基因工程基因操作过程中的工具酶
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各种工具酶在基因工程操作过程中发挥的重要作用下载温馨提示:该文档是我店铺精心编制而成,希望大家下载以后,能够帮助大家解决实际的问题。
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一、限制性核酸内切酶(restriction endonuclease)1.定义:凡能识别和切割双链DNA分子内特定核苷酸序列的酶,也称为限制酶(restriction enzyme,RE)。
2.类型:来自原核生物,有三种类型。
Ⅰ型:兼具甲基化修饰和ATP参与的核酸内切酶活性,随机切割。
Ⅱ型:大多能特异识别4~6个核苷酸序列(回文结构),最大识别序列为8个核苷酸,如SfiI、NotI;但有近10种Ⅱ型限制酶的识别序列为非回文结构,如SfaNI、MnlI等,Ⅱ型限制酶均可作为基因工程的工具酶。
另有一些来源不同的限制酶的识别位点是相同的核苷酸序列,将这类酶特称为同工异源酶(isoschizomers)或同裂酶。
同工异源酶切割产生相同的末端;有一些同工异源酶对于切割位点上的甲基化碱基的敏感性有所差别,故可用来研究DNA 甲基化作用,如SmaI和XmaI;HpaII和MspI;MboI和Sau3AI是成对的同工异源酶;其中HpaII和MspI是一对同工异源酶,其识别位点是CCGG。
与同工异源酶对应的一类限制酶,它们虽然来源各异,识别序列也各不相同,但都产生出相同的粘性末端,称为同尾酶(isocaudamers)。
常用的限制酶BamHI、BclI、BglII、Sau3AI和XhoII就是一组同尾酶,它们切割DNA之后都形成由GATC4个核苷酸组成的粘性末端。
显而易见,由同尾酶所产生的DNA片段,是能够通过其粘性末端之间的互补作用而彼此连接起来的,因此在基因克隆实验中很有用处。
但必须指出,由两种同尾酶消化产生的粘性末端,重组之后所形成的序列结构再不能被原来的任何一种同尾酶所识别。
Ⅲ型:功能基本同Ⅰ型,但为特定位点切割。
三种限制酶的区别如下表所示:Ⅰ型Ⅱ型Ⅲ型DNA底物dsDNA dsDNA dsDNA辅助因子Mg2+,A TP,SAM Mg2+ Mg2+,A TP识别序列特异特异特异切割位点非特定(于识别序列前后100~1000bp范围之内)特定(切割于识别序列之中或近处,固定位点)特定(切割点在识别序列后25~75bp处)与甲基化作用的关系内切酶蛋白同时具有甲基化酶的作用酶蛋白不具有甲基化作用内切酶蛋白同时具有甲基化酶的作用3.命名:第一个字母取自产生该酶的细菌属名,用大写;第二、第三个字母是该细菌的种名,用小写;第四个字母代表株。
基因工程工具酶引言基因工程是一门利用重组DNA技术来改变生物体遗传性状的学科。
在基因工程的过程中,基因工程工具酶发挥着关键的作用。
本文将介绍几种常用的基因工程工具酶,包括限制性内切酶、连接酶和修饰酶。
一、限制性内切酶1.1 定义限制性内切酶(Restriction Enzyme)是一类具有特异性切割DNA双链的酶。
它可以识别并切割DNA的特定序列,通常这个序列是对称的,在切割后会产生特定的片段。
1.2 工作原理限制性内切酶能够通过识别和结合DNA的特定序列来进行切割。
它们通常识别的序列是4到8个碱基对长,具有一定的对称性。
一旦内切酶与特定序列结合,它会切断DNA的链,在特定的位置形成断裂,从而将DNA切割成特定的片段。
1.3 应用限制性内切酶在基因工程中有着广泛的应用。
它们可以用于构建基因工程载体、进行DNA片段的精确克隆等。
通过选择适当的限制性内切酶,可以对DNA进行特定的切割和连接,从而实现对目标基因的定向操作。
二、连接酶2.1 定义连接酶(Ligase)是一种酶类,能够将两条DNA片段连接起来。
