综述-分子标记
- 格式:docx
- 大小:23.76 KB
- 文档页数:4
分子标记种类及概述分子标记是一种在生物学、生物化学和药理学研究中广泛应用的技术。
它主要通过将分子或化合物与特定的标记物相结合,以便于对其进行检测、跟踪和定量分析。
分子标记的种类非常多样,包括荧光标记、放射性标记、酶标记和生物素标记等。
每种标记方法都有其特定的优势和适用范围,下面将详细介绍这些分子标记的类型及其概述。
1.荧光标记:荧光标记是最常用且广泛应用的一种分子标记方法。
它通过将目标分子与荧光染料结合,利用目标分子与激发光源相互作用后发出荧光信号来进行检测和定量分析。
荧光标记具有灵敏度高、非破坏性、实时监测能力强等特点,适用于细胞生物学、分子遗传学和生物化学等研究领域。
2.放射性标记:放射性标记是利用放射性同位素来标记目标分子的一种方法。
通过将放射性同位素(如3H、14C、32P等)与目标分子结合,可以通过放射性衰变的特性来检测和定量分析目标分子。
放射性标记具有极高的敏感性和特异性,适用于分子生物学、药理学和临床药理学等研究领域。
3.酶标记:酶标记是利用酶来标记目标分子的一种方法。
通过将酶与目标分子结合,然后加入适当的底物来触发酶的催化反应,可以产生可见色素或荧光信号,从而实现对目标分子的检测和定量分析。
酶标记具有高度特异性和灵敏度,适用于生物化学、免疫学和临床检验等研究领域。
4.生物素标记:生物素标记是利用生物素(一种小分子)与目标分子结合,然后利用亲和性层析或荧光染料来检测和定量分析目标分子的一种方法。
生物素标记具有快速、简单和高效的特点,适用于生化学、药理学和分子生物学等研究领域。
除了以上几种常见的分子标记方法外,还有许多其他的分子标记方法,比如金纳米颗粒标记、蛋白质标记和DNA标记等。
这些标记方法可以根据研究的具体需求来选择和应用。
标记方法的选择应考虑到目标分子的性质、研究目的和实验条件等因素。
分子标记在生物学研究中有着广泛的应用,如细胞成像、蛋白质定位、基因表达研究等。
它们在分子和细胞水平上为我们提供了许多有关生物学过程和分子机制的信息。
分子标记(Molecular Markers),是以个体间遗传物质内核苷酸序列变异为基础的遗传标记,是DNA水平遗传多态性的直接的反映。
每一代的分子标记技术代表如下:
(1)限制性片段长度多态性(Restriction Fragment Length Polymorphism,RFLP)
RFLP是第一代分子标记技术,指把特定的DNA用特点的限制性核酸内切酶进行切割,将切割形成的片段进行标记之后与其他个体进行杂交,以检测不同物种间的多态性。
(2
RAPD是指把第一个生物的基因组用特定的限制性核酸内切酶进行切割,将切割后形成的片段进行扩增,以这些片段为探针来检测2个或多个物种的多态性。
SSR是第二代分子标记技术,指将人工合成或提取的2-8个核苷酸为探针,将其标记之后检测2个或多个物种的多态性。
(4
SNP是第三代分子标记技术,标记单个特殊的核苷酸,用来检测不同个体间的差异性。
检测SNP 的最佳方法是DNA 芯片技术。
对单个核苷酸的差异进行检测,SNP 标记可帮助区分两个个体遗传物质的差异。
分子标记种类及概述分子标记是一种用于标识和追踪分子的技术,主要应用于生物医学研究和临床诊断中。
分子标记的种类繁多,包括荧光标记、放射性标记、放射免疫分析标记、酶标记等。
本文将对这些常见的分子标记进行概述。
荧光标记是最常用的分子标记方法之一,通过将荧光染料与目标分子结合,可以实现对其实时观测和定量分析。
荧光标记的主要优点是高灵敏度、高选择性和易于操作。
常用的荧光染料有荧光素(Fluorescein)、荧光素同工酶(Rhodamine)和青酰胺(Cyanine),它们具有不同的光谱性质和化学稳定性,可以根据实验需要进行选择。
荧光标记的应用包括蛋白质定位、分子诊断和细胞成像等。
放射性标记是利用放射性同位素对分子进行标记,常见的同位素包括碘-125和碘-131、放射性标记的主要优点是灵敏度高,能够实现极低浓度的目标分子的检测。
放射性标记主要应用于放射免疫分析、肿瘤标记和代谢研究等领域。
然而,由于放射性标记具有放射性危险,使用时需要注意安全操作并遵守相关规定。
放射免疫分析标记是将放射性同位素标记的抗原或抗体与待检测物共同作用,通过测定放射性同位素的放射性衰减来定量分析待检测物的含量。
放射免疫分析标记用于检测微量物质,具有高灵敏度和高特异性的优点,广泛应用于生物医学研究和临床诊断中。
