转录因子研究——为论文加“分”
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大学毕业论文开题报告不通过怎么办大学毕业论文开题报告不通过怎么办开题报告就是大家要面临的第一个考验。
想想看你站在讲台上,一群专家坐在台下用X光般审视的眼神看着你,这场面也是令人未曾开口就已无语凝噎。
这时候如果开题报告写得好,你就成功了一大半。
什么是开题报告?写开题报告之前,首先要弄清楚开题报告的定义。
开题报告指开题者对科研课题的一种文字说明材料,也是毕业论文答辩委员会对学生答辩资格审查的依据材料之一。
开题者需要把自己所选的课题的概况,向有关专家、学者、科技人员进行陈述,由他们对科研课题进行评议。
很多人对于开题报告都存在着误解:1、以为开题报告只是一种可有可无的例行公;2、认为一旦更换课题,开题报告就白写了。
抱着这样的认识,许多同学对开题报告都会产生一种应付了事的心态,其实是大错特错了。
开题报告是进入科研领域的一块"敲门砖"为什么说撰写开题报告对于一个科研人是十分重要的呢?通过撰写开题报告,可以学会如何提出问题、分析问题、归纳问题,对于将来完成整个科研项目有着重要意义。
认真撰写好的开题报告将来也能派上用场,其中的部分内容可以吸纳到自己的学位论文和基金标书中,简直是一举多得啊。
开题报告的主要元素不同的高校或研究院所对开题报告的规定略有不同,但大致上都包括以下几点:研究的目的与意义,国内外研究动态(文献综述)、主要研究内容及创新点、研究方案及进度安排、拟解决的关键问题、参考文献。
接下来我们逐一来看看每个部分的写作要点。
1、研究目的与意义在这个部分中,大家需要回答两个问题。
问题一,为什么要研究这个课题?(理论意义是什么)比如你的课题是"转录因子在胚胎干细胞自我更新过程中的作用",则可以表述为:通过该转录因子进一步揭示和完善胚胎干细胞自我更新的分子调控网络。
问题二,研究这个课题有什么价值?(应用前景)比如,研究一个蛋白在肿瘤转移过程中的作用,其价值就在于:通过这个研究了解肿瘤转移的分子机制,该蛋白可以作为治疗肿瘤转移的靶蛋白。
2006年诺贝尔化学奖在开始用酵母细胞研究转录过程前,科恩伯格研究小组用了10年的时间来精心调试这个系统。
许多研究小组也许早就放弃了,因为几年的时间过去了,他们没有任何实质性的结果,也不能发表论文。
1965年,18岁的罗杰·科恩伯格与父亲阿瑟·科因伯格和保罗·伯格(Paul Berg)合写了一篇论文,这是一篇晦涩难懂的论文——《与结晶性酵母细胞色素b2相关的DNA异种性》,但这篇论文注定是一篇非凡的学术珍品,因为论文中的三位作者先后荣获诺贝尔奖:罗杰·科恩伯格(右)与父亲罗杰·科恩伯格与父亲 美国 斯坦福大学 生于1947年老科恩伯格与他人分享1959年诺贝尔生理学或医学奖,柏格与另外两人获得1980年诺贝尔化学奖。
2006年,诺贝尔化学奖授予罗杰·科恩伯格一人,以表彰他对真核转录的分子基础的研究,他获奖的工作于2001年发表在美国《科学》杂志上。
尽管从论文的发表到获奖只有5年的时间,但这是一项需要极大信心和巨大投入的工作。
“刚开始大家认为这明显是不可能的,有太多的问题基本上不可克服。
这项 研究的最初想法出现在30多年前,20多年前开始认真向这个方向努力。
”10月4日,科恩伯格在接受诺贝尔奖官方网站总编辑采访时如是说。
科恩伯格感谢美国国家卫生研究院(NIH)提供的非同寻常的最重要支持,他说:“NIH从1979年开始资助我的工作,即使当初根本就不知道这项研究是否会成功。
我们的研究全部是由NIH资助的。
”生命的故事今年的诺贝尔化学奖授予科恩伯格,因为他在分子水平上研究了储存在细胞核基因中的信息如何被复制、转送到细胞的其他地方,用以制造蛋白质,这个过程被称为转录,他首次在真核细胞生物中拍摄到了生命中这个动态过程的真实照片。
持续转录DNA中的遗传信息是所有生命的中心过程。
因为DNA分子位于细胞核中,它所携带的遗传信息必须复制到信息RNA分子,再由它带到细胞生产蛋白质的地方,蛋白质构建了生命的器官和功能。
