总RNA的提取原理
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木本植物组织总rna提取的要点与原理木本植物组织总RNA提取是研究植物生物学非常重要的一项技术。
通过总RNA提取,我们能够了解植物的基因表达情况,揭示其分子机制,并且可以用于后续的转录组学和蛋白质组学研究。
以下是木本植物组织总RNA提取的要点和原理。
一、要点:1.样品的选择:首先要选择新鲜且健康的植物组织作为样品,如嫩茎、叶片等。
避免使用受感染、受损或者老化的组织。
2.样品的处理:样品应尽快处理,避免长时间保存。
在处理之前,应该用无菌水清洗样品,并用无菌酒精消毒。
同时,还需要将工作台、仪器和试剂消毒,保持无菌状态。
3.细胞破碎方法:根据木本植物的组织特点,常用的细胞破碎方法包括机械破碎、液氮破碎和酶解破碎。
机械破碎可以利用研钵、搅拌器或者高压细胞破碎机,液氮破碎是将样品冷冻在液氮中后用研钵研磨,酶解破碎则利用酶的作用溶解细胞壁。
4. RNA保护剂的添加:为了保护RNA免受RNase酶的降解,常常在提取过程中加入RNA保护剂,如二硫磷酸二丙酯(DTT)、碟加硫磺酰亚胺(DMSO)等。
5. RNA提取试剂盒的选择:提取总RNA的常用试剂盒有Trizol试剂盒、RNeasy试剂盒和Column试剂盒等。
根据实验需求和样品特点选择适合的试剂盒。
6.RNA的纯化和浓缩:通常会通过反转录酶链反应合成cDNA,去除DNA质粒和RNA小分子杂质,然后利用酒精沉淀或硅胶柱层析等方法将总RNA纯化和浓缩。
二、原理:总RNA提取的原理主要包括样品细胞壁破碎、蛋白质和DNA去除以及RNA的纯化和浓缩。
1.细胞壁破碎:首先需要将植物组织破碎,破碎的方法可以选择机械、酶解和液氮等方法。
机械破碎是利用机械力使细胞壁破裂,液氮破碎则通过冷冻-解冻的过程来破裂细胞壁,酶解破裂则是利用酶的作用降解细胞壁。
2.蛋白质和DNA去除:接下来需要去除蛋白质和DNA,以便提取纯净的RNA。
常用的方法有酚/氯仿提取法和磁珠分离法。
酚/氯仿提取法是利用酚提取混合溶液中的蛋白质和DNA,而磁珠分离法则是通过特定的磁珠来吸附蛋白质和DNA,然后用磁力将磁珠分离。
总RNA提取的原理、步骤1.原理及方法(异硫氰酸胍-酚-氯仿一步法)TRIZOL试剂中的主要成分为异硫氰酸胍和苯酚,其中异硫氰酸胍可裂解细胞,促使核蛋白体的解离,使RNA与蛋白质分离,并将RNA释放到溶液中。
当加入氯仿时,它可抽提酸性的苯酚,而酸性苯酚可促使RNA进入水相,离心后可形成水相层和有机层,这样RNA与仍留在有机相中的蛋白质和DNA分离开。
水相层(无色)主要为RNA,有机层(黄色)主要为DNA和蛋白质。
2.简易步骤细胞或组织,加入0.4ml TRIZOL试剂后匀浆↓室温静置5分钟↓加入1/5 TRIZOL试剂体积量的氯仿,剧烈震荡混匀↓室温静置5分钟,12000g 4℃离心l5分钟↓将上清液转移至新的离心管中,加入与上清液等体积的异丙醇,颠倒混匀↓室温静置10分钟,12000g 4℃离心l0分钟,弃上清↓向沉淀中加入1ml的75%乙醇清洗沉淀,12000g 4℃离心5分钟↓弃上清保留沉淀,干燥↓沉淀物溶解于11μl的DEPC处理水中↓注意:以上操作应在生物安全柜内完成,以防止污染。
注意事项①全程配戴一次性手套。
皮肤经常带有细菌和霉菌,可能污染RNA的抽提并成为RNA酶的来源。
培养良好的微生物实验操作习惯预防微生物污染。
②使用灭菌的,一次性的塑料器皿和自动吸管抽提RNA,避免使用公共仪器所导致的RNA酶交叉污染。
③在TRIZOL中,RNA是隔离在RNA酶污染之外的。
而对样品的后续操作会要求用无RNA酶的非一次性的玻璃器皿或塑料器皿。
玻璃器皿可以在150°C的烘箱中烘烤4小时。
塑料器皿可以在0.5 M NaOH中浸泡10分钟,用水彻底漂洗干净后高压灭菌备用。
④用TRIZOL抽提RNA时要戴手套和护眼罩。
避免接触皮肤和衣服。
在化学通风橱完成操作。
避免呼吸道吸入。
如无例外,所有的操作应该在15 -30°C的条件下完成,试剂亦在15 -30°C的条件下。
⑤75%乙醇(用DEPC处理过的水配制:将水加入无RNA酶的玻璃瓶中,加入DEPC至0.01% (v/v)。
总RNA提取实验原理总RNA提取实验是一种用于从细胞或组织样品中提取总RNA(total RNA)的实验方法。
总RNA包含细胞内的所有RNA,包括mRNA(messenger RNA)、rRNA(ribosomal RNA)和tRNA(transfer RNA)等。
总RNA提取是进行分子生物学研究的重要步骤之一,它使得研究者可以获取样品中的全部RNA,并进一步应用于RNA测序、RT-PCR等实验。
1. 细胞或组织的破碎:首先将待提取的细胞或组织样品加入破碎缓冲液中,通常包含Tris-HCl缓冲液、EDTA、SDS等。
