第二章 氨基酸与蛋白质的一级结构
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武汉大学生科院武汉大学生科院张楚富教授等原作!非常感谢!第二章氨基酸和蛋白质的一级结构基本内容蛋白质含有20种标准氨基酸,这些氨基酸在它们的α碳原子上分别含有一个氨基、一个羧基和一个侧链基团(或称R基团)。
除甘氨酸外,所有其它氨基酸的α碳原子都是一个不对称的碳原子,即手性碳原子。
蛋白质中的所有氨基酸都是L-型的。
20种标准氨基酸可以根据它们侧链的结构分为含脂肪烃基的氨基酸、含芳香基的氨基酸、含硫的(或含羟基的、或含酰胺基的)氨基酸。
如果根据它们的侧链极性(或在生理pH下的解离),可分为侧链非极性氨基酸、侧链不带电荷的极性氨基酸和侧链解离带正电荷或负电荷的氨基酸。
氨基酸侧链的性质对于决定蛋白质的性质、结构和功能来说是很重要的。
氨基酸的α-氨基和α-羧基都是可解离的基团,它们的解离取决于介质的pH。
在生理pH下,α-氨基解离带正电荷(–NH3+),α-羧基解离带负电荷(–CO O–);侧链可解离基团的解离取决于它们的pK值和介质的pH。
氨基酸的解离性质是建立分离和分析氨基酸的方法的基础,它们的解离也影响蛋白质的性质、结构和功能。
分离分析氨基酸的主要方法是离子交换法以及电泳法。
蛋白质是由氨基酸借肽键连接而成多聚物。
在蛋白质多肽链中,肽键是唯一的共价键,由一个氨基酸的α-羧基和相邻氨基酸的α-氨基脱水缩合而成。
在多肽链中,氨基酸残基的顺序称为蛋白质的一级结构。
蛋白质是生物大分子,虽然它们具有与氨基酸相似的解离性质,但这一性质却比氨基酸复杂。
蛋白质的许多重要的性质,例如,溶解性、极性、带电性质、分子大小以及配体亲和性等,是构成分离分析它们的方法的基础。
离子交换法、凝胶过滤法、亲和层析法、超速离心法以及各种电泳法是常用的方法。
蛋白质一级结构的测定通常采用这样的程序,即纯净样品的末端分析、氨基酸组成分析、专一性酶或化学试剂进行部分水解、Edman降解法测定肽碎片的氨基酸残基的顺序以及片段重叠。
末端分析常有丹磺酰氯法和二硝基氟苯法;肽链的部分水解一般是有胰蛋白酶法、胰凝乳蛋白酶法以及溴化氰法。
蛋白质一级结构名词解释
蛋白质一级结构是指氨基酸序列的线性顺序。
蛋白质是由氨基酸构成的,而氨基酸的排列顺序决定了蛋白质的功能和结构。
在蛋白质一级结构中,丰富多样的氨基酸序列可以编码出数以百种的蛋白质。
蛋白质一级结构的解释需要理解以下几个概念:
1. 氨基酸
氨基酸是蛋白质的基本单位。
它是由一个氨基(NH2)和一个羧基(COOH)组成,以及一个侧链(R),侧链的种类决定了氨基酸的不同特性。
2. 多肽链
多个氨基酸通过肽键的连接形成多肽链。
肽键是由一个氨基酸的羧基与下一个氨基酸的氨基之间的共价键。
多肽链可以是短的多肽,也可以是长的多肽或蛋白质。
3. 氨基酸序列
氨基酸序列是指蛋白质中氨基酸的线性排列顺序。
氨基酸序列的不同决定了不同蛋白质之间的差异。
4. 多肽链的方向
多肽链有一个氨基端和一个羧基端,这决定了多肽链的方向。
一般来说,氨基端被称为N-端,而羧基端被称为C-端。
5. 氨基酸的属性
氨基酸的侧链决定了其属性,包括电荷、亲水性、疏水性、大小和形状等。
不同氨基酸的组合可以影响蛋白质的形状和功能。
通过对蛋白质一级结构的研究,科学家可以揭示蛋白质的功能和结构。
了解一级结构有助于解释蛋白质的折叠和稳定性,从而有助于设计和开发新的药物、酶和生物材料等。
第二章氨基酸与蛋白质的一级结构一、选择题(部分题目为多选题)1.用茚三酮试剂鉴定氨基酸是靠它与下面什么功能集团起作用?(D)A.氨基B.羧基C.R基D.A和B2.在适当条件下,盐酸胍变性球蛋白的可逆性,可证明(D)。
A.蛋白质高级结构虽然脆弱,但有机试剂引起的变性可以复性B.蛋白质高级结构很稳定,变性后可以恢复C.蛋白质高级结构不稳定,变性后去掉变性因素就可复性D.蛋白质高级结构不稳定,温和条件下的变性在去掉变性因素后可以复性3.胰蛋白酶水解由下列(AD)的羧基所形成的肽键。