在基因工程中,连接酶通常被用于连接目标基因和载体。
2.2 工作原理连接酶通过催化两条DNA片段之间的磷酸二酯键的形成来连接DNA。
它可以将两条具有互补末端的DNA片段连接在一起,形成一个新的DNA分子。
2.3 应用连接酶在基因工程中的应用非常广泛。
它们可以用于构建重组DNA分子、进行目标基因的插入等。
通过连接酶的作用,可以将多个DNA片段连接起来,构建出符合需要的重组DNA分子。
三、修饰酶3.1 定义修饰酶是指能够修饰DNA分子的酶类。
在基因工程中,修饰酶通常被用于添加或去除特定的DNA序列。
3.2 工作原理修饰酶可以通过催化酸解或碱解反应来改变DNA分子的结构。
它们可以添加或去除DNA上的甲基基团、酶解酶切位点等。
3.3 应用修饰酶在基因工程中起着重要的作用。
它们可以用于DNA甲基化的分析、目标基因的修饰等。
分子生物学实验常用工具酶总结————————————————————————————————作者: ————————————————————————————————日期:现代分子生物学实验手册工具酶基因工程:在人工可以控制条件下,将基因剪切或重新组合,再导入另一生物体内,使这些基因在其中表达并遗传下去的一门技术。
核心:对基因进行人工切割、连接和重新组合,构建重组DNA。
工具酶:在基因工程的重组DNA过程中,所需要用到的酶的统称。
一、限制性内切酶(restriction endonuclease)主要功能:对外源性的双链DNA进行切割、水解,不允许外源性DNA存在于细菌自身细胞内。
(这种酶能对在自身细胞内存在的DNA种类给予限制——限制性内切酶)限制-修饰系统:合成限制性内切酶的细胞,其自身的DNA不受酶的切割,这是因为细菌细胞还会合成一种修饰酶,可以对自身DNA进行修饰,即改变DNA 原来具有的可以被限制性内切酶识别的核酸顺序结构,从而不被限制性内切酶识别及切割、水解。
保护自身遗传物质稳定的机制。
限制性内切酶:从原核生物中发现的,约600种,可识别108种不同的特定DNA顺序。
以内切方式水解核酸链中的磷酸二酯键,产生DNA片段的5’端为P,3’端为-ﻩOH。
命名:获得该酶的细菌属名的第一个字母(大写)+该菌种名的前两个字母(小写)+株系的字母(小写)或数字+罗马数字(同一株菌种不同内切酶的编号)例:细菌属名细菌种名菌株名称限制酶名称Arthrobacter luteusAlu IEscherichia coli RY13Eco R IH Ham H IBacillus amyloliquefaciensHaemophilus influenzae Rd HindIII(一)三种常用内切酶1. I型限制性内切酶同时兼有切割DNA的功能和修饰酶的修饰功能。
在酶的识别位点上,若DNA两条链菌没有发生甲基化,则行使内切酶的功能,对DNA进行切割,同时转变成ATP酶。
《基因工程的工具——酶与载体》知识清单基因工程作为现代生物技术的核心领域之一,为人类带来了前所未有的机遇和挑战。
而在基因工程中,酶和载体是至关重要的工具,它们就像是工匠手中的精巧工具,帮助我们实现对基因的精确操作和转移。
一、基因工程中的酶1、限制性内切酶限制性内切酶,也被称为“分子剪刀”,是基因工程中最重要的工具酶之一。
它能够识别特定的核苷酸序列,并在特定的位点将 DNA 分子切断。
这种特性使得我们能够从复杂的 DNA 分子中切取特定的基因片段。
不同的限制性内切酶识别的序列不同,这为基因工程的操作提供了丰富的选择。
限制性内切酶的作用就像是一把精准的剪刀,能够在 DNA 这个长长的“绳子”上剪出我们需要的特定片段。
比如,EcoRI 能识别GAATTC 序列,并在 G 和 A 之间切断 DNA 双链。
2、 DNA 连接酶当我们用限制性内切酶切下所需的基因片段后,需要将它们与其他DNA 片段连接起来,这时候就轮到 DNA 连接酶发挥作用了。
