蔗糖梯度密度离心
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蔗糖密度梯度离心是一种分离和纯化生物分子(如蛋白质、核酸等)的常用方法。
密度梯度离心利用溶液中不同密度的层级来实现分离,蔗糖是常用的密度梯度介质之一。
下面是蔗糖密度梯度离心的一般步骤:
1. 准备样品:将待分离的混合物样品准备好,通常是细胞裂解液、细胞上清液、蛋白质提取物等。
2. 制备蔗糖梯度:按照需要离心的生物分子的密度范围,选择适当的蔗糖浓度。
通常是在离心管中按体积比例混合蔗糖和缓冲液,制备成密度梯度。
3. 加样:将待分离的样品轻缓地加到蔗糖梯度上,以防混合。
4. 离心:将装有样品和蔗糖梯度的离心管放入离心机中,进行高速离心。
离心过程会使样品中的生物分子沉降到与其密度相匹配的蔗糖层级中。
5. 收集分离物:离心后,观察离心管中形成的密度梯度。
在离心管中,生物分子会沉降到不同的密度层级,形成分离的带状区域。
用适当的技术,如针管、泵或滴管,从密度梯度中收集分离的生物分子。
密度梯度离心是一种常用的生物分离技术,特别适用于分离不同密度的生物分子或细胞亚群。
在生物学、生物化学、免疫学等领域中
广泛应用,用于纯化和分析复杂的混合物。
总结蔗糖溶液梯度的配置方法,注意事项
一、配置方法
1、首先配置好不同百分比的蔗糖溶液。
2、然后在与离心转头相匹配的离心管中先加入浓度最小(10%)的溶液。
3、然后用吸管加入浓度稍大的溶液,加时吸管要插入离心管的底部,缓慢加入,务求界面分明。
4、然后按上法依次分层加入其余各浓度的蔗糖溶液,即可配成蔗糖梯度液。
5、将事先用更低密度蔗糖溶液(小于10%)悬浮的样品轻轻加入10%蔗糖溶液的表面,进行密度梯度离心即可。
二、注意事项
1、梯度混合器有两个室,储存室和混合室,并用一个不互联的膜隔开。
用另一个膜来调控从混合器中流出。
2、在混合室中的磁力搅拌器可以帮助保持一个不变的梯度所有的混合器都有一个平面用于放在磁力搅拌器上。
蔗糖密度梯度离心原理蔗糖密度梯度离心是一种常用的生物化学分离技术,通过蔗糖溶液中浓度梯度的建立,利用生物分子在不同密度梯度中的沉降系数差异,实现生物分子的分离和纯化。
本文将介绍蔗糖密度梯度离心的原理及其在生物化学实验中的应用。
蔗糖密度梯度离心的原理主要是利用蔗糖在水溶液中的密度梯度,使生物分子在不同密度梯度中有不同的沉降速度。
一般来说,蔗糖密度梯度离心需要使用离心管或离心管盒,首先在离心管中依次加入不同浓度的蔗糖溶液,然后将待分离的生物样品加入到蔗糖密度梯度上层,最后进行高速离心。
在高速离心过程中,生物分子会根据其密度在蔗糖密度梯度中沉降到相应位置,从而实现不同生物分子的分离和纯化。
蔗糖密度梯度离心在生物化学实验中有着广泛的应用。
首先,它可以用于分离和纯化细胞器。
由于细胞器具有不同的密度,因此可以利用蔗糖密度梯度离心将不同细胞器分离开来,从而得到纯净的细胞器样品。
其次,蔗糖密度梯度离心还可以用于分离和纯化蛋白质。
许多蛋白质具有不同的密度,因此可以利用蔗糖密度梯度离心将不同蛋白质分离开来,得到纯净的蛋白质样品。
此外,蔗糖密度梯度离心还可以用于分离和纯化病毒、DNA、RNA等生物分子。
总之,蔗糖密度梯度离心是一种重要的生物化学分离技术,它通过建立蔗糖溶液中的密度梯度,利用生物分子在不同密度梯度中的沉降速度差异,实现生物分子的分离和纯化。
在生物化学实验中,蔗糖密度梯度离心有着广泛的应用,可以用于分离和纯化细胞器、蛋白质、病毒、DNA、RNA等生物分子。
通过合理的实验设计和操作,蔗糖密度梯度离心可以为生物化学研究提供重要的技术支持,为科研工作者提供纯净的生物样品,促进生物化学领域的发展和进步。
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实验1 蔗糖密度梯度离心法提取叶绿体实验原理2、1 概述密度梯度区带离心法(简称区带离心法):是将样品加在惰性梯度介质中进行离心沉降或沉降平衡,在一定的离心力下把颗粒分配到梯度中某些特定位置上,形成不同区带的分离方法。
