质粒DNA的提取
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质粒DNA的提取一、原理采用碱变性发抽提取质粒DNA。
该法是基于染色体DNA与质粒DNA的变性预复性的差异而达到分离目的的。
在PH大于12的碱性条件下,染色体DNA的氢键断裂,双螺旋结构解开变性。
质粒DNA的大部分氢键也断裂,但超螺旋共价闭合环状结构的两条互补链不会完全分离,当以pH5.2的乙酸钠高盐缓冲液调节其pH至中性时,变性的质粒DNA又恢复到原来的构型,保存在溶液中。
而染色体DNA不能复性而形成缠连的网状结构。
通过离心,染色体DNA与不稳定的大分子RNA,蛋白质-SDS复合物等一起沉淀下来而被除去。
二、方法1.挑取一环在LB固体培养基平板上生长的含PUC57质粒的大肠杆菌,接在含有100μg/ml氨苄青霉素(Amp)的LB液体培养基(5ml/15ml试管)中,37℃震摇培养过夜。
2.将1.5ml菌液加入微离心管中,14000r/min,离心10秒,其取上清液。
反复数次,收集全部菌体。
3.倾去上清,滤纸吸干。
4.加30μlTE缓冲液(10mmol/L Tris—HCl,1mmol/L EDTA,pH8.0),振荡起菌体。
5.加30μlTENS溶液(10mmol/L Tris—HCl, pH8.0,1mmol/L EDTA,0.1mol/LNaOH,0.5%SDS),震荡10秒至溶液变粘稠。
6.加150μl 3.0mol/LnaAC,震荡3—5S,14000r/min,离心3分钟,沉淀细胞碎片及染色体DNA。
7.上清液转移至另一微离心管中,甲等体积胞和酚,混匀,12000r/min,离心2分钟。
8.上层水相转移至另一位离心管,加2倍量冷水乙醇,14000r/min,离心20分钟。
9.倾去乙醇,加入7o%冷乙醇淋洗。
10.倾去乙醇,滤纸吸于,真空抽吸2~3分钟。
lI.加人50μlTE缓冲液,溶解DNA。
12,加入1μl核糖核酸酶(10mg/m1),14000r/min,离心2s,使核糖核酸酶与管底液体混匀。
质粒dna提取原理
质粒DNA提取原理是通过破坏细菌细胞壁和细胞膜结构,释
放质粒DNA,并利用化学方法提取纯化质粒DNA。
质粒DNA提取的步骤如下:
1. 细胞裂解:将细菌培养物经过离心,得到菌体沉淀,然后加入裂解缓冲液,破坏细菌细胞壁和细胞膜,释放质粒DNA。
2. 质粒DNA纯化:加入一定量的碱性溶液,使细菌染色体DNA变性沉淀,而质粒DNA仍溶于溶液中。
然后通过离心,将质粒DNA沉淀下来。
3. 质粒DNA沉淀:将溶液中的质粒DNA与乙醇混合,使质
粒DNA沉淀成片状。
通过离心,得到质粒DNA沉淀。
4. 质粒DNA溶解:将质粒DNA沉淀洗涤去除杂质,并用适
当的缓冲液将质粒DNA溶解,得到高浓度的质粒DNA。
质粒DNA提取的关键在于破坏细菌细胞结构,释放质粒DNA,然后利用沉淀和溶解等步骤进行纯化。
通过以上步骤,可以提取到纯化后的质粒DNA,用于后续实验或分析。
质粒DNA的提取方案一常规小量提取(碱裂解法)【实验目的】(1)掌握碱裂解法小量提取质粒DNA的原理及操作过程。
(2)掌握微量加样器的使用方法。
【实验原理】在NaOH存在的碱性环境(pH值12.0~12.6)中,线性的大分子量细菌染色体DNA变性,而共价闭环质粒DNA由于分子量小且缠绕紧密,仍为自然状态。
将pH值调至中性并有高盐浓度存在的条件下,染色体DNA之间交联形成不溶性网状结构,大部分DNA和蛋白质在去污剂SDS的作用下形成沉淀,而质粒DNA恢复可溶状态的。
通过离心,去除大部分细胞碎片、染色体DNA、RNA及蛋白质等物质,上清液中的质粒DNA可用酚/氯仿抽提。
【实验试剂】(1)溶液I:50mmol/L葡萄糖25mmol/LTris-HCl(pH值8.0)10mmol/LEDTA(pH值8.0)溶液I可成比配制,每瓶约100ml,在6.9×10°Pa(10lbf/in²)高压下蒸汽灭菌15min,贮存于4℃下。
(2)溶液Ⅱ:0.2mol/LNaOH(临用前用10mol/L贮存液稀释)1%SDS(3)溶液Ⅲ:5mol/L乙酸钾60ml冰乙酸11.5ml水28.5ml(4)酚(pH值7.8~8.0)。
(5)氯仿。
(6)TE缓冲液。
(7)6×DNA上样缓冲液。
(8)0.8%琼脂糖。
(9)无水乙醇。
【实验器材】(1)低温高速离心机。
(2)旋涡振荡器。
(3)Eppendorf管(EP管)。