DNA 连接酶能够将两个具有相同黏性末端或平末端的 DNA 片段连接在一起,形成一个完整的 DNA 分子。
想象一下,DNA 连接酶就像是一个“胶水”,把被剪开的 DNA 片段重新粘在一起,使它们成为一个连续的整体。
3、 DNA 聚合酶在基因工程中,DNA 聚合酶常用于 DNA 的复制和扩增。
例如,PCR(聚合酶链式反应)技术就依赖于耐高温的 Taq DNA 聚合酶。
通过 PCR 技术,我们可以在体外大量扩增特定的 DNA 片段,为后续的实验和应用提供足够的材料。
4、反转录酶反转录酶能够以 RNA 为模板合成互补的 DNA(cDNA)。
这在获取真核生物的基因时非常有用,因为真核生物的基因中含有内含子,而通过反转录得到的 cDNA 不含内含子,更便于在原核生物中表达。
二、基因工程中的载体1、质粒质粒是一种存在于细菌细胞质中的小型环状 DNA 分子。
它具有自主复制能力,可以在细菌细胞内独立存在和复制。
第二章 基因工程中常用的工具酶限制性内切酶—主要用于DNA 分子的特异切割分子的特异切割DNA 甲基化酶—用于DNA 分子的甲基化分子的甲基化 核酸连接酶—用于DNA 和RNA 的连接的连接核酸聚合酶—用于DNA 和RNA 的合成的合成核酸酶—用于DNA 和RNA 的非特异性切割的非特异性切割核酸末端修饰酶—用于DNA 和RNA 的末端修饰的末端修饰其它酶类--用于生物细胞的破壁、转化、核酸纯化、检测等。
用于生物细胞的破壁、转化、核酸纯化、检测等。
§2-1 核酸内切限制酶定义:核酸内切限制酶是一类能够识别双链DNA 分子中的某种特定核苷酸序列,并由此切割DNA 双链结构的核酸内切酶。
双链结构的核酸内切酶。
到目前为止已经从许多种不同的微生物中分离出了2300种以上不同的核酸内切限制酶。
种以上不同的核酸内切限制酶。
核酸内切限制酶的发现及其生物功能(图)一 、限制修饰系统的种类(图)限制修饰系统的种类(图)二、 限制性内切酶的定义、命名1. 定义:广义指上述三个系统中的限制酶;广义指上述三个系统中的限制酶;狭义指II 型限制酶。
型限制酶。
2. 命名:限制酶由三部分构成,即菌种名、菌系编号、分离顺序。
限制酶由三部分构成,即菌种名、菌系编号、分离顺序。
例如:Hin d Ⅲ 前三个字母来自于菌种名称H. influenzae ,“d”表示菌系为d型血清型;“Ⅲ”表示分离到的第三个限制酶。
表示分离到的第三个限制酶。
Eco RI RI——Escherichia coli RI RI Hin d Ⅲ—Haemophilus influensae d ⅢSac I (II)—Streptomyces achromagenes I (Ⅱ)三、Ⅰ型和Ⅲ型核酸内切限制酶的缺点a.Ⅰ型核酸内切限制酶虽然能够识别DNA 分子中的特定序列,但它们的切割作用却是随机的,在距特异性位点至少1000bp 的地方可以随机地切割DNA 分子,因此这类酶在基因克隆中显然是没有用处的。
《基因工程的工具——酶与载体》知识清单一、基因工程简介基因工程,又称为重组 DNA 技术,是指按照人们的愿望,进行严格的设计,通过体外 DNA 重组和转基因等技术,赋予生物以新的遗传特性,从而创造出更符合人们需要的新的生物类型和生物产品。
它是在分子水平上对基因进行操作的复杂技术,而实现这一技术的关键就在于一系列特殊的工具,其中酶和载体起着至关重要的作用。
二、基因工程中的酶1、限制性核酸内切酶(限制酶)限制酶是能够识别双链 DNA 分子的某种特定核苷酸序列,并使每一条链中特定部位的两个核苷酸之间的磷酸二酯键断开的酶。
限制酶具有特异性,即一种限制酶只能识别一种特定的核苷酸序列,并在特定的切点上切割 DNA 分子。
例如,EcoRⅠ限制酶只能识别GAATTC 序列,并在 G 和 A 之间切断磷酸二酯键。
限制酶切割DNA 分子产生的末端有两种类型:黏性末端和平末端。