放射免疫分析标记可以通过放射性同位素的选择和标记方法的改进来提高其性能。
酶标记是将酶与目标分子结合的一种分子标记方法,通过酶作用产生的特定反应来间接检测目标分子的存在。
常用的酶标记方法包括辣根过氧化物酶(Horseradish Peroxidase, HRP)标记、碱性磷酸酶(AlkalinePhosphatase, AP)标记和β-半乳糖苷酶(β-Galactosidase)标记等。
酶标记的优点包括高灵敏度、高稳定性和容易检测,但其缺点是反应时间相对较长。
除了上述常见的分子标记方法外,还有一些其他的分子标记技术,如生物素标记、量子点标记和金纳米颗粒标记等。
分子标记技术概述目录一、声明 (2)二、分子标记技术概述 (3)三、水果产量提升的重要性 (6)四、全球水果种植现状及趋势 (8)五、影响水果产量的主要因素 (11)六、结语总结 (14)一、声明除了上述六大水果大省,河北、湖北、湖南、福建等省份的水果产业也颇具规模。
河北省的水果种类丰富,包括苹果、梨、桃和葡萄等主要水果品种。
湖北的主要水果品种包括柑橘、桃子、梨子、葡萄、枣、西瓜、甜橙、柿子、猕猴桃、枇杷、李子、杏、无花果等。
湖南主要水果有柑桔、桃、杨梅、冰糖橙、葡萄、猕猴桃等。
福建的主要水果品种包括琯溪蜜柚、度尾文旦柚、永春芦柑、顺昌芦柑、建宁黄花梨、福安巨峰葡萄等。
水果产量的增加有助于减少因产量不足而导致的价格波动,稳定市场价格,使更多消费者能够以合理的价格获得高质量的水果,从而促进社会经济的稳定发展。
水果产业是许多国家和地区农业的重要组成部分,提升水果产量直接关联到农业经济的增长。
高产的水果不仅能够提高农业总产值,还能带动相关产业链的发展,如包装、运输、加工和销售等,为地方经济注入新的活力。
水果产量的提升离不开技术创新和科技进步。
为了满足市场对高品质、高产量水果的需求,种植者必须不断探索和应用新技术、新品种和新方法。
这不仅促进了农业科技的发展,还推动了农业产业的现代化进程。
一些特色水果如柠檬、草莓、葡萄、樱桃等,在全国范围内也有广泛种植。
这些水果不仅丰富了人们的餐桌,也为当地经济发展注入了新的活力。
声明:本文内容来源于公开渠道或根据行业大模型生成,对文中内容的准确性不作任何保证。
本文内容仅供参考,不构成相关领域的建议和依据。
二、分子标记技术概述(一)分子标记技术的基本概念分子标记技术是在DNA分子水平上,通过对遗传物质多态性的检测和分析,进行遗传育种和基因研究的一种现代生物技术。
与传统的形态学标记、生物化学标记和细胞学标记相比,分子标记技术具有更高的准确性和可靠性。
它基于生物个体间基因组中核苷酸序列的差异,能够直接反映DNA水平的遗传多态性。
分子标记技术概述现代生物技术是近几十年来发展起来的以现代生命科学为基础,利用生物体系和现代工程原理,集中多学科的新知识生产生物制品和创造新物种的综合科学技术。
随着分子生物学的快速发展,现代生物技术为作物育种提供了强有力的工具,分子标记辅助选择(MAS)是其中一项重要的技术手段,弥补了传统作物育种中选择效率低的缺点,加快了育种进程,为育种家广泛采用。
一、分子标记的定义与特点遗传标记(genetic marker)是指可追踪的染色体、染色体某一节段、某个基因座在家系中传递的任何一种遗传特性。
在遗传分析上遗传标记可用作标记基因,它具有两个基本特征,即可遗传性和可识别性,生物的任何有差异表型的基因突变型均可作为遗传标记。
传统的遗传标记主要包括形态标记、组织细胞标记、生化标记与免疫学标记等,这些标记都是基因表达的产物,易受生理状态、贮藏加工等多个因素的影响,具有较大的局限性。
Bostein 等(1980)利用限制性片段长度多态性(restriction fragment length polymorphism,RFLP)作为遗传标记分析的手段,开创了应用生物体DNA多态性发展遗传标记的新阶段。
分子标记是根据基因组DNA 存在丰富的多态性而发展起来的可直接反映生物个体在DNA水平上差异的一类遗传标记,它是继形态学标记、细胞学标记、生化标记之后发展起来的新型遗传标记技术。
广义的分子标记是指可遗传的并可检测的DNA 序列或蛋白质分子。
而通常所说的分子标记是指以DNA 多态性为基础的遗传标记,是以个体间遗传物质内核苷酸序列变异为基础的遗传标记,直接反映出生物个体或种群间基因组中某种差异的特异性DNA片段。