这些缓冲液中的成分有助于维持适宜的pH值和细胞膜的稳定性。
然后利用机械或化学方法,破坏细胞或组织的结构,以释放RNA。
例如,可通过高速离心破碎细胞,或使用离解酶(如蛋白酶K)降解维持细胞结构的蛋白质。
2.RNA的溶解:破碎后的样品中含有RNA、DNA、蛋白质和其他杂质。
为了分离RNA,需要加入盐溶液(如醋酸钠、乙酸铵等)来改变样品的离子强度,从而促进RNA的溶解。
同时,可以加入乙醇沉淀,将RNA从溶液中沉淀下来。
3.RNA的洗涤:通过多次洗涤,可以去除样品中的DNA、蛋白质和其他杂质。
洗涤时可使用乙醇、乙酸盐等具有去除杂质作用的溶液。
洗涤过程可以使用离心等方法将杂质沉淀下来,然后将上清液收集。
4.RNA的纯化:纯化步骤旨在去除残留的DNA、蛋白质和其他污染物,以获得纯净的RNA。
纯化的方法包括酚/氯仿提取法、硅胶柱提取法等。
其中,酚/氯仿法利用酚醇将DNA溶解于有机相中,而RNA则溶解于水相中。
硅胶柱提取法则依靠RNA与硅胶的亲和力差异,通过将样品通过硅胶柱,使得RNA与硅胶结合,而DNA和蛋白质则被去除。
总RNA提取实验需要注意以下几点:首先,实验室操作环境要经过彻底清洁消毒,以防止RNA的降解或污染;其次,实验中使用的试剂和仪器要保持优良的质量,以确保提取的RNA质量;另外,实验过程中要避免样品受到RNase的污染,RNase是一种常见的蛋白质酶,能够降解RNA,因此需要在RNase-free条件下进行实验。
实验三Trizol法提取细菌总RNA一、实验原理Trizol要紧物质是异硫氰酸胍,它能够破坏细胞使RNA释放出来的同时,爱惜RNA的完整性。
加入氯仿后离心,样品分成水样层和有机层。
RNA存在于水样层中。
搜集上面的的水样层后,RNA 能够通过异丙醇沉淀来还原。
不管是人、动物、植物仍是细菌组织,Trizol法对少量的组织(50-100 mg)和细胞(5×106)和大量的组织(≧1 g)和细胞(>107)均有较好的分离成效。
Trizol试剂操作上的简单性许诺同时处置多个的样品。
所有的操作能够在一小时内完成。
Trizol抽提的总RNA 能够幸免DNA和蛋白的污染。
二、要紧试剂和器材Trizol 溶液氯仿异丙醇 75%乙醇 0.1% DEPC水超净工作台 2.0 mL离心管(无Rnase)移液枪紫外分光光度计石英比色皿泳槽和模具电泳仪凝胶成像系统大肠杆菌三、实验步骤(一). 采纳 Trizol 溶液提取细菌的总 RNA1. 挑取大肠杆菌菌单菌落,培育至稳按期,取菌液2.0 mL 于2.0 mL离心管离心得菌体;二、每管加入 1 mL Trizol 溶液,盖紧管盖,猛烈振荡15 s,室温静置5 min 4℃,12000 g,离心 10 min;取上清转入(约 1 mL)新的 2.0 m L离心管中;3、每管加入 0.2 mL 的氯仿(0.2 体积 Trizol),盖紧盖,猛烈振荡 15 s;室温静置 3 min;4℃, 12000 g, 离心 10 min;警惕吸取上层水相,转入另一新的 2.0mL 离心管,测量其体积;(加氯仿时应充分震荡使其充分乳化。
)4、加入1倍体积的氯仿,盖紧盖,猛烈振荡 15 s;室温静置 3 min;4℃,12000 g,离心 10 min;警惕吸取上层水相,转入另一已编号新的 2.0mL 离心管;五、加入 0.5 mL 的异丙醇(0.5 体积 Trizol),轻轻倒置混匀;室温,静置 10 min;4℃,12000 g,离心 10 min,RNA 沉于管底;警惕吸去上清;六、加1 mL75%的乙醇(预冷),并轻柔倒置,洗涤沉淀;4℃,7500 g,离心 5 min;警惕弃上清,微离,吸去剩余乙醇,室温干躁 10 min;7、各管用 30μL DEPC 处置过的双蒸去离子水溶解,55-60℃温育5 min,分装,-80℃贮存(可贮存5周);(二). RNA 浓度的测定取10 µL RNA 样品以双蒸水稀释至 2 mL,转入预先以无水乙醇隔夜浸泡后晾干的石英比色皿中,警惕排除气泡,以等体积的双蒸水作为空白对照,在紫外分光光度计中别离测定 260 nm、280 nm 的光吸收值,依照公式计算 RNA 的浓度。
Trizol法提取总RNATrizol法是一种常用的RNA提取方法,其原理是基于氯仿-异硫氰酸胍的试剂,能够迅速破碎细胞并抑制细胞释放出的核酸酶。
通过将样品与Trizol试剂混合,可以裂解细胞并释放出RNA。
然后加入氯仿进一步抽提RNA,并通过离心分离出上清液中的RNA。
最后通过乙醇沉淀和洗涤得到纯化的RNA。
所需试剂和耗材1.Trizol试剂:用于细胞裂解和RNA的释放。
2.氯仿:用于抽提RNA。
3.无水乙醇:用于洗涤沉淀的RNA。
4.DEPC水:用于制备无RNA酶的水。
5.1.5ml Eppendorf管:用于RNA的存储。
6.Tips:用于吸取无RNA酶的水和Trizol试剂。
