常见微生物的界门纲、目、科、属、种中英文对照

常见微生物界（Domain）、门(Phylum)、纲（Class）、目(Order)、科(Family)、属(Genus)、种(Species)中英文对照界（Domain）Bacteria细菌Archaea古生菌门（Phylum）Proteobacteria 变形菌门Bacteroidetes 拟杆菌门Actinobacteria 放线菌门Gemmatimonadetes 芽单胞菌门Acidobacteria 酸杆菌门Planctomycetes 浮霉菌门Verrucomicrobia 疣微菌门Chloroflexi 绿弯菌门Nitrospirae 硝化螺旋菌门Firmicutes 厚壁菌门Chlorobi 绿菌门Cyanobacteria 蓝藻细菌门Fibrobacteres 纤维杆菌门Elusimicrobia 迷踪菌门Armatimonadetes 装甲菌门Euryarchaeota 广古菌门Chlamydiae 衣原体Crenarchaeota 泉古菌门Tenericutes 无壁菌门Spirochaetes 螺旋体属Alphaproteobacteria 甲型（α）变形杆菌纲Gammaproteobacteria 丙型变形菌纲Betaproteobacteria β-变形菌纲Actinobacteria 放线菌门、纲Cytophagia 纤维粘网菌Gemmatimonadetes 芽单胞菌门、纲Deltaproteobacteria δ-变形菌纲Acidobacteria-6 酸杆菌门Acidimicrobiia 酸微菌纲Verrucomicrobiae 疣微菌纲Opitutae 丰佑菌纲Nitrospira 消化螺菌属Thermomicrobia 热微菌门Bacteroidia 拟杆菌纲Bacilli 杆菌Chloroflexi 绿弯菌门Anaerolineae 厌氧绳菌纲Clostridia 梭状芽胞杆菌Elusimicrobia 迷踪菌门Ktedonobacteria 纤线杆菌纲Thermoplasmata 热原体纲Chlamydiia 衣原体Thaumarchaeota 奇古菌门Mollicutes 柔膜菌纲Methanomicrobia 甲烷微菌纲Holophagae 全噬菌纲Spirochaetes 螺旋体属Xanthomonadales 黄单孢菌目Sphingomonadales 鞘脂单胞菌目Burkholderiales 伯克霍尔德氏菌目Actinomycetales 放线菌目Cytophagales 噬纤维菌目Myxococcales 粘球菌目Acidimicrobiales 酸微菌目Rhizobiales 根瘤菌目Sphingobacteriales 鞘脂杆菌目Flavobacteriales 黄杆菌目Caulobacterales 柄杆菌目Rhodospirillales 红螺菌目Alteromonadales 交替单胞菌目Enterobacteriales 肠杆菌目Verrucomicrobiales 疣微菌目Opitutales 丰佑菌目Gemmatimonadales 芽单胞菌目Nitrospirales 硝化螺旋菌目Pseudomonadales 假单胞菌目Planctomycetales 浮霉菌目Bacteroidales 拟杆菌目Syntrophobacterales 互营杆菌目Bacillales 芽孢杆菌目Thiotrichales 硫发菌目Rhodobacterales 红细菌目，红杆菌目Methylophilales 噬甲基菌目Nitrosomonadales 亚硝化单胞菌目Streptophyta 木霉菌目Clostridiales 梭菌目Legionellales 军团菌目Bdellovibrionales 蛭弧菌目Rubrobacterales 红色杆菌目Caldilineales 暖绳菌目Herpetosiphonales 爬管菌目Chloroflexales 绿弯菌目Rickettsiales 立克次氏体目Acidobacteriales 酸杆菌目Micrococcales 微球菌目Rhodocyclales 红环菌目Stramenopiles 不等鞭毛类Chlamydiales 衣原体目Ktedonobacterales 纤线杆菌目Neisseriales 奈瑟菌目Oceanospirillales 海洋螺菌目Anaeroplasmatales 厌氧原体目Natranaerobiales 盐碱厌氧菌目Halanaerobiales 盐碱厌氧菌目Procabacteriales 普罗卡杆菌目Sphaerobacterales 球杆菌目Methylococcales 甲基球菌目Chlorophyta 绿藻门Holophagales 全噬菌目Methanosarcinales 八叠球菌目，球菌目Bifidobacteriales 双歧杆菌目Methanomicrobiales 甲烷微菌目Aeromonadales 气单胞菌目Spirochaetales 螺旋体目Desulfuromonadales 除硫单胞菌目科（family）Sphingomonadaceae 鞘脂单胞菌科Xanthomonadaceae 黄单胞菌科Cytophagaceae 噬纤维菌科Oxalobacteraceae 草酸杆菌科Nocardioidaceae 类诺卡氏菌科Comamonadaceae 丛毛单胞菌科Caulobacteraceae 柄杆菌科Sphingobacteriaceae 鞘脂杆菌科Flavobacteriaceae 黄杆菌科Sinobacteraceae 华杆菌科Rhodospirillaceae 红螺旋菌科Hyphomicrobiaceae 生丝微菌科Polyangiaceae 多囊粘菌科Erythrobacteraceae 赤杆菌科Enterobacteriaceae 肠杆菌科Verrucomicrobiaceae 疣微菌科Geodermatophilaceae 地嗜皮菌科Opitutaceae 丰佑菌科Streptomycetaceae 链霉菌科Alteromonadaceae 交替单胞菌科Micrococcaceae 微球菌科Actinosynnemataceae 束丝防线菌科Micromonosporaceae 微单胞菌科Pseudomonadaceae 假单胞菌科Planctomycetaceae 浮霉菌科Nannocystaceae 侏囊菌科Syntrophobacteraceae 互营杆菌科Sporichthyaceae 鱼孢菌科Streptosporangiaceae 链孢囊菌科Bradyrhizobiaceae 慢生根瘤菌科Piscirickettsiaceae 鱼立克次体科Rhizobiaceae 根瘤菌科Microbacteriaceae 微杆菌科Pseudonocardiaceae 假诺卡氏科Bacillaceae 芽孢杆菌科Intrasporangiaceae 间孢囊菌科Nitrospiraceae 硝化螺旋菌科Methylophilaceae 噬甲基菌科Phyllobacteriaceae 叶杆菌科，叶瘤菌科Alcaligenaceae 产碱菌科，产碱杆菌科Nitrosomonadaceae 亚硝化单胞菌科Rhodobacteraceae 红杆菌科Thermomonosporaceae 高温单胞菌科Glycomycetaceae 糖霉菌科Acetobacteraceae 醋杆菌科Mycobacteriaceae 分支杆菌科Hyphomonadaceae 生丝单胞菌科Rubrobacteraceae 红色杆菌科Cystobacteraceae 孢囊杆菌科Caldilineaceae 暖绳菌科Rhodobiaceae 红菌科，红游动菌科Burkholderiaceae 伯克氏菌科Coxiellaceae 柯克斯体科Bdellovibrionaceae 蛭弧菌科Acidobacteriaceae 酸杆菌科Clostridiaceae 梭菌科Paenibacillaceae 类芽孢杆菌科Bacteriovoracaceae 噬菌弧菌科Myxococcaceae 粘液球菌科Cellulomonadaceae 纤维素单胞菌科Beijerinckiaceae 拜叶林克氏菌科Frankiaceae 弗兰克氏菌科Rhodocyclaceae 红环菌科Planococcaceae 动球菌科Methylocystaceae 甲基孢囊菌科Nocardiaceae 诺卡式菌科Chloroflexaceae 绿屈挠菌科Thermoactinomycetaceae 高温放线菌科Staphylococcaceae 葡萄球菌科Alicyclobacillaceae 环脂酸芽孢杆菌科Nocardiopsaceae 拟诺卡式菌科Legionellaceae 军团菌科Ktedonobacteraceae 纤线杆菌科Gemmatimonadaceae 芽单胞菌科Moraxellaceae 莫拉氏菌科Corynebacteriaceae 棒状杆菌科Parachlamydiaceae 副衣原体科Cystobacterineae 孢囊杆菌亚目Aurantimonadaceae 橙单胞菌科Bogoriellaceae 博格利亚湖菌科Methylobacteriaceae 甲基杆菌科Rickettsiaceae 立克次氏体Brucellaceae 布鲁氏菌科Lachnospiraceae 毛螺菌科Neisseriaceae 奈瑟氏菌科Halomonadaceae 盐单胞菌科Anaeroplasmataceae 厌氧原体科Peptococcaceae 消化球菌科，冻球菌科Halanaerobiaceae 盐厌氧菌科Peptostreptococcaceae 消化链球菌科Dermabacteraceae 皮杆菌科Procabacteriaceae 普洛卡杆菌科Kineosporiaceae 动孢囊菌科Methylococcaceae 甲基球菌科Syntrophomonadaceae 单胞菌科，互营单胞菌科Oscillochloridaceae 颤绿菌科Chlamydomonadaceae 【植物】衣藻科Holosporaceae 全胞菌科Gordoniaceae 戈登氏菌科Shewanellaceae 希万氏菌科Aeromonadaceae 气单胞菌科Geobacteraceae 地杆菌科Brevibacteriaceae 短杆菌科Porphyromonadaceae 紫单胞菌科Xanthobacteraceae 黄色杆菌科Spirochaetaceae 螺旋体科Propionibacteriaceae 丙酸杆菌科属（Genus）Janthinobacterium 紫色杆菌属Flavobacterium 黄杆菌属Thermomonas 热单胞菌属Mycoplana 枝动杆菌属Sorangium 堆囊菌属Opitutus 丰佑菌属Sphingomonas 鞘脂单胞菌属Streptomyces 链霉菌属Lysobacter 溶杆菌属Cellvibrio 纤维弧菌属Pedobacter 地杆菌属Aeromicrobium 气微菌属Rhodoplanes 红游动菌属Pseudomonas 假单胞菌属Planctomyces 浮霉状菌属Phenylobacterium 苯基杆菌属Pseudoxanthomonas 假黄色单胞菌属Sphingobium 鞘脂菌属Nannocystis 侏囊菌属Variovorax 贪噬菌属Luteimonas 单胞菌属Gemmata 出芽菌属Saccharothrix 糖丝菌属Prosthecobacter 突柄杆菌属Pirellula 小梨型菌属Acidovorax 食酸菌属Lentzea 伦茨氏菌属Streptosporangium 链孢子囊菌属Caulobacter 茎菌属Nocardioides 类诺卡氏菌属Stenotrophomonas 寡养单胞菌Nitrosovibrio 弧菌属Actinoplanes 游动放线菌属Rubrivivax 红肠命菌属Glycomyces 糖霉菌属Agrobacterium 土壤杆菌属Mesorhizobium 中慢生根瘤菌属Agromyces 壤霉菌属Mycobacterium 分枝杆菌属Chondromyces 粒杆粘细菌属Novosphingobium 新鞘氨醇菌属Actinomadura 马杜拉放线菌属Nonomuraea 野野村菌属Catellatospora 链孢菌属Geodermatophilus 地嗜皮菌属Nitrospira 硝化螺菌属Pseudonocardia 假诺卡氏菌属Sporocytophaga 生孢噬胞菌属Bdellovibrio 蛭弧菌属Asticcacaulis 不粘杆菌属Sinorhizobium 中华根瘤菌Hydrogenophaga 噬氢菌属Rubrobacter 红色杆菌属Dactylosporangium 指孢囊菌属Sphingobacterium 鞘氨醇杆菌属Brevundimonas 短波单胞菌属Burkholderia 伯克霍尔德菌Achromobacter 无色杆菌属Hyphomicrobium 生丝微菌属Pedomicrobium 土微菌属Paenibacillus 类芽孢杆菌Phyllobacterium 叶杆菌属Cellulomonas 纤维菌属Pilimelia 水生角质菌属Arthrobacter 节细菌属Saccharopolyspora 糖多孢菌属Myxococcus 粘球菌Amycolatopsis 拟无枝酸菌Phaeospirillum 褐螺菌属Promicromonospora 原小单孢菌属Cellulosimicrobium 纤维菌属Sporichthya 游鱼孢菌属Chloronema 绿线菌属Nocardia 诺卡氏菌属Pimelobacter 脂肪杆菌属Paracoccus 副球菌属Bosea 氏菌属Staphylococcus 葡萄球菌属Planomicrobium 动性微菌属Rhodoferax 红育菌属Rhodobacter 红杆菌属Hymenobacter 薄层菌属Saccharomonospora 糖单胞菌属Cytophaga 噬细胞菌属Ralstonia 罗尔斯通菌属Rathayibacter 拉氏杆菌属Gemmatimonas 芽单胞菌属Alicyclobacillus 杆菌属Clostridium 梭菌属Corynebacterium 棒状杆菌属Cupriavidus 贪铜菌属Caldilinea 暖绳菌属Azorhizophilus 嗜氮根瘤菌属Rhodococcus 红球菌属Legionella 军团杆菌Brevibacillus 短芽孢杆菌属Polaromonas 单胞菌属Acinetobacter 不动杆菌属Georgenia 乔治菌属Actinocorallia 珊瑚状防线菌属Cryptosporangium 隐孢菌属Comamonas 丛毛单胞菌属CandidatusProtochlamydia Asteroleplasma 无甾醇原体属Sporosarcina 芽孢八叠球菌属Azospirillum 固氮螺菌属Magnetospirillum 磁螺菌属Roseomonas 玫瑰单胞菌属Prauserella 氏菌属Coprococcus 粪球菌属Prauseria 布劳氏菌属Thermoactinomyces 高温防线菌属Methylobacterium 甲基杆菌属Brachybacterium 短状杆菌属Azoarcus 固氮弧菌属Beijerinckia 拜叶林克氏菌属Virgibacillus 枝芽孢菌属Syntrophomonas 互营单胞菌属Geobacillus 土芽孢杆菌属Parachlamydia 副衣原体属Anaeromyxobacter 厌氧粘细菌属Oscillochloris 颤绿菌属Procabacter 普罗卡杆菌属Methanosarcina 甲烷八叠球菌属Microbacterium 微杆菌属Methylophaga 噬甲基菌属Methanoculleus 甲烷囊菌属Methylocaldum 甲基暖菌属Rickettsia 立克次氏体Alkaliphilus 嗜碱菌属Cryobacterium 冷杆菌属Shewanella 希瓦氏菌属Gordonia 戈登氏菌属Psychrobacter 嗜冷杆菌属Serratia 沙雷氏菌属Spirochaeta 螺旋体属Leptolyngbya 鞘丝藻属Caloramator 喜热菌属Dietzia 迪茨氏属Hyphomonas 生丝单胞菌属Yersinia 耶尔森氏鼠疫杆菌属Microlunatus 小月菌属Anaerolinea 厌氧绳菌属Brevibacterium 短杆菌属。

