启动子活性质粒构建步骤
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家兔β干扰素启动子质粒的构建及其启动子活性鉴定细胞中的转录启动子是调控基因表达的关键元件之一。
启动子质粒是指带有目标基因的启动子序列和其他所需的功能序列的质粒。
启动子质粒的构建和启动子活性鉴定对于研究基因调控非常重要。
本文将介绍家兔β干扰素(Rabbit β-interferon,rbIFN-β)启动子质粒的构建及其启动子活性鉴定的方法。
我们需要准备实验所需的材料和试剂。
材料包括家兔rbIFN-β基因片段、质粒DNA、核酸酶、内切酶等。
试剂包括T4 DNA连接酶、DNA外切酶、DNA连接酶、DNA聚合酶、酶切缓冲液、T4 DNA连接酶缓冲液、PCR扩增试剂盒、琼脂糖等。
利用PCR扩增技术从家兔基因组中扩增rbIFN-β启动子序列。
设计合适的引物,将rbIFN-β启动子序列扩增出来。
扩增条件根据实验室设置进行优化。
将扩增得到的rbIFN-β启动子序列通过琼脂糖凝胶电泳检测,确认扩增产物的大小和纯度。
将扩增得到的rbIFN-β启动子序列和质粒DNA进行酶切反应。
选取适当的内切酶对rbIFN-β启动子序列和质粒DNA进行酶切。
根据具体实验设计,选择合适的切位点和酶切时间。
反应结束后,通过琼脂糖凝胶电泳进行验证,确认酶切效果。
将连接后的质粒进行菌落PCR筛选。
选取有一定规模的合适细菌菌落,取出细菌液进行PCR扩增,利用rbIFN-β启动子序列特异性引物进行筛选,识别带有rbIFN-β启动子序列的质粒。
对筛选出的质粒进行测序验证。
将质粒DNA进行提取纯化,发送至商业测序公司进行测序。
通过测序结果验证构建的rbIFN-β启动子质粒的准确性和完整性。
启动子活性鉴定的方法有多种,其中常用的方法有荧光素酶报告基因法。
将构建好的rbIFN-β启动子质粒和荧光素酶报告基因质粒共转染至细胞中,培养一定时间后,利用荧光素酶检测试剂盒检测转染细胞内的荧光素酶活性。
荧光素酶活性的强弱反映了启动子的活性。
可以设置对照组和空白对照组,进行比较和分析。
利用mCherry荧光蛋白报告布鲁氏菌VirB启动子体外活性质粒的构建及应用利用mCherry荧光蛋白报告布鲁氏菌VirB启动子体外活性质粒的构建及应用摘要:布鲁氏菌(Brucella)是一种致病性革兰氏阴性菌,可引起布鲁氏病等严重传染病。
VirB启动子是布鲁氏菌中的一个重要调控元件,参与维持菌体内外环境之间的平衡。
为了研究布鲁氏菌VirB启动子的活性及调控机制,我们构建了一个能够报告VirB启动子活性的体外活性质粒。
本文详细介绍了构建mCherry报告基因所需的实验步骤,并进一步验证了该体外活性质粒在细菌中的应用性。
关键词:布鲁氏菌;VirB启动子;mCherry;体外活性质粒引言布鲁氏菌是一种革兰氏阴性细菌,可引起布鲁氏病等严重传染病,对人类和动物的健康造成了严重威胁。
因此,对布鲁氏菌的生物学特性及其致病机制的研究具有重要意义。
VirB 启动子是布鲁氏菌中的一个重要调控元件,参与维持菌体内外环境之间的平衡。
因此,研究VirB启动子的活性及调控机制有助于我们更深入地了解布鲁氏菌的生物学特性。
目的本文旨在构建一个能够报告布鲁氏菌VirB启动子活性的体外活性质粒,用于研究VirB启动子的调控机制及相关生物学功能。
材料与方法1. 实验菌株与质粒我们选择布鲁氏菌作为实验菌株,并使用质粒进行转染。
2. VirB启动子片段的克隆与构建使用PCR方法扩增布鲁氏菌基因组中的VirB启动子片段,然后将其克隆到适当的质粒载体中。
3. mCherry报告基因的构建与连接使用PCR方法扩增mCherry基因序列,并与构建好的质粒载体进行连接。
4. 体外转染及荧光观察将构建好的质粒转染至布鲁氏菌中,然后观察mCherry荧光蛋白的表达情况。
结果与讨论我们成功地构建了一个能够报告布鲁氏菌VirB启动子活性的体外活性质粒。
通过将VirB启动子片段克隆到质粒载体中,并连接mCherry报告基因,我们实现了VirB启动子活性的可视化。
