酚氯仿法提取DNA主要步骤和原理
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提取dna的方法及原理提取DNA的方法及原理DNA提取是生物学和遗传学研究中的一项基础操作,它是获取DNA样本的过程。
DNA提取的方法有很多种,下面将介绍几种常用的DNA提取方法及其原理。
1. 高盐法高盐法是一种简单且常用的DNA提取方法。
其原理是利用高盐溶液中DNA与其他细胞组分(如蛋白质)之间的亲和性差异。
在高盐环境下,DNA更容易溶解而不与蛋白质结合,从而实现DNA的提取。
具体步骤包括细胞破碎、加入高盐溶液、离心分离DNA和去除蛋白质等。
2. 酚/氯仿法酚/氯仿法是一种经典的DNA提取方法。
其原理是利用酚和氯仿两种溶剂的密度差异,将DNA从细胞中分离出来。
具体步骤包括细胞破碎、加入酚/氯仿混合液、离心分离DNA和去除蛋白质等。
3. 硅胶柱法硅胶柱法是一种高纯度DNA提取方法。
其原理是利用硅胶柱上的硅胶颗粒与DNA之间的亲和性差异。
DNA样本在经过一系列处理后,通过硅胶柱,DNA能够与硅胶颗粒结合,而杂质则被洗脱。
最后,通过洗脱DNA,即可获得高纯度的DNA。
硅胶柱法的优点是提取纯度高、操作简单,适用于分子生物学研究和临床诊断。
4. 磁珠法磁珠法是一种高效、快速的DNA提取方法。
其原理是利用带有亲和基团的磁珠与DNA之间的亲和性,实现DNA的选择性吸附和洗脱。
具体步骤包括磁珠悬浮液制备、样本加入、磁珠与DNA结合、磁珠分离、洗脱DNA等。
除了上述常用的DNA提取方法外,还有其他一些特殊的DNA提取方法,如酶解法、离心法、凝胶切割法等。
这些方法在不同的实验和应用中具有各自的特点和优势。
总结起来,DNA提取的方法多种多样,选择适合的方法取决于实验目的、样本类型和实验条件等。
无论采用哪种方法,都需要严格控制实验操作,以确保提取到高质量的DNA样本。
DNA提取的成功与否直接影响到后续的实验结果,因此在进行DNA提取时,需要注意样本的保存、细胞破碎的方式、溶解液的选择等因素,以获得可靠且高纯度的DNA。
DNA提取和纯化技术标准操作规程组织样品先保存在1.5ml或者2ml的离心管中,用酒精固定低温保存。
DNA提取方法:1、酚-氯仿法:1.1适用范围酚-氯仿法提取DNA原理为在有EDTA及SDS等去污剂存在下用蛋白酶K消化细胞,通过酚-氯仿混合物萃取DNA溶液中的蛋白质类有机物质,而保留DNA于水相溶液中的提取方法。
缓冲液及试剂1) 蛋白酶K2) 细胞裂解液:母液:10%SDS(m/v),0.1M Tris·HCl(PH8.0),0.5M EDTA(PH8.0);裂解液终浓度:200ml裂解液:10%SDS 10ml0.1M Tris·HC 2ml0.5M EDTA 40mlddH2O 149ml3) 饱和酚;4) 100%氯仿;5) 100%异戊醇;6) 100%乙醇、70%乙醇;7) TE(PH8.0):10mmol·ml-1 Tris·HCl(PH8.0),0.1 mol·ml-1 EDTA(PH8.0)1.2组织样品DNA提取步骤:1.2.1取绿豆体积一半大小的组织,在1.5ml离心管中加300µl的双蒸灭菌水,待取下的组织乙醇挥发完之后,用剪刀剪碎组织,使组织细胞悬浮于双蒸水中1.2.2加7000µl的双蒸水冲洗剪碎的组织1.2.312000rpm离心5min,使组织与水分离,弃上清,再13000rpm离心2min,可用移液枪吸出残余的双蒸水。
1.2.4加DNA提取液,即裂解液,加600µl 55℃预热的裂解液,使细胞破碎,再加入5µl的蛋白酶K,结合组蛋白。
1.2.5混匀后,在55℃水浴2h30min,水浴前半小时,每隔5min轻轻摇匀一次。
1.2.6从水浴中取出离心管,冷却至室温,加入600µl酚氯仿(苯酚∶氯仿∶异戊醇=25∶24∶1),轻轻混匀,静置10min,12000rpm离心10min。
酚氯仿法提取DNA原理及方法酚氯仿法是一种常用的DNA提取方法,其原理是利用酚氯仿溶液对细胞和细胞碎片进行破碎,然后通过离心分离DNA。
以下是详细的步骤:1.细胞裂解:将待提取DNA的样本(细胞、组织等)加入含有酚氯仿的裂解缓冲液中,将溶液均匀混合。
酚氯仿是一种有机溶剂,能够破坏细胞膜和核膜,使细胞释放出DNA。
2.蛋白质沉淀:加入混合溶液中的蛋白质会和酚氯仿相互分离,形成一个物理屏障。
离心沉淀后,由于DNA密度比蛋白质低,DNA会上浮到上层,而蛋白质则沉淀在下层。
3.DNA沉淀:将上层液体转移到新的离心管中,加入同等体积的冷乙醇或异丙醇,然后轻轻振荡以促使DNA沉淀。
酒精能够与DNA相互作用,使DNA分子变得更加疏水,从而沉淀下来。
4.清洗:离心沉淀后,将上清液倒掉,加入70%乙醇洗涤沉淀。
乙醇通过去除残留的酚氯仿和其他杂质,使沉淀的DNA纯化。
5. 溶解:将洗涤后的DNA沉淀干燥或用适量的缓冲液溶解,最常用的是TE缓冲液(含有10 mM Tris-HCl和1 mM EDTA),以便后续的DNA浓度测定和实验操作。
总结来说,酚氯仿法利用酚氯仿溶液破坏细胞膜和核膜,将DNA从细胞中释放出来。
离心分离蛋白质和DNA,然后通过酒精沉淀和乙醇洗涤纯化提取的DNA。
