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第六章-细菌的分类与命名PPT课件

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兽医微生物学-细菌的分类及命名

兽医微生物学-细菌的分类及命名
Salmonella pullorum (S. pullorum)
2、分类学文献中的细菌拉丁文学名，属 名和种名之后，往往还要加上首次定 名人（加括号）、现名定名人和现名 定名年份，这些均用正体排字。 – 一般兽医学及医学微生物学文献中， 属名和种名之后的部分均予省略。 – 如：Escherichia coli
二、细菌的命名
1、细菌的命名依据“国际细菌命名法规”(The International
Code of Nomenclature of Bacteria)
• 学名用拉丁文，遵循“双名法”。 • 所谓“双名法”就是每一种细菌的拉丁文名称由属
名和种名两部分组成，属名在前，第一个字母必须 大写，其余均应小字。整个属名及种名在出版物中 应排成斜体。 如：Escherichia coli 属名+种名
复习重点
细菌命名与书写的基本原则。
2）核酸分子杂交法
DNA-DNA DNA-rRNA rRNA-rRNA
方法: 待测菌株dsDNA------ssDNA 参照菌株，同位素标记的ssDNA 检测杂合DNA的放射性强度，参照菌株自 身为DNA复性的放射性强度100%
DNA-DNA杂交同源性性 >60%为同种 >70%同一亚种 20~60%为同一属
三、细菌分类鉴定的标准
1、长期以来，细菌分类鉴定的主要依据是 其表型(phenotype)特征
形态 染色 培养 细胞壁结构 生理生化 抗原特性
这些表型特征对细菌的鉴定和分类具有很重要的 作用，尤其是在临床微生物学的实中，至今仍有 应用价值。
2、目前微生物学界普遍考虑的分类依据 是 细 菌 的 种 系 发 生 关 系 (phylogenetic relationship)，即分析其基因特征从而 确定分类地位。

细菌的分类与命名

细菌的分类与命名

只确定属名， 只确定属名，未确定种名的某一株细菌
Salmonella sp.
只确定属名， 只确定属名，未确定种名的若干菌株
Salmonella spp.
亚种用subsp.表示 表示 亚种用
Pasteurella multocida subsp. septica
第三节 细菌的分类体系
目前公认的细菌分类体系是“伯吉氏系统细菌学手册” 目前公认的细菌分类体系是“伯吉氏系统细菌学手册” 描述了各个属的性状及属内各种的简明比较 。 “国际系统与进化微生物学杂志”（International 国际系统与进化微生物学杂志” Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology, IJSEM）是细菌分类命名的世界公认 ） 的权威期刊。 的权威期刊。
第四节 细菌的鉴定
一般只有纯培养的细菌才能进行鉴定。 一般只有纯培养的细菌才能进行鉴定。DNA分子水平的 分子水平的 鉴定主要限于专业实验室或作研究之用 。 1.形态学检查：标本涂片镜检 形态学检查： 形态学检查 2.病原菌分离鉴定 病原菌分离鉴定 分离培养：一般 ℃ 分离培养：一般37℃ 16-24h 细菌鉴定：菌落特征、形态、染色特征、生化试验、 细菌鉴定：菌落特征、形态、染色特征、生化试验、 血清学试验
复习重点
细菌命名与书写的基本原则。 细菌命名与书写的基本原则。
Escherichia coli 属名 种名 属名+种名 Salmonella pullorum (S. pullorum)
几种不同的书写情况： 几种不同的书写情况：
属名重复出现，可缩写 属名重复出现，
大肠杆菌）； 如：E.coli （大肠杆菌）；
S. pullorum（鸡白痢沙门氏菌） 鸡白痢沙门氏菌）

细菌的分类与命名-微生物命名规则

细菌的分类与命名-微生物命名规则

细菌得分类与命名细菌分类学细菌分类学（ｔaｘｏｎomy）就是指对细菌进行分类、命名与鉴定得一门学科。

它得任务就是在全面了解细菌得生物学特征得基础上,研究它们得种类，探索其起源、演化以及与其她类群之间得亲缘关系，进而提出能反映自然发展得分类系统，并将细菌加以分门别类.它包括三个方面：分类(claｓsificatiｏn）、命名（ｎomencｌature)与鉴定（iｄentiｆicatｉoｎ)。

