--实验四目的基因的PCR扩增及扩增产物回收
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实验四逆转录PCR (RT-PCR)【实验目的】1.了解用逆转录PCR法获取目的基因的原理。
2.学习和掌握逆转录PCR的技术和方法。
【实验原理】聚合酶链式反应〔PCR〕过程利用模板变性,引物退火和引物延伸的多个循环来扩增DNA序列。
因为上一轮的扩增产物又作为下一轮扩增的模板,是一个指数增长的过程,使其成为检测核酸和克隆基因的一种非常灵敏的技术。
一般经25-35轮循环就可使模板DNA扩增达106 倍。
RT-PCR将以RNA为模板的cDNA〔complement DNA〕合成〔即RNA的反转录〔RT,reversetranscription〕〕,同cDNA的PCR 结合在一起的技术,提供了一种基因表达检测、定量和cDNA克隆的快速灵敏的方法。
由于cDNA包括了编码蛋白的完整序列而且不含内含子,只要略经改造便可直接用于基因工程表达和功能研究,因此RT-PCR成为目前获得目的基因的一种重要手段。
RT-PCR技术灵敏而且用途广泛,可用于检测细胞中基因表达水平、表达差异,细胞中RNA病毒的含量和直接克隆特定基因的cDNA序列。
RT-PCR比其他包括Northern印迹、RNase保护分析、原位杂交及S1核酸酶分析在内的RNA分析技术,更灵敏,更易于操作。
RT-PCR的基本原理〔图〕。
首先是在逆转录酶的作用下从RNA合成cDNA,即总RNA中的mRNA 在体外被反向转录合成DNA拷贝,因拷贝DNA的核苷酸序列完全互补于模板mRNA,称之为互补DNA 〔cDNA〕;然后再利用DNA聚合酶,以cDNA第一链为模板,以四种脱氧核苷三磷酸〔dNTP〕为材料,在引物的引导下复制出大量的cDNA或目的片段。
在RT时,有3种引物可选择〔表4.1) 。
用1〕和2〕方法,理论上是扩增的所有的cDNA,还要用此产物做PCR的模板继续扩增。
如果用3〕方法,先要去:// 查它的序列,并用oligo 等软件设计引物。
RT-PCR可以一步法或两步法的形式进行。