盐胁迫下不同品种水稻的基因表达
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《盐胁迫下水稻苗期生理响应及应答机制》一、引言随着全球气候的变化,土壤盐渍化问题日益严重,对农业生产产生了巨大的影响。
水稻作为我国最重要的粮食作物之一,其生长受到盐胁迫的威胁也愈发明显。
因此,研究盐胁迫下水稻苗期的生理响应及应答机制,对于提高水稻抗盐性、保障粮食安全具有重要意义。
本文旨在探讨盐胁迫对水稻苗期生理指标的影响,以及水稻的应答机制,以期为农业生产提供理论依据。
二、材料与方法1. 材料选取当地常见的水稻品种作为试验材料,培育至苗期阶段。
2. 方法(1)盐胁迫处理将水稻苗期植株置于含有不同浓度盐溶液的培养环境中,模拟盐胁迫条件。
设置不同浓度梯度,如0(对照组)、50、100、150mM NaCl等。
(2)生理指标测定测定不同盐浓度处理下的水稻叶片的叶绿素含量、光合作用速率、气孔导度等生理指标。
(3)应答机制分析通过转录组测序、蛋白质组学等方法,分析盐胁迫下水稻的基因表达、蛋白质变化等应答机制。
三、盐胁迫下水稻苗期的生理响应1. 叶绿素含量变化随着盐浓度的增加,水稻叶片的叶绿素含量逐渐降低。
高盐环境下,叶绿体的结构受到破坏,导致叶绿素合成受阻。
2. 光合作用速率变化盐胁迫下,水稻的光合作用速率降低。
这可能是由于气孔导度降低、光合酶活性受抑等因素所致。
3. 渗透调节物质变化在盐胁迫下,水稻体内脯氨酸、可溶性糖等渗透调节物质含量升高,以维持细胞内外的渗透平衡。
四、水稻的应答机制1. 基因表达变化转录组测序结果显示,盐胁迫下水稻的基因表达发生显著变化,涉及光合作用、渗透调节、抗氧化等途径的相关基因表达上调或下调。
2. 蛋白质组学分析蛋白质组学分析表明,盐胁迫下水稻的蛋白质表达也发生改变,如与渗透调节、抗氧化相关的蛋白质含量升高,参与光合作用的酶类活性受到调控等。
3. 抗逆性物质合成与积累在盐胁迫下,水稻体内合成并积累了一系列抗逆性物质,如抗氧化酶类、渗透调节物质等,以应对盐胁迫带来的不利影响。
五、结论本文通过研究盐胁迫下水稻苗期的生理响应及应答机制,发现盐胁迫对水稻的生长产生不利影响,导致叶绿素含量降低、光合作用速率下降等生理指标的变化。
水稻生长发育的分子调控机制水稻是全球重要的粮食作物之一,也是很多发展中国家居民的主要食物来源。
水稻的生产力和质量受多种因素的影响,其中包括表观遗传学调控和RNA介导的信号传递等各种分子调控机制。
这些机制共同作用,决定了水稻生长发育、抗性以及产量等因素。
本文将探讨水稻生长发育的分子调控机制。
1.微RNA调控微RNA是一种小分子RNA,它会与序列特异的靶基因mRNA配对,从而导致靶基因表达的下降。
在一些研究中表明,微RNA在调控水稻的生长发育以及应对生物胁迫时扮演着重要角色。
例如,Sunkar、Jagadeeswaran等人在研究中发现,miR156通过抑制SPL基因家族的表达,调控了水稻的花期和谷粒产量。
同时,Cui等人也证明了miR156可以通过抑制OsEATB基因的表达,提高水稻在低温下的适应性。
与此同时,OsMIR1440还能够调控水稻的花期,这是通过在微小RNA的靶基因中表达调控的。
在研究中,Yan等人发现,当OsMIR1440表达高时,水稻样品的土壤根长度和冠层高度增加,花期向后推迟。
另一篇研究表明,OsMIR528通过调控水稻根的伸长,影响了水稻的生长和发育。
这些研究结果展示了微RNA在水稻生长发育中的重要作用。
2.表观遗传学调控水稻生长和发育过程中的表观遗传学调控包括DNA甲基化、组蛋白乙酰化和染色质重塑。
这些调控机制对水稻的生长和发育、适应性和抗性等都有很大的影响。
在一些研究中,表观遗传学调控因子和对调控因子的快速响应因子也被揭示出来。
例如,当水稻受到盐胁迫时,OsREM4.1和OsREM4.0/REM4.3会被迅速表达,这些基因的表达可以调控水稻适应盐胁迫的机制。
同时,Di Liao等人的研究表明,为水稻生长所必须的OsTAR1蛋白是多个组蛋白修饰调控的靶点。
3.转录因子调控转录因子是一类在生物体内调控基因表达的DNA结合蛋白。
在许多的研究中,转录因子通过参与水稻生长发育过程中的转录调控、信号传递和代谢调控起到了至关重要的作用。
