两个马氏珠母贝养殖群体遗传多样性微卫星分析_闫学春
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马氏珠母贝养殖群体早期生长阶段的遗传多样性与有效亲本数量估计李俊辉;刘青云;杜晓东;邓岳文;王庆恒【摘要】In this paper the effects of selection for faster growth on genetic diversity and effective population size in the stock of pearl oysterPinctada fucata martensiiis reported. In May of 2012,a stock was established by the breeders collected from Daya Bay wild population. The female and male breeder numbers were 30 and 20,respectively. Selection practices were performed at days 6,23 and 80 after fertilization. The selection percentage was 50% at each time. Animals were sampled at days 3,30 and 120 after fertilization. Genetic diversity and effective population size were analyzed by using eight SSR primer pairs. The results showed that the average numbers of alleles at each sampling time were 3.750,3.875 and3.625,respectively. The average observed heterozygosities in the stock at each sampling time were 0.3242,0.5273 and 0.3724,respectively. The average expected heterozygosities in the stock at each sampling time were 0.5511,0.5613 and 0.5048,respectively. Effective population sizes at each sampling time were 38,28 and 30,respectively. A decrease in effective population size at each sampling time relative to the number of breeders used to develop the stock was detected. The present results suggested that selection practices could result in decreases in genetic diversity and effective population size in the stock of pearl oysterP.fucata martensii.%从大亚湾野生群体选择亲本繁育1个养殖群体,受精第6天、23天与80天分别进行优选,按50%选留比率选留快生长个体,分别在受精后第3天、30天120天取样,利用8对SSR标记分析养殖群体遗传多样性与估计有效亲本数量。
马氏珠母贝(Pinctada martensii)2个不同地理种群遗传变异的EST-SSR分析侯战辉;王嫣;石耀华;顾志峰;王爱民【期刊名称】《海洋与湖沼》【年(卷),期】2008(39)2【摘要】应用17个EST-SSR位点分析表明,马氏珠母贝印度种群和三亚种群的平均FST值为0.486,两个种群的分化程度高;三亚种群的等位基因数为1-6,有效等位基因数为1.0-3.3;印度种群的等位基因数为2-7,有效等位基因数为1.1-3.3;三亚种群和印度种群的平均有效等位基因数分别是1.8和1.9;三亚种群和印度种群的等位基因丰度分别为3.16和3.39;印度种群无论是期望杂合度(HE)还是观察杂合度(HO)都高于三亚种群,印度种群的期望杂合度和观察杂合度分别是0.42和0.16;三亚种群的期望杂合度和观察杂合度分别是0.38和0.15;三亚种群与印度种群的Nei's遗传距离为1.119.两个种群都保持了中等水平遗传多样性.