种间转移扩增法筛选长爪沙鼠微卫星位点

应用微卫星标记研究Dunkin Hartley豚鼠封闭群的遗传背景朱亮;蔡月琴;屠珏;应华忠;徐剑钦;陈民利【摘要】目的检测我国现有Dunkin Hartley 豚鼠封闭的遗传背景,分析评估其遗传多样性水平和遗传分离情况,为建立标准化的豚鼠封闭群监测方法提供基础资料.方法应用筛选获得的8个微卫星位点,从一个数量为1000的豚鼠封闭群中随机选择72个个体,通过PCR扩增和聚丙烯酰胺凝胶电泳的方法,进行等位基因检测.并根据检测结果分析评估了该豚鼠封闭群的遗传现状.结果共检测到28个等位基因,每个座位的等位基因数为2～5个,有效等位基因数为1.5191～3.4422,平均2.3093.平均期望杂合度为0.5294.各位点多态信息含量在0.3154～0.6545之间,平均值为0.4687.有5个位点显著偏离Hardy-Weinberg平衡.结论豚鼠封闭群的遗传多态性处于中等水平,遗传平衡检测结果提示种群的繁殖过程未能实现完全随机交配,近交现象一定程度上存在.本研究的结果将为豚鼠封闭群遗传监测方法和标准的建立提供基础.%Objective To estimate the genetic diversity and genetic differentiation of a Dunkin Hartley guinea pig outbred stock and providing valuable information and references for standardization of the population. Methods A total of 72 samples from a Dunkin Hartley guinea outbred pig stock were genotyped using 8 microsatellite DNA markers by PCR-denaturing polyacrylamide gel electrophoresis. Genetic variation of the population was evaluated and Hardy-Weinberg equilibrium was tested for each locus. Results 28 alleles were found in the outbred stock,2-5 alleles each locus,and the effective number of alleles each locus ranged from 1. 5191 to 3.4422,with an average of 2. 3093. The average of unbiasedexpected heterozygosity was 0. 5294. The polymorphic information content (PIC) ranged from 0. 3154 to 0. 6545 ,with an average of 0. 4687. Five of 8 loci showed significant deviations from Hardy-Weinberg equilibrium (HWE). Conclusions The results indicate that the genetic diversity of the Dunkin Hartley guinea pig outbred stock is moderate. Inbreeding has some shortcomings in comparison with outbred stock. Genetic information provided by this reserch will be useful in developing genetic monitoring methods and standardization of the outbred guinea pigs.【期刊名称】《中国实验动物学报》【年(卷),期】2011(019)001【总页数】5页(P51-55)【关键词】豚鼠;封闭群;微卫星标记;遗传多样性【作者】朱亮;蔡月琴;屠珏;应华忠;徐剑钦;陈民利【作者单位】浙江中医药大学动物实验研究中心,杭州,310053;浙江中医药大学动物实验研究中心,杭州,310053;浙江中医药大学动物实验研究中心,杭州,310053;浙江中医药大学动物实验研究中心,杭州,310053;浙江中医药大学动物实验研究中心,杭州,310053;浙江中医药大学动物实验研究中心,杭州,310053【正文语种】中文【中图分类】Q95-33;R394浙江中医药大学动物实验研究中心豚鼠繁殖中心于1998年引进Dunkin Hartley豚鼠封闭群，饲养保种至今，已形成1000个个体的种群。

动物科学毕业论文题目精选动物科学专业是生命科学的重要分支，基本任务是在认识和掌握动物遗传变异、生长发育、繁殖消化代谢等生命规律的基础上，为人类提供质优量多的动物产品。

