猪GPX5基因、FUT1阳基因和NCOA1基因的多态性分析

NCOA1基因多态性与猪繁殖性状相关性分析***（2012届动物科学专业*班）摘要：本实验对核受体辅激活蛋白1（NCOA1）基因多态性与猪繁殖性状的关系进行研究,以探讨NCOA1 基因作为分子标记在猪育种工作中的作用。

本实验应用PCR-RFLP技术，分析了NCOA1 基因3个位点与豫南黑猪、大约克夏猪、杜洛克猪繁殖性状的相关性。

结果表明：NCOA1基因 3个位点分别为G/A、T/C和T/C突变，有2个等位基因，3种基因型，优势基因分别为A、C、E。

3个位点各基因型上大约克夏与豫南黑猪和杜洛克均差异显著，豫南黑猪、杜洛克和大约克夏各个基因型之间在繁殖性状上整体差异显著，其繁殖性状都呈现BB>AB>AA，CC>CD>DD，EE>EF>FF。

结论：NCOA1基因3 个SNP位点有不同程度变异，具有一定的选择潜力. NCOA1对母猪繁殖性状的遗传效应显著，有望将其作为猪繁殖性状的候选基因开展标记辅助选择，提高产仔数。

关键词: NCOA1基因；多态性；繁殖性状Correlation Analysis of Polymorphism of NCOA1 Gene of Swine and Reproductive Traits* *-*(Class * of Animal Science, Graduated in 2012)Abstract: In order to discuss the use of NCOA1 gene being molecular marker in the breeding of pig ,this experiment studied the polymorphism of nuclear receptor and auxiliary activating protein1 (NCOA1) gene of swine and its association with reproductive traits.This experiment applied PCR-RFLP to analyse the correlation of the 3 sitel in NCOA1 gene and reproductive traits of Yunan Black pig 、Duroc 、Large white. The result showed that: NCOA1 gene 3 sites were G/A, T/C and T/C mutation , 2 allele ,3 genotype and the dominant gene were A、C、E. 3 site genotypes on large white and Yunan black pig and Duroc were significantly different, Yunan Black pig 、Duroc and Large white were significantly different in reproductive traits among each genotype,and the reproductive traits are presented BB>AB>AA，CC>CD>DD，EE>EF>FF. Conclusion: The 3 SNP site in NCOA1 gene had different degrees of variation and certain Selection potential.Genetic effect of sows were significantly different on reproductive traits, was expected to be a candidate gene for pig reproductive traits in marker assisted selection, improve the litter size.Key words:NCOA1 gene; Polymorphism; Reproductive traits繁殖性能作为评价猪生产性能的主要指标，越来越受到大家的重视，繁殖性能的高低可直接关系到育肥猪的数量多少和猪肉供给量的多少。

