12 VPA 实际种群分析
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渔业资源评估复习题(2010.6.17)李九奇一、概念题:亲体量(spawning stock)种群在繁殖季节内参加生殖活动的雌、雄个体的数量。
补充量(recruitment)新进入种群的个体数量。
在渔业生物学中,补充量有两种含义:对于产卵群体,补充量是指首次性成熟进行生殖活动的个体;对于捕捞群体,指首次进入渔场、达到捕捞规格的个体。
生物量(biomass)以重量表示的资源群体的丰度,有时仅指群体的某一部分,如产卵群体生物量、已开发群体生物量,等等。
可利用生物量(exploitable biomass)资源群体的生物量中能被渔具捕获的部分。
死亡率(mortality)一定时间间隔内,种群个体死亡尾数与时间间隔开始时的尾数之比,残存率(survival rate)一定时间间隔后,种群个体残存的尾数与时间间隔开始时的尾数之比,数值在0~1之间。
死亡系数(mortality rate, coefficient of mortality)亦称“瞬时死亡率”。
自然死亡系数(natural mortality rate)亦称“瞬时自然死亡率”捕捞死亡系数(fishing mortality rate)亦称“瞬时捕捞死亡率”总死亡系数(total mortality rate)自然死亡系数与捕捞死亡系数之和。
开发率(exploitation ratio)捕捞死亡系数与总死亡系数的比值。
单位捕捞努力量渔获量(catch per unit of effort,CPUE)一个捕捞努力量单位所获得的渔获尾数或重量,通常用渔获量除以相应的捕捞努力量得到。
捕捞努力量标准化(standardizing fishing effort)以一定的标准,将不同作业方式、渔具规格的捕捞努力量转化标准作业方式或渔具的捕捞努力量,一般根据捕捞效果确定一定的转换系数或转换依据。
例如,以A类渔船为标准船,将B类渔船的捕捞努力量根据CPUE转化为A类渔船的捕捞努力量。
绿头鸭线粒体12S rRNA基因序列测定及分析涂剑锋;邢秀梅;杨颖;杨福合【期刊名称】《特产研究》【年(卷),期】2008(030)004【摘要】对4只绿头鸭线粒体12S RNA基因进行了测定和分析.结果显示:4只绿头鸭12S rRNA基因序列完全一致,其全长为98Sbp,碱基A、G、T、C含量分别为31.47%、21.12%、19.09%和28.32%.以白额雁和潜鸭为外群,分别用邻近法和最小进化法构建了系统进化树,结果表明:绿头鸭与斑嘴鸭和北京鸭关系密切,三者共享1个单倍型,它们之间可能存在较为广泛的基因交流.除此之外,绿头鸭与绿翅鸭关系较近,与琵嘴鸭关系较远,罗纹鸭与赤颈鸭关系较近,河鸭属与潜鸭属的亲缘关系要近于与雁属的亲缘关系.【总页数】4页(P24-27)【作者】涂剑锋;邢秀梅;杨颖;杨福合【作者单位】中国农业科学特产研究所,吉林,吉林,132109;中国农业科学特产研究所,吉林,吉林,132109;中国农业科学特产研究所,吉林,吉林,132109;中国农业科学特产研究所,吉林,吉林,132109【正文语种】中文【中图分类】Q959.7;Q344【相关文献】1.鹳形目12种鸟类核c-mos 基因和线粒体12S rRNA基因序列分析及其系统发生研究 [J], 张国萍;王蔚;朱世杰;申煜;常弘2.绿头鸭线粒体DNA控制区全序列测定及分析 [J], 涂剑锋;司方方;邢秀梅;杨福合3.西施舌线粒体COI与16S rRNA基因片段序列测定及其分析 [J], 陈淑吟;吉红九;张雪娜;朱立静4.186例耳聋患者线粒体DNA 12S rRNA基因筛查及家系分析 [J], 戴显宁; 陈茜; 王倩; 王海坚; 童郁; 许锴5.携带线粒体12S rRNA基因突变的新生儿母系家族史分析 [J], 赵敏;申敏;阮自琦;王瑞艳;曲春燕因版权原因,仅展示原文概要,查看原文内容请购买。
生物资源评估2018期末 5名词解释10填空10简答1计算题1。
根据目的和性质不同,资源评估分为两种形式。
决策性和建议性 2。
Russell (1931)原理提出,影响种群数量变动的四个因素。