一、基本概念1、细菌分类就是根据每种细菌各自得特征,并按照它们得亲缘关系分门别类,以不同等级编排成系统。

分类有两种:①以细菌得形态与生理生化特性为依据得表型特征分类法，包括有传统分类法（classicａｌclassｉｆｉcａｔiｏｎ)与数值分类法(numeｒiｃａl clasｓifｉcatｉｏn）;②用化学分析与核酸分析，以细菌大分子物质(核酸、蛋白质）结构得同源程度进行分类称种系分类(phylogenetic ｃｌassｉficaｔｉoｎ）或自然分类（natural cｌassfｉcａtioｎ）。

2、细菌命名在分类基础上,给予每种细菌一个科学名称，使之在生产实践、临床实践与科学研究工作中相互交流成为可能。

按照细菌命名得法规，能保证所有得科研工作者以同样方式给予细菌命名。

3、细菌鉴定将未知细菌按分类原则放入系统中某一适当位置与已知细菌比较其相似性，用对比分析方法确定细菌得分类地位。

若与已知细菌相同即采用已知菌得名称,不同者则按命名原则确定一个新名称。

二、分类等级细菌得分类等级与其她生物相同，依次为界(kinｇdom）、门(divｉsiｏn）、纲（cｌass）、目(order)、科(fａmilｙ）、属（genus）、种（species）。

细菌属于原核生物界（procarｙoｔae），包括有细菌、放线菌、支原体、衣原体、立克次体与螺旋体.分类等级拉丁字尾比较固定，表示方法如下:目—aｌeｓ、亚目-ｉneae、科-aceae、亚科—oideａae、族—eａe、亚族-inａe。

细菌的分类及命名[知识研究]

细菌的分类及命名[知识研究]

着研究的深入科属的划分会发生变动
专业知识
8
1、属（genus）性状相近、关系密切的 若干菌种组成一个菌属，与其他属有明 显差异。
2、种（species）是细菌学分类的最基本 单元，生物学性状基本相同的细菌群体 归成一个菌种。
3 、 菌 株 （ strain ） 是 不 同 来 源 的 某 一 种 细菌的纯培养物。
细菌的分类及命名
一、 细菌的分类地位 二、 细菌的命名 三、 细菌分类鉴定的标准 四、 细菌的分类体系 五、 细菌的鉴定
专业知识
1
一、细菌分类学——对细菌进行分类， 命名与鉴定的 一门学科。
任务：
•在全面了解细菌生物学特征的基础上， 研究它们的种类，探索其起源，演化以 及与其他类群之间的亲缘关系，进而提 出能反映自然发展的分类系统，并将细
专业知识
11
例如 大肠埃希菌的学名全名是：
Escherichia coli(Migula) Castellani et
Chalmers l919 指的是Migula于1895年命名此菌为 Bacillu coli，Castellani及Chalmers 于1919年改为现名。
专业知识
12
金黄色葡萄球菌的学名为：
恶臭消化链球菌是由 Veillon 首先发现和定名的 ，后 Smith 重新定为现名。
专业知识
14
3、拉丁文学名应按拉丁文字母的发音规 则读念
4、属名重复出现时，拉丁文可缩写，用 第一个字母，为避免混肴，也可用2个 字母。大肠杆菌(E.coli)
专业知识
15
5、只确定属名、未确定种名的某一株细菌， 其拉丁文学名可在属名之后加sp．(正体字)； 如果同属未定种名的若干菌株，则用 spp． (species 的缩写， sp. 表示单数，spp. 表示复数 ) ， 如 Micrococcus sp.表示微球菌属的一个种， Micrococcus spp. 表示微球菌属的一些种。

