组蛋白去乙酰化酶(HDACs)的研究进展
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组蛋白乙酰化与肿瘤之间的研究进展组蛋白被修饰所引起的染色质结构的改变和基因表达调控中发挥着重要的作用,这些修饰主要包括甲基化、乙酰化、磷酸化和泛素化等,其中以乙酰化尤为重要。
组蛋白的乙酰化状态,由组蛋白乙酰转移酶和乙酰控制,通过调节染色质无障碍的细胞机制。
表观遗传修饰,如组蛋白乙酰化在许多癌基因驱动的转录调控中发挥核心作用。
表观遗传学是一种细胞内在机制,染色质结构可以由DNA和组蛋白的化学修饰,包括甲基化和乙酰化的改变,而不影响遗传密码。
标签:组蛋白乙酰化肿瘤遗传异常已被公认为是癌症的标志。
然而,在过去几十年的研究表明,表观遗传调控也参与了癌症的发展[1]。
通过独立修改改变遗传的DNA序列的染色体架构,以维持基因组的完整性,即遗传密码。
染色质是有核小体核心组成,在其中DNA被缠绕在芯组蛋白八聚体,染色质结构可以由DNA和组蛋白的化学修饰,包括甲基化和乙酰化而改变,而不影响遗传密码[2]。
与基因突变或缺失相比,表观遗传变化是可逆的[3]。
Deng Y 等通过调查脑啡肽酶(NEP)的基因在小鼠神经母细胞瘤神经-2a干扰素(N2a )细胞的表观遗传调控发现,NEP的基因的表达是通过DNA甲基化和组蛋白乙酰化中的N2a细胞调节。
组蛋白乙酰化对DNA甲基化没有影响[4]。
越来越多的证据表明表观遗传学在癌症中有重要的、病因学的地位[5]。
遗传和表观遗传变化的积累有助于癌症的发生和发展,组蛋白脱乙酰化酶(HDACs )是一类酶,负责基因表达的表观遗传调控的。
表观遗传影响,如DNA甲基化,组蛋白乙酰化,并通过微RNA上调/下调的基因,改变个体的遗传组成但不影响DNA的碱基对序列[6]。
MPT0G030是一种新型的组蛋白脱乙酰化酶,其显示出对各种人癌细胞系的广谱的细胞毒性有效和选择性I类HDAC 抑制剂[7]。
组蛋白去乙酰化抑制剂(HDACi)有在不同组织类型的肿瘤细胞中诱导生长停滞和凋亡的功能[8]。
组蛋白是由大量的酶,如组蛋白乙酰转移酶(HATS),脱乙酰基酶(HDACs ),甲基化酶和去甲基化酶修饰,这些修改可能会改变染色质结构调节多种生物过程,如基因表达细胞周期进程和DNA修复。
现代消化及介入诊疗 2021年第26卷第1期ModernDigestion&Intervention2021牞Vol.26牞No.1 ·综述·组蛋白去乙酰化酶及去甲基化酶抑制剂在胃肠道肿瘤的研究进展陈俊豪1,2,丁杰1,2,李显2,岑祥莹2,张林2,吴明2,樊斐2,曾家兴2 【提要】 组蛋白甲基化及乙酰化修饰的平衡失调与多种肿瘤的发生、发展、侵袭、转移密切相关,多种胃肠道肿瘤中发现组蛋白去乙酰化酶(HDAC)及组蛋白赖氨酸特异性去甲基酶1(LSD1)异常增高。
相应的,一些组蛋白去乙酰化酶抑制剂(HDACi)和LSD1抑制剂已在胃肠道肿瘤的研究中取得进展,如异羟肟酸类HDACi在胃肠道抗肿瘤研究中取得良好疗效,但因其特异选择性低,易产生耐药性和严重副作用,在临床的进一步研究中受到限制;苯甲酰胺类HDACi在特异选择性有所提高,并且能够通过抑制肿瘤细胞分化、诱导免疫自噬、抑制细胞周期蛋白产生抑瘤作用,但其由于活性低而受到限制;环肽类HDACi特异性进一步增加,但只是出于研究的基础阶段。
相应的,LSD1抑制剂,如苯环丙胺类、多肽类、小分子化合物抑制剂均在细胞层面有着良好的抑瘤作用,也在后期的整体实验均显示出耐药性和严重副作用。
这提示着单一的HDACi和LSD1抑制剂的抑瘤效应均不佳,由于HDAC常和LSD1形成复合体发挥转录调节作用,因此,双靶点抑制剂可能是有效的,后期的双靶点抑制剂,比如DuanYC等人报道了TCP和SAHA的组合产生的环戊二烯衍生物,AnastasJN报道的Corin,的确呈现出更加显著的抑瘤成效,本文就HDAC、LSD1抑制剂及二者的双重抑制剂在胃肠道肿瘤的研究进展进行综述。