实验仪器1.台式高速离心机:用于离心分离RNA。
2.涡旋振荡器:用于混合样品和试剂。
3.移液器:用于吸取试剂和样品。
4.无菌微量离心管:用于样品和试剂的存储。
5.无菌手套:用于防止RNA酶的污染。
准备工作1.在实验前需要将实验区域和所有实验用具进行清洁和消毒,以避免RNA酶的污染。
2.使用Trizol试剂前需仔细阅读说明书,并确保按照说明书的要求进行操作。
3.为避免RNA酶的污染,需要穿戴无菌手套进行实验操作。
实验方法1.准备无菌的DEPC水,加入DEPC水至10ml,然后加入10μl的氯仿,充分混匀后放置备用。
2.在无菌的1.5ml Eppendorf管中加入100μl的Trizol试剂,加入10μl的氯仿,充分混匀后加入步骤1中制备好的DEPC水-氯仿混合液100μl,再次充分混匀后放置备用。
3.将样品加入到步骤2中制备好的溶液中,充分混匀后加入氯仿,再次充分混匀后进行高速离心,分离出上清液。
4.将上清液转移至新的离心管中,加入等体积的无水乙醇,充分混匀后进行高速离心,收集沉淀的RNA。
5.用70%乙醇洗涤沉淀的RNA,去除残留的乙醇和盐类,最后将RNA沉淀干燥后重新溶解在水中或指定的缓冲液中。
注意事项1.在加入氯仿之前,不要洗涤细胞,以免降解mRNA。
rna提取原理RNA提取原理RNA提取是分子生物学实验中的一项重要技术,它能够从细胞或组织中提取出RNA分子,为后续的RNA分析和研究奠定基础。
RNA 提取的原理是通过破坏细胞膜和核膜,释放出RNA分子,并使用适当的缓冲液将RNA稳定起来,防止其被降解。
RNA提取的步骤通常包括样本收集、细胞破碎、蛋白质消化、RNA 沉淀和洗涤等。
样本收集是RNA提取的第一步。
样本可以是细胞培养物、动物组织或植物组织等。
样本的选择和采集方法取决于研究的目的和需要。
接下来,细胞破碎是RNA提取的关键步骤之一。
细胞破碎的目的是破坏细胞膜和核膜,释放出细胞内的RNA分子。
常用的细胞破碎方法包括机械破碎、化学破碎和冻融破碎等。
机械破碎是通过高速离心或超声波等方法将细胞破碎成碎片,释放出RNA分子。
化学破碎是通过添加化学试剂破坏细胞膜和核膜,释放出RNA分子。
冻融破碎是将细胞冻结后迅速解冻,破坏细胞膜和核膜,释放出RNA分子。
蛋白质消化是RNA提取的另一个重要步骤。
细胞中含有大量的蛋白质,蛋白质会干扰RNA的提取和分析。
因此,在提取RNA之前,需要使用蛋白酶等消化酶将蛋白质消化掉,使RNA分子得以纯化。
RNA沉淀是RNA提取的核心步骤。
通过添加适当的缓冲液和醇类,可以使RNA分子从混合物中沉淀出来。
缓冲液中的盐类能够与RNA 分子形成离子对,降低RNA的溶解度,促使其沉淀。
醇类能够与RNA分子形成氢键和疏水作用,进一步增强RNA的沉淀能力。
洗涤是为了去除沉淀物中的杂质。
通过多次洗涤,可以将沉淀物中的盐类、蛋白质和其他杂质去除,使RNA得到纯化。
通过以上步骤,就可以从细胞或组织中提取出纯化的RNA分子。
提取的RNA可以用于后续的RNA测序、RT-PCR、Northern blot等实验。
总结起来,RNA提取的原理是通过破坏细胞膜和核膜,释放出RNA 分子,并使用适当的缓冲液将RNA稳定起来,防止其被降解。
RNA 提取的步骤包括样本收集、细胞破碎、蛋白质消化、RNA沉淀和洗涤等。
CTAB法提取植物样本RNA一.实验原理CTAB是阳离子去污剂,低离子强度溶液中沉淀核酸与酸性多聚糖,高离子(7MNaCl)强度溶液中沉淀蛋白、多聚糖。
破碎裂解细胞后,去除与RNA结合的蛋白质以及多糖,DNA等大分子,沉淀RNA,去除盐类及有机溶剂,溶解得到纯化的RNA。
二.实验试剂2% CTAB:CTAB 10g+NaCl 40.91g+1M Tris-HCl PH8.0 50ml+0.5M EDTAPH8.0 20ml,先用200ml水溶解,然后定容至500ml灭菌。
巯基乙醇, 氯仿:异戊醇=24:1,异丙醇,75%乙醇(-20℃预冷),RNaseFree ddH2O,DNaseI三.实验仪器及耗材移液器,水浴锅(或金属浴),振荡器,高速微量离心机,制冰机,2mL无RNA酶离心管,研钵,石英砂,液氮,吸水纸四.实验步骤1)2mL无RNA酶离心管中,加入980uL CTAB和20uL巯基乙醇,混匀65℃预热。
2)样品处理:样品取200mg(不超过),置于研钵中,加入少量石英砂,液氮研磨成粉,快速将粉末转移至上述液体1)中。
混匀,此时溶液为粘稠状。
3)65℃水浴10-30min,期间颠倒混匀几次。