《医学微生物学》ppt课件-2024鲜版

《医学微生物学》ppt课件-2024鲜版

2024/3/27
11
03
细菌学
2024/3/27
12
细菌的形态与结构
细菌的基本形态
球菌、杆菌、螺旋菌
细菌的细胞壁与细胞膜
组成成分、功能特点
2024/3/27
细菌的特殊结构
荚膜、鞭毛、菌毛、芽孢
细菌的细胞质与核质
遗传物质、核糖体
13
细菌的生理与代谢
01
细菌的生长繁殖
生长曲线、繁殖方式
2024/3/27
微生物的分类
微生物包括细菌、病毒、真菌、放 线菌、立克次体、支原体、衣原体、 螺旋体等八大类。
4
微生物的形态与结构
细菌的形态与结构
细菌按形态可分为球菌、杆菌和螺形 菌三类。细菌的基本结构包括细胞壁、 细胞膜、细胞质和核质等。
病毒的形态与结构
病毒是一种非细胞形态的生物，其形态 多样，有球形、杆形、砖形、弹状、丝 状等。病毒的结构包括核酸和蛋白质外 壳两部分。
定义
医学微生物学是研究微生物与人体之间相互关系及其致病机理、 免疫机制、诊断与防治的科学。
2024/3/27
任务
揭示微生物的生物学特性、致病性、免疫性及其与宿主相互作 用规律，为疾病的预防、诊断、治疗提供科学依据。
9
医学微生物学的研究对象与内容
2024/3/27
研究对象
包括细菌、病毒、真菌、寄生虫等微 生物及其与人体之间的相互关系。
15
细菌与人类的关系
正常菌群与微生态平衡
菌群种类、数量、分布及作用
条件致病菌与机会性感染
感染条件、致病机制及预防措施
病原菌与感染性疾病
病原菌种类、致病物质及所致疾病举例
细菌在医学领域的应用

细菌的分类与命名

细菌的分类与命名

细菌的分类方法
传统分类法是临床细菌学检验的基础和依据。这种分
类法的参考书是：
Bergey’s manual of systemic bacteriology
Manual of clinical microbiology
世界畅销书
Diagnostic microbiology
全国临床检验操作规程
中文教科书
标准菌株的用处
(1)标准菌株的典型特征是实验室菌株分 类和鉴定的依据，其种名也是实验室菌 株命名的依据。 (2)标准菌株是临床细菌学检验质量控制 的标准。 (3)在科研中，如涉及细菌，必须使用标 准菌株作为参考菌株或直接使用标准菌 株作为实验材料，否则论文不能公开发 表或不能参加科研成果评定。
2．细菌的命名
(2)数值分类法：分类标记不分主次，而是同等重要看
待（等重要原则）。一般要选用50项以上的生物学特
征作为分类的依据，此分类法是细菌鉴定仪器化、自
动化、电算化的基础和原则，此法称数值分类法。
2．遗传学分类法：CDC分类系统
(1)DNAG+Cmol%测定：用加热变性法测定 两株菌G+Cmol%鉴别 1)不同属:两株菌DNAG+Cmol%相差1015%及以上 2)同属:两株菌DNAG+Cmol%之差<10-15% 3)同种不同亚种:两株菌DNAG+Cmol%之差 ≤4-5% 4)同种同亚种:两株菌DNAG+Cmol%之差 <2%
因为细菌的分类常使用科、属、种、型等分类单位，
细菌的科、属、种、型的数量大，为满足细菌分类需
要，常要求对细菌的科、属、种等进行命名，如
沙门
福氏志贺菌
志贺菌属 鲍特志贺菌

细菌的分类与命名

细菌的分类与命名

志”（IJSEM）原名“国际系统细菌学杂志” （IJSB）发表，如在其他杂志发表，必须提
交论文副本给该杂志公布，两年后无异议，
所提出的新细菌名称才能生效。
第二节 细菌的命名
• 细菌的命名依据国际细菌命名法规采用 “双名法”命名。即用“属名”加“种名” 来表示一个生物的学名。
• 书写时“属名”在前，用拉丁文或拉丁化 的名词表示，且第一个字母大写；“种名” 在后，用拉丁文或拉丁化的形容词或名词 所有格，小写。译成中文时，种名在前， 属名在后。
最重要和最基本的分类单元
• 在微生物分类中种是最重要和最基本 的分类单元，相似的种划归到一起构 成属，相似属构成科，依此类推，最 高的分类单元为界。
• 目前科和科以上的划分在细菌学中还 不太完善，而且随着研究的深入，科、 属的划分还会发生变动。
三、种和种以下分类单位及含义
1、种（species）
第1卷 一般医学和工业方面重要的G-细菌（1984年） 第2卷 放线菌以外的G＋细菌（1986年） 第3卷 古细菌、蓝细菌及其他G－细菌（1989年） 第4卷 放线菌（1989 年）
• 从2001年开始发行第2版，共分5卷，计划在数 年内出齐，内容将反映分子水平的细菌分类。
• 该书的姐妹篇是“伯吉氏细菌鉴定手册”
目前分类主要的依据 • 主要是根据种系发生关系，即分析其 基因的同源性，从而确定分类地位。 方法主要采用三种： 测定DNA分子中碱基(G+C)mol% 核酸分子杂交 16SrRNA寡核苷酸编目
五、细菌的分类体系
• 《伯吉氏系统细菌学手册》（Bergey’s Manual of Systematic Bacterology），由美国细菌学家Holt 主编，共四卷：

