苏州市立医院本部关于荧光定量PCR等询价采购公告(2020)
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实用妇科内分泌杂志Journal Of Practical Gynecologic Endocrinology1102017 年8月C 第4卷/第24期Aug.C 2017 V ol.4 No.24实时荧光定量PCR(RT-PCR)检测NG、UU和CT及MG结果分析李美珠,杨洁飞,李启欣(佛山市第一人民医院,广东佛山 528000)【摘要】目的 RNA恒温扩增实时荧光定量PCR(RT-PCR)检测淋病奈瑟菌(NG)、解脲脲原体(UU)、沙眼衣原体(CT)及生殖支原体(MG)结果。
方法选择我院2016年6月至2017年7月拟诊为泌尿生殖道感染患者的宫颈或者尿道分泌物标本426例,选择培养法对UU、MG及NG病原体进行检测,选择胶体金免疫层析法来对CT抗原进行检测,同时选择RT-PCR来对NG、UU、 MG和CT的核酸进行检测。
结果在病原体检出阳性率方面,RT-PCR检测显著高于金标法或者培养法检测,差异有统计学意义(P<0.05)。
结论在对NG、UU、 MG和CT感染进行检查诊断,采用RT-PCR检测NG、UU、MG和CT具有非常重要的作用,能对常规方法进行有效补充,值得临床推广和应用。
【关键词】荧光定量PCR;淋病奈瑟菌;解脲脲原体;沙眼衣原体;生殖支原体【中图分类号】R695 【文献标识码】B 【文章编号】ISSN.2095-8803.2017.24.110.02非淋菌性尿道炎和淋病是临床中发生率较高的性传播疾病,会引起女性盆腔炎、宫体炎、不孕、宫颈炎、输卵管炎和男性前列腺炎、附睾炎、尿道炎等,除此之外还可能引起女性早产、流产和宫颈癌等,会严重危害患者的生命健康和安全[1]。
泌尿生殖道感染的病原体主要为淋病奈瑟菌(NG)、解脲脲原体(UU)、沙眼衣原体(CT),生殖支原体(MG),而病原体常常表现为共同感染状态。
在临床表现方面,非淋菌性尿道炎和慢性淋病比较类似,临床中常常不能有效明确诊断。
在实际的临床诊断中,传统实验室检测方法存在一定的不足之处,在现代医学技术快速发展和进步的过程中,RT-PCR在临床中的应用也越来越广泛,该方法具有自动化、定量、快速、特异、敏感等特点[2]。
禽源性病毒荧光定量PCR(Q-PCR)检查法本法适用于禽源性生物制品的检测,包括流感全病毒灭活疫苗、流感病毒裂解疫苗种子批毒种的外源性禽病毒检测。
本法用提取的供试品RNA,反转录成cDNA后,或用提取的供试品DNA,针对3种外源性禽病毒设计特异性引物探针,进行荧光定量PCR 检测特异性扩增信号,从而测定供试品中外源性禽源病毒核酸序列,以检查供试品的外源性禽病毒污染。
要求检测的 3 种禽源性病毒:(1)禽腺病毒I 型(DNA 病毒)(2)禽腺病毒III 型(DNA 病毒)(3)外源性禽白血病病毒(逆转录病毒)试剂(1)RNA/DNA 提取试剂:RNA/DNA 的提取可使用酚-氯仿法、磁珠法、离心柱法等。
提取试剂中应含裂解液、洗涤液、洗脱液等,按试剂说明书要求配制。
(2)反转录试剂:含逆转录酶、RNA 酶抑制剂、dNTP 混合液、随机引物、逆转录反应缓冲液等,按试剂说明书要求配制。
(3)引物序列、探针序列见表1。
表 1 引物序列及探针序列(4)扩增缓冲液每20µl 反应体系中,含有上下游引物各5µmol,探针2.5µmol及适量荧光定量PCR混合液(Mix)。
(5)质粒标准品稀释液为DNA 稀释缓冲液或无RNA 酶水稀释。
(6)对照溶液以失活后无感染性的禽源性病毒为阳性对照。
以无RNA 酶水作为阴性对照。
提取核酸和逆转录步骤同(1),置-70℃保存备用。
(7)质粒标准品溶液及灵敏度供试品的制备选择病毒目的核酸序列,人工合成DNA,目的序列转入pMD19-T 质粒中,作为质粒标准品。
测定质粒标准品的DNA 核酸浓度后,对其进行10 倍稀释,从109Copies/µl 稀释至100Copies/µl。
取107Copies/µl~103Copies/µl 质粒标准品溶液作标准曲线各点。
101Copies/µl 稀释度作为灵敏度对照。