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动物科学毕业论文题目一：1、谷氨酰胺对断奶仔猪肠黏膜形态和细胞能量合成的影响2、颈交感神经不同功能状态对周围神经慢性卡压伤的影响3、高压氧对大鼠脑出血后脑水肿的影响及机制研究4、中国部分动物园灵长类动物胃肠道寄生虫与大肠杆菌的调查研究5、成年藏獒犬蛋白质需要量及对常规饲料消化代谢的研究6、动物科学、动物医学专业本科生就业现状及影响因素研究7、主动免疫重组绵羊β_2-肾上腺素受体对大鼠生长及血清生化指标的影响8、地方医科大学实验动物管理工作水平评价研究9、善待实验动物的伦理学思考10、猪12号染色体上四个新基因的分离、鉴定与物理定位11、我国动物实验替代方法研究的思路、模式和优先支持研究领域12、实验型封闭群新西兰白兔与应用有关的生物学特性研究13、中国实验动物科学发展模式的分析与研究14、SPF鸡生产若干关键技术的研究15、青贮香蕉茎叶饲喂条件下的云南黄牛屠宰性能与肉品质研究16、基于ESI和InCites数据库对我国科研论文产出力和学术影响力的统计分析17、高等农业院校产学研结合基地建设的研究18、吉林省东鳌鹿业集团发展战略研究19、GLP实验动物设施屏障环境消毒方法的研究20、动物科学国际期刊论文的被动语态研究21、农学类本科生专业认同研究22、用微卫星DNA标记技术建立猕猴遗传检测方法及对群体遗传多样性的分析23、全国实验动物行业现状调查和发展对策研究24、PCR法鉴定牛早期胚胎性别的研究25、现代农业发展的背景下高等农业本科人才培养的研究26、湖北省实验动物生产管理现状与发展对策研究27、成都PA动物繁育研究基地的发展模式研究28、地方院校与县域经济互动发展的分析29、实验动物生理信号的采集与处理30、利用胚胎移植及相关技术培育实验用SPF小型猪31、实验小鼠精子低温保存及体外受精的研究32、农科本科生专业技能评价指标体系研究33、唐鱼（Tanichthys albonubes）生物学特性及实验动物化研究34、沙葱和油料籽实对绵羊血液生化指标的影响35、慢性化脓性骨髓炎生物学模型的制作及相关指标的测定动物科学毕业论文题目二：36、长爪沙鼠微卫星DNA、RAPD位点筛选和群体遗传结构分析37、慢性冷热应激对荷斯坦奶牛维持行为及免疫功能的影响研究38、仔猪水肿病病原分离鉴定及免疫防制研究39、农科本科生专业课程学习成绩评价研究40、二十一世纪初农科本科专业调整研究123下一页。

微卫星DNA标记应用于畜禽血缘关系鉴定作者：张一君马海明来源：《国外畜牧学·猪与禽》2016年第02期摘要：随着现代畜牧业的发展，公畜对畜禽育种的影响越来越大，优秀公畜的后裔越来越多，优秀种畜在生产上的贡献也较为突出，因此亲子鉴定对畜牧业有重要的指导意义。

微卫星标记技术以其具有分布广泛，多态信息含量高，呈共显性以及检测方便、快速等优点而备受关注，成为国际动物遗传协会（ISAG）和联合国粮农组织（FAO）优先推荐的分析畜禽遗传多样性的工具，被广泛应用于畜禽的遗传多样性分析、品种间遗传距离估测及亲子鉴定和血缘控制来防止近亲交配。

关键词：微卫星标记；亲缘关系；遗传多样性中图分类号：S813.1 文献标识码：A 文章编号：1001-0769（2016）02-0047-021 微卫星标记的结构微卫星标记（Microsatellite），又称为短串联重复序列（Short Tandem Repeats）或简单重复序列（Simple Sequence Repeats），是均匀分布于真核生物基因组中的简单重复序列[1-3]，由2～6个核苷酸的串联重复片段构成，美国人Weber发现了微卫星DNA具有长度多态性[4]，并将微卫星分为3类：单纯（Pure）SSR、复合（Compound）SSR和间隔（Interrupted）SSR。

单纯SSR是指由单一的重复单元所组成的序列，如（AT）n；复合SSR则是由2个或多个重复单元组成的序列，如（GT）n（AT）m；间隔SSR在重复序列中有其他核苷酸夹杂其中，如（GT）nGG（GT）m。

