OsBELL4A 调控水稻 WOX 家族基因表达及 水稻幼苗生长和耐逆
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OsGATAs转录因子调控水稻生长发育机制的初频研究的开题报告一、研究背景及意义水稻作为我国的重要粮食作物,在粮食产量和食品安全保障方面扮演着重要的角色。
然而,水稻的生长发育受到许多内源和外源因素的影响,其中转录因子是调控水稻生长发育的重要因素之一。
OsGATAs是一类高度保守的植物转录因子家族,包括29个成员。
这些成员在植物的生长发育、激素信号传递、胁迫响应和代谢等多个方面发挥重要作用。
此外,OsGATAs在水稻中的表达和调控机制仍不明确,并且对于其在水稻生长发育中的调控作用也存在较为矛盾的研究结果。
因此,本研究将利用生物信息学和分子生物学等方法,初步探究OsGATAs转录因子在调控水稻生长发育过程中的作用和机制,以期为水稻的生长发育调控提供新的思路和理论支持。
二、研究内容和技术路线1. 研究内容:(1)对OsGATAs在水稻中的表达谱进行分析,并利用荧光素酶报告系统筛选OsGATAs家族的确切转录因子活性区域;(2)利用遗传转化法将OsGATAs转录因子定向表达入水稻,通过生长形态、生物量积累、叶绿素含量、抗氧化酶活性等多方面分析OsGATAs转录因子对水稻生长发育的影响;(3)结合转录组学和代谢组学等技术分析OsGATAs转录因子对水稻主要生长发育进程中相关基因和代谢产物组的调控作用及分子机制。
2. 技术路线:(1)克隆OsGATAs基因家族的cDNA序列并进行生物信息学分析;(2)构建荧光素酶报告载体,并进行筛选确切转录因子活性区域;(3)构建OsGATAs变异体植物遗传转化载体,并对水稻进行遗传转化;(4)对遗传转化的水稻进行形态学、生化学和分子生物学等多方位综合评价及分析。
三、预期研究成果1. 明确OsGATAs在水稻生长发育中的作用和机制;2. 探索OsGATAs在调控水稻生长发育时的分子机制;3. 对水稻生长发育的调控提供新的理论和实验依据。
四、研究意义本研究将深入探讨OsGATAs调控水稻生长发育时的分子机制,有利于揭示水稻生长发育的分子调控机理,可以为优化水稻种植和提高产量提供理论支持。
《水稻OsGH3-4生物学功能分析》篇一一、引言水稻作为全球重要的粮食作物,其生长和发育过程中涉及的基因表达与调控机制一直是生物学研究的热点。
OsGH3-4是近年来在水稻中发现的基因,它属于GH3家族的一员,参与了多种生物学过程。
本文旨在通过分析OsGH3-4的生物学功能,揭示其在水稻生长发育中的作用及潜在的分子机制。
二、OsGH3-4基因简介OsGH3-4基因位于水稻基因组中,编码的蛋白质属于GH3家族。
GH3家族是一类广泛存在于植物中的酶,参与多种生物过程,如激素代谢、信号转导等。
OsGH3-4的序列结构、表达模式及与其他GH3家族成员的相似性等特征,表明它在水稻中具有重要功能。
三、OsGH3-4的生物学功能分析1. 激素代谢与信号转导OsGH3-4参与植物激素的代谢与信号转导过程。
研究表明,该基因的表达与植物激素如生长素、细胞分裂素等密切相关。
通过敲除或过表达OsGH3-4基因,可以观察到植物激素相关生理反应的改变,如根的生长、叶片发育等。
这表明OsGH3-4在植物激素代谢和信号转导中发挥重要作用。
2. 氮素代谢与植物生长氮素是植物生长的重要营养元素,而OsGH3-4基因在氮素代谢中发挥了关键作用。
研究发现在水稻中过表达OsGH3-4基因可以提高氮素的吸收和利用效率,促进植物的生长和发育。