4)加入等体积即1ml氯仿:异戊醇=24:1,混匀,12000rpm离心10min,取上清约900uL 至新离心管中5)重复4)2次6)加入等体积的异丙醇900uL,置于冰上10min或在冰箱中-20℃15min7)4℃离心20min 弃去上清,留沉淀8)75%乙醇(-20℃预冷)900ul漂洗1次,12000rpm离心5min8)移液枪吸去上清,离心管倒置在吸水纸上,干燥约20min9)用RNaseFree ddH2O 100uL溶解除去基因组DNA的步骤20uL体系:18ul RNA,1ul DNA酶,1ul buffer,0.25ul DNA酶抑制剂。
用PCR仪设置37℃30min,85℃5min。
总RNA提取的原理步骤
1.细胞破碎:首先需要破坏细胞膜以释放细胞内的RNA。
这可以通过
物理方法(如机械破碎或超声波破碎)或化学方法(如细胞裂解酶或去涂
膜剂)来实现。
2. 去除DNA:细胞内还存在DNA,因此需要使用RNase-free DNase
对DNA进行降解,以避免后续的RNA提取过程中DNA的污染。
3.分离RNA:接下来需要将RNA与其他细胞组分分离。
这可以通过加
入异丙醇或酚/氯仿混合物等有机溶剂,使RNA以水相形式存在并与有机
相相分离。
4.沉淀RNA:将有机相中的RNA沉淀下来,可以通过离心或使用醇沉
淀法实现。
有机相中的RNA会以颗粒状沉积于管壁上。
5. 洗涤和溶解:沉淀下来的RNA还会残留有一些污染物,因此需要
进行洗涤以去除这些污染物。
通常使用乙醇洗涤来去除盐和其他杂质。
最后,RNA可以通过溶解于适当的缓冲液中,如TE缓冲液或RNase-free水。
6.RNA质量检测:为了评估RNA的质量和纯度,一般会使用紫外吸收
光谱仪测定RNA的吸光度比值(A260/A280),以确定是否含有污染物。
总RNA提取的效率和纯度取决于多种因素,包括样本类型、细胞破碎
方法、RNase的去除和混合物分离的效果等。
因此,在总RNA提取过程中,需要注意严格控制废液的处理、采用无RNase酶的耗材和试剂、严格遵循
操作规程等。
总体而言,总RNA提取是从细胞或组织样本中提取总碱基为基础的RNA混合物的过程,它为后续的转录组学研究、基因表达分析等提供了重要的基础。
总RNA提取实验原理、步骤和问题解答Trizol 试剂是直接从细胞或组织中提取总RNA的试剂。
它在破碎和溶解细胞时能保持RNA的完整性,裂解细胞并释放出RNA,酸性条件使RNA与DNA分离, 加入氯仿后离心,样品分成水样层和有机层。
RNA存在于水样层中。
收集上面的的水样层后,RNA可以通过异丙醇沉淀来还原。
在除去水样层后,样品中的DNA和蛋白也能相继以沉淀的方式还原。
乙醇沉淀能析出中间层的DNA,在有机层中加入异丙醇能沉淀出蛋白。
共纯化DNA对于样品间标准化RNA的产量十分有用。
无论是人、动物、植物还是细菌组织,各种样品最大使用量( 1ml Trizol ),动物组织( 50mg) ,植物组织(100 mg) ,丝状真菌( 100mg) ,动物细胞(5 ×106~1×107) ,酵母(1 ×107) 。
TRIZOL试剂能促进不同种属不同分子量大小的多种RNA的析出。
例如,从大鼠肝脏抽提的RNA琼脂糖凝胶电泳并用溴化乙啶染色,可见许多介于7 kb 和15 kb 之间不连续的高分子量条带, ( mRNA和hnRNA成分) 两条优势核糖体RNA条带位于~5 kb (28S) 和~2 kb (18S) ,低分子量RNA介于0.1 和0.3 kb 之间(tRNA, 5S) 。
当抽提的RNA用TE稀释时其A260/A280比值≥1.8 。
[ 实验用品]【实验耗材】1、移液枪:1ml、200μl 、20μl 、10μl 、2μl 。
酒精擦拭,头部重点,紫外线照射。
2、吸头:1ml、200μl 、20μl3、匀浆管:5ml4、吸头台:放置1ml 吸头的一个,放置20μl 吸头的一个5、EP管:1.5ml 、0.2ml 、100μl6、试剂瓶:2个60ml 的棕色广口试剂瓶。
青霉素小瓶(分装无水乙醇,高压的DEPC水,-20°C保存)。
7、量筒:50ml、250ml、500ml8、容量250ml、500ml、1000ml9、试管架:5ml、1.5ml 、20μl10、盐水瓶:250ml、500ml 各2个备用,一个装无水乙醇,另一个装DEPC水11、铝制饭盒:4个12、塑料小饭盒:1个13、大瓷缸:2个14、锡泊纸:一卷15、卷纸:2 卷16、三角烧瓶:带盖,稍大(融琼脂糖)【实验仪器】天平、振荡器、高速离心机、0.5 ~10ul 、20~200ul 、100~1000ul 加样器。
1.原理及方法(异硫氰酸胍-酚-氯仿一步法)TRIZOL试剂中的主要成分为异硫氰酸胍和苯酚,其中异硫氰酸胍可裂解细胞,促使核蛋白体的解离,使RNA与蛋白质分离,并将RNA释放到溶液中。
当加入氯仿时,它可抽提酸性的苯酚,而酸性苯酚可促使RNA进入水相,离心后可形成水相层和有机层,这样RNA与仍留在有机相中的蛋白质和DNA分离开。
水相层(无色)主要为RNA,有机层(黄色)主要为DNA和蛋白质。
RNA降解新鲜细胞:如果试剂没有问题,且外源性污染也可以排除,那么降解几乎都来自裂解液的用量不足。