作物学报ACTA AGRONOMICA SINICA 2022, 48(6): 1463 1475 / ISSN 0496-3490; CN 11-1809/S; CODEN TSHPA9E-mail:***************DOI: 10.3724/SP.J.1006.2022.12027耐盐性不同水稻品种对盐胁迫的响应差异及其机制颜佳倩1,2顾逸彪1,2薛张逸1,2周天阳1,2葛芊芊1,2张耗1,2刘立军1,2王志琴1,2顾骏飞1,2,*杨建昌1,2周振玲3徐大勇31扬州大学江苏省作物遗传生理重点实验室 / 江苏省作物栽培生理重点实验室, 江苏扬州 225009; 2 扬州大学江苏省粮食作物现代产业技术协同创新中心, 江苏扬州 225009; 3连云港市农业科学院 / 江苏省现代作物生产协同创新中心, 江苏连云港 222006摘要: 旨在阐明耐盐性不同水稻的产量对盐胁迫的响应及其生理特性。
本研究以5个耐盐水稻品种和两个盐敏感水稻品种为材料, 设置了5个不同盐浓度处理(0、1、2、2.5和3 g kg–1)。
结果表明, 相较于盐敏感水稻, 耐盐水稻能够耐受更高浓度的盐胁迫(2.5 g kg–1), 且产量受盐胁迫减产幅度较小。
耐盐水稻品种具有较高的产量, 得益于其较高的总颖花量和结实率。
与盐敏感品种相比, 耐盐水稻品种叶片, 在分蘖中期、穗分化期、抽穗期, 具有较高的超氧化物歧化酶(SOD)、过氧化物酶(POD)、过氧化氢酶(CAT)活性, 较高的果糖、海藻糖、山梨醇、脯氨酸等有机渗透调节物质含量, 较高的K+/Na+值; 分蘖至拔节以及抽穗至成熟期具有较高的作物生长速率; 抽穗期具有较高的光合速率。
上述结果表明, 不同耐盐性水稻产量差异, 主要来源于分蘖期、穗分化期与抽穗期的耐盐生理差异, 这些生育时期是决定水稻穗数、穗粒数、结实率的关键时期。
耐盐水稻在这些关键生育时期的良好生理表现是这些水稻品种获得高产的基础。
《盐胁迫下水稻苗期生理响应及应答机制》一、引言随着全球气候的变化,土壤盐渍化问题日益严重,对农业生产产生了巨大的影响。
水稻作为我国最重要的粮食作物之一,其生长过程中常常受到盐胁迫的威胁。
因此,研究盐胁迫下水稻苗期的生理响应及应答机制,对于提高水稻抗盐性、保障粮食安全具有重要意义。
二、盐胁迫对水稻苗期的影响盐胁迫是指土壤中盐分过高,对植物生长产生不利影响。
在盐胁迫下,水稻苗期表现出以下生理响应:1. 生长抑制:盐胁迫会导致水稻幼苗生长速度减缓,株高、根长及生物量均显著降低。
2. 水分代谢紊乱:盐胁迫会引起水稻细胞水分失衡,导致气孔关闭,光合作用受阻。
3. 离子平衡失调:盐胁迫下,土壤中钠离子和氯离子浓度升高,破坏了细胞内离子平衡。
4. 营养元素吸收受阻:盐胁迫影响水稻对氮、磷、钾等营养元素的吸收,进而影响其正常生长。
三、水稻苗期对盐胁迫的应答机制为了应对盐胁迫,水稻苗期形成了一系列的应答机制,包括:1. 渗透调节:水稻通过积累可溶性物质,如脯氨酸、甜菜碱等,来调节细胞内渗透压,维持水分平衡。
2. 离子平衡调节:水稻通过调整根系对离子的选择性吸收和向地上部的转运,维持细胞内离子平衡。
3. 抗氧化系统:水稻通过增强抗氧化酶(如超氧化物歧化酶、过氧化氢酶等)的活性,清除活性氧,减轻氧化应激对细胞的损伤。
4. 信号传导与基因表达:盐胁迫会引发一系列的信号传导过程,激活相关基因的表达,从而产生抗逆蛋白,提高水稻的抗盐性。
四、提高水稻抗盐性的途径为了提高水稻的抗盐性,可以从以下几个方面入手:1. 选育耐盐品种:通过遗传育种手段,选育出耐盐性强的水稻品种。
2. 改善栽培措施:合理施肥、灌溉和排水,提高土壤肥力,增强水稻的抗逆能力。
3. 生物技术手段:利用基因工程技术,将耐盐基因导入水稻中,提高其抗盐性。
4. 农业生态工程:通过农田水利建设、土壤改良等措施,改善农田生态环境,降低土壤盐渍化程度。
五、结论盐胁迫对水稻苗期生长产生了显著的影响,但水稻通过一系列生理应答机制来应对盐胁迫。
盐胁迫对水稻粮食安全影响的研究进展作者:南楠来源:《粮食问题研究》2022年第05期摘要:土地的盐碱化严重制约粮食生产安全。
水稻属于中度盐敏感作物,并且生长在水环境中,是在盐碱地种植的首选粮食作物。
本文综述了盐胁迫对水稻生理生化的影响、水稻耐盐胁迫机制,提出了强化水稻耐盐性的策略,以期通过分子生物技术培育耐盐水稻新品种,实现盐碱地改良,扩大水稻种植面积和总产量,保障粮食生产安全。
关键词:水稻盐碱胁迫粮食安全土壤盐碱化使得耕地面积缩减,也是导致粮食危机的原因之一。
全世界有约10亿公顷的土地受盐害的影响,大约占了全球农业用地面积的20%[1]。
中国是盐碱地大国,现有内陆盐碱面积近1亿公顷[2],滩涂面积234万公顷。
