一视网膜色素变性家系的基因检测分析
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常染色体隐性视网膜色素变性家系致病基因突变分析的开题报告一、研究背景视网膜色素变性(Retinitis Pigmentosa,RP)是由于视网膜色素上皮细胞或视锥细胞及视杆细胞等视网膜细胞受损,导致逐渐视力减退,最终导致失明的一系列疾病。
该疾病的发病率比较高,在全球范围内影响了数百万人。
常染色体隐性视网膜色素变性家系致病基因突变是该疾病的主要遗传模式之一,该模式具有隐匿性和可逆性,患者往往在先天后将来的日子里逐渐表现出病状。
因此,对于RP的早期诊断和治疗具有重要意义。
随着分子遗传学、克隆技术的发展,对RP的研究日益深入,但在目前的研究中,对RP家系致病基因的研究还远远不够,尤其是对于常染色体隐性视网膜色素变性家系致病基因的研究还存在局限和不足。
二、研究目的和意义本研究的主要目的是通过基因突变分析,筛选出常染色体隐性视网膜色素变性家系致病基因,为RP的早期诊断和治疗提供一定的理论依据。
具体任务包括:1.筛选具有RP家系的患者,准确诊断病情,并开展基因突变分析;2.根据先前相关研究,选择合适的基因突变分析方法,并建立分析框架;3.对突变基因进行功能分析,探究其在视网膜色素变性中的具体作用机制;4.分析突变基因在RP中的表达和调控,以及与其相关的生物通路;5.提出RP治疗和干预的相关建议和措施。
通过此研究,我们可以深入探究常染色体隐性视网膜色素变性家系致病基因的作用机制,为RP的早期诊断和治疗提供更为科学、准确的理论基础。
三、研究方法本研究采用横向对照研究设计,对具有RP家系的患者和正常人进行对照分析。
主要方法包括:1.收集RP家系患者的临床资料和生物样本,实施基因突变分析;2.建立分子遗传学分析框架,拟定突变基因的函数筛选和功能分析;3.采用PCR、DNA测序、南方和西方印迹等方法进行突变基因的检测和分析;4.上机分析和生信分析,探究突变基因在RP中的表达调控和与其相关的生物通路。
四、研究计划1.前期准备(1个月):采集RP家系患者生物样本,建立临床数据库,拟定突变基因分析方案。
视网膜色素变性病的基因单基因遗传模式研究视网膜色素变性病是一种以视网膜萎缩和视力丧失为主要表现的疾病,是影响人类视力的最主要原因之一。
该病是一种遗传性疾病,基因单基因遗传模式是其遗传方式之一。
视网膜色素变性病患者基因单基因遗传模式的研究旨在揭示该病的遗传机制,为诊断和治疗提供支持。
目前,已经有很多研究对该病的基因遗传模式进行了研究,并且取得了很大的进展。
研究人员发现,视网膜色素变性病有多种遗传方式,其中基因单基因遗传模式是比较典型的一种方式。
该模式主要是由一个有缺陷的基因所引起的,称为突变基因,同时另一个正常的基因称为野生型基因。
在视网膜色素变性病的基因单基因遗传模式中,突变基因和野生型基因分别处于同一基因位点的不同等位基因上。
因此,突变基因与野生型基因的作用是互相抵消,使得基因表达和遗传信息的继承规律有一定的变异性。
根据目前研究的结果,视网膜色素变性病的基因单基因遗传模式可以分为两种,分别是常染色体显性遗传和常染色体隐性遗传。
常染色体显性遗传是指患者只需有一个基因突变就能够表现出疾病的特征,而常染色体隐性遗传则需要两个基因突变才能表现出疾病的特征。
在常染色体显性遗传中,突变基因只需要与一个野生型基因匹配即可表现疾病的特征,因此该模式的患病率比较高。
而在常染色体隐性遗传中,突变基因需要与另一个突变基因匹配才能表现疾病的特征,因此患病率相对较低。
除此之外,视网膜色素变性病的基因单基因遗传模式还有一些其他特点,比如不同基因位点的基因突变会导致不同的临床表现和遗传规律,这些特点也在研究中得到了很好的体现。
总的来说,视网膜色素变性病的基因单基因遗传模式研究在深入了解该病的遗传机制和发病规律方面做出了重要的贡献,为该病的诊断和治疗提供了重要的支持。
