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生物信息学习题

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生物信息学习题

第一章生物信息学引论（问题与练习）

1、什么是生物信息学？

2、生物信息学的主要研究任务是什么？

3、我国生物信息学的主要发展方向是什么？

4、简述你所了解的人类基因组计划

5、简述你所了解的生物信息学的基本方法和前沿技术

6、生物信息学目前的主要研究内容

第二章生物学基础（问题与练习）

1、细胞学说的基本内容

2、简述细胞分裂周期的全过程

3、细胞分裂有哪些方式？

4、说明细胞的分类

5、简述原核细胞的基本内容

6、真核细胞的基本结构

7、陈述蛋白质的生物学功能

8、试按你的理解对20种氨基酸进行分类

9、画图说明肽键的形成过程

10、何谓蛋白质一级结构？

11、何谓蛋白质二级结构？

12、何谓蛋白质超二级结构？

13、何谓蛋白质四级结构？

14、描述核酸的基本组成

15、叙述DNA结构的基本内容

16、图示目前公认的中心法则

17、何为蛋白质剪切

18、何为GT-AG规则?

19、说明原核、真核生物基因的结构特征

20、阐述DNA复制机制的最新进展 21、阐述基因转录调控模型

22、总结蛋白质转译的基本机制

23、总结遗传密码破译的过程

24、何谓操纵子？

25、叙述基因表达调控的几个层次

第三章生物信息学资源与数据挖掘工具（问题与练习）

一、 单项选择题（从每题的A、B、C、D四个被选答案中选择一个最佳答案。）

1、如果我们试图做蛋白质亚细胞定位分析，应使用

A、NDB数据库

B、SWISS-PROT数据库

C、GenBank数据库

D、PDB数据库

2、如果试图确定一个新蛋白质序列属于哪一个蛋白质家族，或该序列可能包含何种结构域

或功能位点，应使用

A、PROSITE数据库

B、DDBJ数据库

C、PDB数据库

D、PIR数据库

3、在蛋白质一级数据库基础上，构建二级数据库应使用

A、近邻归并法

B、序列比对

C、基因融合法

D、Entrez

4、做DNA结构分析可使用

A、GenBank数据库

B、PIR数据库

C、NDB数据库

D、BLOCKS数据库 5、向核酸数据库GenBank/EMBL/DDBJ提交数据，应使用下列哪个软件

A、BLAST

B、Sequin

C、SRS

D、TreeBASE

6、在蛋白质序列数据库中比较查询蛋白质序列，应使用

A、BLASTn

B、BLASTp

C、tBLASTn

D、BLASTx

7、Profiles数据库是

A、蛋白质序列数据库

B、核酸序列数据库

C、蛋白质二级数据库

D、蛋白质结构数据

库

8、TreeBASE系统主要用于

A、发现新基因

B、系统生物学研究

C、类群间系统发育关系研究

D、序列比对

二、 问答题

1、为什么说SWISS-PROT是最重要的蛋白质一级数据库？

2、构建蛋白质二级数据库的基本原则是什么？

3、构建蛋白质二级数据库的主要方法有哪些？

4、叙述SCOP数据库对蛋白质分类的主要依据

5、试陈述GenBank数据库中一条记录下的主要信息

6、解释正则表达式C-Y-X2-[DG]-G-X-[ST]的含义

三、 填空题 1、目前国际上最常用的核酸序列数据库有 、 和 。

2、列举至少四种权威的蛋白质二级数据库 、 、 和 。

3、列举至少五种NCBI的服务项目 、 、 、 和 等

四、 名词解释

1、基序（motif）

2、SNP

3、基因家族

4、概念性翻译

第四章序列分析（问题与练习）

一、名词解释

1、可读框（ORF）

2、剪切变体

3、表达标签序列（EST）

4、电子克隆

5、同义置换

6、“垃圾”DNA（junk DNA）

7、概念性翻译

二、运算题

1、按照 5 ' -端到 3 ' -端的顺序写出下列核苷酸的互补序列：

5 '－ ATGCTTGCGGATAGA－3 '。

2、若一条mRNA序列5 '－AUG GGA UGU CGC CGA AAC－3

'被核糖体翻译，将形成怎样

的氨基酸的序列？若将第一个核苷酸删掉而将另一个A加到mRNA 序列的3 ' - 端，又将形成怎样的氨基酸序列？

三、问答题