黏性末端是指被限制酶切开的 DNA 双链的切口,带有几个伸出的核苷酸,它们之间正好互补配对;平末端则是指切口平整,不带有伸出的核苷酸。
2、 DNA 连接酶DNA 连接酶的作用是将两个具有相同末端(如黏性末端或平末端)的 DNA 片段连接起来,形成一个完整的 DNA 分子。
DNA 连接酶与限制酶的作用相反,它通过催化磷酸二酯键的形成,将断开的 DNA 片段重新连接起来。
3、 DNA 聚合酶在基因工程中,DNA 聚合酶常用于 DNA 片段的扩增,如 PCR 技术(聚合酶链式反应)。
PCR 技术中使用的热稳定 DNA 聚合酶(Taq 酶)能够在高温环境下保持活性,不断地将脱氧核苷酸加到引物的 3'端,使 DNA 链得以延伸。
4、反转录酶反转录酶能够以 RNA 为模板合成互补的 DNA 链,即 cDNA。
这在获取目的基因时非常有用,例如从真核生物细胞中提取出mRNA,然后通过反转录酶合成 cDNA,再进行后续的基因操作。
三、基因工程中的载体1、载体的作用载体在基因工程中主要起到运输目的基因的作用,它能够将目的基因导入到受体细胞中,并使其在受体细胞中稳定存在和表达。
1.工具酶:基因工程的操作,是在分子水平上的操作,依赖一些酶作为工具对基因进行人工切割,拼接和扩增等操作,所以把这些酶称之为“工具酶”。
2.限制性核酸内切酶简称限制酶,是一类能识别双链DNA分子中特定核苷酸序列,并由此切割DNA双链结构的核酸内切酶。
3.平头末端:两条链断开的位置在识别序列的对称中心产生平末端4.粘性末端:两条链上断开的位置是交错的对称地分布在识别序列中心位置两侧,产生粘性末端5.同裂酶:来源不同,识别相同序列的限制酶6.同序同切酶:识别序列和切割位置都相同7.同序异切酶:识别序列相同,切割位点不同8.同尾酶:识别序列不同,但是产生相同的粘性末端的限制酶9.II型限制性内切酶由于反应条件的改变,其限制酶的特异性发生松动,识别和切割序列发生改变,这一特性称为星号活性。
10.DNA连接酶:可使一段DNA的3` 羟基末端和5`磷酸末端形成3`,5`- 磷酸二酯键,把两个DNA 片段连在一起,封闭DNA双链上切口的酶。
11. DNA聚合酶:在引物和模板存在下,把脱氧核糖单核苷酸连续的加到双链DNA分子引物链的3’-OH端,催化核苷酸的聚合作用。
12.∆G 值:是指DNA 双链形成所需的自由能,该值反映了双链结构内部碱基对的相对稳定性,△G值越大,则双链越稳定。
13.平台期:PCR反应过程中,随着PCR产物的逐渐积累,被扩增的DNA 片段不再呈指数增加,而进入线性增长期或静止期,即出现“停滞效应”。
14.绝对定量:测定目的基因在样本中的拷贝数(必须使用已知拷贝数的绝对标准品,必须做标准曲线)15.相对定量:测定目的基因在样本中的含量的相对比例,不需要知道其拷贝数16.Ct值:每个反应管内的荧光信号到达设定的域值时所经历的循环数17.分子杂交:有一定同源性的两条核酸单链,在适宜的温度和离子浓度等条件下,通过碱基互补退火形成稳定的双链分子的过程。
18. 探针:核酸探针是指用放射性核素、生物素或其他活性物质标记的,能与特定的核酸序列发生特异性互补的已知DNA或RNA片段。
基因工程常用的工具酶常州工程职业技术学院制药与生物工程技术系生物制药0911 刁亚军学号:2009423134引言:在基因工程的研究和发展过程当中,有许多必不可少的因素影响和制约着基因工程的进展。
本篇综述主要讲述的是基因工程常用的一些工具酶,他们包括限制性内切酶,DNA聚合酶,T4噬菌体DNA连接酶,T4多聚核苷酸激酶,碱性磷酸酶,核酸酶。
这些酶在基因工程中发挥着非常重要的作用。
限制性内切酶限制性核酸内切酶是可以识别DNA的特异序列,并在识别位点或其周围切割双链DNA的一类内切酶,简称限制酶。
根据限制酶的结构,辅因子的需求切位与作用方式,可将限制酶分为三种类型,分别是第一型(Type I)、第二型(Type II)及第三型(Type III)。