随着对该病遗传机制的深入探究,相信未来会有更多的进展和成果。
视网膜色素变性-感音神经性耳聋综合征MYO7A基因致病突变筛查发表时间:2017-04-25T15:33:26.607Z 来源:《健康世界》2017年第4期作者:王佳盟马誓成静石毅朱献军[导读] 探讨一个中国视网膜色素变性-感音神经性耳聋综合征家系的致病基因及其突变位点。
1、河南省虞城县高级中学高三13班;2、四川省人民医院摘要:目的探讨一个中国视网膜色素变性-感音神经性耳聋综合征家系的致病基因及其突变位点。
方法在签署知情同意书后,对该家系先证者及父母进行病史收集、常规查体、视野检查及视网膜电图检查。
采集家系成员静脉血,提取基因组DNA、全外显子组测序、生物信息数据分析和Sanger测序验证突变位点。
结果该家系有1例患者,表现为青少年时期发病,视野渐进性变窄,周边视力受损,听力受损,耳聋,视网膜现色素沉着,mfERG显示a波、b波振幅下降。
患者父母均正常,为杂合突变携带者,符合常染色体隐性遗传模式特征。
外显子组测序、数据过滤和Sanger测序验证发现在MYO7A基因上存在两个突变位点:NM_001127180, c.3695_3705del, p.R1232fs和NM_001127180,c.6234+5 G>A。
在1000例健康人对照中没有发现该两个突变。
结论本研究发现MYO7A致病基因上两个新的突变位点,扩大了MYO7A致病突变谱,为临床诊治提供了新靶点。
关键词:视网膜色素变性-感音神经性耳聋综合征;全外显子组测序;常染色体隐性遗传;MYO7A基因视网膜色素变性-感音神经性耳聋综合征1型(Usher I)是一类以渐进性视网膜色素变性、视力受损、先天性耳聋为之一表现的常染色体隐性遗传性疾病,具较强遗传异质性,以其发现者英国眼科医生Charles Usher命名。
Usher综合征在美国和欧洲的发病率约为4.4/100,000[1],中国的发病率约为0.03%[2]。
眼科症状临床上表现为夜盲,暗光线下视力障碍,行走困难,伴视力渐进性丧失,视野缩小,直至管状/隧道状视野。
文章编号:100025404(2002)0120055203论著RH O基因突变在视网膜色素变性中的分子遗传学分析张晓莉,府伟灵,薛 强,张 雪 (第三军医大学附属西南医院检验科,重庆400038) 提 要:目的 探明我国RP患者视紫红质(rhodopsin,RH O)基因突变的特征和意义。
方法 在98例RP患者中运用构象敏感凝胶电泳(con formation sensitive gel electrophoresis,CSGE)和DNA直接测序方法检测RH O基因全编码区范围内的点突变。
结果 一个ADRP家系的4名患者第347密码子发生点突变,Pro347Leu;另一个ADRP家系中一名晚发型患者及其目前还未出现症状的女儿在第327密码子出现点突变,Pro327(12bp del),而对照组100例健康成年人未发现上述两种突变。
此外在1名患者和2名对照者中还检出一非致病的点突变,Ala299Ser,属单个碱基多态现象(single nucleotide polym ophism,S NP)。
结论 98例RP先证者中检出2例携带RH O基因突变,由此可初步预测RH O基因在我国RP患者中的突变频率约为2%(95%的可信区间为0.2%~7.0%)。
Pro347Leu突变改变了视蛋白C末端一段高度保守的氨基酸序列,致使该蛋白在胞内的运输发生障碍。
Pro327(12bp del)使突变蛋白的羧基末端失去了原有的磷酸化位点及上述一段高度保守的功能区,其可能的致病机制有待在今后的研究中通过建立相应的转基因模型或细胞培养系统来阐明。