3.3.4 α-MHC-Pop1-hGH转基因载体的构建根据体外结果的提示,我们试图构建Pop1在体内的过表达系统,于是,我们接下来想研制Pop1在心脏中特异性过表达的转基因小鼠。
α-MHC是心肌细胞特异性表达的标志分子,利用其心脏特异性启动子元件能实现Pop1心脏中特异性表达。
我们设计构建了Pop1转基因载体如图3-4A所示,其具体过程为:以小鼠基因组DNA 为模板扩增获得小鼠Pop1,引物为:Pop1-CDS-S:5’ GTCGACCCAGACAAGTCCCAGAAA 3'Pop1-CDS-A:5’ GAATTCACACCTTCCGTCTTGGTA 3’PCR 扩增条件为:94℃预变性3 min;94℃变性30s,55℃复性30s,72℃延伸1 min,30个循环;72℃延伸10 min,4℃保温。
目的片段,克隆入T 载体中,测序结果确认序列准确无误后亚克隆至转基因的骨架载体。
通过多种酶切显示,Pop1转基因载体的酶切图形与预期相符。
说明Pop1转基因载体构建成功(图3-4B)图3-4、α-MHC-Pop1-hGH转基因载体结构示意图及酶切鉴定图A.α-MHC-Pop1-hGH转基因载体结构示意图;B.转基因载体酶切鉴定图.第二部分: 拟通过心脏特异性GEFT敲除小鼠模型研究在病理性心肌肥大的过程当中,GEFT基因在组织学、功能学以及细胞生物学方面的作用。
申请人对野生型小鼠以及GEFT心脏特异性敲除小鼠,进行病理刺激以诱发其心肌肥厚,然后利用超声心动图检测GEFT对心肌肥厚造成的。
等功能学指标的变化有无影响,然后取心脏组织进行石蜡包埋切片,利用HE染色、Masson三色、免疫组化以及电镜等方式,探索GEFT敲除对心肌肥厚过程当中,在组织形态、纤维沉积、细胞尺寸、细胞内在结构的变化中的作用。
同时分离野生型和敲除型新生小鼠原代心肌细胞,以及分离大鼠原代心肌细胞并通过腺病毒介导GEFT过表达,然后通过肥大刺激诱导心肌细胞肥大生长,评价GEFT对于心肌肥厚的影响是否为心肌细胞自主性的。
抗体质粒构建抗体在免疫学研究和生物医药领域发挥着重要作用。
为了更好地应对疾病和提高治疗效果,研究人员不断探索新的抗体构建方法。
其中,抗体质粒构建技术无疑是一种重要的手段。
本文将介绍抗体质粒构建的基本原理、步骤和应用,并展望其在未来的发展前景。
一、抗体质粒构建的基本原理抗体质粒构建是将目标抗体基因导入到质粒中,通过质粒在细胞中的表达,实现抗体的生产。
基本步骤包括:选择合适的质粒载体、导入目标抗体基因、质粒转染入宿主细胞、筛选和鉴定阳性克隆。
选择合适的质粒载体通常考虑以下因素:适当的载体大小、选择性抗生素标记、高效的启动子和蛋白表达信号。
其中,启动子和蛋白表达信号往往来自高表达的内源基因或病毒,可以确保抗体高水平的表达。
导入目标抗体基因主要有两种方法:PCR扩增和合成基因。
PCR扩增是将抗体的可变区和恒定区分别扩增,然后进行测序和克隆。
合成基因则是将抗体基因序列经过人工合成后导入质粒。
质粒转染常用的方法有热激转染、电激转染和病毒载体介导转染。
其中,病毒载体介导转染由于其高转染效率和稳定性,被广泛应用于抗体质粒构建。
筛选和鉴定阳性克隆主要依靠抗体的特异性和活性检测。
典型的方法有ELISA、Western blot和免疫组化。
二、抗体质粒构建的步骤1. 选择适合的质粒载体:根据实验需求和抗体特点,选择合适的质粒载体。
常用的载体有pCDNA3.1、pET等。
2. 导入目标抗体基因:通过PCR扩增或基因合成方式获得目标抗体基因序列。
然后将其克隆到所选质粒载体的多克隆位点中。
3. 质粒转染入宿主细胞:选择合适的宿主细胞进行质粒转染。
转染方法包括热激转染、电激转染和病毒载体介导转染。
4. 筛选和鉴定阳性克隆:利用适当的检测方法(如ELISA、Western blot等)对转染后的细胞进行筛选和鉴定。
5. 扩增和纯化阳性克隆:将筛选出的阳性克隆进行扩增培养,并进行抗体的纯化和浓缩。
三、抗体质粒构建的应用抗体质粒构建技术在生物医药领域具有广泛应用。