44PEOPLE人物文/王衍行他为什么出国那天就想回来?——访东北林业大学生命科学学院隋广超教授隋广超(右二)在瑞典工作时与导师及同事合影“出国那天,我就想,我要回来,不仅是回国,还要回到家乡哈尔滨。
”在东北林业大学办公室,隋广超坚定地说。
目标是攻克癌症隋广超曾是美国维克森林大学医学院癌症生物学系副教授,美国国立卫生研究院(NIH )综合癌症研究中心的副教授,在美期间,主要利用分子生物学、细胞生物学和动物模型来探索癌症的发生与发展过程中的分子调控机制,他的研究将有助于攻克乳腺癌、前列腺癌、肺癌等。
虽然已经在美国安家,并拥有自己的实验室、研究团队,但他最终选择回到家乡,来到东北林业大学从事教学与科研工作。
翻开隋广超教授的简历,你会发现他是一个纯正的学霸。
1983年从哈尔滨第十二中学考入北京大学,随后在北京大学获得了生物化学及分子生物学博士学位。
从1995年到2004年,他先后获得了瑞典卡罗林斯卡国际人才交流2017 |545PEOPLE 人物(Karolinska)医学院博士和博士后。
值得一提的是,卡罗林斯卡医学院建立于1810年,是世界上最大最好的单一医学院之一,学院中有一个委员会,专门负责评审和颁发诺贝尔生理学或医学奖。
随后,隋广超在美国哈佛大学的哈佛医学院病理系做博士后,并从2005年开始在美国维克森林大学医学院癌症生物学系和美国国立卫生研究院(NIH) 综合癌症研究中心从事教学和科研工作。
在美期间,隋广超发明了以DNA载体为基础的RNA干扰(RNAi)技术。
这一技术的创立为许多生物学科的研究提供了全新的方法,尤其是对基因和蛋白质功能的研究具有重大的创新性。
目前,这一方法已经成为世界范围实验室用于研究基因功能的常规实验技术,对于人类抗击疾病的基础研究和临床应用有着重要意义。
随后,他又利用分子生物学和细胞生物学方法,从事异常表观遗传在肿瘤发生中的作用及关键转录因子(YY1)的功能研究,并论证了抑癌蛋白(SOX7)与肿瘤生长之间的关系,这些研究将为人类治疗癌症奠定基础。
bZIP转录因子在植物逆境胁迫响应和生长发育中的作用目录一、内容描述 (2)1. bZIP转录因子的研究背景与意义 (3)2. bZIP转录因子在植物中的分布与分类 (4)二、bZIP转录因子的基本特性 (5)1. bZIP蛋白的结构与功能 (6)2. bZIP转录因子的稳定性与活性调节 (8)三、bZIP转录因子在植物逆境胁迫响应中的作用 (9)1. bZIP转录因子对干旱胁迫的响应 (10)节水机制 (11)抗旱基因的表达调控 (12)2. bZIP转录因子对盐碱胁迫的响应 (14)盐碱适应机制 (15)盐碱抗性基因的表达调控 (16)3. bZIP转录因子对低温胁迫的响应 (17)低温适应机制 (18)低温抗性基因的表达调控 (19)4. bZIP转录因子对病虫害胁迫的响应 (20)病虫害防御机制 (21)抗病虫害基因的表达调控 (22)四、bZIP转录因子在植物生长发育中的作用 (23)1. bZIP转录因子对植物生长发育的调控 (24)生长激素的合成与信号传导 (25)光合作用与呼吸作用的调节 (27)2. bZIP转录因子对植物抗逆性的影响 (28)抗逆基因的表达与调控 (30)抗逆性的遗传与表观遗传 (31)五、bZIP转录因子的应用与展望 (33)1. bZIP转录因子在育种中的应用 (34)育种材料的创制 (35)育种性状的改良 (37)2. bZIP转录因子在基因工程中的应用 (39)抗逆基因的克隆与表达 (40)基因编辑技术的应用 (41)3. bZIP转录因子研究的未来趋势与挑战 (42)六、结论 (43)1. bZIP转录因子在植物逆境胁迫响应和生长发育中的重要作用.442. 对未来bZIP转录因子研究的展望 (46)一、内容描述本研究旨在探讨bZIP转录因子在植物逆境胁迫响应和生长发育中的作用。
bZIP是一种重要的RNA结合蛋白,参与了多种生物学过程,包括基因转录调控、蛋白质稳定性维持等。
拟南芥中MYB类转录因子研究进展[摘要]:MYB 转录因子家族是植物中最大的转录因子家族之一。
以含有保守的MYB 结构域为共同特征,广泛参与植物发育和代谢的调节。