江西农业学报㊀２０２０，３２（４）：１１８ １２２ＡｃｔａＡｇｒｉｃｕｌｔｕｒａｅＪｉａｎｇｘｉ㊀㊀㊀㊀㊀㊀㊀㊀㊀㊀㊀㊀㊀㊀㊀㊀㊀ｈｔｔｐ：／／ｗｗｗ．ｊｘｎｙｘｂ．ｃｏｍＤＯＩ：１０．１９３８６／ｊ．ｃｎｋｉ．ｊｘｎｙｘｂ．２０２０．０４．２１多浪羊ＮＣＯＡ１基因多态性与产羔数的相关分析牛志刚，王珊，常璐，史洪才∗㊀㊀收稿日期：２０１９－１０－１４基金项目：中国科学院 西部青年学者 项目（２０１５－ＸＢＱＮ－Ａ－０８）；新疆维吾尔自治区区域协同创新专项（上海合作组织科技伙伴计划）（２０１７Ｅ０１０１７）㊂作者简介：牛志刚（１９７９─），男，新疆昌吉人，副研究员，研究方向为家畜遗传育种学㊂∗通信作者：史洪才㊂（新疆畜牧科学院生物技术研究所／农业农村部草食家畜繁育生物技术重点开放实验室，新疆乌鲁木齐８３００２６）摘㊀要：分析研究了新疆多浪羊核受体辅激活蛋白基因（Ｎｕｃｌｅａｒｒｅｃｅｐｔｏｒｃｏａｃｔｉｖａｔｏｒ１ｇｅｎｅ，ＮＣＯＡ１）的多态性及其与产羔数的相关性㊂结果表明：ＮＣＯＡ１基因存在两个多态位点，分别为内含子１２的ｇ．１６６３９７Ａ＞Ｃ突变位点和外显子１７的ｇ．１８７５０１Ｇ＞Ａ突变位点；ｇ．１６６３９７Ａ＞Ｃ突变位点的优势基因为Ａ等位基因，基因频率为０．９６８；ｇ．１８７５０１Ｇ＞Ａ突变位点的优势基因为Ｂ等位基因，基因频率为０．６４３，且在该突变位点发生了错义突变，由原编码的丝氨酸（Ｓｅｒ）改变为谷酰胺酸（Ｇｌｎ）；在多浪羊ＮＣＯＡ１基因的ｇ．１６６３９７Ａ＞Ｃ突变位点，ＡＡ基因型个体的产羔数显著高于ＢＢ基因型个体的（Ｐ＜０．０５）；在多浪羊ＮＣＯＡ１基因的ｇ．１８７５０１Ｇ＞Ａ突变位点，ＢＢ基因型个体的产羔数显著高于ＡＡ和ＡＢ基因型个体的（Ｐ＜０．０５）㊂由此推断ＮＣＯＡ１基因可以作为多浪羊多羔性状的候选基因㊂关键词：多浪羊；繁殖率；ＮＣＯＡ１基因；相关性中图分类号：Ｓ８２６．９２㊀文献标志码：Ａ㊀文章编号：１００１－８５８１（２０２０）０４－０１１８－０５ＣｏｒｒｅｌａｔｉｏｎＡｎａｌｙｓｉｓｂｅｔｗｅｅｎＮＣＯＡ１ＧｅｎｅＰｏｌｙｍｏｒｐｈｉｓｍａｎｄＦｅｒｔｉｌｉｔｙＴｒａｉｔｏｆＤｕｏｌａｎｇＳｈｅｅｐＮＩＵＺｈｉ－ｇａｎｇ，ＷＡＮＧＳｈａｎ，ＣＨＡＮＧＬｕ，ＳＨＩＨｏｎｇ－ｃａｉ∗㊀㊀（ＢｉｏｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙＲｅｓｅａｒｃｈＩｎｓｔｉｔｕｔｅ，ＸｉｎｊｉａｎｇＡｃａｄｅｍｙｏｆＡｎｉｍａｌＳｃｉｅｎｃｅｓ／ＫｅｙＬａｂｏｒａｔｏｒｙｏｆＬｉｖｅｓｔｏｃｋＲｅｐｒｏｄｕｃｔｉｏｎ＆ＢｒｅｅｄｉｎｇＢｉｏｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙ，ＭｉｎｉｓｔｒｙｏｆＡｇｒｉｃｕｌｔｕｒｅａｎｄＲｕｒａｌＡｆｆａｉｒｓ，Ｕｒｕｍｑｉ８３００２６，Ｃｈｉｎａ）Ａｂｓｔｒａｃｔ：ＴｈｅｃｏｒｒｅｌａｔｉｏｎｂｅｔｗｅｅｎＮＣＯＡ１（Ｎｕｃｌｅａｒｒｅｃｅｐｔｏｒｃｏａｃｔｉｖａｔｏｒ１）ｇｅｎｅｐｏｌｙｍｏｒｐｈｉｓｍａｎｄｆｅｒｔｉｌｉｔｙｔｒａｉｔｏｆＤｕｏｌａｎｇｓｈｅｅｐｗａｓａｎａｌｙｚｅｄ．ＴｈｅｒｅｓｕｌｔｓｓｈｏｗｅｄｔｈａｔｔｈｅｒｅｗｅｒｅｔｗｏｐｏｌｙｍｏｒｐｈｉｃｌｏｃｉｉｎＮＣＯＡ１ｇｅｎｅ，ｇ．１６６３９７Ａ＞Ｃｍｕｔａｔｉｏｎｉｎｉｎｔｒｏｎ１２ａｎｄ１７ａｎｄｇ．１８７５０１Ｇ＞Ａｍｕｔａｔｉｏｎｉｎｅｘｏｎ１２．Ｔｈｅｄｏｍｉｎａｎｔｇｅｎｅｏｆｇ．１６６３９７Ａ＞ＣｍｕｔａｔｉｏｎｌｏｃｉｗａｓＡａｌｌｅｌｅｗｉｔｈａｇｅｎｅｆｒｅｑｕｅｎｃｙｏｆ０．９６８．Ｔｈｅｇ．１８７５０１Ｇ＞ＡｍｕｔａｔｉｏｎｌｏｃｉｗａｓＢａｌｌｅｌｅｗｉｔｈａｇｅｎｅｆｒｅｑｕｅｎｃｙｏｆ０．６４３，ａｎｄｔｈｅｍｕｔａｔｉｏｎｓｉｔｅｗａｓｍｉｓｓｅｎｓｅｍｕｔａｔｉｏｎ，ｗｈｉｃｈｗａｓｃｈａｎｇｅｄｆｒｏｍｔｈｅｏｒｉｇｉｎａｌｓｅｒｉｎｅ（Ｓｅｒ）ｔｏｇｌｕｔａｍｉｃａｃｉｄ（Ｇｌｎ）．ＴｈｅｃｏｒｒｅｌａｔｉｏｎａｎａｌｙｓｉｓｂｅｔｗｅｅｎｔｗｏＳＮＰｌｏｃｉｏｆＮＣＯＡ１ｇｅｎｅａｎｄｌｉｔｔｅｒｓｉｚｅｓｈｏｗｅｄｔｈａｔｔｈｅｌｉｔｔｅｒｓｉｚｅｏｆＡＡｇｅｎｏｔｙｐｅｏｆＮＣＯＡ１ｇｅｎｅｗａｓｓｉｇｎｉｆｉｃａｎｔｌｙｈｉｇｈｅｒｔｈａｎｔｈａｔｏｆＢＢｇｅｎｏｔｙｐｅ（Ｐ＜０．０５）．ＴｈｅｌｉｔｔｅｒｓｉｚｅｏｆＢＢｇｅｎｏｔｙｐｅｏｆ１８７５０１Ｇ＞ＡｇｅｎｏｔｙｐｅｏｆＮＣＯＡ１ｇｅｎｅｗａｓｓｉｇｎｉｆｉｃａｎｔｌｙｈｉｇｈ⁃ｅｒｔｈａｎｔｈａｔｏｆＡＡａｎｄＡＢｇｅｎｏｔｙｐｅ（Ｐ＜０．０５）．ＩｔｃｏｕｌｄｂｅｃｏｎｃｌｕｄｅｄｔｈａｔＮＣＯＡ１ｇｅｎｅｃｏｕｌｄｂｅｕｓｅｄａｓａｃａｎｄｉｄａｔｅｇｅｎｅｆｏｒｔｈｅｍｕｌｔｉ－ｌａｍｂｔｒａｉｔｏｆＤｕｏｌａｎｇｓｈｅｅｐ．Ｋｅｙｗｏｒｄｓ：Ｄｕｏｌａｎｇｓｈｅｅｐ；Ｒｅｐｒｏｄｕｃｔｉｏｎｒａｔｅ；ＮＣＯＡ１ｇｅｎｅ；Ｃｏｒｒｅｌａｔｉｏｎ㊀㊀多浪羊是新疆一个以肉用为主㊁肉脂兼用型地方绵羊品种，主要分布在新疆南部地区的叶尔羌河流域㊁塔里木盆地西南边缘地区㊂多浪羊具有体型高大㊁生长发育快㊁早熟㊁产肉和繁殖率高㊁适应性强㊁遗传性稳定㊁饲料报酬高等特点㊂多浪羊母羊四季均可发情，以４ ５月和９ １１月发情较多，发情周期１８ｄ，发情持续期２４ ４８ｈ，妊娠期１５０ｄ，平均产羔率１３０％左右㊂多浪羊是新疆南疆地区非常优良的肉羊品种，因此提高多浪羊的繁殖性能对新疆南疆畜牧业发展具有重大意义㊂陈晓军等［１］㊁钟发刚等［２］㊁史洪才等［３］对多浪羊的ＦｅｃＢ基因进行了多态性分析，发现新疆多浪羊存在两种基因型（Ｂ＋㊁＋＋），其中Ｂ＋型在多浪羊体内为优势基因型，说明多浪羊的多胎性能与ＦｅｃＢ基因密切相关㊂本课题组近年来利用ＦｅｃＢ基因分子标记辅助育种培育多浪羊多羔新品系，已取得了显著的效果，多羔育种核心群的平均产羔率达到１４９％㊂在此基础上，本课题组利用全基因组重测序技术，通过比较产单羔组与产双羔组的差异，挖掘了影响多浪羊繁殖性状的相关基因和分子标记，最终富集分析筛选了ＮＣＯＡ１㊁ＩＮＨＢＡ㊁ＡＣＰ１㊁ＩＮＧ５㊁ＡＲＮＴ㊁ＫＬＨＬ１等一些候选基因㊂核受体辅激活因子１（Ｎｕｃｌｅａｒｒｅｃｅｐｔｏｒｃｏａｃｔｉｖａｔｏｒ１，ＮＣＯＡ１），又被命名为类固醇受体辅活化因子－１（ｓｔｅｒｏｉｄｒｅｃｅｐｔｏｒｃｏａｃｔｉｖａｔｏｒ－１，ＳＲＣ－１），属于对配体有依赖性的转录因子，是ｐ１６０类固醇受体辅助活化因子家族成员中的一员［４］㊂ＲａｚｅｔｏＡ等［５］提出了ＮＣＯＡ１是生殖激素 开关 的观点，认为生殖激素长时间打开是导致哺乳动物繁殖性能增加的原因㊂ＮＣＯＡ１蛋白的作用是通过与结合到ＤＮＡ上的核受体相互作用来增强转录活性，ＮＣＯＡ１蛋白可以调节与繁殖性状有关基因的转录，从而影响这些基因的表达，进而影响哺乳动物的繁殖性能㊂ＮＣＯＡ１基因和ＮＣＯＡ３基因协同作用可以调节胎盘的形态以及胚胎的存活率［６］㊂ＮＣＯＡ１基因在不同组织（下丘脑㊁垂体㊁卵巢和子宫）中均有表达，并且对妊娠期起到重要的调节作用［７］㊂我们以新疆多浪羊为研究对象，对ＮＣＯＡ１基因的１个内显子和１个外显子序列进行克隆，分析了Ｎｃｏａ１基因不同基因型ＳＮＰ位点的多态性，以期探讨ＮＣＯＡ１基因与多浪羊产羔性状的相关性，为多浪羊多胎新品系的选育奠定理论基础㊂１㊀材料与方法１．１㊀试验材料在新疆喀什麦盖提县的多浪羊养殖场采集产单羔母羊（１１２只），以及产双羔和三羔母羊（５６只）；从颈静脉采血，所采血样量均为５ｍＬ／只，用肝素钠抗凝，于－２０ħ冻存㊂１．２㊀主要试剂ＴａｑＤＮＡ聚合酶㊁ｄＮＴＰ购于北京天根生物技术有限公司，限制性内切酶ＡｌｕⅠ㊁ＤＮＡＭａｒｋｅｒ等购自ＢＢＩ公司㊂１．３㊀ＤＮＡ的提取用北京全式金生物技术有限公司生产的ＥａｓｙＰｕｒｅＢｌｏｏｄＧｅｎｏｍｉｃＤＮＡＫｉｔ试剂盒提取ＤＮＡ㊂１．４㊀引物设计根据ＧｅｎＢａｎｋ上公布的绵羊ＮＣＯＡ１基因序列（登陆号为ＮＣ－０１９４６０．２），利用引物设计软件Ｐｉｍｅｒ６．