【关键词】 组蛋白去甲基化酶;组蛋白去乙酰化酶;组蛋白去甲基化酶抑制剂;组蛋白去乙酰化酶抑制剂;双重抑制剂;胃癌与结肠癌中图分类号:R735.2;R57 文献标志码:A DOI:10.3969/j.issn.1672-2159.2021.01.028作者单位:1563003遵义医科大学研究生院;2550000贵州省人民医院胃肠外科通信作者:丁杰,E mail:dingjieboy@126.com基金项目:国家自然科学基金(81360366,81302169);贵州省社会发展攻关项目(黔科合SY字[2014]3023号);贵州省优秀青年科技人才培养对象(黔科合平台人才[2017]5602);贵州省高层次创新型人才培养对象(GZSYQCC[2014]001);贵州省科技计划项目(黔科合基础[2019]1198号,黔科合基础[2020]1Z064);贵州省高层次留学人才创新创业项目(留学人才择优资助合同[2018]04号) 胃癌新发病例排在恶性肿瘤的第5位[1],而结直肠癌是世界第三大恶性肿瘤和第四大癌症死亡原因,且无论是发病例数还是死亡率均呈上升趋势[2]。
Advances in Clinical Medicine 临床医学进展, 2023, 13(6), 9937-9946 Published Online June 2023 in Hans. https:///journal/acm https:///10.12677/acm.2023.1361389HDACs 家族在乳腺癌中的研究进展苑豪芳1,刘 震2*,达梦婷1,张 瑾11青海大学研究生院,青海 西宁 2青海大学附属医院,乳腺疾病诊疗中心,青海 西宁收稿日期:2023年5月21日;录用日期:2023年6月18日;发布日期:2023年6月25日摘要 近年来,组蛋白去乙酰化酶(Histone Deacetylase; HDACs)家族在乳腺癌发病机制中的研究备受关注。
HDACs 家族是一个重要的表观遗传学调节因子,可以去除组蛋白的乙酰基化修饰,从而影响基因的转录和表达。
研究发现,HDACs 家族在乳腺癌细胞中的表达与肿瘤的恶性程度和预后密切相关。
目前,针对HDACs 家族的抑制剂已成为乳腺癌治疗的重要策略之一。
总之,HDACs 家族在乳腺癌的研究进展为开发新的治疗策略提供了重要的理论基础和临床应用前景。
关键词HDACs ,组蛋白去乙酰化酶,乳腺癌,HDACi ,HDAC 抑制剂Research Progress of HDACs Family in Breast CancerHaofang Yuan 1, Zhen Liu 2*, Mengting Da 1, Jin Zhang 11Graduate School of Qinghai University, Xining Qinghai 2Breast Disease Diagnosis and Treatment Center, Affiliated Hospital of Qinghai University, Xining QinghaiReceived: May 21st , 2023; accepted: Jun. 18th , 2023; published: Jun. 25th , 2023AbstractRecently, the role of the histone deacetylase (HDACs) family in the pathogenesis of breast cancer is attracting attention. They are a family of important epigenetic regulators that suppress histone acetylation modifications, thereby affecting transcription and expression of genes. The expression of the HDAC family in breast cancer cells is found to be strongly associated with the malignancy and tumor prognosis. An inhibitor that currently targets the HDAC family is one of the key strate-*通讯作者。