含单一MYB 结构域的MYB 转录因子在维持染色体结构和转录调节上发挥着重要作用,其中一项重要功能就是对非生物逆境的应答。
是MYB 转录因子家族中较为特殊的一类。
这类转录因子通过调控生长发育,影响代谢产物的合成和影响激素信号等多方面参与非生物逆境的应答。
[关键字]:拟南芥;MYB转录因子;结构和分类;逆境胁迫;次生代谢1.引言转录因子是通过特定的方式激活或抑制目的基因的表达,使其以特定强度在特定的时间和空间表达,来调控细胞的发育、增殖和新陈代谢等生理生化反应。
MYB 转录因子家族是一个庞大的转录因子家族,广泛地存在于所有真核生物中。
(1)根据与DNA结合的方式可以把TF分为两类:普遍性转录因子(general transcription factor,GTF)和特异性转录因子(sequence—specific transcription factor)(3~5)。
GTF能和启动子的核心序列TATA框结合,它们与RNA聚合酶Ⅱ共同组成转录起始复合体,可以激活所有基因的转录。
而特异性转录因子受到一些类固醇激素,生长因子或其他刺激后,和DNA序列上的其它调节元件结合,只能激活特定的基因。
典型的转录因子一般具有4个功能区:DNA结合区、转录调控区、核定位信号区和寡聚化位点。
通常根据保守性较强的DNA结合区把转录因子分类,例如螺旋一转角一螺旋(helix-turn-helix)、锌指(zinc finger)结构、亮氨酸拉链(1eucine zipper)和MADS盒等结构。
而MYB 转录因子家族是功能多样,数量众多的转录因子家族之一,参与调控植物发育,代谢和对生物与非生物胁迫的反应等多种生理过程。
第一个MYB 基因v-MYB是在禽类成髓细胞瘤病毒(avian myeloblastosis virus)中发现的一个癌基因,因此人们把这一类的基因都称为MYB 基因。
2.转录因-TSpl与人肝癌转移潜能关系的实验分析结果2.1.不同转移潜能人肝癌细胞系转录因子Spl活性差异的验证应用EMSA法检测在Hep3B、MHCC97L、MHCC97H三种转移潜能不同的人肝癌细胞核中转录因子Spl的活性差异以验证转录因子活性芯片的结果。
结果表明随肝癌转移潜能升高(Hep3B<MHCC97L<MHCC97H),Spl活性均显著增强。
与转录因子活性芯片检测的差异趋势是一致的(见图2)。
图2EMSA验证转录因子Spl在转移潜能不同的人肝癌细胞的活性差异2.2.不同转移潜能人肝癌细胞的Spl蛋白表达量及磷酸化水平:转录因子蛋白表达量及表达后的修饰(如磷酸化)均可影响转录因子的活性,因此应用Westernblot检测Spl,磷酸化Spl(p.Spl)在三种不同转移潜能的人肝癌细胞系(I--Iep3B、MHCC97L和MHCC97H)中的表达及磷酸化水平的差异。
结果表明随肝癌细胞转移潜能的升高(Hep3B<MHCC97L<MHCC97H),Spl的表达量也随之增高,而P.Spl的表达差异更显著(见图3),这提示Spl蛋白表达量和磷酸化均可影响Spl活性,而磷酸化水平可能是更为主要的因素。
图3Spl在转移潜能不同的人肝癌细胞的表达及磷酸化情况3.RNA干扰效果鉴定3.1.转染效率检测用脂质体将SplsiRNA转染MHCC97H细胞的同时,设置一个平行的未转染组和一个阴性对照组。
对照组也用脂质体转染带荧光标记的非特异性dsRNA,对照dsRNA转染后除作为转染过程的对照外,还可以在荧光显微镜下观察转染的效率。
转染对照dsRNA18h后,分别在普通光镜下和荧光显微镜下观察细胞,发现两显微镜下的同一视野内细胞数目形态相同,即光镜下看到的同一视野的全部细胞在荧光显微镜下均带有绿色荧光,表明转染效率几乎为100%(见图5)。
图5转染荧光标记的阴性对照dsRNA后转染效率的观察A:普通光学显微镜下;B:荧光显微镜下3.2.SplsiRNA转染MHCC97H细胞后SplmRNA水平检测SplsiRNA转染MHCC97H细胞24小时后,用Real-timePCR检测mRNA的抑制效果。
