基因芯片及其在胶质瘤中的应用
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片 、应 用 于蛋 白表达 谱 分 析 的蛋 白质 芯 片及 特异 性 较 D A 芯 片更 高 的 D A类 似 物 P A ( e t e n — N N N p pi u d
ce c ) 片等 [, 中 , lcai 芯 i d 2其 】 以基 因芯 片 的应 用最 多 。 基 因芯 片分 为 D A 片段 点 状 微 阵 列 和 高 密 度 N 寡 聚核 苷酸 微 阵 列两 类 。前 者 为 预先 合 成后 组 装 于 载 体之上 ,碱 基序 列 可 能是 未 知 的 ,存 在 交叉 杂 交
交 , 果 有 假 阳性 和 假 阴性 可 能 ; 对 靶 R A 的 纯 结 ② N
生 。 它 的 基 因 测 序 速 度 比传 统 S n e a g r和 Ma a xm
Glet i r 法快 10 0倍 ,还 能 同时 对成 百 上 千 甚 至上 b 0 万 的基 因序 列或 组织 进 行分 析 。一 经 问世 , 即被 】 立 应用 于 临床 医学 , 瘤基 因分析 应 用最 多 。 肿
1 基 因芯 片 简介
度 和 量 的要 求 很 高 ; 检 测 结 果受 到载 体 材 质 、 ③ 操作
和 制 作 方法 的影 响 , 稳 定 ; 必 须 进行 烦 琐 的标 准 欠 ④
化 等 。因此 , 片 分 析结 果 往 往需 要 结 合 N ten印 芯 oh r
迹 或 P R分 析 来 验 证 -。 管 如此 , 的“ 高 ” 点 C 4尽 】 它 三 特
基 因表 达谱 研 究 揭 示 ,无 论 是 新 鲜 标 本 还 是体
外 细 胞 , B 的 基 因 表 达 均 十 分 复 杂 。 S h a 等 G M e gl ( 9 8 以 At s c N 人 类 基 因表 达 微 阵列 对 G M 19 ) l D A a B 和 正 常脑 组 织 的 5 8个 已知 基 因 表 达 进 行 比较 分 8 析 , 检 测 到 1 3个 基 因克 隆 。其 中在 G M 中过 表 共 4 B
析 。 已有 的分子 生 物 学 技术 一 般一 次 仅 分析 一 个 或 几个 基 因 , 然 不能 胜任 。 显 因此 , 一种 高 通量 、 效率 高
和 高 自动化 的新 型基 因分 析 技 术 即基 因芯 片应 运 而
体 上 的 D A存 在 相 同或 类 似 序 列 , 能 出现 交 叉 杂 N 可
性 肿 瘤 。 因可 能是 恶 性肿 瘤 对 人 类 危 害最 大 , 们 原 人 急 于 找 到解 决 途径 。 神经 外 科 领 域 , 年来 的研 究 在 近 多 针 对 多 形 性 胶 质 母 细 胞 瘤 (l batm l— gi ls a mut o o i fr B 。此前 已明确 ,5 ome G M) P 3及 P E T N基 因 突变 缺 失 或 表 皮 生 长 因 子 受 体 扩 增/ 表 达 均 可 导 致 过 G M,但 其起 病 和进 展 的一 系 列 责 任基 因至 今 并 不 B 完 全 清楚 。 此 , 必要 应 用 基 因 芯 片对 该肿 瘤 进行 为 有 多 基 因分 析 。迄 今 为止 , 们 应 用 基 因芯 片 就 G M 人 B 的基 因表 达 谱 、分 子 生 物 学 诊 断 和化 疗 影 响 因素 等 三 个方 面 作 了初 步 分 析 。
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中 国临 床 神 经 外 科 杂 志 2 0 年 6月 第 7卷 第 3期 02
一 19 8 一
・芯 片及其 在胶质 瘤 中的应 用
江 荣才 综述 浦佩 玉 审校
【 关键 词 】 基 因 芯 片 ; 质 瘤 ; 断 ; 疗 胶 诊 治 【 文章 编号 】 10 — 5 X(0 2 0 - 19 0 0 9 13 2 0 )3 0 8 — 3 【 献标识码 】 B 文 【 图分 类 号 】 R 7 94 ; 8 中 3 .1 Q 7 6
还 是 吸 引 了许 多 生命 科 学 工 作 者 ,基 因 芯 片 的应 用
研 究 就几 乎 涉 及 了 医学 领域 的所 有 范畴 。
2 基 因芯 片在 胶 质 瘤 中 的应 用 目前 ,基 因芯 片对 肿 瘤 的研 究 几 乎还 仅 限于 恶
所谓 基 因 芯 片 , 初 是 指将 特 定 的 D A或 寡 聚 最 N 核 苷酸 片段通 过物 理 化 学方 法 固定 于 玻璃 、尼 龙甚 至 塑料 片上 , 多基 因分 析可 同时 进行 的一种 装 置 。 使 此创 意源 于计算 机 芯片 ,习惯上 称作 基 因芯 片 。 cN D A或 寡 聚 核 苷酸 片段 常 以微 小 点 阵形 式 固定 于 载体 上 , 又常 称 为 c N D A或 寡 聚 核苷 酸微 阵 列 。 9 4 19
以荧 光 标 记 D A, 阵列 上 的 c N 或 寡 聚 核 苷 酸 N 与 D A 片段 杂交 ,洗 片后 通 过 激 光 扫 描 读 出杂 交强 度 及 相
关 数 据 信息 、 电子 计算 机 及 相 应 软 件包 进 行 量 化 分
析 。标记 物 也 可 以是 同位素 。 基 因芯 片存 在 一些 技 术 缺 点 :① 由 于 固定 于 载
肿瘤 是 多 基 因变 异 累积 的结果 ,通 常表 现 为原
癌基 因的激 活 和/ 抑 瘤 基 因 的失 活 , 或 肿瘤 中 的异 常 基 因 常达 到 13 1 5分 析 肿 瘤 基 因表 达 常 需 对成 千 0~ , o 上 万的碱 基 测 序和 数 以百 计 的基 因相 互关 系进 行分
年 ,首先 由美 国和 俄 罗斯 分 子 生物 学 专 家联 合研 制
出第 一块 基 因芯 片 , 成 功 地应 用 于 一 中海贫 血 并 地 病人 的突 变基 因检 测 。 由于 其潜 在 的 巨 大生 物 学和 商业 意义 , 展 十分 快 速 , 发 目前 已 由基 因序 列 分析 范 畴扩展 到 组织 抗 原和 受 体检 测 , 称为 生 物芯 片 。 统 除 了基 因芯 片外 ,还 包括 应 用 于多 组 织分 析 的组织 芯