(4)微量移液器。
(5)移液器头。
(6)电泳仪与电泳槽。
(7)紫外透射仪。
【实验样本】细菌(含某种质粒)。
【实验步骤】(1)将5ml菌液分次装入同一1.5mlEP管中,3000r/min离心5min,以收集菌体。
(2)将细菌沉淀重悬于100μl用冰预冷的溶液I中,剧烈振荡5min。
(3)加200μl新配制的溶液Ⅱ,盖紧管口,快速颠倒离心管5次,以混合内容物,不可强烈振荡,放置于冰上3min左右。
提取质粒dna的方法提取质粒DNA的方法是一种从生物样品中提取DNA的方法,用于分析基因组学、遗传学或其他基因相关的研究。
它是所有DNA技术的基础。
提取质粒DNA的方法主要包括三个步骤:破解细胞壁、提取DNA片段和提取DNA片段。
第一步,破解细胞壁。
为了提取细胞内的DNA,必须先破坏细胞壁。
这一步可以通过使用植物激素、酶和其他破坏细胞壁的物质来完成。
第二步,提取DNA片段。
在破坏细胞壁之后,生物样品中的DNA就可以从细胞内被提取出来。
这一步通常是将样品加入一定的溶液,如洗涤溶液,然后用放大器去提取DNA片段。
第三步,提取DNA片段。
在提取DNA片段之后,必须对其进行纯化处理,以便提取的DNA片段不会受到其他物质的干扰。
一般情况下,这一步是通过使用离心机将DNA 片段从溶液中分离出来,然后用水冲洗去除其他物质,最后得到纯净的DNA片段。
提取质粒DNA的方法也可以用来提取植物细胞内的DNA。
与提取动物细胞中的DNA不同,植物细胞内的DNA要更加困难,因为植物细胞周围可能有多层细胞壁,而这些细胞壁很难被破坏。
因此,植物细胞内的DNA提取一般都是采用化学方法,即使用碱性有机溶液,以破坏细胞壁,然后再用放大器提取DNA片段。
此外,还有一些无细胞DNA提取的方法,如PCR法、小RNA测序、质粒提取等。
PCR法是用来检测和检验DNA的一种技术,可以扩增微量DNA,从而获取充足的DNA材料进行检测。
小RNA测序是一种新型的基因测序技术,可以检测植物和动物体内特定的RNA,检测特定靶基因的表达。
最后,质粒提取是一种从生物样品中提取DNA质粒的技术,可以用于分子生物学研究,如基因克隆、DNA测序等。
总之,提取质粒DNA的方法是一种常用的DNA提取技术,也是所有DNA技术的基础。
它可以用于从动物和植物样品中提取DNA片段,以及从无细胞DNA中提取DNA质粒,以用于各种基因组学、遗传学和分子生物学研究。
质粒DNA的提取1. 引言质粒DNA提取是在分子生物学研究中常用的实验操作之一。
质粒是一类圆环状的DNA分子,存在于原核生物中。
质粒DNA提取的目的是为了获取纯度高的DNA样品,以便进行后续的实验操作,如聚合酶链式反应(PCR)、限制性酶切、测序等。
2. 实验材料在进行质粒DNA提取实验前,需要准备以下实验材料:•细菌培养液:含有所需质粒的培养液。
•碱裂解液:用于裂解细胞并释放质粒DNA的实验液。
•高盐含量的溶液:用于提取DNA。
•蛋白酶K:用于消化蛋白质。
•硅胶粉末:用于吸附DNA。
•乙醇:用于沉淀DNA。
•TE缓冲液:用于溶解和储存提取的质粒DNA。
3. 实验步骤3.1 细菌培养与收获首先,需进行细菌培养和收获,以获取含有所需质粒的培养液。
培养液中的细菌应为含有目标质粒的菌株,如大肠杆菌。
3.2 细胞破碎与质粒DNA释放将收获的细菌培养液进行离心,去除培养液并沉淀细胞。
然后将细胞重悬于碱裂解液中,用震荡器在适当的温度和时间条件下裂解细胞,释放质粒DNA。
3.3 蛋白质消化为了去除细胞中的蛋白质,加入适量的蛋白酶K,进行蛋白消化。
消化的时间和温度应根据实验要求进行调整。
蛋白消化完成后,通过离心将蛋白质沉淀分离。
3.4 DNA提取将消化液中的DNA溶液转移到其它离心管中,并加入高盐含量的溶液。
通过离心将DNA与其他杂质分离。
此步骤中,DNA会被溶液中的硅胶粉末吸附,以去除杂质。
3.5 DNA沉淀将去除杂质的DNA溶液转移到新的离心管中,加入冰冷的乙醇。
通过离心,将沉淀的DNA分离出来。
注意,在沉淀过程中,应避免DNA的过度离心,以免损坏DNA分子。
3.6 DNA溶解和储存将DNA沉淀后,溶解在适量的TE缓冲液中。
TE缓冲液具有适当的pH值和离子浓度,能够稳定DNA分子,并提供良好的保存条件。
4. 实验注意事项在质粒DNA提取实验中,需要注意以下几点:•操作过程应严格遵守无菌操作,避免外源性DNA的污染。
质粒dna提取步骤
质粒 DNA 提取是分子生物学实验中的一项基本技术,用于从细菌细胞中分离出质粒DNA。
