q部分三体的探讨 [J], 李露霞;曹云;曹新;王晓闻因版权原因,仅展示原文概要,查看原文内容请购买。
微阵列比较基因组杂交用于智力低下和发育迟缓伴2q37微缺失患儿的分子诊断刘安;胡平;马定远;周静;孟露露;孙云;惠伟戎;蒋涛;许争峰【期刊名称】《临床检验杂志》【年(卷),期】2012(30)4【摘要】目的寻找1例生长发育迟缓( development delay,DD)、智力低下(mental retardation,MR)患儿潜在的致病性基因组不平衡( genomic imbalance),分析其与表型的相关性;探讨高密度微阵列比较基因组杂交技术(array-based comparative genomic hybridization,array-CGH)在临床分子遗传学诊断中的应用价值.方法用array-CGH技术对患儿进行全基因组高分辨率扫描分析,并用多重连接探针扩增技术(multiplex ligation-dependent probe amplification,MLPA)对新发现的基因组不平衡进行验证.结果该患儿外周血细胞G显带核型未见异常,array-CGH结果发现患儿2号染色体末端存在1个亚显微结构微缺失del(2q37.1-37.3,-9.3 Mb).MLPA结果也验证了患儿该缺失区域的存在,患儿的基因组不平衡为新发的,但患儿父母该区域未见异常.文献查询与表型基因型分析证实了该缺失具有病理性意义.结论新发现的Del(2q37.1-37.3,-9.3Mb)是该患儿真正的致病原因;array-CGH技术在MR/DD患儿的分子遗传学诊断中具有重要价值.【总页数】4页(P259-262)【作者】刘安;胡平;马定远;周静;孟露露;孙云;惠伟戎;蒋涛;许争峰【作者单位】南京医科大学附属南京妇幼保健院产前诊断中心,南京210004;南京医科大学附属南京妇幼保健院产前诊断中心,南京210004;南京医科大学附属南京妇幼保健院产前诊断中心,南京210004;南京医科大学附属南京妇幼保健院产前诊断中心,南京210004;南京医科大学附属南京妇幼保健院产前诊断中心,南京210004;南京医科大学附属南京妇幼保健院产前诊断中心,南京210004;南京医科大学附属南京妇幼保健院产前诊断中心,南京210004;南京医科大学附属南京妇幼保健院产前诊断中心,南京210004;南京医科大学附属南京妇幼保健院产前诊断中心,南京210004【正文语种】中文【中图分类】Q596;Q987【相关文献】1.微阵列比较基因组杂交技术在检测智力发育迟缓和先天性多发畸形患儿中的研究进展 [J], 傅文婷;卢建;尹爱华;郑来萍;张忆聪;许玲;王游声;钟银环;刘畅2.微阵列比较基因组杂交技术检测不明原因智力低下/发育迟缓患儿的基因组拷贝数变异 [J], 陈晓丽;郭金;王珺;王立文;丁秀原;张霆;吴柏林3.新生儿2q37缺失伴4q部分三体全基因组拷贝数变异(CNVs)分析 [J], 胡萍;杨琳;詹国栋;马端;黄国英;周文浩4.罕见的4q13.1-13.3微缺失导致患者智力低下及生长发育迟缓表型 [J], 马娜;胡浩;贾政军;席惠;王华5.应用单核苷酸多态性微阵列技术对不明原因智力低下/发育迟缓患儿的遗传学分析 [J], 熊卿圆;岑锦明;曾赤佳因版权原因,仅展示原文概要,查看原文内容请购买。
62例发育异常儿童染色体芯片检测结果分析作者:程双喜陈蕾娄季武来源:《中国当代医药》2019年第10期[摘要]目的了解染色体芯片在儿童发育异常中的应用情况。
方法对我院2015年3月~2018年10月 62例存在不明原因的智力障碍、特殊面容的发育异常、身高低于均值3个标准差以上的特发性矮小或小于胎龄儿且出生后生长迟缓持续加重,或合并多个(2个或以上)系统的发育异常儿童应用染色体芯片进行检测以明确病因。
结果 62例发育异常儿童中染色体芯片检测发现异常结果有45例(占72.58%),发现拷贝数变异39例(占62.90%),另外发现明确致病的单亲二倍体2例(占3.22%)。
其中明确致病性突变的29例(46.77%),发现意义不明的拷贝数变异10例(占16.13%)。
结论染色体芯片检测有利于儿童发育异常相关罕见病的诊治。
[关键词]发育异常儿童;染色体芯片;智力障碍;特殊面容;特发性矮小[中图分类号] R446.9 [文献标识码] A [文章编号] 1674-4721(2019)4(a)-0004-04[Abstract] Objective To understand the application of chromosome microarray in children with dysplasia. Methods From March 2015 to October 2018, 62 idiopathic short stature or small for gestational age infants with growth retardation continuing after birth with unexplained mental retardation, abnormal development of special face, and height with 3 standard deviations lower,or children with