０进行引物设计，对ＮＣＯＡ１基因的１个外显子㊁１个内含子设计２对引物，引物由上海生工生物工程技术服务有限公司合成，引物信息见表１㊂表１㊀设计的引物信息引物上游引物序列（５ᶄ－３ᶄ）下游引物序列（５ᶄ－３ᶄ）退火温度／ħ扩展片段／ｂｐ位置Ｎｃｏａ１２ＴＴＣＣＡＧＴＧＴＴＡＧＧＴＣＡＴＧＣＴＡＣＡＣＴＣＣＣＡＡＴＡＡＡＣＡＡＡＡＧＧＴ６０４６１内含子１２Ｎｃｏａ１７ＡＡＣＴＴＧＣＧＡＴＡＣＴＡＡＡＡＣＣＴＣＡＡＣＧＡＡＡＣＡＡＡＧＡＡＴＣＣＴＣＡ６０４１６外显子１７１．５㊀ＰＣＲ扩增及产物检测利用设计的引物对多浪羊的基因组ＤＮＡ进行ＰＣＲ扩增㊂ＰＣＲ反应体系为５０μＬ：２ˑＢｕｆｆｅｒ（含Ｍｇ２＋２．５Ｕ／μＬ）２５μＬ㊁上下游引物各１．０μＬ㊁５０ｎｇ／μＬ的ＤＮＡ２μＬ㊁２．５ｍｍｏｌ／ＬｄＮＴＰｓ４μＬ㊁ＴａｑＤＮＡ聚合酶１μＬ，用灭菌双蒸水补至５０μＬ㊂ＰＣＲ反应程序为：９４ħ预变性５ｍｉｎ；９４ħ变性３０ｓ，６２ ５５ħ退火３０ｓ，７２ħ延伸３０ｓ，共３５个循环；７２ħ延伸７ｍｉｎ；４ħ保存㊂用２％琼脂糖凝胶电泳检测ＰＣＲ产物㊂将上述ＰＣＲ产物进行纯化回收后，送至上海生工生物有限公司进行测序㊂１．６㊀数据分析用ＤＮＡＳｔａｒ软件对ＮＣＯＡ１基因外显子的测序结果进行序列比对和分析，计算ＮＣＯＡ１基因的ＳＮＰ位点在新疆多浪羊群体中的等位基因频率㊁杂合度（ｈｅｔｅｒｏｚｙｇｏｓｉｔｙ，Ｈｅ）㊁有效等位基因数（ｎｕｍｂｅｒｏｆｅｆｆｅｃｔｉｖｅａｌｌｅｌｅ，Ｎｅ）㊁群体遗传纯合度（ｈｏｍｏｚｙｇｏｓｉｔｙ，Ｈｏ）㊁多态信息含量（ｐｏｌｙｍｏｒｐｈｉｓｍｉｎｆｏｒｍａｔｉｏｎｃｏｎｔｅｎｔ，ＰＩＣ）和基因型频率；用ＳＰＳＳ１９．０软件中的最小二乘法分析个体不同基因型与多浪羊产羔数的关联效应㊂２㊀结果与分析２．１㊀ＮＣＯＡ１基因的ＰＣＲ扩增结果对Ｎｃｏａ１２和Ｎｃｏａ１７引物进行ＰＣＲ扩增，对ＰＣＲ产物分别用２％琼脂糖凝胶电泳进行检测，结果发现，扩增片段大小与预期一致，片段长度分别为４６１和４１６ｂｐ，特异性好，且电泳条带清晰明亮（图１和图２），可进行下一步检测㊂２．２㊀ＮＣＯＡ１基因测序结果对ＰＣＲ产物进行测序，结果在ＮＣＯＡ１基因序９１１㊀４期㊀㊀㊀㊀㊀㊀㊀㊀㊀㊀㊀㊀牛志刚等：多浪羊ＮＣＯＡ１基因多态性与产羔数的相关分析列中内含子１２发现了ｇ．１６６３９７Ａ＞Ｃ突变位点，检测到两种基因型，分别为ＡＡ和ＡＢ基因型（图３）㊂在外显子１７的ｇ．１８７５０１Ｇ＞Ａ突变位点，检测到３种基因型，分别为ＢＢ㊁ＡＢ和ＡＡ基因型㊂序列分析结果（图４）表明，在外显子１７的ｇ．１８７５０１Ｇ＞Ａ突变位点发生了错义突变，由原编码的丝氨酸（Ｓｅｒ）改变为谷酰胺酸（Ｇｌｎ）㊂图１㊀ＮＣＯＡ１基因内含子１２的ＰＣＲ扩增电泳图图２㊀ＮＣＯＡ１基因外显子１７的ＰＣＲ扩增电泳图２．３㊀基因频率和基因型频率㊀㊀对ＮＣＯＡ１基因多态位点的基因频率㊁基因型频率进行统计分析，结果（表２）显示：在多浪羊群体中，ｇ．１６６３９７Ａ＞Ｃ位点的优势基因型为ＡＡ基因型，基因型频率为０．９３６；优势基因为Ａ等位基因，基因频率为０．９６８㊂在多浪羊群体中，ｇ．１８７５０１Ｇ＞Ａ位点的优势基因型为ＢＢ基因型，基因型频率为０．５００；优势基因为Ｂ等位基因，基因频率为０．６４３㊂图３㊀ｇ．１６６３９７Ａ＞Ｃ的测序结果图４㊀ｇ．１８７５０１Ｇ＞Ａ的测序结果２．４㊀ＮＣＯＡ１基因ＳＮＰ位点基因座的遗传多态性分析采用软件进行卡方适合性检验，结果表明：新疆多浪羊ｇ．１６６３９７Ａ＞Ｃ和ｇ．１８７５０１Ｇ＞Ａ位点均处于Ｈａｒｄｙ－Ｗｅｉｎｂｅｒｇ平衡状态，说明多浪羊ＮＣＯＡ１基因突变位点的基因型频率没有受到选择㊁突变或迁移等因素的影响㊂对多浪羊群体在ＮＣＯＡ１基因的２个ＳＮＰ位点的纯合度㊁杂合度㊁有效等位基因数以及多态信息含量进行统计分析，计算结果（表３）表明，多浪羊群体中ＮＣＯＡ１基因的ｇ．１６６３９７Ａ＞Ｃ和ｇ．１８７５０１Ｇ＞Ａ位点的多态信息含量分别属于低度多态（ＰＩＣ＜０．２５）和中度多态（０．２５＜ＰＩＣ＜０．