由于两个种群高度的遗传分化和保持丰富的遗传多样性为开展两个种群间杂交及获得杂种优势奠定了基础.【总页数】6页(P178-183)【作者】侯战辉;王嫣;石耀华;顾志峰;王爱民【作者单位】热带生物资源教育部重点实验室,海南大学海洋学院,海南省热带水生生物技术重点实验室,海口,570228;热带生物资源教育部重点实验室,海南大学海洋学院,海南省热带水生生物技术重点实验室,海口,570228;热带生物资源教育部重点实验室,海南大学海洋学院,海南省热带水生生物技术重点实验室,海口,570228;热带生物资源教育部重点实验室,海南大学海洋学院,海南省热带水生生物技术重点实验室,海口,570228;热带生物资源教育部重点实验室,海南大学海洋学院,海南省热带水生生物技术重点实验室,海口,570228【正文语种】中文【中图分类】Q953【相关文献】1.马氏珠母贝(Pinctada martensii)四种壳色选育系F_5的生长及遗传多样性分析 [J], 朱晓闻;刘志刚;王辉;邬思荣2.马氏珠母贝(Pinctada martensii)2个地理群体杂交子代的杂种优势和遗传变异[J], 王爱民;王嫣;顾志峰;黎明;石耀华;李思发3.马氏珠母贝两个不同地理种群的形态性状和贝壳珍珠质颜色比较分析 [J], 顾志峰;王嫣;石耀华;方建光;王清印;毛玉泽;王爱民4.马氏珠母贝不同地理种群内自繁和种群间杂交子一代形态性状参数及相关性分析[J], 王爱民;石耀华;周志刚5.马氏珠母贝不同地理种群内自繁和种群间杂交子一代感染多毛类寄生病的分析[J], 王爱民;阎冰;叶力;兰国宝因版权原因,仅展示原文概要,查看原文内容请购买。
马氏珠母贝选育系遗传结构的SSR分析的开题报告
一、选题背景和研究意义
马氏珠母贝是一种重要的经济性质贝类,主要分布在全球温带和亚
热带海域,其高度的育种效率使得它成为海洋经济中的重要品种。
然而,基于传统鉴别技术繁琐且费时,同时也存在一定误差。
因此,采用分子
标记技术,特别是SSR(微卫星)技术可以很好地促进马氏珠母贝良种
选育和培育。
二、研究内容和目标
本研究的主要目的是通过SSR技术分析含五对特定位点基因的遗传
结构,为马氏珠母贝选育系的建立和质量评估提供有力的分子基础。
三、研究方法和步骤
1.提取DNA样本,通过PCR对其进行扩增;
2.筛选SSR标记,在筛选中加入特定位点的基因进行筛选;
3.基于多态性位点的数据构建遗传关系网络,发现个体之间的遗传
差异及其遗传群体结构。
四、期望的研究结果
本研究将通过分析马氏珠母贝选育系中的SSR位点结构,得到该物
种种群遗传多样性和遗传结构相关信息,为马氏珠母贝的遗传育种提供
分子基础。
同时,本研究的结果也将有助于加强马氏珠母贝的品种鉴定,保护与管理。
马氏珠母贝3个野生种群及种群间杂交后代遗传多样性的ISSR分析吕林兰;杜晓东;王嫣;石耀华;王爱民【期刊名称】《水生生物学报》【年(卷),期】2008(32)1【摘要】运用ISSR分子标记技术分析了马氏珠母贝(Pinctada martensii)广西北海(BW)、广东大亚湾(DW)和海南三亚(SW)野生种群及其自繁子一代(BB1、SS1、DD1)和杂交子一代(BS1、BD1、DS1)9个群体各50个个体的遗传多样性.结果表明:3个野生群体遗传多样性分别是0.2585、0.2607和0.2571;3个自繁群体子一代遗传多样性分别是0.2504、0.2545和0.2527,3个杂交子一代遗传多样性分别是0.2747、0.2659和0.2784.种群间杂交增加了子代的遗传多样性,同时增加了杂交子一代与杂交亲本间的遗传距离,而自繁群体的遗传多样性与其来源的野生种群比较,遗传多样性降低.本文指出利用野生群体进行杂交育种应该纯化亲本才能获得杂种优势,人工育苗或选择性育种需要保持足够数量的繁殖亲本以避免遗传多样性降低.【总页数】7页(P26-32)【作者】吕林兰;杜晓东;王嫣;石耀华;王爱民【作者单位】盐城工学院,盐城,224003;广东海洋大学,湛江,524025;海南大学海洋学院,海口,570228;海南省热带水生生物技术重点实验室,海口,570228;广东海洋大学,湛江,524025;海南大学海洋学院,海口,570228;海南省热带水生生物技术重点实验室,海口,570228;海南大学海洋学院,海口,570228;海南省热带水生生物技术重点实验室,海口,570228;海南大学海洋学院,海口,570228;海南省热带水生生物技术重点实验室,海口,570228【正文语种】中文【中图分类】Q344+.5【相关文献】1.秦岭山区美容杜鹃五个野生种群遗传多样性的ISSR分析 [J], 赵冰;郑茜子;李厚华2.深圳梅林仙湖苏铁野生种群遗传多样性ISSR分析 [J], 王晓明;赖燕玲;徐向明;应站明;苏应娟;李月波;廖文波3.三个野生种群马氏珠母贝遗传多样性的RAPD分析 [J], 王爱民;阎冰;叶力;邓凤娇;张锡元;武波4.马氏珠母贝大亚湾和三亚野生种群内自繁及种群间杂交一代的RAPD分析 [J], 王爱民;丁小雷;邓凤姣;叶力;阎冰5.野生坛紫菜种群遗传多样性的ISSR分析 [J], 陈昌生;谢潮添;纪德华;徐燕;郭留超因版权原因,仅展示原文概要,查看原文内容请购买。