dysplasia who have multiple (two or more) systems were tested using chromosome microarrays to find out the possible reasons. Results Among 62 children with dysplasia, 45 cases (72.58%) were found to be abnormal in chromosome microarrays, 39 cases (62.90%) to variation of copy number, and 2 cases (3.22%) were identified as pathogenic diploids. Among them, 29 cases (46.77%) with pathogenic mutations were identified, and 10 cases (16.13%) with unknown variation of copy number were detected. Conclusion Chromosome microarray detection is beneficial for the diagnosis and treatment of rare diseases related to children with dysplasia.[Key words] Children with dysplasia; Chromosome microarray; Mental retardation; Special face; Idiopathic short stature儿童生长发育异是儿科临床中常见的就诊原因,包括智力发育异常、体格发育异常或者同时存在的多种发育异常,但临床常规检查常难以明确病因。
doi:10.3969/j.issn.1000-3606.2019.09.014通信作者:姚如恩 电子信箱:yaoruen@CASK 基因变异1例临床特征分析张 仪 姚如恩 胥雨菲 韩 聪 王 剑上海交通大学医学院附属上海儿童医学中心分子诊断实验室(上海 200127)摘要: 目的 分析CASK 基因变异的临床特征。
方法 回顾1例因CASK 基因变异导致智力障碍、小头畸形伴脑桥小脑发育不良患儿的临床资料以及基因检测结果。
结果 男性患儿,3个月27天。
临床主要表现为小头畸形、先天性喉软骨发育不良以及气管软化、生长发育迟缓、喂养困难、四肢肌张力高、反复无热抽搐。
染色体微阵列检测未检测到有临床意义的基因拷贝数缺失、重复和大片段纯合子现象。
高通量测序结合Sanger 测序验证结果显示患儿携带CASK 基因半合子移码变异c.1818_1821dupAACT ,p.T608Nfs*16,该变异为可能致病性变异。
结论 发现1例CASK 变异导致智力障碍、小头畸形伴脑桥小脑发育不良的病例。
关键词: CASK 基因; 生长发育迟缓; 智力障碍; 小头畸形; 脑桥小脑发育不良Clinical characteristics of CASK gene mutation in a child ZHANG Yi, YAO Ruen, XU Yufei, HAN Cong, WANG Jian (Molecular Diagnostic Laboratory, Shanghai Children’s Medical Center, Affiliated Hospital of Shanghai Jiao Tong University School of Medicine, Shanghai 200127, China)Abstract: Objective To explore the clinical characteristics of CASK gene mutation. Methods The clinical data and gene test results of a child with mental retardation, microcephaly and pontocerebellar dysplasia caused by CASK gene mutation were reviewed. Results The male patient was 3 months and 27 days old. The main clinical manifestations were microcephaly, congenital laryngeal cartilage dysplasia and tracheomalacia, growth retardation, feeding difficulties, high limb muscle tension and repeated convulsions without fever. Chromosome microarray analysis did not detect clinically significant gene copy number deletion, duplication and large fragment homozygote