由于重复单位的重复次数在个体间呈高度变异性并且数量丰富，因此微卫星标记的应用非常广泛。

2 微卫星标记的特点2.1 分布广泛，有高度多态性微卫星DNA在真核生物的基因组中广泛存在且分布比较均匀。

平均每10 kb的DNA序列中就会出现一个微卫星序列[5]。

在猪的基因组中，每隔 30 kb～50 kb就会有1个两核苷酸重复[6]。

目录摘要 (1)Abstract (2)1文献综述 (3)1.1微卫星介绍 (3)1.2 微卫星位点筛选方法 (4)1.3子午沙鼠简介 (5)1.4 研究的目的和意义 (5)1.4.1 研究的目的 (6)1.4.2 研究意义 (6)2.材料与方法 (7)2.1 子午沙鼠基因组DNA的提取 (7)2.2 微卫星位点的选择与引物的合成 (7)2.3 PCR扩增，筛选位点 (8)2.4 筛选高多态性位点 (8)2.5微卫星分型 (9)3.实验结果 (10)3.1微卫星引物筛选结果 (10)3.2微卫星分型结果 (11)3.3微卫星位点遗传参数分析结果 (14)3.4累计排除率分析结果 (15)4.讨论 (17)5.结论 (19)参考文献 (20)致谢 (22)子午沙鼠DNA分子微卫星相关的引物筛选及评价摘要：分子微卫星是一种简单的，重复DNA序列，是真核生物基因组的重要成分之一，其种类多、分布广泛且具有高度的多态性和杂合度等特征。

作为高度可区分性的双亲遗传共显性标记，分子微卫星在亲权鉴定、系谱分析和物种遗传多样性分析中得到了广泛的应用。

因此，为了筛选子午沙鼠高多态性的微卫星位点，本研究选择20个长爪沙鼠(子午沙鼠近缘种)的微卫星位点，使用交叉扩增的方法进行筛选。

通过琼脂糖电泳筛选及微卫星分型验证，最终筛选出7个能够稳定扩增且同时具有高多态性的微卫星位点。

经验证，这七个位点在10个子午沙鼠个体中共扩增出127个等位基因，平均多态信息含量为0.822，平均期望杂合度为0.8849，均为高度多态位点。

因此，可以用于子午沙鼠遗传多样分析及遗传性婚配制度研究。

关键词：子午沙鼠；微卫星DNA；遗传多态性；微卫星分型Screening and evaluation of primers related to microsatellitein Midday gerbilsAbstract: Molecular microsatellite is a simple and repetitive DNA sequence, which is one of the important components of eukaryotic genome. It has many kinds, wide distribution and high polymorphism and heterozygosity. As a highly distinguishable parental codominant marker, microsatellite has been widely used in parental identification, pedigree analysis and species genetic diversity analysis. Therefore, in order to screen the microsatellite Loci with high polymorphism in Midday Jird, we selected 20 microsatellite Loci from close relatives of Midday jird Gerbils by cross-amplification. By agarose Gel electrophoresis and microsatellite typing, 7 microsatellite loci with stable amplification and high polymorphism were selected. It has been proved that these seven loci can be used in the analysis of genetic diversity and the study of genetic mating system in Midday jird.Key words: Midday Jird; microsatellite DNA; Single-nucleotide polymorphism；Microsatellite typing1文献综述1.1微卫星介绍微卫星也常被称为简单的碱基重复分子序列,是以1-6个简单核苷酸碱基为重复序列单位子所组成的5-40个简单分子串联体的重复分子序列。

基因组微卫星DNA位点的分离方法及其在水产动物中的应用李莉好;喻达辉
【期刊名称】《南方水产科学》
【年(卷),期】2006(002)005
【摘要】微卫星DNA是分布于基因组的1～6个碱基组成的串联重复序列,或简单序列重复.微卫星DNA具有多态性高、数量丰富、共显性遗传和分析简单等特点,应用越来越广泛,已成为最受青睐的分子标记之一.微卫星分子标记的获得首次必须从实验生物中分离.分离微卫星DNA位点的方法有多种.文章对几种微卫星DNA 位点分离技术进行介绍和分析比较,为选择合适的分离方法提供参考.
【总页数】7页(P74-80)
【作者】李莉好;喻达辉
【作者单位】中国水产科学研究院南海水产研究所,广东,广州,510300;上海水产大学,上海,200090;中国水产科学研究院南海水产研究所,广东,广州,510300
【正文语种】中文
【中图分类】Q753
【相关文献】
1.基因组学技术及其在水产动物研究中的应用综述 [J], 张思源;欧江涛;王资生;柴志欣;钟金城
2.鳞翅目昆虫基因组中微卫星DNA的特征以及对其分离的影响 [J], 吉亚杰;张德兴
3.微卫星DNA的分离方法及其在猪遗传育种中的应用 [J], 马海明;黄生强;贺长青
4.全基因组选择育种策略及在水产动物育种中的应用前景 [J], 于洋;张晓军;李富花;相建海
5.水产动物基因组近交分析软件的开发和应用 [J], 栾培贤;张晓峰;户国
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中华猕猴桃与软枣猕猴桃种间杂交亲本的筛选
杜奎;王丽华;张茜;谢玥;李利军;庄启国;李峤虹;李明章;王永志
【期刊名称】《资源开发与市场》
【年(卷),期】2022(38)6
【摘要】为筛选中华猕猴桃(A.chinensis Planch.var.chinensis)与软枣猕猴桃(A.argute(Sieb.&Zucc)Planch.ex Miq.)种间杂交亲本,对两类猕猴桃进行染色体倍性测定、物候期调查和果实感官品质、主要营养成分、耐藏性评价。

结果表明:①软枣猕猴桃均为四倍体,中华猕猴桃既有四倍体又有二倍体。

②两类猕猴桃的萌芽期、展叶期、花期接近,但软枣猕猴桃果实成熟期和休眠期较中华猕猴桃早。

③两类猕猴桃果实感官评价指标呈现差异,中华猕猴桃单果重和可溶性固形物含量均显著高于软枣猕猴桃。

④受试材料中,HN-AA-03067的VC含量最高,‘魁绿’可溶性糖含量和糖酸比最高,‘金实1号’耐藏性最好。

【总页数】6页(P739-744)
【作者】杜奎;王丽华;张茜;谢玥;李利军;庄启国;李峤虹;李明章;王永志
【作者单位】四川省自然资源科学研究院中国—新西兰猕猴桃“一带一路”联合实验室、猕猴桃育种及利用四川省重点实验室
【正文语种】中文
【中图分类】S663.4;S334
【相关文献】
1.芒果新病害露水斑病病菌9种单剂间复配增效配比筛选
2.红曲霉种间产色能力比对与高产色素菌株的筛选
3.种间转移扩增筛选仙湖苏铁微卫星位点及其遗传多样性研究
4.诱导纤维堆囊菌高产埃博霉素的种间微生物筛选及鉴定
5.种间转移扩增法筛选长爪沙鼠微卫星位点
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微卫星位点获取方法的研究进展微卫星位点获取方法是一种基因分型和遗传分析的重要手段，它可以通过测定微卫星位点的多态性来研究个体间的遗传差异和进化关系。

研究者们一直致力于发展更加高效、准确和便捷的微卫星位点获取方法。

本文将介绍微卫星位点获取方法的研究进展，并分析不同方法的优劣势。

传统的微卫星位点获取方法主要依赖于聚丙烯酰胺凝胶电泳（Polyacrylamide Gel Electrophoresis, ）或琼脂糖凝胶电泳（Agarose Gel Electrophoresis）技术。

这些方法需要进行反应体系的优化和样品处理的多个步骤，操作繁琐且费时。

此外，这些方法对于微卫星序列扩增反应的选择性和敏感性有一定的限制，导致了低位点数目和较大的测定误差。

近年来，随着高通量测序技术的发展，研究者们开始采用下一代测序（Next Generation Sequencing, NGS）平台进行微卫星位点的获取和分型。

这些方法不仅可以获得更多的位点信息，还可以提高测定精度和准确性。

NGS方法的主要优势在于其高通量性和多样性，可以同时对多个样品进行测定，并且可以对微弱突变进行敏感检测。

其中，常用的NGS方法包括基因组重测序（Whole Genome Sequencing, WGS）、基因组库构建和目标区域测序（Targeted Re-Sequencing）等。

此外，研究者们还开发了一些基于多聚酶链反应（Polymerase Chain Reaction, PCR）的位点获取方法，如多重微卫星分型法（Multiplex PCR）和简化微卫星-PCR方法（Simplified Microsatellite-PCR, SMP）。

这些方法通过引入多个引物或优化反应体系，提高了微卫星位点的扩增效率和选择性，并减少了操作的复杂性。

此外，通过引入荧光标记和电泳分离等技术，可以实现高通量的微卫星位点分型。

除了上述方法外，近年来还涌现了一些新的位点获取技术，如基于DNA芯片（DNA microarray）的方法和全基因组关联分析（Genome-Wide Association Study, GWAS）。