A.ArgB.GluC.ApD.Ly4.用DNFB确定氨基酸是靠它与下面(A)功能集团起作用。
A.α-氨基B.α-羧基C.α-氨基和α-羧基D.两者都不是5.当多肽键存在(D)残基时,α螺旋就被中断。
A.GlyB.AlaC.PheD.Pro6.溴化氰(CNBr)作用于(A)。
A.Met-某B.Arg-某C.某-TrpD.某-Hi7.Trypin降解肽键的特点是(A)。
A.Ly和Arg的羧基形成的肽键B.Ap和Glu的羧基形成的肽键C.Ly和Arg的氨基形成的肽键D.Ap和Glu的氨基形成的肽键8.Chymotrypin降解肽键的特点是(C)。
A.Ly和Arg的羧基形成的肽键B.Ap和Glu的羧基形成的肽键C.Phe、Trp和Tyr的羧基形成的肽键D.Met和Ile的羧基形成的肽键9.当Ala、Ser、Phe、Leu、Arg、Ap和Hi的混合物在pH3.9进行纸电泳时,哪些氨基酸移向正极?(D)A.Arg和HiC.Phe和LeuD.Ser和AlaD.ApE.没有10.当Ala、Ser、Phe、Leu、Arg、Ap和Hi的混合物在pH3.9进行纸电泳时,哪些氨基酸移向负极?(E)A.Arg和HiC.Phe和LeuD.Ser和AlaD.ApE.除Ap以外的氨基酸11.用食盐和硝酸盐腌制的干鱼中含有一种基因诱变剂:2-氯-4-甲基硫丁酸(2-chloro-4-methylthiobutanoicacid,CMBA),它是(A)衍生物。
第二章氨基酸与蛋白质的一级结构一、选择题(部分题目为多选题)1. 用茚三酮试剂鉴定氨基酸是靠它与下面什么功能集团起作用?()A. 氨基B. 羧基C. R基D. A和B2. 在适当条件下,盐酸胍变性球蛋白的可逆性,可证明()。
A.蛋白质高级结构虽然脆弱,但有机试剂引起的变性可以复性B.蛋白质高级结构很稳定,变性后可以恢复C.蛋白质高级结构不稳定,变性后去掉变性因素就可复性D.蛋白质高级结构不稳定,温和条件下的变性在去掉变性因素后可以复性3. 胰蛋白酶水解由下列()的羧基所形成的肽键。
A. ArgB. GluC. AspD. Lys4. 用DNFB确定氨基酸是靠它与下面()功能集团起作用。
A.α-氨基 B. α-羧基 C. α-氨基和α-羧基 D. 两者都不是5. 当多肽键存在( )残基时,α螺旋就被中断。
A. GlyB. AlaC. PheD. Pro6. 溴化氰(CNBr)作用于( )。
A. Met-XB. Arg-XC. X-TrpD. X-His7. Trypsin降解肽键的特点是()。
A.Lys和Arg的羧基形成的肽键 B. Asp和Glu的羧基形成的肽键C.Lys和Arg的氨基形成的肽键 D. Asp和Glu的氨基形成的肽键8. Chymotrypsin降解肽键的特点是()。
A.Lys和Arg的羧基形成的肽键 B. Asp和Glu的羧基形成的肽键C.Phe、Trp和Tyr的羧基形成的肽键 D. Met和Ile的羧基形成的肽键9. 当Ala、Ser、Phe、Leu、Arg、Asp和His的混合物在pH3.9进行纸电泳时,哪些氨基酸移向正极?()A. Arg和His C. Phe和Leu D. Ser和Ala D. Asp E. 没有10. 当Ala、Ser、Phe、Leu、Arg、Asp和His的混合物在pH3.9进行纸电泳时,哪些氨基酸移向负极?()A. Arg和His C. Phe和Leu D. Ser和Ala D. Asp E. 除Asp以外的氨基酸11.用食盐和硝酸盐腌制的干鱼中含有一种基因诱变剂:2-氯-4-甲基硫丁酸(2-chloro-4-methylthiobutanoic acid, CMBA),它是()衍生物。
A.Met B. Leu C. Cys D. Ser E. None12. Proinsulin是由一条"连接肽"通过碱性氨基酸残基连接其他二条链的C端和N端,这条"连接肽"称为( )。