这表明OsGH3-4在氮素代谢和植物生长中具有重要功能。
3. 逆境响应与抗性逆境条件下,植物会通过调节基因表达来应对环境变化。
研究发现,OsGH3-4基因在逆境条件下表达量发生变化,这表明它可能参与了逆境响应过程。
通过敲除或过表达OsGH3-4基因,可以观察到植物对逆境如干旱、盐碱等环境的抗性发生变化。
这表明OsGH3-4在逆境响应和抗性中发挥了重要作用。
四、分子机制探讨OsGH3-4的生物学功能与其编码的蛋白质结构、互作蛋白以及基因表达的调控等因素密切相关。
研究通过分析OsGH3-4基因的互作网络和表达模式,探讨了其作用的分子机制。
《水稻OsGH3-4生物学功能分析》篇一一、引言近年来,植物生长素应答的调控研究成为生物学领域的热点,其中生长素相关基因作为调节植物生长与发育的重要基因组之一,受到广泛的关注。
OsGH3-4是一种生长素相关基因,其在水稻(Oryza sativa)中的表达和功能研究具有重要的科学意义。
本文旨在分析水稻OsGH3-4的生物学功能,以期为农业生产及植物生长发育研究提供理论基础。
二、材料与方法1. 材料本研究采用的水稻品种为粳稻(Nipponbare),以及经由分子生物学技术构建的OsGH3-4基因的过表达和抑制表达转基因株系。
2. 方法(1)基因克隆与转基因株系构建:通过PCR技术克隆OsGH3-4基因,并构建过表达和抑制表达的转基因株系。
(2)表达分析:利用实时荧光定量PCR(qRT-PCR)技术,分析OsGH3-4基因在不同组织及不同发育阶段的表达情况。
(3)表型分析:对转基因株系进行表型观察,分析OsGH3-4基因过表达或抑制表达对水稻生长发育的影响。
(4)功能分析:利用酵母双杂交、生物化学实验及分子生物学技术,探讨OsGH3-4的生物学功能及其与生长素等植物激素的关系。
三、结果与分析1. 基因表达分析通过qRT-PCR实验发现,OsGH3-4基因在水稻不同组织及不同发育阶段存在差异性表达。
在根、茎、叶等组织中均有一定程度的表达,而在分蘖期、抽穗期和成熟期等生长发育阶段,其表达量有明显变化。
2. 表型分析(1)过表达株系表型分析:OsGH3-4基因过表达的转基因株系表现出较强的生长势和分蘖能力,株高和生物量显著增加。
同时,对病虫害的抗性也得到了一定程度的提高。
(2)抑制表达株系表型分析:与野生型相比,OsGH3-4基因抑制表达的转基因株系生长势较弱,分蘖能力降低,株高和生物量明显减少。
此外,这些株系对某些病虫害的抗性也较弱。
3. 功能分析(1)酵母双杂交实验:通过酵母双杂交实验发现,OsGH3-4可以与其他生长素相关蛋白发生相互作用,表明其可能参与生长素的信号传导过程。
《水稻OsVDAC4与其互作蛋白功能的初步研究》一、引言近年来,随着植物生物学领域研究的深入,水稻作为重要的粮食作物,其生理生化特性的研究日益受到关注。
其中,线粒体电压依赖性阴离子通道(VDACs)作为线粒体膜上的重要组成部分,在细胞能量代谢、凋亡等过程中发挥着关键作用。
OsVDAC4是水稻线粒体电压依赖性阴离子通道家族的成员之一,其与互作蛋白的功能研究对于揭示水稻生长与发育的分子机制具有重要意义。
本文将就水稻OsVDAC4及其互作蛋白功能进行初步研究,为进一步揭示其在植物生长与代谢中的作用提供理论基础。
二、材料与方法1. 材料本研究采用水稻品种为粳稻品种日本晴,通过基因克隆技术获得OsVDAC4基因及其互作蛋白基因。
2. 方法(1)基因克隆与序列分析:通过PCR扩增法获取OsVDAC4基因及其互作蛋白基因,并进行序列分析。