Ⅰ型限制性内切酶既能催化宿主DNA的甲基化,又催化非甲基化的DNA的水解;而Ⅱ型限制性内切酶只催化非甲基化的DNA的水解。
III型限制性内切酶同时具有修饰及认知切割的作用。
限制性内切酶的由来一般是以微生物属名的第一个字母和种名的前两个字母组限制性核酸内切酶成,第四个字母表示菌株(品系)。
例如,从Bacillus amylolique faciens H中提取的限制性内切酶称为Bam H,在同一品系细菌中得到的识别不同碱基顺序的几种不同特异性的酶,可以编成不同的号,如HindII、HindIII,HpaI、HpaII,MboI、MboI等。
限制性内切酶(restriction endonuclease):一种在特殊核甘酸序列处水解双链DNA的内切酶。
Ⅰ型限制性内切酶既能催化宿主DNA的甲基化,又催化非甲基化的DNA的水解;而Ⅱ型限制性内切酶只催化非甲基化的DNA的水解。
别名Endodeoxyribonuclease简称限制酶酶反应限制性内切酶能分裂DNA分子在一限定数目的专一部位上。
它能识别外源DNA并将其降解。
单位定义在指明pH与37℃,在0.05mL反应混合物中,1小时消化1μg的λDNA的酶量为1单位。
基因工程基因操作过程中的工具酶09生物工程(2)班0902012010摘要:基因工程涉及众多的工具酶可粗略的分为限制酶,连接酶,聚合酶和修饰酶四大类。
其中,以限制性核酸内切酶和DNA连接酶在分子克隆中的作用最为突出。
关键词:基因工程工具酶聚合酶连接酶内切酶正文:一、基因工程工具酶基因工程的操作,是在分子水平上的操作,是依赖一些酶(如限制性核酸内切酶,连接酶,DNA聚合酶等)作为工具对基因进行人工切割,拼接和扩增等操作。
所以把这些酶称之为“工具酶”。
工具酶是对野生菌株(或真核生物如酵母)进行改造、优化、而产生的生物工程产品。
自然界的许多微生物体内存在着一些具有特异功能的酶类。
这些酶类参与微生物的核酸代谢,在核酸复制和修复等反应中具有重要作用,有的酶还作为微生物区别自己和非己的DNA进而降解非己DNA的防御工具。
在研究掌握了利用这些酶类对基因切割、拼接操作方法后,人类获得了最好的基因工程工具。
二、限制性核酸内切酶及其应用(一)限制性核酸内切酶的发现当λ(k)噬菌体侵染E.coli B时,由于其DNA中有EcoB核酸酶特异识别的碱基序列,被降解掉。
而E.coli B的DNA中虽然也存在这种特异序列,但可在EcoB 甲基化酶的作用下,催化S-腺苷甲硫氨酸(SAM)将甲基转移给限制酶识别序列的特定碱基,使之甲基化。
Eco B核酸酶不能识别已甲基化的序列。
最早分离出的限制内切酶是在1968年,Meselson和Yuan,大肠杆菌B和K 菌株,Eco B和Eco K,是I型的,没有实用价值。
首个II型限制内切酶是在1970年,由H.O.Smith等从Heamophilus influenzae 的Rd菌株中Hin d II 。
使得DNA分子的体外精确切割成为可能。
从此,相关研究展开。
如NEB公司的提取和克隆。
目前已纯化出3000种限制性内切酶中,其中有30%是在NEB发现的。
限制性核酸内切酶(restriction endonuclease ):是一类能够识别双链DNA 分子中的某种特定核苷酸序列,并由此切割DNA双链结构的核酸内切酶。
切开的是3,5-磷酸二酯键。
(二)限制性核酸内切酶的分类分为I型、II型和III型。
(三)限制性核酸内切酶的命名1、寄主菌属名的第一个字母和种名的头两个字母组成3个斜体字母的略语表示酶来源的菌种名称,如大肠杆菌Escherichia coli表示为Eco , 流感嗜血菌Haemophilus influenzae表示为Hin;2、用一个正体字母表示菌株的类型,比如Eco R、Hin d;3、如果一种特殊的寄主菌株具有几个不同的限制修饰体系,则用罗马数字标出,比如Eco R I、Hin d III。
