joinmap使用图文教程

joinmap使用图文教程
文档来源为:从网络收集整理.word 版本可编辑.欢迎下载支持.
1 新建 new project
点击 dataset 新建 new
dataset 设置数据格式和大小
选择数据复制粘贴到矩
阵检测数据是否有错误
第一个错误蓝色选中之
后错误显示红色
点击错误处按下F2 修改
再次检测数据是否错误
创建群体节点计算位点基因型频率情况：
计算连锁群
设置参数，然后计算
确定那个群需要作出连锁图右键点击使之成为红色点击create group using the grouping tree
点击计算
点击calculate map 生产连锁遗传图
用另一种直观的方式查看基因型
点击（De-）Colorize
用最大似然法再次利用group1作图
选择group 并选择ML 点击OK
点击calculate map 再次作图
最后将两张图放在一起比较
右键点击选择两个连锁MAP
点击join 里的 combine maps
OK 完成更多调试请自我感觉！这只是一个example ！Its finished by Dragon, please call me Dragon! [使用文档中的独特引言吸引读者的注意力，或者使用此空间强调要点。

要在此页面上的任
何位置放置此文本框，只需拖动它即可。

] Info 数
据概要不可更改的数
据显示
Loci 和 individual 显示的是loci 和 individual 的名称和序号，在这里可以删除一些loci 和 individual。

map join 写法Map Join是一种常见的Join操作，它将两个数据集按照某个键进行匹配，并将匹配的结果合并成一个新的数据集。

在Map Join中，一个数据集作为驱动表，另一个数据集作为被驱动表。

驱动表会被加载到内存中，而每个驱动表的键值都会被传递给被驱动表，以查找匹配的行。

以下是一个使用Python语言实现Map Join的示例代码：```python# 假设我们有两个数据集data1和data2，它们都有一个键列key data1 = [('a', 1), ('b', 2), ('c', 3)]data2 = [('a', 'x'), ('b', 'y'), ('d', 'z')]# 将数据集转换为Pandas的DataFrame对象df1 = pd.DataFrame(data1, columns=['key', 'value1'])df2 = pd.DataFrame(data2, columns=['key', 'value2'])# 使用merge函数进行Map Join操作result = df1.merge(df2, on='key', how='inner')# 输出结果print(result)```在这个示例中，我们首先将两个数据集转换为Pandas的DataFrame对象。

然后，我们使用merge函数进行Map Join操作，其中on参数指定了键列的名称，how参数指定了Join的方式（这里是内连接）。

最后，我们输出结果。

需要注意的是，在实际使用中，我们需要根据实际情况选择合适的Join方式，并考虑数据的加载方式、内存使用等因素，以避免出现性能问题。

巧用M a p i n f o软件S Q L查询功能肖Final approval draft on November 22, 2020巧用Mapinfo软件SQL查询功能提高工作效率1.新建图层操作顶端菜单：“文件->新建表”：出现“新建表窗口”如下：在“新建表窗口”中选择Open New Mapper，如果已经打开了一个地图窗口，也可以选择Add to Current Mapper。

选择Create New 创建一个新的表结构。

点击“Create…”按钮，出现“新建表结构”的窗口如下：在“新建表结构窗口”的下部输入Name、Type、Width用于定义字段的名字、类型和长度。

每输入完一个字段Name、Type和Width，点击窗口右上部的Add Field 按钮进入下一个字段的定义。

所有字段定义完成后，点击“新建表结构窗口”下部的Create…按钮，出现如下保存窗口，选择合适的路径，输入文件名后保存tab文件，保存类型选择默认的tab文件。

经过以上操作，空白的网格图层就新建并定义好了。

2.网格划分及去除重叠区域方法3.网格划分方法步骤一、使用顶端菜单：“文件->打开”或工具栏上的“打开”按钮，打开各参考图层步骤二、与步骤一同样的方法打开前一节建立的空白网格图层，并设置网格图层可编辑，如下图：步骤三、网格图层设置为可编辑后，使用“多边形”绘图工具开始绘制物理网格，如下图：如果与之前画的网格有共同的边界，建议尽量有交叠区域，便于去除重叠区域后形成无缝的边界。

4.去除重叠区域的方法5.步骤一、确认网格图层处于可编辑状态6.步骤二、选择两个网格中的一个网格，右键->编辑对象->设置目标，如下图：7.8.步骤三、选择另一个网格，右键->编辑对象->擦除，如下图：9.10.在弹出的窗口点击“OK”，如下图：11.计算网格面积使用顶端菜单：表->更新列：弹出更新列窗口如下，选择需要更新的表(Table to Update)为物理网格图层，需要更新的列(Column to Update)为网格面积，值来源(Get Value From Table)同样为物理网格图层，选择后点击“Assist…”按钮：弹出表达式窗口如下，选择functions框里的Area函数，然后点击“OK”按钮，网格的面积就计算并填入图层了，保存图层。

在Excel中输入，横向是用到的株系，纵向是marker，主题内容填A或B，保存为.csv（逗号分隔）格式。

然后打开写字板，在写字板中打开这个.csv格式文件，另存为.loc格式即可。

在我给你的例子中，name = demoF2popt = F2nloc =65nind = 104name表示名字（自己取），popt表示群体，如F2;nloc表示标记的数目，nind表示单株的数目。

下面是标记名称和单株的基因型，在F2中，对于共显性标记,采用ABH记录法。

即:亲本1的纯合带型记为“A”，亲本2的纯合带型记为“B”，杂合带型记为“H”，缺失数据记为“-”。

对于显性标记，若亲本1无带时，只有A和C，有带记为“C”，无带记为“A”。

若亲本2无带时，只有B和D，有带记为“D”，无带记为“B”。

在EXCEL中按以上格式整理后，考入文本文档，例如取名jiansheng安装好joinmap后，打开joinmap，点击file，再点击new project，然后取一个文件名，点击保存，这时进入一个新的joinmap界面，再点击file，点击load data，选择上面我们的文本文档jiansheng，点击打开，又进入一个新的界面，会出现name = demoF2popt = F2nloc =65nind = 104finial number indivals=104这时点击options，再点calution options，可以修改LOD lower 值，假定改为5.选择后，点击OK,又回到刚才的界面。

然后点击LOD grouping tree，然后点击calcuate，（或者计算器的那个图形）。

然后，会出现树状的图形。

如果你上面选的LOD值为5.0，则你用右键点击用5.0/1（56）、5.0/2（5），5.0/3(2)这里5.0表示LOD,1表示连锁群，56表示标记数。

这里共有3个连锁群。

如果你以前选择LOD=3,这里会出现1个连锁群，所以你自己可以选择LOD值，这样连锁上的标记数也不同。