第6章细菌分类与命名

第6章细菌分类与命名
兽医微生物学
第六章
细菌的分类与命名
河南牧业经济学院动物医学系检疫检验教研室
兽医微生物学
目的要求
掌握细菌学常用的分类单位； 掌握细菌的命名及鉴定； 了解细菌分类鉴定的标准及其分类方法。
河南牧业经济学院动物医学系检疫检验教研室
兽医微生物学
主要内容
细菌的分类地位（重点） 细菌的命名（重点） 细菌分类鉴定的标准（了解） 细菌的分类方法（了解） 细菌的分类体系（了解） 细菌的鉴定（重大的是
《伯杰氏手册》。所以该书目前已成为对细菌 进行分类鉴定的主要参考书。
河南牧业经济学院动物医学系检疫检验教研室
兽医微生物学
DNA分子水平的鉴定主要限于专业实验室。 目前常用的细菌鉴定方法为表型特征鉴定法。 鉴定工作分三个步骤： ①获得该微生物的纯培养物 ②测定一系列必要的鉴定指标 ③查找权威性的鉴定手册。
河南牧业经济学院动物医学系检疫检验教研室
兽医微生物学
（一）形态学和生理生化特征
1．形态学特征 （1）细菌形态：形状、大小、排列 （2）培养特征：菌落特征 （3）特殊结构：鞭毛、芽孢、荚膜、孢子 （4）染色反应：革兰、抗酸 （5）内含物：异染颗粒、伴孢晶体 （6）运动性：
河南牧业经济学院动物医学系检疫检验教研室
在出版物中排成斜体。
而中文译名与拉丁文名顺序正好相反，即种名在前，属名在后。
如金黄色葡萄球菌： Staphylococcus aureus
（属名）
葡萄球菌
（种名）
金黄色
河南牧业经济学院动物医学系检疫检验教研室
兽医微生物学
只确定属名，未确定种名的某一株细菌，则在属名后加sp. （正体字）；如同属未定种名的若干菌株，则用spp. （species复数的简写）代替sp.。 如果是新种，则在学名后加上“sp. Nov.”，如 Lawsonia intracellularis gen. nov.,sp. nov.，译 为胞内劳森菌，新属，新种。 亚种用ssp.或subsp.（正体字），如Pasteurlla multocida ssp. septica，译为多杀性巴氏杆菌败血亚 种。