相对于传统的遗传标记,DNA 分子标记的优势在于:DNA 分子标记多为共显性标记,能够简单直观地分辨出纯合和杂合的基因型,对隐性性状的选择十分有利;多态性高,由于自然界中存在丰富的基因组变异,能够开发出几乎无限的DNA 分子标记;稳定性好,不受环境和生物生长与发育阶段的影响,任何时候任何组织的DNA 都可用于标记分析;由于DNA 分子标记是在DNA 水平上开发而来,表现为中性,不会与其他性状连锁,因此不影响目标性状的表达;检测手段简便、迅速,成本低。
分子标记种类及概述分子标记是一种在生物学和化学研究中广泛应用的技术,用于标记和追踪特定分子或化合物。
这些标记物能够提供关于分子的定位、数量、运动和相互作用的信息,从而帮助研究人员理解生物过程和化学反应的机制。
在本文中,将介绍几种常见的分子标记技术及其应用。
1.荧光标记:荧光标记是一种将荧光染料与目标分子结合的技术。
这些染料能够吸收特定波长的光并发射出不同波长的荧光。
通过在显微镜下观察荧光信号的强度和位置,研究人员可以了解分子在细胞或组织中的分布和动态变化。
荧光标记在细胞成像、蛋白质定位和分子交互作用研究等领域得到广泛应用。
2.放射性标记:放射性标记利用放射性同位素将目标分子标记。
这些同位素会发射出放射性粒子,可以通过放射性探测器进行检测和定量。
放射性标记在生物体内的追踪和代谢研究中具有重要作用。
例如,放射性同位素碘-125可以用于标记核酸和蛋白质,用于核酸杂交实验和蛋白质免疫沉淀等研究。
3.酶标记:酶标记是一种将酶与目标分子结合的技术。
酶可以催化底物的转化并产生可测量的信号。
常用的酶标记方法包括辣根过氧化物酶(HRP)标记和碱性磷酸酶(AP)标记。
这些标记在免疫学实验、分子诊断和酶联免疫吸附实验(ELISA)等领域得到广泛应用。
4.金属标记:金属标记利用金属离子将目标分子标记。
这些金属离子可以与特定配体结合形成稳定的络合物。
常用的金属标记包括铁、铑、镉等。
金属标记在蛋白质结构研究、药物输送和分子成像等领域具有重要应用价值。
5.生物素标记:生物素标记是一种将生物素与目标分子结合的技术。
生物素是一种小分子,能够与亲和力很高的亲生素结合。
通过将亲生素标记上荧光染料或酶等探针,可以实现对目标分子的标记和检测。
生物素标记在免疫组织化学、核酸杂交和蛋白质亲和纯化等领域得到广泛应用。
总之,分子标记技术是现代生物学和化学研究中不可或缺的工具。
通过将特定的标记物与目标分子结合,研究人员可以追踪和定量目标分子在生物体内的分布、运动和相互作用,从而深入了解生物过程和化学反应的机制。
分子标记技术分子标记技术是一种在物理学、生物学和化学领域具有重要应用的技术,它可以被用来检测和追踪细胞、组织和器官内的少量物质。
此外,它还可以用于分析和组织多种小分子的表征和探索。
与传统的分析技术相比,分子标记技术具有更高的灵敏度,可以快速进行大批量的分析,而不影响样本细节。
分子标记技术主要分为三大类:基于分子探针的标记技术,基于蛋白质和细胞表面抗原的标记技术以及基于偶联反应的标记技术。
基于分子探针的标记技术是一种最常用的分子标记技术,它利用一些特定的化合物来检测特定的物质,如DNA和RNA等。
通常,这些探针化合物是染料或荧光素等有色物质,当它们与特定的分子结合时,会发出特定的荧光信号。
基于蛋白质和细胞表面抗原的标记技术包括各种免疫技术,比如免疫组化,抗原-抗体免疫印迹,以及免疫荧光技术等。
这些技术通过抗原-抗体结合的方式,利用特异的抗体识别特定的蛋白质和细胞表面抗原,并通过染料或荧光素的发光表示检测出的信息。
偶联反应标记技术是一种重要的分子标记技术,它通过一种偶联的反应,将一种可以发出特定荧光或染色信号的化合物连接到另一种特定部位的分子上。
这种技术可以应用于检测例如DNA和RNA等特定类型的分子,从而对细胞内各种活动进行检测。
此外,分子标记技术也是分子生物学和化学研究领域中非常重要的技术,它可以帮助研究者们更好地了解结构、功能和调控机制等相关课题。
它还可以应用于药物开发、重大疾病的研究与治疗、医学诊断等多个领域,对生命科学的研究和发展具有重要的意义。
总而言之,分子标记技术是细胞和分子研究中重要的技术,其结果具有高精确度,可以快速、准确地检测细胞及其内部物质和活动物质,为细胞和分子生物学研究打开了新的大门,也为疾病的诊断和治疗提供了强有力的支持。
食安0801 02 邓凯近年来,现代生物技术,特别是分子标记技术发及其产品的检验检疫工作中,分子标记技术也得到展迅速,已被广泛应用于生物进化、系统分类、物种了越来越广泛的应用。