５０）㊂２．５㊀多浪羊群体ＮＣＯＡ１基因的ＳＮＰ位点与产羔数的相关性分析由表４可知：多浪羊ＮＣＯＡ１基因的ｇ．１６６３９７０２１江㊀西㊀农㊀业㊀学㊀报㊀㊀㊀㊀㊀㊀㊀㊀㊀㊀㊀㊀㊀㊀㊀㊀㊀㊀３２卷Ａ＞Ｃ突变位点的ＡＡ基因型个体产羔数显著高于ＢＢ基因型个体的（Ｐ＜０．０５）；多浪羊ＮＣＯＡ１基因的ｇ．１８７５０１Ｇ＞Ａ突变位点的ＢＢ基因型个体的产羔数显著高于ＡＡ和ＡＢ基因型个体的（Ｐ＜０．０５），ＡＡ㊁ＡＢ基因型个体之间差异不显著㊂表２㊀基因频率和基因型频率ＳＮＰ位点样本数基因型频率（样本数）ＡＡＡＢＢＢ基因频率ＡＢｇ．１６６３９７Ａ＞Ｃ７８０．９３６（７３）０．０６４（５）０（０）０．９６８０．０３２ｇ．１８７５０１Ｇ＞Ａ１１２０．２１４（２４）０．２１４（３２）０．５００（５６）０．３５７０．６４３表３㊀多浪羊群体多态位点的多态信息含量㊁纯合度㊁杂合度和等位基因数ＳＮＰ位点杂合度纯合度多态信息含量有效等位基因数Χ２Ｐｇ．１６６３９７Ａ＞Ｃ０．０６２０．９３８０．０６０１．０６６０．０８６０．９９９ｇ．１８７５０１Ｇ＞Ａ０．４５９０．５４１０．３５４１．８４９１．９９９０．７３６㊀注：ＰＩＣ＞０．５０为高度多态；０．２５＜ＰＩＣ＜０．５０为中度多态；ＰＩＣ＜０．２５为低度多态㊂３㊀讨论研究发现核受体辅激活蛋白１（ＮＣＯＡ１）基因是影响猪繁殖性状的一个候选基因并定位于猪３号染色体上㊂人的ＮＣＯＡ１基因总共有１８３．４ｋｂ，含有２２个外显子，其ｃＤＮＡ长度为４７２１ｂｐ㊂猪的ＮＣＯＡ１基因总共有９７６８１ｂｐ，含有１９个外显子，其ｃＤＮＡ长度为４４５１ｂｐ㊂绵羊的ＮＣＯＡ１基因的编码区全长为２１８４７７ｂｐ，共有９种可变剪切体，含有２１或２２个外显子㊂ＮＣＯＡ１蛋白通过与结合到ＤＮＡ上的雌激素受体和雄激素受体相互作用来增强转录活性，刺激特定的雌激素和雄激素反应基因的转录并调节随后的生理反应，作用于动物的生长发育㊁体内微生态平衡以及繁殖等生理过程［８－１０］㊂霍自双等［１１］对红眼白水貂的ＮＣＯＡ１基因多态性及其与繁殖性状的相关性进行了分析，发现在ＮＣＯＡ１基因上存在１个多态位点，为第６外显子处ｇ．１５１５３６Ｔ＞Ｃ突变，且ＡＢ基因型个体的总产仔数和产活仔数均极显著高于ＡＡ基因型个体的（Ｐ＜０．０１）㊂胡慧艳等［１２］在英系和美系大白猪ＮＣＯＡ１基因多态位点均检测到ＡＡ㊁ＡＢ两种基因型㊂武子寅等［１３］在邵伯鸡母系ＮＣＯＡ１多态性与产蛋性能的相关研究中发现，该基因在第１０外显子多态位点，ＡＡ型的产蛋数极显著高于ＢＢ型的，且显著高于ＡＢ型的㊂李涛等［１４］对大白母猪的ＮＣＯＡ１基因进行了多态性与繁殖性能的关联分析，发现经产母猪ＮＣＯＡ１基因中ＡＢ型个体的总产仔数显著高于ＡＡ型个体的㊂李永辉研究发现长白猪与大白猪均存在３种基因型，且在不同基因型之间总产仔数与产活仔数均差异极显著［１５］，说明ＮＣＯＡ１可能是影响猪产仔数的一个候选基因㊂ＮＣＯＡ１基因是否调控绵羊的繁殖性能，尚未见相关报道㊂本研究将ＮＣＯＡ１基因作为影响多浪羊产羔性状的候选基因，利用ＰＣＲ直接测序技术分析了ＮＣＯＡ１基因的多态性及其与多浪羊繁殖性状的相关性，发现在ＮＣＯＡ１内含子１２处的ｇ．１６６３９７Ａ＞Ｃ突变位点产生了ＡＡ㊁ＡＢ两种基因型，ＡＡ基因型为优势基因型，且在ＡＡ与ＡＢ基因型个体间产羔数存在显著差异；在ＮＣＯＡ１外显子１７处的ｇ．１８７５０１Ｇ＞Ａ突变位点产生了ＡＡ㊁ＡＢ㊁ＢＢ三种基因型，ＢＢ基因型为优势基因型，在该突变点发生了错义突变，使原编码的丝氨酸（Ｓｅｒ）改变为谷酰胺酸（Ｇｌｎ），且在ＡＡ与ＢＢ基因型㊁ＡＢ与ＢＢ基因型个体间产羔数均存在显著差异，说明ＮＣＯＡ１基因对多浪羊产羔性状的效应是显著的，表明ＮＣＯＡ１基因可以作为多浪羊产羔性状的主要候选基因㊂关于新疆多浪羊的繁殖性能仍需进行深入研究，比如可以将ＮＣＯＡ１基因作为分子遗传标记，对新疆多浪羊进行标记辅助选种选配，从而提高多浪羊的繁殖性能，这将对新疆南疆畜牧业的发展具有重大意义㊂表４㊀ＮＣＯＡ１基因ＳＮＰ位点与多浪羊产羔数的相关性ＳＮＰ位点基因型产羔数ｇ．