此法的优点是:①分离效果好,可一次获得较纯颗粒;②适应范围广,能像差速离心法一样分离具有沉降系数差的颗粒,又能分离有一定浮力密度差的颗粒;③颗粒不会挤压变形,能保持颗粒活性,并防止已形成的区带由于对流而引起混合。
此法的缺点是:①离心时间较长;②需要制备惰性梯度介质溶液;③操作严格,不易掌握。
密度梯度区带离心法又可分为两种:(1)差速区带离心法:当不同的颗粒间存在沉降速度差时(不需要像差速沉降离心法所要求的那样大的沉降系数差)。
在一定的离心力作用下,颗粒各自以一定的速度沉降,在密度梯度介质的不同区域上形成区带的方法称为差速区带离心法。
此法仅用于分离有一定沉降系数差的颗粒(20% 的沉降系数差或更少)或分子量相差3倍的蛋白质,与颗粒的密度无关,大小相同,密度不同的颗粒(如线粒体,溶酶体等)不能用此法分离。
离心管先装好密度梯度介质溶液,样品液加在梯度介质的液面上,离心时,由于离心力的作用,颗粒离开原样品层,按不同沉降速度向管底沉降,离心一定时间后,沉降的颗粒逐渐分开,最后形成一系列界面清楚的不连续区带,沉降系数越大,往下沉降越快,所呈现的区带也越低,离心必须在沉降最快的大颗粒到达管底前结束,样品颗粒的密度要大于梯度介质的密度。
梯度介质通常用蔗糖溶液,其最大密度和浓度可达1、28 kg/cm3和60%。
此离心法的关键是选择合适的离心转速和时间(2)等密度区带离心法:离心管中预先放置好梯度介质,样品加在梯度液面上,或样品预先与梯度介质溶液混合后装入离心管,通过离心从而形成梯度,这就是预形成梯度和离心形成梯度的等密度区带离心产生梯度的二种方式。
离心时,样品的不同颗粒向上浮起,一直移动到与它们的密度相等的等密度点的特定梯度位置上,形成几条不同的区带,这就是等密度离心法。
标准操作规程(SOP)——一、目的流感病毒的浓缩和纯化方式可以分为物理和化学的方法。
如:超速离心法,酸沉淀法,红细胞吸附-释放法,蒸馏水透析法及聚乙二醇浓缩法等。
其中超速离心法最为常用并且纯度较高。
本SOP明确流感病毒蔗糖密度梯度离心纯化的标准操作方法,保证了实验结果的职能却可靠。
二、范围适用于中国国家流感中心的所有技术人员进行蔗糖密度梯度离心纯化流感病毒。
三、程序(一)生物安全要求H5、H7亚型高致病性禽流感病毒及H2N2亚型流感病毒的操作需要在BSL-3级实验室中进行。
其余流感病毒的操作需要在BSL-2级实验室中进行。
操作人员的生物安全防护要求详见流感中心“生物安全个人防护SOP”(二)材料1.病毒液2.PBS(100mmol/L pH7.2)液3.30%和60%蔗糖溶液4.耗材(注射器,离心管,吸管,实验滤纸)(三)实验步骤1.将待纯化的流感病毒种子株接种鸡胚或者MDCK细胞,收获病毒尿囊液。
具体接种方法参见“流感病毒的鸡胚分离方法SOP”和“MDCK细胞分离流感病毒SOP”。
2.将流感病毒收获的鸡胚尿囊液使用实验滤纸粗滤,以去除蛋壳或者其它沉淀物。
MDCK细胞培养的病毒收获液可以省略此步骤。
3.收集过滤液,使用SIGMA3K18 高速离心及2000rpm离心20min,去沉渣。
4.将上清使用OptimaTM L-80XP 超速离心机30000rpm的转速离心1h,去上清。
加入100mmol/L pH7.2的PBS液数滴浸泡沉淀,置4℃冰箱过夜。
5.制备蔗糖梯度管,用10mL吸管加5mL的60%的蔗糖溶液于管底,在其上小心加入10mL的30%的蔗糖溶液。
在其上缓慢加入20mL病毒悬液。
6.使用OptimaTM L-80XP 超速离心机20000rpm的转速离心1.5h,取出离心管。
使用注射器小心吸取位于30%和60%之间的靠近管底的病毒条带。
7.于所收获的液体加入5倍体积的PBS液,混匀后30000rpm的转速离心1h,去上清。
蔗糖密度梯度离心原理
蔗糖密度梯度离心原理是一种常用的离心分离方法。
它基于不同物质在离心离心过程中所受的离心力不同,利用离心离心力将混合物中的物质分离出来。
在蔗糖密度梯度离心中,通常将一定浓度的蔗糖溶液制备成密度梯度。
制备密度梯度的方法可以通过加入不同浓度的蔗糖溶液层层加入,形成从低密度到高密度逐渐增大的梯度。
将待分离的混合物滴加到密度梯度上方,然后进行离心。