phenomena. High-throughput sequencing and Sanger sequencing showed that the children carried a hemizygous frameshift mutation in CASK gene, c.1818_1821dupAACT, p.t608nfs *16, which was a possible pathogenic variation. Conclusion A case of mental retardation, microcephaly and pontocerebellar dysplasia caused by CASK mutation was found.Key words: CASK gene; growth retardation; mental retardation; microcephaly ; pontocerebellar dysplasia智力障碍伴小头畸形、脑桥小脑发育不良(mental retardation and microcephaly with pontine and cerebellar hypoplasia ,MICPCH ,OMIM :300749)是一种罕见X 连锁显性遗传病,CASK (calcium/calmodulin-dependent serine protein kinase )基因是其致病基因,该基因位于Xp 11.4,编码一种支架蛋白[1,2]。
·论著·《中国产前诊断杂志(电子版)》 2023年第15卷第1期犆犜犆犉基因突变致胎儿不良妊娠结局的遗传学分析谢潇潇1 蒋晓莹2 胡凌云1 周红辉3 汪龙霞4 游艳琴1 卢彦平1 (1.解放军总医院第一医学中心妇产科,北京 100853;2.解放军医学院,北京 100853;3.解放军总医院第一医学中心创新医学部,北京 100853;4.解放军总医院第一医学中心超声科,北京 100853)【摘要】 目的 探讨犆犜犆犉基因致病突变的产前遗传学分析及咨询。
方法 运用染色体核型分析、荧光原位杂交技术(FISH)、染色体微阵列分析(CMA)及全外显子组测序技术(WES)对一例产前超声发现双侧肾脏回声增强结构模糊的胎儿进行产前遗传学检测。
结果 核型分析、荧光原位杂交技术、染色体微阵列分析未见异常,家系全外显子测序检测到胎儿犆犜犆犉基因存在新发变异c.944_951dup,为移码突变,导致318位甘氨酸密码子(GGT)被替换为组氨酸密码子(CAC),并在第18个密码子后终止(p.Gly318Hisfs 18),产生截短蛋白质。
犆犜犆犉基因突变可致罕见常染色体显性智力障碍21型,胎儿期尚未见报道。
结论 本例为首次在胎儿期检出犆犜犆犉基因致病突变,推测双肾回声增强结构模糊为该基因突变相关的一种新的胎儿期表型。
全外显子组测序技术在产前检测出罕见致病突变的病例需重视检测前后的咨询。
【关键词】 犆犜犆犉基因;双肾回声增强;全外显子组测序;胎儿【中图分类号】 R715.5 【文献标识码】 A犇犗犐:10.13470/j.cnki.cjpd.2023.01.004 通信作者:卢彦平,Email:luyp301@163.com基金项目:1、国家重点研发计划(2021YFC1005300);2、军队育龄家庭出生缺陷的遗传病学研究(19JSZ16)犌犲狀犲狋犻犮犪狀犪犾狔狊犻狊狅犳犪犮犪狊犲狅犳犆犜犆犉犵犲狀犲犿狌狋犪狋犻狅狀犻狀犳犲狋狌狊犪狊狊狅犮犻犪狋犲犱狑犻狋犺犪犱狏犲狉狊犲狅狌狋犮狅犿犲犡犻犲犡犻犪狅狓犻犪狅1,犑犻犪狀犵犡犻犪狅狔犻狀犵2,犎狌犔犻狀犵狔狌狀1,犣犺狅狌犎狅狀犵犺狌犻1,犠犪狀犵犔狅狀犵狓犻犪1,犢狅狌犢犪狀狇犻狀1,犔狌犢犪狀狆犻狀犵1 (1犜犺犲犳犻狉狊狋犿犲犱犻犮犪犾犮犲狀狋犲狉狅犳犆犺犻狀犲狊犲犘犔犃犌犲狀犲狉犪犾犎狅狊狆犻狋犪犾,犅犲犻犼犻狀犵100853,犆犺犻狀犪;2犕犲犱犻犮犪犾狊犮犺狅狅犾狅犳犆犺犻狀犲狊犲犘犔犃,犅犲犻犼犻狀犵100853,犆犺犻狀犪)【犃犫狊狋狉犪犮狋】 犗犫犼犲犮狋犻狏犲 Toexplorethegeneticanalysisandcounselingofpathogenic犆犜犆犉mutationinfetus.犕犲狋犺狅犱狊 Chromosomekaryotypeanalysis,Fluorescenceinsituhybridization(FISH),chromosomemicroarrayanalysis(CMA)andwholeexomesequencing(WES)wereusedtodetectthefetuswithpoorlystructuredbilateralhyperechogenickidneys.犚犲狊狌犾狋狊 Karyotypeanalysis,FISHandCMAwerenormal.Adenovoframeshiftmutationc.944_951dup(p.G318Hfs 18)of犆犜犆犉wasdetectedbyWESresultingtruncatedprotein.Itcancause“Mentalretardation,autosomaldominant21”,whichhasnotbeenreportedinfetuses.