一、质粒的构建:启动子的选择启动子的选择对于转染基因的有效表达是非常重要的。
对于转染过程本身虽然无甚影响,但是对转染结果却有着微妙的影响。
启动子可分为2大类:诱导型启动子是比较精明的,平时歇着,一旦接到诱导信号指示就马上开工干活儿。
而组成型启动子比较老实的,就是从头到尾不停干活从不闲着的那种——比如我们很熟悉的CMV启动子啊,SV40啊,pMC1啊,PGK启动子啊等等。
获得高转染活性所需选择的启动子依赖于选用的细胞系和要表达的蛋白。
CMV启动子在大多数细胞类型中可以获得高表达活性。
在BHK-21中,CMV 启动子活性比其他启动子如SV40和RSV都要高。
但这三种病毒启动子在T细胞来源的细胞系,如Jurkat中组成表达水平较低。
转染后在培养基中加入PHA-L和PMA可以激活Jurkat细胞中CMV启动子,而单PMA就足以激活KG1和K562(人骨髓瘤白细胞)中的CMV启动子。
SV40启动子的表达在含有大T抗原(存在于COS-1和COS-7)时会提高,因为大T抗原可以刺激染色体外的合成。
一个强悍的高表达组成型启动子是我们做表达所求之不得的,但是对于转染本身来说却不一定好——因为任何持续过高表达外源基因都可能带来某种程度的细胞毒性,影响细胞生长——如果外源基因本身对细胞生长有毒,那更完蛋了,你很可能筛不到转染成功的细胞株,更别提稳定转染了——因为过量表达本身可能已经害死了那个转染了的细胞,没转染的细胞又死于筛选压力。
这种时候一个不那么“能干”的启动子可能更适合一些。
如果你曾经遇到原因不明的转染失败案例,会不会是这个原因呢?过犹不及就是这个道理咯。
诱导型启动子对于转染来说,特别是稳定转染,可能是更好的选择。
它使得目的基因的表达可以受到我们的调控——转染的时候不表达,筛选稳定表达株后再诱导表达,使得表达有毒性的基因或者精确分析表达产物的生物学效应成为可能。
多数诱导型启动子在接受某种信号后“打开开关”开始工作,也有的相反,在缺失某种信号后打开开关。
启动子活性质粒构建步骤启动子活性质粒构建步骤1、PCR扩增目的片段(50ul体系如下)Mix酶:50% (25ul)上下游引物:各2% (各1ul)模板: 3% (1.5ul)水:补足体系(21.5ul)2、取3.5ul用于跑胶检测,若条带大小正确则切胶回收否则重新PCR4、剩下体系切胶回收(标注:某启动子如0559p及日期)5、回收完之后,取3.5ul用于跑胶检测6、如果有则将回收的目的片段连T载,体系如下(10ul):SolutionI: 5ul,目的片段:4.5ul,PMD19-T(T载):0.5ul16℃连接3-4个小时或者过夜7、连接产物转化至DH5α感受态细胞,涂布氨苄(Amp)抗性LB固体平板8、12-16小时后看平板有没有长出单菌落,如有挑2-5个转化子(体系:3ml氨苄抗性LB液体培养基)9、待菌摇起来(4-6h)后菌液PCR验证转化子是否正确,剩下菌液放入冰箱(15ul体系)Mix酶:50% (7.5ul)上下游引物:各2% (各0.3ul)模板: 3% (0.45ul)水:补足体系(6.45ul)10、如果正确,送2-3个转化子测序11、测序正确后取1ml保菌(保菌管上标注:DH5α,T-启动子,如DH5α,T-0559p及日期),剩下2ml抽质粒12、抽质粒(标注:T-启动子,如T-0559p及日期)13、取3.5ul用于跑胶检测,如果质量抽到了则进行下一步14、XbaI、HindIII双酶切T-启动子,同时XbaI、HindIII双酶切PMV261-hsp60-lacz质粒(如果PMV261-hsp60-lacz质粒没有了,则应从“DH5α,PMV261-hsp60-lacz”保菌管里接菌抽质粒,然后再切)酶切体系如下(50ul):质粒:25ulM buffer:5ulXbaI:1.25ul HindIII:1.25ul水补足体系:17ul37℃酶切4-6个小时或者过夜(注:不同的酶用的buffer不一样,而且有些酶还需要加BSA)15、酶切好后先取3.5ul跑胶检测,看有没有切开(即是否有两条带,T载大概在2700bp左右,目的片段大小各异,一般在300-600bp)16、如果切开了将剩下的进行切胶回收,回收目的片段(标注:XH启动子,如:XH-0559p及日期)17、回收好之后取3.5ul跑胶检测,看有没有回收到18、同样,酶切的PMV261-hsp60-lacz也进行上述处理,酶切后的PMV261-hsp60-lacz也有两条带,分别为:PMV261-lacz质粒大小在4200bp左右;hsp60启动子片段大小在200-300bp左右。