介绍两个马氏珠母贝新品种
喻达辉;王爱民
【期刊名称】《农村百事通》
【年(卷),期】2017(0)1
【摘要】南珍1号:是由中国水产科学研究院南海水产研究所培育,以广东徐闻、广西北海和海南三亚3个合浦珠母贝养殖群体为亲本来源构建基础群体,以生长速度为选育指标,采用家系选育技术,经连续4代选育而成的马氏珠母贝。
2015年经全国水产原种和良种审定委员会审定为新品种,命名为南珍1号。
南珍1号贝壳斜四方形,壳顶位于前方,后耳大,前耳稍小。
背缘平直,腹缘圆。
边缘鳞片层紧密,末端稍翘起。
同心生长轮脉极细密,呈片状。
【总页数】1页(P36)
【作者】喻达辉;王爱民
【作者单位】
【正文语种】中文
【相关文献】
1.介绍两个葡萄新品种 [J], 杨立柱;郭紫娟;赵胜建
2.介绍两个葡萄新品种 [J], 杨立柱;郭紫娟;赵胜建
3.介绍两个高类黄酮含量苹果新品种 [J], 王楠; 陈学森
4.亳州市农业科学研究院育成并通过国审的两个小麦新品种渊封面介绍冤 [J],
5.北京市农林科学院杂交小麦研究所培育的两个小麦新品种(封面介绍) [J],
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马氏珠母贝贝壳珍珠质层厚度性状与微卫星标记的相关性分析战欣;陈琼;顾志峰;石耀华;王爱民【期刊名称】《热带生物学报》【年(卷),期】2016(007)003【摘要】运用科研型光学相干断层扫描仪测量了341个马氏珠母贝贝壳内表面珍珠质层的厚度,同时分析了这341个贝壳内表面珍珠质层厚度性状与5个微卫星标记的相关性.结果表明:其中4个微卫星位点(2PM206,4PM34,4PMS0和PM6)与检测的珠层厚度性状的相关性达到显著水平(P<0.05);2PM206标记173/173基因型个体的贝壳珍珠质层厚度的平均值、4PM34标记189/189基因型个体对应的性状平均值、4PM50标记201/205基因型个体的珍珠质层厚度值和PM6标记260/266基因型个体对应的珍珠层厚度平均值较同一标记的其他基因型均为最大值;4PMS0标记中含有209 bp等位基因个体的珍珠层厚度平均值均低于其他基因型,209 bp等位基因可能与贝壳珍珠质层厚度性状之间存在负相关关系.【总页数】6页(P290-295)【作者】战欣;陈琼;顾志峰;石耀华;王爱民【作者单位】海南大学海洋学院/热带生物资源教育部重点实验室/海南省热带水生生物技术重点实验室,海口570228;海南大学海洋学院/热带生物资源教育部重点实验室/海南省热带水生生物技术重点实验室,海口570228;海南大学海洋学院/热带生物资源教育部重点实验室/海南省热带水生生物技术重点实验室,海口570228;海南大学海洋学院/热带生物资源教育部重点实验室/海南省热带水生生物技术重点实验室,海口570228;海南大学海洋学院/热带生物资源教育部重点实验室/海南省热带水生生物技术重点实验室,海口570228【正文语种】中文【中图分类】S968.31+6.1【相关文献】1.哲罗鲑微卫星标记与重要生长性状的相关性分析 [J], 杨贵强;袁丁;马国庆;王占全;贺杰;周云2.马氏珠母贝生长性状与珍珠质量和珍珠层厚度的相关分析 [J], 王庆恒;逯云召;邓岳文;杜晓东3.马氏珠母贝两个不同地理种群的形态性状和贝壳珍珠质颜色比较分析 [J], 顾志峰;王嫣;石耀华;方建光;王清印;毛玉泽;王爱民4.源于鳞被相关基因的微卫星标记与鲤4种生长性状的相关性分析 [J], 肖同乾;鲁翠云;李超;曹顶臣;程磊;孙效文5.杂交鳜(Siniperca chuatsi×Siniperca scherzeri)微卫星标记与主要生长性状的相关性分析 [J], 李燕;董晓丽;郑先虎因版权原因,仅展示原文概要,查看原文内容请购买。