犆狅狀犮犾狌狊犻狅狀 Inthiscase,thepathogenicmutationin犆犜犆犉wasfirstdetectedinfetus.Thepoorlystructuredbilateralhyperechogenickidneysmaybeanovelfetalclinicalfeatureassociatedwiththemutationin犆犜犆犉.Pretestandprotestcounselingshouldbewelldone,especiallywhentherarepathogenicmutationsaredetectedbyWES.【犓犲狔狑狅狉犱狊】 犆犜犆犉;Bilateralhyperechogenickidneys;Wholeexomesequencing;Fetus81Copyright ©博看网. All Rights Reserved.《中国产前诊断杂志(电子版)》 2023年第15卷第1期·论著· 犆犜犆犉基因是脊椎动物体内染色质结构组成和调控的重要参与者之一,位于染色体16q22.1区域,对于染色体三维立体结构的形成和协调起着重要的作用,同时还参与许多基因调控,其编码的蛋白含有11个高度保守的锌指结构,通过这些锌指结构绑定多种DNA从而发挥多元调控作用,在人类基因中其DNA的绑定位点超过30000个,所发挥的作用包括基因调节、阻断异染色质的传播、基因印记、X染色体失活等[1,2]。
儿童智力低下434例染色体异常核型分析
李桦;张小琼;李晓明;陈大庆
【期刊名称】《中国优生与遗传杂志》
【年(卷),期】2000(8)1
【摘要】对临床诊断有脑发育不全、生长发育迟缓、先天畸形、特殊面容、智力低下等832例患儿外周血淋巴细胞进行染色体分析,共发现染色体异常434例,占全部受检病例的52-16%,其中各种类型的21三体综合征(Down′s)426例,占染色体异常核型的98-16%(426/434),有3例还同时合并有13,14,18,19号染色体数目或结构异常;其余异常核型分别涉及到5,8,15,18,20,22号染色体共8例。
表明儿童智力低下染色体异常是重要原因,而Down’s综合征又占绝大多数,可达98-16%。
临床并发现1例极少见的异卵双胎Down’s患儿。
【总页数】2页(P34-35)
【关键词】染色体异常;智力低下;Down综合征;儿童
【作者】李桦;张小琼;李晓明;陈大庆
【作者单位】南京儿童医院
【正文语种】中文
【中图分类】R725.961
【相关文献】
1.儿童智力低下212例染色体异常核型分析 [J], 陈宇新
2.52例先天性智力低下儿童的染色体核型及病因分析 [J], 郑虹;杨业洲
3.180例智力低下儿童染色体核型分析 [J], 王晓云;高文英
4.141例智力低下儿童染色体核型分析 [J], 李小桦;王东芳;刘纪清;蔡若莲
5.271例儿童染色体异常核型分析及其与疾病关系 [J], 蔡燕娜;邓华;林涛;夏健清因版权原因,仅展示原文概要,查看原文内容请购买。
10例稽留流产绒毛染色体CNV-seq检测结果分析结果分析发布时间:2022-12-01T06:45:54.021Z 来源:《医师在线》2022年7月14期作者:王雪[导读]王雪*(安徽医科大学第二附属医院遗传与产前诊断中心,安徽合肥,230601)【摘要】目的探究早期稽留流产与绒毛组织染色体异常、患者年龄及流产次数之间的关系。
方法回顾性分析2020年8月至2022年5月于安徽医科大学第二附属医院因稽留流产行基因组拷贝数变异测序技术检测绒毛染色体的患者110例,对其结果进行统计分析。
结果 110例绒毛组织中检测成功108例,染色体异常检出率56.48%(61/108),其中数目异常占50.92%(55/108),以三体为主,16-三体和X染色体单体最多见;致病性拷贝数异常占5.56%(6/108)。
染色体异常组的患者年龄较正常组偏大(P<0.05),且年龄≥35岁组的染色体异常率明显高于<35岁组(P<0.05)。
稽留流产与流产次数无明显关系(P>0.05)。
结论染色体异常是稽留流产的重要原因,以染色体非整倍体变异为主,少数为基因组拷贝数变异。
年龄可增加稽留流产风险。
关键词:稽留流产;基因组拷贝数变异测序技术;绒毛;染色体异常Analysis of 110 cases of missed abortion villus chromosome detected by CNV-seq techniqueWANG Xue(Genetic and Prenatal Diagnostic Center, The Second Affiliated Hospital of Anhui Medical University, Anhui, Hefei 230001, China )ABSTRACT Objective To explore the relationship between missed abortion and villus chromosome abnormality, age and previous miscarriage times. Methods From August 2020 to May 2022, 110 cases of villous chromosomes detected