(四)II型限制性核酸内切酶的基本特性1、识别位点的特异性每种酶都有其特定的DNA识别位点,通常是由4~8个核苷酸组成的特定序列(靶序列)。
2、识别序列的对称性靶序列通常具有双重旋转对称的结构,即双链的核苷酸顺序呈回文结构。
3、切割位点的规范性交错切或对称切(可形成粘性末端或平末端的DNA分子)。
与II型核酸内切酶有关的几个概念粘性末端:cohesive ends是指DNA分子在限制酶的作用之下形成的具有互补碱基的单链延伸末端结构,它们能够通过互补碱基间的配对而重新环化起来。
平末端:Blunt end在识别序列对称处同时切开DNA分子两条链,产生的平齐末端结构。
则不易于重新环化。
同裂酶:isoschizomers 能识别和切割同样的核苷酸靶序列的不同来源的内切酶。
不同同裂酶对位点的甲基化敏感性有差别。
同尾酶:isocaudamers 识别的靶序列不同,但能产生相同粘性末端的一类限制性核酸内切酶。
如Bam H I 、Bcl I、Bgl II和Xho I 是一组同尾酶。
注意:由同尾酶产生的粘性末端序列很容易重新连接,但是两种同尾酶消化产生的粘性末端重新连接形成的新片段将不能被该两种酶的任一种所识别。
(五)限制性核酸内切酶的消化反应一个限制酶单位(U)指:在理想的反应条件(适宜的缓冲液和反应温度,通常为37℃)下,1h内中完全降解1 μg λ DNA所需要的酶量。
影响酶活性的因素很多,最重要的有:⑴DNA的纯度⑵DNA的甲基化程度⑶酶切反应的温度(通常为37℃)⑷DNA的分子结构⑸核酸内切限制酶的缓冲液在“非最适的”反应条件下,有些核酸内切限制酶识别序列的特异性便会发生“松动”,从其“正确”识别序列以外的其它位点切割DNA分子,这种现象叫星号活性。
用*表示。
三、DNA连接酶及其应用(一)DNA连接酶的发现环形DNA分子的发现使科学家相信一定有一种能连接这种切口的酶存在。
首个DNA连接酶(ligase)——大肠杆菌DNA连接酶,是1967年发现的,是大肠杆菌基因编码。
1970年,发现了T4DNA连接酶,由大肠杆菌T4噬菌体基因编码的。
(二)DNA连接酶作用特点1. 连接的两条链必须分别具有自由3’-OH和5’-P,而且这两个基团彼此相邻;2. 在羟基和磷酸基团间形成磷酸二酯键是一种耗能过程。
E.coli DNA连接酶-连接具互补碱基黏性末端(最初研究表明),现在研究可连接平末端;需NAD+辅助因子,活性低,不常用。
T 4DNA连接酶-连接具互补碱基黏性末端和平末端,需ATP辅助因子,活性高,常用。
(三)DNA连接酶的反应条件影响连接效率的因素有:1. 温度(通常在4-15℃)2. ATP的浓度(10μM/L - 1μM/L )3. 连接酶浓度(一般平末端大约需1~2U,黏性末端仅需0.1U)4. 反应时间(通常连接过夜)5. 插入片段和载体片段的摩尔比(1∶1~5∶1)(四)T4 DNA连接酶对目的DNA片段和载体连接的一般方案1.连接反应一般在灭菌的0.5ml离心管中进行。
2.10μl体积反应体系中:取载体50-100ng,加入一定比例的外源DNA 分子(一般线性载体DNA分子与外源DNA分子摩尔数为1∶1~5∶1),补足ddH2O 至8μl。
3.轻轻混匀,稍加离心,56℃水浴5min后,迅速转入冰浴。
4.加入含ATP的10×Buffer 1μl,T4 DNA连接酶合适单位,用ddH2O 补至10μl,稍加离心,在适当温度(一般14-16℃)连接8-14hr。
四、DNA聚合酶及其应用(一)大肠杆菌DNA聚合酶I是Kornberg A. 1956年首先从大肠杆菌E。
Coli 细胞中分离出来的。
它是一种多功能性的酶,包括3种不同的酶活力:A.5′→3′聚合酶活性(模板,带3′-OH游离基团的引物、4dNTPs、Mg2+ )。