这种方法简单快速,并且能够获得较纯的DNA样品。
不过,酚氯仿法在提取DNA时会同时提取到RNA和蛋白质,因此在一些需要高纯度DNA的实验中可能不适用。
在使用酚氯仿法提取DNA时,还需要注意避免DNA的降解,避免污染和交叉污染,以及正确保存提取的DNA样品。
酚氯仿抽提dna原理
酚氯仿(Phenol-Chloroform)抽提DNA是一种常用的DNA 提取方法。
其原理是基于酚在酸性条件下具有与DNA高度亲和性的特点,可以将DNA从细胞溶液中抽提出来。
具体的步骤如下:
1. 细胞溶解:首先将待提取DNA的细胞样品加入适量的细胞裂解缓冲液中,通过机械或化学方法使细胞壁破裂,释放出细胞内的DNA。
2. 酚抽提:加入相同体积的酚溶液,并进行充分混合。
酚能与DNA形成复合物,并与其他细胞组分(如蛋白质和脂质)发生分层,形成一个DNA上层和一个下层。
3. 脱水:将抽提产物转移至新管中,加入酒精或异丙醇,通过离心将DNA沉淀下来。
脱水过程可以去除溶液中的多余酚,提高DNA沉淀的纯度。
4. 酯化:将DNA沉淀物溶解在适量的TE缓冲液(含有EDTA和Tris)中,经过一定的时间酯化,使DNA变得更为稳定。
5. 沉淀:通过低温离心将DNA沉淀下来,去除上清液。
6. 洗涤:用70%的乙醇洗涤并去除残余的盐、酚和脏物质。
洗涤过程中,可以多次进行离心和上清液倒掉操作。
7. 干燥:最后,将DNA输送液置于干燥器中或者自然风干,以去除溶剂中的残留物质,得到纯度较高的DNA。
通过酚氯仿抽提DNA的方法,可以从复杂的细胞中提取出高质量、高纯度的DNA,以供后续分子生物学研究使用。
基因组DNA的提取方法—酚-氯仿抽提法1. 将95% 酒精浸泡过的标本取出,用吸水纸吸去标本表面的乙醇,用1×TE Buffer浸泡两次,每次20min。
2. 解剖取个体胸部肌肉组织约0.02g,将组织转入1.5mL离心管加入1mL液氮使其迅速冻结, 用玻璃棒迅速有力地将团状组织研磨成细粉末。
3. 加入500uL消化液(消化液成分为NaCl 0.1mol/L, Tris-HCl 0.3mol/L, EDTA 0.01mol/L, SDS 1%, Proteimase K 200ug/mL),于56℃恒稳水浴中消化8-10小时, 每隔两小时摇晃一次。
4. 消化结束后,加入等体积的饱和酚(pH7.6),用封口胶封好,置于混匀器上约12小时,离心10分钟(10000r/m)。
5. 取上清液于另一新的EP管中,加入等体积的酚:氯仿:异戊醇(25:24:1),缓慢抽提20分钟,离心10分钟(10000r/m)。
6. 取上清液于另一新的EP管中,加入等体积的氯仿:异戊醇(24:1),缓慢抽提20分钟,离心10分钟(10000r/m)。
7. 取上清液于另一新的EP管中,加入2倍体积的预冷的无水乙醇,-20℃放置2小时。
8. 离心后,DNA沉积于管底,用70%的预冷的乙醇洗涤2次,37℃烘干。
烘干的DNA溶于TE中,4℃保存。
9. 于基因组DNA中加入终浓度为50ug/mL的RNase(每次使用前90℃灭活10min),于37℃消化1.0-1.5hr。
10. 用0.8%的琼脂糖凝胶检测,取3μL DNA样品及2μL Load-buffer (含溴酚蓝和缓冲液),加入点样孔。
实验所用Marker是 DNA(EcoR/HindIII),100V电压电泳90分钟。
凝胶成象分析仪进行检测。
11. 用紫外可见分光光度计测定DNA的OD值,判定DNA纯度和浓度。
酚氯仿法提取DNA主要步骤:1.将动物组织放在1.5ml的离心管中,分别用75%、50%酒精和纯水梯度脱酒精。
每个梯度脱水时间为5-10min2.将组织放入研钵中,加入适量DN A裂解液(300μl),研磨后再加入300μl DNA裂解液冲洗研磨棒。
3.将研磨好的组织液用移液枪加到1.5ml离心管,在管中加10μl蛋白酶K,用封口带将离心管封口,放入摇床(56℃,5h)。
4.加入等体积的Tris饱和酚(500μl),摇匀(10min)。
5.离心:12000R,7min,4℃。
离心后分成上中下三层,上层为DNA,中层为蛋白质,下层为有机质。
6.吸取上层液体加入新的离心管。
7.配制Tris饱和酚:氯仿:异戊醇=25:24:1。
8.在含有上清液的离心管中加入Tri s饱和酚、氯仿和异戊醇混合液450μl,摇匀10mi n。
9.离心:12000R,7min,4℃。
10.吸取上清液加到新的离心管,加入等体积的氯仿和异戊醇混合液400μl(氯仿:异戊醇=24:1)。
11.离心:12000R,7min,4℃。
12.吸取上清液加入新的离心管,加入2.5倍经过-20℃冷冻的100%的酒精。
-20℃过夜。
13.将样品取出,12000R,7min,4℃离心。
14.弃上清,留白色沉淀(DNA),加400μl的75%的经过-20℃冷冻的酒精,反复吹打溶解。
15.重复第14步骤2次(用75%酒精洗三次)。
16.提取DNA完成。
溴氯仿法提取DNA的原理:用酚抽提细胞DNA时,有什么作用?使蛋白质变性,同时抑制了D Nase的降解作用。
用苯酚处理匀浆液时,由于蛋白与D NA联结键已断,蛋白分子表面又含有很多极性基团与苯酚相似相溶。