如果将裂解液直接加入培养皿中裂解细胞,一定要使裂解液能覆盖住细胞。
2. 新鲜组织:某些富含内源核酸酶的样品(如肝脏,胸腺等),即使使用电动匀浆器匀浆也不能避免RNA的降解。
更可靠的方法是:在液氮条件下将组织研碎,并且匀浆时使用更多裂解液。
3. 冷冻样品:样品取材后应立即臵于液氮中速冻,然后移至-70℃冰箱保存。
样品决不能未经液氮速冻而直接保存于-70℃冰箱中。
冷冻样品,即使是冷冻细胞,如果不在液氮条件下研磨碎,而直接加入裂解液中匀浆,RNA也比新鲜样品更容易降解。
样品在与裂解液充分接触前决不能出现融化,所以研磨用具必须预冷,在碾磨过程中要及时补充液氮。
样品研碎后,在液氮刚刚挥发完时,将样品迅速转移到含裂解液的容器中,立即混匀匀浆。
4. 外源RNA酶的污染:试剂,器械及实验环境中的RNA酶进入实验系统。
5. 内源RNA酶的污染:抑制剂失效或者用量不够,实验样品过多;匀浆时温度过高。
Q:OD260/OD280比值偏低A:1. 蛋白质污染:确保不要吸入中间层及有机相。
减少起始样品量,确保裂解完全、彻底。
加入氯仿后首先要充分混匀,并且离心分层的离心力和时间要足够。
如果所得RNA的OD260/OD280比值偏低,则用氯仿重新抽提一次,再沉淀,溶解。
2.苯酚残留:确保不要吸入中间层及有机相。
加入氯仿后首先要充分混匀,并且离心分层的离心力和时间要足够。
提取植物rna的步骤及原理答案:一、实验目的通过本实验学习从植物组织中提取RNA的方法二、实验原理RNA是一类极易降解的分子,要得到完整的RNA,必须最大限度地抑制提取过程中内源性及外源性核糖核酸酶对RNA的降解。
高浓度强变性剂异硫氰酸胍,可溶解蛋白质,破坏细胞结构,使核蛋白与核酸分离,失活RNA酶,所以RNA从细胞中释放出来时不被降解。
细胞裂解后,除了RNA,还有DNA、蛋白质和细胞碎片,通过酚、氯仿等有机溶剂处理得到纯化、均一的总RNA。
三、仪器、药品与试剂配方(一) 仪器1.低温离心机2.分光光度计3.琼脂糖胶电泳系统,用前先用1% Na OH溶液浸泡过夜,之后再用DEPC水浸泡冲洗。
4.高压灭菌锅5.研钵、剪刀、一次性手套等(二) 药品1.焦碳酸二乙酯(DEPC)2.吗啉代丙烷磺酸(MOPS)3.异硫氰酸胍4.醋酸钠(NaAc)5.氯仿6.苯酚7.甲醛8.乙醇9.乙二胺四乙酸(EDTA)10.琼脂糖11.异丙醇(三) 试剂配方1.0.1% DEPC水0.1 ml DEPC 加入100 ml三蒸水中,振摇过夜,再湿热灭菌。
2.2 mol/L NaAc、0.5 mol/L EDTA、4 mol/L异硫氰酸胍、4 mol/L LiCl等均用DEPC 水配制。
3.5ΧMOPS 电泳缓冲液(pH 7.0)MOPS 0.1 mol/LNaAc 40 mmol/LEDTA 5 mmol/L四、实验步骤(一)总RNA的提取(方案一)1.实验前10天左右播种水稻种子,在3-4叶期,剪取1.2 g幼叶。
放入研钵,在液氮中研磨成粉末状,移入10 mL离心管。
加入4 mol/L异硫氰酸胍4 mL苯酚3 mL2 mol/L NaAc (pH 4.8) 0.3 mL氯仿0.6 mL混匀,冰浴放置30 min。
2.4℃,8000 r/min,离心13 min。
3.弃沉淀,取上清至另一干净无菌离心管中。
4.加入2倍体积无水乙醇,-70℃,0.5 h。
实验十一动物组织细胞总RNA的提取一、实验原理RNA是基因表达的中间产物,存在于细胞质与核中。
对RNA进行操作在分子生物学中占有重要地位。
获得高纯度和完整的RNA 是很多分子生物学实验所必需的,如Northern杂交、cDNA合成及体外翻译等实验的成败,在很大程度上取决于RNA的质量。
由于细胞内的大部分RNA是以核蛋白复合体的形式存在,所以在提取RNA时要利用高浓度的蛋白质变性剂,迅速破坏细胞结构,使核蛋白与RNA分离,释放出RNA。
再通过酚、氯仿等有机溶剂处理、离心,使RNA与其他细胞组分分离,得到纯化的总RNA。
在提取的过程中要抑制内源和外源的RNase 活性,保护RNA分子不被降解。
因此提取必须在无RNase的环境中进行。
可使用RNase抑制剂,如DEPC是RNase的强抑制剂,常用来抑制外源RNase活性。
提取缓冲液中一般含SDS、酚、氯仿、胍盐等蛋白质变性剂,也能抑制RNase活性。
并有助于除去非核酸成分。
本实验介绍异硫氰酸胍法和TRIzol法提取动物组织总RNA并通过电泳进行鉴定。
二、仪器和试剂1.仪器:超净工作台、高速冷冻离心机、电泳仪、紫外分光光度计、凝胶成像系统、振荡器、移液器、吸头、Ep管、玻璃匀浆器、试管、玻璃器皿洗净后置180℃烘烤8h;不耐高温的器皿(如塑料制品)应用0.1% DEPC浸泡2h,70~80℃烘烤干燥,120℃高压20min,再70~80℃烘烤干燥方可使用。