常见微生物界（Domain）、门(Phylum)、纲（Class）、目(Order)、科(Family)、属(Genus)、种(Species)中英文对照界（Domain）Bacteria细菌Archaea古生菌Proteobacteria 变形菌门Bacteroidetes 拟杆菌门Actinobacteria 放线菌门Gemmatimonadetes 芽单胞菌门Acidobacteria 酸杆菌门Planctomycetes 浮霉菌门Verrucomicrobia 疣微菌门Chloroflexi 绿弯菌门Nitrospirae 硝化螺旋菌门Firmicutes 厚壁菌门Chlorobi 绿菌门Cyanobacteria 蓝藻细菌门Fibrobacteres 纤维杆菌门Elusimicrobia 迷踪菌门Armatimonadetes 装甲菌门Euryarchaeota 广古菌门Chlamydiae 衣原体Crenarchaeota 泉古菌门Tenericutes 无壁菌门Spirochaetes 螺旋体属Alphaproteobacteria 甲型（α）变形杆菌纲Gammaproteobacteria 丙型变形菌纲Betaproteobacteria β-变形菌纲Actinobacteria 放线菌门、纲Cytophagia 纤维粘网菌Gemmatimonadetes 芽单胞菌门、纲Deltaproteobacteria δ-变形菌纲Acidobacteria-6 酸杆菌门Acidimicrobiia 酸微菌纲Verrucomicrobiae 疣微菌纲Opitutae 丰佑菌纲Nitrospira 消化螺菌属Thermomicrobia 热微菌门Bacteroidia 拟杆菌纲Bacilli 杆菌Chloroflexi 绿弯菌门Anaerolineae 厌氧绳菌纲Clostridia 梭状芽胞杆菌Elusimicrobia 迷踪菌门Ktedonobacteria 纤线杆菌纲Thermoplasmata 热原体纲Chlamydiia 衣原体Thaumarchaeota 奇古菌门Mollicutes 柔膜菌纲Methanomicrobia 甲烷微菌纲Holophagae 全噬菌纲Spirochaetes 螺旋体属Xanthomonadales 黄单孢菌目Sphingomonadales 鞘脂单胞菌目Burkholderiales 伯克霍尔德氏菌目Actinomycetales 放线菌目Cytophagales 噬纤维菌目Myxococcales 粘球菌目Acidimicrobiales 酸微菌目Rhizobiales 根瘤菌目Sphingobacteriales 鞘脂杆菌目Flavobacteriales 黄杆菌目Caulobacterales 柄杆菌目Rhodospirillales 红螺菌目Alteromonadales 交替单胞菌目Enterobacteriales 肠杆菌目Verrucomicrobiales 疣微菌目Opitutales 丰佑菌目Gemmatimonadales 芽单胞菌目Nitrospirales 硝化螺旋菌目Pseudomonadales 假单胞菌目Planctomycetales 浮霉菌目Bacteroidales 拟杆菌目Syntrophobacterales 互营杆菌目Bacillales 芽孢杆菌目Thiotrichales 硫发菌目Rhodobacterales 红细菌目，红杆菌目Methylophilales 噬甲基菌目Nitrosomonadales 亚硝化单胞菌目Streptophyta 木霉菌目Clostridiales 梭菌目Legionellales 军团菌目Bdellovibrionales 蛭弧菌目Rubrobacterales 红色杆菌目Caldilineales 暖绳菌目Herpetosiphonales 爬管菌目Chloroflexales 绿弯菌目Rickettsiales 立克次氏体目Acidobacteriales 酸杆菌目Micrococcales 微球菌目Rhodocyclales 红环菌目Stramenopiles 不等鞭毛类Chlamydiales 衣原体目Ktedonobacterales 纤线杆菌目Neisseriales 奈瑟菌目Oceanospirillales 海洋螺菌目Anaeroplasmatales 厌氧原体目Natranaerobiales 盐碱厌氧菌目Halanaerobiales 盐碱厌氧菌目Procabacteriales 普罗卡杆菌目Sphaerobacterales 球杆菌目Methylococcales 甲基球菌目Chlorophyta 绿藻门Holophagales 全噬菌目Methanosarcinales 八叠球菌目，球菌目Bifidobacteriales 双歧杆菌目Methanomicrobiales 甲烷微菌目Aeromonadales 气单胞菌目Spirochaetales 螺旋体目Desulfuromonadales 除硫单胞菌目科（family）Sphingomonadaceae 鞘脂单胞菌科Xanthomonadaceae 黄单胞菌科Cytophagaceae 噬纤维菌科Oxalobacteraceae 草酸杆菌科Nocardioidaceae 类诺卡氏菌科Comamonadaceae 丛毛单胞菌科Caulobacteraceae 柄杆菌科Sphingobacteriaceae 鞘脂杆菌科Flavobacteriaceae 黄杆菌科Sinobacteraceae 华杆菌科Rhodospirillaceae 红螺旋菌科Hyphomicrobiaceae 生丝微菌科Polyangiaceae 多囊粘菌科Erythrobacteraceae 赤杆菌科Enterobacteriaceae 肠杆菌科Verrucomicrobiaceae 疣微菌科Geodermatophilaceae 地嗜皮菌科Opitutaceae 丰佑菌科Streptomycetaceae 链霉菌科Alteromonadaceae 交替单胞菌科Micrococcaceae 微球菌科Actinosynnemataceae 束丝防线菌科Micromonosporaceae 微单胞菌科Pseudomonadaceae 假单胞菌科Planctomycetaceae 浮霉菌科Nannocystaceae 侏囊菌科Syntrophobacteraceae 互营杆菌科Sporichthyaceae 鱼孢菌科Streptosporangiaceae 链孢囊菌科Bradyrhizobiaceae 慢生根瘤菌科Piscirickettsiaceae 鱼立克次体科Rhizobiaceae 根瘤菌科Microbacteriaceae 微杆菌科Pseudonocardiaceae 假诺卡氏科Bacillaceae 芽孢杆菌科Intrasporangiaceae 间孢囊菌科Nitrospiraceae 硝化螺旋菌科Methylophilaceae 噬甲基菌科Phyllobacteriaceae 叶杆菌科，叶瘤菌科Alcaligenaceae 产碱菌科，产碱杆菌科Nitrosomonadaceae 亚硝化单胞菌科Rhodobacteraceae 红杆菌科Thermomonosporaceae 高温单胞菌科Glycomycetaceae 糖霉菌科Acetobacteraceae 醋杆菌科Mycobacteriaceae 分支杆菌科Hyphomonadaceae 生丝单胞菌科Rubrobacteraceae 红色杆菌科Cystobacteraceae 孢囊杆菌科Caldilineaceae 暖绳菌科Rhodobiaceae 红菌科，红游动菌科Burkholderiaceae 伯克氏菌科Coxiellaceae 柯克斯体科Bdellovibrionaceae 蛭弧菌科Acidobacteriaceae 酸杆菌科Clostridiaceae 梭菌科Paenibacillaceae 类芽孢杆菌科Bacteriovoracaceae 噬菌弧菌科Myxococcaceae 粘液球菌科Cellulomonadaceae 纤维素单胞菌科Beijerinckiaceae 拜叶林克氏菌科Frankiaceae 弗兰克氏菌科Rhodocyclaceae 红环菌科Planococcaceae 动球菌科Methylocystaceae 甲基孢囊菌科Nocardiaceae 诺卡式菌科Chloroflexaceae 绿屈挠菌科Thermoactinomycetaceae 高温放线菌科Staphylococcaceae 葡萄球菌科Alicyclobacillaceae 环脂酸芽孢杆菌科Nocardiopsaceae 拟诺卡式菌科Legionellaceae 军团菌科Ktedonobacteraceae 纤线杆菌科Gemmatimonadaceae 芽单胞菌科Moraxellaceae 莫拉氏菌科Corynebacteriaceae 棒状杆菌科Parachlamydiaceae 副衣原体科Cystobacterineae 孢囊杆菌亚目Aurantimonadaceae 橙单胞菌科Bogoriellaceae 博格利亚湖菌科Methylobacteriaceae 甲基杆菌科Rickettsiaceae 立克次氏体Brucellaceae 布鲁氏菌科Lachnospiraceae 毛螺菌科Neisseriaceae 奈瑟氏菌科Halomonadaceae 盐单胞菌科Anaeroplasmataceae 厌氧原体科Peptococcaceae 消化球菌科，冻球菌科Halanaerobiaceae 盐厌氧菌科Peptostreptococcaceae 消化链球菌科Dermabacteraceae 皮杆菌科Procabacteriaceae 普洛卡杆菌科Kineosporiaceae 动孢囊菌科Methylococcaceae 甲基球菌科Syntrophomonadaceae 单胞菌科，互营单胞菌科Oscillochloridaceae 颤绿菌科Chlamydomonadaceae 【植物】衣藻科Holosporaceae 全胞菌科Gordoniaceae 戈登氏菌科Shewanellaceae 希万氏菌科Aeromonadaceae 气单胞菌科Geobacteraceae 地杆菌科Brevibacteriaceae 短杆菌科Porphyromonadaceae 紫单胞菌科Xanthobacteraceae 黄色杆菌科Spirochaetaceae 螺旋体科Propionibacteriaceae 丙酸杆菌科属（Genus）Janthinobacterium 紫色杆菌属Flavobacterium 黄杆菌属Thermomonas 热单胞菌属Mycoplana 枝动杆菌属Sorangium 堆囊菌属Opitutus 丰佑菌属Sphingomonas 鞘脂单胞菌属Streptomyces 链霉菌属Lysobacter 溶杆菌属Cellvibrio 纤维弧菌属Pedobacter 地杆菌属Aeromicrobium 气微菌属Rhodoplanes 红游动菌属Pseudomonas 假单胞菌属Planctomyces 浮霉状菌属Phenylobacterium 苯基杆菌属Pseudoxanthomonas 假黄色单胞菌属Sphingobium 鞘脂菌属Nannocystis 侏囊菌属Variovorax 贪噬菌属Luteimonas 单胞菌属Gemmata 出芽菌属Saccharothrix 糖丝菌属Prosthecobacter 突柄杆菌属Pirellula 小梨型菌属Acidovorax 食酸菌属Lentzea 伦茨氏菌属Streptosporangium 链孢子囊菌属Caulobacter 茎菌属Nocardioides 类诺卡氏菌属Stenotrophomonas 寡养单胞菌Nitrosovibrio 弧菌属Actinoplanes 游动放线菌属Rubrivivax 红肠命菌属Glycomyces 糖霉菌属Agrobacterium 土壤杆菌属Mesorhizobium 中慢生根瘤菌属Agromyces 壤霉菌属Mycobacterium 分枝杆菌属Chondromyces 粒杆粘细菌属Novosphingobium 新鞘氨醇菌属Actinomadura 马杜拉放线菌属Nonomuraea 野野村菌属Catellatospora 链孢菌属Geodermatophilus 地嗜皮菌属Nitrospira 硝化螺菌属Pseudonocardia 假诺卡氏菌属Sporocytophaga 生孢噬胞菌属Bdellovibrio 蛭弧菌属Asticcacaulis 不粘杆菌属Sinorhizobium 中华根瘤菌Hydrogenophaga 噬氢菌属Rubrobacter 红色杆菌属Dactylosporangium 指孢囊菌属Sphingobacterium 鞘氨醇杆菌属Brevundimonas 短波单胞菌属Burkholderia 伯克霍尔德菌Achromobacter 无色杆菌属Hyphomicrobium 生丝微菌属Pedomicrobium 土微菌属Paenibacillus 类芽孢杆菌Phyllobacterium 叶杆菌属Cellulomonas 纤维菌属Pilimelia 水生角质菌属Arthrobacter 节细菌属Saccharopolyspora 糖多孢菌属Myxococcus 粘球菌Amycolatopsis 拟无枝酸菌Phaeospirillum 褐螺菌属Promicromonospora 原小单孢菌属Cellulosimicrobium 纤维菌属Sporichthya 游鱼孢菌属Chloronema 绿线菌属Nocardia 诺卡氏菌属Pimelobacter 脂肪杆菌属Paracoccus 副球菌属Bosea 氏菌属Staphylococcus 葡萄球菌属Planomicrobium 动性微菌属Rhodoferax 红育菌属Rhodobacter 红杆菌属Hymenobacter 薄层菌属Saccharomonospora 糖单胞菌属Cytophaga 噬细胞菌属Ralstonia 罗尔斯通菌属Rathayibacter 拉氏杆菌属Gemmatimonas 芽单胞菌属Alicyclobacillus 杆菌属Clostridium 梭菌属Corynebacterium 棒状杆菌属Cupriavidus 贪铜菌属Caldilinea 暖绳菌属Azorhizophilus 嗜氮根瘤菌属Rhodococcus 红球菌属Legionella 军团杆菌Brevibacillus 短芽孢杆菌属Polaromonas 单胞菌属Acinetobacter 不动杆菌属Georgenia 乔治菌属Actinocorallia 珊瑚状防线菌属Cryptosporangium 隐孢菌属Comamonas 丛毛单胞菌属CandidatusProtochlamydiaAsteroleplasma 无甾醇原体属Sporosarcina 芽孢八叠球菌属Azospirillum 固氮螺菌属Magnetospirillum 磁螺菌属Roseomonas 玫瑰单胞菌属Prauserella 氏菌属Coprococcus 粪球菌属Prauseria 布劳氏菌属Thermoactinomyces 高温防线菌属Methylobacterium 甲基杆菌属Brachybacterium 短状杆菌属Azoarcus 固氮弧菌属Beijerinckia 拜叶林克氏菌属Virgibacillus 枝芽孢菌属Syntrophomonas 互营单胞菌属Geobacillus 土芽孢杆菌属Parachlamydia 副衣原体属Anaeromyxobacter 厌氧粘细菌属Oscillochloris 颤绿菌属Procabacter 普罗卡杆菌属Methanosarcina 甲烷八叠球菌属Microbacterium 微杆菌属Methylophaga 噬甲基菌属Methanoculleus 甲烷囊菌属Methylocaldum 甲基暖菌属Rickettsia 立克次氏体Alkaliphilus 嗜碱菌属Cryobacterium 冷杆菌属Shewanella 希瓦氏菌属Gordonia 戈登氏菌属Psychrobacter 嗜冷杆菌属Serratia 沙雷氏菌属Spirochaeta 螺旋体属Leptolyngbya 鞘丝藻属Caloramator 喜热菌属Dietzia 迪茨氏属Hyphomonas 生丝单胞菌属Yersinia 耶尔森氏鼠疫杆菌属Microlunatus 小月菌属Anaerolinea 厌氧绳菌属Brevibacterium 短杆菌属。