1、有哪些信息可用于发现基因？

2、陈述BLASTn、BLASTp和BLASTx软件的用途

3、解释正则表达式C-Y-X2-[DG]-G-X-[ST]的含义

4、试从密码子使用偏向性角度说明编码区和非编码区的区别

第五章序列比对（问题与练习） 一、名词解释

序列比对直系同源并系同源

二、问答题

序列对位排列的主要用途

三、填空题

1、蛋白质得分矩阵类型有 、 、 、 和 等。

2、对位排列主要有局部比对和

三、运算题

1、画出下面两条序列的简单点阵图。将第一条序列放在 x 坐标轴上，将第二条序列放在 y

坐标轴上。

TGAACTCCCTCAGATATTA

CGAACCCTCACATATTAGCG

2、对两个核酸序列ACACACTA和AGCACACA进行全局比对

第六章分子系统发生分析（问题与练习）

1、构建系统发生树，应使用

A、BLAST

B、FASTA

C、UPGMA

D、Entrez

2、构建系统树的主要方法有、、等。

3、根据生物分子数据进行系统发生分析有哪些优点？

4、在 5 个分类单元所形成的所有可能的有根系统发生树中，随机抽取一棵树是反映真实关

系的树的可能性是多少？从这些分类单元所有可能的无根系统发生树中，随机选择一棵正确的树的可能性比前一种情况大还是小？

5、对于下列 5 条序列的比对构造一个距离矩阵，其中序列之间的距离值为比对中失配的碱

基数目，但是颠换的权值为转换的两倍。

GTGCTGCACG GCTCAGTATA GCATTTACCC ACGCTGCACG GCTCAGTGCG GTGCTTACCC

GTGCTGCACG GCTCGGCGCA GCATTTACCC

GTATCACACG ACTCAGCGCA GCATTTGCCC

GTATCACATA GCTCAGCGCA GCATTTGCCC

6、对于下列距离矩阵，用UPGMA构建系统发生树。

A B C D E

A 0

B 3 0

C 6 5 0

D 9 9 10 0

E 12 11 13 9 0

7、对下面距离矩阵，用UPGMA法构建系统发生树

A B C D E

A 0

B 8 0

C 4 8 0

D 6 8 6 0

E 8 4 8 8 0

8、对下面距离矩阵，用邻近归并法构建系统发生树

A B C D E F

A 0 5 4 7 6 8

B 0 7 109 11

C 0 7 6 8

D 0 5 9

E 0 8

F 0

9、为了发现最简约树，主要有哪几类搜索策略，各自有什么特点？

10、利用最大似然法构造系统发生树的本质是什么？

第七章生物芯片（问题与练习）

1、解释生物芯片的概念 2、陈述生物芯片产生的历史背景

3、根据支持介质划分，生物芯片有哪几种？

4、根据制备方法划分，生物芯片有哪几种？

5、根据探针划分，生物芯片有哪几种？

6、基因芯片的基本原理

7、基因芯片技术的四个步骤

8、进行探针设计时需要考虑的主要因素

9、列举检测芯片杂交信号的主要仪器

10、列举生物芯片的应用领域

第八章后基因组时代的生物信息学（问题与练习）

1、比较生物还原论与生物综合论的异同

2、简述“后基因组生物信息学”的基本研究思路

3、后基因组生物信息学的主要挑战是什么？

4、功能基因组系统学的基本特征是什么？

5、说明后基因组生物信息学对信息流动的最新理解

6、列举几种预测蛋白质-蛋白质相互作用的理论方法

7、解释从基因表达水平关联预测蛋白质-蛋白质相互作用的理论方法

8、解释基因保守近邻法预测蛋白质-蛋白质相互作用的理论方法

9、解释基因融合法预测蛋白质-蛋白质相互作用的理论方法

10、解释种系轮廓发生法预测蛋白质-蛋白质相互作用的理论方法

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分子生物学习题库与参考答案

分子生物学习题库与参考答案

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一、单选题（共49题，每题1分，共49分）

1.可以实现体细胞克隆的技术是:

A、基因编辑

B、聚合酶链式反应

C、诱导多能干细胞

D、体细胞核移植

正确答案：D

2.在PCR反应中,引物与模板的结合温度约为:

A、37°C

B、55°C

C、72°C

D、95°C

正确答案：B

3.大肠杆菌对于基因克隆的主要作用是:

A、提供连接酶

B、合成引物

C、表达目的蛋白

D、作为宿主

正确答案：D 4.将单链DNA合成双链的酶是:

A、连接酶

B、DNA聚合酶

C、裂解酶

D、RNA聚合酶

正确答案：B

5.可以增加靶标DNA拷贝数的技术是:

A、PCR

B、电泳

C、测序

D、印迹杂交

正确答案：A

6.在Southern杂交中起探针作用的是:

A、DNA

B、RNA

C、载体

D、引物

正确答案：A

7.编码氨基酸顺序信息的DNA序列称为:

A、启动子 B、基因

C、外显子

D、启动密码子

正确答案：B

8.可以自我复制的核酸是:

A、mRNA

B、rRNA

C、tRNA

D、miRNA

正确答案：B

9.DNA聚合酶在PCR反应过程中不需要的元素是:

A、铜离子

B、镁离子

C、锰离子

D、钾离子

正确答案：A

10.启动子序列通常位于:

A、转录起始点上游

B、编码区

C、基因内含子 D、终止子上游

正确答案：A

11.可以直接导入植物细胞的方法是:

A、阳离子脂质体法

B、农杆菌法

C、微粒射击法

D、电穿孔法

正确答案：B

12.DNA的组成单位是:

A、氨基酸

B、核苷酸

C、核糖

D、脱氧核糖

正确答案：B

13.农杆菌可以将T-DNA转入植物细胞的原因是:

A、具有连接酶

B、具有限制性内切酶

C、具有转座子

D、可以与植物细胞膜融合

正确答案：C 14.DNA测序中的Sanger方法利用了:

A、引物延伸终止

B、核酸杂交

C、蛋白质切割

D、荧光标记

-朱玉贤分子生物学习题题库

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整理为word格式 第一章绪论练习题

请就你感兴趣的分子生物学发展史上的重大事件或重要人物或重要理论作以相关论述？

第二章染色体与DNA练习题1

一、【单选题】

1.生物遗传信息传递中心法则是【 】

A.DNA→RNA→蛋白质B.RNA→DNA→蛋白质

C.DNA→蛋白质→RNAD.RNA→蛋白质→DNA

2.关于DNA复制的叙述，下列哪项是错误的【 】

A.为半保留复制 B.为不对称复制

C.为半不连续复制 D.新链合成的方向均为3'→5'

3.合成DNA的原料有【 】

A.dAMP dGMP dCMP dTMP

B.dADP dGDP dCDP dTDP

C.dATP dGTP dCTP dTTP

D.AMP UMP CMP GMP

4.DNA合成时碱基互补规律是【 】

A.A－UC－G B.T－AC－G

C.A－GC－U D.A－GC－T

5.关于DNA的复制错误的【 】：

A包括一个双螺旋中两条子链的合成

B遵循新的子链与其亲本链相配对的原则

C依赖于物种特异的遗传密码

D是碱基错配最主要的来源

6.一个复制子是：【 】

A细胞分裂期间复制产物被分离之后的DNA片段

B复制的DNA片段和在此过程中所需的酶和蛋白

C任何自发复制的DNA序列(它与复制起始点相连)

D任何给定的复制机制的产物(如：单环)

E复制起点和复制叉之间的DNA片段

7.真核生物复制子有下列特征，它们：【 】

A比原核生物复制子短得多，因为有末端序列的存在

B比原核生物复制子长得多，因为有较大的基因组

C通常是双向复制且能融合

D全部立即启动，以确保染色体在S期完成复制

E不是全部立即启动，在任何给定的时间只有大约15％是有活性的

8.下述特征是所有(原核生物、真核生物和病毒)复制起始位点都共有的是：【 】

A起始位点是包括多个短重复序列的独特DNA片段

生物信息学复习题已附答案

生物信息学复习题已附答案

1 本卷的答案仅做参考，如有疑问欢迎提出。后面的补充复习题要靠你们自己整理答案了。

生物信息学复习题

一、填空题

1、识别基因主要有两个途径即基因组DNA外显子识别和基于EST策略的基因鉴定。

2、表达序列标签是从 mRNA 中生成的一些很短的序列（300-500bp），它们代表在特定组织或发育阶段表达的基因。

3、序列比对的基本思想，是找出 检测基因 和 目标序列 的相似性，就是通过在序列中插入 空位 的方法使所比较的序列长度达到一致。比对的数学模型大体分为两类，分别是整体比对 和 局部比对 。