其中,东北地区盐碱土的主要形式是苏打盐碱地,面积高达756万公顷[2];吉林省西部12个市县盐碱地面积为160多万公顷[3]。
土地的不合理灌溉利用使土壤次生盐渍化现象日益严重,为解决日益增长的人口需求和可使用耕地面积有限等实际问题,开发利用盐碱地资源是保障耕地面积的有效途径之一[4]。
水稻是世界上最重要的粮食作物之一,养活了世界一半以上的人口,它的生产对全球粮食安全具有重要意义。
水稻作为中度盐敏感作物可以对土壤的可溶性盐碱起到淋溶作用[5],是开发沿海滩涂和盐碱地的首选粮食作物。
一、鹽胁迫对水稻的危害盐胁迫会对水稻生长发育产生影响,如种子萌发、光合作用、呼吸作用及能量代谢、蛋白质的合成等[6]。
根据盐胁迫对水稻造成影响的先后顺序可分为三个阶段,即渗透胁迫、离子胁迫以及次级胁迫(如氧化胁迫、营养不平衡等)[7]。
(一)渗透胁迫盐胁迫首先对水稻造成渗透胁迫。
当水稻根部周围离子浓度达到阈值时,外界的渗透压高于根部渗透压,造成植物根部吸收水分困难,地上部分生长速率明显下降,光合面积减少,侧芽发育变慢或者停滞[1]。
对于单子叶植物来说,盐胁迫引起分蘖数下降导致叶片总面积下降。
有趣的是植物地上部分比根部对盐胁迫更敏感,对于这种现象的分子机制还不清楚,推测可能的原因是叶片面积下降比根部发育迟缓能够更多的降低植物对水分的利用[1]。
盐胁迫对不同水稻品种光合特性和生理生化特性的影响徐晨1 凌风楼2 徐克章2 武志海2 刘晓龙2 安久海2 赵兰坡3,*(1吉林农业大学中药材学院,吉林长春130118;2吉林农业大学农学院,吉林长春130118;3吉林农业大学资源与环境学院,吉林长春130118;*通讯联系人,E-mail:zhaolanpo12@163.com)Effect of Salt Stress on Photosynthetic Characteristics and Physiological andBiochemical Traits of Different Rice VarietiesXUChen1,LINGFeng-lou2,XUKe-zhang2,WUZhi-hai 2,LIUXiao-long2,ANJiu-hai 2,ZHAOLan-po3,*(1 College of Traditional Chinese Herbs,Jilin Agricultural University,Changchun 130118,China;2College of Agronomy,JilinAgricultural University,Changchun 130118,China;3 College of Resources and Environment,Jilin Agricultural University,Chang-chun 130118,China;*Corresponding author,E-mail:zhaolanpo12@163.com)XU Chen,LING Fenglou,XU Kezhang,et al.Effect of salt stress on photosynthetic characteristics and physiologicaland biochemical traits of different rice varieties.Chin J Rice Sci,2013,27(3):280-286.Abstract:With two salt-tolerant rice varieties and two salt-sensitive varieties as material,the influence of salt stress onplant biomass accumulation,photosynthetic characteristics and the other physiological characteristics was studied.Theresults showed that the dry weight and fresh weight of shoot and root of salt-tolerant rice varieties and salt-sensitivevarieties were declined under salt stress.The fresh weight of shoot and dry weight of roots were declined significantly.The net