１６６３９７Ａ＞ＣＡＡ１．４０ʃ０．５２ａＡＢ１．８０ʃ０．４５ｂｇ．１８７５０１Ｇ＞ＡＡＡ１．３３ʃ０．５８ａＡＢ１．２５ʃ０．５０ａＢＢ１．５７ʃ０．５３ｂ㊀注：在不同基因型之间进行比较，数据后有任一字母不同者为差异显著（Ｐ＜０．０５）㊂参考文献：［１］陈晓军，钟发刚，罗淑萍，等．多浪羊ＢＭＰＲ－ＩＢ基因多态性的初步研究［Ｊ］．新疆农业科学，２００３，４１（１）：６－９．１２１㊀４期㊀㊀㊀㊀㊀㊀㊀㊀㊀㊀㊀㊀牛志刚等：多浪羊ＮＣＯＡ１基因多态性与产羔数的相关分析［２］钟发刚，王新华，刘守仁，等．小尾寒羊和新疆多浪羊群体ＢＭＰＲ－ＩＢ基因多态性研究［Ｊ］．中国草食动物，２００５，２５（６）：１５－１６．［３］史洪才，武坚，朱二勇，等．ＢＭＰＲ－ＩＢ基因作为新疆多浪羊多胎性能候选基因的研究［Ｊ］．中国草食动物，２００６，２６（２）：１２－１４．［４］ＢｏｏｒｊｉａｎＳＡ，ＨｅｅｍｅｒｓＨＶ，ＦｒａｎｋＩ，ｅｔａｌ．Ｅｘｐｒｅｓｓｉｏｎａｎｄｓｉｇｎｉｆｉｃａｎｃｅｏｆａｎｄｒｏｇｅｎｒｅｃｅｐｔｏｒｃｏａｃｔｉｖａｔｏｒｓｉｎｕｒｏｔｈｅｌｉａｌｃａｒｃｉｎｏｍａｏｆｔｈｅｂｌａｄｄｅｒ［Ｊ］．ＥｎｄｏｃｒＲｅｌａｔＣａｎｃｅｒ，２００９，１６（１）：１２３－１３７．［５］ＲａｚｅｔｏＡ，ＲａｍａｋｒｉｓｈｎａｎＶ，ＬｉｔｔｅｒｓｔＣＭ，ｅｔａｌ．ＳｔｒｕｃｔｕｒｅｏｆｔｈｅＮＣｏＡ－１／ＳＲＣ－１ＰＡＳ－ＢｄｏｍａｉｎｂｏｕｎｄｔｏｔｈｅＬＸＸＬＬｍｏｔｉｆｏｆｔｈｅＳＴＡＴ６ｔｒａｎｓａｃｔｉｖａｔｉｏｎｄｏｍａｉｎ［Ｊ］．ＪＭｏｌＢｉｏ，２００４，３３６（２）：３１９－３２９．［６］ＣｈｅｎＸ，ＬｉｕＺ，ＸｕＪ．Ｔｈｅｃｏｏｐｅｒａｔｉｖｅｆｕｎｃｔｉｏｎｏｆｎｕｃｌｅａｒｒｅｃｅｐｔｏｒｃｏａｃｔｉｖａｔｏｒ１（ＮＣＯＡ１）ａｎｄＮＣＯＡ３ｉｎｐｌａｃｅｎｔａｌｄｅｖｅｌｏｐｍｅｎｔａｎｄｅｍｂｒｙｏｓｕｒｖｉｖａｌ［Ｊ］．ＭｏｌＥｎｄｏｃｒｉｎｏｌ，２０１０，２４（１０）：１９１７－１９３４．［７］霍自双．红眼白水貂主要生产性状相关基因的表达及相关性分析［Ｄ］．哈尔滨：东北农业大学，２０１８．［８］ＨａｎｓｔｅｉｎＢ，ＥｃｋｎｅｒＲ，ＤｉＲｅｎｚｏＨＪ．Ｐ３００ｉｓａｃｏｍｐｏｎｅｎｔｏｆａｎｅｓｔｒｏｇｅｎｒｅｃｅｐｔｏｒｃｏａｃｔｉｖａｔｏｒｃｏｍｐｌｅｘ［Ｊ］．ＰｒｏｃＮａｔｉＡｃａｄＳｃｉＵＳＡ，１９９６，９３（２１）：１１５４０－１１５４５．［９］ＫａｍｅｉＹ，ＸｕＬ，ＨｅｉｎｚｅｌＴ，ｅｔａｌ．ＡＣＢＰｉｎｔｅｇｒａｔｏｒｃｏｍ⁃ｐｌｅｘｍｅｄｉａｔｅｓｔｒａｎｓｃｒｉｐｔｉｏｎａｌａｃｔｉｖａｔｉｏｎａｎｄＡＰ－１ｉｎｈｉｂｉｔｉｏｎｂｙｎｕｃｌｅａｒｒｅｃｅｐｔｏｒｓ［Ｊ］．Ｃｅｌｌ，１９９６，８５（３）：４０３－４１４．［１０］ＧｌａｓｓＣＫ．Ｄｉｆｆｅｒｅｎｔｉａｌｒｅｃｏｇｎｉｔｉｏｎｏｆｔａｒｇｅｔｇｅｎｅｓｂｙｎｕ⁃ｃｌｅａｒｒｅｃｅｐｔｏｒｍｏｎｏｍｅｒｓ，ｄｉｍｅｒｓａｎｄｈｅｔｅｒｏｄｉｍｅｒｓ［Ｊ］．ＥｎｄｏｃｒｉｎｏｌＲｅｖ，１９９４，１５：１５０３－１５１９．［１１］霍自双，刘宗岳，岳志刚，等．红眼白水貂ＦＳＨβ和ＮＣＯＡ１基因多态性及其与繁殖性状的相关分析［Ｊ］．中国畜牧兽医，２０１８，４５（２）：４２９－４３８．［１２］胡慧艳，贾青，赵思思，等．大白猪产仔数相关基因多态性及其遗传效应［Ｊ］．中国兽医学报，２０１７，３７（１１）：２２２７－２２３４．［１３］武子寅．邵伯鸡母系（Ｓ２）ＥＳＲ和ＮＣＯＡ１基因多态性与产蛋性能关联分析及其表达规律研究［Ｄ］．扬州：扬州大学，２０１３．［１４］李涛，黄涛，胡九英，等．大白猪ＮＣＯＡ１和ＦＵＴ１基因多态性与繁殖性能的关联分析［Ｊ］．中国畜牧杂志，２０１７，５３（６）：５８－６３．［１５］李永辉．ＮＣＯＡ１基因与猪产仔性状的相关及序列分析［Ｄ］．长沙：湖南农业大学，２００５．（责任编辑：黄荣华）２２１江㊀西㊀农㊀业㊀学㊀报㊀㊀㊀㊀㊀㊀㊀㊀㊀㊀㊀㊀㊀㊀㊀㊀㊀㊀３２卷。