4、2-DE的基本原理是根据蛋白质 等电点 和 分子量 不同，进行两次电泳将之分离。第一向是 等电聚焦分离 ,第二向是 SDS-PAGE分离 。

5、蛋白质组研究的三大关键核心技术是 双向凝胶电泳技术 、

质谱鉴定技术 、 计算机图像数据处理与蛋白质数据库 。

二、判断题

1、生物体的结构和功能越复杂的种类就越多，所需要的基因也越多，C值越大，这是真核生物基因组的特点之一。（对）

2、CDS一定就是ORF。（对）

3、两者之间有没有共同的祖先，可以通过序列的同源性来确定，如果两个基因或蛋白质有着几乎一样的序列，那么它们高度同源,就具有共同的祖先。（错）

4、STS，是一段200-300bp的特定DNA序列，它的序列已知，并且在基因组中属于单拷贝。（对）

5、非编码DNA是“垃圾DNA”，不具有任何的分析价值，对于细胞没有多大的作用。（错）

6、基因树和物种树同属于系统树，它们之间可以等同。（错）

7、基因的编码序列在DNA分子上是被不编码的序列隔开而不连续排列的。( 对）

8、对任意一个DNA序列，在不知道哪一个碱基代表CDS的起始时，可用6框翻译法，获得6个潜在的蛋白质序列。（对）

9、 一个机体只有一个确定的基因组，但基因组内各个基因表达的条件和表达的程度随时间、空间和环境条件而不同。（对）

10生物科学复习题答案

10生物科学复习题答案

10⽣物科学复习题答案

⼀、名词解释

基因基因是核酸分⼦中储存遗传信息的基本单位，是核酸分⼦中由特定的核苷酸按照⼀定的碱基顺序排列⽽形成的具有⼀定功能的⽚段，是RNA序列和蛋⽩质多肽链顺序相关遗传信息的基本存在形式，以及表达这些信息所需要的全部核苷酸序列。

外显⼦结构基因中参与编码蛋⽩质的序列称为外显⼦。

内含⼦结构基因中不参与编码蛋⽩质的序列称为外显⼦。

启动⼦启动⼦是⼀段特定的直接与RNA聚合酶及其转录因⼦（或其他蛋⽩质）相结合、决定基因转录起始与否的DNA序列。

增强⼦增强⼦是⼀段与转录有关的短DNA序列，它可以特异性的与转录因⼦结合，增加转录结构基因的RNA聚合酶分⼦的数量，使启动⼦发动转录的能⼒⼤⼤增强。

终⽌⼦终⽌⼦是结构基因下游3’端的⼀段DNA序列，由AATAAA和⼀段回⽂序列组成，在转录中提供终⽌信号，使转录作⽤终⽌。

基因组细胞或⽣物体中，⼀套完整的单倍体遗传物质的总和称为基因组。

核酸杂交核酸杂交（nucleic acid hybridization ）指序列互补的单链DNA 和DNA 、DNA 和RNA 、RNA 和RNA ，根据碱基配对原则，借助氢键相连⽽形成双链杂交分⼦的过程。菌落原位杂交菌落原位杂交是在组织或细胞⽔平，使⽤标记探针与细胞内DNA 或RNA 杂交的⽅法。

聚合酶链式反应（PCR）cDNA ⽂库：cDNA ⽂库( cDNA library）是指某⼀⽣物特定器官或特定发育阶段的细胞内总mRNA ，应⽤逆转录酶逆转录成cDNA ，以此构建的重组DNA 克隆群称为cDNA ⽂库。

转录因⼦：在真核细胞核中，能够协助RNA聚合酶转录RNA 的蛋⽩质被统称为转录因⼦。RNA编辑：RNA 编辑（RNAediting ) 是指在mRNA ⽔平上，通过核苷酸的缺失、插⼈或替换⽽改变遗传信息的过程。

SD序列：在细菌的mRNA 起始密码⼦AUG 上游约10 个碱基左右的位置，通常含有⼀段富含嘌呤碱基的六聚体序列（-AGGAGG-），它与原核⽣物核糖体⼩亚基16S rRNA3’端富含嘧啶的短序列（-UCCUCC-）互补，从⽽使mRNA 与⼩亚基结合。