by high-throughput sequencing technology in the Second Affiliated Hospital of Anhui Medical University due to delayed abortion were retrospectively analyzed, and the results were statistically analyzed. Results Among 110 cases of villous tissue, 108 cases were successfully detected and 2 cases failed. The detection rate of chromosomal abnormalities was 56.48% (61/108), in which the number of abnormalities accounted for 50.92% (55/108). Trisomy was the most common, and 16 trisomy and X chromosome monomer were the most common. Pathogenic copy number abnormalities accounted for 5.56% (6/108).The age of patients in the chromosomal abnormality group was older than that in the normal group (P<0.05), and the chromosomal abnormality rate in the age ≥35 years group was significantly higher than that in the <35 years group (P<0.05). There was no significant relationship between missed abortion and the previous miscarriage times (P>0.05). Conclusion Chromosomal abnormality is an important cause of missed abortion, mainly chromosomal aneuploid variation, and a small number of genomic copy number variation. Age increases the risk of missed abortion.KEY WORDS missed abortion; CNV-seq technology; villous; Chromosome abnormalities稽留流产(missed abortion)又称过期流产,指胚胎或胎儿已死亡滞留宫腔内未能及时自然排出者。
KIF4A基因变异所致智力发育障碍和牙齿形态发育异常伴孤
独症患儿一例遗传学分析
刘磊;安爽;王彦红;郭鹏波;夏志毅;张耀东;梅世月
【期刊名称】《郑州大学学报(医学版)》
【年(卷),期】2024(59)3
【摘要】KIF4A基因位于Xq13.1,编码一种ATP依赖的微管运动蛋白,该蛋白参与膜性细胞器的胞内运输,对细胞周期和神经元的发育至关重要[1]。
目前,只有少数与KIF4A基因变异相关的病例报道[2-5],在OMIM数据库中KIF4A基因变异与X连锁智力发育障碍100型和牛齿、小齿、内陷牙三联征相关联。
有研究[5]认为KIF4A基因变异可能与更广谱的神经发育障碍和先天性异常表型有关。
本研究对1例携带KIF4A基因变异且智力发育障碍、牙齿形态发育异常伴孤独症患儿的临床资料及基因检测结果进行分析,以期提高临床医师对该基因所致疾病的认识。
【总页数】4页(P427-430)
【作者】刘磊;安爽;王彦红;郭鹏波;夏志毅;张耀东;梅世月
【作者单位】郑州大学附属儿童医院(河南省儿童医院郑州儿童医院)儿科医学研究所;郑州大学附属儿童医院(河南省儿童医院郑州儿童医院)康复科
【正文语种】中文
【中图分类】R74
【相关文献】
1.6号染色体短臂部分重复致性发育异常伴智力低下患者一例遗传学分析
2.多媒体感觉统合训练配合言语训练对伴智力低下孤独症谱系障碍儿童智力发育和事件相关电位的影响
3.六例KIF1A基因变异相关常染色体显性遗传神经发育障碍患儿临床和遗传学分析
4.学龄前孤独症谱系障碍共患智力发育障碍儿童智力与孤独症症状的相关性分析
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《中国产前诊断杂志(电子版)》 2024年第16卷第1期·论著· MECP2重复综合征的产前临床表型及遗传学分析何凌 韦庆芳 卢庆(南宁市第二人民医院产科,广西南宁 530031)【摘要】 目的 探讨1例新发MECP2重复综合征产前病例和遗传咨询。
方法 应用常规G显带染色体核型分析和拷贝数变异测序(copynumbervariationsequencing,CNV Seq)对胎儿羊水样本检测,对胎儿进行系统超声检查,夫妇行外周血CNV seq明确胎儿基因组变异来源,并对相关文献资料进行复习。