关键词:视网膜色素变性;视紫红质基因;基因突变;构象敏感凝胶电泳;DNA测序 中图法分类号:R394.3;R774.13 文献标识码:AMolecular study on rhodopsin gene point mutations in retinitis pigmentosaZH ANG X iao2li,FU Wei2ling,X UE Qiang,ZH ANG Xue(Department of Clinical Laboratories,S outhwest H ospital,Third M ilitary M edical University, Chongqing400038,China) Abstract:Objective T o evaluate the patterns and significance of rhodopsin(RHO)gene mutations in Chinese patients with retinitis pigmentosa (RP).Methods C on formation sensitive gel electrophoresis(CSGE)and direct DNA sequencing were em ployed to detect point mutations occurring in the5coding ex ons and splice sites of rhodopsin gene in98subjected patients with RP.Re sults F our patients of one autos omal dominant RP (ADRP)family were found to have a missense mutation at codon347,Pro347Leu.One late2onset RP patient and her daughter,who had no clinical expressions at present,were discovered to have a novel frameshift mutation at codon327,Pro327with only one base loss.N one of the2mutations was found in100normal controls.Ala299Ser was found in one patient as missense mutation.T w o control subjects als o had Ala299Ser,suggesting its nonpathogenicity and just single nucleotide polym ophism(S NP).Conclusion S ince2out of98RP patients have rhodopsin mutations,the frequen2 cy of RH O mutations in RP might be about2.0%(95%con fidence interval0.2%~7.0%).A highly conserved C2terminal sequence QVS(A)PA is altered due to Pro347Leu and thereby rhodopsin is misdirected to an incorrect subcellular location.Loss of all phosphorylation sites at the C2termi2 nus and the highly conserved sequence QVS(A)PA may occur because of Pro327.T o elucidate the predominant biochemical