合浦珠母贝2个野生种群的遗传多样性杜晓东;李广丽;刘志刚;叶富良;王如才【期刊名称】《中国水产科学》【年(卷),期】2002(009)002【摘要】用形态特征比较与同工酶电泳分析相结合的方法,对产于我国北部湾和大亚湾的野生合浦珠母贝(Pinctada martensii)的遗传多样性进行研究.结果表明,在贝壳形态方面,北部湾种群的平均壳长与壳高都略大于大亚湾种群,壳高与壳长呈乘幂相关,壳宽与壳长呈对数相关.大亚湾种群的壳宽指数、壳重指数和肥满度指标都大于北部湾种群.用聚丙烯酰胺梯度凝胶电泳检测由26个位点编码的12种同工酶,2种群都显示出较高的多态性,北部湾种群多态位点的比率为38.46%,大亚湾种群则为46.15%.都表现出明显的杂合子缺失现象,北部湾种群的平均杂合度(0.099 9)小于大亚湾种群(0.124 3).2种群之间的遗传距离为0.0159.本文还讨论了引起2种群杂合子缺失现象的原因,并认为生化遗传分析的结果与2个种群的形态特征是相关联的.【总页数】6页(P100-105)【作者】杜晓东;李广丽;刘志刚;叶富良;王如才【作者单位】青岛海洋大学,水产学院,山东,青岛,266003;湛江海洋大学,水产学院,广东,湛江,524025;湛江海洋大学,水产学院,广东,湛江,524025;湛江海洋大学,水产学院,广东,湛江,524025;青岛海洋大学,水产学院,山东,青岛,266003【正文语种】中文【中图分类】Q959.215【相关文献】1.合浦珠母贝两个野生种群的生化遗传变异 [J], 李广丽;杜晓东;叶富良2.马氏珠母贝3个野生种群及种群间杂交后代遗传多样性的ISSR分析 [J], 吕林兰;杜晓东;王嫣;石耀华;王爱民3.基于ISSR标记的南方红豆杉野生种群和迁地保护种群的遗传多样性和遗传结构分析 [J], 李乃伟;贺善安;束晓春;汪庆;夏冰;彭峰4.中国极小种群野生植物亟待保护——55种极小种群野生植物面临野外灭绝的危险专家呼吁实施全国极小种群野生植物保护工程 [J],5.基于mtDNACytb基因序列的我国不同水系野生鲇种群遗传多样性与种群历史分析 [J], 徐丹丹;黄燕;曾庆;李斌;彭作刚因版权原因,仅展示原文概要,查看原文内容请购买。
两个马氏珠母贝养殖群体遗传多样性微卫星分析闫学春;佟广香;匡友谊;梁利群;孙效文【期刊名称】《水产学杂志》【年(卷),期】2009(022)001【摘要】以两个马氏珠母贝(Pinctada martensii Dunker)养殖群体为对象,采用微卫星分子标记技术对两个群体的遗传结构进行了研究,分析了各群体内的遗传多样性和两个群体间的遗传分化.结果表明,在广东养殖贝和三亚养殖贝群体中,分别获得232和230条扩增片段,两群体的平均观测杂合度分别为0.28和0.29,平均多态信息含量分别为0.44和0.46,平均有效等位基因数分别为2.25和2.13,显示两个群体的群体遗传多样性水平相差较小(p<0.05),两群体间遗传变异性小,其遗传多样性处于中等水平.两个养殖群体的基因分化系数(GST)为0.0448,群体之间属于轻度偏中度分化水平.【总页数】5页(P5-9)【作者】闫学春;佟广香;匡友谊;梁利群;孙效文【作者单位】中国水产科学研究院黑龙江水产研究所,农业部水产生物技术重点开放实验室,黑龙江,哈尔滨,150070;中国水产科学研究院黑龙江水产研究所,农业部水产生物技术重点开放实验室,黑龙江,哈尔滨,150070;中国水产科学研究院黑龙江水产研究所,农业部水产生物技术重点开放实验室,黑龙江,哈尔滨,150070;中国水产科学研究院黑龙江水产研究所,农业部水产生物技术重点开放实验室,黑龙江,哈尔滨,150070;中国水产科学研究院黑龙江水产研究所,农业部水产生物技术重点开放实验室,黑龙江,哈尔滨,150070【正文语种】中文【中图分类】Q953【相关文献】1.鲤野生和养殖群体遗传多样性分析中的微卫星(SSLP)分析 [J], 梁利群;冯国军;常玉梅;汪海燕2.利用微卫星标记分析军曹鱼养殖群体的遗传多样性 [J], 李伟强; 汤保贵; 陈刚; 马骞; 黄建盛; 施钢; 潘传豪; 周晖; 谢瑞涛; 张健东3.不同凡纳滨对虾养殖群体的微卫星遗传多样性分析 [J], 唐芳;温贝妮;刘红4.不同凡纳滨对虾养殖群体的微卫星遗传多样性分析 [J], 唐芳;温贝妮;刘红5.利用微卫星标记分析马氏珠母贝4个养殖群体遗传结构 [J], 赵晓霞;邓岳文;杜晓东;王庆恒;黄荣莲;卢婧因版权原因,仅展示原文概要,查看原文内容请购买。
文章编号:1005-3832(2009)01-0005-05第22卷第1期2009年3月水产学杂志CHINESE JOURNAL FISHERIESVol.22,No.1Mar.2009DNA 分子标记自1980年出现以来,先后有RFLP 、RAPD 、AFLP 、SSLP 等多种分子标记,并已广泛用于动、植物遗传连锁图谱的构建及重要基因的定位和克隆。
微卫星(Microsatellite )是一类以2~5个核苷酸为基本单位,多次串联重复的DNA 序列,具有数量多、分布广且均匀、多态性丰富、分析快速等优点,已成为遗传图谱构建、功能基因定位、标记QTL 、连锁分析、标记辅助选择、检测种群内遗传变异和种群间遗传距离等多项研究中的重要标记[1,2]。
鱼类微卫星研究进展很快,目前已在鲑、鳟、鲶、鳕、鲤、鲫、金鱼、斑马鱼、罗非鱼、日本河豚等几十种鱼类中分离到微卫星序列。