结果 系统超声检查提示胎儿右侧肾盂分离(12mm)。
胎儿染色体核型分析未见异常。
羊水CNV seq结果:seq[hg19]dup(X)(q28q28)chrX:g.153140000_153400000dup,Xq28区段存在约260kb的拷贝数重复,夫妇外周血CNV seq检查未见异常,提示胎儿为新发MECP2重复综合征。
结论 MECP2重复综合征在胎儿期缺乏特异的超声表现,CNV seq可有效检出MECP2重复综合征,为其产前诊断和遗传咨询提供依据。
【关键词】 MECP2重复综合征;产前诊断;CNV seq;胎儿【中图分类号】 R715.5 【文献标识码】 A犇犗犐:10.13470/j.cnki.cjpd.2024.01.006犘狉犲狀犪狋犪犾犮犾犻狀犻犮犪犾狆犺犲狀狅狋狔狆犲犪狀犪犾狔狊犻狊犪狀犱犾犻狋犲狉犪狋狌狉犲狉犲狏犻犲狑狅犳犕犈犆犘2犱狌狆犾犻犮犪狋犻狅狀狊狔狀犱狉狅犿犲犎犲犔犻狀犵,犠犲犻犙犻狀犵犳犪狀犵,犔狌犙犻狀犵(犇犲狆犪狉狋犿犲狀狋狅犳犗犫狊狋犲狋狉犻犮狊,犖犪狀狀犻狀犵犛犲犮狅狀犱犘犲狅狆犾犲’狊犎狅狊狆犻狋犪犾,犖犪狀狀犻狀犵犌狌犪狀犵狓犻530031,犆犺犻狀犪)【犃犫狊狋狉犪犮狋】 犗犫犼犲犮狋犻狏犲 ToexploretheprenataldiagnosisandgeneticcounselingforacaseofdenovoMECP2duplicationsyndrome.犕犲狋犺狅犱狊 RoutineG bandingkaryotypingandCNV seqwereusedtodetectfetalamnioticfluidsamples,andsystematicultrasoundexaminationwasperformedonthefetus.CNV seqofperipheralbloodofthecouplewasperformedtodeterminethesourceoffetalgenomicvariation,andtherelevantliteraturewasreviewed.犚犲狊狌犾狋狊 Systematicultrasoundexaminationsuggestedrightrenalpelvisseparationinthefetus.Fetalchromosomekaryotypeanalysisshowednoabnormality.TheCNV Seqresultsofthefetuswereseq[hg19]dup(X)(q28q28)chrX:g.153140000_153400000dup,revealinga260KbduplicationatXq28.CNV seqofthecouple'speripheralbloodshowednoabnormalities,suggestingthatthefetuswasadenovoMECP2duplicationsyndrome.犆狅狀犮犾狌狊犻狅狀 MECP2duplicationsyndromelacksspecificultrasoundmanifestationsinfetus.CNV seqcaneffectivelydetectMECP2duplicationsyndrome,whichprovidesabasisforprenataldiagnosisandgeneticcounseling.【犓犲狔狑狅狉犱狊】 MECP2duplicationsyndrome;prenataldiagnosis;CNV seq 甲基化CpG结合蛋白 2基因(methyl CpGbindingprotein2gene,犕犈犆犘2)重复综合征是一种罕见的X连锁隐性遗传性染色体疾病,主要累及男性患者,临床特征为反复呼吸道感染和严重神经发育障碍,包括严重智力障碍、全面发育迟缓、癫痫、肌张力低下等,最早于1999年由Lubs等报道[1],故也叫LubsX连锁智力障碍综合征(LubsX linkedmentalretaradationsyndrome),2005年被证实为MECP2基因重复所致[2],2010年被命名为MECP2重复综合征(犕犈犆犘2duplicationsyndrome,MDS,92·论著·《中国产前诊断杂志(电子版)》 2024年第16卷第1期OMIM:300260)[3]。
32例智力低下发育迟缓患儿基因组拷贝数变异的分析党颖慧;宋婷婷;万陕宁;郑芸芸;黎昱;陈必良;张建芳【摘要】目的应用染色体微阵列分析技术(chromosomal microarray analysis,CMA)在全基因组水平对32例不明原因的智力低下或发育迟缓患儿(mental retardation or developmental delay,MR/DD)进行拷贝数变异检测(copy number variations,CNVs),探讨CMA对不明原因MR/DD患儿可能的分子病因诊断的作用,寻求与遗传学相关的致病因素.方法收集2015年1月~2017年11月到笔者医院初步诊断为MR/DD的32例患儿,利用CytoScan750K芯片检测全基因组CNVs,结合生物信息学分析致病性CNVs.