以下是一般的质粒 DNA 提取步骤:
1. 收集细菌培养物:将含有质粒的细菌培养在适当的培养基上,直到培养物达到合适的密度。
可以使用离心或过滤的方法收集细菌细胞。
2. 细胞裂解:将收集的细菌细胞加入裂解缓冲液中,通过物理方法(如搅拌、超声处理等)或化学方法(如加入裂解酶等)使细胞破裂,释放出质粒 DNA 和其他细胞成分。
3. 去除细胞碎片:将裂解后的混合液通过离心或过滤的方法去除细胞碎片和其他杂质。
4. 沉淀 DNA:向裂解液中加入乙醇或异丙醇等沉淀剂,使质粒 DNA 沉淀。
通过离心将沉淀收集。
5. 洗涤沉淀:用 70%的乙醇洗涤沉淀,以去除残留的盐分和杂质。
6. 干燥沉淀:将洗涤后的沉淀离心,并去除上清液。
然后将沉淀在室温下干燥,以去除残留的乙醇。
7. 溶解 DNA:将干燥的沉淀加入适当的缓冲液中,使质粒 DNA 溶解。
可以在缓冲液中加入 RNA 酶以去除 RNA 杂质。
8. 纯化和浓缩 DNA:可以使用柱层析、电泳或其他方法对提取的质粒 DNA 进行进一步的纯化和浓缩。
9. 质量检测:使用琼脂糖凝胶电泳或其他适当的方法检测提取的质粒 DNA 的质量和完整性。
需要注意的是,具体的质粒 DNA 提取步骤可能因使用的试剂盒或实验条件而有所不同。
在进行质粒 DNA 提取之前,应仔细阅读所使用的试剂盒说明书或相关实验方案,并根据实际情况进行适当的调整和优化。
质粒DNA的提取一、实验方法碱裂解法抽提质粒DNA二、实验原理基于质粒DNA与染色体DNA变性与复性的差异。
三、实验步骤1)质粒提取1. 10,000g,1min离心收集1.5-5ml菌液沉淀于1.5ml离心管中。
2. 加入100μl溶液1,振荡至彻底悬浮。
3. 加入200μl溶液2,立即轻柔颠倒离心管6次,使菌体充分裂解,随后将离心管冰上放置3分钟4. 加入150μl溶液3,立即温和颠倒离心管数次,冰上放置3分钟,10,000g离心10min。
5. 将步骤4的上清转移至新的离心管(尽量去除杂质),加入等体积的苯酚/氯仿/异戊醇混合均匀10,000g离心5min。
6. 将步骤5的上清转移至新的离心管,加入2倍体积的无水乙醇,室温放置5-10min,沉降DNA7. 10,000g离心10分钟,弃乙醇,保留沉淀,加入1ml 70%的乙醇洗涤沉淀,10,000g离心5分钟8. 倒掉乙醇溶液,用吸水纸吸净管壁上的水珠,室温蒸发痕量乙醇9. 加入适量含RNase的TE或灭菌双蒸水溶解质粒DNA2)质粒鉴定→琼脂糖凝胶电泳灌胶:胶中加入荧光染料(SYBR Green I)加样:质粒+上样缓冲液→混匀电泳结果观察:UV灯下四、实验结果五、实验分析裂解细胞中除含有质粒DNA外,还含有基因组DNA、各种RNA、蛋白质和脂类等物质,因此用碱裂解法除去杂质1、防止DNA裂解:Solution 11)、所含糖增加溶液黏度,维持渗透压,防止DNA受机械剪切作用降解2)、所含EDTA抑制酶活性2、溶解与变性:Solution21)强碱使质粒DNA和染色体DNA变性2)离子型表面活性剂SDS可溶解膜蛋白3、沉降与复性:Solution31)质粒DNA复性2)在钾盐中,染色体DNA形成缠连的不溶性网状结构,和不稳定的大分子RNA以及变性的蛋白质和细菌碎片等一起沉淀预期结果为剩余质粒DNA4、琼脂糖凝胶电泳1)荧光染色染料分子可嵌入双链DNA分子配对碱基之间2)琼脂糖可起到电泳和分子筛的作用,因所带电荷、分子量大小和构型不同,泳动速度不同六、误差分析实验失败,本组实验出现4条带,3明1暗,明亮处应为DNA分子数最多的,为质粒DNA,质粒DNA前有较暗的两条带,推测其中一条为未复性质粒DNA,可能Solution2处变性过长,不易复性,或Solution3处时间过短,复性不充分。
实验8 质粒DNA的提取(碱裂解法)一、实验目的了解碱裂解法提取质粒的基本原理和主要应用,掌握碱裂解法提取质粒的实验方法和各种试剂在提取过程中的作用。
二、实验原理碱裂解法是利用细菌染色体DNA与质粒DNA结构的大小差异来分离质粒DNA的。
碱性(pH 12.0~12.5)条件可以破坏碱基配对,宿主和质粒DNA的碱基之间的氢键被破坏。
当条件恢复正常时(加入酸性试剂中和),共价闭合环状的质粒DNA会迅速准确地恢复配对,重新形成完全天然的超螺旋分子;而较大的细菌染色体DNA分子则难以复性,会交联形成不溶于水的线团结构,缠绕附着在细胞壁碎片上,离心时易被沉淀下来,而质粒DNA则留在上清液中,用异丙醇沉淀、70 %乙醇洗涤即可获得质粒DNA。