家兔β干扰素启动子质粒的构建及其启动子活性鉴定β干扰素是一种重要的抗病毒细胞因子,其启动子序列对于β干扰素的表达调控起着关键作用。
本文主要针对家兔β干扰素启动子进行质粒的构建以及启动子活性的鉴定工作。
我们从家兔基因组中扩增得到了β干扰素启动子的序列。
通过PCR扩增,我们利用特定引物扩增出约500bp的启动子序列。
随后,将PCR产物进行电泳检测,确保启动子序列的扩增成功。
将扩增得到的启动子序列进行测序验证。
接下来,我们将家兔β干扰素启动子序列克隆到表达载体质粒中。
将质粒载体进行线性化处理。
然后,将启动子序列与线性化的质粒进行连接。
通过连接试剂盒进行连接反应,并进行高效转化,将连接产物转化到E.coli DH5α菌株中。
随后,通过菌落PCR和限制酶切分析,筛选出带有家兔β干扰素启动子的质粒。
为了验证构建的质粒是否具有启动子活性,我们选择了哺乳动物细胞株进行转染实验。
将构建的质粒提取并纯化。
然后,将质粒转染到目标细胞株中,并设置空质粒和阳性对照组。
经过一定时间后,收集细胞并提取总RNA。
随后,利用逆转录酶将RNA转录成cDNA。
通过荧光定量PCR检测目标基因表达的量。
实验结果显示,与空质粒组相比,家兔β干扰素启动子质粒组中的目标基因表达量明显增加,且远高于阳性对照组。
这表明,家兔β干扰素启动子质粒具有较高的启动子活性。
我们成功地构建了家兔β干扰素启动子质粒,并通过转染实验验证了其启动子活性。
这项研究为深入研究家兔β干扰素的调控机制提供了有力的工具,也为进一步挖掘家兔免疫应答机制提供了新的思路。
转录因子和启动子实验步骤转录因子和启动子是基因表达调控的重要组成部分,通过实验可以研究转录因子与启动子之间的相互作用以及基因的调控机制。
以下是进行转录因子和启动子实验的一般步骤:1. 确定研究对象:首先需要确定研究对象,包括要研究的基因、转录因子和启动子的信息。
可以通过文献调研或数据库查询获得相关信息。
2. 提取DNA:从细胞或组织中提取DNA,可以使用基因组DNA或质粒DNA 进行实验。
DNA的质量和浓度对后续实验结果影响很大,因此提取的DNA质量要保证。
3. 克隆启动子序列:将要研究的启动子序列进行PCR扩增,然后进行克隆到适当的载体中,如质粒载体或报告基因载体。
可以通过限制性内切酶酶切和连接酶连接的方法进行启动子序列的克隆。
4. 选择适当的细胞系:选择适当的细胞系用于实验,可以选择与研究对象相关的细胞系或转染能力强的细胞系。
5. 转染实验:将转录因子的表达载体转染到细胞中,可以选择瞬时转染或稳定转染的方法。
转染后细胞需进行培养以确保转录因子的表达。
6. 检测启动子活性:使用报告基因或荧光素酶等方法检测启动子的活性,可以通过荧光素酶报告基因检测启动子的转录活性。
7. 蛋白质与DNA相互作用实验:可以通过染色质免疫共沉淀(ChIP)实验等方法研究转录因子与启动子之间的相互作用,从而揭示基因的调控机制。
8. 数据分析:对实验结果进行统计分析和解读,可以使用生物信息学工具对数据进行处理和分析,如启动子的序列分析、转录因子的结合位点预测等。
9. 结果呈现:将实验结果进行图表展示,撰写实验报告或论文,可以向科学期刊投稿或在学术会议上进行分享。
总的来说,转录因子和启动子的实验步骤包括确定研究对象、提取DNA、克隆启动子序列、转染实验、检测启动子活性、蛋白质与DNA相互作用实验、数据分析和结果呈现等步骤,通过这些实验可以深入研究基因的调控机制。
希望以上内容对您的研究有所帮助。
启动子活性质粒构建步骤
1、PCR扩增目的片段(50ul体系如下)