结果在32例不明原因MR/DD患者中共检测到16例存在CNVs,通过比对数据库8例确认为致病性CNVs,阳性率25%,其中1q21.1缺失综合征1例,Waardenburg综合征1例,Smith-Magenis综合征1例,其他5例携带MR/DD相关的CNVs.结论 CNVs 相关的微缺失或微重复是不明原因MR/DD的病因之一,CMA可作为对不明原因MR/DD患儿的病因诊断技术,对深入研究MR/DD病因机制及为患儿预后和家庭再发风险评估都具有重要意义.【期刊名称】《医学研究杂志》【年(卷),期】2019(048)004【总页数】5页(P29-33)【关键词】染色体微阵列分析;发育迟缓;智力低下;拷贝数变异【作者】党颖慧;宋婷婷;万陕宁;郑芸芸;黎昱;陈必良;张建芳【作者单位】710032西安,空军军医大学第一附属医院妇产科;710032西安,空军军医大学第一附属医院妇产科;710032西安,空军军医大学第一附属医院妇产科;710032西安,空军军医大学第一附属医院妇产科;710032西安,空军军医大学第一附属医院妇产科;710032西安,空军军医大学第一附属医院妇产科;710032西安,空军军医大学第一附属医院妇产科【正文语种】中文【中图分类】R742.8儿童智力低下(mental retardation,MR)和发育迟缓(developmental delay,DD)是一类严重危害儿童健康的疾病,发生率约为 2.3%[1]。
在我国导致智力低下的先天性因素中,遗传病约占 40.5%,而染色体因素占遗传因素的 37.0%[2]。
染色体微阵列分析技术(CMA)是一种全新的分子核型分析技术,具有敏感度高、分辨率高、自动化程度高等优点,在遗传性疾病和正常人群中能检测出各种基因拷贝数变化,应用CMA对CNVs进行深入研究是国内外研究该病遗传机制的发展趋势,但国内应用经验仍有限[3]。
本研究应用CMA对32例不明原因的MR/DD患儿进行全基因组扫描与分析,探讨CMA对不明原因MR/DD患儿可能的分子病因诊断的作用。
对象与方法1.筛选标准:选择2015年1月~2017年11月到笔者医院儿科及遗传咨询门诊就诊的患儿32例为本次调查对象,选择标准包括:①临床诊断为智力低下/发育迟缓患儿;②无明显围生期异常病史,无明确出生后缺氧、中毒、头颅外伤及中枢神经系统感染等病史;③无甲状腺功能异常,无颅内肿瘤;④常规染色体核型正常;⑤排除已知的遗传性综合症和遗传性代谢病导致的智力低下。
其中男性患儿14例,女性患儿18例,患儿年龄2个月~10岁,主要表现为智力低下、生长发育迟缓、特殊面容等。
根据不同的年龄段分别采用《Gesell发育量表》和《中国韦氏智力量表》测定儿童的发育商(DQ)或智商(IQ),同时运用《婴儿-初中生社会适应性能力量表》进行社会适应性能力评价。
IQ或DQ<70,伴社会适应性能力低下者诊断为MR,5岁称为MR,<5岁称为DD;以下统称为MR/DD。
告知所有患儿监护人CMA的检测范围及局限性,签署书面知情同意书。
本研究获得笔者医院医学伦理学委员会批准。
2.检测方法:皮肤表面常规消毒后抽取静脉血2ml,使用 DNA 提取试剂盒(QIAamp DNA Blood Mini Kit)按说明书操作方法提取基因组DNA。
应用Affymetrix公司的Cytogenetic CytoScan 750K Array全基因芯片扫描技术检测全基因组CNVs。
Affymetrix CytoScan 750K Array芯片包含有20万SNP标记和55万CNV标记,以平均大约1marker/4kb的密度分布于人类的整个基因组,用于检测全基因组染色体。
按试剂盒说明书操作:将DNA溶解于AE buffer 溶液并将DNA 浓度调整至50ng/μl。
对DNA样品进行酶切、连接、PCR扩增。
将扩增产物用磁珠法进行纯化,纯化后的PCR产物进行片段化处理,片段在25~125bp。
片段化后的产物在末端脱氧核糖转移酶(TdT)的作用下进行标记反应。
标记完成后和杂交试剂混合,95℃ 10min,49℃孵育2min后取200μl样本载入到置密的芯片中,密闭50℃,60r/min杂交16~18h。
然后将芯片放入洗染工作站内完成洗涤、SAPE染色等步骤。
洗染结束后将芯片放入扫描仪进行扫描。
用Affymetrix GeneChip Scaner生成原始cel文件通过AGCC软件芯片图像显示分析,利用CHAS软件对结果进行分析。
3.CMA检测结果判定:对于检测出的CNVs通过与公共数据库UCSC、ISCA、DGV、DECIPHER、OMIM等数据库进行比对分析判断其性质,结果分为:①致病性CNVs;②意义不明确CNVs;③意义不明确,可能致病CNVs;④意义不明确,可能良性CNVs;⑤良性CNVs[4]。
结果1.32例MR/DD患儿的染色体拷贝数异常情况:在32例不明原因的MR/DD患儿中,共检出16例存在CNVs,临床表现详见表1。
其中致病性CNVs 8例(25%,8/32),意义不明确CNVs 6例(19%,6/32),意义不明确、可能良性CNVs 2例(6.3%,2/32)。