组蛋白去乙酰化酶(HDACs)及其调控的研究进展钟理;杨春燕;吴佳海【期刊名称】《中国农学通报》【年(卷),期】2014(30)21【摘要】组蛋白乙酰化修饰是表观遗传研究的重要内容,其行使去乙酰化功能的去乙酰化酶更是临床肿瘤抑制剂研究开发的热点。
通过动物和酵母的深入研究,组蛋白去乙酰化酶广泛的参与了生物生长发育的调控。
介于组蛋白乙酰化修饰在植物上的相关研究较少,文章借鉴动物和酵母的研究结果,归纳了其作用方式,通过氨基酸序列相似性、蛋白保守结构域分析,分析了植物去乙酰化酶可能行使的功能,得出以下结论:从组蛋白去乙酰化酶(HDACs)对对激素及非生物胁迫的响应来看,HDACs广泛的参与了植物生长发育的调控;酵母、动植物HDACs蛋白保守结构域分布有所不同,表明植物HDACs可能存在与酵母、动物不同的功能和调控方式;植物也存在非组蛋白乙酰化修饰,但其发挥功能的酶还需要进一步确认。
【总页数】8页(P1-8)【关键词】组蛋白去乙酰化酶;功能;调控【作者】钟理;杨春燕;吴佳海【作者单位】贵州省草业研究所【正文语种】中文【中图分类】S1【相关文献】1.组蛋白去乙酰化酶HDAC2突变体构建及其SUMO修饰E3连接酶功能研究 [J], 郭韡;熊渊;黄宏;邢伟;李向云;徐祥2.组蛋白乙酰化酶和去乙酰化酶在细胞周期中的调控作用 [J], 李莉;田杰3.组蛋白去乙酰化酶(HDACs)的研究进展 [J], 夏靖;冯冰虹4.敲除组蛋白去乙酰化酶基因hdac对里氏木霉纤维素酶表达的调控作用 [J], 张珂珂; 周娇娇; 佘炜怡; 高云雨; 邓嘉雯; 谢宁; 田生礼5.组蛋白去乙酰化酶(HDACs)在胃癌中的研究进展 [J], 徐珊;尹晓燕;田字彬因版权原因,仅展示原文概要,查看原文内容请购买。
HDACs抑制剂在肿瘤治疗中的研究与发展近年来,肿瘤治疗领域出现了一种新兴的治疗方法,即利用组蛋白去乙酰化酶(HDACs)抑制剂治疗肿瘤。
HDACs是一类能够去除染色质中乙酰基修饰,从而影响基因表达和细胞命运的酶,而HDACs抑制剂则是一类药物,通过抑制HDACs的活性来影响细胞自身的调节系统,进而达到治疗肿瘤的目的。
HDACs抑制剂被证明在治疗多种类型的癌症中都拥有良好的效果,并且在许多肿瘤细胞系中已经被广泛研究。
最近的研究表明,HDACs抑制剂对肝癌、胰腺癌、乳腺癌、肺癌等多种癌症有着深远的影响。
同时,HDACs抑制剂具有较少毒副作用,可以与其他化学治疗药物或放疗技术联合使用,缓解患者痛苦,并提高治疗效果。
HDACs抑制剂的研究和发展至今已逐渐进入了临床实验阶段,其中一些具有代表性的HDACs抑制剂,如亚型选择性HDACs抑制剂和非选择性HDACs抑制剂,开展了多项临床实验,也取得了一定的临床应用成效。
一、HDACs抑制剂的分类根据对HDACs的作用机制和抑制剂药物的特点,HDACs抑制剂通常分为5类:类柿寒素、羧酸类、羟肟酸类、疏水性端环类和环类。
类柿寒素是由针孢菌类中提取出的天然化合物,药理研究表明,类柿寒素可抑制肿瘤细胞增殖,诱导细胞凋亡,同时通过调节不同的生物学途径实现抗肿瘤作用。
其中,VPA为最常用的类柿寒素抑制剂。
羧酸类抑制剂由多个酰化环类结构拓展而来,药理研究显示,这类抑制剂常用于对肝癌、胰腺癌、乳腺癌等癌症的治疗,其中SAHA可以被认为是目前应用最广的HDACs抑制剂。
羟肟酸类抑制剂是一类含有羟肟酸官能团的化合物,如Belinostat和Panobinostat等。