蛋白分子溶于酚相,而DNA 溶于水相。
dna纯化方法
DNA纯化方法
DNA纯化是分子生物学中的一个重要步骤,它是从混合物中分离出DNA分子的过程。
DNA纯化方法有很多种,其中常用的方法包括酚/氯仿法、离心柱法、磁珠法等。
酚/氯仿法是最常用的DNA纯化方法之一。
它的原理是利用酚和氯仿的密度差异,将DNA分子从其他杂质中分离出来。
具体操作步骤如下:首先将细胞裂解,使DNA分子释放到溶液中;然后加入等体积的酚/氯仿混合液,混合均匀后离心分层;最后将上层的DNA溶液取出,加入等体积的异丙醇,沉淀DNA分子。
离心柱法是一种快速、简便的DNA纯化方法。
它利用离心柱的特殊结构,将DNA分子从其他杂质中分离出来。
具体操作步骤如下:首先将细胞裂解,使DNA分子释放到溶液中;然后将DNA溶液加入离心柱中,离心分离DNA分子和其他杂质;最后将离心柱中的DNA分子洗涤、洗脱,得到纯净的DNA分子。
磁珠法是一种高效、自动化的DNA纯化方法。
它利用磁珠表面的亲和分子与DNA分子的特异性结合,将DNA分子从其他杂质中分离出来。
具体操作步骤如下:首先将细胞裂解,使DNA分子释放到溶液中;然后加入磁珠,使其与DNA分子结合;最后利用磁力将磁珠与DNA分子分离,得到纯净的DNA分子。
DNA纯化方法有很多种,每种方法都有其优缺点。
在选择纯化方法时,需要根据实验的具体要求和样品的特点进行选择。
DNA和RNA提取方法及原理DNA提取方法:1.酚/氯仿方法:这是最早应用的DNA提取方法之一,适用于绝大多数生物样本。
原理是利用酚酸抽提DNA,酚酸能溶解细胞膜和蛋白质,而DNA在酚相沉淀。
然后用氯仿提取,分离DNA与酚相中的蛋白质和RNA。
最后通过乙醇沉淀纯化DNA。
这种方法可以得到高质量的DNA,但操作过程相对繁琐。
2.硅胶基质法:硅胶基质可吸附DNA,该方法使用硅胶膜或硅胶粉末来固定DNA,通过洗涤去除杂质,最后用洗脱液从硅胶上洗脱DNA。
这种方法具有简便和高纯度的优点,适用于大规模提取DNA。
3.盐酸法:盐酸法以酸性条件下使DNA变为不溶性沉淀物的原理,通过加入盐酸将DNA沉淀下来,然后经过洗涤和乙醇沉淀纯化。
这种方法适用于提取纯度要求不高的DNA。
RNA提取方法:1.酚酸提取法:这是最常用的RNA提取方法之一、原理类似于DNA的酚/氯仿法,通过酚酸将核酸与蛋白质和其他杂质分离。
然后通过氯仿脱脂,去除酚相中的蛋白质,并且获得RNA水相。
最后通过乙醇沉淀纯化RNA。
这种方法适用于大多数样品,得到的RNA纯度较高。
2.硅胶基质法:与DNA提取类似,它也适用于RNA的提取。
通过硅胶膜或硅胶粉末结合RNA并洗脱,用洗脱液分离RNA与杂质。
这种方法适用于大规模提取RNA。
3.氯仿法:这是一种较为简便的RNA提取方法,它通过氯仿脱脂去除脂质和其他杂质,并且能够同时去除DNA。
最后用乙醇沉淀纯化RNA。
这种方法适用于需要较快速提取RNA的情况。
DNA和RNA提取的基本原理都是通过分离和纯化DNA或RNA与其他杂质的物质。
酚酸提取法和硅胶基质法同属于酚酸法,都是通过酚酸和氯仿来分离DNA或RNA与蛋白质和其他杂质。
其中酚酸能溶解细胞膜和蛋白质,并且DNA或RNA在酚相中沉淀,而蛋白质和RNA在氯仿相中溶解。
然后通过洗脱和纯化步骤,从酚酸相中提取DNA或RNA。
盐酸法与酚酸法不同,它是通过酸性条件下使DNA变为不溶性沉淀物来分离DNA与其他杂质。
dna提取方法DNA提取方法。
DNA提取是分子生物学实验中的一项重要步骤,它是从生物样本中分离出DNA分子的过程。
DNA提取的目的是为了获得足够纯度和浓度的DNA样本,以便进行后续的实验操作,比如PCR扩增、测序等。
在实际操作中,DNA提取的方法有很多种,下面将介绍几种常用的DNA提取方法。
1. 酚/氯仿提取法。
酚/氯仿提取法是最早的DNA提取方法之一,它利用酚和氯仿两种有机溶剂的密度差异来分离DNA。
首先,将生物样本经过细胞裂解,然后加入酚/氯仿混合溶液,混合均匀后离心,DNA会在上清液中,而蛋白质和其他杂质则会沉淀在底部。
接着将上清液转移到新的离心管中,加入等体积的异丙醇,再次离心,DNA会沉淀在离心管底部。
最后将上清液倒掉,用70%乙醇洗涤DNA沉淀,最后溶解于适量的缓冲液中。
酚/氯仿提取法简单易行,适用于各种类型的生物样本。
2. 离心柱法。
离心柱法是一种基于硅胶膜或硅胶颗粒的DNA提取方法,它利用DNA与硅胶的亲和性来实现DNA的分离纯化。
首先,将样本加入裂解缓冲液,然后加入蛋白酶和蛋白酶K进行细胞裂解。
接着将裂解液加入离心柱中,经过离心后,DNA会在离心柱上残留,而其他杂质则会通过离心柱底部的滤膜排除。
然后用洗涤缓冲液洗涤离心柱,最后用去离子水或低盐缓冲液洗脱DNA。
离心柱法操作简便,能够快速、高效地获得纯度较高的DNA样本。
3. 硝酸盐法。
硝酸盐法是一种利用硝酸盐沉淀DNA的提取方法。
首先,将生物样本进行细胞裂解,然后加入等体积的乙醇和适量的硝酸盐溶液,混合后DNA会沉淀出来。
接着用乙醇洗涤DNA沉淀,最后溶解于适量的缓冲液中。
硝酸盐法操作简单,适用于大规模DNA提取。
4. 磁珠法。
磁珠法是一种利用磁珠颗粒与DNA的亲和性来实现DNA的分离纯化的方法。