本文综述了分子标记技术在多样性、遗传育种、品种鉴定、基因组作图或基因定植物检疫实践中的应用和发展前景。
位、基因定位克隆(map-based cloning)等领域的研1分子标记技术发展概况究。
广义的分子标记(molecular markers)是指可遗传遗传标记(geneticmarkers)的发展经历了4个阶的并可检测的DNA序列或蛋白质标记;狭义的分子段:①形态标记(morphological markers),主要指植标记概念只是指DNA标记。
蛋白质标记包括种子储物学形态特征;②细胞标记(cytological markers),主藏蛋白、同工酶(指由一个以上基因位点编码的酶的要是染色体核型和带型等;③生化标记(biochemical 不同分子形式)及等位酶(指由同一基因位点的不同markers),主要是同工酶和储藏蛋白等生化物质;等位基因编码的酶的不同分子形式)。
在出入境植物④分子标记(molecular markers),即核苷酸。
分子标记是以生物大分子(主要是遗传物质DNA)的多态性为基础的一种遗传标记。
理想的分子基于“3S”技术的数字化烟草农业标记所具有的优点:①多态性高;②遍布整个基因③检测手段简单、迅速;④无基因多效性;⑤能够明确辨别等位基因;⑥实验重复性好;⑦直接以试论林木病虫害防治信息的数DNA的形式表现,不受植物的生长条件和发育阶段的影响,在植物的任何生长阶段都可检测。
第一代分子标记(以Southern杂交技术为核心)对数字农业的认识及其基本构想现代农为限制性片段长度多态性(restriction fragment length polymorphism,缩写20世纪80年代中期发展起来的一种最早的分子标记。
分子标记技术的类型原理及应用分子标记技术是一种基于分子生物学的技术,在研究、诊断和治疗等领域具有广泛的应用价值。
这种技术利用染料、荧光物质、辐射标记物等来标记目标分子,从而实现对分子的检测、追踪和研究。
下面将介绍分子标记技术的几种类型、原理及应用。
一、荧光标记技术荧光标记技术是一种常见的分子标记技术,基于物质的荧光特性,通过在目标分子上标记荧光染料或荧光蛋白等物质,实现对目标分子的可见或可荧光检测。
该技术的原理是标记物被激发后会发出荧光,通过检测荧光信号的强度、波长或寿命等特征来获得关于目标分子的信息。
荧光标记技术在生物学研究、生命体内药物输送系统的研究和临床诊断等方面得到了广泛的应用。
在生物学研究中,荧光标记技术可以用于研究细胞结构和功能、蛋白质相互作用、细胞内信号传导等。
在药物输送系统的研究中,荧光标记技术可以用于研究药物在体内的分布和代谢情况等。
在临床诊断中,荧光标记技术可以用于检测血液中的病原体、肿瘤标志物以及其他疾病相关分子等。
二、辐射标记技术辐射标记技术是一种通过辐射标记物对目标分子进行标记的技术。
常用的辐射标记物包括放射性同位素和放射性荧光染料等。
该技术的原理是通过辐射标记物自身所放出的辐射(如α、β射线等)或荧光来检测目标分子。
辐射标记技术在医学、生物学和环境科学等领域都有广泛的应用。
在医学方面,辐射标记技术可以用于肿瘤的早期诊断和治疗、药物代谢和排泄的研究等。
在生物学方面,辐射标记技术可以用于研究生物体的代谢过程、病原体的传播途径等。
在环境科学方面,辐射标记技术可以用于了解污染物的迁移和转化、生态系统的功能及稳定性等。
三、化学标记技术化学标记技术是一种通过化学反应将标记物与目标分子结合的技术。
常见的化学标记物包括生物素、抗原抗体等。
该技术的原理是通过物质间的化学反应使两者结合,并通过检测化学标记物的特征来获得目标分子的信息。
化学标记技术在生物医学研究、食品安全检测和环境监测等领域有广泛应用。
分子标记的名词解释分子标记是一种用于识别和定位生物分子的技术。
它通过在目标分子上附着特定的标记物(通常是化学物质)来实现。
这些标记物可以使科学家们追踪和可视化目标分子的位置、数量和活性,从而帮助我们更好地理解生物学过程和疾病的发展机制。
以下将进一步解释分子标记的原理和应用。
一、原理分子标记的原理基于分子生物学的相关技术,主要包括荧光标记、放射性标记和化学标记等。
其中,荧光标记是应用最为广泛的分子标记方法。
荧光标记是将目标分子与带有荧光染料的分子结合,使目标分子能够发出荧光信号。
荧光标记技术非常灵敏,能够在细胞或组织的微观尺度上检测目标分子的存在和定位。
它可以通过荧光显微镜等设备观察和记录分子的空间分布、动态变化以及相互作用情况。