.常见微生物界（Domain）、门(Phylum)、纲（Class）、目(Order)、科(Family)、属(Genus)、种(Species)中英文对照1 / 17.界（Domain）Bacteria细菌Archaea古生菌2 / 17.门（Phylum）Proteobacteria 变形菌门Bacteroidetes 拟杆菌门Actinobacteria 放线菌门Gemmatimonadetes 芽单胞菌门Acidobacteria 酸杆菌门Planctomycetes 浮霉菌门Verrucomicrobia 疣微菌门Chloroflexi 绿弯菌门Nitrospirae 硝化螺旋菌门Firmicutes 厚壁菌门Chlorobi 绿菌门Cyanobacteria 蓝藻细菌门纤维杆菌门Fibrobacteres迷踪菌门Elusimicrobia装甲菌门Armatimonadetes广古菌门Euryarchaeota衣原体Chlamydiae泉古菌门Crenarchaeota无壁菌门TenericutesSpirochaetes 螺旋体属3 / 17.纲（Class）Alphaproteobacteria 甲型（α）变形杆菌纲Gammaproteobacteria 丙型变形菌纲Betaproteobacteria β-变形菌纲Actinobacteria 放线菌门、纲Cytophagia 纤维粘网菌Gemmatimonadetes 芽单胞菌门、纲变形菌纲δ- Deltaproteobacteria酸杆菌门Acidobacteria-6酸微菌纲Acidimicrobiia疣微菌纲Verrucomicrobiae丰佑菌纲Opitutae消化螺菌属Nitrospira热微菌门Thermomicrobia拟杆菌纲Bacteroidia杆菌Bacilli绿弯菌门ChloroflexiAnaerolineae 厌氧绳菌纲梭状芽胞杆菌Clostridia迷踪菌门ElusimicrobiaKtedonobacteria 纤线杆菌纲Thermoplasmata 热原体纲Chlamydiia 衣原体Thaumarchaeota 奇古菌门Mollicutes 柔膜菌纲甲烷微菌纲Methanomicrobia全噬菌纲HolophagaeSpirochaetes 螺旋体属4 / 17.目（Order）Xanthomonadales 黄单孢菌目Sphingomonadales 鞘脂单胞菌目Burkholderiales 伯克霍尔德氏菌目Actinomycetales 放线菌目Cytophagales 噬纤维菌目Myxococcales 粘球菌目Acidimicrobiales 酸微菌目Rhizobiales 根瘤菌目Sphingobacteriales 鞘脂杆菌目Flavobacteriales 黄杆菌目Caulobacterales 柄杆菌目Rhodospirillales 红螺菌目Alteromonadales 交替单胞菌目Enterobacteriales 肠杆菌目Verrucomicrobiales 疣微菌目Opitutales 丰佑菌目Gemmatimonadales 芽单胞菌目Nitrospirales 硝化螺旋菌目Pseudomonadales 假单胞菌目Planctomycetales 浮霉菌目Bacteroidales 拟杆菌目Syntrophobacterales 互营杆菌目Bacillales 芽孢杆菌目Thiotrichales 硫发菌目Rhodobacterales 红细菌目，红杆菌目Methylophilales 噬甲基菌目Nitrosomonadales 亚硝化单胞菌目Streptophyta 木霉菌目5 / 17. Clostridiales 梭菌目Legionellales 军团菌目Bdellovibrionales 蛭弧菌目Rubrobacterales 红色杆菌目Caldilineales 暖绳菌目Herpetosiphonales 爬管菌目Chloroflexales 绿弯菌目Rickettsiales 立克次氏体目Acidobacteriales 酸杆菌目Micrococcales 微球菌目Rhodocyclales 红环菌目Stramenopiles 不等鞭毛类Chlamydiales 衣原体目Ktedonobacterales 纤线杆菌目Neisseriales 奈瑟菌目Oceanospirillales 海洋螺菌目Anaeroplasmatales 厌氧原体目Natranaerobiales 盐碱厌氧菌目Halanaerobiales 盐碱厌氧菌目Procabacteriales 普罗卡杆菌目Sphaerobacterales 球杆菌目Methylococcales 甲基球菌目Chlorophyta 绿藻门Holophagales 全噬菌目Methanosarcinales 八叠球菌目，球菌目Bifidobacteriales 双歧杆菌目Methanomicrobiales 甲烷微菌目Aeromonadales 气单胞菌目Spirochaetales 螺旋体目6 / 17.Desulfuromonadales 除硫单胞菌目7 / 17. 科（family）Sphingomonadaceae 鞘脂单胞菌科Xanthomonadaceae 黄单胞菌科Cytophagaceae 噬纤维菌科Oxalobacteraceae 草酸杆菌科Nocardioidaceae 类诺卡氏菌科Comamonadaceae 丛毛单胞菌科Caulobacteraceae 柄杆菌科Sphingobacteriaceae 鞘脂杆菌科Flavobacteriaceae 黄杆菌科Sinobacteraceae 华杆菌科Rhodospirillaceae 红螺旋菌科Hyphomicrobiaceae 生丝微菌科Polyangiaceae 多囊粘菌科Erythrobacteraceae 赤杆菌科Enterobacteriaceae 肠杆菌科Verrucomicrobiaceae 疣微菌科Geodermatophilaceae 地嗜皮菌科Opitutaceae 丰佑菌科Streptomycetaceae 链霉菌科Alteromonadaceae 交替单胞菌科Micrococcaceae 微球菌科Actinosynnemataceae 束丝防线菌科Micromonosporaceae 微单胞菌科Pseudomonadaceae 假单胞菌科Planctomycetaceae 浮霉菌科Nannocystaceae 侏囊菌科Syntrophobacteraceae 互营杆菌科Sporichthyaceae 鱼孢菌科8 / 17. Streptosporangiaceae 链孢囊菌科Bradyrhizobiaceae 慢生根瘤菌科Piscirickettsiaceae 鱼立克次体科Rhizobiaceae 根瘤菌科Microbacteriaceae 微杆菌科Pseudonocardiaceae 假诺卡氏科Bacillaceae 芽孢杆菌科Intrasporangiaceae 间孢囊菌科Nitrospiraceae 硝化螺旋菌科Phyllobacteriaceae 叶杆菌科，叶瘤菌科Alcaligenaceae 产碱菌科，产碱杆菌科Nitrosomonadaceae 亚硝化单胞菌科Rhodobacteraceae 红杆菌科Thermomonosporaceae 高温单胞菌科Glycomycetaceae 糖霉菌科Acetobacteraceae 醋杆菌科Mycobacteriaceae 分支杆菌科Hyphomonadaceae 生丝单胞菌科Rubrobacteraceae 红色杆菌科Cystobacteraceae 孢囊杆菌科Caldilineaceae 暖绳菌科Rhodobiaceae 红菌科，红游动菌科Burkholderiaceae 伯克氏菌科Coxiellaceae 柯克斯体科Bdellovibrionaceae 蛭弧菌科Acidobacteriaceae 酸杆菌科Clostridiaceae 梭菌科Paenibacillaceae 类芽孢杆菌科9 / 17. Bacteriovoracaceae 噬菌弧菌科Myxococcaceae 粘液球菌科Cellulomonadaceae 纤维素单胞菌科Beijerinckiaceae 拜叶林克氏菌科Frankiaceae 弗兰克氏菌科Rhodocyclaceae 红环菌科Planococcaceae 动球菌科Methylocystaceae 甲基孢囊菌科Nocardiaceae 诺卡式菌科Chloroflexaceae 绿屈挠菌科Thermoactinomycetaceae 高温放线菌科Staphylococcaceae 葡萄球菌科Alicyclobacillaceae 环脂酸芽孢杆菌科Nocardiopsaceae 拟诺卡式菌科Legionellaceae 军团菌科Ktedonobacteraceae 纤线杆菌科Gemmatimonadaceae 芽单胞菌科Moraxellaceae 莫拉氏菌科Corynebacteriaceae 棒状杆菌科Parachlamydiaceae 副衣原体科Cystobacterineae 孢囊杆菌亚目Aurantimonadaceae 橙单胞菌科Methylobacteriaceae 甲基杆菌科Rickettsiaceae 立克次氏体Brucellaceae 布鲁氏菌科Lachnospiraceae 毛螺菌科Neisseriaceae 奈瑟氏菌科Halomonadaceae 盐单胞菌科10 / 17. Anaeroplasmataceae 厌氧原体科Peptococcaceae 消化球菌科，冻球菌科Halanaerobiaceae 盐厌氧菌科Peptostreptococcaceae 消化链球菌科Dermabacteraceae 皮杆菌科Procabacteriaceae 普洛卡杆菌科Kineosporiaceae 动孢囊菌科Methylococcaceae 甲基球菌科Syntrophomonadaceae 单胞菌科，互营单胞菌科Oscillochloridaceae 颤绿菌科Chlamydomonadaceae 【植物】衣藻科Holosporaceae 全胞菌科Gordoniaceae 戈登氏菌科Shewanellaceae 希万氏菌科Aeromonadaceae 气单胞菌科Geobacteraceae 地杆菌科Brevibacteriaceae 短杆菌科Porphyromonadaceae 紫单胞菌科Xanthobacteraceae 黄色杆菌科Spirochaetaceae 螺旋体科Propionibacteriaceae 丙酸杆菌科11 / 17.属（Genus）Janthinobacterium 紫色杆菌属Flavobacterium 黄杆菌属Thermomonas 热单胞菌属Mycoplana 枝动杆菌属Sorangium 堆囊菌属Opitutus 丰佑菌属Sphingomonas 鞘脂单胞菌属Streptomyces 链霉菌属Lysobacter 溶杆菌属Cellvibrio 纤维弧菌属Pedobacter 地杆菌属Aeromicrobium 气微菌属Rhodoplanes 红游动菌属Pseudomonas 假单胞菌属Planctomyces 浮霉状菌属Phenylobacterium 苯基杆菌属Pseudoxanthomonas 假黄色单胞菌属Sphingobium 鞘脂菌属Nannocystis 侏囊菌属Variovorax 贪噬菌属Luteimonas 单胞菌属Gemmata 出芽菌属Saccharothrix 糖丝菌属Prosthecobacter 突柄杆菌属Pirellula 小梨型菌属Acidovorax 食酸菌属Lentzea 伦茨氏菌属Streptosporangium 链孢子囊菌属12 / 17. Bacillus 芽孢杆菌属Caulobacter 茎菌属Nocardioides 类诺卡氏菌属Stenotrophomonas 寡养单胞菌Nitrosovibrio 弧菌属Actinoplanes 游动放线菌属Rubrivivax 红肠命菌属Glycomyces 糖霉菌属Agrobacterium 土壤杆菌属Mesorhizobium 中慢生根瘤菌属Agromyces 壤霉菌属Mycobacterium 分枝杆菌属Chondromyces 粒杆粘细菌属Novosphingobium 新鞘氨醇菌属Actinomadura 马杜拉放线菌属Nonomuraea 野野村菌属Catellatospora 链孢菌属Geodermatophilus 地嗜皮菌属Nitrospira 硝化螺菌属Pseudonocardia 假诺卡氏菌属Sporocytophaga 生孢噬胞菌属Bdellovibrio 蛭弧菌属Asticcacaulis 不粘杆菌属Sinorhizobium 中华根瘤菌Hydrogenophaga 噬氢菌属Rubrobacter 红色杆菌属Dactylosporangium 指孢囊菌属Sphingobacterium 鞘氨醇杆菌属Brevundimonas 短波单胞菌属13 / 17. Jiangella 姜氏菌属Burkholderia 伯克霍尔德菌Achromobacter 无色杆菌属Hyphomicrobium 生丝微菌属Pedomicrobium 土微菌属Paenibacillus 类芽孢杆菌Phyllobacterium 叶杆菌属Cellulomonas 纤维菌属Pilimelia 水生角质菌属Arthrobacter 节细菌属Saccharopolyspora 糖多孢菌属Myxococcus 粘球菌Amycolatopsis 拟无枝酸菌Phaeospirillum 褐螺菌属Promicromonospora 原小单孢菌属Cellulosimicrobium 纤维菌属Sporichthya 游鱼孢菌属Chloronema 绿线菌属Nocardia 诺卡氏菌属Pimelobacter 脂肪杆菌属Paracoccus 副球菌属Bosea 氏菌属Staphylococcus 葡萄球菌属Planomicrobium 动性微菌属Rhodoferax 红育菌属Rhodobacter 红杆菌属Hymenobacter 薄层菌属Saccharomonospora 糖单胞菌属Cytophaga 噬细胞菌属14 / 17. Ralstonia 罗尔斯通菌属Rathayibacter 拉氏杆菌属Gemmatimonas 芽单胞菌属Alicyclobacillus 杆菌属Clostridium 梭菌属Corynebacterium 棒状杆菌属Cupriavidus 贪铜菌属Caldilinea 暖绳菌属Azorhizophilus 嗜氮根瘤菌属Rhodococcus 红球菌属Legionella 军团杆菌Brevibacillus 短芽孢杆菌属Polaromonas 单胞菌属Acinetobacter 不动杆菌属Georgenia 乔治菌属Actinocorallia 珊瑚状防线菌属Cryptosporangium 隐孢菌属Comamonas 丛毛单胞菌属CandidatusProtochlamydia Asteroleplasma 无甾醇原体属Sporosarcina 芽孢八叠球菌属Azospirillum 固氮螺菌属Magnetospirillum 磁螺菌属Roseomonas 玫瑰单胞菌属Prauserella 氏菌属Coprococcus 粪球菌属Prauseria 布劳氏菌属Thermoactinomyces 高温防线菌属Methylobacterium 甲基杆菌属15 / 17. Brachybacterium 短状杆菌属Azoarcus 固氮弧菌属Beijerinckia 拜叶林克氏菌属Virgibacillus 枝芽孢菌属Syntrophomonas 互营单胞菌属Geobacillus 土芽孢杆菌属Parachlamydia 副衣原体属Anaeromyxobacter 厌氧粘细菌属Oscillochloris 颤绿菌属Procabacter 普罗卡杆菌属Methanosarcina 甲烷八叠球菌属Microbacterium 微杆菌属Methylophaga 噬甲基菌属Methanoculleus 甲烷囊菌属Methylocaldum 甲基暖菌属Rickettsia 立克次氏体Alkaliphilus 嗜碱菌属Cryobacterium 冷杆菌属Shewanella 希瓦氏菌属Gordonia 戈登氏菌属Psychrobacter 嗜冷杆菌属Serratia 沙雷氏菌属Spirochaeta 螺旋体属Leptolyngbya 鞘丝藻属Caloramator 喜热菌属Dietzia 迪茨氏属Hyphomonas 生丝单胞菌属Yersinia 耶尔森氏鼠疫杆菌属Microlunatus 小月菌属16 / 17. Anaerolinea 厌氧绳菌属Brevibacterium 短杆菌属17 / 17。