photosynthetic rate,stomatal conductance,transpiration and apparent mesophyll conductance were declined todifferent degrees under salt stress.The drop of Pn,Gs,Trand Pn/Ciof salt-tolerant varieties was less than salt-sensitive varieties.The water use efficiency(WUE)of salt-tolerant varieties was higher than that of salt-sensitive onesat the same time.The intercellular CO2concentration(Ci)of salt-tolerant varieties and salt-sensitive ones was notchanged obvirously under salt stress.The stomatal limitation percentage(Ls)under salt stress was low and thedifference among the varieties was not significant.And apparent mesophyll conductance(Pn/Ci)was changedsignificantly.The decline of Pnresulted from the decline of RuBPCase rather than from stomatal limitation.Thepermeability regulation substance contents of leaf and root such as soluble sugar and proline,total amino acids wereincreasd under salt stress with significant increase in soluble sugar contents(P<0.01).The protective enzyme SOD,POD and CAT activities were enhanced,as well as the membrane permeability and the MDA content,the root vigorwas declined under salt stress.Key words:rice;salt stress;photosynthesis;biomass;protective enzyme activities徐晨,凌风楼,徐克章,等.盐胁迫对不同水稻品种光合特性和生理生化特性的影响.中国水稻科学,2013,27(3):280-286.摘 要:用2个耐盐水稻品种和2个盐敏感型水稻品种为材料,研究盐胁迫对水稻植株生物量积累、光合特性等生理特性的影响。
盐胁迫对水稻的影响及水稻耐盐育种研究郑英杰【摘要】Salt stress were the main constraint on rice production in saline soil, it would produce unfavorable effects on shape growth and physiological metabolism of rice, salt stress influences plant growth and development through osmotic stress and ion toxic. the main method for salt tolerant breeding were screen salt tolerant material, the combinationof conventional breeding, transgenic breeding techniques and marker assisted breeding were made to breed variety of salt tolerant and practical value.%盐胁迫是盐渍化地区水稻生产的主要制约因素之一。
盐胁迫对水稻的形态发育及生理生化代谢产生不利影响,其作用机理主要表现在渗透胁迫和离子毒害等。