马氏珠母贝(又称合浦珠母贝)是我国和世界海水珍珠的主要种类。
自上世纪六十年代中期我国马氏珠母贝人工育苗取得成功并大批量生产之后,其养殖种苗则完全为人工苗,养殖规模因此得到很两个马氏珠母贝养殖群体遗传多样性微卫星分析闫学春,佟广香,匡友谊,梁利群,孙效文(中国水产科学研究院黑龙江水产研究所,农业部水产生物技术重点开放实验室,黑龙江哈尔滨150070)摘要:以两个马氏珠母贝(Pinctada martensii Dunker )养殖群体为对象,采用微卫星分子标记技术对两个群体的遗传结构进行了研究,分析了各群体内的遗传多样性和两个群体间的遗传分化。
结果表明,在广东养殖贝和三亚养殖贝群体中,分别获得232和230条扩增片段,两群体的平均观测杂合度分别为0.28和0.29,平均多态信息含量分别为0.44和0.46,平均有效等位基因数分别为2.25和2.13,显示两个群体的群体遗传多样性水平相差较小(p<0.05),两群体间遗传变异性小,其遗传多样性处于中等水平。
两个养殖群体的基因分化系数(GST )为0.0448,群体之间属于轻度偏中度分化水平。
关键词:马氏珠母贝;微卫星;养殖群体;遗传多样性中图分类号:Q953文献标识码:AAnalysis of Genetic Diversity Between in Two Cultured Populations of Pinctada MartensiiDunker Cultured Populations Using Microsatellite MarkersYAN Xue-chun ,TONG Guang-xiang ,KUANG You-yi ,LING Li-qun ,SUN Xiao-wen(Heilongjiang River Fishery Research Institute,Chinese Academy of Fishery Sciences ,Harbin 150070,China )Abstract:In this experiment,we utilized microsatellite loci to study the genetic structureion of two cultured populations of Pinctada Martensii Dunke.RThe results showed that 232and 230reproducible fragments were detected in CZ and SY cultured population,respectively;the mean value of the observed heterozygosity,the polymorphism information content (PIC)and the valid allele number in CZ and SY populations was were 0.28and 0.29in CZ and SY cultured population,respectively;the average of polymorphism information content (PIC)was 0.44and 0.46in CZ and SY cultured population,respectively;the average valid allele number was 2.25and 2.13in CZ and SY cultured population,respectively.This indicated that there existed a slight genetic variation diversity (P<0.05)differentiation between two populations which have were moderately differentiateddiversities.The value of GST was 0.0448between two populationsthem,demonstrating which these two populations have a were weaker slightly differentiationed.Key words:Pinctada martensii ;Microsatellite ;Cultured population ;Genetic diversity收稿日期:2009-01-05基金项目:中国水产科学研究院水产种质资源与养殖技术重点开放实验室开放基金;国家自然科技资源共享平台资助项目(2005DKA30470).作者简介:闫学春(1964-),男,副研究员,主要从事鱼类基因工程育种.大的发展,但由于养殖密度大,盲目追求高产,缺乏优良的养殖新品种,造成种质资源严重退化,使其养殖群体对野生群体的影响也越来越大[3]。