常见微生物界（ Domain ）、门(Phylum) 、纲（ Class）、目 (Order) 、科 (Family) 、属(Genus) 、种 (Species)中英文对照Bacteria 细菌Archaea古生菌Proteobacteria变形菌门Bacteroidetes拟杆菌门Actinobacteria放线菌门Gemmatimonadetes芽单胞菌门Acidobacteria酸杆菌门Planctomycetes浮霉菌门Verrucomicrobia疣微菌门Chloroflexi绿弯菌门Nitrospirae硝化螺旋菌门Firmicutes厚壁菌门Chlorobi绿菌门Cyanobacteria蓝藻细菌门Fibrobacteres纤维杆菌门Elusimicrobia迷踪菌门Armatimonadetes装甲菌门Euryarchaeota广古菌门Chlamydiae衣原体Crenarchaeota泉古菌门Tenericutes无壁菌门Spirochaetes螺旋体属纲（Class）Alphaproteobacteria Gammaproteobacteria Betaproteobacteria Actinobacteria Cytophagia Gemmatimonadetes Deltaproteobacteria Acidobacteria-6 Acidimicrobiia Verrucomicrobiae OpitutaeNitrospira Thermomicrobia BacteroidiaBacilliChloroflexi Anaerolineae Clostridia Elusimicrobia Ktedonobacteria Thermoplasmata Chlamydiia Thaumarchaeota Mollicutes Methanomicrobia Holophagae Spirochaetes甲型（α）变形杆菌纲丙型变形菌纲β-变形菌纲放线菌门、纲纤维粘网菌芽单胞菌门、纲δ -变形菌纲酸杆菌门酸微菌纲疣微菌纲丰佑菌纲消化螺菌属热微菌门拟杆菌纲杆菌绿弯菌门厌氧绳菌纲梭状芽胞杆菌迷踪菌门纤线杆菌纲热原体纲衣原体奇古菌门柔膜菌纲甲烷微菌纲全噬菌纲螺旋体属目（ Order ）Xanthomonadales黄单孢菌目Sphingomonadales鞘脂单胞菌目Burkholderiales伯克霍尔德氏菌目Actinomycetales放线菌目Cytophagales噬纤维菌目Myxococcales粘球菌目Acidimicrobiales酸微菌目Rhizobiales根瘤菌目Sphingobacteriales 鞘脂杆菌目Flavobacteriales黄杆菌目Caulobacterales 柄杆菌目Rhodospirillales红螺菌目Alteromonadales交替单胞菌目Enterobacteriales肠杆菌目Verrucomicrobiales疣微菌目Opitutales丰佑菌目Gemmatimonadales芽单胞菌目Nitrospirales硝化螺旋菌目Pseudomonadales假单胞菌目Planctomycetales浮霉菌目Bacteroidales拟杆菌目Syntrophobacterales互营杆菌目Bacillales芽孢杆菌目Thiotrichales硫发菌目Rhodobacterales红细菌目，红杆菌目Methylophilales噬甲基菌目Nitrosomonadales亚硝化单胞菌目Streptophyta木霉菌目Clostridiales梭菌目Legionellales军团菌目Bdellovibrionales蛭弧菌目Rubrobacterales红色杆菌目Caldilineales暖绳菌目Herpetosiphonales爬管菌目Chloroflexales绿弯菌目Rickettsiales立克次氏体目Acidobacteriales酸杆菌目Micrococcales微球菌目Rhodocyclales红环菌目Stramenopiles不等鞭毛类Chlamydiales衣原体目Ktedonobacterales纤线杆菌目Neisseriales奈瑟菌目Oceanospirillales海洋螺菌目Anaeroplasmatales厌氧原体目Natranaerobiales盐碱厌氧菌目Halanaerobiales盐碱厌氧菌目Procabacteriales普罗卡杆菌目Sphaerobacterales球杆菌目Methylococcales甲基球菌目Chlorophyta绿藻门Holophagales全噬菌目Methanosarcinales八叠球菌目，球菌目Bifidobacteriales双歧杆菌目Methanomicrobiales甲烷微菌目Aeromonadales气单胞菌目Spirochaetales螺旋体目Desulfuromonadales除硫单胞菌目科（ family ）Sphingomonadaceae鞘脂单胞菌科Xanthomonadaceae黄单胞菌科Cytophagaceae噬纤维菌科Oxalobacteraceae草酸杆菌科Nocardioidaceae类诺卡氏菌科Comamonadaceae丛毛单胞菌科Caulobacteraceae柄杆菌科Sphingobacteriaceae鞘脂杆菌科Flavobacteriaceae黄杆菌科Sinobacteraceae华杆菌科Rhodospirillaceae红螺旋菌科Hyphomicrobiaceae生丝微菌科Polyangiaceae多囊粘菌科Erythrobacteraceae赤杆菌科Enterobacteriaceae肠杆菌科Verrucomicrobiaceae疣微菌科Geodermatophilaceae地嗜皮菌科Opitutaceae丰佑菌科Streptomycetaceae链霉菌科Alteromonadaceae交替单胞菌科Micrococcaceae微球菌科Actinosynnemataceae束丝防线菌科Micromonosporaceae微单胞菌科Pseudomonadaceae假单胞菌科Planctomycetaceae浮霉菌科Nannocystaceae侏囊菌科Syntrophobacteraceae互营杆菌科Sporichthyaceae鱼孢菌科Streptosporangiaceae链孢囊菌科Bradyrhizobiaceae慢生根瘤菌科Piscirickettsiaceae鱼立克次体科Rhizobiaceae根瘤菌科Microbacteriaceae微杆菌科Pseudonocardiaceae假诺卡氏科Bacillaceae芽孢杆菌科Intrasporangiaceae间孢囊菌科Nitrospiraceae硝化螺旋菌科Methylophilaceae噬甲基菌科Phyllobacteriaceae叶杆菌科，叶瘤菌科Alcaligenaceae产碱菌科，产碱杆菌科Nitrosomonadaceae亚硝化单胞菌科Rhodobacteraceae红杆菌科Thermomonosporaceae高温单胞菌科Glycomycetaceae糖霉菌科Acetobacteraceae醋杆菌科Mycobacteriaceae分支杆菌科Hyphomonadaceae生丝单胞菌科Rubrobacteraceae红色杆菌科Cystobacteraceae孢囊杆菌科Caldilineaceae暖绳菌科Rhodobiaceae红菌科，红游动菌科Burkholderiaceae伯克氏菌科Coxiellaceae柯克斯体科Bdellovibrionaceae蛭弧菌科Acidobacteriaceae酸杆菌科Clostridiaceae梭菌科Paenibacillaceae类芽孢杆菌科Bacteriovoracaceae噬菌弧菌科Myxococcaceae粘液球菌科Cellulomonadaceae纤维素单胞菌科Beijerinckiaceae拜叶林克氏菌科Frankiaceae弗兰克氏菌科Rhodocyclaceae红环菌科Planococcaceae动球菌科Methylocystaceae甲基孢囊菌科Nocardiaceae诺卡式菌科Chloroflexaceae绿屈挠菌科Thermoactinomycetaceae高温放线菌科Staphylococcaceae葡萄球菌科Alicyclobacillaceae环脂酸芽孢杆菌科Nocardiopsaceae拟诺卡式菌科Legionellaceae军团菌科Ktedonobacteraceae纤线杆菌科Gemmatimonadaceae芽单胞菌科Moraxellaceae莫拉氏菌科Corynebacteriaceae棒状杆菌科Parachlamydiaceae副衣原体科Cystobacterineae孢囊杆菌亚目Aurantimonadaceae橙单胞菌科Bogoriellaceae博格利亚湖菌科Methylobacteriaceae甲基杆菌科Rickettsiaceae立克次氏体Brucellaceae布鲁氏菌科Lachnospiraceae毛螺菌科Neisseriaceae奈瑟氏菌科Halomonadaceae盐单胞菌科Anaeroplasmataceae厌氧原体科Peptococcaceae消化球菌科，冻球菌科Halanaerobiaceae盐厌氧菌科Peptostreptococcaceae消化链球菌科Dermabacteraceae皮杆菌科Procabacteriaceae普洛卡杆菌科Kineosporiaceae动孢囊菌科Methylococcaceae甲基球菌科Syntrophomonadaceae单胞菌科，互营单胞菌科Oscillochloridaceae颤绿菌科Chlamydomonadaceae【植物】衣藻科Holosporaceae全胞菌科Gordoniaceae戈登氏菌科Shewanellaceae希万氏菌科Aeromonadaceae气单胞菌科Geobacteraceae地杆菌科Brevibacteriaceae短杆菌科Porphyromonadaceae紫单胞菌科Xanthobacteraceae黄色杆菌科Spirochaetaceae螺旋体科Propionibacteriaceae丙酸杆菌科属（ Genus ）Janthinobacterium紫色杆菌属Flavobacterium黄杆菌属Thermomonas热单胞菌属Mycoplana枝动杆菌属Sorangium堆囊菌属Opitutus丰佑菌属Sphingomonas鞘脂单胞菌属Streptomyces链霉菌属Lysobacter溶杆菌属Cellvibrio纤维弧菌属Pedobacter地杆菌属Aeromicrobium气微菌属Rhodoplanes红游动菌属Pseudomonas假单胞菌属Planctomyces浮霉状菌属Phenylobacterium苯基杆菌属Pseudoxanthomonas假黄色单胞菌属Sphingobium鞘脂菌属Nannocystis侏囊菌属Variovorax贪噬菌属Luteimonas单胞菌属Gemmata出芽菌属Saccharothrix糖丝菌属Prosthecobacter突柄杆菌属Pirellula小梨型菌属Acidovorax食酸菌属Lentzea伦茨氏菌属Streptosporangium链孢子囊菌属Bacillus芽孢杆菌属Caulobacter茎菌属Nocardioides类诺卡氏菌属Stenotrophomonas寡养单胞菌Nitrosovibrio弧菌属Actinoplanes游动放线菌属Rubrivivax红肠命菌属Glycomyces糖霉菌属Agrobacterium土壤杆菌属Mesorhizobium中慢生根瘤菌属Agromyces壤霉菌属Mycobacterium分枝杆菌属Chondromyces粒杆粘细菌属Novosphingobium新鞘氨醇菌属Actinomadura马杜拉放线菌属Nonomuraea野野村菌属Catellatospora链孢菌属Geodermatophilus地嗜皮菌属Nitrospira硝化螺菌属Pseudonocardia假诺卡氏菌属Sporocytophaga生孢噬胞菌属Bdellovibrio蛭弧菌属Asticcacaulis不粘杆菌属Sinorhizobium中华根瘤菌Hydrogenophaga噬氢菌属Rubrobacter红色杆菌属Dactylosporangium指孢囊菌属Sphingobacterium鞘氨醇杆菌属Brevundimonas短波单胞菌属Jiangella姜氏菌属Burkholderia伯克霍尔德菌Achromobacter无色杆菌属Hyphomicrobium生丝微菌属Pedomicrobium土微菌属Paenibacillus类芽孢杆菌Phyllobacterium叶杆菌属Cellulomonas纤维菌属Pilimelia水生角质菌属Arthrobacter节细菌属Saccharopolyspora糖多孢菌属Myxococcus粘球菌Amycolatopsis拟无枝酸菌Phaeospirillum褐螺菌属Promicromonospora原小单孢菌属Cellulosimicrobium纤维菌属Sporichthya游鱼孢菌属Chloronema绿线菌属Nocardia诺卡氏菌属Pimelobacter脂肪杆菌属Paracoccus副球菌属Bosea氏菌属Staphylococcus葡萄球菌属Planomicrobium动性微菌属Rhodoferax红育菌属Rhodobacter红杆菌属Hymenobacter薄层菌属Saccharomonospora糖单胞菌属Cytophaga噬细胞菌属Ralstonia罗尔斯通菌属Rathayibacter拉氏杆菌属Gemmatimonas芽单胞菌属Alicyclobacillus杆菌属Clostridium梭菌属Corynebacterium棒状杆菌属Cupriavidus贪铜菌属Caldilinea暖绳菌属Azorhizophilus嗜氮根瘤菌属Rhodococcus红球菌属Legionella军团杆菌Brevibacillus短芽孢杆菌属Polaromonas单胞菌属Acinetobacter不动杆菌属Georgenia乔治菌属Actinocorallia珊瑚状防线菌属Cryptosporangium隐孢菌属Comamonas丛毛单胞菌属CandidatusProtochlamydia Asteroleplasma无甾醇原体属Sporosarcina芽孢八叠球菌属Azospirillum固氮螺菌属Magnetospirillum磁螺菌属Roseomonas玫瑰单胞菌属Prauserella氏菌属Coprococcus粪球菌属Prauseria布劳氏菌属Thermoactinomyces高温防线菌属Methylobacterium甲基杆菌属Brachybacterium短状杆菌属Azoarcus固氮弧菌属Beijerinckia拜叶林克氏菌属Virgibacillus枝芽孢菌属Syntrophomonas互营单胞菌属Geobacillus土芽孢杆菌属Parachlamydia副衣原体属Anaeromyxobacter厌氧粘细菌属Oscillochloris颤绿菌属Procabacter普罗卡杆菌属Methanosarcina甲烷八叠球菌属Microbacterium微杆菌属Methylophaga噬甲基菌属Methanoculleus甲烷囊菌属Methylocaldum甲基暖菌属Rickettsia立克次氏体Alkaliphilus嗜碱菌属Cryobacterium冷杆菌属Shewanella希瓦氏菌属Gordonia戈登氏菌属Psychrobacter嗜冷杆菌属Serratia沙雷氏菌属Spirochaeta螺旋体属Leptolyngbya鞘丝藻属Caloramator喜热菌属Dietzia迪茨氏属Hyphomonas生丝单胞菌属Yersinia耶尔森氏鼠疫杆菌属Microlunatus小月菌属Anaerolinea厌氧绳菌属Brevibacterium短杆菌属。

