雄鼠的生殖器官包括睾丸、附睾、输精管、储精囊、凝固腺、前列腺、尿道球腺、包皮腺及阴茎。
睾丸：睾丸又称精巢，是产生精子的地方。
睾丸共有两个，幼年时睾丸藏存腹腔内，性成熟以后则下降到阴囊内，其表面为纤维性结缔组织，内部有无数的曲细精管，雄性间质组织产生精子，存在与睾丸的曲细精管内。
附睾：附睾又称精巢上体，由许多弯曲旋廻的细管组成，是接受并暂时贮存精子的地方。
附睾分头、体、尾三部分。
附睾头部与睾丸上部的精细管连接，体部在睾丸的一侧下行，尾部与输精管相连。
精子在通过附睾期间成熟。
成熟的有受精能力的精子通过与附睾相接的输精管，交配时射入雌鼠阴道。
输精管：输精管是精子通过的管道，它是由附睾尾部引出的毛细管在储精囊下面、膀胱的背侧汇合进入尿道。
成年小鼠的输精管存在无数的有受精能力的精子。
储精囊(精液腺)：储精囊呈半月状，形成多数锯齿分叶，内部储存营养精子的白色浓稠分泌物。
凝固腺：为精液腺内侧附着的半月弧形的半透明的器官，起着凝固精液腺所分泌的分泌液的作用，交配后，形成阴栓。
前列腺：前列腺分背叶和腹叶，背叶位于尿道的背侧，腹叶位于膀胱基部附近处尿道腹侧，它与尿道球腺及精液腺等分泌的液体稀释精液，而使精子更为活跃。
尿道球腺：为球状分泌腺，位于骨盆腔内尿道球的背上方。
包皮腺：小鼠的包皮腺较大，是存于阴茎近腹壁上皮间的瓜籽形的脂质分泌腺，开口于包皮内侧。
阴茎：公鼠交配器官，由阴茎体、龟头组成，不交配时保持于包皮内Hypothalamus 下丘脑 Optic chiasma 视交叉 pituitary stalk 垂体Optic chiasm 视神经交叉Adenohypophysis 腺（性）垂体（前叶） intermediate lobe （脑下）垂体中叶 neurohypophysis 垂体神经部。