二、应用1. 生命科学研究分子标记技术在生命科学研究中有着广泛的应用。
例如,在细胞生物学中,科学家们可以用分子标记技术追踪细胞内的特定蛋白质、核酸或化学分子。
通过观察它们的分布和相互关系,可以揭示细胞内部分子的信号传递、运输和相互作用机制,进而更好地理解生命的基本过程。
2. 疾病诊断和治疗分子标记技术也在临床医学中被广泛应用。
例如,利用荧光标记技术,可以精确地检测和定位肿瘤细胞、病毒、细菌等疾病相关的分子标记物。
这些标记物的出现可以帮助医生们早期发现疾病,进行准确的诊断,并且在治疗中提供指导。
同时,分子标记技术还可以用于评估药物对特定疾病标记物的影响,为精准医疗提供重要的依据。
3. 生物工程和食品安全在生物工程和食品安全领域,分子标记技术也发挥着重要作用。
例如,利用PCR技术与荧光标记相结合,可以进行基因突变、检测和定量分析。
这不仅可以应用于基因工程的研究和应用,还可以在食品安全中检测和鉴定转基因成分,确保食品的质量和安全性。
4. 化学和材料科学分子标记技术在化学和材料科学领域也有着广泛的应用。
例如,在材料表面修饰方面,科学家们可以利用分子标记技术实现在金属或化合物表面附加分子标记物,从而改变其表面性质和功能。
分子标记的种类及其发展分子标记是指通过将特定的标记分子连接到目标分子上来实现对其进行检测和定位的技术。
随着生物学、医学和化学等领域的发展,分子标记逐渐得到了广泛应用。
目前,分子标记主要分为以下几类:荧光标记、放射性标记、酶标记和纳米颗粒标记。
以下是对每种标记的简要介绍以及其发展情况。
1.荧光标记:荧光标记是一种通过激发分子到高能态,再通过发射光子使其降至低能态的方式来实现分子标记的方法。
荧光标记的特点是对目标物质的检测灵敏、成本相对较低、操作相对简便等。
随着成像技术的发展,荧光标记已经广泛应用于细胞和分子生物学、医学影像等领域。
2.放射性标记:放射性标记是通过标记分子与放射性同位素结合来实现分子标记的方法。
放射性标记的特点是检测敏感度高、能够实现定量测量等。
然而,由于放射性同位素的辐射危害,放射性标记的应用受到了限制。
近年来,随着技术的发展,放射性标记已经逐渐向非放射性标记转变,例如利用放射性同位素替代品或荧光物质进行标记。
3.酶标记:酶标记是将酶与目标分子结合,然后利用酶的催化活性对目标分子进行检测的方法。
酶标记的特点是灵敏度高、选择性好、对目标分子的检测快速等。
常见的酶标记方法包括辣根过氧化物酶(HRP)标记、碱性磷酸酶(AP)标记等。
酶标记在生物学和生物化学研究中广泛应用,特别是在免疫学研究和生物医学检测中得到了广泛应用。
4.纳米颗粒标记:纳米颗粒标记是将纳米颗粒与目标分子结合,然后利用纳米颗粒的特殊性质对目标分子进行检测的方法。
纳米颗粒标记的特点是灵敏度高、标记稳定性好、可实现多重标记等。
常见的纳米颗粒包括金纳米颗粒、磁性纳米颗粒等。
近年来,纳米颗粒标记在生物医学检测、分子诊断等领域得到了广泛应用,并展现出了很大的潜力。
总体来说,分子标记的发展已经取得了很大的进展,不同种类的标记各具特点,适用于不同领域的研究和应用。
未来,随着技术的不断发展,分子标记将更加精准、灵敏和多样化,为科学研究、医学诊断和治疗等领域提供更多的可能。
分子标记技术简介分子标记是以个体间遗传物质内核苷酸序列变异为基础的遗传标记,是DNA水平遗传多态性的直接的反映。
与其他几种遗传标记——形态学标记、生物化学标记、细胞学标记相比,DNA分子标记具有的优越性有:大多数分子标记为共显性,对隐性的性状的选择十分便利;基因组变异极其丰富,分子标记的数量几乎是无限的;在生物发育的不同阶段,不同组织的DNA都可用于标记分析;分子标记揭示来自DNA的变异;表现为中性,不影响目标性状的表达,与不良性状无连锁;检测手段简单、迅速。
随着分子生物学技术的发展,现在DNA分子标记技术已有数十种,广泛应用于遗传育种、基因组作图、基因定位、物种亲缘关系鉴别、基因库构建、基因克隆等方面。
分子标记的概念有广义和狭义之分。
广义的分子标记是指可遗传的并可检测的DNA序列或蛋白质。
狭义分子标记是指能反映生物个体或种群间基因组中某种差异的特异性DNA片段。
理想的分子标记必须达以下几个要求:(1) 具有高的多态性;(2) 共显性遗传,即利用分子标记可鉴别二倍体中杂合和纯合基因型;(3) 能明确辨别等位基因;(4) 遍布整个基因组;(5) 除特殊位点的标记外,要求分子标记均匀分布于整个基因组;(6) 选择中性(即无基因多效性);(7) 检测手段简单、快速(如实验程序易自动化);(8) 开发成本和使用成本尽量低廉;(9) 在实验室内和实验室间重复性好(便于数据交换)。
