下载文档原格式
高通量测序与生物信息学概论参考答案1二代测序相对于一代测序，最显著的技术优势是A边合成边测序能力B双端测序能力C高通量测序能力D单条Read的准确度高考生答案：C2关于高通量测序上机前文库，下列说法正确的是A文库的DNA序列是完全未知的B制备文库时必须加Barcode/IndexC必须是双链DNA才能上机测序D制备文库时必须加接头/Adapter考生答案：D3三代测序相对于二代测序，最显著的技术优势是A、Reads的长度长B、测序过程不需要PCRC、测序仪小巧便携D、单分子测序能力考生答案：D4关于新冠病毒，下列哪个名称是WHO指定的VOC之一A、XBBB、BA.5C、DeltaD、PANGO考生答案：C5三代测序长Reads的优势在于A容易拼接B数据量大C单Reads准确度高D容易用于辨识物种考生答案：A,D6下列说法正确的是A、Sanger测序中的ddNTP连接的叠氮基团可以去掉并启动新一轮合成B、Sanger测序中连接了ddNTP后不能继续合成DNAC、Sanger测序中的ddNTP的羟基被叠氮基团封锁了D、Sanger测序是边合成边测序考生答案：B7关于不明原因感染，下列说法正确的是A荧光定量PCR、分离培养等传统技术可用于验证高通量测序结果，但结果可能不一致B“宏”策略比“靶向”更适用于前期获得线索C不明原因感染的识别暂时没有唯一的“金标准”，要基于线索不断积累证据，并结合行病学调查和临床症状综合研判，找到可能性最大已知病原体并警惕是否有可能是新病原体。
D获得较明显的线索时，可考虑有参拼接策略进一步强化证据考生答案：A,B,C,D8在一次新冠疫情暴发中，实验室经过高通量测序发现感染者张三的新冠病毒基因组比李四多1个SNP，其他SNP完全一样，下列说法正确的是A他俩可能被同一个其他人感染B他俩可能没有传播关系C可能是李四传染给了张三D可能是张三传染给了李四考生答案：A,B,C9纳米孔测序技术的主要研发方向包括A光学纳米孔B液态纳米孔C固态纳米孔D生物纳米孔考生答案：C,D10、Illumina测序的“边合成边测序”过程一般被称为“桥式PCR”。
生物信息学概论
生物信息学是一门生物学、计算机科学和统计学交叉的新兴学科，利
用计算机科学、统计学和生物学等领域的技术手段，研究生物学中的信息
问题。
生物信息学的发展得益于计算机技术的迅速发展和基因组学的大规
模进展，是推动生命科学发展和实现个性化医学的关键技术之一。
生物信息学的研究内容主要包括基因组学、转录组学、蛋白质组学、
代谢组学、系统生物学和生物信息学软件等方面。
其中，基因组学是生物
信息学的核心内容，研究的是基因组的结构、功能和进化等问题。
转录组
学是研究基因的转录和表达的分子生物学学科，蛋白质组学是研究所有蛋
白质的表达和功能，代谢组学研究的是生物体内代谢产物的组成和代谢活动。
系统生物学则是研究生物体系统级的调控规律和功能。
生物信息学也是个充满挑战和机遇的领域。
生物物种之间的差异和基
因组的复杂性，给生物信息学的研究和应用带来了很大的挑战。
目前生物
信息学面临着数据管理、数据标准化、数据挖掘和信息整合等方面的挑战。
同时，在生物信息学应用中，还有重要的伦理和法律问题等等。
总之，生物信息学不仅是一个新兴专业，也是生命科学与计算机科学、统计学等交叉领域的典型代表，它将成为解决许多生命科学研究的重要工具，对医学、农业等领域的发展也将产生深远影响。
生物信息学概论引言生物信息学是一个跨学科领域，综合了生物学、计算机科学和统计学的原理和方法。
它通过处理和分析大量的生物数据来解决生物学问题。
生物信息学在基因组学、蛋白质组学、代谢组学等领域都起着重要作用。
本文将介绍生物信息学的基本概念、技术和应用。
生物信息学的基本概念生物信息学的核心概念是将生物学数据与计算机科学和统计学方法相结合。
生物学数据可以包括基因序列、蛋白质结构、代谢通路等。
计算机科学和统计学方法则用于处理和分析这些数据。
生物信息学的目标是从生物学数据中提取有用的信息，从而加深对生物系统的理解。
生物信息学的基本任务包括生物数据的收集、存储、管理和分析。
生物数据的收集可以通过实验室技术如DNA测序、质谱分析等获得。
收集到的数据需要进行格式转换和标准化，以便于存储和分析。
存储和管理生物数据需要高效的数据库和文档管理系统。
生物数据的分析可以使用各种统计学和机器学习算法来识别生物学特征和解释生物学现象。
生物信息学的技术和工具生物信息学使用了许多技术和工具来处理和分析生物学数据。
以下是一些常见的生物信息学技术和工具：1. 基因组学分析基因组学分析是生物信息学的重要领域之一。
它主要研究基因组的结构和功能。
常用的基因组学分析技术包括基因组序列比对、基因预测、基因表达分析等。
常用的基因组学工具包括BLAST、GeneMark、TopHat等。
2. 蛋白质组学分析蛋白质组学分析研究蛋白质的结构和功能。
它可以通过质谱分析等技术来识别和鉴定蛋白质。
常用的蛋白质组学工具包括MASCOT、Proteome Discoverer等。
3. 代谢组学分析代谢组学研究生物体内代谢产物的数量和种类。