三、仪器设备微量取液器(2 μL;20 μL;200 μL;1 000 μL),tip头,手掌型离心机,1.5 mL离心管, 恒温水浴,制冰机,超净工作台,恒温培养箱。
振荡器,离心机,金属浴,电泳仪,凝胶成像仪。
四、实验试剂(1)溶液Ⅰ:50 mmol/L葡萄糖;20 mmol/L Tris·HCl(pH = 8.0);10 mmol/L EDTA(pH=8.0),高压蒸汽灭菌(121 ℃,0.105 Mpa)20 min。
4 ℃贮存。
(2)溶液Ⅱ(现用现配):0.2 mol/L NaOH;1 g / L SDS。
(3)溶液Ⅲ(pH 4.8):每100 mL溶液中含5 mol/L乙酸钾60 mL;冰乙酸11.5 mL;H2O 28.5 mL。
(4)RNase(10 mg / mL),LB液体培养基,氨苄青霉素,异丙醇,70 %(V / V)乙醇,无菌水。
五、实验方法(1)分装3 mL LB液体培养基和3 μL氨苄青霉素(50 mg/mL)于15 mL玻璃试管中。
(2)用灭菌牙签挑取一白色单克隆,放入玻璃管内,置37 ℃恒温摇床中以200转/min培养,至OD600=2.0。
质粒提取原理和方法质粒提取是从细菌基因组中提取出质粒DNA的一种方法。
它是分子生物学和遗传工程中常用的技术,可用于质粒的纯化和制备。
质粒提取的原理主要基于以下几个步骤:1.细菌培养:首先,我们需要将含有目标质粒的细菌培养在适当的培养基上,通过高速离心将细菌收集起来。
2.细菌溶解:将培养物进行离心,分离菌落。
然后采用一定的细胞破碎方法,如超声波震荡、冻融等,将细菌细胞壁破坏,使质粒DNA释放到溶液中。
3.质粒分离:通过离心将细菌碎片、蛋白质等杂质与质粒DNA分离。
一般是通过两次离心来完成,第一次较低速离心用于去除细菌碎片和细胞蛋白质,第二次较高速离心用于沉淀质粒DNA。
4.DNA纯化:将质粒DNA从上一步得到的沉淀物中提取出来。
可以使用酚/氯仿法、硅胶柱法、商用试剂盒等方法进行纯化。
其中酚/氯仿法是较为常用的方法,它可以将DNA溶于水相,而蛋白质和其他的污染物则溶于有机相。
5.DNA沉淀:将纯化得到的DNA溶液加入适量的酒精沉淀剂(如乙醇或异丙醇),再次进行高速离心,使DNA沉淀到离心管底部。
6.DNA洗涤:将离心管底部形成的DNA沉淀用70%乙醇洗涤,去除酒精沉淀剂和其他杂质。
然后用空气吹干,最后用一定体积的纯水或缓冲液溶解。
质粒提取的方法根据实验需求不同和实验室条件的不同可以有所差异,常用的方法有以下几种:1.酚/氯仿法:这是一种经典的DNA提取方法,它将质粒DNA溶于三氯甲烷和酚的混合物中,蛋白质和其他污染物则溶于酚相。
离心去除酚相,再用异丙醇沉淀DNA,最后用70%乙醇洗涤。
2.硅胶柱法:这是一种基于硅胶柱的离心柱技术,可用于高通量的质粒提取。
DNA样品在硅胶柱中被结合,杂质被洗掉,最后用纯水或缓冲液洗提质粒DNA。
3.磁珠法:这是一种基于磁性珠子的质粒提取方法,通过在磁性珠子表面修饰DNA结合物,使质粒DNA与磁性珠子结合。
通过外加磁场将磁性珠子与DNA一起沉淀,然后去除上清液,最后用纯水洗提DNA。
质粒DNA提取方案碱裂解法的原理是利用碱性溶液来打断细菌细胞壁和细胞膜,从而释放质粒DNA。
以下是一种常用的碱裂解法质粒DNA提取方案:材料和试剂:1.细菌培养物(含有质粒的细菌株)2.稀释缓冲液(例如TE缓冲液,pH8.0)3.碱性溶液(例如10%SDS和0.2NNaOH的混合液)4.中和缓冲液(例如3M醋酸和5MNaCl的混合液)5.离心管和离心机6.微量移液器和离心管管盖7.筛网或滤纸(用于分离细菌细胞碎片)步骤:1.将适量的细菌培养物加入离心管中。
2.离心管离心,收集细菌细胞沉淀。
3.弃去上清液。
4.加入适量的稀释缓冲液,悬浮细菌细胞。
5.离心管离心,收集细菌细胞沉淀。
6.弃去上清液。
7.加入适量的碱性溶液,充分混匀。
8.将离心管放入70°C水浴中,孵育5分钟。
9.在离心机中以最大转速离心10分钟,以沉淀细菌细胞碎片。
10.弃去上清液。
11.加入适量的中和缓冲液,充分混匀。
12.在离心机中以最大转速离心10分钟,收集质粒DNA沉淀。
13.弃去上清液。
14.用适量的冷稀释缓冲液溶解质粒DNA沉淀。
15.使用微量移液器将溶解的质粒DNA转移到干净的离心管中。
16.使用筛网或滤纸分离细菌细胞碎片。
17.将离心管盖盖好,储存质粒DNA在-20°C冰箱中。