( 生长 )、(补充)、(自然死亡)和(捕捞死亡)3。
鱼类体长与体重关系表达式。
(W=aL b)4。
生长方程是用来描述(鱼类体长或体重随(时间)或(年龄))的数学模型或数学方程。
5。
Ricker (1975)生长方程认为,把鱼类的生命周期分成若干短的时距,其生长曲线可以作为(指数)生长来对待。
6。
鱼类各年龄的体长组成的概率分布接近于(正态分布)其概率表达形式。
()2,t t l N σ()()⎰--=≤≤212222121l l l l t dtel l l t t σσπρ :tl t龄的平均体长:t σ体长分布的标准差7. CPUE 指的是(单位捕捞努力量渔获量 ),其计算公式为(U=C/f ),常常用来作为(相对资源量)指标. 8。
捕捞努力量与捕捞死亡系数之间的关系式.F=qf 9. 渔业资源评估最早的三个学说。
(繁殖论)、(稀疏论)和(波动论)10。
在鱼类体长与体重关系式中, a 和b 的意义。
(a )常常被称为条件因子,(b)可用来判断鱼类是否处于匀速生长。
11. von Bertalanffy 体长生长方程的速度和加速度。
)(0t t k t e kl dt dl --∞= )(2220t t k t e l k dt l d --∞-=12. von —Bertalanffy 体重生长方程的生长速度和生长加速度。
13. 标志放流法可用来估算( 捕捞死亡系数)和(资源量) 14. Fox 剩余产量模型是以(Gompertz )种群增长曲线为基础.15. Schaefer 剩余产量模型是以(Graham )种群增长曲线为基础。
16. MSY 实际指的是(最大持续产量 ), f MSY 实际指的是(达到MSY 的捕捞努力量 )。
利用12S rRNA基因的限制性酶切末端片段长度多态性鉴定动物种类汪琦;张昕;赵大贺;马海萍;陈广全;张惠媛【期刊名称】《食品科学》【年(卷),期】2010(031)002【摘要】目的:建立一种精确可靠的鉴定常见的10种动物(猪、狗、牛、山羊、绵羊、马、鸡、鼠、三文鱼和鹿)的方法.方法:利用12S rRNA基因的限制性酶切末端片段长度多态性(terminal restriction fragment length polymorphism,T-RFLP)鉴别动物种类.将线粒体12S rRNA基因通过引物的5'端用FAM荧光标记,从基因组DNA中扩增450bp的目的片段.引物对1(下游引物FAM标记,上游引物不标记)扩增的PCR产物用限制性内切酶Alu Ⅰ酶切.引物对2(上游引物FAM标记,下游引物不标记)扩增的PCR产物用限制性内切酶Tru9 Ⅰ酶切.得到的酶切产物分别在遗传分析仪ABI 3100上进行毛细管电泳,片段大小用Peak Scanner 1.0软件分析.结果:根据Alu Ⅰ酶切图谱能够区分鸡、马、猪和三文鱼,而鹿和牛、山羊和绵羊、鼠和狗因酶切图谱相同无法分开.根据Tru9 Ⅰ酶切图谱,能够进一步将鹿和牛、山羊和绵羊、鼠和狗分开.同一种动物不同个体的酶切图谱完全相同,结果具有可重复性.没有出现物种内多态的现象.大多数情况下,实际得到的末端片段长度与理论值非常接近,只存在2~5bp的差异.结论:该方法操作简单、结果精确,适用于鉴定动物种类.【总页数】6页(P214-219)【作者】汪琦;张昕;赵大贺;马海萍;陈广全;张惠媛【作者单位】北京出入境检验检疫局,北京,100026;北京出入境检验检疫局,北京,100026;北京师范大学生命科学学院,北京,100875;北京师范大学生命科学学院,北京,100875;北京出入境检验检疫局,北京,100026;北京出入境检验检疫局,北京,100026【正文语种】中文【中图分类】Q78【相关文献】1.末端限制性酶切片段长度多态性分析一个能够降解聚乙烯醇的混合体系 [J], 张颖;堵国成;刘和;李光伟;陈坚2.应用限制性酶切片段长度多态性及变性高效液相色谱法筛选胶质瘤易感基因ERCC2的单核苷酸多态性比较 [J], 杨冬;李庆国;张亚卓;王红云;罗亦男;蒋传路;柯杨;戴钦舜3.末端限制性酶切片段长度多态性分析技术进展 [J], 李红4.云贵两省三地带绦虫的分子鉴定——核糖体DNA第一内转录间隔区(ITS1)限制性酶切片段长度多态性(RFLP)分析 [J], 张朝云;包怀恩;杨明;郎书源5.双创造酶切位点聚合酶链反应-限制性片段长度多态性检测MGMT基因多态性的应用 [J], 王威;缪文彬;仇玉兰;夏昭林因版权原因,仅展示原文概要,查看原文内容请购买。