它可以通过质谱分析和核磁共振等技术来分析代谢产物。
常用的代谢组学工具包括MetaboAnalyst、XCMS等。
4. 网络分析网络分析研究生物系统中的相互作用关系。
这些关系可以通过基因调控网络、蛋白质相互作用网络等来表示。
常用的网络分析工具包括Cytoscape、STRING等。
952《生物信息学》考试大纲及解析本《生物信息学》考试大纲适用于中国科学院大学报考生物信息学专业的硕士研究生入学考试。
生物信息学是一门研究生物和生物相关系统中信息内容和信息流向的综合性科学。
它采用信息科学、计算机科学、生物数学、比较生物学等学科的观点和方法对生命的现象及其组成分子（核酸、蛋白质等）进行研究，主要研究生命中的本质和规律，包括物质组成、结构功能、生命体的能量和信息交换传递等。
通过对生物信息的计算处理，人们能从众多分散的生物学观测数据中获得对生命运行机制的详细而系统的理解。
考试内容★生物信息学概论和数据库★序列数据的收集和存储★基因组序列组装和基因注释★基因结构元件识别和分析★双序列与多序列比对★数据库检索算法★序列变异研究的算法与进化分析★数据可视化★基因表达与调控网络★表观遗传学数据分析★蛋白质分类与结构预测考试要求★了解生物信息学概念、研究方向•生物信息学是一门研究生物和生物相关系统中信息内容和信息流向的综合性科学。
它采用信息科学、计算机科学、生物数学、比较生物学等学科的观点和方法对生命的现象及其组成分子（核酸、蛋白质等）进行研究，主要研究生命中的本质和规律，包括物质组成、结构功能、生命体的能量和信息交换传递等。
通过对生物信息的计算处理，人们能从众多分散的生物学观测数据中获得对生命运行机制的详细而系统的理解。
★发展趋势和重要事件•1953DNA双螺旋结构•1955牛胰岛素蛋白质序列生物信息学基础•1967Dayhoff蛋白质序列数据库•1971蛋白质结构数据库protein data bank PDB•1974欧洲分子生物学实验室EMBL建立•1977化学降解法链终止法发明第一个基因组序列噬菌体•1982GenBank数据库建立•1986SwissProt蛋白质序列数据库建立人类基因组计划提出•1987日本DNA数据库DDBJ发行•1990人类基因组计划启动•1995全基因组鸟枪法完成流感嗜血杆菌全基因组测序第一个全基因组序列基因组时代开始•2003人类基因组计划完成★包括泛基因组和元基因组的概念，和第一个基因组数据库的产生等。
山东师范大学生科院生物信息学知识点生物信息学名词解释：1、遗传图谱(genetic map)2、物理图谱(physical map)3、重叠群(Contig)4、同线性(synteny)5、序列图谱6、转录图谱7、进化信息8、ORF开放阅读框9、序列比对(Sequence Alignment)10、一致性(identity)11、相似性(Similarity)12、同源性(Homology)13、直系同源（Orthologous ）14、旁系同源（Paralogous）15、空位罚分(Gap Penalties)16、低复杂度区域（Low-Complexity Region ，LCR）17、双序列比对（Pairwise Sequence Alignment）18、命中点（hit）19、密码子偏好性(Codon Usage bias)20、同义密码子21、目标肽（Target peptide）22、信号肽（signal peptide）23、系统发生学（phylogenetics）24、分子系统发生学（molecular phylogenetics）25、系统发生树(phylogenetic tree)26、遗传漂变(Genetic drift)27、分子进化速率28、选择压力（Selective pressure）29、异系同源物(Xenolog)30、密码子使用的相对频率(Relative Synonymous Codon Usage，RSCU)31、密码子适应指数(Codon adaption index，CAI)32、有效密码子数(Efective Number of Codon，Nc)一、知识点：英文字母简称及其代表含义:EST表达序列标签（从cDNA文库中获得的短序列）SNP单核苷酸序列多态性SRA序列读取片段，效率高错误率高RFLP限制性片段长度多态性VNTR可变串联重复STR 简短串联重复HGP 序列标记位点STS（单拷贝）Contig 重叠群（跨叠克隆群）CDS 编码区Base pair碱基对TSS转录起始ORF开放阅读框UTR非编码区RGP 水稻基因组计划HGP 人类基因组计划ENCODE:DNA元件百科全书计划MSP:最大片段对，maximal segment pair第二章生物信息学引论1、遗传图谱、序列图谱、Contig、同线性的概念理解2、人类基因组计划的一些关键数字：1990年启动、2001年发表草图、2003年完成、2004年完成图公布，预计15年时间(1990～2005)至少投入30亿美元，完成人全部24(22+X+Y)条染色体中3.2×109个碱基对的序列测定。