注意事项:1. 操作过程中尽量保持洁净和细菌污染的最小可能性,并勿让细菌接触到DNase。
2.在所有步骤中尽量避免剧烈振荡和搅拌,以防止DNA的破坏。
3.稀释缓冲液、碱性溶液和中和缓冲液的配方可以根据实验需求进行调整。
以上是一种常用的碱裂解法质粒DNA提取方案,该方法简单可行,适用于实验室中常见的质粒DNA提取需求。
在实际操作过程中,可以根据实验要求和具体样本进行一定的调整和优化。
质粒dna 的提取和基因组dna的提取以质粒DNA的提取和基因组DNA的提取为标题,本文将分别介绍质粒DNA和基因组DNA的提取方法。
一、质粒DNA的提取质粒DNA是存在于细菌细胞内的一个环状DNA分子,它具有独立复制和转录的能力。
质粒DNA的提取是进行基因工程研究和分子生物学实验的重要步骤之一。
质粒DNA的提取方法一般包括以下步骤:1.细菌培养与收获:首先选取含有目标质粒的细菌菌株进行培养,培养至适宜的生长阶段,然后通过离心将细菌菌体收获。
2.细菌菌体破碎:将收获的细菌菌体进行破碎,破碎方法常用的有物理破碎和化学破碎。
物理破碎可以通过超声波处理或高压破碎等方法进行;化学破碎则常使用蛋白酶K等酶进行。
3.质粒DNA的分离:通过离心将破碎后的细菌细胞碎片与其他细胞组分进行分离。
常用的方法包括差速离心和密度梯度离心等。
4.质粒DNA的纯化:将分离得到的质粒DNA进行纯化,去除杂质和其他核酸。
纯化方法常用的有酚-氯仿法、硅胶柱层析法和离子交换层析法等。
5.质粒DNA的测定:对提取得到的质粒DNA进行浓度和纯度的测定,常用的方法有比色法和紫外分光光度法等。
二、基因组DNA的提取基因组DNA是一个生物体内所有基因的总和,它包含了生物体的全部遗传信息。
基因组DNA的提取是进行基因组学研究和遗传分析的重要步骤之一。
基因组DNA的提取方法一般包括以下步骤:1.样品处理:首先选择合适的样品,如动物组织、植物组织或微生物等,然后对样品进行预处理,如细胞破碎、蛋白酶处理等。
2.细胞破碎:将样品中的细胞破碎,使细胞内的DNA释放出来。
破碎方法常用的有物理破碎和化学破碎。
物理破碎可以通过高温、高压或超声波处理等方法进行;化学破碎则常使用蛋白酶K等酶进行。
3.基因组DNA的分离:通过离心将破碎后的细胞碎片与其他细胞组分进行分离。
常用的方法包括差速离心和密度梯度离心等。
4.基因组DNA的纯化:将分离得到的基因组DNA进行纯化,去除杂质和其他核酸。
质粒DNA的提取一、目的学习碱裂解法提取质粒的原理二、原理质粒是一种染色体外的稳定遗传因子,具有双链闭环结构的DNA分子。
它具有自主复制能力,能使子代细胞保持它们恒定的拷贝数,可表达它携带的遗传信息。
目前,经人工改造的质粒已广泛用作基因工程中目的基因的运载工具——载体。
质粒DNA的提取是依据质粒DNA分子较染色体DNA分子小,且具有超螺旋共价闭合环状的特点,从而将质粒DNA与大肠杆菌染色体DNA分离。
现在常用的方法有:碱裂解法、密度梯度离心法、煮沸裂解法等。
实验室普遍采用的碱裂解法具有操作简便、快速、得率高的优点。
其主要原理:利用染色体DNA与质粒DNA的变性与复性的差异而达到分离的目的。
在碱变性条件下,染色体DNA的氢键断裂,双螺旋解开而变性,质粒DNA氢键也大部分断裂,双螺旋也有部分解开,但共价闭合环状结构的两条互补链不会完全分离,当pH=4.8的乙酸钠将其pH调到中性时,变性的质粒DNA又恢复到原来的构型,而染色体DNA不能复性,形成缠绕的致密网状结构,离心后,由于浮力密度不同,染色体DNA与大分子RNA、蛋白质-SDS复合物等一起沉淀下来而被除去。
三、实验材料、试剂与主要仪器(一)实验材料含质粒的大肠杆菌GFP、P38(二)试剂1、LB液体培养基:胰蛋白胨10g,酵母提取物5g,NaCl 10g,溶解于1000mL蒸馏水中,用NaOH调pH至7.0。
高压灭菌20分钟。
2、LB平板培养基:在每1000mL LB液体培养基中中加入15g琼脂,高压灭菌20分钟。
3、溶液Ⅰ:50mmol/L 葡萄糖,10mmol/L EDTA,25mmol/L Tris-HCl(pH 8.0)。
4、溶液Ⅱ:0.2mol/L NaOH,1% SDS。
(必须新鲜配制)5、溶液Ⅲ:pH4.8的醋酸钾溶液(5mo1/L乙酸钾60 ml,冰乙酸11.5 ml,水28.5ml)。
6、TE缓冲液(pH 8.0):10 mmol/L Tris-HCl,1mmol/ L EDTA。
质粒dna提取的方法
提取质粒DNA的常用方法主要有:
1. 碱裂解法:将含有质粒DNA的细菌株进行裂解,使细菌质粒DNA与蛋白质分离。
一般使用碱性裂解缓冲液(如0.2 M NaOH)和含有细菌裂解酶(如SDS)的胰酶溶液进行裂解,然后使用中性盐溶液(如3 M醋酸钠)进行酸性沉淀,最后通过离心分离沉淀的质粒DNA。
2. 除菌剂法:使用含有除菌剂(如SDS)的裂解缓冲液直接裂解细菌细胞,使质粒DNA与细菌蛋白质分离。
然后使用物理方法(如离心)分离DNA和蛋白质,最后使用醋酸盐沉淀法分离质粒DNA。
3. 膜裂解法:将含有质粒DNA的细菌株均匀涂在含有质粒DNA结合断裂物的特殊膜上,经裂解后,膜上会形成质粒DNA的斑点。
然后使用洗脱缓冲液将质粒DNA从膜上洗脱,得到纯化的质粒DNA。
4. 商业化质粒DNA提取试剂盒:市面上有各种质粒DNA提取试剂盒可供选择,这些试剂盒能够提供简便、快速、高产量且高质量的质粒DNA纯化方法。
根据试剂盒的不同,步骤和原理会有所区别。
不同的方法适用于不同的实验目的和样品类型,请根据具体情况选择合适的提取方法。
质粒dna的提取实验报告引言:DNA是生命的基本遗传物质,研究DNA的结构和功能对于理解生命的本质具有重要意义。
在分子生物学实验中,质粒DNA的提取是一项关键步骤,它能够帮助我们获得足够纯度和数量的DNA样本,以便进行后续的实验分析。
本实验旨在提取质粒DNA,并验证提取效果和纯度。
材料和方法:1. 细菌培养:选择含有目标质粒的菌落进行预培养,接种至100ml含有适当抗生素的LB培养基中,37℃摇床培养过夜。
2. 提取质粒DNA:使用质粒DNA提取试剂盒,按照说明书进行操作。
主要步骤包括细菌离心、细菌裂解、质粒DNA与蛋白质分离、质粒DNA沉淀和洗涤等。
3. DNA质量和浓度检测:使用紫外分光光度计检测提取得到的DNA样品的260nm吸光度值,计算DNA浓度。
结果和讨论:量和浓度的检测。
质检测结果显示,提取得到的质粒DNA纯度较高,吸光度比值(A260/A280)在1.8-2.0之间,说明DNA中没有明显的蛋白污染。
这对于后续实验如聚合酶链式反应(PCR)等有着重要的影响。
同时,我们还测定了DNA的浓度,得到了大致的目标值,为1μg/μl左右。
在实验过程中,我们需要注意一些关键点,例如细菌的培养条件、细菌离心和裂解的时间和速度、蛋白质分离的温度等。
这些因素都会对质粒DNA的提取效果产生影响,需要精确控制,保证实验结果的准确性。
质粒DNA的提取是分子生物学实验的常见步骤之一,其应用广泛。
例如,可以将提取得到的DNA用于质粒转染、DNA测序、基因克隆等研究中。
同时,提取得到的质粒DNA也可以用于分子诊断、疾病基因检测等临床应用。
结论:提取效果和纯度。
提取得到的DNA可以广泛应用于分子生物学及医学研究领域,为后续的实验工作提供了坚实的基础。
总结:质粒DNA的提取是分子生物学实验中不可或缺的一环。
本实验通过严谨的操作步骤和质量检测,成功地提取了高纯度、适量的质粒DNA。
在今后的实验工作中,我们将继续基于这些DNA 样本,进一步开展相关研究,推动科学的发展和创新。
现代生化技术实验报告学院:基础医学院姓名:陈美玲学号:20161104392班级:大学城学术4班实验一质粒DNA的提取、纯化、鉴定限切酶酶切分析、琼脂糖电泳凝胶一、实验目的:(1)通过本次实验学习和掌握碱裂解法提取质粒;(2)通过本次实验学习琼脂糖凝胶电泳检测DNA的方法和技术;二、实验原理:1)质粒DNA的提取:(1)关于质粒:质粒是一类存在于几乎所有细菌中染色体之外(细胞质中)呈游离状态的双链、闭环的DNA 分子。
质粒通常携带有染色体上所不存在的能够表达产生抗生素、耐受重金属等重要性状的基因。
细菌质粒的大小范围从1kb至200kb以上不等,且拥有自己的复制起始位点,可不依赖于染色体而进行独立自主复制。
一些小的质粒利用宿主细胞的酶进行复制,而较大的质粒则自身携有复制与编码的有关酶。
(2)一般分离质粒DNA的方法都包括3个步骤:①培养细菌,使质粒DNA大量扩增;②收集和裂解细菌;③分离和纯化质粒DNA。
分离制备质粒DNA的方法很多,其中常用的方法有碱裂解法、煮沸法、SDS法、羟基磷灰石层析法等。
在实际操作中可以根据宿主菌株类型、质粒分子大小、碱基组成和结构等特点以及质粒DNA的用途进行选择。
(3)碱裂解法提取大肠杆菌质粒DNA的原理:碱裂解法提取质粒DNA是根据共价闭合环状质粒DNA和线性染色体DNA在拓扑学上的差异来分离质粒DNA。