2.试剂:(1)细胞裂解液:异硫氰酸胍 4mol/L柠檬酸钠(pH7.0) 25mmol/L十二烷基肌氨酸钠 0.5%β-巯基乙醇 0.1mol/L称取柠檬酸钠0.64g,十二烷基肌氨酸钠0.415g,吸取β-巯基乙醇0.7ml,用无Rnase的蒸馏水溶解,定容至50ml。
然后取以上配制的溶液(CBS液)33ml,异硫氰酸胍 25g,混合,完全溶解后4℃保存备用。
(2)10×凝胶缓冲液:吗啉代丙璜酸(MOPS)(pH7.0) 200mmol/LNaAc 100mmol/LEDTA(pH 8.0) 10mmol/L过滤除菌后避光保存。
总RNA的提取原理总RNA提取总RNA提取是生物学研究中常用的一种实验步骤,旨在从生物样品(如细胞或组织)中分离出所有的RNA分子,包括mRNA、rRNA和tRNA等。
总RNA提取的原理主要涉及以下几个方面:1.细胞破碎:总RNA提取的第一步是将细胞或组织破碎,以释放RNA。
破碎方法通常包括融解细胞膜和核膜,如物理破碎(机械剪切或超声波破碎)和化学破碎(利用洗涤剂、有机溶剂或酶等)。
2.RNA的稳定化:由于RNA易受到核酸酶的降解,因此在总RNA提取过程中需要将RNA稳定化以防止其降解。
常用的方法是在提取缓冲液中加入抑制核酸酶活性的剂。
3.蛋白质的去除:总RNA提取中需要将蛋白质从RNA中分离。
通常采用蛋白酶K或亲水基团(如硅胶或磷酸纤维素)来与蛋白质发生相互作用,从而将蛋白质分离出来。
4.RNA的纯化:在总RNA提取中,需要将RNA和其他杂质分离开来,以得到纯净的RNA。
常用的方法包括酚-氯仿提取、离心柱层析和磁珠层析等。
其中,酚-氯仿提取法是一种常用且经典的RNA纯化方法,通过酚醇中RNA在水相中的溶解度较高,而DNA和蛋白质则更倾向于酚醇相,从而实现RNA的分离。
总RNA提取的流程通常包括以下几个步骤:1.样品的处理:对细胞或组织样品进行处理,包括破碎细胞膜和核膜。
2.RNA的稳定化:将样品在提取缓冲液中孵育以稳定RNA。
3.蛋白质的去除:通过蛋白酶或亲水基团与蛋白质发生相互作用,将蛋白质分离出来。
4.RNA的纯化:通过酚-氯仿提取、离心柱层析或磁珠层析等方法将RNA纯化。
5.RNA的定量和质量检测:使用比色法、吸光度法或聚丙烯酰胺凝胶电泳等方法定量和检测RNA的质量。
总RNA提取是一种常用的实验步骤,在分子生物学和遗传学研究中起着重要的作用。
它可用于研究基因调控机制、新基因的发现、遗传多样性分析等研究领域,并为后续的转录组分析、RT-PCR和RNA测序等方法提供基础。
提取rna原理及应用RNA提取是从细胞或组织中分离纯化RNA的过程。
RNA(核糖核酸)是一种生物大分子,它在细胞中具有多种功能,例如:作为信息分子参与蛋白质合成、调节基因表达、催化化学反应等。
因此,对RNA的研究具有重要意义,需要进行RNA提取来获取纯净的RNA样本。
RNA提取的原理可以分为以下几个步骤:1. 细胞破碎和裂解:通过机械破碎或化学处理等方法,将细胞或组织破碎并释放RNA分子。
2. 离心:通过离心将细胞碎片与残余细胞器分离,以分离除RNA。
3. 蛋白质去除:通过酶解、酸性沉淀等方法去除蛋白质,以净化RNA。
4. RNA沉淀:向上清液中加入盐酸异丙醇或乙醇等沉淀剂,使RNA沉淀下来。
5. 洗涤:用乙醇洗涤RNA沉淀,以去除杂质。
6. 干燥和溶解:将得到的RNA沉淀干燥,并用水或缓冲液溶解,得到纯净的RNA样本。
RNA提取的应用非常广泛,主要包括以下几个方面:1. 基因表达分析:通过提取细胞中的RNA,可以分析基因的表达水平,了解不同条件下基因的活性和调控机制。
这对于研究细胞发育、生长和疾病发生机制具有重要意义。
2. RNA测序:随着高通量测序技术的发展,RNA提取成为进行转录组测序的重要步骤。
通过测序得到的转录组数据,可以对细胞中所有的转录本进行全面分析,揭示基因的结构、变异和功能。
3. siRNA合成和功能研究:RNA提取可以用于合成小干扰RNA(siRNA),用于基因沉默实验。
siRNA是一种能够特异性降低目标基因表达的双链RNA,可以用于研究基因的功能和信号通路。
4. RNA互作研究:RNA提取可用于研究RNA之间的相互作用。
通过技术如RNA 免疫共沉淀(RIP)和RNA交联免疫沉淀(CLIP),可以分析RNA与蛋白质或其他RNA分子之间的相互作用。
5. 分子诊断和生物医学研究:RNA提取可用于分析与疾病相关的基因表达变化。
例如,在癌症诊断中,可以通过提取肿瘤组织中的RNA,分析肿瘤相关基因的表达水平,预测病情和指导治疗策略。
总RNA的Trizol法提取流程及原理提取原理:Trizol试剂的主要成分是苯酚。
苯酚的主要作用是对细胞进行裂解,从而使细胞当中的蛋白质以及核酸物质解聚而得以释放。