1渔业资源评估Fish Stock Assessment在了解、掌握渔业种群对象生物学特征的基础上,以一定的假设条件为前提,通过建立数学模型,描述和估算种群的组成结构、资源量及其变动,评估捕捞强度和捕捞规格对种群的影响,掌握种群资源量的变动特征与规律,从而对资源群体过去和未来的状况进行模拟和预测,为制定和实施渔业资源的管理措施提供科学依据。
2.研究对象1)对鱼类等捕捞对象的生长、死亡等有关参数进行测定和计算,对其生长、死亡和补充的规律进行研究;2)考察捕捞作用对渔业资源数量和质量的影响;对资源量和渔获量作出估计和预报;3)寻求渔业资源合理利用的最佳方案,包括确定合适的或较合适的捕捞强度和起捕规格,如限定渔获量、限定作业船数或作业次数或作业时间,限定网目大小和鱼体长度等,为渔业政策和渔业管理措施提供科学依据。
3.渔业资源评估的方法有:数学分析法、初级生产力法、生物学法及水声学调查等方法,本课程所阐述的主要是数学分析法(生物参数资料和渔业统计资料)。
4.渔业评估据服务的性质不同可分为生产性的资源评估和决策性的资源评估。
5.鱼类资源数量研究非常活跃,当时以耿克(Heincke)、彼得逊(Pertersen)、约尔特(Hjort)等为代表根据自己的研究结果提出的不同的理论和学说,大体上可分为繁殖论、稀疏论、波动说三种。
第一章渔业资源数量变动的一般规律1.种群(Population):是指生活在有限空间内、有较多特征一致的同一种类生物个体的集合,即指在一个种的分布区内,有一群或若干群体中的个体,其形态特征相似,生理、生态特征相同,特别是具有共同的繁殖习性(相同遗传属性,同一基因库的种内个体群)。
2.影响资源数量变动的因素1)鱼类本身的因素以及环境因素的制约(繁殖、生长、死亡、环境)2)捕捞因素3.Russell提出资源数量变动基本模型的表达式为:B2=B1+R+G-M-Y 式中B1、B2分别为某一期间始末可利用资源群体的资源生物量。
1渔业资源评估Fish Stock Assessment在了解、掌握渔业种群对象生物学特征的基础上,以一定的假设条件为前提,通过建立数学模型,描述和估算种群的组成结构、资源量及其变动,评估捕捞强度和捕捞规格对种群的影响,掌握种群资源量的变动特征与规律,从而对资源群体过去和未来的状况进行模拟和预测,为制定和实施渔业资源的管理措施提供科学依据。
2.研究对象1)对鱼类等捕捞对象的生长、死亡等有关参数进行测定和计算,对其生长、死亡和补充的规律进行研究;2)考察捕捞作用对渔业资源数量和质量的影响;对资源量和渔获量作出估计和预报;3)寻求渔业资源合理利用的最佳方案,包括确定合适的或较合适的捕捞强度和起捕规格,如限定渔获量、限定作业船数或作业次数或作业时间,限定网目大小和鱼体长度等,为渔业政策和渔业管理措施提供科学依据。
3.渔业资源评估的方法有:数学分析法、初级生产力法、生物学法及水声学调查等方法,本课程所阐述的主要是数学分析法(生物参数资料和渔业统计资料)。
4.渔业评估据服务的性质不同可分为生产性的资源评估和决策性的资源评估。
5.鱼类资源数量研究非常活跃,当时以耿克(Heincke)、彼得逊(Pertersen)、约尔特(Hjort)等为代表根据自己的研究结果提出的不同的理论和学说,大体上可分为繁殖论、稀疏论、波动说三种。
第一章渔业资源数量变动的一般规律1.种群(Population):是指生活在有限空间内、有较多特征一致的同一种类生物个体的集合,即指在一个种的分布区内,有一群或若干群体中的个体,其形态特征相似,生理、生态特征相同,特别是具有共同的繁殖习性(相同遗传属性,同一基因库的种内个体群)。
2.影响资源数量变动的因素1)鱼类本身的因素以及环境因素的制约(繁殖、生长、死亡、环境)2)捕捞因素3.Russell提出资源数量变动基本模型的表达式为:B2=B1+R+G-M-Y 式中B1、B2分别为某一期间始末可利用资源群体的资源生物量。