defects in such mutant, the study of transgenic mice and trans fected culture cells carrying Pro327(12bp del)is of great value. K ey w ords:retinitis pigmentosa;rhodopsin;mutation;con formation sensitive gel electrophoresis;sequencing 视网膜色素变性(Retinitis pigmentosa,RP)是视网膜感光细胞和色素上皮细胞变性导致夜盲和进行性视野缺损的一组最常见的致盲眼底病,全世界约有150万人患此病,其中中国人占1Π4左右[1]。
眼视网膜色素变性症的遗传学研究眼视网膜色素变性症,简称AMD,是一种常见的视网膜疾病,主要表现为视力逐渐减退、视野模糊、颜色感知异常等症状。
这种疾病的发生与遗传因素有着密切的关系,因此对AMD的遗传学研究至关重要。
AMD的遗传模式复杂多样,其中最为典型的是单基因遗传模式和复杂遗传模式。
单基因遗传模式指的是AMD是由一个单一的遗传基因所致,这种遗传模式多见于家族性AMD的病例。
复杂遗传模式包括多基因遗传、环境因素和基因-环境交互作用等多个因素所导致的AMD,这种遗传模式多数见于散发性AMD的病例。
在AMD的遗传模式中,相关的基因被认为是起着至关重要的作用。
目前已经发现的与AMD相关的基因包括了CFH、ARMS2、HTRA1等等。
其中,CFH基因的突变是AMD的最主要原因之一,而ARMS2和HTRA1基因的突变也在AMD的发生中贡献不小。
除此之外,环境因素也对AMD的发生和发展起着一定的影响。
如年龄、吸烟、营养状况、糖尿病等都与AMD的发生有一定的关系。
同时,在基因和环境之间也有着交互作用,即基因-环境交互作用。
这种交互作用不仅对AMD的发生和发展有着重要的影响,也对AMD的预防和治疗提出了更为复杂的挑战。
幸运的是,随着现代技术的不断发展,AMD的遗传学研究也在不断深入和进步。
通过比较分析不同病例的基因组序列、表达谱和蛋白质组等数据,科研人员逐渐揭示了AMD的遗传调控网络和分子机制,这为AMD的诊断、治疗和预防提供了更为准确和有效的依据。
另外,由于AMD的遗传模式具有较高的家族性,家系研究也成为AMD研究中非常重要的一个方向。
通过追踪家庭中多代人的AMD发病情况,科研人员可以进一步深入探究AMD的遗传模式和机制。
总的来说,AMD的遗传学研究在不断深入和进步,不仅为AMD的预防和治疗提供了科学依据,也为我们更好地了解人类遗传学机制和生命起源和发展提供了更广阔的视野。
相信在不久的将来,人类将能够更好地了解和掌握AMD的遗传特征,为保护人类视力健康做出更大的贡献。
视网膜色素变性的基因、蛋白1857年在眼底镜发明不久,德国的一位内科医生Donders就发现了一些致盲的疾病视网膜有骨细胞样色素,为了描述他所见,起名为 Retinitis Pigmentosa(RP),这在学术上实际为一个误称,因为这种原发性缺陷并无炎症现象,但这个名称一直被广泛使用而得以保留下来。
在现代医学的定义中,RP被描述为一组遗传异质性的进行性的视网膜变性,主要影响周边部视网膜,病人有夜盲和进行性视野丧失,大约30%病人最终失明,其余病人最终也视力严重受损。
RP是一种最常见的视网膜变性,发病率约1:3500,全世界约有200 万人受累,眼科检查一般有视网膜动脉变细,视盘蜡黄色,有特征性骨细胞样色素沉着,同时电生理检查有杆细胞反应降低或引不出。
RP的色素一般认为是由于RPE(含色素)迁移到变性的视网膜上或由脉络膜毛细血管的巨噬细胞在迁移到受损的视网膜过程中“捡到”的变性RPE细胞中的色素。