表1 16例MR/DD患儿临床表现病例性别年龄临床特征1女性8岁听力差,不会说话,生长发育迟缓,双侧半规管形态异常,2岁时MRI示脑白质营养不良,左眼虹膜异常,上眼皮下垂2女性5岁智力低下,1岁时发现患有癫痫,一直药物控制,2岁时能走路,双侧侧脑室旁白质局限性减少,目前仅会叫爸爸、妈妈等简单的话语3女性1岁7个月生长发育迟缓,语言表达能力障碍,左手通贯掌,喜伸舌,爱动4男性2岁5个月发育迟缓,先心病,房间隔缺损5男性6岁多动,语言障碍,智力低下6男性8岁早产,脑瘫,不会说话,发育迟缓,智力低下7男性2岁4个月足月顺产,不会说话,智力低下,2岁时行隐睾手术治疗8女性3岁足月顺产儿,出生时无缺氧,MRI示头颅不对称,生长发育迟缓,语言表达能力差9男性5岁8个月体格发育迟缓,身高103cm,体重15kg,多动,易怒,无法控制情绪,原左侧精索鞘膜积液做手术后正常10女性2岁3个月出生时为低体重儿(2.35kg),住院1周,现2岁3个月,不能抬头,不会走路和说话,肌张力高,一直做康复训练,效果较差11男性3岁智力偏低,语言表达能力欠佳,脾气暴躁,轻微自闭症;MRI显示左颞极蛛网膜囊肿12男性9岁父母三代近亲结婚,走路尚可,语言表达能力欠佳,智力偏低,主诉激素水平偏高13男性6岁出生2个月发现先天性心脏病,4个月患化脓性脑膜炎,左侧隐睾,语言发育迟缓,智力低下,喜吐舌,招风耳,眼距宽,身高1.1m14女性4岁11个月生长发育迟缓,语言表达能力障碍,自闭症,耳位偏高15女性5个月足月顺产,5个月发育迟缓,无法坐立,身体软,反应慢,双手通贯,面容正常16女性5个月足月剖宫产,双手通贯,现5个月,发育迟缓表2 CMA检出的8例致病性CNVs结果对比序号CMA检测结果CNV片段染色体异常类型综合征12arr[hg19] 9q22.33q31.3(100014738~112393341)x112.4Mb缺失无arr[hg19] 9q22.32q32(98197961~115161407)x1-217Mb缺失无arr[hg19] 4q35.2(189952641~190630694)x1680kb缺失无arr[hg19] 12p13.33p12.3(173786~16878737)x3 16.7Mb重复无arr[hg19] 13q34(111552901~115107733)x13.6Mb缺失无3arr[hg19] 1q21.1q21.2(145895746~147885600)x11.99Mb缺失1q21.1缺失综合征4arr[hg19] 2q35q36.1(218765838~224539497)x15.8Mb缺失瓦登伯格综合征5arr[hg19] 17p11.2(17143150~20213815)x13.1 Mb缺失史密斯-马吉利综合征6arr[hg19] 18q22.2q23(67180770~78014123)x110.8 Mb缺失无7arr[hg19] 20q11.21q11.23(30277973~36680020)x36.4Mb重复无8arr[hg19] 2q24.3(166015178~166237196)x1222kb缺失无2.16例患儿CNVs结果分析:16例患儿中存在CNVs,8例为致病性CNVs,阳性率25%,其中存在缺失6例,重复1例,重复合并缺失1例,所检出的CNVs大小为(0.22~17.00)Mb;3例确诊为已知综合征患儿,分别是1q21.1缺失综合征(1q21.1 deletion syndrome),瓦登伯格综合征(Waardenburg syndrome),史密斯-马吉利综合征(Smith-Magenis syndrome),详见表2。
意义不明确CNVs 6例(19%,6/32),其中缺失2例,重复1例,杂合性缺失3例,所检出的CNVs 大小为(0.42~19.50)Mb,>10Mb的片段有6个,详见表3。
另外意义不明确,可能良性有2例。
表3 CMA检出的意义不明确CNVs结果对比序号CMA检测结果CNV片段染色体异常类型9arr[hg19] Yq11.223q11.23(24987791~27224389)x0arr[hg19] Yq11.23(27535696~28420380)x02.2Mb885kb缺失缺失10arr[hg19]Xp11.23p11.1(46857766~58227320) hmz11.4Mb杂合性缺失11arr[hg19]9q33.3(126592124~127011695)x1arr[hg19]14q11.2(22510337~22944507)x1420kb434kb缺失缺失12arr[hg19]7p14.3p14.1(32053690~43033668) hmzarr[hg19] 17p13.2p11.1(3393443~22217883) hmzarr[hg19]17q11.1q21.31(25309336~44809001)hmzarr[hg19] 20q11.21q12(29448795~39662842)hmz10.9M18.8M19.5M10.2M杂合性缺失杂合性缺失杂合性缺失杂合性缺失13arr[hg19] Yq11.223q11.23(24987791~26202092)x2arr[hg19]Yq11.23(26427508~27778177)x21.21Mb1.35 Mb重复重复14arr[hg19]4q21.21q22.1(80731702~92733937) hmz12Mb杂合性缺失讨论智力障碍是一类遍及全世界的严重危害儿童身心健康的一类疾患,初步估计目前约15%~20%的智力障碍是由于亚显微的染色体拷贝数变异造成的。