但是,目前发现的任何一种分子标记均不能满足以所有要求。
【分子标记的种类】一、基于分子杂交技术的分子标记技术此类标记技术是利用限制性内切酶解及凝胶电泳分离不同的生物DNA 分子,然后用经标记的特异 DNA 探针与之进行杂交,通过放射自显影或非同位素显色技术来揭示 DNA 的多态性。
①限制性片段长度多态性(Restriction Fragment Length Polymorphism,RFLP)1974年Grodzicker等创立了限制性片段长度多态性(RFLP)技术,它是一种以DNA—DNA杂交为基础的第一代遗传标记。
分子标记的发展及分子标记辅助育种分子标记是一种分子生物学技术,利用分子标记可以对生物体进行精确的鉴定和分类,从而为种质资源的收集、保存和利用提供了科学依据,也为育种研究提供了有力的工具。
在过去的几十年里,分子标记在植物和动物育种中的应用得到了快速的发展,并取得了显著的成果。
分子标记的发展始于20世纪80年代初,当时人们发现了一种短序列的DNA片段可以在不同个体之间显示出遗传多样性,这是由于这些DNA片段的序列差异引起的。
这些DNA片段被称为分子标记,通过对它们进行分析可以对个体之间的遗传关系和遗传多样性进行研究。
最早被应用的分子标记技术是限制性片段长度多态性(RFLP),它通过酶切基因组DNA并利用凝胶电泳分析鉴定目标DNA片段。
随着技术的不断进步,研究者们开发了更多的分子标记技术,如随机扩增多态性DNA(RAPD)、简单重复序列(SSR)、单核苷酸多态性(SNP)等。
这些技术的应用使得分子标记研究更加快速、精确和可行,并且具有较高的标记密度和遗传显著性。
分子标记辅助育种是一种利用分子标记技术辅助繁殖和选育目标生物种的育种方法。
通过对目标性状的分子标记进行检测和分析,可以提高育种效率和精确性。
分子标记可以用来鉴定和筛选出具有良好性状的亲本,进行遗传多样性分析,生成遗传地图,以及进行分子辅助选择等。
分子标记辅助育种可以节省时间和人力,并且提高了育种的预测能力和成功率。
在植物育种中,分子标记辅助育种已经取得了显著成果。
例如,通过利用分子标记鉴定具有抗病性的基因或性状,育种者可以选择更适应特定环境或具有更好品质的材料,从而加速育种进程。
此外,分子标记辅助选育还可以用于配制亲本材料,避免不受欢迎的亲缘关系交配,从而提高杂交育种的成功率。
在动物育种中,分子标记辅助育种也得到了广泛应用。
例如,通过对动物基因组进行分子标记分析,可以提高畜禽在繁殖、营养和抗病等方面的性能。
另外,分子标记辅助选择还可以用于肉用动物的品质评估和选育,对于提高畜禽产品的品质和市场竞争力具有重要意义。
分子标记遗传标记作为识别基因型的表现形式,在生物基因研究方面起到了重要作用,目前通过遗传标记的方法定位基因位置已成为基因定位的常用方法。
遗传标记主要有形态标记(morphological marker)、细胞标记(cytological markers)、生化标记(Biochemical marker)和分子标记(molecular marker)四种类型。
形态标记、细胞标记因其自身局限性的原因,目前鲜有使用。
虽然以同工酶标记为代表的生化标记得到了广泛的发展,但由于其检测的范围狭窄、统计难度大等缺陷,目前仅在少数方面有所应用。
从20世纪70年代分子标记出现至今的40年,分子标记因其无比的优越性,使得其成为目前应用最广泛的遗传标记方法。
一、分子标记的概念分子标记是指以生物大分子的多态性为基础的一种遗传标记。
广义的分子标记是指可遗传并能检测的蛋白质或DNA序列。
而狭义的分子标记仅仅是指基于DNA分子多态性构建的标记方法。
二、分子标记的特点理想的分子标记一定要达到以下标准:1、具有高的多态性;2、共显性遗传即利用分子标记可鉴别二倍体中杂合和纯合基因型;3、能明确辨别等位基因;4、遍布整个基因组;5、除特殊位点的标记外要求分子标记均匀分布于整个基因组;6、选择中性即无基因多效性;7、检测手段简单、快速如实验程序易自动化;8、开发成本和使用成本尽量低廉;9、在实验室内和实验空间重复性好便于数据交换。