药理研究发现,这类抑制剂普遍具有良好的特异性和选择性,可以靶精细地调节肿瘤细胞的功能。
疏水性环类抑制剂是由苯酮环结构改良而来的一类抑制剂,其中Vorinostat是目前最常用的疏水性环类抑制剂,其作用机理主要是通过抑制HDACs增强组蛋白乙酰肽合酶(HATs)而产生抗肿瘤作用。
组蛋白去乙酰化酶的研究进展组蛋白去乙酰化酶(HDACs)是一类重要的酶类蛋白质,在细胞核内对染色质修饰起着重要的作用,调节基因的表达。
在过去的几十年中,对HDACs的研究取得了重大进展,深化了人们对这些蛋白质的认知和理解。
一、HDACs的分类HDACs主要分为四类:I、II、III和IV类。
其中I、II类又分为A、B、C、D子型。
这四类HDACs在受体结构及功能上都有所不同。
从结构上来看,HDACs主要由三个结构域组成,包括一个催化结构域、一个辅酶A结合结构域和一个维持结构稳定的结构域。
二、HDACs的生物学功能HDACs主要通过催化组蛋白的去乙酰化反应来调节基因的表达。
在生物体内,组蛋白去乙酰化是一个非常关键的生物过程,能够帮助细胞调节基因转录的水平,从而影响细胞的生长、分化、凋亡和代谢等生物过程。
HDACs通过去掉组蛋白的乙酰基,使其变得更加紧密结合,从而抑制相应的基因表达。
三、HDACs在疾病治疗上的应用近年来,越来越多的研究表明,在很多重要的疾病中,包括癌症、炎症和神经系统疾病等,HDACs扮演着非常重要的角色。
特别是在抗癌治疗方面,HDACs已经成为了一个非常重要的领域。
很多针对HDACs的抗癌药物,如美罗华(Merck)、法诺司汀(Novartis)等,已经被广泛使用,并取得了很好的治疗效果。
四、HDACs与DNA甲基化的关系HDACs在细胞内还与DNA甲基化过程密切相关。
DNA甲基化是一种常见的表观修饰形式,在基因表达、DNA复制和细胞分化等生物过程中起着非常重要的作用。
通过调节HDACs的表达和活性,可以进一步影响细胞内DNA甲基化修饰,从而调节基因的表达。
总结起来,HDACs是一类非常重要的酶类蛋白质,对于细胞核内染色质修饰和基因转录调节起着重要的作用。
在细胞内,通过调节HDACs的表达和活性,可以进一步影响基因的表达和细胞的生物过程,具有广泛的研究和应用前景。
HDACs蛋白去乙酰化酶家族的生物学功能及其调控机制HDACs蛋白去乙酰化酶家族是一类重要的细胞因子,其在许多生物学过程中都发挥着关键的作用。
本文将介绍HDACs蛋白去乙酰化酶家族的生物学功能及其调控机制。
一、HDACs蛋白去乙酰化酶家族的生物学功能HDACs蛋白去乙酰化酶家族主要参与细胞核内染色质修饰以及基因表达调控过程。
粗略的分类可以分为四类:1. 细胞周期调控:HDAC-1主要参与细胞周期调控,其促进细胞G1期的进程和有丝分裂;2. 细胞凋亡:HDACs家族从不同方面调控细胞凋亡。
如HDAC6在细胞凋亡过程中的活性会升高,通过促进生长因子受体的囊泡化发挥作用;3. DNA修复:HDACs还可能参与细胞的DNA修复过程。
如在非小细胞肺癌中,一个非常强的HDAC抑制剂可以通过激活细胞内的铜离子去促进DNA损伤修复;4. 肿瘤相关:在癌症领域,HDACs的表达及活性都发生了异常改变。
HDACs 被认为是一种很好的肿瘤治疗靶点。
二、HDACs蛋白的调控机制HDACs蛋白的表达和活性会受到许多因素的影响。
目前最为深入的研究是在小核苷酸环以及转录因子调控方面。
1. 小核苷酸环调控小核苷酸环是非常重要的基因调控元件,它们能够通过DNA甲基化和脱甲基化等方式改变核酸结构,从而影响转录因子的结合及作用。
其中HDACs家族成员在小核苷酸环形成过程中发挥了重要的作用。
通过组蛋白修饰、DNA去甲基化等方式调控小核苷酸环的形成,HDACs蛋白可以在这一过程中起到调节转录因子活性的作用。
2. 转录因子调控转录因子作为调控基因表达的关键因子,对于HDACs蛋白的表达和活性有着重要的作用。