苹果TCP转录因子家族进化关系及结构域序列保守性的分析-植物学论文-生物学论文——文章均为WORD文档,下载后可直接编辑使用亦可打印——TEOSINTE BRANCHED1 / CYCLOIDEA / PRO-LIFERATING CELL FACTOR1( 简称TCP) 家族是一类植物特有的转录因子家族。
最早发现的家族成员是玉米TB1( teosinte branched 1) 基因,金鱼草CYC( cycloidea) 基因和水稻PCF1、PCF2 基因,这4 个基因编码的蛋白都包含一段由约60 个氨基酸组成的保守序列,该保守序列能形成一种非典型的螺旋-环-螺旋结构( non -canonical basic -Helix -Loop -Helix structure)。
根据其代表成员TB1、CYC 和PCFs 的首字母缩写,把能够编码这段保守氨基酸序列的基因命名为TCP 基因,把这段保守的氨基酸序列命名为TCP 结构域。
TCP 结构域中的螺旋-环-螺旋区域( bHLH) 含有两个由保守的亲水氨基酸构成的中性螺旋结构和一个负责连接两个螺旋区域的环结构。
在第二个螺旋区域有一个特异的LXXLL基序,动物bHLH 蛋白的研究结果表明这段基序可以通过调控转录的共激活单元结合到核定位蛋白上。
TCP 家族成员除了含有TCP 结构域外,还存在一个保守的R 结构域,R 结构域并不是所有的TCP 转录因子共有的,它富含精氨酸、赖氨酸和谷氨酸等极性氨基酸,可以形成一个亲水性的螺旋。
前人对CYC、TB1、PCFs 和其他9 条预测的拟南芥和玉米TCP 基因进行了进化分析,结果表明,这12 个基因可以被分为两个亚家族,一个包含有CYC 和TB1,命名为CYC/TB1 亚家族; 另一个包括PCFs,命名为PCF 亚家族。
其中TCP 结构域普遍存在于所有的TCP 家族成员中,而R 结构域则特异存在于CYC/TB1 亚家族的一些基因中。
摘要`转录因子对很多下游基因的表达具有调控作用,在植物的生长发育、代谢及抵抗生物和非生物胁迫为中起着重要作用。
随着全球环境的恶化以及人口增长的压力,植物抗逆机制和植物抗逆性的研究对于可持续发展的现代农业来说是至关重要的。
植物经过长期的自然选择,不断进化以适应外界环境的变化,形成了对各种环境胁迫的适应性或抗逆能力。
植物体通过感受环境胁迫信号,通过多种信号转导途径,诱导一系列相关基因的表达,参与响应胁迫反应,调节体内生理生化代谢,形成抗逆防御反应体系,以抵御环境胁迫对植物体的伤害。
转录因子是一类能够与启动子区域顺式作用元件特异性结合的蛋白质,是植物中最大的基因家族之一。
本实验通过构建携带GAL4顺式元件(GAL-UAS)双荧光素酶报告子载体和GAL4BD(GAL4的DNA Binding结构域)融合表达目的转录因子(已知具有转录抑制活性的OsMADS57和转录激活活性的OsDRAP1)的效应子载体,通过农杆菌介导的烟草瞬时转化体系对该系统进行验证,明确转录因子转录活性分析系统的灵敏性。
研究结果将为进一步探究候选基因(转录因子)的生物学功能、转录调节机制研究提供技术支撑。
关键词:植物;转录因子;双荧光素酶;转录活性;GAL4AbstractTranscription factors play a regulatory role in the expression of many downstream genes and play an important role in plant growth, metabolism and resistance to biological and abiotic stress. With the deterioration of the global environment and the pressure of population growth, the study of plant resistance mechanism and plant resistance is very important for sustainable modern agriculture. Plants