96猪业科学 SWINE INDUSTRY SCIENCE 2019年36卷第3期大白猪FUT1和PRLR 基因多态性与产仔性状的关联分析谢 苏，孙晓梅，孙义姗，黄 涛*(石河子大学动物科技学院,新疆 石河子 832000）摘 要：为探讨FUT1和PRLR 基因多态性与母猪繁殖性状的相关性，该试验采取PCR-RFLP 和PCR 检测方法对909头大白猪群体进行FUT1和PRLR 基因的多态性检测，并对不同基因型的总产仔数、产活仔数、健仔数、窝重等与繁殖相关的性状进行了关联性分析。

分析结果显示，在该试验群体中B 基因是FUT1的优势等位基因，A 基因是PRLR 的优势等位基因。

对于FUT1基因，AA 型个体死胎比BB 型少0.31头/胎（P ＜0.05），AA 型个体总活仔数比AB 型个体高1.30头/胎（P ＜0.05），其他繁殖性状上各基因型间均无显著差异。

对于PRLR 基因，AA 型个体窝重比BB 型个体显著高出0.84头/胎（P ＜0.05），各基因型间其他繁殖性状上均无显著差异。

合并基因型分析发现：在大白猪中PRLR-FUT1最优分子标记组合为BBAA,其次是ABAA 型组合较佳。

关键词：大白母猪；FUT1；PRLR ；繁殖性状；基因多态性对于生猪养殖行业来说，母猪产仔数是一个非常重要的繁殖性状，也是一个非常重要的经济性状，可以说产仔数直接影响到猪场经济效益的高低[1]。