例如STAT3、YY1和SP1等转录因子与HDACs家族成员之间具有整合作用,通过修饰小核苷酸环、组蛋白去乙酰化等方式来转录以上所述的四类基因。
三、未来展望HDACs家族成员发挥了重要的生物学功能,对于细胞的生长和凋亡、合成DNA和修复DNA等方面都起到了关键的作用。
万方数据生堡型堂进匮垫!Q生笠垒!鲞复!疆酰化,涉及了基因的调节。
HDAC6由1215个氨基酸构成,属于该家族中的lib类,由两个组蛋白去乙酰化酶活性功能区和一个泛素结合区构成,主要分布于细胞浆、核周结构和细胞的生长前沿区(1eadingedge),在心、肝、脑等脏器中有高表达。
HDAC6可使非组蛋白,包括alph一微管蛋白等去乙酰化,并可调节细胞的运动∞J。
HDAC6的基因定位于x染色体p11.22~23区带,约21923bp,由28个从4lbp排列到677bp的外显子编码(Kawaguchi等.2003)。
二、m)AC6的功能区和结构特征从蛋白质结构来讲,HDAC6拥有两个独特的催化区域,在进化过程中,这种保守的双重催化反应功能区是识别HDAC6的标记。
HDAC6的第一催化区(DDl)起始于第215位氨基酸,第二个催化区(DD2)起始于第610位氨基酸,两个催化区高度同源,而且均有去乙酰化酶活性,在体外HDAC6的去乙酰基活性主要由位于c一末端的DD2来完成;在HDAC6的c.末端还有一个保守的半胱氨酸和组氨酸富含区,被称为锌指结构(ZnF—UBP),在UPS中也有类似区域,因其可特异性粘附单一或多聚泛素链,也被称为泛素结合区;此外,在DD2与ZnF—UBP之间有一个由8个保守的14肽构成的重复区域(SEl4),其决定了HDAC6去乙酰化功能靶向的定位,并使HDAC6锚定在细胞质中;最后是定位于N一末端和DDl之间的细胞核输出信号区(NES),其可阻止HDAC6与细胞核蛋白结合,同时参与了人类HDAC6在细胞质中活性和稳定性的维持(图1)。
圈1HDAC6功能区的组织结构(引自Boyault等.2007a,26:5468—5476)三、IIDAOI的功能近年来对HDAC6功能的研究发现,它是位于细胞内蛋白质赖氨酸乙酰化和蛋白质泛素化两个信号系统交叉路口的功能蛋白。
HDAC6通过这两种功能调控了细胞内部异常蛋白的降解过程。
组蛋白去乙酰化酶与心血管疾病的研究进展岳洪华;何国伟;刘晓程【摘要】组蛋白去乙酰化酶(HDAC)是表观遗传的调控子,调控着组蛋白尾,核染色质构象,蛋白-脱氧核酸之间的相互作用,转录及转录后的修饰等.HDAC在心血管疾病的发展中发挥着重要的调控作用,与动脉粥样硬化、心肌重构、高血压、肺动脉高压、心律失常、糖尿病性心肌病、心力衰竭等心血管疾病的发生、发展密切相关.抑制HDAC对心血管的保护发挥着重要作用,可成为心血管疾病的诊断和治疗的新方法,HDAC与HDAC抑制剂已经成为目前心血管疾病领域的研究热点.%Histone deacetylase(HDAC) is an epigenetic regulator,which regulates histone tail,chromatin conformation,interactions between protein and deoxyribonucleic acid,transcriptional and post-transcriptional modification.HDAC play an important role in the development of cardiovascular diseases such as atherosclerosis,myocardial remodeling,hypertension,pulmonary hypertension,arrhythmia,diabetic cardiomyopathy and heart failure.Inhibition of HDAC expression is cardiovascular protective,and can be a new method for the diagnosis and treatment of cardiovascular diseases.Therefore,the HDAC and HDAC inhibitors have become hot spots of the research field of treating and preventing the cardiovascular diseases.