A. A链B. B链C. C肽13. 镰刀型红细胞贫血症的病因是由于正常的血红蛋白分子中的氨基酸被另一个氨基酸所置换()A. Val → Glu;B. Gln → V al;C. Glu → Val;D. Ala → Gln14. 双缩脲反应主要用来测定()A. DNAB. RNAC. CarbohydrateD. Peptide15.下列对GSH中肽键肽键描述正确的是()。
A. 是由α-氨基和α-羧基形成的B. 是由α-氨基和ε-羧基形成的C. 一个肽键是由α-羧基和α-氨基形成,而另一个则是由一个ε-羧基和α-氨基形成D. 一个肽键是由α-羧基和α-氨基形成,而另一个则是由一个ε-氨基和α-羧基形成16. 下列氨基酸中等电点最高的氨基酸是()。
A. GluB. GlnC. MetD. CysE. Arg17. 有一个三肽,用胰蛋白酶水解,发现有游离的Gly和一种二肽,下列多肽的一级结构中,哪一个符合该肽的结构?()A. Ala-Lys-GlyB. Lys-Ala-GlyC. Gly-Lys-AlaD. Ala-Gly-Lys18. 下列氨基酸分子中含有两个不对称碳原子的氨基酸是:()A. ProB. TyrC. ThrD. Arg19. 下列哪一种氨基酸不含极性侧链? ( )A.Thr B.Met C.Ser C.Cys E.Tyr20. 下列哪一种氨基酸的侧链的pK值最接近pH7( )A.Ser B.Glu C.Gln D.His E.Tyr参考答案:1.D 2.D 3.AD 4.A 5.D 6.A 7.A 8.C 9.D 10.E 11.A 12.C 13.C 14.D 15.C 16.E 17.A 18.C 19.B 20.D二、判断题1. 自然界中存在的氨基酸有20中。
( )2. 天然α-氨基酸的构型大多数为L-型。
( )3. 蛋白质的功能是由其特殊结构决定的,也可以说是由其一级结构决定的。
()4. 核酶即是核酸酶。
()5. Asp、Leu和Lys的混合物,经过sulphonated polystyrene 阳离子交换树脂粒,用pH5的缓冲液洗脱,先后洗脱顺序为Asp/Leu/Lys。
()6. 有机溶剂导致蛋白质沉淀是由于有机溶剂同蛋白质结合形成了不溶于水的复合物。
()7. 有一条肽链含有51个氨基酸,所以含有51个肽键。
()8. R f值是指物质分离后在纸层析图谱上的位置。
()9. 蛋白质高级结构决定于其一级结构。
()10. 蛋白质中肽键平面的形成是共振作用的结果。
()11. 一个氨基酸残基就是一个肽单元。
( )12. 蛋白质在热力学上最稳定的构象是自由能最低的结构。
( )13. 所有a氨基酸中的a碳原子都是一个不对称的碳原子。
( )14. 蛋白质是两性电解质,当溶液的pH在其等电点以上时,蛋白质带负电荷,而pH在其等电点以下时,带正电荷。
()15. 功能相似的蛋白在进化上其三级结构相似。
()16. CNBr能裂解Gly-Met-Pro。
()参考答案:1× 2√ 3√ 4× 5√ 6× 7× 8× 9√ 10√ 11× 12√ 13× 14√ 15√ 16√三、问答题1. 请默写20种标准氨基酸的化学结构式及英文缩写。
2. 组胺二盐酸(histamine)是一种抗黑瘤癌(melanoma)药物的辅助治疗剂,因为它可以使癌细胞对药物更敏感。
请画出组胺二盐酸的化学结构式。
3. 根据书中表2-1中氨基酸的pK值,计算Ala、Tyr、Asp和Arg的pI值。
4.(1)当Ala、Ser、Phe、Leu、Arg、Asp和His的混合物在pH3.9进行纸纸电泳时,带有相同电荷的氨基酸常有少许分开,例如Gly可与Leu分开,试说明为什么?(2)设Ala、Val、Glu、Lys和Thr的混合物pH为6.0,试指出纸电泳后氨基酸的分离情况。
5. 用食盐和硝酸盐腌制的干鱼中含有一种基因诱变剂:2-氯-4-甲基硫丁酸(2-chloro-4-methylthiobutanoic acid, CMBA),请画出CMBA的化学结构式,并指出它是什么氨基酸的衍生物?6. 下列结构是修饰了的氨基酸侧链,请指明其相应的氨基酸。