Mix酶:50% (25ul)
上下游引物:各2% (各1ul)
模板: 3% (1.5ul)
水:补足体系(21.5ul)
2、取3.5ul用于跑胶检测,若条带大小正确则切胶回收否则重新PCR
4、剩下体系切胶回收(标注:某启动子如0559p及日期)
5、回收完之后,取3.5ul用于跑胶检测
6、如果有则将回收的目的片段连T载,体系如下(10ul):
SolutionI: 5ul,
目的片段:4.5ul,
PMD19-T(T载):0.5ul
16℃连接3-4个小时或者过夜
7、连接产物转化至DH5α感受态细胞,涂布氨苄(Amp)抗性LB
固体平板
8、12-16小时后看平板有没有长出单菌落,如有挑2-5个转化子(体
系:3ml氨苄抗性LB液体培养基)
9、待菌摇起来(4-6h)后菌液PCR验证转化子是否正确,剩下菌液
放入冰箱(15ul体系)
Mix酶:50% (7.5ul)
上下游引物:各2% (各0.3ul)
模板: 3% (0.45ul)
水:补足体系(6.45ul)
10、如果正确,送2-3个转化子测序
11、测序正确后取1ml保菌(保菌管上标注:DH5α,T-启动子,如
DH5α,T-0559p及日期),剩下2ml抽质粒
12、抽质粒(标注:T-启动子,如T-0559p及日期)
13、取3.5ul用于跑胶检测,如果质量抽到了则进行下一步
14、XbaI、HindIII双酶切T-启动子,同时XbaI、HindIII双酶切
PMV261-hsp60-lacz质粒(如果PMV261-hsp60-lacz质粒没有了,则应从“DH5α,PMV261-hsp60-lacz”保菌管里接菌抽质粒,然后再切)酶切体系如下(50ul):
质粒:25ul
M buffer:5ul
XbaI:1.25ul HindIII:1.25ul
水补足体系:17ul
37℃酶切4-6个小时或者过夜
(注:不同的酶用的buffer不一样,而且有些酶还需要加BSA)15、酶切好后先取3.5ul跑胶检测,看有没有切开(即是否有两条带,
T载大概在2700bp左右,目的片段大小各异,一般在300-600bp)16、如果切开了将剩下的进行切胶回收,回收目的片段(标注:XH
启动子,如:XH-0559p及日期)
17、回收好之后取3.5ul跑胶检测,看有没有回收到
18、同样,酶切的PMV261-hsp60-lacz也进行上述处理,酶切后的
PMV261-hsp60-lacz也有两条带,分别为:PMV261-lacz质粒大小在4200bp左右;hsp60启动子片段大小在200-300bp左右。
将PMV261-lacz质粒片段回收(标注XH-PHL及日期)
19、XH-启动子与XH-PHL的酶连,体系如下(10ul)
载体(XH-PHL):3ul
片段(XH-启动子):5ul
T4 DNA连接酶:0.5ul
T4 DNA连接酶buffer:1ul
PEG4000:0.5ul (有助于提高连接效率)
22℃酶连6-8个小时或者过夜
20、将酶连产物转化至DH5α感受态细胞,涂布卡那抗性(Kan)LB
固体平板
21、12-16小时后看平板有没有长出单菌落,如有挑2-3个转化子(体
系:3ml卡那抗性LB液体培养基)
22、待菌长起来(4-6h)后菌液PCR(15ul体系)验证转化子是否正
确
23、如果正确取1ml保菌(保菌管上标注:DH5α,P-启动子-LacZ,如
DH5α, P-0559p-LacZ及日期),剩下2ml抽质粒(标注:P-0559p-LacZ及日期)
24、取3.5ul质粒跑胶检测,看有没有抽到
25、如果有则将质粒电转化至耻垢分枝杆菌感受态,涂7H10卡那抗
性固体平板
26、3-4天后看有没有长出单菌落
27、如有则滴X-gal至单菌落上看菌落是否变蓝,如果变蓝则是我们
想要的目的菌株
28、挑2-3个变蓝的菌株至卡那抗性7H9液体培养基中,37℃摇床
培养
29、1-2天后看菌是否摇起来,待菌液OD600在1.5-2.0左右时将菌
液取出
30、保菌(标注:MS,P-0559p-LacZ及日期)。