在pH值介于12.0~12.5这个狭窄的范围内,线性的DNA双螺旋结构解开而变性,尽管在这样的条件下,共价闭环质粒DNA的氢键会被断裂,但两条互补链彼此相互盘绕,仍会紧密地结合在一起。
当加入pH4.8乙酸钾高盐缓冲液恢复pH至中性时,共价闭合环状的质粒DNA 的两条互补链仍保持在一起,因此复性迅速而准确;而线性的染色体DNA的两条互补链彼此已完全分开,因复性较缓慢且不准确而相互缠绕形成不溶性网状结构。
而复性的质粒DNA 恢复原来构型,保持可溶性状态。
通过离心,染色体DNA与不稳定的大分子RNA,蛋白质-SDS 复合物等一起沉淀下来而被除去,最后用酚氯仿可以抽提纯化上清液中的质粒DNA。
2)质粒DNA的琼脂糖凝胶电泳:(1)关于电泳技术:电泳常用于分离和纯化那些分子大小、电荷性状或分个构象有所不同的生物大分子——尤其是蛋白质和核酸。
正因为如此,电泳已成为生物化学和分子生物学中应用最为广泛的技术之一,其中在分子生物学实验中最为常用的是琼脂糖凝胶电泳。
琼脂糖是一种海藻多糖,琼脂糖胶分离范围很大,但其分辨率却相对较低。
通过改变琼脂糖凝胶的浓度,应用标准的电泳技术可以分离200到50,000 bp 大小的 DNA 片断。
一般琼脂糖胶浓度在0.5%到4%之间,且琼脂糖凝胶浓度越大,凝胶就越硬。
较高浓度的琼脂糖胶有利于较小的DNA片断分离,而较低浓度的琼脂糖胶则可以分离较大的DNA片断。
(2)琼脂糖凝胶电泳条带的观察:通过观察示踪染料的迁移距离可以判断DNA的迁移距离。
溴酚蓝染料在琼脂糖凝胶的迁移速率大小与300和4000bp大小的双链DNA片断相同。
当迁移足够距离后,就可以通过Gelview染色来观察DNA片断。
Gelview是一种荧光染料。
它可以在做胶时混入其中在电泳时进行染色,也可以待电泳完成后将凝胶浸泡在稀释的Gelview 溶液中进行染色。
但必须将凝胶置于紫外透射仪中才可以对凝胶中的DNA或RNA进行观察。
(3)质粒DNA的琼脂糖凝胶电泳分离:DNA分子在琼脂糖凝胶中泳动时有电荷效应和分子筛效应,DNA分子在高于等电点的pH溶液环境中带负电荷,在电场中向正极移动,由于磷酸骨架在结构上的重复性质,相同数量的双链DNA几乎具有等量的净电荷,因此它们能以相同的速度向正极移动。
在一定的电场强度下,DNA分子的迁移速度取决于分子筛效应,即DNA分子本身的构型和大小。
具有不同分子质量或者不同构型的DNA分子泳动速率不一样,可以进行分离。
未切割的质粒DNA在其泳道上也许会出现几个条带,之所以这样是由于质粒DNA在琼脂糖凝胶中的迁移距离是由其分子构象及其碱基对大小所决定的。
质粒DNA以下列三种主要构象中的任何一种形式存在:①超螺旋DNA:尽管质粒通常以开环的形式进行描述,然而在细菌细胞内DNA链即是盘绕在组蛋白周围形成一种致密的结构。
这就是所谓超螺旋结构,由于其结构致密,它在凝胶中的泳动速度最快。
②线性DNA:当DNA损伤在DNA双链相对应的两条链上同时产生切口时,就会出现线性质粒DNA,这种DNA的泳动速率介于超螺旋与切口质粒DNA之间。
③开环DNA:在质粒DNA复制过程中,拓扑异构酶I会在DNA双螺旋中的一条链中引入一个切口,解开质粒的超螺旋。
在质粒分离过程中由于物理剪切和酶的切割作用同样也会在超螺旋质粒中引入切口从而产生松散的开环结构。
这种形式的质粒迁移速率最慢,其“松散”的分子形式阻碍了它在琼脂糖凝胶中的运动。
三、实验器材:(1)实验仪器:恒温培养箱、恒温摇床、高速离心机、漩涡振荡器、超净工作台、高压灭菌锅、微量加样器、烧杯、量筒、玻璃棒、微波炉、天平、电泳梳子、电泳槽、电泳器、紫外灯(2)材料与试剂:①溶液I(Solution Ⅰ):50mmol/L 葡萄糖;25mmol/L 三羟基甲基氨基甲烷(Tris)Tris-HCl(pH8.0);10mmol/L 乙二胺四乙酸(EDTA) pH8.0溶液I可成批配制,每瓶约100ml,10磅高压蒸气灭菌15分钟,贮存于4℃。
②溶液Ⅱ(Solution Ⅱ):新鲜配制,等体积混合0.2mol/L NaOH(临用前用10mol/L贮存液现用现稀释);1% SDS (可用10%贮存液稀释配制)注意:SDS易产生气泡,不要剧烈搅拌。
③溶液III (Solution Ⅲ,100mL):加上后混匀会形成絮状沉淀60mL 5mol/L KAc,11.5mL 冰醋酸,28.5mL H2O (该溶液钾离子浓度为3mol/L,醋酸根离子浓度为5mol/L)④TE液缓冲液:10 mmol/L Tris-HCl(pH8.0);1 mmol/L EDTA(pH8.0)⑤70% 乙醇;⑥平衡酚:氯仿 1:1:将量取25 ml Tris-HCl(pH8.0)平衡苯酚,加入24 ml 氯仿和 1 ml 异戊醇,充分混合后,移入棕色玻璃瓶中,4℃保存。
