基于nrDNAITS序列的枣属植物亲缘关系分析

，
从 ＮＣ Ｂ Ｉ 网站上 获 取 截 至 目前 为 止 所 有 枣 属 （ ３ １
个种） 以及枳棋的 Ｉ Ｔ Ｓ序列 ， 分别 以 Ｆ ａ ｓ ｔ ａ 格式保存 ， 并通过 Ｄ Ｏ Ｓ下 Ｃ ｏ ｐ ｙ 命 令将 所有文件保存在一个文 件中， Ｉ Ｔ Ｓ 序列 的登录号、 长度等信息见表 １ 。
Ｄ ＯＩ ： １ ０ ． １ ３ ４ ５ ６ ￣． ｃ ｎ ｋ ｉ ． １ ｙ ｋ ｔ ． ２ ０ １ ５ ． ０ ８ ． ０ ０ ４
枣属 （ Ｚ ｉ ｚ ｉ ｐ ｈ ｕ ｓ Ｍｉ ｌ １ ． ） 为 鼠李 科 （ Ｒｈ ａ ｍｎ ａ ｃ ｅ ａ ｅ ） 灌
木或乔木 ， 具有 良好地经 济、 生态 和药用价 值。枣 果 可 食用 、 药用 ； 枣蜜 质 优 ； 枣木木质坚硬 ， 纹 理 细密 ， 是 雕 刻 和 制 作 家 具 的 优 良木 材［ １ ］ 。此外 ， 枣 的适 应 性
学术 园地
Ａ ｃ ａ ｄ ｅ ｍｉ ｃ Ｆ ｉ ｅ ｌ ｄ
二
ｏ
＿ Ｉ Ｊ 的枣 属 植 物 亲 缘 关 系分 析
王 小 国
学院 ， 河南 三 门峡 ４ ７ ２ ０ ０ ０ ）
五 年 — —
第
期 八
林
关系， 以近缘属枳楔 为外类群 ， 用Ｃ ｌ ｕ ｓ ｔ ａ ｌ Ｘ ２ ． １对枣属 下 ３ １ 个 种和 １ 软 件 中 Ｋｉ ｍｕ ｒ ａ双 参 数模 型计 算 种 间遗传 距 离 ， 并运用 Ｐ ＡＵＰ和 山枣 和大果枣 间、 枣 和酸枣 间、 毛脉 枣、 无瓣 枣和褐果 枣 间的遗传 距 芋列相似 性为 ８ ３ ． ４ ％， 核苷酸 中平 均 Ｇ＋Ｃ含量为 ６ ３ ． ７ ％； 系统发育
强， 耐瘠 薄 ， 防风 固沙 ， 是 优 良的水 土 保 持 树 种 。据统 计， 全世 界 枣属 约 有 １ ７ ０种 （ Ｉ ｓ ｌ ａ ｍ，Ｍ．Ｂ ． ， ２ ０ ０ ６ ） ， 其 中， 枣（ Ｚ ．ｊ ｕ ｊ ｕ ｂ ａ ） 和滇刺 枣 （ Ｚ ．ｍ ａ ｕ Ｈｔ ｉ ａ ｎ ａ ） 是 ２种 广 泛栽 培 的经 济植 物 ， 但 一 直 以来 在 枣属 属 下 分类 和 系 统地 位 问题 上 比较混 乱 。 核 核糖 体 ＤＮＡ（ Ｎｕ ｃ ｌ ｅ ａ ｒ ｒ ｉ ｂ ｏ ｓ ｏ ｍｅ ， ｎ ｒ Ｄ ＮＡ） 是核
多种 植 物 的种 间系 统 发 育 研 究 中得 到 了应 用 ， 如桃 、 李、 梅、 杏 等核果类［ 、 忍 冬 属 引、 苹 果 。 和 Ｍｉ ｓ ｃ ａ ｎ ｔ — ｈ ｕ ｓ ｓ ｉ ｎ ｅ ｎ ｓ ｉ ｓ ［ ］ 等 。本 文 根 据 ＮＣ Ｂ Ｉ 网站上 获 取 的 Ｉ ＴＳ 序列（ 包 括 部分 １ ８ Ｓ核 糖体 Ｒ ＮＡ 基 因 、 Ｉ ＴＳ １ 、 ５ ． ８ Ｓ全 序列和部 分 Ｉ ＴＳ ２ ） ， 以近 缘 属 枳 棋 （ Ｈｏ ｖ ｅ ｎ ｉ ａ ａ ｃ ｅ ｒ ｂ ａ Ｌ ． ） 为外 类 群 ， 对 枣属 属 下 ３ １个 种 （ 因序 列 提 交 者 不 同， 部分 种有 重 复 ） 进 行 了序 列 比对 和 系统 发 育 树 构 建， 以探 讨 枣 属 各 种 之 间 的亲 缘 关 系 ， 为 枣 属 的分 类 和 系统 进化研 究 提供 参考 。