因此，提高母猪的产活仔数一直是动物科学研究和养猪生产的主要工作之一。

而随着分子生物学技术的飞速发展，分子繁育理论已经成为了现代育种的主流方法。

FUT1基因定位于6号染色体 [2]，然而在这个染色体区域附近已经发现与猪产仔性状相关[3]。

一直以来，FUT1基因作为F18大肠杆菌的一个抗性候选基因，与仔猪水肿病、腹泻等疾病相关，对繁殖性能造成很大的影响，故将其视为猪产仔数的一个候选基因[4]。

PRLR(催乳素受体基因)也是母猪繁殖性状上的一个候选基因，在动物生长发育过程中发挥着重要作用[5]。

猪NCOA1基因PCR-RFLP多态性分析侯永刚;闫守庆;何晓波;柏蒙蒙;孙泰雷;吴明明;孙金海【期刊名称】《安徽农业科学》【年(卷),期】2010(038)012【摘要】[目的]研究猪NCOA1基因的PCR-RFLP多态性,为猪的分子育种和标记辅助选择提供理论依据.[方法]以81头山东寿光六和原种猪场的长白猪为研究对象,采取常规酚-氯仿抽提法从猪耳组织提取基因组DNA,以基因组DNA为模板进行PCR扩增获得440 bp的NCOA1基因目的片段,利用限制性内切酶Rsa Ⅰ对PCR 产物进行酶切和琼脂凝胶电泳检测,并计算各等位基因频率和基因型频率.[结果]琼脂糖电泳检测酶切产物出现3种基因型:AA型(1条带:440 bp)、AB型(3条带:440、282、158 bp)、BB型(2条带:282、158 bp);基因型频率分别为0.54、0.43和0.03;A和B 2个等位基因的基因频率分别为0.76和0.24.[结论]该研究猪群中,A为优势等位基因,AA基因型频率较高.【总页数】2页(P6235-6236)【作者】侯永刚;闫守庆;何晓波;柏蒙蒙;孙泰雷;吴明明;孙金海【作者单位】青岛农业大学动物科技学院,山东青岛,266109;吉林大学畜牧兽医学院,吉林长春,130062;青岛农业大学动物科技学院,山东青岛,266109;青岛农业大学动物科技学院,山东青岛,266109;青岛农业大学动物科技学院,山东青岛,266109;青岛农业大学动物科技学院,山东青岛,266109;青岛农业大学动物科技学院,山东青岛,266109;吉林大学畜牧兽医学院,吉林长春,130062【正文语种】中文【中图分类】S828【相关文献】1.猪GPX5基因、FUT1基因和NCOA1基因的多态性分析 [J], 赵金凤;张冬杰;谷溪;谢雨彤;刘娣2.撒坝猪及长撒二元杂交猪SLA-DQA基因PCR-RFLP多态性分析 [J], 钱锦花;连林生3.猪NCOA1基因PCR-RFLP多态性分析（摘要）（英文） [J], 侯永刚;闫守庆;何晓波;柏蒙蒙;孙泰雷;吴明明;孙金海4.猪NCOA1基因PCR-RFLP多态性分析 [J], 侯永刚; 闫守庆; 何晓波; 柏蒙蒙; 孙泰雷; 吴明明; 孙金海5.大约克猪和二花脸猪SLA-DRB基因外显子2的PCR-RFLP多态性分析 [J], 杨彤彤;张婷婷;赵族;徐银学因版权原因，仅展示原文概要，查看原文内容请购买。

中外六个猪种FUT1基因多态性研究
张引红
【期刊名称】《中国比较医学杂志》
【年(卷),期】2007(17)8
【摘要】目的对6个中外猪种共245头猪的FUT1基因进行了研究.方法采用PCR-RFLP技术.结果与结论 Hin6I位点上,大白猪、长白猪、杜洛克猪3个外来猪种均存在多态,且以敏感型(GG型和AG型)居多;山西黑猪、太原花猪、马身猪3个本地猪种的所有检测样品都表现为GG型.
【总页数】3页(P487-489)
【作者】张引红
【作者单位】山西医科大学实验动物中心,山西,太原,030001
【正文语种】中文
【中图分类】R-33
【相关文献】
1.3个外种猪群FUT1基因多态性研究 [J], 罗家琴;陈红颂;黄祥春;王家圣;杨军
2.FUT1基因多态性及其与产仔性状的关联性研究 [J], 张引红;周忠孝;曹果清
3.中外猪种ESR基因多态性与繁殖性状相关研究 [J], 胡建伟;杨晓琼;余永华
4.部分引进猪种α1-岩藻糖转移酶基因多态性研究 [J], 吴圣龙;鞠慧萍;孙鹏翔;包文斌;朱国强;李碧春;谢恺舟;陈国宏
5.猪a1-岩藻糖转移酶基因(FUT1)在26个中外猪种中的遗传变异研究(英文) [J], 晏学明;任军;郭源梅;丁能水;陈克飞;高军;艾华水;陈从英;麻骏武;黄路生
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苏太猪FUT1基因多态性及其与生产性能的关联分析孙鹏翔;吴圣龙;包文斌;李碧春;陈国宏【期刊名称】《中国畜牧杂志》【年(卷),期】2007(43)5【摘要】采用PCR-RFLP方法对苏太猪FUT1基因多态性进行分析.结果表明:苏太猪FUT1基因开放阅读框307位点经Hin6 I酶切后,产生GG型和AG型,不存在抗性纯合子AA型.分析这两种基因型与苏太猪生产性能间的相关性,结果表明:AG型个体平均生产性能均高于GG型个体,且AG型个体的1胎断奶窝重、2胎断奶窝重、3胎总产仔数和6胎断奶窝重显著(p＜0.05)高于GG型个体,对一些生产性状而言,AG型是有益基因型.【总页数】3页(P4-6)【作者】孙鹏翔;吴圣龙;包文斌;李碧春;陈国宏【作者单位】扬州大学动物科学与技术学院,江苏扬州,225009;扬州大学动物科学与技术学院,江苏扬州,225009;扬州大学动物科学与技术学院,江苏扬州,225009;安徽农业大学动物科技学院,安徽合肥,230036;扬州大学动物科学与技术学院,江苏扬州,225009;扬州大学动物科学与技术学院,江苏扬州,225009【正文语种】中文【中图分类】S8【相关文献】1.苏太猪与野猪×苏太杂交猪的生产性能测定 [J], 潘祖荫2.苏太猪抗F18+大肠杆菌病基础群FUT1基因多态性及其与生长发育的关联分析[J], 叶兰;潘章源;黄雪根;华金第;吴圣龙;包文斌3.苏太猪ESR基因多态性及其与繁殖性能的关联分析 [J], 黄雪根;叶兰;刘楷;华金第;包文斌;吴圣龙4.苏太猪SLA-DQA基因多态性及其与生产性能的关联分析 [J], 吴圣龙;鞠慧萍;包文斌;李碧春;陈国宏;杨建生;黄雪根;华金弟5.大白猪FUT1和PRLR基因多态性与产仔性状的关联分析 [J], 谢苏;孙晓梅;孙义姗;黄涛因版权原因，仅展示原文概要，查看原文内容请购买。