在离心过程中,不同密度的物质根据它们在蔗糖梯度中的浮力和离心力的平衡关系在梯度中形成不同高度的分离层。
离心时间越长,分离越明显。
离心结束后,可以通过分层梯度冷冻切片或者以分离层的方式收集不同密度的物质。
这种方法可以用于分离和纯化蛋白质、细胞器、病毒、DNA、RNA等多种生物样品。
蔗糖密度梯度离心原理的优势在于分离效果好,分离度高,可以分离密度相近的物质。
且操作简单,适用于多种生物样品的分离。
而且,蔗糖溶液对生物大分子具有较好的保护作用,不易对生物样品产生影响。
需要注意的是,在蔗糖密度梯度离心过程中,离心速度和时间的选择需要根据具体的实验条件和分离样品的特性来确定。
同时,在进行离心前需要将样品均质悬浮并避免气泡的产生,以保证分离效果的准确性。
纯化病毒常用的方法是蔗糖密度梯度离心法,能得到比较纯的病毒。
其过程如下:1、将收集的组织或脏器或其他,用玻璃匀浆器充分研磨后制成悬液,经反复冻融3 次后,置- 20 ℃冰箱中,备用。
2、先以5000g离心15分钟后,获取上清夜,然后再20000g高速离心30分钟后取上清夜。
3、接着10万g超速离心2h,将沉淀用少量STE溶解。
4、先在超速离心管中加入5-8mL的第3步所获取的含病毒样品的溶解液,然后在离心管中依次加入30 % , 45 % , 60 %的蔗糖,加的时候是用长针头从底部往上加的。
11万g离心2.5h,发现在30 %与45 % 以及45 % 与60 %之间都有一条明亮的带,用长针头将两条不同部位的带都吸取出来,分别收集到不同的瓶内。
5、去蔗糖;用STE缓冲液适量稀释纯化的病毒,然后11万g离心3h,用少量STE (根据沉淀的量决定加入多少)缓冲液把沉淀悬起,即最后获得了纯化的病毒。
-20度冻纯备用,用时可用分光光度计测定其病毒含量。
问:我在做病毒纯化时,需先用超速离心,再用蔗糖密度梯度离心,求助高手用蔗糖密度梯度离心时的转速与超速离心时的转速有联系吗,是相等还是蔗糖密度梯度离心的转速要比超速离心的速度高?若为后者,那又若何决定蔗糖密度梯度离心时的转速?谢谢!答:1、病毒的纯化时,先用超速离心,你应该查一下资料,看在多大的转速时能够把病毒离心下来.那么你的这一步的转速应该至少不小于该转速,你这一步离心下来的沉淀中含有病毒和蛋白成分。
2、因此你的第二步工作就是要将病毒与其他的蛋白以及杂质分离开,密度梯度离心就可以达到该目的。
这时你的离心速度要考虑病毒的大小和蔗糖的密度,使得病毒不能沉淀道管底又可与蛋白层分开。
这也可能要具体问题具体分析。
问:谢谢主任的指点,我的病毒直径为100nm。
查阅了有观资料,超速离心为21000rpm,45min,我用24000rpm2hr,我用20%-60%连续蔗糖密度梯度离心,该病毒在蔗糖中的浮密度为1.18mg/ml,请问我的糖密度梯度离心速度大概是多少?谢谢!答:我们实验室IBV (80-100nm)的纯化是:l 病毒纯化浓缩(方法一)1、冷冻之尿囊液解冻后,4℃,11000rpm离心20min。
不连续蔗糖密度梯度离心法嘿,今天咱们聊聊一个有趣的实验方法,叫做不连续蔗糖密度梯度离心法。
听起来是不是有点拗口?别担心,这可不是在教你什么高深的科学理论,而是个好玩又实用的东西,像是一道魔术,让你在实验室里“施展法术”。
想象一下,你有一堆细胞,要把它们分开。
就像在一场派对上,你得把舞池里的舞者和坐在角落里喝果汁的小伙伴分开。
咋办呢?这时候不连续蔗糖密度梯度离心法就派上用场了。
你先准备一些不同浓度的蔗糖溶液,嘿,这可不是拿来做甜点的,而是要把它们分层。
就像你喝的那种分层饮料,底下是浓稠的果汁,上面漂浮着清爽的气泡水。
然后,咱们把细胞样本放进去,转起来,呼啦啦,转速越来越快。
细胞就像在跳舞,重的细胞会往下沉,而轻的则慢慢漂到上面。
就这样,浓度高的蔗糖溶液在底部,浓度低的在顶部,形成了一个美丽的梯度。
这时候,就像一场精心策划的比赛,细胞们按照密度一层层地分开。
可别小看这层次分明的效果,简直能让你眼前一亮。
有趣的是,这个过程不仅仅是个玩笑,实际上它能帮助科学家们研究细胞的特性。
比如,某些细胞的内含物质,像是蛋白质、核酸,统统能在这个梯度里找到自己合适的位置。