A,-CH2OPO32-; B, -CH2CH(COO-)2;C, -(CH2)4-NH-C(O)CH37. 向1L 1mol/L处于等电点的Gly溶液中加入0.3 mol HCl, 其溶液的pH值是多少?如果加入的是1.3 mol NaCl, 溶液的pH值又是多少?(2.71;9.23)8. 用胰蛋白酶和胰凝乳蛋白酶分别处理下列多肽将产生什么样的片段?Gly-Ala-Trp-Arg-Asp-Ala-Lys-Glu-Phe-Gly-Gln9. 分离了一个具有抗癌活性的十肽(FP),请根据下面实验现象推断出其氨基酸序列。
(1)一轮Edman降解每mole产生2mole的PTH-Asp;(2)FP用巯基乙醇处理后用胰蛋白酶降解得到三种肽片:(Ala, Cys, Phe), (Arg, Asp), (Asp, Cys, Gly, Met, Phe)。
前述完整的三肽Edman降解第一轮产生PTH-Cys; (3)1molFP用羧肽酶降解产生2mol的Phe;(4)在(2)中的五肽用CNBr裂解产生两肽片:一个高丝氨酸内酯(含Asp)、三肽(Cys, Gly, Phe)。
该三肽Edman降解第一轮产生Gly。
()10. 有一个七肽含有Asp、Leu、Lys、Met、Phe、Tyr,用trypsin处理没有明显变化;用Edman 降解产生PTH-Phe;用Chymotrypsin处理的产物中含有一个二肽和四肽,该四肽的氨基酸组成为Leu、Lys和Met;用溴化氰(Cyanogen bromide)处理得到一二肽、四肽和游离的Lys。
试推导该七肽的氨基酸序列。
(Phe-Asp-Tyr-Met-Leu-Met-Lys)11. 有一个七肽在分析氨基酸的组成时发现有Asp、Glu、Leu、Lys、Met、Tyr、Trp和NH4+。
该七肽用胰蛋白酶处理没有效果;用Edman降解产生PTH-Tyr;用Chymotrypsin处理得到的产物中含有一个二肽和四肽,且四肽的氨基酸的组成为Glx、Leu、Lys和Met;用CNBr 处理得到一个四肽和一个三肽,在pH7.0时该四肽带净的正电荷,三肽净电荷为0。
请推导出该七肽的氨基酸序列。
(Tyr-Asn-Trp-Met-(Glu-Leu)-Lys,括号中的两个氨基酸残基顺序无法根据已知条件确定)12. 一个十肽在分析氨基酸的组成时发现含有NH4+、Asp、Glu、Tyr、Arg、Met、Pro、Lys、Ser和Phe。
羧肽酶A和B对该十肽都没有作用;用Trypsin处理得到两种四肽和一种游离的A.A.:Lys;用梭菌蛋白酶(Clostripain)处理得到一个六肽和一个四肽;用溴化氰处理得到一八肽和一二肽(序列为Asn-Pro);用Chymotrypsin处理得到两个三肽和一个四肽,且位于N-端的寡肽在pH中性时带-1单位的电荷,在pH 12时带-3单位的电荷;该十肽Edman 降解反应发现第一个其氨基酸的衍生物为PTH-Ser。
请推导出该十肽的氨基酸序列。
(Ser-Glu-Tyr-Arg-Lys-Lys-Phe-Met-Asn-Pro)13. 对极度兴奋的足球迷血样的分析结果发现血液中存在高浓度的一种八肽,其氨基酸的组成为:2 Ala、1Arg、1Asp、1Met、2Tyr、1Val、1NH4+。
部分酸解发现有Ala-Val存在;用Chymotrypsin处理该八肽得到两四肽,每个含有Ala残基;取上步中的一种四肽用Trysin 处理可得到两个二肽,若用溴化氰处理可得一三肽和游离的Tyr;第二步中的另一四肽末端氨基酸分析结果为Asp。
试推导该八肽的氨基酸序列。
(Asn-Ala-Val-Tyr和Ala-Arg-Met-Tyr 的两种连接都符合题意)14. 一八肽氨基酸组成分析结构如下:2 Arg、1Gly、1Trp、1Met、1Tyr、1Lys、1Phe。