为了解养殖对马氏珠母贝遗传多样性的影响,利用本实验室自克隆的马氏珠母贝微卫星标记对马氏珠母贝养殖群体基因组DNA进行了遗传分析,以期进一步揭示养殖马氏珠母贝的遗传背景,为提高马氏珠母贝的养殖性状,保护马氏珠母贝种质资源,培育其优良品种积累数据。
1材料和方法1.1实验动物的获得及引物、试剂实验用马氏珠母贝采自广东养殖贝(群体A,22尾)和三亚养殖贝(群体B,22尾)。
本研究所使用的8个微卫星DNA标记,均为本实验室采用磁珠富集与同位素杂交相结合在马氏珠母贝全基因组中筛选微卫星获得的。
引物由上海生工生物工程技术服务有限公司合成,DNA分子量Marker为Promega公司的300bp-2500bp DNA Ladder。
为国产分析纯。
1.2基因组DNA提取取0.2g闭壳肌,0.8%生理盐水漂洗后,置于1.5ml离心管中,加入0.5ml STE[10mmol/L Tris. HCl、pH8.0,1mmol/L EDTA(PH8.0),100mmol/L NaCl]、65μL10%SDS和6μL蛋白酶k(10mg/mL),55℃消化,依次以等体积酚/氯仿(酚∶氯仿∶异戊醇=25∶24∶1)和氯仿/异戊醇(氯仿∶异戊醇= 24∶1)各抽提2次,然后加入无水乙醇沉淀,70%乙醇洗涤,于室温干燥,0.1×TE溶解备用。
选择合适的反应条件,进行PCR扩增。
1.3PCR反应PCR扩增反应总体积为25μL,其中包括DNA 模板1μL(30~50ng/μL),10×PCR buffer18μL (含M g2+(25mmol/L)1μL、dATP、dGTP、dTTP、dCTP 各2mmol/L)、上下游引物(10μmol/L)各0.5μL, Taq DNA聚合酶(上海生工)1U,加ddH2O补足体系。
扩增反应在PE9700型PCR(PE公司)上完成。
反应程序为:94℃变性3min;94℃30s,50-56℃30s,72℃30s,38个循环;72℃延伸5min。
引物序列及具体退火温度情况见表1。
1.4扩增产物电泳分析用8%非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳8~12h(120V),银染[4],利用扫描仪成像。
根据标准GeneRuler T M 100bp DNA Laddder计算扩增片段的大小,确定个体基因型。
1.5数据统计方法用gel-pro4.5分析电泳图谱,并进行基因分型操作。
利用popgene3.2进行基因频率、等位基因数、杂合度分析。
统计分析各位点上的多态性信息含量PIC[5],公式如下:PIC=1-ni=1ΣP i2-n-1i=1Σnj=i+1Σ2P i2P j2,其中,n为位点的等位基因数,P i/P j为每个位点第i/j个等位基因频率,K 为位点数。
2结果2.1电泳结果基因组DNA经过相应的引物扩增和电泳后,能够较为清晰地显示出各个等位基因,HLJM24微卫星标记在群体A和群体B中的电泳结果如图1、图2所示。
10个微卫星位点所检测出的等位基因数、等位基因频、杂合度和多态信息含量,见表2。
2.2群体遗传多样性分析两个群体的各等位基因数都在2~4之间,杂合度在0.05~0.82之间,两个群体的平均观测杂合度(H o)和多态信息含量(PIC)均较低,有效等位基因数与实测等位基因数较接近,在群体A中,有5个高度多态坐位,2个中度多态座位和1个低度多态座位,平均多态信息含量为0.44;在群体B中,有4个高度多态坐位,3个中度多态座位和1个低度多态座位,平均多态信息含量为0.46。
根据Ne i氏无偏标准遗传距离公式计算得出,两个群体的遗传一致度为0.9444,遗传距离为0.0572。
说明两个群体的遗传多样性程度处于中等水平。
2.3群体间遗传分析不同种群的等位基因差异Fisher's模式分析及固定系数见表3,其中位点HLJM24和HLJM30表现出极显著差异(P<0.05),其他的几个位点在各个群体中是均匀分布的。
根据总的基因多样性(Fit)和群体内基因多样性(Fis),计算不同群体间的分化水平(G ST),两个养殖群体的基因分化系数(G ST)为0.0448。