have evolved over a long period of time to adapt to changes in the external environment, forming an adaptable or resistant ability to various environmental stress. By feeling the signal of environmental stress, through a variety of signal transduction channels, the plant body induces the expression of a series of related genes, participates in the response to the stress response, regulates the physiological and biochemical metabolism in the body, and forms an anti-reversal defensive response system to resist the damage to the plant body by environmental stress. Transcription factoris is a class of proteins that can bind specifically to the co-acting elements of the promoter region and is one of the largest gene families in plants.This experiment verified the system by constructing an effect subcarrier that carries GAL4-cherokin enzyme reporting subcarriers and GAL4BD (THE DNA Binding domain of GAL4) fusion expression purpose transcription factors (OsMADS57 known to have transcription inhibition activity and osDRAP1 with transcriptional activation activity) to verify the system through the agricultural bacteria-mediated tobacco transient conversion system. The results will provide technical support for further exploration of the biological function of candidate genes (transcription factors) and the study of transcription alchemy mechanisms.Key words:Plants; transcription factors; difluoroenzyme; transcription activity; GAL41绪论1.1植物响应非生物胁迫反应旱涝、盐渍、高低温影响了植物的生长发育,这些非生物胁迫在自然环境中非常常见,造成了农作物产量下降。
植物转录因子国自然申请书尊敬的国自然评审委员会:亲爱的评审老师们!我是[申请人姓名],今天怀着超级激动又有点小紧张的心情,来提交这份关于植物转录因子的国自然申请呢。
一、项目的研究背景。
咱们都知道,植物在整个自然界那可是超级重要的存在呀。
而植物转录因子就像是植物生长、发育、应对环境变化的小指挥官一样。
在目前的研究现状下呢,虽然已经对植物转录因子有了一些了解,但是还有好多好多神秘的地方等着我们去探索。