B.双链特异性的5'→3'核酸外切酶活性。
C.3'→5'核酸外切酶活性。
从游离的双链或单链DNA的3′端降解。
不过对于双链的降解可被5′-3′的多聚活性所抑制。
主要是校正作用。
大肠杆菌DNA聚合酶I 的三种用途1.利用缺口转移法制备高比活度的DNA探针利用其5′--3′的外切酶活性及其聚合酶活性。
2.用于DNA连接前的大缺口填充利用5′--3′的聚合酶活性。
3.用于DNA的序列分析利用5′--3′的聚合酶活性。
(二)Klenow片段酶Klenow片段是大肠杆菌聚合酶I 全酶经枯草杆菌蛋白酶处理后产生的大片段酶分子,分子量为76KD 。
酶催活性:⑴5’ →3’ 的聚合酶活性⑵3’ →5’ 的核酸外切酶活性Klenow片段的主要用途(利用5’ →3’ 的聚合酶活性):⑴修补限制性酶消化DNA形成的3′隐蔽末端⑵标记DNA片段的末端底物用[α-32P]-dNTPs⑶cDNA克隆中第二链cDNA的合成⑷DNA序列的测定(三)T4 DNA聚合酶T4DNA聚合酶是从T4噬菌体感染了的大肠杆菌中分离出来的,1.酶催活性:⑴5′→3′的聚合酶活性⑵3 ′→ 5 ′的核酸外切酶活性。
其外切酶活性要比大肠杆菌聚合酶I 的活性高200倍。
比Klenow 片段酶强100~1,000倍。
因此,可以综合利用这两种活性进行取代合成反应:如果反应体系中仅存在一种dNTP或没有底物时,这时T4DNA聚合酶就会表现出3 ′→ 5 ′外切酶活力,从双链DNA的3′开始降解,直到露出底物dNTP相同的碱基。
然后就在此位置发生合成和取代反应。
2.T4DNA聚合酶的用途(1)利用取代合成反应制备探针(2)标记具有平末端的或具有3’-隐蔽末端的DNA片段利用较强的3 ′→ 5 ′外切酶活性和5′→3′聚合活性(3)用于DNA序列分析(四)逆转录酶(反转录酶)逆转录酶是一种依赖RNA的DNA聚合酶。
此酶首先是1970年从鼠白血病毒和劳氏肉瘤病毒中发现的。
这两个课题组的论文都发在了同一期的《Nature》杂志上。
最普遍使用的是从鸟类骨髓母细胞瘤病毒(AMV)分离出来的。
活性:一种可以有效地将mRNA反转录成DNA的酶,其产物称为cDNA(complementary DNA).主要用途是将mRNA转录成cDNA以制备基因片段。
五、修饰性工具酶(一)末端转移酶(terminal transferase)●末端转移酶是一类不依赖于DNA模板的DNA聚合酶。
●特性:该类酶可以在没有模板链存在的情况下,将核苷酸连接到dsDNA或ssDNA的在3’-OH。
特别是对于平末端的双链DNA末端加尾十分有用。
●最常见的用途:给外源DNA片段及载体分子加上互补的同聚物尾巴,以创造黏性末端,便于重组。
(二)SI核酸酶(SI nuclease)这是一种从米曲霉(Aspergillus oryzae)中分离的高度单链特异的外切酶。
活性:可以降解单链DNA或RNA或双链的单链区。
其主要用途有:⑴在cDNA合成过程中,切开cDNA的发夹末端;⑵载体构建过程中,切去DNA片段的单链尾巴,形成平末端结构。
(三)碱性磷酸酶从大肠杆菌中分离的细菌碱性磷酸酶(Bacterial Alkaline Phosphatase)简称BAP。
从小牛肠中分离的叫小牛肠碱性磷酸酶(Calf Intestinal Alkaline Phosphatase),简称CIP,用的广泛。
酶催功能:脱磷酸作用,将单链或双链DNA或RNA5’-P转化成5’-OH。
其主要用途有:⑴在用32P标记DNA 5′端之前,去除5′端的磷;⑵在DNA重组技术中,去除DNA片段的5′磷酸,防止载体的自身环化,提高重组子比例。
参考文献:吴乃虎,基因工程原理,科学出版社,北京,2003.5张惠展,基因工程,高等教育出版社,北京,2010.1毕东海,解开生命密码的钥匙—基因工程,北京,2000.8。