常见微生物界（Domain）、门(Phylum)、纲（Class）、目(Order)、科(Family)、属(Genus)、种(Species)中英文对照界（Domain）Bacteria细菌Archaea古生菌门（Phylum）Proteobacteria 变形菌门Bacteroidetes 拟杆菌门Actinobacteria 放线菌门Gemmatimonadetes 芽单胞菌门Acidobacteria 酸杆菌门Planctomycetes 浮霉菌门Verrucomicrobia 疣微菌门Chloroflexi 绿弯菌门Nitrospirae 硝化螺旋菌门Firmicutes 厚壁菌门Chlorobi 绿菌门Cyanobacteria 蓝藻细菌门Fibrobacteres 纤维杆菌门Elusimicrobia 迷踪菌门Armatimonadetes 装甲菌门Euryarchaeota 广古菌门Chlamydiae 衣原体Crenarchaeota 泉古菌门Tenericutes 无壁菌门Spirochaetes 螺旋体属Alphaproteobacteria 甲型（α）变形杆菌纲Gammaproteobacteria 丙型变形菌纲Betaproteobacteria β-变形菌纲Actinobacteria 放线菌门、纲Cytophagia 纤维粘网菌Gemmatimonadetes 芽单胞菌门、纲Deltaproteobacteria δ-变形菌纲Acidobacteria-6 酸杆菌门Acidimicrobiia 酸微菌纲Verrucomicrobiae 疣微菌纲Opitutae 丰佑菌纲Nitrospira 消化螺菌属Thermomicrobia 热微菌门Bacteroidia 拟杆菌纲Bacilli 杆菌Chloroflexi 绿弯菌门Anaerolineae 厌氧绳菌纲Clostridia 梭状芽胞杆菌Elusimicrobia 迷踪菌门Ktedonobacteria 纤线杆菌纲Thermoplasmata 热原体纲Chlamydiia 衣原体Thaumarchaeota 奇古菌门Mollicutes 柔膜菌纲Methanomicrobia 甲烷微菌纲Holophagae 全噬菌纲Spirochaetes 螺旋体属Xanthomonadales 黄单孢菌目Sphingomonadales 鞘脂单胞菌目Burkholderiales 伯克霍尔德氏菌目Actinomycetales 放线菌目Cytophagales 噬纤维菌目Myxococcales 粘球菌目Acidimicrobiales 酸微菌目Rhizobiales 根瘤菌目Sphingobacteriales 鞘脂杆菌目Flavobacteriales 黄杆菌目Caulobacterales 柄杆菌目Rhodospirillales 红螺菌目Alteromonadales 交替单胞菌目Enterobacteriales 肠杆菌目Verrucomicrobiales 疣微菌目Opitutales 丰佑菌目Gemmatimonadales 芽单胞菌目Nitrospirales 硝化螺旋菌目Pseudomonadales 假单胞菌目Planctomycetales 浮霉菌目Bacteroidales 拟杆菌目Syntrophobacterales 互营杆菌目Bacillales 芽孢杆菌目Thiotrichales 硫发菌目Rhodobacterales 红细菌目，红杆菌目Methylophilales 噬甲基菌目Nitrosomonadales 亚硝化单胞菌目Streptophyta 木霉菌目Clostridiales 梭菌目Legionellales 军团菌目Bdellovibrionales 蛭弧菌目Rubrobacterales 红色杆菌目Caldilineales 暖绳菌目Herpetosiphonales 爬管菌目Chloroflexales 绿弯菌目Rickettsiales 立克次氏体目Acidobacteriales 酸杆菌目Micrococcales 微球菌目Rhodocyclales 红环菌目Stramenopiles 不等鞭毛类Chlamydiales 衣原体目Ktedonobacterales 纤线杆菌目Neisseriales 奈瑟菌目Oceanospirillales 海洋螺菌目Anaeroplasmatales 厌氧原体目Natranaerobiales 盐碱厌氧菌目Halanaerobiales 盐碱厌氧菌目Procabacteriales 普罗卡杆菌目Sphaerobacterales 球杆菌目Methylococcales 甲基球菌目Chlorophyta 绿藻门Holophagales 全噬菌目Methanosarcinales 八叠球菌目，球菌目Bifidobacteriales 双歧杆菌目Methanomicrobiales 甲烷微菌目Aeromonadales 气单胞菌目Spirochaetales 螺旋体目Desulfuromonadales 除硫单胞菌目科（family）Sphingomonadaceae 鞘脂单胞菌科Xanthomonadaceae 黄单胞菌科Cytophagaceae 噬纤维菌科Oxalobacteraceae 草酸杆菌科Nocardioidaceae 类诺卡氏菌科Comamonadaceae 丛毛单胞菌科Caulobacteraceae 柄杆菌科Sphingobacteriaceae 鞘脂杆菌科Flavobacteriaceae 黄杆菌科Sinobacteraceae 华杆菌科Rhodospirillaceae 红螺旋菌科Hyphomicrobiaceae 生丝微菌科Polyangiaceae 多囊粘菌科Erythrobacteraceae 赤杆菌科Enterobacteriaceae 肠杆菌科Verrucomicrobiaceae 疣微菌科Geodermatophilaceae 地嗜皮菌科Opitutaceae 丰佑菌科Streptomycetaceae 链霉菌科Alteromonadaceae 交替单胞菌科Micrococcaceae 微球菌科Actinosynnemataceae 束丝防线菌科Micromonosporaceae 微单胞菌科Pseudomonadaceae 假单胞菌科Planctomycetaceae 浮霉菌科Nannocystaceae 侏囊菌科Syntrophobacteraceae 互营杆菌科Sporichthyaceae 鱼孢菌科Streptosporangiaceae 链孢囊菌科Bradyrhizobiaceae 慢生根瘤菌科Piscirickettsiaceae 鱼立克次体科Rhizobiaceae 根瘤菌科Microbacteriaceae 微杆菌科Pseudonocardiaceae 假诺卡氏科Bacillaceae 芽孢杆菌科Intrasporangiaceae 间孢囊菌科Nitrospiraceae 硝化螺旋菌科Methylophilaceae 噬甲基菌科Phyllobacteriaceae 叶杆菌科，叶瘤菌科Alcaligenaceae 产碱菌科，产碱杆菌科Nitrosomonadaceae 亚硝化单胞菌科Rhodobacteraceae 红杆菌科Thermomonosporaceae 高温单胞菌科Glycomycetaceae 糖霉菌科Acetobacteraceae 醋杆菌科Mycobacteriaceae 分支杆菌科Hyphomonadaceae 生丝单胞菌科Rubrobacteraceae 红色杆菌科Cystobacteraceae 孢囊杆菌科Caldilineaceae 暖绳菌科Rhodobiaceae 红菌科，红游动菌科Burkholderiaceae 伯克氏菌科Coxiellaceae 柯克斯体科Bdellovibrionaceae 蛭弧菌科Acidobacteriaceae 酸杆菌科Clostridiaceae 梭菌科Paenibacillaceae 类芽孢杆菌科Bacteriovoracaceae 噬菌弧菌科Myxococcaceae 粘液球菌科Cellulomonadaceae 纤维素单胞菌科Beijerinckiaceae 拜叶林克氏菌科Frankiaceae 弗兰克氏菌科Rhodocyclaceae 红环菌科Planococcaceae 动球菌科Methylocystaceae 甲基孢囊菌科Nocardiaceae 诺卡式菌科Chloroflexaceae 绿屈挠菌科Thermoactinomycetaceae 高温放线菌科Staphylococcaceae 葡萄球菌科Alicyclobacillaceae 环脂酸芽孢杆菌科Nocardiopsaceae 拟诺卡式菌科Legionellaceae 军团菌科Ktedonobacteraceae 纤线杆菌科Gemmatimonadaceae 芽单胞菌科Moraxellaceae 莫拉氏菌科Corynebacteriaceae 棒状杆菌科Parachlamydiaceae 副衣原体科Cystobacterineae 孢囊杆菌亚目Aurantimonadaceae 橙单胞菌科Bogoriellaceae 博格利亚湖菌科Methylobacteriaceae 甲基杆菌科Rickettsiaceae 立克次氏体Brucellaceae 布鲁氏菌科Lachnospiraceae 毛螺菌科Neisseriaceae 奈瑟氏菌科Halomonadaceae 盐单胞菌科Anaeroplasmataceae 厌氧原体科Peptococcaceae 消化球菌科，冻球菌科Halanaerobiaceae 盐厌氧菌科Peptostreptococcaceae 消化链球菌科Dermabacteraceae 皮杆菌科Procabacteriaceae 普洛卡杆菌科Kineosporiaceae 动孢囊菌科Methylococcaceae 甲基球菌科Syntrophomonadaceae 单胞菌科，互营单胞菌科Oscillochloridaceae 颤绿菌科Chlamydomonadaceae 【植物】衣藻科Holosporaceae 全胞菌科Gordoniaceae 戈登氏菌科Shewanellaceae 希万氏菌科Aeromonadaceae 气单胞菌科Geobacteraceae 地杆菌科Brevibacteriaceae 短杆菌科Porphyromonadaceae 紫单胞菌科Xanthobacteraceae 黄色杆菌科Spirochaetaceae 螺旋体科Propionibacteriaceae 丙酸杆菌科属（Genus）Janthinobacterium 紫色杆菌属Flavobacterium 黄杆菌属Thermomonas 热单胞菌属Mycoplana 枝动杆菌属Sorangium 堆囊菌属Opitutus 丰佑菌属Sphingomonas 鞘脂单胞菌属Streptomyces 链霉菌属Lysobacter 溶杆菌属Cellvibrio 纤维弧菌属Pedobacter 地杆菌属Aeromicrobium 气微菌属Rhodoplanes 红游动菌属Pseudomonas 假单胞菌属Planctomyces 浮霉状菌属Phenylobacterium 苯基杆菌属Pseudoxanthomonas 假黄色单胞菌属Sphingobium 鞘脂菌属Nannocystis 侏囊菌属Variovorax 贪噬菌属Luteimonas 单胞菌属Gemmata 出芽菌属Saccharothrix 糖丝菌属Prosthecobacter 突柄杆菌属Pirellula 小梨型菌属Acidovorax 食酸菌属Lentzea 伦茨氏菌属Streptosporangium 链孢子囊菌属Bacillus 芽孢杆菌属Caulobacter 茎菌属Nocardioides 类诺卡氏菌属Stenotrophomonas 寡养单胞菌Nitrosovibrio 弧菌属Actinoplanes 游动放线菌属Rubrivivax 红肠命菌属Glycomyces 糖霉菌属Agrobacterium 土壤杆菌属Mesorhizobium 中慢生根瘤菌属Agromyces 壤霉菌属Mycobacterium 分枝杆菌属Chondromyces 粒杆粘细菌属Novosphingobium 新鞘氨醇菌属Actinomadura 马杜拉放线菌属Nonomuraea 野野村菌属Catellatospora 链孢菌属Geodermatophilus 地嗜皮菌属Nitrospira 硝化螺菌属Pseudonocardia 假诺卡氏菌属Sporocytophaga 生孢噬胞菌属Bdellovibrio 蛭弧菌属Asticcacaulis 不粘杆菌属Sinorhizobium 中华根瘤菌Hydrogenophaga 噬氢菌属Rubrobacter 红色杆菌属Dactylosporangium 指孢囊菌属Sphingobacterium 鞘氨醇杆菌属Brevundimonas 短波单胞菌属Jiangella 姜氏菌属Burkholderia 伯克霍尔德菌Achromobacter 无色杆菌属Hyphomicrobium 生丝微菌属Pedomicrobium 土微菌属Paenibacillus 类芽孢杆菌Phyllobacterium 叶杆菌属Cellulomonas 纤维菌属Pilimelia 水生角质菌属Arthrobacter 节细菌属Saccharopolyspora 糖多孢菌属Myxococcus 粘球菌Amycolatopsis 拟无枝酸菌Phaeospirillum 褐螺菌属Promicromonospora 原小单孢菌属Cellulosimicrobium 纤维菌属Sporichthya 游鱼孢菌属Chloronema 绿线菌属Nocardia 诺卡氏菌属Pimelobacter 脂肪杆菌属Paracoccus 副球菌属Bosea 氏菌属Staphylococcus 葡萄球菌属Planomicrobium 动性微菌属Rhodoferax 红育菌属Rhodobacter 红杆菌属Hymenobacter 薄层菌属Saccharomonospora 糖单胞菌属Cytophaga 噬细胞菌属Ralstonia 罗尔斯通菌属Rathayibacter 拉氏杆菌属Gemmatimonas 芽单胞菌属Alicyclobacillus 杆菌属Clostridium 梭菌属Corynebacterium 棒状杆菌属Cupriavidus 贪铜菌属Caldilinea 暖绳菌属Azorhizophilus 嗜氮根瘤菌属Rhodococcus 红球菌属Legionella 军团杆菌Brevibacillus 短芽孢杆菌属Polaromonas 单胞菌属Acinetobacter 不动杆菌属Georgenia 乔治菌属Actinocorallia 珊瑚状防线菌属Cryptosporangium 隐孢菌属Comamonas 丛毛单胞菌属CandidatusProtochlamydia Asteroleplasma 无甾醇原体属Sporosarcina 芽孢八叠球菌属Azospirillum 固氮螺菌属Magnetospirillum 磁螺菌属Roseomonas 玫瑰单胞菌属Prauserella 氏菌属Coprococcus 粪球菌属Prauseria 布劳氏菌属Thermoactinomyces 高温防线菌属Methylobacterium 甲基杆菌属Brachybacterium 短状杆菌属Azoarcus 固氮弧菌属Beijerinckia 拜叶林克氏菌属Virgibacillus 枝芽孢菌属Syntrophomonas 互营单胞菌属Geobacillus 土芽孢杆菌属Parachlamydia 副衣原体属Anaeromyxobacter 厌氧粘细菌属Oscillochloris 颤绿菌属Procabacter 普罗卡杆菌属Methanosarcina 甲烷八叠球菌属Microbacterium 微杆菌属Methylophaga 噬甲基菌属Methanoculleus 甲烷囊菌属Methylocaldum 甲基暖菌属Rickettsia 立克次氏体Alkaliphilus 嗜碱菌属Cryobacterium 冷杆菌属Shewanella 希瓦氏菌属Gordonia 戈登氏菌属Psychrobacter 嗜冷杆菌属Serratia 沙雷氏菌属Spirochaeta 螺旋体属Leptolyngbya 鞘丝藻属Caloramator 喜热菌属Dietzia 迪茨氏属Hyphomonas 生丝单胞菌属Yersinia 耶尔森氏鼠疫杆菌属Microlunatus 小月菌属Anaerolinea 厌氧绳菌属Brevibacterium 短杆菌属。