RP的遗传类型有常染色体显性遗传、常染色体隐性遗传、性连锁遗传以及少数的线粒体DNA遗传和双基因模式遗传,另外仍有50%的患者无家族发病史,这些病人一般认为是阴性的,虽然他们也可能是X连锁或常染色体显性遗传的不全显性遗传,或新的显性突变。
这也可能说明他们代表了由于多对基因座的不支持的等位基因造成的遗传复杂性。
最近十年,我们对RP的遗传学认识有了很快发展,通过人量研究,对它的遗传异质性己成共识,这儿我们仅对无其它系统缺陷的RP进行综述。
到目前为1卜,有39个基因位点涉及典型的非综合症RP中,有30个致病基因确认,剩余的9个止在鉴定中(显性1个,阴性5个,性连锁3个)实际上RP仅是大量视网膜疾病中的一种,另外还有33个基因或位点与综合症型RP有关,总共有132个基因参与了人类各种形式的视网膜色素变性。
随着大量致病基因被确认,我们将大多数影响RP的蛋白质规划为6大类,表工综合了各组以及对各个蛋白的认识,汇总了各个致病基因,这种形式的分类让我们对引起视网膜变性的各种细胞缺陷有了清晰的认识。
一个疑似X连锁型视网膜色素变性家系的遗传连锁分析的研究朱静;张晓莉;府伟灵;阴正勤;张峰;贾若愚;李新【期刊名称】《重庆医学》【年(卷),期】2008(37)6【摘要】目的对一个疑似X连锁型视网膜色素变性(X-linked retinitis pigmentosa,XLRP)家系进行分析,确定其致病基因的所在位点.方法选取已知XLRP候选基因附近的微卫星位标,用多点参数分析方法计算其最大优势对数值(LOD score),并通过对家系成员单倍型分析,确定该家系致病基因所在的染色体位置.结果位于X染色体长臂的微卫星标记DXS8043与该例遗传家系间最大LOD 值小于-2,其他位于X染色体短臂的11个微卫星标记与该例遗传家系LOD值保持在0.5上下,无明显的高值.单倍型结果表明该家系中2例患者兄弟(Ⅲ1、Ⅲ6)和他们的携带者母亲(Ⅱ2)在DXS8051与DXSl214之问拥有在正常成员中不存在的基因型,表明该基因型与疾病共分离,进一步确定了他们X性连锁遗传模式,并且可将致病基因初步定位于DXS8051与DXSl214之间的RP23和RP6基因.结论可以排除该例家系的致病位点与X染色体长臂上的RP24基因的连锁,高度怀疑连锁位点存在于X染色体的短臂的RP23和RP6基因,需另增加位标的信息量,以进一步缩小致病基因所在的具体范围.【总页数】2页(P608-609)【作者】朱静;张晓莉;府伟灵;阴正勤;张峰;贾若愚;李新【作者单位】第三军医大学西南医院,基因诊断治疗中心,重庆,400038;第三军医大学西南医院,基因诊断治疗中心,重庆,400038;第三军医大学西南医院,基因诊断治疗中心,重庆,400038;第三军医大学西南医院,全军眼科中心,重庆,400038;中科院北京基因组研究所,北京,101300;中科院北京基因组研究所,北京,101300;中科院北京基因组研究所,北京,101300【正文语种】中文【中图分类】R774.12【相关文献】1.应用微卫星多态位点对X连锁型视网膜色素变性疾病进行遗传连锁分析的研究[J], 陈翠敏;府伟灵;张晓莉2.中国人一个显性视网膜色素变性家系8号染色体连锁分析 [J], 李宁东;李扬;赵堪兴;陈薇英;陆莎莎;王立;王黎明;单晓艳3.一个镜鲤家系的遗传多样性及经济性状的遗传连锁分析 [J], 金舒博;张晓峰;贾智英;郑先虎;孙效文4.一个肌萎缩侧索硬化家系D21S223微卫星位点遗传连锁分析 [J], 史树贵;李露斯;刘昕;倪兵;陈康宁5.遗传连锁分析法对一常染色体显性遗传性视网膜色素变性家系的基因定位研究[J], 马晓晔;魏锐利;蔡季平;朱莉因版权原因,仅展示原文概要,查看原文内容请购买。
视网膜色素变性与遗传因素的关系研究视网膜色素变性(Retinitis Pigmentosa,RP)是一组遗传性眼病的统称,其特征是视网膜神经节细胞和视杆细胞的进行性死亡和退化。