首先,将生物样本进行细胞裂解,然后加入磁珠颗粒,DNA会在磁场的作用下与磁珠结合,然后用磁场将DNA与磁珠分离出来。
接着用洗涤缓冲液洗涤磁珠,最后用去离子水或低盐缓冲液洗脱DNA。
苯酚-氯仿法小提DNA试剂配制:1:细胞裂解液:0.32 M 的蔗糖;5 mM 的MgCl22:DNA稀释缓冲液:0.375 M的NaCl;12 mM的Tris-HCl [PH 7.5]3:10%的SDS [PH 7.2]4:5 M的NaCl5:苯酚-氯仿混合液V/V = 1:16:无水乙醇和70%的乙醇DNA 抽提:1、收集白细胞:500 μl新鲜/冻存全血(EDTA-2Na抗凝),加入1 ml的细胞裂解液充分混匀后孵育10分钟,,13000 rpm离心15 sec/3min;2、洗涤白细胞:离心后弃去上清液,加入1ml双蒸水重悬沉淀,将沉淀充分吹打使起完全溶解后, 13000 rpm离心1 /5min;3、稀释DNA,去除蛋白:弃离心后上清液,加入80 μl DNA 稀释缓冲液,重悬沉淀,完全溶解后,加入10 μl 10% SDS 和5 M NaCl 100μl,用手摇匀,再加双蒸水240 μl稀释DNA;4、加入300 μl苯酚-氯仿-异戊醇溶液(V/V=25:24:1,PH=7.5).盖紧试管,彻底混合均匀后, 13000 rpm离心12 min;5、取上清相转至另一1.5 ml EP管中,加入上清液体积比的1.5-2倍体积的预冷无水乙醇。
反复颠倒数次后,可见有絮状DNA沉淀析出;6、13000 rpm离心5 min,去上清水相。
加入和无水乙醇等量的70%预冷乙醇洗去DNA中的盐后,离心5 min。
用100 μl ddH2O或50 μl TE保存DNA备用。
为什么用酚与氯仿抽提DNA时,还要加少量的异戊酵?在抽提DNA时,为了混合均匀,必须剧烈振荡容器数次,这时在混合液内易产生气泡,气泡会阻止相互间的充分作用。
加入异戊醇能降低分子表面张力,所以能减少抽提过程中的泡沫产生。
一般采用氯仿与异戊酵为24:1之比。
也可采用酚、氯仿与异戊醇之比为25:24:1(不必先配制,可在临用前把一份酚加一份24:1的氯仿与异戊醇即成),同时异戊醇有助于分相,使离心后的上层水相,中层变性蛋白相以及下层有机溶剂相维持稳定。
SDS-酚氯仿法1.实验方法步骤:1)试剂的配制(1)SDS提取液的配置,PH=8.0 (常温保存):(Tris-Hcl 100ml;Nacl 100ml;EDTA100ml;SDS 1g)(2)氯代异戊醇(氯仿:异戊醇=24:1)(3)蛋白酶K(-20℃冰箱保存)(4)Tris-平衡酚(-20℃冰箱保存)2)DNA的提取:(1)先将标本的足取下,放在1.5ml的离心管中,放在-80℃的冰箱中冷冻3-5分钟,以便使标本更易研磨;(2)用研磨棒将足在离心管中充分研磨,加入SDS提取液400µl,再用研磨棒充分研磨;(3)加入蛋白酶K 5µl,56℃水浴加热3-3.5个小时,再加入等体积的酚(即是400µl);(4)放入12000转/分离心机离心10分钟,取上清液,加入与上清液等体积的氯代异戊醇(氯仿:异戊醇=24:1);(5)再取上清液(如果上清液较浑浊,可以再放入12000转/分离心机,离心10分钟);(6)加入上清液2倍体积的100%的乙醇,放入-20℃的冰箱中1小时以上,使DNA充分沉淀;(7)放入12000转/分离心机离心10分钟,去除液体后加入300µl 70%的酒精,再放入12000转/分离心机离心10分钟(8)去除酒精,使其自然风干,加入40µl的灭菌蒸馏水,放在-20℃的冰箱中保存备用。
3)PCR扩增(1)PCR反映液的试剂成分和比例:(2)以上试剂的加样顺序是:灭菌蒸馏水--10×PCR Buffer---- Mgcl2— DNTP Mixture (各2.5mM)—模板DNA---引物1---引物2---- Takapa酶。
加好样以后先用震动棒震动,使其均匀混合,然后放在4000转/分的离心机中离心1分钟,放入PCR仪中扩增(大约2-2.5个小时)。
4)凝胶电泳检测DNA(1)配胶称取0.25g的琼脂糖和量取25ml的TE,将两者放入三角瓶中充分摇匀,放在微波炉中加热30秒,取出震荡后再次放入微波炉中加热15秒后,取出使其温度降到60℃左右,加入EB少量摇匀后倒入胶槽中,插上梳子使其凝固备用。
试验原理:苯酚/氯仿提取DNA是利用酚是蛋白质的变性剂,反复抽提,使蛋白质变性,SDS(十二烷基磺酸钠)将细胞膜裂解,在蛋白酶K、EDTA的存在下消化蛋白质或多肽或小肽分子,核蛋白变性降解,使DNA从核蛋白中游离出来。
DNA易溶于水,不溶于有机溶剂。
蛋白质分子表面带有亲水基团,也容易进行水合作用,并在表面形成一层水化层,使蛋白质分子能顺利地进入到水溶液中形成稳定的胶体溶液。
当有机溶液存在时,蛋白质的这种胶体稳定性遭到破坏,变性沉淀。
离心后有机溶剂在试管底层(有机相),DNA存在于上层水相中,蛋白质则沉淀于两相之间。
酚-氯仿抽提的作用是除去未消化的蛋白质。
氯仿的作用是有助于水相与有机相分离和除去DNA溶液中的酚。
抽提后的DNA溶液用2倍体积的无水乙醇在1/103mol/LNaCl存在下沉淀DNA,回收DNA用70%乙醇洗去DNA沉淀中的盐,真空干燥,用TE缓冲液溶解DNA备用。