苯酚虽然可以有效的使蛋白质变性,但它不能完全抑制RNA酶的活性,因此Trizol中还加入了8-羟基喹啉、异硫氰酸胍、β-巯基乙醇等来抑制内源和外源RNase(即RNA酶)。
Trizol试剂是直接从细胞或组织中提取总RNA的试剂。
在样品的裂解液或匀浆中,Trizol能保持RNA的完整性。
加入氯仿(CHCl3)后离心,样品能分成水样层和有机层。
而RNA存在于水样层中。
在收集上面的水样层后,RNA可以通过异丙醇沉淀的方法来还原。
在除去水样层之后,样品中的核酸和蛋白也能相继以沉淀的形式还原。
乙醇沉淀能析出中间层的DNA,在有机层中加入异丙醇能析出有机层的蛋白。
Trizol试剂不但可用于小量样品(组织:50-100mg;细胞:5×106),也可用于大量样品(组织≥1g或细胞≥107),对动物、植物、细菌、血液提取都适用,可同时处理大量不同样品。
反应迅速,提取的总RNA没有DNA和蛋白质污染,可用于Northernblot、RT-PCR、RNase保护分析等。
本试剂带有颜色,以便于区分水相和有机相,同时最大限度的保持RNA的完整性。
保存条件:2-8℃,避光保存12个月。
实验前需要准备的试剂:Trizol,氯仿,异丙醇,75%乙醇(用RNase-Free水配制),RNase-Free水。
实验前需要准备的物品:1ml注射器,1.5ml EP管(DEPC处理过),大、中、小号枪头(DEPC处理)样品前处理注意点:1.选择新鲜血液。
2.选择生长旺盛的组织。
3.选择新鲜的幼嫩组织。
4.选择处于生长旺盛的时期的细胞。
RNA纯化要求:1.纯化后不应存在对酶(如逆转录酶)有抑制作用的物质。
2.排除有机溶剂和金属离子的污染。
3.蛋白质、多糖和脂类分子等的污染降到最低程度。
rneasy kit法提取rna原理一、简介rneasykit是一种常用的用于从组织样品或病毒中提取总RNA的试剂盒。
它是根据酚/氯仿抽提和有机溶剂沉淀等方法,结合一系列试剂和酶,能够有效且稳定地提取高质量的RNA。
这种提取方法广泛应用于生物学研究中的基因组研究、转录组学研究、逆转录病毒研究等。
二、提取原理1.组织样品处理:首先,试剂盒中的裂解液能够溶解组织细胞。
裂解液中含有蛋白酶K,它可以分解组织中的蛋白质,同时不会对RNA 产生破坏。
2.细胞碎片和核酸分离:通过离心,将组织中的细胞碎片和上清液分离。
沉淀中包含了大部分的总RNA,因为它与蛋白质等杂质不同,RNA更重,会下沉。
3.RNA沉淀洗涤:在洗涤步骤中,试剂盒中的洗涤液可以去除可能残留的蛋白等杂质,进一步提高RNA的质量。
4.酚/氯仿抽提:这是RNA提取的关键步骤。
酚和氯仿的混合物能够将RNA从其他杂质中分离出来。
通过离心,可以将有机相和上清液去除,留下含RNA的沉淀。
5.异戊烷相的分离:通过异戊烷相的分离,得到纯化的RNA更加容易。
同时,异戊烷相中的RNA可以被收集起来。
6.乙醇洗涤:通过70%的乙醇洗涤,可以进一步去除可能残留的酚和氯仿,并回收RNA。
这一步骤可以减少RNA被降解的风险。
7.RNA定量和纯度检测:通过紫外分光光度计测定RNA的浓度和纯度,以确保其可用于后续实验。
这种方法可以确定RNA的质量和纯度,为后续实验提供基础数据。
8.逆转录反应:如果需要,可以使用试剂盒提供的逆转录酶和引物,将RNA逆转录为cDNA。
这一步骤可以为后续的基因表达分析做准备。
三、注意事项1.在使用过程中,要避免RNA受到RNA酶的破坏,以保持其完整性。
因此,需要在无RNA酶的环境中进行操作。
2.使用无RNase和无DNA酶的试剂盒和耗材,以减少对RNA的污染。
这样可以确保提取出的RNA质量更高,结果更准确。
3.在离心和洗涤过程中,要小心操作,避免对RNA造成物理损害。
RNA 提取的原理与方法RNA 提取的原理与方法细胞中的RN A 可以分为信使RN A、转运RN A 和核糖体RN A 三大类,不同组织总RN A 提取的实质就是将细胞裂解,释放出RN A, 并通过不同方式去除蛋白,DN A 等杂质,最终获得高纯度RN A 产物的过程。
RNA 提取流程L样品处理从各种不同来源样品(如细菌、酵母、血液、动物组织、植物组织和培养细胞),或同—来源样品的不同组织(如植物幼嫩叶片、成熟根、茎等)中提取高质址的RN A, 因细胞结构及所含的成分不同,样品预处理的方式也各有差异。
样品肋要戎最好使用新鲜的样品或取样后立即在低温<-2o·c 或-1o·c) 冷冻保存的样品,避免反复冻融,因为这会导致提取的RN A 降解和提取址下降。
样品预姓型方式植物材料-液氮研磨动物材料-匀浆、液氮研磨细菌-溶菌酶破壁酵母-液氮研磨、玻璃珠处理、混合酶破壁2.细胞裂解异磅氖酸腑苯酚法(TRIZOL)这是一种传统的RN A 提取方法,适用于大部分动植物材料,但对于次生代谢产物较多的植物材料提取RN A 效果较差。