常见微生物界( Domain )、门(Phylum) 、纲( Class)、目(Order) 、科(Family) 、属(Genus) 、种(Species)中英文对照Domain )界Bacteria细菌Archaea古生菌门（Phylum ）Proteobacteria 变形菌门Bacteroidetes 拟杆菌门Actinobacteria 放线菌门Gemmatimonadetes 芽单胞菌门Acidobacteria 酸杆菌门Planctomycetes 浮霉菌门Verrucomicrobia 疣微菌门Chloroflexi 绿弯菌门Nitrospirae 硝化螺旋菌门Firmicutes 厚壁菌门Chlorobi 绿菌门Cyanobacteria 蓝藻细菌门Fibrobacteres 纤维杆菌门Elusimicrobia 迷踪菌门Armatimonadetes 装甲菌门Euryarchaeota 广古菌门Chlamydiae 衣原体Crenarchaeota 泉古菌门Tenericutes 无壁菌门Spirochaetes 螺旋体属AlphaproteobacteriaGammaproteobacteriaBetaproteobacteriaActinobacteriaCytophagiaGemmatimonadetesDeltaproteobacteriaAcidobacteria-6AcidimicrobiiaVerrucomicrobiaeOpitutae NitrospiraThermomicrobiaBacteroidia BacilliChloroflexiAnaerolineae ClostridiaElusimicrobiaKtedonobacteriaThermoplasmataChlamydiiaThaumarchaeotaMollicutesMethanomicrobiaHolophagaeSpirochaetes 纲（ Class ）甲型（α）变形杆菌纲 丙型变形菌纲 β-变形菌纲放线菌门、纲 纤维粘网菌芽单胞菌门、纲 δ-变形菌纲 酸杆菌门 酸微菌纲 疣微菌纲 丰佑菌纲 消化螺菌属 热微菌门 拟杆菌纲 杆菌 绿弯菌门 厌氧绳菌纲 梭状芽胞杆菌 迷踪菌门 纤线杆菌纲 热原体纲 衣原体 奇古菌门 柔膜菌纲 甲烷微菌纲 全噬菌纲 螺旋体属目（Order ）Xanthomonadales 黄单孢菌目Sphingomonadales 鞘脂单胞菌目Burkholderiales 伯克霍尔德氏菌目Actinomycetales 放线菌目Cytophagales 噬纤维菌目Myxococcales 粘球菌目Acidimicrobiales 酸微菌目Rhizobiales 根瘤菌目Sphingobacteriales 鞘脂杆菌目Flavobacteriales 黄杆菌目Caulobacterales 柄杆菌目Rhodospirillales 红螺菌目Alteromonadales 交替单胞菌目Enterobacteriales 肠杆菌目Verrucomicrobiales 疣微菌目Opitutales 丰佑菌目Gemmatimonadales 芽单胞菌目Nitrospirales 硝化螺旋菌目Pseudomonadales 假单胞菌目Planctomycetales 浮霉菌目Bacteroidales 拟杆菌目Syntrophobacterales 互营杆菌目Bacillales 芽孢杆菌目Thiotrichales 硫发菌目Rhodobacterales 红细菌目，红杆菌目Methylophilales 噬甲基菌目Nitrosomonadales 亚硝化单胞菌目Streptophyta 木霉菌目Neisseriales 奈瑟菌目Oceanospirillales 海洋螺菌目Anaeroplasmatales 厌氧原体目Natranaerobiales 盐碱厌氧菌目Halanaerobiales 盐碱厌氧菌目Procabacteriales 普罗卡杆菌目Sphaerobacterales 球杆菌目Methylococcales 甲基球菌目Chlorophyta 绿藻门Holophagales 全噬菌目 Methanosarcinales 八叠球菌目， 球菌目 Bifidobacteriales 双歧杆菌目 Methanomicrobiales 甲烷微菌目 Aeromonadales 气单胞菌目 Spirochaetales 螺旋体目ClostridialesLegionellales Bdellovibrionales Rubrobacterales Caldilineales HerpetosiphonalesChloroflexalesRickettsialesAcidobacterialesMicrococcalesRhodocyclalesStramenopilesChlamydiales Ktedonobacterales 梭菌目 军团菌目 蛭弧菌目 红色杆菌目 暖绳菌目 爬管菌目 绿弯菌目立克次氏体目 酸杆菌目 微球菌目 红环菌目 不等鞭毛类 衣原体目 纤线杆菌目Desulfuromonadales 除硫单胞菌目科（family ）Sphingomonadaceae 鞘脂单胞菌科Xanthomonadaceae 黄单胞菌科Cytophagaceae 噬纤维菌科Oxalobacteraceae 草酸杆菌科Nocardioidaceae 类诺卡氏菌科Comamonadaceae 丛毛单胞菌科Caulobacteraceae 柄杆菌科Sphingobacteriaceae 鞘脂杆菌科Flavobacteriaceae 黄杆菌科Sinobacteraceae 华杆菌科Rhodospirillaceae 红螺旋菌科Hyphomicrobiaceae 生丝微菌科Polyangiaceae 多囊粘菌科Erythrobacteraceae 赤杆菌科Enterobacteriaceae 肠杆菌科Verrucomicrobiaceae 疣微菌科Geodermatophilaceae 地嗜皮菌科Opitutaceae 丰佑菌科Streptomycetaceae 链霉菌科Alteromonadaceae 交替单胞菌科Micrococcaceae 微球菌科Actinosynnemataceae 束丝防线菌科Micromonosporaceae 微单胞菌科Pseudomonadaceae 假单胞菌科Planctomycetaceae 浮霉菌科Nannocystaceae 侏囊菌科Syntrophobacteraceae 互营杆菌科Sporichthyaceae 鱼孢菌科Streptosporangiaceae 链孢囊菌科Bradyrhizobiaceae 慢生根瘤菌科Piscirickettsiaceae 鱼立克次体科Rhizobiaceae 根瘤菌科Microbacteriaceae 微杆菌科Pseudonocardiaceae 假诺卡氏科Bacillaceae 芽孢杆菌科Intrasporangiaceae 间孢囊菌科Nitrospiraceae 硝化螺旋菌科Methylophilaceae 噬甲基菌科Phyllobacteriaceae 叶杆菌科，叶瘤菌科Alcaligenaceae 产碱菌科，产碱杆菌科Nitrosomonadaceae 亚硝化单胞菌科Rhodobacteraceae 红杆菌科Thermomonosporaceae 高温单胞菌科Glycomycetaceae 糖霉菌科Acetobacteraceae 醋杆菌科Mycobacteriaceae 分支杆菌科Hyphomonadaceae 生丝单胞菌科Rubrobacteraceae 红色杆菌科Cystobacteraceae 孢囊杆菌科Caldilineaceae 暖绳菌科Rhodobiaceae 红菌科，红游动菌科Burkholderiaceae 伯克氏菌科Coxiellaceae 柯克斯体科Bdellovibrionaceae 蛭弧菌科Acidobacteriaceae 酸杆菌科Clostridiaceae 梭菌科Paenibacillaceae 类芽孢杆菌科粘液球菌科 纤维素单胞菌科 拜叶林克氏菌科 弗兰克氏菌科 红环菌科 动球菌科 甲基孢囊菌科 诺卡式菌科 绿屈挠菌科 高温放线菌科 葡萄球菌科 环脂酸芽孢杆菌科 拟诺卡式菌科 军团菌科 纤线杆菌科 芽单胞菌科 莫拉氏菌科 棒状杆菌科 副衣原体科 孢囊杆菌亚目 橙单胞菌科 博格利亚湖菌科 甲基杆菌科 立克次氏体 布鲁氏菌科 毛螺菌科 奈瑟氏菌科Halomonadaceae 盐单胞菌科 Bacteriovoracaceae噬菌弧菌科 MyxococcaceaeCellulomonadaceaeBeijerinckiaceaeFrankiaceaeRhodocyclaceaePlanococcaceaeMethylocystaceaeNocardiaceaeChloroflexaceae Thermoactinomycetaceae StaphylococcaceaeAlicyclobacillaceaeNocardiopsaceaeLegionellaceaeKtedonobacteraceaeGemmatimonadaceae MoraxellaceaeCorynebacteriaceaeParachlamydiaceaeCystobacterineaeAurantimonadaceaeBogoriellaceaeMethylobacteriaceaeRickettsiaceaeBrucellaceaeLachnospiraceaeNeisseriaceaeAnaeroplasmataceae 厌氧原体科Peptococcaceae 消化球菌科，冻球菌科Halanaerobiaceae 盐厌氧菌科Peptostreptococcaceae 消化链球菌科Dermabacteraceae 皮杆菌科Procabacteriaceae 普洛卡杆菌科Kineosporiaceae 动孢囊菌科Methylococcaceae 甲基球菌科Syntrophomonadaceae 单胞菌科，互营单胞菌科Oscillochloridaceae 颤绿菌科Chlamydomonadaceae 【植物】衣藻科Holosporaceae 全胞菌科Gordoniaceae 戈登氏菌科Shewanellaceae 希万氏菌科Aeromonadaceae 气单胞菌科Geobacteraceae 地杆菌科Brevibacteriaceae 短杆菌科Porphyromonadaceae 紫单胞菌科Xanthobacteraceae 黄色杆菌科Spirochaetaceae 螺旋体科Propionibacteriaceae 丙酸杆菌科属（Genus ）Janthinobacterium 紫色杆菌属Flavobacterium 黄杆菌属Thermomonas 热单胞菌属Mycoplana 枝动杆菌属Sorangium 堆囊菌属Opitutus 丰佑菌属Sphingomonas 鞘脂单胞菌属Streptomyces 链霉菌属Lysobacter 溶杆菌属Cellvibrio 纤维弧菌属Pedobacter 地杆菌属Aeromicrobium 气微菌属Rhodoplanes 红游动菌属Pseudomonas 假单胞菌属Planctomyces 浮霉状菌属Phenylobacterium 苯基杆菌属Pseudoxanthomonas假黄色单胞菌属Sphingobium 鞘脂菌属Nannocystis 侏囊菌属Variovorax 贪噬菌属Luteimonas 单胞菌属Gemmata 出芽菌属Saccharothrix 糖丝菌属Prosthecobacter 突柄杆菌属Pirellula 小梨型菌属Acidovorax 食酸菌属Lentzea 伦茨氏菌属Streptosporangium 链孢子囊菌属Bacillus 芽孢杆菌属Caulobacter 茎菌属Nocardioides 类诺卡氏菌属Stenotrophomonas 寡养单胞菌Nitrosovibrio 弧菌属Actinoplanes 游动放线菌属Rubrivivax 红肠命菌属Glycomyces 糖霉菌属Agrobacterium 土壤杆菌属Mesorhizobium 中慢生根瘤菌属Agromyces 壤霉菌属Mycobacterium 分枝杆菌属Chondromyces 粒杆粘细菌属Novosphingobium 新鞘氨醇菌属Actinomadura 马杜拉放线菌属Nonomuraea 野野村菌属Catellatospora 链孢菌属Geodermatophilu地嗜皮菌属sNitrospira 硝化螺菌属Pseudonocardia 假诺卡氏菌属Sporocytophaga 生孢噬胞菌属Bdellovibrio 蛭弧菌属Asticcacaulis 不粘杆菌属Sinorhizobium 中华根瘤菌Hydrogenophaga 噬氢菌属Rubrobacter 红色杆菌属Dactylosporangium 指孢囊菌属Sphingobacterium 鞘氨醇杆菌属Brevundimonas 短波单胞菌属Jiangella 姜氏菌属Burkholderia 伯克霍尔德菌Achromobacter 无色杆菌属Hyphomicrobium 生丝微菌属Pedomicrobium 土微菌属Paenibacillus 类芽孢杆菌Phyllobacterium 叶杆菌属Cellulomonas 纤维菌属Pilimelia 水生角质菌属Arthrobacter 节细菌属Saccharopolyspora 糖多孢菌属Myxococcus 粘球菌Amycolatopsis 拟无枝酸菌Phaeospirillum 褐螺菌属Promicromonospora 原小单孢菌属Cellulosimicrobium 纤维菌属Sporichthya 游鱼孢菌属Chloronema 绿线菌属Nocardia 诺卡氏菌属Pimelobacter 脂肪杆菌属Paracoccus 副球菌属Bosea 氏菌属Staphylococcus 葡萄球菌属Planomicrobium 动性微菌属Rhodoferax 红育菌属Rhodobacter 红杆菌属Hymenobacter 薄层菌属Saccharomonospora 糖单胞菌属Cytophaga 噬细胞菌属罗尔斯通菌属Rathayibacter 拉氏杆菌属Gemmatimonas 芽单胞菌属 Alicyclobacillus 杆菌属 Clostridium 梭菌属Corynebacterium 棒状杆菌属 Cryptosporangium 隐孢菌属 Comamonas 丛毛单胞菌属 CandidatusProtochlamydia Asteroleplasma 无甾醇原体属 Sporosarcina 芽孢八叠球菌属 Azospirillum 固氮螺菌属 Magnetospirillum 磁螺菌属 Thermoactinomyces 高温防线菌属 Methylobacterium 甲基杆菌属 Ralstonia CupriavidusCaldilineaAzorhizophilusRhodococcusLegionellaBrevibacillusPolaromonasAcinetobacterGeorgeniaActinocorallia贪铜菌属 暖绳菌属 嗜氮根瘤菌属 红球菌属 军团杆菌 短芽孢杆菌属 单胞菌属 不动杆菌属 乔治菌属 珊瑚状防线菌属 RoseomonasPrauserellaCoprococcusPrauseria玫瑰单胞菌属 氏菌属 粪球菌属 布劳氏菌属Brachybacterium 短状杆菌属Azoarcus 固氮弧菌属Beijerinckia 拜叶林克氏菌属Virgibacillus 枝芽孢菌属Syntrophomonas 互营单胞菌属Geobacillus 土芽孢杆菌属Parachlamydia 副衣原体属Anaeromyxobacter 厌氧粘细菌属Oscillochloris 颤绿菌属Procabacter 普罗卡杆菌属Methanosarcina 甲烷八叠球菌属Microbacterium 微杆菌属Methylophaga 噬甲基菌属Methanoculleus 甲烷囊菌属Methylocaldum 甲基暖菌属Rickettsia 立克次氏体Alkaliphilus 嗜碱菌属Cryobacterium 冷杆菌属Shewanella 希瓦氏菌属Gordonia 戈登氏菌属Psychrobacter 嗜冷杆菌属Serratia 沙雷氏菌属Spirochaeta 螺旋体属Leptolyngbya 鞘丝藻属Caloramator 喜热菌属Dietzia 迪茨氏属Hyphomonas 生丝单胞菌属Yersinia 耶尔森氏鼠疫杆菌属Microlunatus 小月菌属Anaerolinea 厌氧绳菌属Brevibacterium 短杆菌属。