试验步骤:1、将1mlEDTA抗凝贮冻血液于室温解冻后移入5ml离心管中,加入1ml磷酸缓冲盐溶液(PBS),混匀,3500rpm离心15min,倾去含裂解红细胞的上清。
重复一次。
用0.7mlDNA 提取液混悬白细胞沉淀,37℃水浴温育1h。
2、将上述DNA提取液混悬白细胞,37℃水浴温育1h后,加入1mg/ml蛋白酶K0.2ml,至终浓度为100-200ug/ml,上下转动混匀,液体变粘稠。
50℃水浴保温3h,裂解细胞,消化蛋白。
保温过程中,应不时上下转动几次,混匀反应液。
3、反应液冷却至室温后,加入等体积的饱和酚溶液,温和地上下转动离心管5-10min,直至水相与酚相混匀成乳状液。
5000rpm离心15min,用大口吸管小心吸取上层粘稠水相,移至另一离心管中。
重复酚抽提一次。
加等体积的氯仿﹕异戊醇(24﹕1),上下转动混匀,5000rpm离心15min,用大口吸管小心吸取上层粘稠水相,移至另一离心管中。
重复一次。
4、加入1/5体积的3mol/LNaAc及2倍体积的预冷的无水乙醇,室温下慢慢摇动离心管,即有乳白色云絮状DNA出现。
提取dna的方法及步骤提取DNA的方法及步骤DNA(脱氧核糖核酸)是构成生物遗传信息的基本单位,因此,准确提取DNA样本是进行遗传研究、基因工程和犯罪侦查等领域的重要步骤。
以下将介绍几种常见的DNA提取方法及其步骤。
方法一:酚氯仿法酚氯仿法是一种常用的DNA提取方法,其步骤如下:1. 收集样本:可以是人体组织、血液、细胞培养物等。
确保样本新鲜,并避免受到污染。
2. 细胞破碎:将样本加入含有细胞破碎缓冲液的离心管中,通过离心将细胞沉淀。
3. 酚氯仿提取:将沉淀加入酚氯仿混合液中,轻轻混匀,并离心以分离DNA。
4. 沉淀DNA:将上清液转移到新的离心管中,加入冷乙醇沉淀DNA。
5. 洗涤:用70%乙醇洗涤沉淀的DNA,以去除杂质。
6. 干燥:将洗涤后的DNA在室温下晾干或用低温真空干燥器加速干燥。
方法二:盐析法盐析法是一种简单易行的DNA提取方法,其步骤如下:1. 细胞破碎:将样本加入含有细胞破碎缓冲液的离心管中,通过离心将细胞沉淀。
2. 盐析提取:加入高盐缓冲液使DNA与其他核酸和蛋白质分离。
3. 沉淀DNA:将上清液转移到新的离心管中,加入冷乙醇沉淀DNA。
4. 洗涤:用70%乙醇洗涤沉淀的DNA,以去除杂质。
5. 干燥:将洗涤后的DNA在室温下晾干或用低温真空干燥器加速干燥。
方法三:硅胶柱法硅胶柱法是一种高纯度DNA提取方法,其步骤如下:1. 细胞破碎:将样本加入含有细胞破碎缓冲液的离心管中,通过离心将细胞沉淀。
2. 硅胶柱处理:将细胞沉淀加入硅胶柱中,经过洗涤和离心,将DNA吸附在硅胶柱上。
3. 洗涤:用洗涤缓冲液洗涤硅胶柱,以去除杂质。
4. DNA洗脱:加入低盐缓冲液,使DNA从硅胶柱上洗脱出来。
5. 洗涤:用70%乙醇洗涤洗脱后的DNA,以去除杂质。
6. 干燥:将洗涤后的DNA在室温下晾干或用低温真空干燥器加速干燥。
方法四:酶解法酶解法是一种特异性较高的DNA提取方法,其步骤如下:1. 细胞破碎:将样本加入含有细胞破碎缓冲液的离心管中,通过离心将细胞沉淀。
酚氯仿抽提dna原理
酚氯仿抽提DNA原理是一种常用的DNA提取方法,通过该
方法可以从复杂的生物样品中高效地提取纯度较高的DNA样本。
其原理主要包括以下几个步骤:
1. 细胞破碎:首先将待提取的生物样品经过离心等操作,去除无关细胞和组织,然后使用细胞裂解缓冲液将目标细胞破碎,使细胞内部的DNA释放出来。
2. 蛋白酶处理:在细胞裂解的过程中,蛋白酶会释放出来,为了去除其对DNA的影响,可以加入蛋白酶抑制剂来保护DNA。
此步骤的目的是降解蛋白质,同时保持DNA的完整性。
3. 混合酚氯仿:将细胞裂解液与等体积的氯仿混合,产生两相体系。
氯仿主要用来分离DNA和其他细胞成分,如脂质、蛋
白质等。
在混合过程中,DNA溶于水相,而其他成分溶于有
机相。
这样,通过离心使两相分离。
DNA会聚集在水相中。
4. DNA沉淀:将水相转移到新的离心管中,加入冷酒精或异
丙醇,使DNA沉淀出来。
酒精或异丙醇中的离子会中和
DNA上的电荷,从而使DNA不溶于水,形成可见的白色沉淀。
5. 洗涤与溶解:将DNA沉淀用无菌蒸馏水洗涤去除酒精或异
丙醇的残余,并用TE缓冲液溶解DNA,使其得以储存和进
一步应用。
通过酚氯仿抽提DNA,可以将DNA从细胞中高效地提取出
来,纯度较高,适用于许多分子生物学实验和技术的应用,如PCR、酶切、测序等。
定位克隆实验室2010-12-27 胡文波修订酚氯仿提基因组-大量高纯度DNA的制备原理:酚、氯仿是蛋白质变性剂,能有效去除核蛋白,使核酸从核蛋白中分离出来。
氯仿还能加速有机相与液相的分层,少许异戊醇能稳定界面,减少蛋白质变性过程中产生气泡。
操作步骤:1.将材料放入预冷的研钵中,加入液氮后迅速研磨成粉末状(刚加入液氮时不停上下锤击材料,液氮快挥发完时用研棒旋转搅拌挤压材料使之破碎)。
2.研磨完毕后,加入800ul抽提缓冲液,轻轻摇匀,形成匀浆状。
3.将匀浆液转移至1个2ml离心管中,加入Proteinase K至终浓度为100ug/ml(800ul加4ul蛋白酶K(20ug/ul)),55℃水浴保温过夜。