RP是一种非常罕见的疾病,但它的遗传性质使得它在某些人群中有较高的发生率。
本文将探讨视网膜色素变性与遗传因素的关系,并介绍一些相关的研究成果。
视网膜色素变性是一种遗传性疾病,目前已经发现与RP相关的遗传突变共有1000余种。
大多数RP病例呈现出常染色体显性遗传的模式,但也存在其他遗传模式,如常染色体隐性遗传、X连锁遗传等。
这些遗传突变可以导致视网膜色素变性相关基因的异常表达或功能缺陷,进而引发视网膜细胞的死亡和退化。
通过近年来进行的大量研究,已经鉴定出许多视网膜色素变性相关基因。
其中最常见的基因突变包括RHO、RPGR、PRPH2等。
这些基因突变会影响视网膜细胞的正常功能,导致视网膜逐渐丧失对光信号的感知和处理能力,从而造成患者在视觉上的受限。
研究表明,RP的发生率在不同的人群中有着显著的差异。
欧洲和北美等地的人群中RP的发生率相对较低,约为1/4000至1/5000,而亚洲地区,尤其是日本、中国和韩国等东亚国家,RP的发生率较高,约为1/1000至1/2000。
这种地域差异可能与不同人群中的遗传突变有关。
除了地域差异外,RP的遗传规律也显示出一定的复杂性。
虽然多数RP病例呈现出常染色体显性遗传的模式,但也存在其他遗传模式。
例如,常染色体隐性遗传模式的RP发生率相对较低,约占RP病例的15%至20%。
此外,X连锁遗传模式的RP主要发生在男性患者中,而女性患者则往往是带有突变基因的携带者。
对于RP的遗传机制的研究已经取得了一些进展,但仍有许多问题需要进一步研究。
例如,尽管已经鉴定出许多与RP相关的基因,但仍有一部分RP病例无法找到明确的遗传突变。
这表明还存在其他未知的遗传因素参与了RP的发生和发展。
此外,研究人员还研究了RP的遗传变异对疾病临床表现的影响。
亚洲人群视网膜色素变性的基因遗传学研究概述亚洲人群视网膜色素变性(Retinitis Pigmentosa,RP)是一种罕见但严重的眼部疾病,主要影响视网膜中的感光细胞,导致渐进性视力损失。
近年来,通过对RP患者的遗传学研究,科学家们发现多个与亚洲人群RP相关的基因突变。
本文将探讨这些基因在RP发病中的作用,并尝试提出预防和治疗该疾病的可能途径。
亚洲人群视网膜色素变性与基因1. RP的遗传方式视网膜色素变性可以通过不同的遗传方式传递给后代。
根据以往的研究,RP 分为常染色体隐性遗传、常染色体显性遗传以及X连锁遗传等几种类型。
这些不同类型又涉及到多个不同基因突变。
2. 亚洲人群RP相关基因近年来,科学家们对亚洲人群RP相关基因进行了深入研究。
其中,一些突变基因在亚洲地区患者中被发现频率较高。
研究表明,CERKL、EYS、USH2A、PRPH2等基因与亚洲人群RP的发病有关。
这些基因在视网膜中的功能紊乱会导致感光细胞逐渐退化。
3. 基因突变对RP发病的影响亚洲人群RP相关的基因突变可以直接或间接地影响视网膜中感光细胞的正常功能。
一些突变会损害视觉信号传导、感受器结构或保护系统,导致感光细胞死亡和视力退化。
此外,有研究表明RP可能涉及到其他脑部和视觉系统内组织的异常功能。
通过深入了解这些突变对RP发病机制的影响,我们可以更好地理解该疾病并寻找针对性治疗方法。
预防和治疗策略1. 基因诊断和咨询根据已知的RP相关基因,在亚洲人群中进行基因筛查有助于早期诊断和风险评估。
当有家族成员患有RP时,其他家庭成员可以通过基因检测确定是否存在遗传风险,并及早采取预防措施。
2. 药物治疗的前景目前,尚无特效药物可以完全治愈RP。
然而,一些研究表明一些潜在的药物具有减缓RP进展的作用。
例如,利用维生素A、抗氧化剂和光敏剂等对视网膜进行保护,可在一定程度上延缓疾病的发展。
此外,使用基因治疗和基因编辑技术也显示出治疗RP的潜力。
我国X连锁型视网膜色素变性家系的基因连锁定位及突变的分析研究的开题报告1. 研究背景和意义视网膜色素变性(Retinitis pigmentosa, RP)是一种以视网膜感光细胞的凋亡和色素沉积为主要特征的遗传性眼病。