【期刊名称】《医学综述》【年(卷),期】2017(023)006【总页数】5页(P1104-1108)【关键词】组蛋白去乙酰化酶;组蛋白去乙酰化酶抑制剂;心血管疾病【作者】岳洪华;何国伟;刘晓程【作者单位】中国医学科学院北京协和医学院,北京 100730;泰达国际心血管病医院心外科,天津300457;中国医学科学院北京协和医学院,北京 100730;泰达国际心血管病医院心外科,天津300457;中国医学科学院北京协和医学院,北京 100730;泰达国际心血管病医院心外科,天津300457【正文语种】中文【中图分类】R34组蛋白去乙酰化酶(histone deacetylases,HDAC)是一类蛋白酶,主要作用是改变蛋白的乙酰化水平,使核小体去乙酰化,核染色质凝聚,继而起到转录抑制作用[1]。
组蛋白去乙酰化酶(HDACs)的研究进展【摘要】在肿瘤的表观遗传学研究中,组蛋白的乙酰化修饰对肿瘤的发生发展起重要作用。
正常细胞体一旦出现核内组蛋白乙酰化与去乙酰化的失衡,即会导致正常的细胞周期与细胞代谢行为的改变而诱发肿瘤。
组蛋白去乙酰化酶(histone deacetylases,HDACs)催化组蛋白的去乙酰化,维系组蛋白乙酰化与去乙酰化的平衡状态,与癌相关基因转录表达、细胞增殖分化及细胞凋亡等诸多过程密切相关。
从组蛋白去乙酰化酶HDACs的结构分类及其与肿瘤发生发展关系两方面对HDACs做一综述。
【关键词】组蛋白去乙酰化酶(HDACs);肿瘤;表观遗传学Abstract:The modification for histone acetylation is of great importance for formulation and development oftumors in the epigenetic study of tumors. The disequilibrium of histone acetylation and deacetylation may cause some changes of cell cycle and cell metabolism. Histone deacetylases (HDACs) catalyze the deacetylation of histones,and maintain the equilibrium between histone acetylation and deacetylation as well. They are related to many regulation processes containing transcription of oncogene,cell cycle,apoptosis and so on. The structure classification of HDACs and the relationship between the HDACs and the formation and advancement of tumor were reviewed in this paper.Key words:histone feacetylases (HDACs); tumor; epigenetics肿瘤的发生是一个复杂的病理过程,受多重因素的影响,包括个体遗传因素、环境因素、物理化学因素、分子生物学因素等等。