耐盐水稻品种的选育方法主要是筛选耐盐材料,将常规选育和转基因、分子标记辅助选择等现代生物技术相结合,选育耐盐性强且具有实用价值的品种。
【期刊名称】《北方水稻》【年(卷),期】2013(000)005【总页数】5页(P71-74,80)【关键词】水稻;盐胁迫;耐盐育种;转基因;分子标记【作者】郑英杰【作者单位】辽宁省盐碱地利用研究所,辽宁盘锦 124010【正文语种】中文【中图分类】S-1盐胁迫(胁迫是指某一环境因子的强度超过适于植物正常生活的范围)是目前制约农作物产量的主要逆境因素之一[1],盐胁迫下,Na+等有害离子在植株体内大量吸收和积累,破坏植物体内的水分和离子平衡,最终对植株造成伤害[2]。
2盐碱胁迫对水稻生理特性及遗传基因表达的影响2.1盐碱胁迫对细胞膜的损伤受到盐碱危害的水稻的细胞膜透性增大,内含物渗漏,造成细胞物质交换平衡破坏,代谢紊乱,有毒物质积累,原生质停止流动,使得土壤水势下降,致使植物根系吸水困难。
2.2盐碱胁迫对水稻光合作用的影响盐胁迫后,水稻叶片中的叶绿素和类胡萝卜素含量显著下降[8],高盐胁迫降低K +/Na +比值。
2.3盐碱胁迫对养分积累和运输的影响盐碱胁迫降低植物中N 、P 、K 、Ca 、Mg 的含量,从而导致营养成分失衡。
Abdur 等[9]报道,高盐胁迫影响水稻植株根系中的Na +、Ca 2+,K +和Mg 2+浓度。
2.4盐碱胁迫对激素产生的影响在高盐胁迫下,水稻植株中的脱落酸、赤霉素、细胞分裂素、生长素、茉莉酸和水杨酸等各种激素会发生失衡。
汤日圣等[10]研究表明,ABA 能有效地提高水稻秧苗的耐盐能力。
2.5盐碱胁迫对水稻遗传基因表达的影响水稻在盐碱胁迫下的Δ1-吡咯琳-5-羧酸合成酶、甜菜碱醛脱氢酶、肌醇单磷酸酶等基因表达量会升高[11]。
吕丙盛[12]研究表明,在碱胁迫条件下,根系细胞的损伤程度和细胞凋亡相关基因OsNAC4的表达量都有明显增加。
管清杰[13]研究发现,盐碱胁迫会对抗坏血酸过氧化物酶相关的基因家族的表达产生影响。
此外,盐碱胁迫下,水稻的适应性基因的表达还受Na +、HCO 3-和pH 的影响[14]。
3水稻抗盐碱胁迫的调控途径3.1水稻品种的基因改造分子生物学和各种组学以及测序技术的发展,特别是耐碱相关QTL 和基因的广泛发掘,形成了包括分子标记辅助育种技术、转基因、全基因组选择和细胞工程育种等一批分子育种新技术。
运用分子标记辅助选择和转基因等手段,开发耐盐碱基因型的水稻,改造水稻品种的耐盐碱基因。
3.2使用生长调节剂提高水稻耐盐碱力利用生长调节剂,如赤霉素、脱落酸、抗坏血酸、水杨酸和多胺等,促进水稻生长,稀释其体内盐分,有效改善盐分胁迫下水稻幼苗的多种生理指标,提高水稻的耐盐能力,缓解水稻在盐胁迫下的伤害。
盐胁迫下不同品种水稻的基因表达
作者:朱长保等
来源:《安徽农业科学》2018年第36期
摘要{目的]初步探索水稻耐盐机制,筛选关键基因。
{方法]从公共基因芯片数据库GEO (GeneExpressionOmnibus)搜索有关盐胁迫下水稻基因表达的数据,利用TAC (TranscriptomeAnalysisConsole)筛选表达差异基因,对差异基因进行GO(GeneOntology)富集分析、信号通路富集分析。
{结果]在盐胁迫下,CSR11、PL177两种耐受型水稻与IR64、VSR156两种敏感型水稻分别有3289、1934、1806、4426个基因表达。
耐受型水稻中同时上调或下调的基因有288个,敏感型水稻中同时上调或下调的基因有330个。
通过生物信息学研究发现,耐受型水稻盐胁迫主要影响代谢途径、次级代谢产物合成、转录因子等方面。
敏感型水稻盐胁迫影响主要影响胁迫响应、激素转导、物质代谢等方面。
{结论]利用生物信息学方法能有效筛选目标基因,并可为进一步研究提供依据。
关键词水稻;盐胁迫;差异基因表达
中图分类号S; 511;Q786文献标识码A文章编号0517-6611(2018)36-0018-03
水稻是世界上最重要的粮食作物,世界上一半以上的人口以水稻作为主食,尤其在发展中国家。
近年来由于工业污染的加剧,大量使用农药、化肥以及不合理灌溉等使土壤盐碱化程度日益加重,盐害已经严重威胁粮食安全{1-3]。
研究显示,盐对植物组织的伤害主要是离子毒害和渗透胁迫{4]。
随着分子生物学技术的不断发展,研究人员希望能够掌握盐害下的作物生理响应机制,以此为基础,利用基因工程技术提高作物抗盐能力,从而对合理开发和利用盐碱土地资源,确保国家粮食安全具有重要意义。