异硫氝酸肌能使核蛋白复合体解离,并将RN A 释放到溶液中,采用酸性酚氯仿混合液抽提,低PH 值的酚将使RN A 进入水相,而蛋白质和DN A 仍留在有机相,从而可以完成RN A 的提取工作。
该法应用非常广泛,适用于包括动物组织、微生物、培养细胞等在内的各类动物性材料,同时还适用于次生代谢物较少的植物性材料,如幼苗、幼叶等。
该法主要应用在动物组织和培养细胞的RN A 提取中。
l/!l(纫'/3 -资基乙醇法适用于各种不同动物材料和次生代谢物少的植物材料。
在这种方法中,抓盐使细胞充分裂解,13 -硫基乙醇作为蛋白的变性剂在实验全程中可以抑制RN aseA 的活性,保护RN A 不被降解。
我公司的" GREEN" 系列总RN A 提取试剂盒是基于这种方法开发的产品,分别适用于各类不同的材料。
1.原理及方法(异硫氰酸胍-酚-氯仿一步法)
TRIZOL试剂中的主要成分为异硫氰酸胍和苯酚,其中异硫氰酸胍可裂解细胞,促使核蛋白体的解离,使RNA与蛋白质分离,并将RNA释放到溶液中。
当加入氯仿时,它可抽提酸性的苯酚,而酸性苯酚可促使RNA进入水相,离心后可形成水相层和有机层,这样RNA与仍留在有机相中的蛋白质和DNA分离开。
水相层(无色)主要为RNA,有机层(黄色)主要为DNA和蛋白质。
RNA降解
新鲜细胞:如果试剂没有问题,且外源性污染也可以排除,那么降解几乎都来自裂解液的用量不足。
如果将裂解液直接加入培养皿中裂解细胞,一定要使裂解液能覆盖住细胞。
2. 新鲜组织:某些富含内源核酸酶的样品(如肝脏,胸腺等),即使使用电动匀浆器匀浆也不能避免RNA的降解。
更可靠的方法是:在液氮条件下将组织研碎,并且匀浆时使用更多裂解液。
3. 冷冻样品:样品取材后应立即臵于液氮中速冻,然后移至-70℃冰箱保存。
样品决不能未经液氮速冻而直接保存于-70℃冰箱中。
冷冻样品,即使是冷冻细胞,如果不在液氮条件下研磨碎,而直接加入裂解液中匀浆,RNA也比新鲜样品更容易降解。
样品在与裂解液充分接触前决不能出现融化,所以研磨用具必须预冷,在碾磨过程中要及时补充液氮。
样品研碎后,在液氮刚刚挥发完时,将样品迅速转移到含裂解液的容器中,立即混匀匀浆。
4. 外源RNA酶的污染:试剂,器械及实验环境中的RNA酶进入实验系统。
5. 内源RNA酶的污染:抑制剂失效或者用量不够,实验样品过多;匀浆时温度过高。
Q:OD260/OD280比值偏低
A:
1. 蛋白质污染:确保不要吸入中间层及有机相。
减少起始样品量,确保裂解完全、彻底。
加入氯仿后首先要充分混匀,并且离心分层的离心力和时间要足够。
如果所得RNA的OD260/OD280比值偏低,则用氯仿重新抽提一次,再沉淀,溶解。
2.苯酚残留:确保不要吸入中间层及有机相。
加入氯仿后首先要充分混匀,并且离心分层的离心力和时间要足够。
3.多糖或多酚的残留:一些特殊的组织和植物中,多糖、多酚含量较多,这些残留也会导致OD260/OD280比值偏低。
因此,从这类材料中提取RNA时,需要注意多糖、多酚杂质的去除。
4.设备限制:测定OD260及OD280数值时,要使OD260读数在0.1-0.5之间。
此范围线性最好。
用水稀释样品:测OD值时,对照及样品稀释液请使用10mM Tris,pH7.5。
用水作为稀释液将导致比值偏低。
Q:RNA提取得率低
A:
1. 该组织或者细胞中RNA含量偏低:不同细胞和组织中RNA的丰度不同,如肝脏,胰腺,心脏等是高丰度组织(总RNA含量2-4μg/mg),脑,胚胎,肾脏,肺,胸腺,卵巢等是中丰度组织(总RNA含量0.05-2μg/mg),膀胱,骨,脂肪等是低丰度组织(总RNA含量<0.05μg/mg)。
2. 组织起始量太少或者太多:样品量过少,则细胞组织中RNA含量较低;样品量过多则可能超过裂解液的裂解能力,裂解将不完全,从而导致RNA得率低。
核糖体RNA(ribosomal RNA,rRNA)是组成核糖体的主要成分。
核糖体是合成蛋白质的工厂。
在大肠杆菌中,rRNA量占细胞总RNA量的75%-85%,而tRNA占15%,mRNA仅占3-5%。
rRNA一般与核糖体蛋白质结合在一起,形成核糖体(ribosome),如果把rRNA从核糖体上除掉,核糖体的结构就会发生塌陷。
原核生物的核糖体所含的rRNA有5S、16S及23S三种。
S为沉降系数(sedimentation coefficient),当用超速离心测定一个粒子的沉淀速度时,此速度与粒子的大小直径成比例。
5S含有120个核苷酸,16S含有1540个核苷酸,而23S含有2900个核苷酸。
而真核生物有4种rRNA,它们分子大小分别是5S、5.8S、18S和28S,分别具有大约120、160、 1900和4700个核苷酸。
RNA样品电泳后,可见28S、18S及5S小分子RNA条带,则说明完整性好。
若有降解可能是操作不当或污染了RNase.。
28S和18S RNA比值约为2:1,表明RNA无降解。
如比值逆转,则表明RNA 降解。