(2)蛋白表达与纯化:将目的基因克隆至表达载体,转化至大肠杆菌中表达,并采用亲和层析法纯化目的蛋白。
(3)酵母双杂交实验:通过酵母双杂交实验检测OsVDAC4与互作蛋白之间的相互作用。
(4)生物信息学分析:利用生物信息学软件分析OsVDAC4及其互作蛋白的理化性质、结构特点等。
三、结果与分析1. 基因克隆与序列分析通过PCR扩增法成功克隆了OsVDAC4基因及其互作蛋白基因,并进行序列分析。
结果表明,OsVDAC4基因编码的蛋白质具有典型的线粒体电压依赖性阴离子通道结构特征。
互作蛋白的序列也符合预期,表明其可能与OsVDAC4存在一定的相互作用。
2. 蛋白表达与纯化将目的基因克隆至表达载体,转化至大肠杆菌中表达,并采用亲和层析法纯化目的蛋白。
经过纯化后的OsVDAC4和互作蛋白纯度较高,可用于后续实验。
3. 酵母双杂交实验通过酵母双杂交实验检测OsVDAC4与互作蛋白之间的相互作用。
结果表明,OsVDAC4与互作蛋白在酵母细胞中存在相互作用,进一步证实了两者之间的关联性。
4. 生物信息学分析利用生物信息学软件对OsVDAC4及其互作蛋白进行理化性质、结构特点等分析。
《水稻OsIAA20基因功能研究》篇一一、引言随着农业生物科技的进步,对于植物基因的功能性研究显得越来越重要。
在水稻这种主要粮食作物中,对于基因的研究可以帮助我们了解其生长发育的机制,提高产量和抗逆性。
其中,OsIAA20基因作为一种在植物生长调控中具有重要功能的基因,对其功能的深入研究,有助于进一步优化水稻种植和提高其生产效益。
二、OsIAA20基因的背景OsIAA20基因是植物生长素响应因子家族的一员,它在植物的生长和发育过程中扮演着重要的角色。
在早期的研究中,我们发现OsIAA20基因在水稻中的表达水平会受到不同环境条件的影响,例如光、温度、营养状况等。
然而,关于OsIAA20基因的具体功能,我们仍知之甚少。
三、研究方法为了深入研究OsIAA20基因的功能,我们采用了多种研究方法。
首先,我们利用生物信息学手段分析了OsIAA20基因的序列特性及其与其他生长素响应因子的关系。
然后,我们通过基因编辑技术,创建了OsIAA20基因的过表达和敲除突变体,以观察其在水稻生长过程中的作用。
此外,我们还利用了分子生物学和遗传学手段,对OsIAA20基因的表达模式和调控机制进行了深入研究。
四、OsIAA20基因的功能研究1. 表达模式研究我们发现OsIAA20基因在水稻的各个组织中都有表达,尤其是在根和叶中表达量较高。
在不同的生长阶段和环境条件下,OsIAA20基因的表达水平也会发生变化。
这表明OsIAA20基因可能参与了水稻的多种生物学过程。
2. 对生长发育的影响通过对过表达和敲除突变体的研究,我们发现OsIAA20基因对水稻的生长发育有显著影响。
过表达OsIAA20基因的水稻植株表现出更强的生长势和更高的生物量。
相反,敲除OsIAA20基因的水稻植株则表现出生长受阻的现象。
这表明OsIAA20基因在促进水稻生长方面具有重要作用。
3. 对抗逆性的影响我们还发现OsIAA20基因对水稻的抗逆性有影响。
过表达OsIAA20基因的水稻植株在遭受环境压力(如干旱、盐碱等)时,能够更好地抵抗这些压力,维持正常的生长状态。
水稻OsSKIPa互作蛋白OsTMF和OsARID3在抗逆和发育中的功能研究非生物逆境严重制约着植物的生长发育和作物的生产增收,水稻是世界上主要的粮食作物之一,研究水稻对非生物逆境的适应和抵抗机制,将有助于对其进行抗逆遗传改良,扩大种植范围、提高产量。
OsSKIPa是本室已经鉴定的一个在水稻抗逆和生长发育过程中起关键作用的转录调控因子。
