生物信息学练习题

1.1简述DNA双螺旋结构模型要点

a.DNA两条链逆平行、围绕同中心轴右手螺旋的双链结构，双螺旋结构的直径为2.0nm，螺距为3.4nm。

b.脱氧核糖和磷酸基团构成亲水性骨架位于双螺旋结构的外侧，疏水碱基位于螺旋内侧。每周约10个碱基。

c.两条链借助彼此之间的的氢键结合在一起。AT配对有两个氢键GC配对有三个氢键。每两个碱基对之间的相对旋转角度为36°

d.双螺旋结构的表面形成了一个大沟(major groove)和一个小沟(minor groove)。

1.2 名词解释：DNA的变性与复性；DNA分子杂交

DNA的变性：在某些理化因素作用下，DNA双链解开成两条单链的过程。DNA变性的本质是双链间氢键的断裂。

DNA的复性：当变性条件缓慢地除去后，两条解离的互补链可重新配对，恢复原来的双螺旋结构，这一现象称为DNA复性(renaturation) 。

DNA分子杂交：热变性的DNA在缓慢冷却过程中，具有碱基序列互补的不同DNA之间或DNA与RNA之间形成杂环双链的现象称为核酸分子杂交。

1.3 简述核酸分子杂交技术

不同种类的DNA单链分子或RNA分子放在同一溶液中，只要两种单链分子之间存在着一定程度的碱基配对关系，在适宜的条件可以在不同的分子间形成杂化双链(heteroduplex)。这种杂化双链可以在不同的DNA与DNA之间形成，也可以在DNA和RNA分子间或者RNA与RNA分子间形成。这种现象称为核酸分子杂交

1.4生物体内氨基酸有180多种,组成蛋白质的氨基酸只有（20）种,都是（α-氨基酸）。

1.5 写出氨基酸的结构通式

1.6名词解释：氨基酸的等电点

氨基酸的等电点：调节氨基酸溶液PH值,使氨基酸溶液中的氨基和羧基的解离度完全相等,即氨基酸所带静电荷为0,在电场中既不向阴极移动,也不向阳极移动,此时,氨基酸溶液的PH值称为该氨基酸的等电点,以符号PI表示。