目前,在现实条件下并没有这种绝对理想的分子标记,但相比形态标记、细胞标记、生化标记,分子标记依旧有着明显的优越性:1、直接以DNA形式表现,在生物体各组织、各时期均可检测,不受环境限制;2、数量多,遍布全基因组,有近乎无限的检测座位;3、多态性高;4、表现为中性,不影响目标性状的表达;5、许多标记为共显性,能区别纯合体与杂合体。
三、分子标记的分类分子标记技术通常被分为基于分子杂交的分子标记技术(RFLP)(或叫做非PCR基础上的分子标记技术)、基于PCR技术的分子标记技术和同时基于分子杂交和PCR两种技术的分子标记技术三大类型。
基于PCR技术的分子标记技术又可分为基于随机引物的PCR分子标记技术(或叫非特异PCR分子标记技术)和基于特异引物的PCR分子标记技术(或叫特异PCR分子标记技术)。
随着分子标记技术的不断发展,许多新兴分子标记技术的出现,人们又根据分子标记的基因组来源将分子标记技术分为随机DNA分子标记(Random DNA Markers,RDM)、目的基因分子标记(Gene Targeted Markers,GTM)和功能性分子标记(Functional Markers,FM)。
1、限制性片段长度多态性标记限制性片段长度多态性(restriction fragment length polymorphism,RFLP)由Grodzicker等人于1974年基于DNA被限制性内切酶酶切后形成特定大小的片段。
其优点在于:1、广泛存在;2、共显性,可区分纯合与杂合;3、结果稳定可靠,重复性好。
正是有了这些优点,RFLP作为最早出现的分子标记方式,曾被广泛应用。
但由于其在使用时需要用放射性同位素标记、酶切时对DNA质量要求高、标记的多态性变异程度偏低等原因,使得RFLP很快就被新的分子标记所替代。
2、随机扩增多态性DNA标记随机扩增多态性DNA标记(random amplified polymorphic DNA,RAPD)是以基因组DNA 为模板,以人工合成的随机引物,通过PCR 扩增反映扩增片段的DNA片段导入、缺失以及引物结合位点上的碱基突变。
RAPD只需合成一套引物,就可可用于不同生物基因组的分析;RAPD技术简便易行,省力省时,并且检测灵敏方便;RAPD分析所需样品DNA量极少;RAPD标记可以对那些RFLP难以区分的基因组区域作出遗传连锁图。
正是有了以上优点,使得RAPD在可靠性比其他主要分子标记差的同时依旧被广泛使用。
3、任意引物PCR标记任意引物PCR标记(arbitary primer PCR,AP-PCR)是利用PCR扩增原理,用一个随机核苷酸序列的寡核苷酸引物指导PCR扩增,对PCR产物做电泳分析获得DNA指纹图谱,从而提供DNA多态性信息的标记方法。
4、简单序列重复标记简单序列重复标记(simple sequence repeat,SSR)是一类由几个(多为1~6个)碱基组成的基序串联重复而成的DNA序列,广泛分布于基因组的不同位置,长度一般在200 bp以下。
研究表明,微卫星在真核生物的基因组中的含量非常丰富,而且常常是随机分布于核DNA中。
通过对拟南芥、玉米、水稻、小麦等的研究表明微卫星在植物中也很丰富,均匀分布于整个植物基因组中,但不同植物中微卫星出现的频率变化是非常大的。
SSR标记的特点为:1、SSR标记技术一般检测到的是一个单一的多等位基因位点;2、微卫星呈共显性遗传,可鉴别杂合子和纯合子;3、SSR标记技术仅需微量DNA,即便DNA降解,其亦能有效地分析鉴定;4、SSR标记位点专化性;5、SSR标记数量丰富,标记覆盖整个基因组,而且分布均匀;6、实验重复性好,结果可靠性高;7、SSR序列两侧顺序长较保守,在同种而不同遗传型间多相同;8、多数SSR无功能作用,增减重复序列的频率高,因而在品种间具广泛的位点变异,比RFLP及RAPD分子标记具多态性;9、实验成本中等且技术难度低。
正是因为以上众多优点,使得SSR成为目前使用相对广泛的一种分子标记方法。
5、简单序列重复间区标记简单序列重复间区标记(inter-simple sequence repeat,ISSR)也称作锚定简单序列重复(anchored simple sequence repeat,ASSR)或微卫星引物PCR(microsatellite-primed PCR,MP-PCR)。
该技术是在SSR技术上改进而来的,通过在SSR标记的引物3’端或5’端加上2~4个随机核苷酸,使得引物可以锚定在目标DNA片段上。
ISSR的特点为:快速、高效不需构建基因组文库;扩增基因组DNA适用于任何富含SSR重复单元和SSR广泛分布的物种,可同时提供多位点信息和提示不同卫星座位个体间变异的信息;遗传多态性高,重复性好;标记为显性标记;无需知道任何靶序列的SSR背景信息;耗资少,模板DNA用量少。