水产学杂志第22卷·6·图2养殖群体B 在HLJM24微卫星座位扩增图谱Fig.2Electrophore gram of HLJM24in cultured population of B 表1马氏珠母贝微卫星引物序列Tab.1Microsatellite primer pairs for Pinctada martensii位点locus HLJM 19HLJM 20HLJM 24HLJM 29HLJM 30HLJM 31HLJM 36正向引物序列forward primerF :GCAAGTGCGAATGGGAAT F :CCATACCCACCCACCATC F :CTTTCCGTTGGTATGTGA F :GGTTATTTTCCTCTTACA F :TTGCTACTACACATCCCT F :ACACGAATGGACATAGCG F ATGTAGTGACCACAGCGG 反向引物序列reverse primerR :AACATAAACTGGAGATGGGTCA R :TATCAAAGTCGGGAGGCA R :TACTTTGTCTTCTATGCTGTT R :ACATACAAACAGACAGCA R :ATCGTGTGATTGTGTGTT R :AGGTATTCCAAAGGTGCC R :TACCCAAAAGGTTGAGAA 退火温度annealingtemperature (℃)56565356525355图1养殖群体A 在HLJM24微卫星座位扩增图谱Fig .1ElectrophoregramofHLJM24inculturedpopulationofA1期闫学春等:两个马氏珠母贝养殖群体遗传多样性微卫星分析表2马氏珠母贝10个微卫星座位在两个群体的遗传多样性统计Tab.2Genetic diversity statistics for the 10microsatellite loci in the two cultivated populations of Pinctata martensi 座位locusHLJM 29HLJM 19HLJM 20HLJM 24HLJM 38HLJM 30HLJM 31HLJM 36等位基因数(A )1.00~4.001.00~2.001.00~3.001.00~3.001.00~4.001.00~2.001.00~2.001.00~3.00等位基因频率allele (P )0.11~0.500.82~0.180.20~0.460.14~0.550.07~0.480.60~0.410.91~0.100.14~0.43观测杂合度(Ho )0.520.360.450.140.320.100.090.27期望杂合度(He )0.660.300.640.580.640.480.170.61有效等位基因数(Ne )2.951.422.742.402.771.941.202.55多态信息含量(PIC )0.610.250.560.510.570.370.150.53等位基因数alleles(A )1.00~4.001.00~2.001.00~3.001.00~3.001.00~4.001.00~2.001.00~2.001.00~3.00等位基因频率allele (P )0.02~0.360.86~0.140.23~0.550.16~0.430.05~0.480.23~0.770.98~0.020.18~0.52观测杂合度(Ho )0.410.270.550.360.230.090.050.32期望杂合度(He )0.680.240.600.620.580.350.040.61有效等位基因数(Ne )3.091.312.502.642.391.541.052.54多态信息含量(PIC )0.610.210.530.540.490.290.430.54群体A population A群体B population B·7·表3马氏珠母贝两个种群等位基因差异的Fisher,s检验概率和固定系数Tab.3The Fish's test probability and fixed quotiety of allele differentiation between two populations of Pinctata martensi 基因位点locusHLJM29 HLJM19 HLJM20 HLJM24概率(P)0.056250.77260.56050.01013标准误差(SE)0.001030.00080.0020.0005基因分化系数(Gst)0.02820.00390.00870.0447基因位点locusHLJM30HLJM31HLJM36HLJM38概率(P)0.001280.35780.40670.3458标准误差(SE)0.00010.010.0020.009基因分化系数(Gst)0.13680.02170.01180.1028等位基因差异differenceof alleles等位基因差异differenceof alleles3讨论3.1群体的遗传多样性多态信息含量(polymorphism in formation content,PIC)是衡量一个基因片段在一个群体中多态性的指标。