RP的发病率很高,每年全球新增病例约有150万人。
在RP中,X连锁遗传的RP(X-linked RP, XLRP)约占15-20%。
XLRP的致病基因研究对于揭示RP的分子机制、提高对RP的认识和诊疗,具有重要的意义。
2. 研究目的本研究旨在通过遗传学分析,寻找并锁定我国XLRP家系的致病基因定位,进一步深入研究基因的功能和突变类型,为该疾病的临床诊疗提供科学的依据。
3. 研究方法3.1 家系选择:收集我国某地区具有 XLRP 疾病家族史的患者和家人,建立家系并进行基因型分析。
3.2 DNA 提取:从家系成员的外周血中提取 DNA,采用标准的基因组 DNA 提取方法。
3.3 PCR 扩增:利用已报道的据有代表性的 XLRP 基因及 flanking 区的 primers 进行 PCR 扩增,选取家系成员的特定基因位点,分别分析家系内序列特征,检测序列多态性。
扩增反应后,将 PCR 产物纯化后送至生物科技公司进行测序。
同时,利用多态性标记对扩增产物进行分型,筛选与 RP 相关的多态性标记,与基因座进行连锁分析。
3.4 测序与分析:对测序数据进行质量控制、序列比对和变异筛选,计算 LOD 分值和连锁分析,测序结果进行群体遗传和统计学分析,根据家系成员的基因型确定XLRP 病因基因定位,进行突变分析和功能预测。
4. 研究预期结果本研究将通过家系整合、遗传分析、定位鉴定确切的 XLRP 病因基因。
预计可筛查发现新的 XLRP 突变位点,明确该疾病的发病机制,深入研究 XLRP 相关基因功能和调节机制,为该疾病的诊断和治疗提供科学的依据。
5. 研究意义本研究将为揭示 XLRP 的病因机制、临床症状和分子特征的提高和诊疗方案的制定提供科学依据。
视网膜色素变性RPGR基因ORF15检测基因检测过程中,数据解读是很重要的一个环节。
如果对疾病了解不清楚,或者对数据不敏感,很有可能会漏检。
后续我们会为大家介绍解读过程中遇到的各种坑儿。
今天为大家带来的是一个视网膜色素变性RPGR基因ORF15的检测案例。
1.视网膜色素变性简介视网膜色素变性(retinitis pigmentosa,RP)是一组以感光细胞和色素上皮细胞进行性选择性丧失为特点的遗传致盲眼病,世界范围内发病率为1/3000,是致盲的主要病因之一,目前无有效疗法。
该病早期症状为夜盲,随病程发展,中心视力逐渐减退,最终可完全失明。
RP可以在眼部单独存在,也可以是全身多个系统疾病或综合征的眼部组成部分。
RP可呈常染色体显性遗传、常染色体隐性遗传、X连锁遗传、线粒体遗传和双基因遗传。
在所有RP患者中,常染色体显性遗传占15-25%,常染色体隐性遗传占5-22%,X连锁遗传占5-15%。
2.RPGR是X连锁视网膜色素变性的主要致病基因,外显子ORF15具有复杂结构在各类遗传型的RP患者中,X连锁视网膜色素变性( X-linked retinitis pigmentosa,XLRP)临床表现最为严重,患者发病早,通常在20岁之前出现夜盲等视觉障碍,在40岁之前可进展为部分或完全失明。
RPGR是XLRP最重要的的致病基因,能解释XLRP 70%-75%的病因[参考文献1]。
RPGR又称为视网膜色素变性GTP酶调控因子(retinitis pigmentosa GTPase regulator),位于Xp21.1。
该基因有多种剪切体,最初发现的剪切体A含有19个外显子,编码815个氨基酸的蛋白。
检测该转录本上的变异,能够找到10-20%的XLRP 患者的致病变异。
后来剪切体C的发现是RPGR研究的一个重要的里程碑,该转录本含有15个外显子,编码1152个氨基酸。
该转录本含有一个新的外显子ORF15,它是由原来的Exon15及一部分Intron15序列组合构成。