随着生命科学的迅速发展和有关肿瘤致病机制和发病机制的分子生物学研究的深入开展,分子生物学因素在肿瘤发生中的突出作用被逐步揭示,影响细胞生长、增殖的基因和参与细胞生长增殖调控的各种因子的失活成为肿瘤发生的关键诱因。
随着生命科学的深入发展,对肿瘤的致病和发病机制的分子生物学研究为开发低毒高效针对特异性分子靶标的抗肿瘤药物提供了基础[1]。
组蛋白去乙酰化酶(histone deacetylases,HDACs)是维持染色体的基本组成单位核小体中组蛋白乙酰化平衡的关键酶类之一,其催化组蛋白的去乙酰化作用,与基因转录抑制密切相关,牵涉到促基因沉默的诸多过程,是抗肿瘤药物设计中的热门靶标[2]。
就HDACs 的表观遗传学作用、分类及结构、与肿瘤发生发展的关系作一综述,以期为后续抗肿瘤研究提供新的思路。
1HDACs的表观遗传学作用表观遗传学(epigenetics)是不涉及DNA序列改变的可遗传的基因表达变化研究[3],在其诸多形式中,组蛋白的共价修饰占有重要地位,其与基因的表达调控密切关联,包括磷酸化、乙酰化、甲基化修饰等。
组蛋白乙酰化及去乙酰化修饰是最重要的方式,是基因表达调控最主要的驱动力[4],此可逆的动态修饰组蛋白乙酰基转移酶(HAT)和HDACs 共同催化,共同控制染色质各区域核心组蛋白的乙酰化程度。
组蛋白的乙酰化程度与转录活性密切相关:转录活动区域核心组蛋白的乙酰化密度高,而不活动区域乙酰化密度低[5]。
HAT促使染色体的解聚,激活转录;而HDACs则封闭DNA,进而抑制转录过程。
在正常生理状态下,HAT与HDACs对组蛋白乙酰化作用的调控处于平衡状态。
而细胞在发生转化的状态下,HDACs的活性明显增强,使得原有的基因表达平衡状态被打破,导致一些影响细胞增殖和调控细胞周期的分子表达失衡,进而导致细胞恶变[6]。
HDACs成为表观遗传学中抗肿瘤药物设计的重要和潜力靶点。
2 HDACs分类及结构特点分类基于酵母种系发育中的不同HDACs的结构同源性分析[7],真核生物HDACs被分成4类:Ⅰ类HDACs与酵母Rpd3具有同源性,包括HDAC1、HDAC2、HDAC3、HDAC8;Ⅱ类HDACs 与酵母Hda1具有同源性,包括HDAC4、HDAC5、HDAC6、HDAC7、HDAC9和HDAC10,其根据催化区域的不同又可分为2类:Ⅱa类具有一段催化区域,包括HDAC4、HDAC5、HDAC7和HDAC9,Ⅱb类具有两段催化区域,主要包括HDAC6和HDAC10;Ⅲ类HDACs即沉默信息调节因子2(silent information regulator2,Sir2)-相关酶类[8] (Sir2-related enzymes,sirtuins),其是烟酰胺腺嘌呤二核苷酸(nicotinamide adenine dinucleotide,NAD+)依赖的组蛋白去乙酰化酶类;Ⅳ类HDACs主要是HDAC11,其与Ⅰ、Ⅱ类HDACs差异较大而被独立划归一类。
HDACs家族各成员主要定位于细胞核与细胞质中,另有少部分定位于胞质细胞器如线粒体中(主要是Ⅲ类HDACs中的SIRT3、SIRT4与SIRT5),HDACs发挥催化作用的目标蛋白种类繁多,常见如抑癌蛋白p53、热休克蛋白HSP70、Smads蛋白家族等,HDACs正是通过与催化多种生理过程中的关键蛋白而在调控肿瘤进程中发挥重要作用。
结构特点Ⅰ类HDACsⅠ类HDACs中的HDAC1已被研究证实,其磷酸化可以促进酶本身的催化活性及催化复合物形成,磷酸化发生于HDAC1中421位丝氨酸位点Ser421与423位丝氨酸位点Ser423。
运用K-trap(K-抗酒石酸酸性磷酸酶)亲和树脂对HDAC1进行纯化,SDS-PAGE(聚丙烯酰氨凝胶电泳)分离K-trap纯化的HDAC1,考马斯亮蓝染色检测蛋白,运用质谱法鉴定磷酸化基团,显示HDAC1分子量标识物大小分别为75 000、66 000,其他种Ⅰ类HDACs即HDAC2、HDAC3与HDAC8蛋白鉴定分析应用Clustal法完成,HDAC1、HDAC2、HDAC8分别482、488、377种氨基酸构成[9]。