4.加入等体积平衡酚,室温温和振荡,摇匀,10-15min。
5.离心:12000rpm 4℃ 10min,将粘稠的水相移至洁净的离心管中。
6.再用酚:氯仿(v:v =1:1),氯仿各抽提1次(离心:12000rpm 4℃ 10min)。
7.将上层水相移至洁净的离心管中,加入2倍体积无水乙醇,转动离心管使溶液充分混合,DNA立即形成沉淀。
8.离心:7500g 4℃ 10min,使DNA沉于管底,将离心管倒置于滤纸上,晾干(或用玻璃棒/消毒牙签将DNA沉淀从乙醇沉淀中移出)。
9.用70%乙醇洗涤DNA沉淀2次(离心:7500g 4℃ 10min)。
10.加入200ul TE(pH8.0)使DNA完全溶解。
11.加入RNase至终浓度为50ug/ml,37℃保温1h。
12.紫外分光光度计检测DNA的浓度和纯度。
13.调节DNA终浓度为1000ng/ul。
14.将DNA做梯度稀释:1×102 ,1×101 ,1×100 ,1×10-1 ,1×10-2ng/ul,稀释体积为100ul。
15.取2ul DNA与2ul 2×上样缓冲液混匀,点样到琼脂糖凝胶(w/v = 2%)中,以2.5-5v/cm电泳。
DNA的提取是分子生物学实验技术中的最重要、最基本的操作。
本实验通过植物样品在液氮下研磨以粉碎组织,通过裂解液裂解细胞,有机溶剂反复抽提,使DNA进入水相与蛋白质成分分开,在RNase作用下,降解RNA以纯化DNA。
二、材料以方法1、材料:培养菌体2、仪器设备:超净工作台,培养箱,摇床,恒温水浴锅,高速冷冻离心机,台式离心机,移液枪一套,低温冰箱,冷冻真空干燥机,电泳仪,水平电泳槽,紫外观测仪3、试剂:细胞裂解液100 mM Tris-HCl 5 mM EDTA 500 mM NaCl 1.25% SDS(PH 7.5) 饱和酚氯仿/异戊醇酚/氯仿/异戊醇无水乙醇70%乙醇异丙醇 3 M NaAc(pH5.2) RNase 50×TE缓冲液电泳载样缓冲液三、操作步骤(1)培养菌体(2)加入10 ml裂解液,1/10体积酚,于65℃下20-30 min,然后加入等体积的氯仿,轻摇(3)12000-15000rpm离心15 min(4)取上淸液,加入等体积氯仿,轻摇,12000-15000rpm离心15 min(5)取上淸液,加入0.6倍体积冷异丙醇(-20℃)或2倍体积冷无水乙醇(-20℃)(6)加入1/10体积的3 M NaAc(pH5.2),置于室温下10 min(7)12000-15000rpm离心10 min(8)倒弃液体留下沉淀,用70%乙醇洗涤沉淀(9)加入2倍体积无水乙醇(10)12000-15000rpm离心10 min(11)倒弃液体留下沉淀,真空干燥(12)复溶于2 ml TE(13)加入RNase,65℃或37℃处理10-30 min(14)加等体积酚,酚/氯仿,氯仿各一次,12000-15000rpm离心10 min(15)取上淸液,加入0.6倍体积冷异丙醇(-20℃)或2倍体积冷无水乙醇(-20℃)(16)加入1/10体积的3 M NaAc(PH5.2),置于室温下10 min(17)12000-15000rpm离心10 min(18)倒弃液体留下沉淀,用70%乙醇洗涤沉淀(19)真空干燥沉淀(20)复溶于0.5-1.0 ml的TE或水中,分装成小体积,4℃或-20℃保存。
酚氯仿法提取DNA的原理酚氯仿法是一种用于提取DNA的常见方法,它基于DNA与酚氯仿在两相溶液中由于密度差异而发生分离的原理。
下面将详细介绍酚氯仿法提取DNA的原理及步骤。
DNA是一个带有负电荷的双链分子,其溶解度与其环境的离子力有关。
酚氯仿可以形成无水酚、蛋白质和DNA、RNA在其中既不溶于水又不溶于酚氯仿的界面。
当DNA溶液与酚氯仿混合时,DNA会从水相转移到有机相(酚氯仿相)中,实现分离。
1.细胞裂解:将待提取DNA的细胞加入缓冲液中,并通过机械、热力或化学方法使细胞裂解,释放DNA。
2.去除蛋白质:加入蛋白酶K等蛋白酶使蛋白质降解,形成胶冻样物质。
3.DNA溶解:加入盐酸溶解胶冻样物质,使DNA溶于溶液中。
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5.沉淀DNA:加入冰冷的异丙醇或乙醇,在DNA溶液中形成DNA沉淀。
6.制备DNA:将DNA沉淀转移到新的管中,并用乙醇洗涤去除杂质。
7.定量和存储:使用分光光度计测量DNA的浓度,然后将其保存在适当的条件下,以便后续实验中使用。
1.方法成本较低,步骤简单易行。
2.可以提取高纯度的DNA。
3.可以在较短时间内提取大量DNA。
1.操作要注意安全,避免酚氯仿的接触和吸入。
2.使用无菌技术和无菌材料,以避免外源性DNA的污染。
3.避免DNA溶液的过热和过长的暴露于空气中,以避免降解DNA。
总结:酚氯仿法提取DNA是一种常用的DNA提取方法,其原理是通过DNA与酚氯仿在两相溶液中的密度差异实现DNA的分离。
该方法简单易行,可以提取高纯度的DNA,适用于很多生物学实验和研究领域。
在进行实验时,需注意操作安全和避免DNA污染,以保证提取到高质量的DNA。
酚氯仿法提取DNA主要步骤:1.将动物组织放在1.5ml的离心管中,分别用75%、50%酒精和纯水梯度脱酒精。