抑制表达OsSKIPaa的转基因水稻(OsSKIPa-RNAi)细胞活力降低、生长受阻;而超量表达OsSKIPa的转基因水稻(OsSKIPa-OE)在干旱胁迫下能维持较高的细胞活力,抗旱能力增强,并且其中很多抗逆关键基因的表达发生显著变化。
另外,OsSKIPa-OE植株对低温胁迫的敏感性显著提高。
为了解析OsSKIPa调控水稻抗逆性和生长发育的分子机制,本研究从OsSKIPa的互作蛋白入手,研究了其中两个转录因子(OsTMF和OsARID3)在水稻逆境应答和生长发育中的作用。
OsTMF是人类TMF(TATAelementmodulatory factor)蛋白在水稻中唯一的同源蛋白。
OsTMF通过其C-末端的TMF_TATA_bd结构域与OsSKIPa互作。
超量表达OsTMF 的转基因水稻(OsTMF-OE)与对照水稻“中花11”相比,在正常条件和干旱、高盐和高温等逆境胁迫下没有明显差异;在低温胁迫下,OsTMF-OE植株表现出更高的敏感性,却积累更多的脯氨酸。
基因芯片分析显示,低温胁迫下,OsTMF-OE植株中参与低温应答调控的DREBls基因的表达显著上升,而参与活性氧(ROS)清除的过氧化物酶基因(POXs)的表达显著下降。
与之相对应的是,ostmf突变体耐低温胁迫的能力显著高于野生型;低温胁迫下ostmf突变体中脯氨酸含量降低,DREBls基因的表达显著下降,而POXs基因的表达显著上升。
另外,OsTMF-OE植株对氧化胁迫的敏感性提高。
这些结果说明OsTMF对植物在低温胁迫下的信号传递和应答过程起着正调控作用,OsTMF促进低温胁迫下DREB1s基因的表达和脯氨酸的产生,并通过负调控POXs基因的表达来维持ROS 水平,以激活依赖于ROS的低温胁迫信号传递。
《水稻OsGH3-4生物学功能分析》篇一一、引言水稻作为全球最重要的粮食作物之一,其生长发育及产量形成受多种基因调控。
OsGH3-4是近年来在稻属植物中发现的一个关键基因,它在植物生长发育过程中起着重要作用。
本文旨在分析水稻OsGH3-4的生物学功能,以加深对这一基因的了解,并为提高水稻产量提供理论依据。
二、OsGH3-4基因简介OsGH3-4基因属于GH3家族,GH3家族基因是一类参与植物生长、发育和应激反应的重要调控因子。
OsGH3-4在水稻中具有独特的表达模式和功能,对于植物的生长发育、逆境适应以及产量形成等方面具有重要作用。
三、OsGH3-4的生物学功能分析1. 参与植物生长发育OsGH3-4基因在植物生长发育过程中起着关键作用。
研究表明,该基因的表达与植物根、茎、叶等组织的生长密切相关。
通过敲除或过表达OsGH3-4基因,可以观察到植物表型发生明显变化,如根系发育、叶片形态以及植物的高度等。
这些变化进一步证明了OsGH3-4在植物生长发育过程中的重要作用。
2. 抗逆性分析除了参与植物生长发育,OsGH3-4还具有抗逆性功能。
通过对OsGH3-4基因进行敲除或过表达,发现转基因植物在逆境条件下的表现有所不同。
例如,过表达OsGH3-4的植物在干旱、盐碱等逆境条件下表现出更强的抗逆能力,而敲除该基因的植物则表现出相反的表型。
这表明OsGH3-4在提高植物抗逆性方面具有重要作用。
3. 产量形成及品质改善OsGH3-4基因的过表达可以显著提高水稻的产量和品质。
研究显示,过表达该基因的转基因水稻具有更高的生物量、更多的分蘖数和穗粒数,从而提高产量。
此外,转基因水稻还表现出更优的籽粒品质和更强的抗倒伏能力。
这些结果说明OsGH3-4在提高水稻产量和品质方面具有潜在的应用价值。