基因芯片使研究人员能够快速、高通量地了解植物在特定环境条件下的基因表达水平及变化{5]。
鉴于此,笔者基于公共基因芯片数据库GEO 中盐胁迫下水稻基因表达的芯片数据,通过生物信息学分析对相关基因进行筛选。
1材料与方法
1.1数据来源
登录GEO(http:///geo)下载水稻芯片数据(GSE21651、
GSE58603),两组数据都是选择研究盐胁迫下水稻叶片基因的表达。
水稻类型分别为
CSR11、PL177、IR64、VSR156,其中CSR11、PL177为耐受型水稻,IR64、VSR156为敏感型水稻{6-7]。
1.2方法
GEO数据利用TAC进行芯片数据分析,获得差异表达基因,选择差异在2倍以上的表达基因(P<0.05)。
利用PlantReMapGO富集分析(http:
///index.php)(P<0.01,Q<0.05),DAVID6.8(https:
///)KEGG通路分析(P<0.05)。
2结果与分析
2.1盐胁迫下不同水稻基因的表达
CSR11水稻在盐胁迫下出现差异表达的基因是3289个,其中盐胁迫诱导上调的基因有815个,下调的基因有2502个。
IR64水稻在盐胁迫下出现差异表达的基因是1806个,其中盐胁迫诱导上调的基因有786个,下调的基因有1020个。
PL177水稻在盐胁迫下出现差异表达的基因是1934个,其中盐胁迫诱导上调的基因有995个,下调的基因有939个。
VSR156水稻在盐胁迫下出现差异表达的基因是4426个,其中盐胁迫诱导上调的基因有1400个,下调的基因有3026个(图1)。
在4种水
稻中,CSR11、PL177为耐受型水稻。
经研究分析发现,
CSR11、PL177表达重叠的基因有398个,但是同时上下调的基因为288个,其中上调的基因有110个,下调的基因有178个。
IR64、VSR156为敏感型水稻。
分析发现,IR64、VSR156表达重叠的基因有542个,但是同时上下调的基因为330个,其中上调的基因有249个,下调的基因有81个。
2.2盐胁迫下2种水稻表达一致基因生物信息学分析
在耐受型、敏感型水稻中同时上调的表达基因有58个,同时下调的表达基因有25个(图2)。
说明这类基因对于水稻适应盐胁迫至关重要,它们不受基因型的限制、不具有组织特异性。
通过生物信息学分析,发现这些表达基因富集以响应温度刺激为主、在信号通路上则主要在光合作用、内质网蛋白质加工上,包括热激转录蛋白OsHsfA3(LOC_Os02g32590)、乙醇脱氢酶基因Adh1(LOC_Os11g10480)等基因(表1)。
2.3盐胁迫下2种水稻特异性上调表达基因生物信息学分析
耐受型水稻特异性上调基因有52个,敏感型水稻特异性上调基因则有191个(图2)。
对耐受型水稻上调基因进行生物信息学分析发现,基因富集无统计学意义,这可能是因为特异性上调基因太少导致的。
对信号通路分析发现,其主要在代谢途径、次级代谢产物合成过程中,包括乙醛脱氢酶OsALDH18B2(LOC_Os01g62900)、核酮糖-1,5-二磷酸羧化酶/加氧酶OsRBCS4(LOC_Os12g19470)等基因。
对敏感型水稻上调基因进行生物信息学分析,发现基因富集以胁迫响应为主,如温度刺激、非生物刺激物质化学反应、渗透压等功能,信号通路则主要参与植物激素信号转导,包括活化蛋白激酶OsSAPK1(LOC_Os03g27280)、锌指蛋白ZFP179(LOC_Os03g27280)、赖氨酸-酮戊二酸还原酶/酵母氨酸脱氢酶OsLKR/SDH
(LOC_Os02g54254)等基因(表1)。
2.4盐胁迫下2种水稻特异性下调表达基因生物信息学分析
耐受型水稻特异性下调基因有153个,敏感型水稻特异性下调基因有56个(图2)。
对耐受型水稻下调基因进行生物信息学分析,发现基因富集主要在核蛋白结合转录因子、特异DNA结合转录因子等功能上,包括WRKY转录因子(LOC_Os01g09080,LOC_Os07g48260,LOC_Os09g25070)、bZIP转录因子(LOC_Os03g19370、LOC_Os05g49420、
LOC_Os06g45140)、AP2/ERF转录因子(LOC_Os05g41760,LOC_Os01g58420)等基因,而信号通路无统计学意义。
对敏感型水稻下调基因进行生物信息学分析,发现基因富集以酶活性为主,如葡糖激酶、己糖激酶等,信号通路则主要参与到糖代谢途径,包括己糖激酶OsHXK (LOC_Os01g71320、LOC_Os01g53930)等基因(表1)。