每个梯度脱水时间为5-10min2.将组织放入研钵中,加入适量DNA裂解液(300μl),研磨后再加入300μlDNA裂解液冲洗研磨棒。
3.将研磨好的组织液用移液枪加到1.5ml离心管,在管中加10μl蛋白酶K,用封口带将离心管封口,放入摇床(56℃,5h)。
4.加入等体积的Tris饱和酚(500μl),摇匀(10min)。
5.离心:12000R,7min,4℃。
离心后分成上中下三层,上层为DNA,中层为蛋白质,下层为有机质。
6.吸取上层液体加入新的离心管。
7.配制Tris饱和酚:氯仿:异戊醇=25:24:1。
8.在含有上清液的离心管中加入Tris饱和酚、氯仿和异戊醇混合液450μl,摇匀10min。
9.离心:12000R,7min,4℃。
10.吸取上清液加到新的离心管,加入等体积的氯仿和异戊醇混合液400μl(氯仿:异戊醇=24:1)。
11.离心:12000R,7min,4℃。
12.吸取上清液加入新的离心管,加入2.5倍经过-20℃冷冻的100%的酒精。
-20℃过夜。
13.将样品取出,12000R,7min,4℃离心。
14.弃上清,留白色沉淀(DNA),加400μl的75%的经过-20℃冷冻的酒精,反复吹打溶解。
15.重复第14步骤2次(用75%酒精洗三次)。
16.提取DNA完成。
溴氯仿法提取DNA的原理:用酚抽提细胞DNA时,有什么作用?使蛋白质变性,同时抑制了DNase的降解作用。
用苯酚处理匀浆液时,由于蛋白与DNA 联结键已断,蛋白分子表面又含有很多极性基团与苯酚相似相溶。
蛋白分子溶于酚相,而DNA 溶于水相。
使用酚的优点:1. 有效变性蛋白质;2. 抑制了DNase的降解作用。
缺点:1. 能溶解10-15%的水,从而溶解一部分poly(A)RNA。
2. 不能完全抑制RNase 的活性。
氯仿的作用?氯仿:克服酚的缺点;加速有机相与液相分层。
最后用氯仿抽提:去除核酸溶液中的迹量酚。
(酚易溶于氯仿中)用酚-氯仿抽提细胞基因组DNA时,通常要在酚-氯仿中加少许异戊醇,为什么?异戊醇:减少蛋白质变性操作过程中产生的气泡。
异戊醇可以降低表面张力,从而减少气泡产生。
另外,异戊醇有助于分相,使离心后的上层含DNA的水相、中间的变性蛋白相及下层有机溶剂相维持稳定。
用乙醇沉淀DNA时,为什么加入单价的阳离子?用乙醇沉淀DNA时,通常要在溶液中加入单价的阳离子,如NaCl 或NaAc,Na+中和DNA 分子上的负电荷,减少DNA分子之间的同性电荷相斥力,而易于聚集沉淀。
原理:动物和植物组织的脱氧核糖核蛋白(DNP)可溶于水或浓盐溶液(如1mol/L氯化钠),但在0.14mol/L氯化钠盐溶液中溶解度最低,而核酸核蛋白(RNP)则在0.14mol/L氯化钠中溶解度最大,利用这一性质可将其分开。
将沉淀物溶解于生理盐水,加入去污剂十二烷基硫酸钠(SDS)溶液,使DNA与蛋白质分离开。
加入固体氯化钠使其浓度达到1mol/L,使DNA溶解。
加氯仿-异戊醇去除蛋白质,也可重复该步操作得较纯DNA。
最后用95%乙醇沉淀DNA。
溶解:将离心后除去RNA的沉淀,用30ml生理盐水溶解,充分搅拌后,匀浆一次。
加4毫升10%SDS溶液,使溶液的SDS浓度达到1%左右,边加边搅拌,放置60 ℃水浴保温10分钟(不停搅拌),冷却。
加固体氯化钠,使溶液氯化钠浓度达到1mol/L,充分搅拌10分钟;除杂质:加等体积氯仿-异戊醇混合液,充分震荡10分钟,8000 r/min离心7分钟,取上层液量好体积,倒入烧杯中(离心管),加同体积的氯仿-异戊醇混合液,重复上次操作。
直至界面不出现蛋白凝胶为止;沉淀:准确量取上清液体积,加2倍体积95%冷乙醇,搅拌后,置冰箱静止冷却,待有白色丝状物出现,约10-15分钟,离心8000 r/min离心7分钟,得白色沉淀;溶解:将沉淀物用0.1mol/L NaOH约10毫升溶解,得DNA溶液。
溶液I—溶菌液:溶菌酶:它是糖苷水解酶,能水解菌体细胞壁的主要化学成分肽聚糖中的β-1,4糖苷键,因而具有溶菌的作用。
当溶液中pH小于8时,溶菌酶作用受到抑制。
葡萄糖:增加溶液的粘度,维持渗透压,防止DNA受机械剪切力作用而降解。
EDTA:(1)螯合Mg2+、Ca2+等金属离子,抑制脱氧核糖核酸酶对DNA的降解作用(DNase作用时需要一定的金属离子作辅基);(2)EDTA的存在,有利于溶菌酶的作用,因为溶菌酶的反应要求有较低的离子强度的环境。
溶液II-NaOH-SDS液:NaOH:核酸在pH大于5,小于9的溶液中,是稳定的。
但当pH >12或pH<3时,就会引起双链之间氢键的解离而变性。
在溶液II中的NaOH浓度为0.2mo1/L,加抽提液时,该系统的pH就高达12.6,因而促使染色体DNA与质粒DNA的变性。
SDS:SDS是离子型表面活性剂。
它主要功能有:(1)溶解细胞膜上的脂质与蛋白,因而溶解膜蛋白而破坏细胞膜。
(2)解聚细胞中的核蛋白。
(3)SDS能与蛋白质结合成为R-O-SO3-…R+-蛋白质的复合物,使蛋白质变性而沉淀下来。
但是SDS能抑制核糖核酸酶的作用,所以在以后的提取过程中,必须把它去除干净,防止在下一步操作中(用RNase 去除RNA时)受到干扰。