2023年全国临床检验质量指标初步质量规范备注:2023年全国临床检验质量指标初步质量规范的建立是基于2022年全国多省临床检验中心同步开展临床检验质量指标室间质评结果,其中最低质量规范基于第25百分位数(或第75百分位数),适当质量规范基于第50百分位数,最佳质量规范基于第75百分位数(或第25百分位数)质量指标初步质量规范三级医院二级医院最低适当最佳最低适当最佳率(%)σ率(%)σ率(%)σ率(%)σ率(%)σ率(%)σ血标本类型错误率0.0187 5.10.0052 5.40.0009 5.80.0236 5.00.0031 5.50 6.0体液标本类型错误率0.0385 4.90.0055 5.40 6.00.0207 5.00 6.00 6.0其他标本类型错误率0.0283 4.90 6.00 6.00 6.00 6.00 6.0标本类型错误率0.0236 5.00.0078 5.30.0017 5.60.0268 5.00.0046 5.40 6.0血标本容器错误率0.0152 5.10.0057 5.40.0013 5.70.0168 5.10.0034 5.50 6.0体液标本容器错误率0.0287 4.90.0049 5.40 6.00.0229 5.00 6.00 6.0其他标本容器错误率0.0120 5.20 6.00 6.00 6.00 6.00 6.0标本容器错误率0.0177 5.10.0068 5.30.0019 5.60.0210 5.00.0043 5.40 6.0血标本采集量错误率0.0319 4.90.0128 5.20.0038 5.50.0369 4.90.0096 5.20 6.0体液标本采集量错误率0.0506 4.80.0079 5.30 6.00.0379 4.90 6.00 6.0其他标本采集量错误率0.0075 5.30 6.00 6.00 6.00 6.00 6.0标本采集量错误率0.0367 4.90.0147 5.10.0046 5.40.0414 4.80.0107 5.20 6.0抗凝血标本凝集率0.1344 4.50.0584 4.70.0192 5.10.0970 4.60.0317 4.90.0049 5.4抗凝体液标本凝集率0.5526 4.00 6.00 6.00.8230 3.90 6.00 6.0抗凝其他标本凝集率 1.7808 3.60 6.00 6.00.8262 3.90 6.00 6.0抗凝标本凝集率0.1356 4.50.0582 4.70.0191 5.10.0972 4.60.0314 4.90.0043 5.4标本溶血率0.0315 4.90.0104 5.20.0023 5.60.0482 4.80.0121 5.20.0002 6.0标本溶血率’0.0404 4.80.0139 5.10.0031 5.50.0613 4.70.0158 5.10.0007 5.8血标本丢失率0 6.00 6.00 6.00 6.00 6.00 6.0体液标本丢失率0 6.00 6.00 6.00 6.00 6.00 6.0其他标本丢失率0 6.00 6.00 6.00 6.00 6.00 6.0标本丢失率0 6.00 6.00 6.00 6.00 6.00 6.0检验报告不正确率0.0142 5.10.0004 6.00 6.00.0144 5.10 6.00 6.0危急值通报率100 6.0100 6.0100 6.0100 6.0100 6.0100 6.0危急值通报及时率99.8673 4.5100 6.0100 6.0100 6.0100 6.0100 6.0血培养污染率 1.1980 3.80.5348 4.10.0846 4.60.8333 3.90.1389 4.50 6.0室内质控项目开展率50.8065 1.571.4286 2.188.9610 2.738.9408 1.257.4803 1.779.5082 2.3室内质控项目CV不合格率 4.2254 3.20.4695 4.10 6.07.6923 2.9 1.1205 3.80 6.0室间质评项目参加率87.6404 2.798.6301 3.7100 6.078.1250 2.3100 6.0100 6.0室间质评项目不合格率 2.5641 3.40.6135 4.00 6.0 4.2373 3.20.7092 4.00 6.0实验室间比对率 1.8692010.60610.333.3333 1.100 3.7594020.00000.7国家级室间质评项目参加率86.1789 2.698.6755 3.7100 6.0 5.00000100 6.0100 6.0国家级室间质评项目不合格率 3.0303 3.4 1.0363 3.80 6.0 1.2821 3.70 6.00 6.0省级室间质评项目参加率94.1520 3.1100 6.0100 6.092.3077 2.9100 6.0100 6.0省级室间质评项目不合格率 1.9608 3.60 6.00 6.0 4.6875 3.2 1.2658 3.70 6.0质量指标初步质量规范(周转时间(分钟))三级医院二级医院最低适当最佳最低适当最佳急诊检验前周转时间中位数生化312315301810自动化免疫342515302010三大常规302011261510凝血302215301510常规(住院)检验前周转时间中位数生化906041604830自动化免疫926041605030三大常规815733603830凝血805735604030急诊实验室内周转时间中位数生化604734604730自动化免疫896045706035三大常规261813302015凝血463529403028常规(住院)实验室内周转时间中位数生化1241007312011560自动化免疫1891319818012081三大常规593627603030凝血906045816039。