菌物的分类PPT课件

菌物的分类PPT课件
第4页/共21页
原生动物界、假菌界和真菌界的异同
细胞壁
线粒体的 嵴
原生动物 假菌界 界（黏菌） （卵菌）
营养阶段 纤维素 无细胞壁
管状
管状
真菌界 （真菌） 几丁质及 β-葡聚糖 平坦
赖氨酸合 二氨基庚 二氨基庚 α-氨基已 成途径 二酸(DAP) 二酸(DAP) 二酸(AAA)
第5页/共21页
二、菌物的分类系统
?原生动物界?集孢黏菌门?网柱黏菌门?黏菌门?根肿菌门?根肿菌纲?假菌界?丝壶菌门?网黏菌门?卵菌门?卵菌纲?真菌界?壶菌门?壶菌纲?接合菌门?接合菌纲?毛菌纲?子囊菌门?半子囊菌纲?不整囊菌纲?核菌纲?腔菌纲?盘菌纲?虫囊菌纲?担子菌门?担子菌纲?冬孢菌纲?黑粉菌纲?半知菌类?芽孢纲?丝孢纲?腔孢纲文档仅供参考如有不当之处请联系本人改正
内容分别被归在哪一界当中。
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谢谢您的观看！
第21页/共21页
第12页/共21页
2）变种(Variety ， Var.)、 亚种(Subspecies ， subsp.)：种下具 有一定的形态差异。
3）专化型(Forma specialis，f. sp.)：根据植物病原菌物种对 不同科、属的寄主植物的寄生专化性，在种的下面划分为 专化型。（如禾柄锈菌可根据寄生麦类情况划分为6个专化型。危害
真菌5个亚门的主要特征
亚门
鞭毛菌 接合菌 子囊菌 担子菌
半知菌
营 养 体 无性繁殖 有性生殖
原质团或没有隔 膜的菌丝体
游动孢子
菌丝体，典型的 没有隔膜
孢囊孢子
有隔膜的菌丝体， 少数是单细胞
分生孢子等
休眠孢子囊或 卵孢子 接合孢子
子囊孢子
有隔膜的菌丝体 不发达
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(一) 种（Species) 种是生物分类的基本单位。凡属同种 的生物，均具有共同的基本性状特征。 它是生物在一定演化阶段，具有相对稳 定的一定性状特征的实体。
2021
Байду номын сангаас
9
(二) 种以下的分类单位
1.亚种(subspecies)：种内可能存在一些
在某些性状上相互差异的类别。
2.型(type)与亚型(subtype)：仅仅是某一 方面的性状， 如血清型。型内还可按 进一步的性状差异区分为不同亚型。
2021
10
3.菌株(strain)（品系）：是指同种细菌 中不同来源的纯培养物。
具有典型特征的菌株称为典型株或代 表株或标准株。
不同菌株可能性状完全相同，也可能 有某种微小差异。
2021
11
六、细菌的命名
“双名法”命名（国际细菌命名规约）
由属名和种名两部分组成。属名（第一 字母大写）在前，种名在后。均用拉丁 文或拉丁化的文字表示。
DNA-DNA杂交试验(hybridization)
原理：同源DNA单链或非同源DNA单链， 只要它们彼此在核苷酸序列上有相应互 补的部分，就可产生不同程度的结合。
应用：通过在体外测定菌株间DNA的杂 合率，据此推算出DNA的相似程度，判 断它们在亲缘关系上的亲疏，帮助分类 鉴定。
2021
6
3）rRNA的分析 rRNA在遗传信息传递中起重要作用， 特别是16S rRNA能反映各种细菌间在 系统发生方面的关系。从该rRNA的碱 基序列可绘制系统发生树。
第六章 细菌的分类与命名
一、生物的分类 六界：动物界、植物界、真菌界、
原生生物界、原核生物界、病毒界。 细菌分类层次与其他生物相同，即：
界 、 门 、 纲 、 目 、 科 (Family) 、 属 (Genus)、种(Species)。
2021
1
二、细菌分类的指征
1. 形态学特性 2. 培养特性
2021
4
2．分子生物学分类法 （种系发生）
1）DNA中G+C摩尔百分数(%)含量测定
（G+C）mol%含量：某一生物 DNA中的 G+C配对碱基按摩尔数计算占全部碱基的 百分数。（反映该生物遗传性能的一种本 质特征）。
测定方法：梯度密度离心法、解链温度法 (Tm)等。
2021
5
2）DNA或RNA同源性的测定
2021
7
四、细菌的分类体系
细菌分类有三个主要体系
前苏联、法国、美国
《伯杰氏分类系统细菌学手册》，该手 册共四卷（1984-1989）。并于1994年 出版了《伯杰氏鉴定细菌学手册》第9 版，将细菌门分为33个部分，其中与兽 医学和医学有关的计13个部分。
2021
8
五、细菌种的划分和种以下的分类单位
3. 生活方式
4. 生理生化特性
5. 抗原构造
6. 对噬菌体的敏感性
7．对抗生素及其他化学物质的敏感性
8．病原性
9．遗传学特征。
2021
2
三、细菌分类的方法
1、数值分类法 2．分子生物学分类法 3．血清学方法： 共同抗原 4．化学分类法：比较细菌各种细胞成分
2021
3
1. 数值分类法
其分类范畴的基本单位是种，根 据比较细菌在形态、生理和生化 等方面的特性，计算出相似值来 确定种的分类归属。
翻译时，种名在前，属名在后。
如Staphylococcus aureus
• 未确定种名的细菌命名 ：在属名后加 上sp.或spp.。
• 新种的命名：在学名之后加注sp. nov. （novo species）。
• 亚种的命名：subsp.
2021
12