基因检测案例16-视⽹膜⾊素变性RPGR基因ORF15检测视⽹膜⾊素变性RPGR基因ORF15检测基因检测过程中,数据解读是很重要的⼀个环节。
如果对疾病了解不清楚,或者对数据不敏感,很有可能会漏检。
后续我们会为⼤家介绍解读过程中遇到的各种坑⼉。
今天为⼤家带来的是⼀个视⽹膜⾊素变性RPGR基因ORF15的检测案例。
1.视⽹膜⾊素变性简介视⽹膜⾊素变性(retinitispigmentosa,RP)是⼀组以感光细胞和⾊素上⽪细胞进⾏性选择性丧失为特点的遗传致盲眼病,世界范围内发病率为1/3000,是致盲的主要病因之⼀,⽬前⽆有效疗法。
该病早期症状为夜盲,随病程发展,中⼼视⼒逐渐减退,最终可完全失明。
RP可以在眼部单独存在,也可以是全⾝多个系统疾病或综合征的眼部组成部分。
RP可呈常染⾊体显性遗传、常染⾊体隐性遗传、X连锁遗传、线粒体遗传和双基因遗传。
在所有RP患者中,常染⾊体显性遗传占15-25%,常染⾊体隐性遗传占5-22%,X连锁遗传占5-15%。
2.RPGR是X连锁视⽹膜⾊素变性的主要致病基因,外显⼦ORF15具有复杂结构在各类遗传型的RP患者中,X连锁视⽹膜⾊素变性(X-linkedretinitispigmentosa,XLRP)临床表现最为严重,患者发病早,通常在20岁之前出现夜盲等视觉障碍,在40岁之前可进展为部分或完全失明。
RPGR是XLRP最重要的的致病基因,能解释XLRP70%-75%的病因[参考⽂献1]。
RPGR⼜称为视⽹膜⾊素变性GTP酶调控因⼦(retinitispigmentosaGTPaseregulator),位于Xp21.1。
该基因有多种剪切体,最初发现的剪切体A含有19个外显⼦,编码815个氨基酸的蛋⽩。
检测该转录本上的变异,能够找到10-20%的XLRP患者的致病变异。
后来剪切体C的发现是RPGR研究的⼀个重要的⾥程碑,该转录本含有15个外显⼦,编码1152个氨基酸。
常染色体显性遗传视网膜色素变性家系的临床表型和致病突变基因位点鉴定作者:李菁蒴汤苏珍刘雅宁陈鹏来源:《青岛大学学报(医学版)》2020年第01期[摘要]目的分析一个中国北方视网膜色素变性(RP)家系病人的临床表型及致病基因突变,寻找致病基因突变位点,探讨表型与基因型之间的关系。
方法收集中国北方地区的一个RP家系的临床资料,共有11例家庭成员参与研究,其中包括5例病人和6例正常成员。
完善该家系内所有参与研究成员的眼科检查,提取该家系中全部成员的外周血基因组DNA,选取先证者进行视觉系统相关目标区域全外显子组测序,最终通过家系内共分离验证致病突变,进一步分析该突变与病人表型间的关系。
结果临床检查显示该家系内5例病人均符合典型的RP表型,目标区域外显子组测序显示核受体亚科2第E组第3个成员([STBX]NR2E3)基因c.166G>A突变,该突变导致了[STBX]NR2E3基因所编码蛋白第56号氨基酸由甘氨酸变为精氨酸(p.56,G>R);保守性分析显示该突变在各物种中高度保守,生物信息学预测结果表明该突变具有较高的致病性。
结论该家系内符合典型RP表型病人目标区域外显子组测序发现了[STBX]NR2E3基因上一个已知的突变(c.166G>A,p.56,G>R),该突变在家系内共分离。
[关键词]视网膜变性;色素细胞;点突变;高通量核苷酸序列分析;[STBX]NR2E3基因[中图分类号]R774.13;R394[文献标志码]A[文章编号]2096-5532(2020)01-0030-05视网膜色素变性(RP)是以早期夜盲,随后出现渐进性视野缺损、视网膜色素沉着、视盘蜡黄色、视网膜电图呈熄灭型以及中心视力下降等为主要临床特征的常见致盲性遗传眼病[1]。
在世界范围内RP的发病率为1/3800~1/3500,在我国其发病率约为1/3784,全世界至少有100万病人[2]。
此组疾病是导致人类视力障碍最主要的疾病之一。