四、结论本文通过对水稻OsGH3-4基因的生物学功能进行分析,发现该基因在植物生长发育、抗逆性以及产量形成等方面具有重要作用。
专利名称:一个调控水稻根生长发育的转录因子基因OsWOX20的克隆及应用
专利类型:发明专利
发明人:赵毓,周道绣
申请号:CN200710052664.2
申请日:20070709
公开号:CN101323853A
公开日:
20081217
专利内容由知识产权出版社提供
摘要:本发明属于植物基因工程技术领域,具体涉及一个调控水稻根生长发育的转录因子基因OsWOX20的分离克隆、功能验证和应用。
本发明的特征是,分离得到一种调控水稻根生长发育的转录因子基因OsWOX20DNA,其具有(a)序列表SEQ ID NO:1中第1-786位所示的DNA序列,或(b)编码与(a)编码的蛋白质相同的蛋白质的DNA序列。
本发明的启动子具有如序列表SEQ ID NO:3中的第1-2078位所示的DNA序列。
用克隆的基因序列对水稻品种进行了转化,获得根生长发育明显改善的转基因水稻植株;该启动子驱动的报告基因在水稻的根中特异表达。
本发明显示了克隆的目标基因和启动子在培育改善根生长发育性能的转基因水稻上的良好应用前景。
申请人:华中农业大学
地址:430070 湖北省武汉市洪山区狮子山街1号
国籍:CN
代理机构:武汉宇晨专利事务所
代理人:王敏锋
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专利名称:水稻基因OsGRF4在提高植物耐冷性中的应用专利类型:发明专利
发明人:孙平勇,邓华凤,毛东海,张武汉,陈彩艳,舒服,何强,邢俊杰,彭志荣,谢芸
申请号:CN201910335375.6
申请日:20190424
公开号:CN109988231B
公开日:
20220329
专利内容由知识产权出版社提供
摘要:本发明提供水稻基因OsGRF4在提高植物耐冷性中的应用。
本发明涉及的水稻基因OsGRF4为穗部性状调控基因,来源于籼稻品种川大粒,该基因表达量的升高导致水稻耐冷性的增强。
实验结果表明,在冷胁迫下OsGRF4超表达转基因株系的存活率显著高于野生型,而OsGRF4抑制表达转基因株系的存活率显著低于野生型,本发明首次证明OsGRF4基因具有增强水稻耐冷性的功能。
OsGRF4基因对于培育耐冷水稻品种具有较大的应用前景,本发明为植物抗寒育种,特别是水稻抗寒育种提供了新的基因资源。
申请人:湖南杂交水稻研究中心,中国科学院亚热带农业生态研究所
地址:410125 湖南省长沙市芙蓉区马坡岭远大二路736号
国籍:CN
代理机构:北京路浩知识产权代理有限公司
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中文标题:OsBELL4A 调控水稻 WOX 家族基因表达及水稻幼苗生长和耐逆
发表单位:中国农业科学院生物技术研究所
中文核心期刊:中国农业科技导报
研究背景:
转录调控能够改变基因表达水平,进而调控生物自身生长发育以及响应逆境胁迫。
目前水稻中鉴定到 2300个转录调控因子,按照蛋白结构它们被分为不同的家族,如MYC 家族、 MYB 家族、WRKY 家族、AP2/EREBP 家族和TALE 家族。
其中,TALE 家族包含两个亚家族: KNOX 和BELL。
BELL 家族在水稻根系发育及逆境胁迫应答中的功能还有待研究。
研究思路
本研究通过与拟南芥序列比对,在水稻中鉴定到 4 个 BELL4同源基因,并对它们同源基因的启动子元件进行了分析。
进一步又对水稻幼苗根中BELL4同源基因在不同激素和非生物胁迫处理条件下的表达模式进行了分析。