就像每个人在聚会上找到自己最舒服的地方,有些人喜欢热闹,有些人更享受安静的角落。
通过这种方法,科学家们能够分离和纯化目标细胞,进而进行后续的实验。
说到这里,大家可能会想,离心机是不是个高大上的东西?它就像厨房里的搅拌机,只不过它把东西转得飞快,利用离心力把细胞和其他成分分开。
很多人一听“离心”,就觉得特别复杂,实则不然,只要你把样品放好,转起来,就能看见分层的奇观。
在实验室里,大家常常会调侃说,这简直是“看谁更沉”的游戏。
离心法的原理也很简单,重的下沉,轻的浮起。
这就好比吃火锅,底下的肉和菜煮得熟透了,浮上来的豆腐可能还在慢慢热。
科学家们就是借着这个道理,让细胞在密度的海洋中漂流,找到自己的位置。
最妙的是,这个方法还可以用来分离病毒和细胞器,真是多才多艺。
实验一密度梯度离心法提取叶绿体[实验项目]密度梯度离心法提取叶绿体[实验目的]掌握手工制作密度梯度技术,了解蔗糖密度梯度离心的原理及优缺点。
[实验原理]不同颗粒之间存在沉降系数差时,在一定离心力作用下,颗粒各自以一定速度沉降,在密度梯度不同区域上形成区带。
用不同浓度的蔗糖制成浓度梯度,在离心条件下,叶绿体和比他沉降系数小的细胞组分会聚集中到梯度交界处,而沉降系数较大的细胞组分则沉淀到离心管底部,这样可粗略的分离叶绿体。
[实验仪器设备]超速冷冻离心机(BECKMAN L8-60MR)一台荧光显微镜((Olympus,FX-35WA,Japan))一台组织捣碎机一台[实验材料]新鲜菠菜叶片[实验药品]匀浆介质(0.25mol/L蔗糖,0.05mol/L Tris-HCl缓冲液 pH 7.4);称取88.55g 蔗糖,6.05g Tris,溶解在近800ml蒸馏水中,加入约4.25ml 0.1mol/L HCl,最后定容至1000ml。
60%蔗糖溶液,50%蔗糖溶液,40%蔗糖溶液,20%蔗糖溶液,15%蔗糖溶液。
[实验内容]1、洗净菠菜叶片,沥干水分,去除叶柄、主脉,称取50g,剪碎。
2、加入预冷到0℃的匀浆介质200ml,用组织捣碎机高档捣碎2min。
3、捣碎液双层纱布过滤到烧杯中。
4、滤液500r/min离心5min,轻取上清液。
5、在Polyallomer离心管内一次加入50%和15%蔗糖溶液(或依次加入60%,40%,20%,15%蔗糖溶液),注意要用滴管吸取15%蔗糖液沿离心管壁缓缓注入,不能搅动50%蔗糖液面,一般两种溶液各加12ml(四个梯度各加6ml),加液完成后,可见两种溶液接口处折光稍有不同,这样密度梯度便制好了。
6、在制好的密度梯度上小心的沿着管壁加入3ml粗离心过的上清液。
7、严格平衡离心管,分量不足加入少许上清液。
8、用甩平转头离心(18000r/min)90min。
9、取出离心管,可见叶绿体在密度梯度液中间形成带,用滴管轻轻吸出滴于载玻片,盖上盖玻片,荧光显微镜下观察。
纯化病毒常用的方法是蔗糖密度梯度离心法,能得到比较纯的病毒。
其过程如下:1、将收集的组织或脏器或其他,用玻璃匀浆器充分研磨后制成悬液,经反复冻融3 次后,置- 20 ℃冰箱中,备用。
2、先以5000g离心15分钟后,获取上清夜,然后再20000g高速离心30分钟后取上清夜。
3、接着10万g超速离心2h,将沉淀用少量STE溶解。
4、先在超速离心管中加入5-8mL的第3步所获取的含病毒样品的溶解液,然后在离心管中依次加入30 % , 45 % , 60 %的蔗糖,加的时候是用长针头从底部往上加的。
11万g离心2.5h,发现在30 %与45 % 以及45 % 与60 %之间都有一条明亮的带,用长针头将两条不同部位的带都吸取出来,分别收集到不同的瓶内。
5、去蔗糖;用STE缓冲液适量稀释纯化的病毒,然后11万g离心3h,用少量STE (根据沉淀的量决定加入多少)缓冲液把沉淀悬起,即最后获得了纯化的病毒。
-20度冻纯备用,用时可用分光光度计测定其病毒含量。
问:我在做病毒纯化时,需先用超速离心,再用蔗糖密度梯度离心,求助高手用蔗糖密度梯度离心时的转速与超速离心时的转速有联系吗,是相等还是蔗糖密度梯度离心的转速要比超速离心的速度高?若为后者,那又若何决定蔗糖密度梯度离心时的转速?谢谢!