常见微生物的界门纲目科属种中英文对照Modified by JEEP on December 26th, 2020.常见微生物界（Domain）、门(Phylum)、纲（Class）、目(Order)、科(Family)、属(Genus)、种(Species)中英文对照界（Domain）Bacteria细菌Archaea古生菌门（Phylum）Proteobacteria 变形菌门Bacteroidetes 拟杆菌门Actinobacteria 放线菌门Gemmatimonadetes 芽单胞菌门Acidobacteria 酸杆菌门Planctomycetes 浮霉菌门Verrucomicrobia 疣微菌门Chloroflexi 绿弯菌门Nitrospirae 硝化螺旋菌门Firmicutes 厚壁菌门Chlorobi 绿菌门Cyanobacteria 蓝藻细菌门Fibrobacteres 纤维杆菌门Elusimicrobia 迷踪菌门Armatimonadetes 装甲菌门Euryarchaeota 广古菌门Chlamydiae 衣原体Crenarchaeota 泉古菌门Tenericutes 无壁菌门Spirochaetes 螺旋体属Alphaproteobacteria 甲型（α）变形杆菌纲Gammaproteobacteria 丙型变形菌纲Betaproteobacteria β-变形菌纲Actinobacteria 放线菌门、纲Cytophagia 纤维粘网菌Gemmatimonadetes 芽单胞菌门、纲Deltaproteobacteria δ-变形菌纲Acidobacteria-6 酸杆菌门Acidimicrobiia 酸微菌纲Verrucomicrobiae 疣微菌纲Opitutae 丰佑菌纲Nitrospira 消化螺菌属Thermomicrobia 热微菌门Bacteroidia 拟杆菌纲Bacilli 杆菌Chloroflexi 绿弯菌门Anaerolineae 厌氧绳菌纲Clostridia 梭状芽胞杆菌Elusimicrobia 迷踪菌门Ktedonobacteria 纤线杆菌纲Thermoplasmata 热原体纲Chlamydiia 衣原体Thaumarchaeota 奇古菌门Mollicutes 柔膜菌纲Methanomicrobia 甲烷微菌纲Holophagae 全噬菌纲Spirochaetes 螺旋体属Xanthomonadales 黄单孢菌目Sphingomonadales 鞘脂单胞菌目Burkholderiales 伯克霍尔德氏菌目Actinomycetales 放线菌目Cytophagales 噬纤维菌目Myxococcales 粘球菌目Acidimicrobiales 酸微菌目Rhizobiales 根瘤菌目Sphingobacteriales 鞘脂杆菌目Flavobacteriales 黄杆菌目Caulobacterales 柄杆菌目Rhodospirillales 红螺菌目Alteromonadales 交替单胞菌目Enterobacteriales 肠杆菌目Verrucomicrobiales 疣微菌目Opitutales 丰佑菌目Gemmatimonadales 芽单胞菌目Nitrospirales 硝化螺旋菌目Pseudomonadales 假单胞菌目Planctomycetales 浮霉菌目Bacteroidales 拟杆菌目Syntrophobacterales 互营杆菌目Bacillales 芽孢杆菌目Thiotrichales 硫发菌目Rhodobacterales 红细菌目，红杆菌目Methylophilales 噬甲基菌目Nitrosomonadales 亚硝化单胞菌目Streptophyta 木霉菌目Clostridiales 梭菌目Legionellales 军团菌目Bdellovibrionales 蛭弧菌目Rubrobacterales 红色杆菌目Caldilineales 暖绳菌目Herpetosiphonales 爬管菌目Chloroflexales 绿弯菌目Rickettsiales 立克次氏体目Acidobacteriales 酸杆菌目Micrococcales 微球菌目Rhodocyclales 红环菌目Stramenopiles 不等鞭毛类Chlamydiales 衣原体目Ktedonobacterales 纤线杆菌目Neisseriales 奈瑟菌目Oceanospirillales 海洋螺菌目Anaeroplasmatales 厌氧原体目Natranaerobiales 盐碱厌氧菌目Halanaerobiales 盐碱厌氧菌目Procabacteriales 普罗卡杆菌目Sphaerobacterales 球杆菌目Methylococcales 甲基球菌目Chlorophyta 绿藻门Holophagales 全噬菌目Methanosarcinales 八叠球菌目，球菌目Bifidobacteriales 双歧杆菌目Methanomicrobiales 甲烷微菌目Aeromonadales 气单胞菌目Spirochaetales 螺旋体目Desulfuromonadales 除硫单胞菌目科（family）Sphingomonadaceae 鞘脂单胞菌科Xanthomonadaceae 黄单胞菌科Cytophagaceae 噬纤维菌科Oxalobacteraceae 草酸杆菌科Nocardioidaceae 类诺卡氏菌科Comamonadaceae 丛毛单胞菌科Caulobacteraceae 柄杆菌科Sphingobacteriaceae 鞘脂杆菌科Flavobacteriaceae 黄杆菌科Sinobacteraceae 华杆菌科Rhodospirillaceae 红螺旋菌科Hyphomicrobiaceae 生丝微菌科Polyangiaceae 多囊粘菌科Erythrobacteraceae 赤杆菌科Enterobacteriaceae 肠杆菌科Verrucomicrobiaceae 疣微菌科Geodermatophilaceae 地嗜皮菌科Opitutaceae 丰佑菌科Streptomycetaceae 链霉菌科Alteromonadaceae 交替单胞菌科Micrococcaceae 微球菌科Actinosynnemataceae 束丝防线菌科Micromonosporaceae 微单胞菌科Pseudomonadaceae 假单胞菌科Planctomycetaceae 浮霉菌科Nannocystaceae 侏囊菌科Syntrophobacteraceae 互营杆菌科Sporichthyaceae 鱼孢菌科Streptosporangiaceae 链孢囊菌科Bradyrhizobiaceae 慢生根瘤菌科Piscirickettsiaceae 鱼立克次体科Rhizobiaceae 根瘤菌科Microbacteriaceae 微杆菌科Pseudonocardiaceae 假诺卡氏科Bacillaceae 芽孢杆菌科Intrasporangiaceae 间孢囊菌科Nitrospiraceae 硝化螺旋菌科Methylophilaceae 噬甲基菌科Phyllobacteriaceae 叶杆菌科，叶瘤菌科Alcaligenaceae 产碱菌科，产碱杆菌科Nitrosomonadaceae 亚硝化单胞菌科Rhodobacteraceae 红杆菌科Thermomonosporaceae 高温单胞菌科Glycomycetaceae 糖霉菌科Acetobacteraceae 醋杆菌科Mycobacteriaceae 分支杆菌科Hyphomonadaceae 生丝单胞菌科Rubrobacteraceae 红色杆菌科Cystobacteraceae 孢囊杆菌科Caldilineaceae 暖绳菌科Rhodobiaceae 红菌科，红游动菌科Burkholderiaceae 伯克氏菌科Coxiellaceae 柯克斯体科Bdellovibrionaceae 蛭弧菌科Acidobacteriaceae 酸杆菌科Clostridiaceae 梭菌科Paenibacillaceae 类芽孢杆菌科Bacteriovoracaceae 噬菌弧菌科Myxococcaceae 粘液球菌科Cellulomonadaceae 纤维素单胞菌科Beijerinckiaceae 拜叶林克氏菌科Frankiaceae 弗兰克氏菌科Rhodocyclaceae 红环菌科Planococcaceae 动球菌科Methylocystaceae 甲基孢囊菌科Nocardiaceae 诺卡式菌科Chloroflexaceae 绿屈挠菌科Thermoactinomycetaceae 高温放线菌科Staphylococcaceae 葡萄球菌科Alicyclobacillaceae 环脂酸芽孢杆菌科Nocardiopsaceae 拟诺卡式菌科Legionellaceae 军团菌科Ktedonobacteraceae 纤线杆菌科Gemmatimonadaceae 芽单胞菌科Moraxellaceae 莫拉氏菌科Corynebacteriaceae 棒状杆菌科Parachlamydiaceae 副衣原体科Cystobacterineae 孢囊杆菌亚目Aurantimonadaceae 橙单胞菌科Bogoriellaceae 博格利亚湖菌科Methylobacteriaceae 甲基杆菌科Rickettsiaceae 立克次氏体Brucellaceae 布鲁氏菌科Lachnospiraceae 毛螺菌科Neisseriaceae 奈瑟氏菌科Halomonadaceae 盐单胞菌科Anaeroplasmataceae 厌氧原体科Peptococcaceae 消化球菌科，冻球菌科Halanaerobiaceae 盐厌氧菌科Peptostreptococcaceae 消化链球菌科Dermabacteraceae 皮杆菌科Procabacteriaceae 普洛卡杆菌科Kineosporiaceae 动孢囊菌科Methylococcaceae 甲基球菌科Syntrophomonadaceae 单胞菌科，互营单胞菌科Oscillochloridaceae 颤绿菌科Chlamydomonadaceae 【植物】衣藻科Holosporaceae 全胞菌科Gordoniaceae 戈登氏菌科Shewanellaceae 希万氏菌科Aeromonadaceae 气单胞菌科Geobacteraceae 地杆菌科Brevibacteriaceae 短杆菌科Porphyromonadaceae 紫单胞菌科Xanthobacteraceae 黄色杆菌科Spirochaetaceae 螺旋体科Propionibacteriaceae 丙酸杆菌科属（Genus）Janthinobacterium 紫色杆菌属Flavobacterium 黄杆菌属Thermomonas 热单胞菌属Mycoplana 枝动杆菌属Sorangium 堆囊菌属Opitutus 丰佑菌属Sphingomonas 鞘脂单胞菌属Streptomyces 链霉菌属Lysobacter 溶杆菌属Cellvibrio 纤维弧菌属Pedobacter 地杆菌属Aeromicrobium 气微菌属Rhodoplanes 红游动菌属Pseudomonas 假单胞菌属Planctomyces 浮霉状菌属Phenylobacterium 苯基杆菌属Pseudoxanthomonas 假黄色单胞菌属Sphingobium 鞘脂菌属Nannocystis 侏囊菌属Variovorax 贪噬菌属Luteimonas 单胞菌属Gemmata 出芽菌属Saccharothrix 糖丝菌属Prosthecobacter 突柄杆菌属Pirellula 小梨型菌属Acidovorax 食酸菌属Lentzea 伦茨氏菌属Streptosporangium 链孢子囊菌属Bacillus 芽孢杆菌属Caulobacter 茎菌属Nocardioides 类诺卡氏菌属Stenotrophomonas 寡养单胞菌Nitrosovibrio 弧菌属Actinoplanes 游动放线菌属Rubrivivax 红肠命菌属Glycomyces 糖霉菌属Agrobacterium 土壤杆菌属Mesorhizobium 中慢生根瘤菌属Agromyces 壤霉菌属Mycobacterium 分枝杆菌属Chondromyces 粒杆粘细菌属Novosphingobium 新鞘氨醇菌属Actinomadura 马杜拉放线菌属Nonomuraea 野野村菌属Catellatospora 链孢菌属Geodermatophilus 地嗜皮菌属Nitrospira 硝化螺菌属Pseudonocardia 假诺卡氏菌属Sporocytophaga 生孢噬胞菌属Bdellovibrio 蛭弧菌属Asticcacaulis 不粘杆菌属Sinorhizobium 中华根瘤菌Hydrogenophaga 噬氢菌属Rubrobacter 红色杆菌属Dactylosporangium 指孢囊菌属Sphingobacterium 鞘氨醇杆菌属Brevundimonas 短波单胞菌属Jiangella 姜氏菌属Burkholderia 伯克霍尔德菌Achromobacter 无色杆菌属Hyphomicrobium 生丝微菌属Pedomicrobium 土微菌属Paenibacillus 类芽孢杆菌Phyllobacterium 叶杆菌属Cellulomonas 纤维菌属Pilimelia 水生角质菌属Arthrobacter 节细菌属Saccharopolyspora 糖多孢菌属Myxococcus 粘球菌Amycolatopsis 拟无枝酸菌Phaeospirillum 褐螺菌属Promicromonospora 原小单孢菌属Cellulosimicrobium 纤维菌属Sporichthya 游鱼孢菌属Chloronema 绿线菌属Nocardia 诺卡氏菌属Pimelobacter 脂肪杆菌属Paracoccus 副球菌属Bosea 氏菌属Staphylococcus 葡萄球菌属Planomicrobium 动性微菌属Rhodoferax 红育菌属Rhodobacter 红杆菌属Hymenobacter 薄层菌属Saccharomonospora 糖单胞菌属Cytophaga 噬细胞菌属Ralstonia 罗尔斯通菌属Rathayibacter 拉氏杆菌属Gemmatimonas 芽单胞菌属Alicyclobacillus 杆菌属Clostridium 梭菌属Corynebacterium 棒状杆菌属Cupriavidus 贪铜菌属Caldilinea 暖绳菌属Azorhizophilus 嗜氮根瘤菌属Rhodococcus 红球菌属Legionella 军团杆菌Brevibacillus 短芽孢杆菌属Polaromonas 单胞菌属Acinetobacter 不动杆菌属Georgenia 乔治菌属Actinocorallia 珊瑚状防线菌属Cryptosporangium 隐孢菌属Comamonas 丛毛单胞菌属CandidatusProtochlamydia Asteroleplasma 无甾醇原体属Sporosarcina 芽孢八叠球菌属Azospirillum 固氮螺菌属Magnetospirillum 磁螺菌属Roseomonas 玫瑰单胞菌属Prauserella 氏菌属Coprococcus 粪球菌属Prauseria 布劳氏菌属Thermoactinomyces 高温防线菌属Methylobacterium 甲基杆菌属Brachybacterium 短状杆菌属Azoarcus 固氮弧菌属Beijerinckia 拜叶林克氏菌属Virgibacillus 枝芽孢菌属Syntrophomonas 互营单胞菌属Geobacillus 土芽孢杆菌属Parachlamydia 副衣原体属Anaeromyxobacter 厌氧粘细菌属Oscillochloris 颤绿菌属Procabacter 普罗卡杆菌属Methanosarcina 甲烷八叠球菌属Microbacterium 微杆菌属Methylophaga 噬甲基菌属Methanoculleus 甲烷囊菌属Methylocaldum 甲基暖菌属Rickettsia 立克次氏体Alkaliphilus 嗜碱菌属Cryobacterium 冷杆菌属Shewanella 希瓦氏菌属Gordonia 戈登氏菌属Psychrobacter 嗜冷杆菌属Serratia 沙雷氏菌属Spirochaeta 螺旋体属Leptolyngbya 鞘丝藻属Caloramator 喜热菌属Dietzia 迪茨氏属Hyphomonas 生丝单胞菌属Yersinia 耶尔森氏鼠疫杆菌属Microlunatus 小月菌属Anaerolinea 厌氧绳菌属Brevibacterium 短杆菌属。

微生物的分类与命名以啤酒酵母为例，它在分类学上的地位是：界(Kindom)：真菌界门(Phyllum)：真菌门纲(Class)：子囊菌纲目(Order)：内孢霉目科(Family)：内孢霉科属(Genus)：酵母属种(Species)：啤酒酵母（一）、微生物的分类单位界、门、纲、目、科、属、种种是最基本的分类单位每一分类单位之后可有亚门、亚纲、亚目、亚科...种的概念定义：种是一个基本分类单位，是一大群表型特征高度相似、亲缘关系极其接近、与同属内其他种有明显差异的菌株的总称。

在微生物中，一个种只能用该种内的一个典型菌株作为具体标本，它就是该种的模式种。

新种：sp.nov.或nov. sp.，新被鉴定的种发表时应在其学名后标上sp.nov.的符号，新种发表前应将其模式菌株的培养物存放在一个永久性的保藏机构，并应允许人们从中取得。

1. 种（species）：是一个基本分类单位；是一大群表型特征高度相似、亲缘关系极其接近，与同属内其他种有明显差别的菌株的总称。

①菌株（strain）: 表示任何由一个独立分离的单细胞繁殖而成的纯种群体及其一切后代（起源于共同祖先并保持祖先特性的一组纯种后代菌群）。

因此，一种微生物的不同来源的纯培养物均可称为该菌种的一个菌株。

菌株强调的是遗传型纯的谱系。

例如：大肠埃希氏杆菌的两个菌株：Escherichia coli B 和Escherichia coli K12★菌株的表示法：★如果说种是分类学上的基本单位，那末菌株实际上是应用的基本单位，因为同一菌种的不同菌株在产酶上种类或代谢物产量上会有很大的不同和差别！微生物的分类单位-2②亚种(subspecies）或变种(variety)：为种内的再分类。