2.1 Sanger通过氨基酸与（2,4-二硝基氟苯(DNFB)）反应测定了胰岛素的序列。

A类综合习题

1.一种计算机病毒叫黑色星期五，如果当天是13号，又恰好是星期五，就会发作起来毁球计算机的存储系统，试编程找出九十年代中这种病毒可能发作的日期。

2.任意给定一个自然数N，要求M是N的倍数，且它的所有各位数字都是由0或1组成，并要求M尽可能小。

例：N＝3―――＞M＝3*37＝111， N＝31―――＞M＝31*3581＝111011

3．合下面条件的5个正整数：

(1)5个数之和为23；

(2)从这5个数中选取不同的数作加法，可得1－23中的所有自然数,打印这5个数及选取数组成的1--23的加法式。

4．将数字65535分解成若干个素数之积。

5．由1..9这九个数字组成的九位数（无重复数字）能被11整除，求最大、最小值。

6．某次智力测验，二等奖获得者共三人，以下奖品每人发给两样：

①钢笔 ②集邮本 ③影集 ④日记本 ⑤圆珠笔 ⑥象棋

打印各种分配方案及总分配数。

7．个同样种类的零件，已知其中有一个是次品，比正品较轻，仅限用天平称4次，把次品找出来，要求打印每次称量过程。

8．输入N个数字（0－9），然后统计出这组数中相邻两数字组成的数字对出现的次数。

如：0,1,5,9,8,7,2,2,2,3,2,7,8,7,9,6,5,9中可得到：

（7,8）数字对出现次数2次，（8,7）数字对出现次数为3次。

9．由M个数字构成一个圆，找出四个相邻的数，使其和为最大、最小。

10．输一个十进制数，将其转换成N进制数（0＜N＜＝16)。

11．读入N，S两个自然数（0＜＝S，N＜＝9），打印相应的数字三角形（其中，S表示确定三角形的第一个数，N表示确定三角形的行数）。

例：当N＝4，S＝3时打印： 当N＝4。S＝4时打印：

3{首位数为奇数} {首位数为偶数} 4

4 5 &nb sp; 6 5

生物信息学作业题

绪论

1．什么是生物信息学？

2．生物信息学有哪些主要研究领域？

第一章 生物信息学的分子生物学基础

1．DNA的双螺旋结构要点是什么？

2．什么是基因组和蛋白质组？对它们的研究有何意义？

第二章 生物信息学的计算机基础

1．简述网络操作系统的类型。

第三章 核酸序列分析

1．什么是全局比对？

2．什么是局部比对？有哪些优点？

第四章 分子进化分析

1．分子进化分析具有哪些优点？

2. 简述分子进化的中性学说。

第五章 基因组分析

1. 什么是基因组学？其主要研究内容是什么？

2．简述基因预测分析的一般步骤。

第六章 蛋白质组分析

1. 蛋白质组学的概念和主要研究的大致方向是什么？

2. 蛋白质组功能预测的程序是怎样的？

第七章 生物芯片数据分析

1. 什么是生物芯片?

2. 生物芯片有哪些方面的应用?

第八章 核酸与蛋白质结构预测

1. RNA二级结构典型的预测方法有哪些？

2. 基于统计学的预测蛋白质二级结构的方法有哪些？

第九章 生物信息学平台与工具软件

1. 请利用Clustal X软件对下列6条蛋白质序列进行多重比对（比对结果用BioEdit软件打开，用“截图”方式显示比对结果）。

>1

mqngkvkwfn sekgfgfiev eggedvfvhf saiqgegfkt leegqevtfe veqgnrgpqatnvnkk

>2

mqgkvkwfnn ekgfgfieie gaddvfvhfs aiqgegykal eegqevsfdi tegnrgpqaanvvkl

>3 mqngkvkwfn sekgfgfiev eggedvfvhf saiqgegfkt leegqevtfe veqgnrgpqatnvnkk

>4

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1 生物信息学复习题及答案（陶士珩）

名词解释

1. Homology (同源):来源于共同祖先的序列相似的序列及同源序列。序列相似序列并不一定是同源序列。

2.Orthologs（直系同源）：指由于物种形成的特殊事件来自一个共同祖先的不同物种中的同源序列，它们具有相似的功能。

3.Paralogs（旁系（并系）同源）：指同一个物种中具有共同祖先，通过基因复制产生的一组基因，这些基因在功能上的可能发生了改变。基因复制事件是促进新基因进化的重要推动力。

4.Xenologs (异同源)：通过横向转移，来源于共生或病毒侵染而产生的相似的序列，为异同源。

5.Identity Score：The sum of the number of identical matches and conservative (high

scoring) substitutions in a sequence alignment divided by the total number of

aligned sequence characters. Gap总是不计入总数中。

6.点矩阵（dot matrix）：构建一个二维矩阵，其X轴是一条序列，Y轴是另一个序列，然后在2个序列相同碱基的对应位置（x，y）加点，如果两条序列完全相同则会形成一条主对角线，如果两条序列相似则会出现一条或者几条直线；如果完全没有相似性则不能连成直线。

7. E值：得分大于等于某个分值S的不同的比对的数目在随机的数据库搜索中发生的可能性。衡量序列之间相似性是否显著的期望值。E值大小说明了可以找到与查询序列（query）相匹配的随机或无关序列的概率，E值越小意味着序列的相似性偶然发生的机会越小，也即相似性越能反映真实的生物学意义，E值越接近零，越不可能找到其他匹配序列。

8.P值：得分为所要求的分值比对或更好的比对随机发生的概率。它是将观测得到的比对得分S，与同样长度和组成的随机序列作为查询序列进行数据库搜索进行比较得到的HSP（高分片段对）得分的期望分布联系起来计算的。通常使用低于0.05来定义统计的显著性。P=1-e-E