⑦LB培养基:胰化蛋白胨 10g酵母提取物 5gNaCl 15gpH 7.0⑧琼脂糖(Agarose);⑨1 liter(升)5×TBE备用溶液(stock solution):54g tris base,27.5g 硼酸(boric acid),20ml 0.5 mol/L EDTA , pH 8.0;⑩6×凝胶加样缓冲液:0.25% 溴酚蓝(bromophenol blue),40% 蔗糖(sucrose in water);另外还有的试剂是:胰RNA酶、DNA Marker、硼酸、Gelview试剂(2)实验材料:含有pUC19质粒的大肠杆菌等。
四、实验步骤及注意事项:第一部分:质粒DNA的提取及酶切(1)向留有菌体沉淀的离心管中加入200ul溶液I,使用移液器切底悬浮细菌沉淀。
(2)向离心管中加入200 μl 溶液Ⅱ悬浮细菌沉淀,盖紧管口,轻缓上下翻转5次,使菌体充分裂解。
注意:温和地混合,不要剧烈震荡,以免打断基因组DNA,造成提取的质粒中混有基因组DNA片段。
此时菌液应变得清亮粘稠,所用时间不应超过5分钟,以免质粒受到破坏。
(3)向离心管中加200 μl溶液Ⅲ,盖紧管口,轻缓上下5次颠倒离心管以混合内容物。
充分混匀,此时将出现白色絮状沉淀,12000转离心10分钟。
注意:P3加入后应立即混合,避免产生局部沉淀,如果上清中还有微小白色沉淀,可再次离心后取上清。
(4)将上一步收集的上清液用移液器转移到吸附柱CP3中(吸附柱放入收集管中),注意尽量不要吸出沉淀。
12000转离心1分钟,倒掉收集管中的的废液。
将吸附柱CP3放入收集管中。
(5)将吸附柱CP3加入500ul漂洗液A,12000转离心1分钟,倒掉收集管中的废液,将吸附柱CP3放入收集管中。
(6))将吸附柱CP3加入700ul漂洗液B,12000转离心1分钟,倒掉收集管中的废液,将吸附柱CP3放入收集管中。
(7)12000转离心2分钟,目的是将吸附柱残余的漂洗液去除。
注意:漂洗液中的乙醇的残留会影响后续的酶反应(酶切,PCR等)实验。
为确保下游实验不受乙醇的影响,将建议CP3开盖,置于室温放置数分钟,已切底晾干吸附材料中残余漂洗液。
(8)将吸附柱CP3置于一个干净的离心管中,向吸附膜的中间部位滴加40ul洗脱缓冲液,室温放置2分钟,12000转离心2分钟,将质粒溶液收集到离心管中。
第二部分:质粒DNA的琼脂糖凝胶电泳1)凝胶的制备(Preparation of the gel)(1)制备1%琼脂糖凝胶:称取0.5g琼脂糖,放人锥形瓶中,加入50mL的 0.5×TBE 缓冲液,放入微波炉加热至完全溶化,则为0.5%琼脂糖凝胶液(由于蒸发作用,溶解前在容量瓶上作一个记号,溶解后用三蒸水补足);(2)制胶器的安装:①取多功能制胶器,洗净,晾干;②将多功能制胶器放置于一水平位置,选择12×6cm制胶架,然后选择1.5mm 18teeth的梳子(最大加样量25µl);③将所选择规格的梳子插入制胶架的定位槽中;(3)将熔化的琼脂糖凝胶液转入Gelview专用的三角瓶中,然后加入Gelview 5µl;(4)将冷到60℃左右的琼脂糖凝胶液,缓缓倒入所选择的制胶槽内,直至有机玻璃板上形成一层均匀的胶面(注意不要形成气泡);(5)待胶凝固后(30-60min),轻轻拔掉梳子,将凝胶盘从制胶槽中取出,放入电泳槽内;(6)加入电泳缓冲液(0.5×)至电泳槽中;Ⅱ. 加样(Loading DNA samples):用移液枪缓慢将DNA样品及其经过酶切的质粒DNA样品垂直加入加样孔直至开口下方(记录点样顺序,以便作为对照和分析),各加样量如下:DNA samples :15µl 酶切的DNA样品:3µlLoading buffer:2µl DNA markers :6µl(DNA samples与Loading buffer总共加入20µl)Ⅲ. 电泳(Gel):(1)接通电泳槽与电泳仪的电源(注意正负极,DNA片段从负极向正极移动)。
保持电压120V;(2)当溴酚蓝染料移动到凝胶总长度一半处时,停止电泳;Ⅳ. Gel Interpretation (凝胶图像解释):将电泳后的凝胶放在紫外灯的照射下进行DNA电泳条带的观察,并用凝胶电泳成像系统进行拍照、分析。