渔业资源评估的发展概况资源、环境和食物问题是当今世界面临的三大课题,在过去的几十年间,陆地资源过度开发,使环境遭到严重破坏,随着科技的不断发展,人们逐渐将视线转向海洋,海洋占地球面积的三分之二,蕴藏丰富的生物资源,渔业资源就是其中重要的一部分。
在全球范围内,随着渔业资源的不断开发,诸多不合理因素已经严重影响到渔业资源存量、海洋生物多样性及与渔业相关的经济领域,在发展渔业资源的过程中,如何处理好增加产量与合理利用渔业资源的关系,已成为世界各国迫在眉睫的问题。
渔业资源评估正是围绕这一主题展开的。
渔业资源评估就是利用各种方法对渔业资源进行评估和估算,包括为确定某一渔业资源的生产率、捕捞对资源的影响、捕捞格局变化(如管理或发展政策的执行)所产生的效果等所进行的一切科学研究。
具体说,就是在了解和掌握了捕捞对象的年龄、生长、长度、重量、繁殖力及渔获组成等生物学资料的基础上,又获得多年的渔获量和捕捞努力量的较完整的渔业统计资料,对鱼类等捕捞对象的生长、死亡等有关参数进行测定和计算;考察捕捞作用对渔业资源数量和质量的影响;对资源量和渔获量做出估计和预报。
目前许多国家制定的限额捕捞等一系列渔业管理措施,都是以资源估计数学模式作为科学依据的。
就世界范围来说,到本世纪50 年代以前,多数资源研究工作是以生物学为基础的,着重从世代变迁来估计产量和预报种群数量,研究工作大多限于定性描述。
50 年代起,由于受到数理统计学发展的影响,研究工作着重于定量分析,数学模式在资源数量变动研究上有了很大的发展,通过对数学模型的不断实践和修改,其由原先的单一模型逐渐转向多元分析,将外界环境因素也整合到模型中去。
在评估数据的处理上也有了新的方法,近年来,随着计算机的发展,一些渔业资源的评估软件应运而生,极大的简化了估算过程,使评估更加准确、快捷、方便。
1 三大学说第一次世界大战时期,伴随着大规模大西洋渔业的停顿、发展出现了渔业资源的“衰落—兴盛—衰落”过程,这为渔业资源的研究提供了一次难得的“实验” ,渔业资源数量变动的研究蓬勃兴起。
渔业资源评估复习题(2010.6.17)李九奇一、概念题:亲体量(spawningstock)种群在繁殖季节内参加生殖活动的雌、雄个体的数量。
补充量(recruitment)新进入种群的个体数量。
在渔•业生物学中,补充量有两种含义:对于产卵群体,补充量是指首次性成熟进行生殖活动的个体;对于捕捞群体,指首次进入渔场、达到捕捞规格的个体。
生物量(biomass)以重量表示的资源群体的丰度,有时仅指群体的某一部分,如产卵群体生物量、已开发群体生物量,等等。
可利用生物量(exploitable biomass)资源群体的生物量中能被渔具捕获的部分。
死亡率(morality) —圧时间间隔内,种群个体死亡尾数与时间间隔开始时的尾数之比,残存率(survival rate) 一泄时间间隔后,种群个体残存的尾数与时间间隔开始时的尾数之比,数值在0〜1之间。
死亡系数(mortality rate, coefficient of mortality)亦称"瞬时死亡率“。
自然死亡系数(natund mortality rate)亦称“瞬时自然死亡率"捕捞死亡系数(fishing mortality rate)亦称“瞬时捕捞死亡率”总死亡系数(total mortality rate)自然死亡系数与捕捞死亡系数之和。
开发率(exploitation ratio)捕捞死亡系数与总死亡系数的比值。
单位捕捞努力量渔获量(catch per unit of effort, CPUE) 一个捕捞努力量单位所获得的渔获尾数或重量,通常用渔获量除以相应的捕捞努力量得到。
捕捞努力量标准化(standardizing fishing effort)以一定的标准,将不同作业方式、渔具规格的捕捞努力量转化标准作业方式或渔具的捕捞努力量,一般根据捕捞效果确左一左的转换系数或转换依据。
例如,以A类渔船为标准船,将B类漁船的捕捞努力量根据CPUE 转化为A类渔船的捕捞努力量。
运用体长股法初步估算湖口江段短颌鲚资源量作者:吴斌等来源:《湖北农业科学》2014年第16期摘要:短颌鲚(Coilia brachygnathus)是一种重要的渔业资源,2012年湖口江段短颌鲚的渔获量为1.03 t,运用体长股法对湖口江段短颌鲚资源量进行了初步评估。