尽管ISSR的引物相比SSR的引物更具有通用性,但由于其标记为显性标记,因此在育种方面没有SSR使用的广泛。
6、扩增片段长度多态性标记扩增片段长度多态性标记(amplified fragment length polymorphism,AFLP)技术是基于PCR 反应的一种选择性扩增限制性片段的方法。
由于不同物种的基因组DNA大小不同,基因组DNA经限制性内切酶酶切后,产生分子量大小不同的限制性片段。
使用特定的双链接头与酶切DNA片段连接作为扩增反应的模板,用含有选择性碱基的引物对模板DNA进行扩增,选择性碱基的种类、数目和顺序决定了扩增片段的特殊性,只有那些限制性位点侧翼的核苷酸与引物的选择性碱基相匹配的限制性片段才可被扩增。
扩增产物经放射性同位素标记、聚丙烯酰胺凝胶电泳分离,然后根据凝胶上DNA指纹的有无来检验多态性。
进行AFLP分析时,双酶切产生的DNA片段在AFLP反应中可被优先扩增,扩增产物可被很好地分离,因此一般多采用稀有切点限制性内切酶与多切点限制性内切酶相搭配使用的双酶切。
该标记的特点是:1、分析所需DNA 量少;2、可重复性好;3、多态性强;4、分辨率高;5、不需要Southern杂交,且不需要预先知道被分析基因组DNA的序列信息,是一种半随机的PCR;6、样品适用性广;7、标记在后代中的遗传和分离中符合孟德尔遗传规律,种群中标记位点遵循Hardy-Weinberg 平衡。
目前AFLP标记技术常被用在高密度基因图谱构建或对某个基因所在区域精细作图。
7、表达序列标签标记技术表达序列标签(Expressed Sequence Tag,EST)标记技术是通过从cDNA 文库中随机挑选的克隆进行5’端和3’端单一次测序获得的短的cDNA 部分序列,一般长度为300~500bp左右,平均长度360±120bp。
EST 来源于一定环境下一个组织总mRNA 所构建的cDNA 文库,每一个EST代表一个表达基因的部分转录片段。
EST标记技术有以下特点:1、EST标记可以直接和一个表达基因相关;2、大量EST标记累积起来可以建立一个新的数据库,为表达基因的鉴别提供大量信息;3、EST标签在GenBank和蛋白质信息资源库等数据库中能进行比较,进而获得其可能的功能和表达模式等信息;4、序列保守性强;5、与组织差异显示相关的EST或者与某些候选数据基因具有同源性的EST能成为遗传连锁作图的特定目标。
但由于EST技术费用高、基因组信息不全等缺陷,目前使用并不广泛。
8、单核苷酸多态性标记技术单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)标记技术指利用DNA序列中单个核苷酸的差别。
SNP所表现的多态性只涉及到单个碱基的变异,这种变异可由单个碱基的转换(transition)或颠换(transversion)所引起,也可由碱基的插入或缺失所致。
但通常所说的SNP并不包括后两种情况。
SNP标记技术有以下特点:1、SNP等位基因频率容易估计;2、数量多,分布广;3、高度稳定;4、因部分SNP可能直接影响产物蛋白质结构或基因表达水平,故其本身可能就是疾病遗传机制的候选改变位点;5、筛查快;6、因其二态性易于分型。
目前SNP标记技术已成为基因组图谱构建、基因精细定位常用标记技术。
四、分子标记在分子辅助育种中应用目前,分子标记主要在QTL、基因定位方面有大量应用。
目前的定位步骤主要是:首先构建定位的材料,主要有近等基因系(NIL)、自交系(RIL)、杂合分离群体(F2),自20世纪末Zamir[1]首次构建了野生番茄渗入系并利用此群体预测定位了众多QTL,导入系(IL)成为热门材料。
郝伟等[2]以野生稻为供体亲本,构建覆盖绝大部分野生稻基因组的替换系,初步定位了控制稻米外观和理化品质性状的15个QTL;董华林[3]利用野生稻高代回交群体分析水稻农艺性状QTL;孔会利[4]等精细定位了水稻株高主效QTL;周勇[5]等精细定位了水稻抽穗期主效QTL;聂元元[6]等精细定位了水稻抗旱相关性状QTL。
其次对材料进行基因型分析,因分子标记的不同特点,常在QTL初步定为时利用SSR标记进行分析。
Feng Tian 等人初步定位于水稻产量相关性状的QTL[7]。
在精细定位时,往往因材料、分子标记的特点而采用多种分子标记共同定位。