，
业 科 技 通
讯
大果 枣、 山枣和 蜀枣 为 １个 进化 枝， 酸枣和 枣为 １个进 化枝 ， 毛 脉
பைடு நூலகம்磊
ｅ ／ ａ ｔ ａ为单独一个进化枝 ， ｂ ｏ ｏ ｔ ｓ ｔ ｒ ａ ｐ支持 率达 ９ ９ ～１ Ｏ ０ 。．
中图分类号 ： Ｓ ６ ６ ５ ． １ ； ￥ ７ １ ８ ． ３ 文献标识号 ： Ａ 文章编号 ： １ ６ ７ １ —４ ９ ３ ８ （ ２ Ｏ １ ５ ） Ｏ ８ 一Ｏ Ｏ １ ５ —０ ４
五
亟
第 八 期 林
业 科 技
通
讯
１ ２ ｌ ３ １ ４
１ ５
山枣 蜀枣 酸枣
酸枣
Ｚ ． ｍＤ ， 抛ｍ Ｚ ｘ ｉ ａ ｎ ｇ ｃ ｈ ｅ ｎ ｇ ｅ ｎ ｓ ｉ ｓ Ｚ ． ａ ｃ ｉ ｄ ｏ ｊ ｕ ｂ ａ ．
Ｚ ． ａ ｃ ｉ ｄ ｏ ｊ ｕ ｂ ａ
拉丁名
Ｚ． ｐ ｕ ｂ ｉ ｎ ｅ ｒ ｖ ｉ ｓ Ｚ ｍａ ｉ ｒ ｅ ｉ
孙 孔 Ｇ 站 ｂ ｅ ｎ ｅ ｂ ａ ｎ ｋ ． 登录号 ∞ 驵 序列长度／ ｐ Ｅ Ｕ０ ７ ５ ０ ９ ３ Ｅ Ｕ０ ７ ５ ０ ９ ２ ６ ０ １ ６ ０ ５
盯 作者／ 国家 Ｆ ｅ ｎ ｇ ， Ｊ ． ／ 中国 Ｐ ｅ ｎ ｇ ， ／ 中国
Ｅ Ｕ０ ７ ５ ０ ９ １ Ｅ Ｕ０ ７ ５ ０ ９ ０ Ｅ Ｕ ０ ７ ５ ０ ８ ９
Ｄ Ｑ １ ４ ６ ５ ７ ２
１ 材 料 和 方 法
１ ． １ Ｉ ＴＳ序 列 片段 的获取
基因组 中编码核糖体 Ｒ Ｎ Ａ的 Ｄ Ｎ Ａ， 高度保守的编码 区序列（ １ ８ Ｓ ａ ５ ． ８ Ｓ 、 ２ ６ Ｓ ） 适用于高分类 阶元的系统发 育研 究 ， 而 内转 录 间 隔区 （ Ｉ ｎ ｔ ｅ ｒ ｎ ａ ｌ ｔ ｒ ａ ｎ ｓ ｃ ｒ ｉ ｂ ｅ ｄ ｓ ｐ ａ ｃ ｅ ｒ ， Ｉ ＴＳ ） 由于 进化 速度 较 快 ， 可用 于较 低 分 类 阶 元 的 系统 发育和群体 遗传学研究［ 。 ］ 。近年来 ， Ｉ Ｔ Ｓ序列 已在
表１’ 枣■ ３ １个种和外类群的 Ｉ Ｔ Ｓ序 列信 息
作 者简介 王 小 固（ １ ９ ７ ７ ～） ， 硕士， 讲师， 主要 从 事植 物 遗传 育 种
研 究。
学术 园地
二
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种名
毛脉枣 大果枣
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序号
１ Ｏ １ １