实时荧光定量PCR目前实时荧光定量PCR已得到广泛应用,如:扩增特异性分析、基因定量分析、基因分型、SNP分析等......荧光定量PCR最常用的方法是DNA结合染料SYBR Green I 的非特异性方法和Taqman水解探针的特异性方法SYBR Green I 的非特异性方法(试剂盒:LightCycler 480 SYBR Green I Master)SYBR Green I是一种结合于所有dsDNA双螺旋小沟区域的具有绿色激发波长的染料。
在游离状态下,SYBR Green I发出微弱的荧光,但一旦与双链DNA结合后,荧光大大增强。
因此,SYBR Green I的荧光信号强度与双链DNA的数量相关,可以根据荧光信号检测出PCR 体系存在的双链DNA数量。
一、实验前准备:实验试剂及耗材:试剂:特异性PCR引物,新鲜提取备用的总RNA试剂盒:Transcriptor First Strand cDNA Synthesis Kit、LightCycler 480 SYBR Green I Master1号管包含:热启动Taq DNA Polymerase、反应缓冲液、dNTP mix、SYBR Green I染料、MgCI2仪器及耗材:罗氏LightCycler 480全自动实时定量PCR仪以及配套使用的48或96孔板;Thermo Scientific Arktik PCR仪、F1单道移液器、冰盒、QSP盒装吸头等正式实验开始前,冰上解冻各个试剂【注意:SYBR Green I Master 需要避光放置】二、反转录实验操作时注意:所有RNA相关的操作均需要佩戴手套,防止RNase污染。
严格按照试剂盒使用说明进行相关操作。
按照体系配方在冰上的Rnasefree的灭菌PCR管中配置Templateprimer mix,总体系13ul。
本实验是联合使用anchored oligo dT引物和随机六聚体引物进行的反转录。
苏州市立医院本部关于荧光定量PCR等询价采购公告(2020)
2、交付使用时间:合同签订后7天内交货并安装调试完成。
3、免费质保期:提供至少3年的质保。
4、交货地点:苏州市立医院(本部)指定地点。
5、验收标准:产品安装后,采购单位按国际或国家标准及厂方标准进行质量验收。
二、供应商资格条件:
1、具有独立承担民事责任的能力;
2、具有良好的商业信誉和健全的财务会计制度;
3、具有履行合同所必需的人员和专业技术能力;
4、有依法缴纳税收和社会保障资金的良好记录;
5、参加政府采购活动前三年内,在经营活动中没有重大违法记录;
6、法律、行政法规规定的其他条件;
7、具有所投产品合法的经营许可资格;
8、非生产厂家投标的,须具有产品的合法代理商资格证明。
三、采购文件获取信息:
1、获取时间:自本次采购公告发布之日起至递交询价响应文件截止时间前。
2、获取方式:供应商自行至苏州政府采购网上下载询价采购文件。
四、递交询价响应文件时间、地点:
1、递交时间:2020年5月11日8:3010:30(北京时间)
2、递交截止时间:2020年5月11日10:30(北京时间)
3、递交地点:苏州市干将西路120号3号楼四楼苏州市卫康招投标咨询服务有限公司前台
4、本项目将于2020年5月11日下午13:30在苏州市姑苏区平泷路251号城市生活广
场西楼五楼,苏州市公共资源交易中心进行评审。
五、联系及监督
1、采购单位:苏州市立医院(本部)
电话(略)
地址:苏州市道前街26号
2、采购代理机构:
苏州市卫康招投标咨询服务有限公司联系人:吕兆莉、张田。
电话(略)电话(略)。
地址:苏州市干将西路120号3号楼四楼邮编:215005
3、政府采购监督电话(略)
六、信息发布媒体:
1、该信息刊登在江苏政府采购网、苏州市政府采购网,成交公告亦是刊登在此媒体,敬请各供应商注意。
七、公告期:自公告发布之日起三个工作日。
苏州市卫康招投标咨询服务有限公司
2020年5月6日
(非正式文本,仅供参考。
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