结果表明,体长体重关系为BW=0.003BL3.041;自然死亡系数M=0.603;最大体长组的捕捞死亡系数F初始值分别取0.25、0.50和0.75时,短颌鲚资源数量依次为198.492万、186.456万和182.432万尾;短颌鲚资源重量依次为3.52、3.15和3.04 t。
关键词:短颌鲚(Coilia brachygnathus);实际种群分析(VPA);体长股法;湖口中图分类号:S932.4 文献标识码:A 文章编号:0439-8114(2014)16-3866-04Abstract: Coilia brachygnathus is one of important fishery resources, with yield of 1.03 t in Hukou in 2012. Resource of C.brachygnathus in Hukou was preliminarily assessed with length based cohort method to provide reference for fisheries management. The results showed that body length (BL) and weight(BW) relationship was BW=0.003 BL3.041. Natural mortality coefficient was M=0.603. Fishing mortality coefficient of maximum body length group was 0.25,0.50 and 0.75,respectively. The number of resources was 1.984 92 million, 1.864 56 million and 1.824 32 million. The resource weight was 3.52 t,3.15 t and 3.04 t.Key word:Coilia brachygnathus; virtual population analysis; length based cohort method;Hukou鲚属(Coilia)鱼类主要栖息于海洋和沿岸海域,也可能生活在低盐的环境中,并且常栖息于河口区域。
最小存活种群和种群生存力分析理论最小存活种群和种群生存力分析理论姓名:王飞提出背景研究系统生存力的最小面积上世纪初自然保护区与人类经济发展在土地利用方面的矛盾最小存活种群和种群生存力分析理论研究目标种的最小种群大小或密度最小存活种群(Miniminm Viable Population):简称MVP,广义的MVP概念有两种,一种是遗传学概念,即在一定的时间内保持一定的遗传变异所需的最小隔离的种群大小;另一种是种群统计学概念,即以一定概率存活一定时间所需的最小隔离的种群大小。
种群生存力分析(Population Viability Analy-sis):简称PVA,是结合分析和模拟技术,估计物种以一定概率存活一定时间的过程。
PVA研究物种绝灭问题,它的目标是制定最小可存活种群。
一、最小存活种群研究内容:1、小种群对种群遗传退化的影响(1)使得近亲繁殖可能增加(2)使得异质性变小(3)遗传漂移对物种长期进化产生的深刻影响2、有效种群大小与种群短期存活和长期存活(1)有效种群大小为50只能作为物种短期存活的MVP(有待考证)(2)有效种群大小为500,可保持遗传变异的损失与突变产生的遗传变异输入平衡(有待考证)种群生存力分析主要研究内容小种群的随机绝灭问题绝灭的划分方法:(1)把绝灭分为系统压力和随机干扰(2)确定性绝灭或随机绝灭物种灭绝的漩涡模型R漩涡D漩涡F漩涡A漩涡R漩涡N Var r种群扰动N Var r种群结构改变,斑块化斑块中有效种群D漩涡有效种群近亲繁殖,遗传变异损失表现型缺失自然增长率F漩涡有效种群走向选择效率表现型与环境更加不协调自然增长率A漩涡发,互相加重PVA模型分类1、分析模型:描述和分析各种随机因素对小种群灭绝时间影响的模型。
2、模拟模型:结合多种随机因素来模拟种群灭绝风险应用用广泛的PVA软件,如GIS、VORTEX、ALEX3、岛屿生物地理学分析:研究岛屿物种的分布和存活证实分析模型和模拟模型的正确性。