Ⅱ类HDACsⅡa类HDACs研究证实[10],Ⅱa 类HDACs一段保守的锌结合域——HDAC4催化序列与Ⅰ类HDACs相区别的特征是一段锌离子结合域,其容纳了2种自分子中心分离的蛋白片段(图1A)。
第1个片段形成了1个17-氨基酸环(Lα1-α2),其贡献了3个锌离子配体:His665,Cys667,和His678(图1A)。
第2个片段是1含35个残基的插入体(α6-α7-β3-β4),形成了1个螺旋结构,紧接着1个包含其尖端第4锌配体Cys751的β-发夹结构。
值得注意的是,这4个锌配体在所有的Ⅱa类HDACs中均高度保守,但在其他种类的HDACs中缺失。
此锌结合域与环结构方面不同点的存在导致HDAC4相比HDAC8及HDAH拥有一个更活跃的活性位点(图1B、C)。
同时,在HDAC8、HDLP及HDAH中并不存在催化醋酸盐反应产物释放的水性通道(图1B、C)。
晶胞分析的结果显示,在位于锌结合域的Cys669与来自于邻近分子的Cys700之间,有一分子内部的二硫键形成。
为排除此二硫化物对抑制物与活性位点间作用可能的影响,对野生型(WT 型)HDAC4与HDAC4催化序列功能性突变体(GOF-HDAC4cd)(包括含有C669A/C700A两个突变体与C700A单一突变体)的抑制物结构均进行了论证,结果显示突变体的结构与相应的无突变的野生型及排除紊乱状态下的锌结合域突变体蛋白相同。
证明HDAC4cd-抑制剂复合物的结构域在空间弯曲折叠,且分子内部的二硫带在某些部位已将其封闭。
Ⅱb类HDACs有研究证实[11],Ⅱb 类HDACs的HDAC10是一种含有669个氨基酸残基的多肽,其N-末端的Hda1相关去乙酰化序列与C-末端的亮氨酸富集序列构成组合式的结构。
如图2示,HDAC10的去乙酰化序列(DAC)用白框表示,亮氨酸富集序列(LRD)用阴影框来阐明。
另HDAC10的去乙酰化序列与HDAC6对应的区域的相同及相似度亦在图中反映,即HDAC10两段乙酰化序列与HDAC6的对应序列的相同/相似度分别为54%/62%与53%/60%。
[;S*3〗图1HDAC4结合态的催化序列结构模式图[10]Figure 1Structural diagram of catalytic sequences of HDAC4 in bound state[PSa6132;S*2〗图2Ⅱb类HDACs 的HDAC10序列及与HDAC6比较Figure 2Sequence comparison of HDAC10 and HDAC6Ⅲ类HDACs哺乳动物有7种Sir2-related enzymes,sirtuins,即Ⅲ类HDACs,包括SIRT1-7。
所有成员均含有一段NAD+依赖的催化核序列,其扮演着单-ADP-核糖基转移酶(mono-ADP-ribosyl transferase (ART))或者NAD+依赖的去乙酰化酶(DAC)的角色,此催化序列两端环绕着可变长度的N-末端与C-末端序列,在细胞内不同的sirtuins其定位不同。
如图3示,SIRT1与SIRT5只具有DAC活性,SIRT4与SIRT6只具有ART活性,而SIRT2与SIR3具有DAC与ART两种活性;在细胞定位方面,SIRT1主要定位于常染色质中,SIRT2重要定位于细胞质中,SIRT3-SIRT5则主要定位于细胞线粒体中,而SIRT7则定位于细胞核仁中[12]。
[〗图3Ⅲ类HDACs各成员功能、胞内定位及大小比较[12]Figure 3Comparison of function,intracellular localization,and size of Class ⅢHDACsⅣ类HDACsGao等[13]运用cDNA 克隆预测到人类HDAC11氨基酸序列,揭示了HDAC11拥有347个氨基酸的开放阅读框(对应分子量为39 000)。