当某一个种内的不同菌株存在少数明显而稳定的变异特征或遗传形状，而又不足以区分成新种时，可以将这些菌株细分成两个或更多的小的分类单元——亚种。

变种是亚种的同义词，因“变种”一词易引起词义上的混淆，从1976年后，不在使用变种一词。

常见微生物界（Domain）、门(Phylum)、纲（Class）、目(Order)、科(Family)、属(Genus)、种(Species)中英文对照界（Domain）Bacteria细菌Archaea古生菌门（Phylum）Proteobacteria 变形菌门Bacteroidetes 拟杆菌门Actinobacteria 放线菌门Gemmatimonadetes 芽单胞菌门Acidobacteria 酸杆菌门Planctomycetes 浮霉菌门Verrucomicrobia 疣微菌门Chloroflexi 绿弯菌门Nitrospirae 硝化螺旋菌门Firmicutes 厚壁菌门Chlorobi 绿菌门Cyanobacteria 蓝藻细菌门Fibrobacteres 纤维杆菌门Elusimicrobia 迷踪菌门Armatimonadetes 装甲菌门Euryarchaeota 广古菌门Chlamydiae 衣原体Crenarchaeota 泉古菌门Tenericutes 无壁菌门Spirochaetes 螺旋体属纲（Class）Alphaproteobacteria 甲型（α）变形杆菌纲Gammaproteobacteria 丙型变形菌纲Betaproteobacteria β-变形菌纲Actinobacteria 放线菌门、纲Cytophagia 纤维粘网菌Gemmatimonadetes 芽单胞菌门、纲Deltaproteobacteria δ-变形菌纲Acidobacteria-6 酸杆菌门Acidimicrobiia 酸微菌纲Verrucomicrobiae 疣微菌纲Opitutae 丰佑菌纲Nitrospira 消化螺菌属Thermomicrobia 热微菌门Bacteroidia 拟杆菌纲Bacilli 杆菌Chloroflexi 绿弯菌门Anaerolineae 厌氧绳菌纲Clostridia 梭状芽胞杆菌Elusimicrobia 迷踪菌门Ktedonobacteria 纤线杆菌纲Thermoplasmata 热原体纲Chlamydiia 衣原体Thaumarchaeota 奇古菌门Mollicutes 柔膜菌纲Methanomicrobia 甲烷微菌纲Holophagae 全噬菌纲Spirochaetes 螺旋体属目（Order）Xanthomonadales 黄单孢菌目Sphingomonadales 鞘脂单胞菌目Burkholderiales 伯克霍尔德氏菌目Actinomycetales 放线菌目Cytophagales 噬纤维菌目Myxococcales 粘球菌目Acidimicrobiales 酸微菌目Rhizobiales 根瘤菌目Sphingobacteriales 鞘脂杆菌目Flavobacteriales 黄杆菌目Caulobacterales 柄杆菌目Rhodospirillales 红螺菌目Alteromonadales 交替单胞菌目Enterobacteriales 肠杆菌目Verrucomicrobiales 疣微菌目Opitutales 丰佑菌目Gemmatimonadales 芽单胞菌目Nitrospirales 硝化螺旋菌目Pseudomonadales 假单胞菌目Planctomycetales 浮霉菌目Bacteroidales 拟杆菌目Syntrophobacterales 互营杆菌目Bacillales 芽孢杆菌目Thiotrichales 硫发菌目Rhodobacterales 红细菌目，红杆菌目Methylophilales 噬甲基菌目Nitrosomonadales 亚硝化单胞菌目Streptophyta 木霉菌目Clostridiales 梭菌目Legionellales 军团菌目Bdellovibrionales 蛭弧菌目Rubrobacterales 红色杆菌目Caldilineales 暖绳菌目Herpetosiphonales 爬管菌目Chloroflexales 绿弯菌目Rickettsiales 立克次氏体目Acidobacteriales 酸杆菌目Micrococcales 微球菌目Rhodocyclales 红环菌目Stramenopiles 不等鞭毛类Chlamydiales 衣原体目Ktedonobacterales 纤线杆菌目Neisseriales 奈瑟菌目Oceanospirillales 海洋螺菌目Anaeroplasmatales 厌氧原体目Natranaerobiales 盐碱厌氧菌目Halanaerobiales 盐碱厌氧菌目Procabacteriales 普罗卡杆菌目Sphaerobacterales 球杆菌目Methylococcales 甲基球菌目Chlorophyta 绿藻门Holophagales 全噬菌目Methanosarcinales 八叠球菌目，球菌目Bifidobacteriales 双歧杆菌目Methanomicrobiales 甲烷微菌目Aeromonadales 气单胞菌目Spirochaetales 螺旋体目Desulfuromonadales 除硫单胞菌目科（family）Sphingomonadaceae 鞘脂单胞菌科Xanthomonadaceae 黄单胞菌科Cytophagaceae 噬纤维菌科Oxalobacteraceae 草酸杆菌科Nocardioidaceae 类诺卡氏菌科Comamonadaceae 丛毛单胞菌科Caulobacteraceae 柄杆菌科Sphingobacteriaceae 鞘脂杆菌科Flavobacteriaceae 黄杆菌科Sinobacteraceae 华杆菌科Rhodospirillaceae 红螺旋菌科Hyphomicrobiaceae 生丝微菌科Polyangiaceae 多囊粘菌科Erythrobacteraceae 赤杆菌科Enterobacteriaceae 肠杆菌科Verrucomicrobiaceae 疣微菌科Geodermatophilaceae 地嗜皮菌科Opitutaceae 丰佑菌科Streptomycetaceae 链霉菌科Alteromonadaceae 交替单胞菌科Micrococcaceae 微球菌科Actinosynnemataceae 束丝防线菌科Micromonosporaceae 微单胞菌科Pseudomonadaceae 假单胞菌科Planctomycetaceae 浮霉菌科Nannocystaceae 侏囊菌科Syntrophobacteraceae 互营杆菌科Sporichthyaceae 鱼孢菌科Streptosporangiaceae 链孢囊菌科Bradyrhizobiaceae 慢生根瘤菌科Piscirickettsiaceae 鱼立克次体科Rhizobiaceae 根瘤菌科Microbacteriaceae 微杆菌科Pseudonocardiaceae 假诺卡氏科Bacillaceae 芽孢杆菌科Intrasporangiaceae 间孢囊菌科Nitrospiraceae 硝化螺旋菌科Methylophilaceae 噬甲基菌科Phyllobacteriaceae 叶杆菌科，叶瘤菌科Alcaligenaceae 产碱菌科，产碱杆菌科Nitrosomonadaceae 亚硝化单胞菌科Rhodobacteraceae 红杆菌科Thermomonosporaceae 高温单胞菌科Glycomycetaceae 糖霉菌科Acetobacteraceae 醋杆菌科Mycobacteriaceae 分支杆菌科Hyphomonadaceae 生丝单胞菌科Rubrobacteraceae 红色杆菌科Cystobacteraceae 孢囊杆菌科Caldilineaceae 暖绳菌科Rhodobiaceae 红菌科，红游动菌科Burkholderiaceae 伯克氏菌科Coxiellaceae 柯克斯体科Bdellovibrionaceae 蛭弧菌科Acidobacteriaceae 酸杆菌科Clostridiaceae 梭菌科Paenibacillaceae 类芽孢杆菌科Bacteriovoracaceae 噬菌弧菌科Myxococcaceae 粘液球菌科Cellulomonadaceae 纤维素单胞菌科Beijerinckiaceae 拜叶林克氏菌科Frankiaceae 弗兰克氏菌科Rhodocyclaceae 红环菌科Planococcaceae 动球菌科Methylocystaceae 甲基孢囊菌科Nocardiaceae 诺卡式菌科Chloroflexaceae 绿屈挠菌科Thermoactinomycetaceae 高温放线菌科Staphylococcaceae 葡萄球菌科Alicyclobacillaceae 环脂酸芽孢杆菌科Nocardiopsaceae 拟诺卡式菌科Legionellaceae 军团菌科Ktedonobacteraceae 纤线杆菌科Gemmatimonadaceae 芽单胞菌科Moraxellaceae 莫拉氏菌科Corynebacteriaceae 棒状杆菌科Parachlamydiaceae 副衣原体科Cystobacterineae 孢囊杆菌亚目Aurantimonadaceae 橙单胞菌科Bogoriellaceae 博格利亚湖菌科Methylobacteriaceae 甲基杆菌科Rickettsiaceae 立克次氏体Brucellaceae 布鲁氏菌科Lachnospiraceae 毛螺菌科Neisseriaceae 奈瑟氏菌科Halomonadaceae 盐单胞菌科Anaeroplasmataceae 厌氧原体科Peptococcaceae 消化球菌科，冻球菌科Halanaerobiaceae 盐厌氧菌科Peptostreptococcaceae 消化链球菌科Dermabacteraceae 皮杆菌科Procabacteriaceae 普洛卡杆菌科Kineosporiaceae 动孢囊菌科Methylococcaceae 甲基球菌科Syntrophomonadaceae 单胞菌科，互营单胞菌科Oscillochloridaceae 颤绿菌科Chlamydomonadaceae 【植物】衣藻科Holosporaceae 全胞菌科Gordoniaceae 戈登氏菌科Shewanellaceae 希万氏菌科Aeromonadaceae 气单胞菌科Geobacteraceae 地杆菌科Brevibacteriaceae 短杆菌科Porphyromonadaceae 紫单胞菌科Xanthobacteraceae 黄色杆菌科Spirochaetaceae 螺旋体科Propionibacteriaceae 丙酸杆菌科属（Genus）Janthinobacterium 紫色杆菌属Flavobacterium 黄杆菌属Thermomonas 热单胞菌属Mycoplana 枝动杆菌属Sorangium 堆囊菌属Opitutus 丰佑菌属Sphingomonas 鞘脂单胞菌属Streptomyces 链霉菌属Lysobacter 溶杆菌属Cellvibrio 纤维弧菌属Pedobacter 地杆菌属Aeromicrobium 气微菌属Rhodoplanes 红游动菌属Pseudomonas 假单胞菌属Planctomyces 浮霉状菌属Phenylobacterium 苯基杆菌属Pseudoxanthomonas 假黄色单胞菌属Sphingobium 鞘脂菌属Nannocystis 侏囊菌属Variovorax 贪噬菌属Luteimonas 单胞菌属Gemmata 出芽菌属Saccharothrix 糖丝菌属Prosthecobacter 突柄杆菌属Pirellula 小梨型菌属Acidovorax 食酸菌属Lentzea 伦茨氏菌属Streptosporangium 链孢子囊菌属Bacillus 芽孢杆菌属Caulobacter 茎菌属Nocardioides 类诺卡氏菌属Stenotrophomonas 寡养单胞菌Nitrosovibrio 弧菌属Actinoplanes 游动放线菌属Rubrivivax 红肠命菌属Glycomyces 糖霉菌属Agrobacterium 土壤杆菌属Mesorhizobium 中慢生根瘤菌属Agromyces 壤霉菌属Chondromyces 粒杆粘细菌属Novosphingobium 新鞘氨醇菌属Actinomadura 马杜拉放线菌属Nonomuraea 野野村菌属Catellatospora 链孢菌属Geodermatophilus 地嗜皮菌属Nitrospira 硝化螺菌属Pseudonocardia 假诺卡氏菌属Sporocytophaga 生孢噬胞菌属Bdellovibrio 蛭弧菌属Asticcacaulis 不粘杆菌属Sinorhizobium 中华根瘤菌Hydrogenophaga 噬氢菌属Rubrobacter 红色杆菌属Dactylosporangium 指孢囊菌属Sphingobacterium 鞘氨醇杆菌属Brevundimonas 短波单胞菌属Jiangella 氏菌属Burkholderia 伯克霍尔德菌Hyphomicrobium 生丝微菌属Pedomicrobium 土微菌属Paenibacillus 类芽孢杆菌Phyllobacterium 叶杆菌属Cellulomonas 纤维菌属Pilimelia 水生角质菌属Arthrobacter 节细菌属Saccharopolyspora 糖多孢菌属Myxococcus 粘球菌Amycolatopsis 拟无枝酸菌Phaeospirillum 褐螺菌属Promicromonospora 原小单孢菌属Cellulosimicrobium 纤维菌属Sporichthya 游鱼孢菌属Chloronema 绿线菌属Nocardia 诺卡氏菌属Pimelobacter 脂肪杆菌属Paracoccus 副球菌属Bosea 氏菌属Staphylococcus 葡萄球菌属Planomicrobium 动性微菌属Rhodoferax 红育菌属Rhodobacter 红杆菌属Hymenobacter 薄层菌属Saccharomonospora 糖单胞菌属Cytophaga 噬细胞菌属Ralstonia 罗尔斯通菌属Rathayibacter 拉氏杆菌属Gemmatimonas 芽单胞菌属Alicyclobacillus 杆菌属Clostridium 梭菌属Corynebacterium 棒状杆菌属Cupriavidus 贪铜菌属Caldilinea 暖绳菌属Azorhizophilus 嗜氮根瘤菌属Rhodococcus 红球菌属Legionella 军团杆菌Brevibacillus 短芽孢杆菌属Polaromonas 单胞菌属Acinetobacter 不动杆菌属Georgenia 乔治菌属Actinocorallia 珊瑚状防线菌属Cryptosporangium 隐孢菌属Comamonas 丛毛单胞菌属CandidatusProtochlamydia Asteroleplasma 无甾醇原体属Sporosarcina 芽孢八叠球菌属Azospirillum 固氮螺菌属Magnetospirillum 磁螺菌属Roseomonas 玫瑰单胞菌属Prauserella 氏菌属Coprococcus 粪球菌属Prauseria 布劳氏菌属Thermoactinomyces 高温防线菌属Methylobacterium 甲基杆菌属Brachybacterium 短状杆菌属Azoarcus 固氮弧菌属Beijerinckia 拜叶林克氏菌属Virgibacillus 枝芽孢菌属Syntrophomonas 互营单胞菌属Geobacillus 土芽孢杆菌属Parachlamydia 副衣原体属Anaeromyxobacter 厌氧粘细菌属Oscillochloris 颤绿菌属Procabacter 普罗卡杆菌属Methanosarcina 甲烷八叠球菌属Microbacterium 微杆菌属Methylophaga 噬甲基菌属Methanoculleus 甲烷囊菌属Methylocaldum 甲基暖菌属Rickettsia 立克次氏体Alkaliphilus 嗜碱菌属Cryobacterium 冷杆菌属Shewanella 希瓦氏菌属Gordonia 戈登氏菌属Psychrobacter 嗜冷杆菌属Serratia 沙雷氏菌属Spirochaeta 螺旋体属Leptolyngbya 鞘丝藻属Caloramator 喜热菌属Dietzia 迪茨氏属Hyphomonas 生丝单胞菌属Yersinia 耶尔森氏鼠疫杆菌属Microlunatus 小月菌属Anaerolinea 厌氧绳菌属Brevibacterium 短杆菌属。