同
时利用OsBELL4的干扰材料分析了其在水稻根系发育中的功能及其与 WOX 家族间的调控关系。
背景知识
1: 植物根系是植物与土壤接触的部分,也是研究植物适应环境,应对逆境胁迫的理想模型,对植物整个生长发育过程都起着重要作用。
2:BELL家族成员在分生组织和花器官发育、芽尖分生组织的起始和维持、叶片发育、开花、卵细胞分化和珠被发育等生物学过程中发挥重要的功能。
主要结果:
1:水稻中BELL4的启动子中含有响应脱落酸、乙烯、赤霉素和生长素的元件
对水稻BELL4同源基因起始密码子 ATG 上有2kb 启动子区域进行分析,发现4个基因的启动子中含有响应脱落酸、乙烯、赤霉素和生长素的元件,表明 BELL 蛋白水稻中中发挥功能受到植物激素或者外界环境的调控
图注:BELL4 基因启动子序列分析
2:不同激素对水稻根系中 BELL4 同源基因的影响
图注:不同激素处理下水稻 BELL4 同源基因的表达分析水稻根系在100 μmol/L IAA 、ACC处理下,OsBEL L4B、OsBELH4A、 OsBELH4A 和 OsBELH4B的表达量迅速
下调,在 10 μmol/L GA3处理下,OsBELL4B 和 OsBEL H4A的表达量急剧下调, OsBELHB 表达量显著升高。
AB A 对于OsBELH4A 和 OsBELH4B 表达的促进作用并不明显,且抑制12 h 部分解除。
说明水稻根系中的 BELL4 同源基因均能快速响应响应乙烯、生长素、赤霉素及脱落酸等植物激素。
3:非生物胁迫对水稻根系中 BELL4 同源基因的影响
图注:干旱、低温和盐处理条件下水稻 BELL4 同源基因的表达模式分析
对日本晴幼苗根系进行干旱、低温及盐处理,干旱处理抑制了 OsBELL4A 和 OsBELH4A 表达,而诱导 OsBE LH4B 的表达,对 OsBELL4B 的表达无显著影响。
在低温胁迫下 OsBELL4A 和 OsBELL4B 的基因表达有上调的趋势,后期表达量又会受到抑制,而 OsBELH4A 和 OsBELH 4B 则一直呈现下调的趋势。
在盐胁迫下,OsBELH4A和OsBELH4B分别在胁迫0.5 h和6 h出现了上调趋势, O sBELL4A 和 OsBELL4B 基因表达都呈下调趋势。
这种不同的表达模式说明水稻根中BELLE同源基因参与这些激素信号介导的生长发育进程及抗逆性。
4:OsBELL4A RNAi 干扰转基因植株的表型分析及其 WOX 家族基因的表达分析
图注:OsBELL4A 的RNAi 干扰转基因植株苗期根表型
OsBELL4A 的RNAi 干扰转基因植株的根系生长情况与野生型( NIP) 有较明显的差异,表明OsBELL4A 参与调控水稻幼苗根系的发育,抑制OsBELL4A 的表达可以促进冠根的发育并延缓初生根的伸长。
图注:OsWOX 基因家族在 OsBELL4A RNAi转基因植株中的表达水平
OsBELL4A 的两个干扰株系RI-49 和RI-58都表现出冠根数量增加而主根的长度下降的表型,并且在这两个株系中OsWOX9 的表达量都较野生型有明显的增加,说明 OsBELL4A对OsWOX9基因表达的调控很有可能是导致 OsBELL4A RNAi干扰转基因植株冠根数增加的原因。
结论:
BELL 家族基因在水稻根系中参与多种植物激素信号转导及逆境胁迫应答反应,并且 OsBELL4A 在水稻根发育中起到调控作用,这种作用与 OsWOX 家族基因表达有很大相关性。
该研究丰富了 BELL 家族基因的功能,为探究 BELL家族在水稻根系发育及逆境胁迫应答中的功能奠定基础。