答:1、病毒的纯化时,先用超速离心,你应该查一下资料,看在多大的转速时能够把病毒离心下来.那么你的这一步的转速应该至少不小于该转速,你这一步离心下来的沉淀中含有病毒和蛋白成分。
2、因此你的第二步工作就是要将病毒与其他的蛋白以及杂质分离开,密度梯度离心就可以达到该目的。
这时你的离心速度要考虑病毒的大小和蔗糖的密度,使得病毒不能沉淀道管底又可与蛋白层分开。
这也可能要具体问题具体分析。
问:谢谢主任的指点,我的病毒直径为100nm。
查阅了有观资料,超速离心为21000rpm,45min,我用24000rpm2hr,我用20%-60%连续蔗糖密度梯度离心,该病毒在蔗糖中的浮密度为1.18mg/ml,请问我的糖密度梯度离心速度大概是多少?谢谢!
答:我们实验室IBV (80-100nm)的纯化是:l 病毒纯化浓缩(方法一)
1、冷冻之尿囊液解冻后,4℃,11000rpm离心20min。
2、取上清,加入30%PEG6000(含7.85%NaCl)至沉淀出现(终浓度约为7~8%),4℃放置(或搅拌)过夜。
3、4℃,19000rpm离心20min,弃上清,沉淀用适量TEN溶解。
4、4℃,35000rpm离心3hrs,弃上清,沉淀用适量TEN溶解。
5、4℃,33000rpm蔗糖密度梯度离心2.5hrs(蔗糖梯度:20%, 30%, 40%, 50%, 60%)。
6、抽取40%蔗糖带(含IBV病毒),-40℃保存。
你的我想也差不多吧!
答:你的病毒在蔗糖中的浮密度为1.18mg/ml,如果经过足够长的时间的离心话,那么大概就沉淀在40%-50%靠近40%的这已层中。
(40%的蔗糖25度时的浓度为1.176,50%的蔗糖25度时的浓度为1.230)现在必须知道病毒的沉降系数才能算出她你所需要的时间。
单纯回答你的离心速度时豪无意义的,必须与时间结合来说明你的离心。
一定的速度加上一定的时间才能把病毒分开。
注意事项
离心前将样品小心铺放在密度梯度溶液表面,离心形成区带。
离心后不
同大小、不同形状、有一定沉降系数差异的颗粒在密度梯度液中形成若干条
界面清楚的不连续区带。
再通过虹吸、穿刺或切割离心管的方法将不同区带
中的颗粒分开收集,得到所需的物质。
1
、梯度介质应具备足够大的溶解度,以形成所需的密度梯度范围。
2
、梯度介质不会与样品中的组分发生反应。
3
、梯度介质也不会引起样品中组分的凝集、变性或失活。
4
、若离心时间过长由于颗粒的扩散作用,会使区带越来越宽。
为此,应
适当增大离心力、缩短离心时间,可以减少由于扩散而导致的区带扩宽现象。
STE
缓冲液(
So di um-T ris-E DT A
,
STE
)
•
10 mmol/L
Tris-Cl
(pH 8.0)
•
0.1 mol/L
NaCl
•
1 mmol/L
E D T A
(pH 8.0)
在
15 psi (1.05 kg/cm 2
)
高压下蒸汽灭菌
15 min。
将灭菌溶液与
4
°
C
保存。