溶液III--3mol/L NaAc(pH4.8)溶液:NaAc的水溶液呈碱性,为了调节pH至4.8,必须加入大量的冰醋酸。
所以该溶液实际上是NaAc-HAc的缓冲液。
用pH4.8的NaAc溶液是为了把pH12.6的抽提液,调回pH至中性,使变性的质粒DNA能够复性,并能稳定存在。
而高盐的3mol/L NaAc有利于变性的大分子染色体DNA、RNA以及SDS-蛋白复合物凝聚而沉淀之。
前者是因为中和核酸上的电荷,减少相斥力而互相聚合,后者是因为钠盐与SDS -蛋白复合物作用后,能形成较小的钠盐形式复合物,使沉淀更完全。
为什么用无水乙醇沉淀DNA?用无水乙醇沉淀DNA,这是实验中最常用的沉淀DNA的方法。
乙醇的优点是可以任意比和水相混溶,乙醇与核酸不会起任何化学反应,对DNA很安全,因此是理想的沉淀剂。
DNA溶液是DNA以水合状态稳定存在,当加入乙醇时,乙醇会夺去DNA周围的水分子,使DNA失水而易于聚合。
一般实验中,是加2倍体积的无水乙醇与DNA相混合,其乙醇的最终含量占67%左右。
因而也可改用95%乙醇来替代无水乙醇(因为无水乙醇的价格远远比95%乙醇昂贵)。
但是加95%的乙醇使总体积增大,而DNA在溶液中有一定程度的溶解,因而DNA损失也增大,尤其用多次乙醇沉淀时,就会影响收得率。
折中的做法是初次沉淀DNA时可用95%乙醇代替无水乙酵,最后的沉淀步骤要使用无水乙醇。
也可以用0.6倍体积的异丙醇选择性沉淀DNA。
一般在室温下放置15-30分钟即可。
在用乙醇沉淀DNA时,为什么一定要加NaAc或NaCl至最终浓度达0.1~0.25mol/L?在pH为8左右的溶液中,DNA分子是带负电荷的,加一定浓度的NaAc或NaCl,使Na+中和DNA分子上的负电荷,减少DNA分子之间的同性电荷相斥力,易于互相聚合而形成DNA 钠盐沉淀,当加入的盐溶液浓度太低时,只有部分DNA形成DNA钠盐而聚合,这样就造成DNA沉淀不完全,当加入的盐溶液浓度太高时,其效果也不好。
在沉淀的DNA中,由于过多的盐杂质存在,影响DNA的酶切等反应,必须要进行洗涤或重沉淀。
加核糖核酸酶降解核糖核酸后,为什么再要用SDS与KAc来处理?加进去的RNase本身是一种蛋白质,为了纯化DNA,又必须去除之,加SDS可使它们成为SDS-蛋白复合物沉淀,再加KAc使这些复合物转变为溶解度更小的钾盐形式的SDS-蛋白质复合物,使沉淀更加完全。
也可用饱和酚、氯仿抽提再沉淀,去除RNase。
在溶液中,有人以KAc代替NaAc,也可以收到较好效果。
7.为什么在保存或抽提DNA过程中,一般采用TE缓冲液?在基因操作实验中,选择缓冲液的主要原则是考虑DNA的稳定性及缓冲液成分不产生干扰作用。
磷酸盐缓冲系统(pKa =7.2)和硼酸系统(pKa=9.24)等虽然也都符合细胞内环境的生理范围(pH),可作DNA的保存液,但在转化实验时,磷酸根离子的种类及数量将与Ca2+产生Ca3(PO4)2沉淀;在DNA反应时,不同的酶对辅助因子的种类及数量要求不同,有的要求高离子浓度,有的则要求低盐浓度,采用Tris-HCl(pKa=8.0)的缓冲系统,由于缓冲液是TrisH+/Tris,不存在金属离子的干扰作用,故在提取或保存DNA时,大都采用Tris-HCl系统,而TE缓冲液中的EDTA更能稳苯酚、氯仿、异戊醇在DNA提取时的作用抽提DNA去除蛋白质时,怎样使用酚与氯仿较好?酚与氯仿是非极性分子,水是极性分子,当蛋白水溶液与酚或氯仿混合时,蛋白质分子之间的水分子就被酚或氯仿挤去,使蛋白失去水合状态而变性。
经过离心,变性蛋白质的密度比水的密度为大,因而与水相分离,沉淀在水相下面,从而与溶解在水相中的DNA分开。
而酚与氯仿有机溶剂比重更大,保留在最下层。
作为表面变性的酚与氯仿,在去除蛋白质的作用中,各有利弊,酚的变性作用大,但酚与水相有一定程度的互溶,大约10%~15%的水溶解在酚相中,因而损失了这部分水相中的DNA,而氯仿的变性作用不如酚效果好,但氯仿与水不相混溶,不会带走DNA。
所以在抽提过程中,混合使用酚与氯仿效果最好。
经酚第一次抽提后的水相中有残留的酚,由于酚与氯仿是互溶的,可用氯仿第二次变性蛋白质,此时一起将酚带走。
也可以在第二次抽提时,将酚与氯仿混合(1:1)使用。
为什么用酚与氯仿抽提DNA时,还要加少量的异戊酵?在抽提DNA时,为了混合均匀,必须剧烈振荡容器数次,这时在混合液内易产生气泡,气泡会阻止相互间的充分作用。
加入异戊醇能降低分子表面张力,所以能减少抽提过程中的泡沫产生。
一般采用氯仿与异戊酵为24:1之比。
也可采用酚、氯仿与异戊醇之比为25:24:1(不必先配制,可在临用前把一份酚加一份24:1的氯仿与异戊醇即成),同时异戊醇有助于分相,使离心后的上层水相,中层变性蛋白相以及下层有机溶剂相维持稳定。
苯酚:氯仿:异戊醇为什么要25:24:1?抽提DNA去除蛋白质时,怎样使用酚与氯仿较好?酚与氯仿是非极性分子,水是极性分子,当蛋白水溶液与酚或氯仿混合时,蛋白质分子之间的水分子就被酚或氯仿挤去,使蛋白失去水合状态而变性。
经过离心,变性蛋白质的密度比水的密度为大,因而与水相分离,沉淀在水相下面,从而与溶解在水相中的DNA分开。
而酚与氯仿有机溶剂比重更大,保留在最下层。