比如说,有一些植物转录因子在特殊环境下的功能就像一个隐藏的宝藏,还没有被完全挖掘出来。
像在干旱或者盐碱地这种比较恶劣的环境下,植物是怎么通过转录因子来调整自己的生长策略的呢?这就像是植物在和大自然玩一场艰难的生存游戏,而转录因子就是它手中的秘密武器,可我们还不太清楚这个武器到底是怎么使用的。
二、项目的研究目的。
我这个项目呀,就是想把这些不清楚的地方弄明白。
我的小目标就是深入研究植物转录因子在特定环境下的调控机制。
具体来说呢,我想知道在不同的环境压力下,植物转录因子是怎么和其他基因相互作用的。
这就好比要弄清楚一个团队里每个成员之间的关系,谁在指挥谁,谁在配合谁。
而且呀,我还想找到那些可以被转录因子调控的关键基因,这些基因可能就是让植物在恶劣环境下还能茁壮成长的关键因素呢。
我就像一个好奇的小侦探,想要把这些隐藏在植物体内的秘密都找出来。
三、项目的研究内容。
(一)转录因子的筛选。
我打算从一些比较特殊的植物品种入手,这些植物可能在应对环境变化方面有独特的能力。
然后用一些超级酷的生物技术,像是基因芯片技术之类的,来筛选出那些可能在环境适应过程中起重要作用的转录因子。
这就像是在一群小豆子里挑出那些闪闪发光的金豆子一样,得特别仔细呢。
(二)转录因子的功能验证。
找到这些转录因子之后,可不能就这么算了呀。
我得通过各种实验来验证它们到底有什么功能。
比如说,做一些转基因的实验,把这些转录因子转到其他植物里,看看那些植物会发生什么变化。
转录因子T-bet、GATA-3、RORgammat及FOXP3在肝癌患者外周血中表达情况的研究硕士研究生:吴立旋1导师:刘晓平2 教授1、汕头大学医学院2006级临床硕士研究生汕头 5150312、深圳市北京大学深圳医院深圳 518036中文摘要目的:一、了解肝癌患者外周血中是否存在Treg优势化现象。
二、研究肝癌患者外周血中Th1、Th2、Th17及Treg各自的主要转录因子T-bet、GATA-3、RORgammat及FOXP3的表达情况。
材料与方法:抽取实验组20例肝癌患者与对照组20例健康志愿者的外周静脉血,采用流式细胞术检测外周静脉血单个核细胞中CD4+CD25+T细胞占CD4+细胞比例;采用荧光定量PCR法检测外周静脉血单个核细胞中Th1、Th2、Th17及Treg各自的主要特异转录因子T-bet、GATA-3、RORgammat及FOXP3的mRNA表达情况。
结果:原发性肝癌组外周血单个核细胞中CD4+CD25+Treg占CD4+T细胞比例要显著高于对照组(17.72±4.97 VS 9.22±2.68, P<0.01),Treg的特异转录因子FOXP3 mRNA的表达肝癌组明显高于对照组(3.17±1.59 VS 1.39±1.13,P<0.01),斯皮尔曼相关性分析显示FOXP3 mRNA表达与CD4+CD25+Treg细胞量呈正相关(肝癌组r=0.761, P<0.01)。
Th1的特异转录因子T-bet mRNA的表达肝癌组显著低于对照组(52.34±34.07 VS 104.±56.00, P<0.01),而Th2的特异转录因子GATA-3 mRNA的表达则高于对照组(1.38±1.15 VS 0.58±0.65, P<0.05),T-bet mRNA/GATA-3 mRNA比值明显减小(86.01±116.71 VS 461.88±708.81, P<0.05)。
转录因子研究——为论文加“分”
什么是转录因子?
●转录因子(Transcription factor,TF)是一类能与特异性DNA序列结合并调
节基因转录的调控蛋白。
●转录因子通常是细胞内信号通路的核心蛋白,是将外界刺激转化为基因表达
变化的关键调控者。
为什么要研究转录因子?
●人体的35000多个基因在不同的组织、不同的时间具有表达差异性,转录因
子的调控起到重要的作用。
●2012年的诺贝尔生理学或医学奖得主山中伸弥,在小鼠成纤维细胞中表达
Oct3/4、Sox2、c-Myc以及Klf4四种转录因子,将成纤维细胞逆转形成多能干细胞(iPS)。
●转录因子与多种人类重大疾病相关,比如p53、myc、ER、Id与癌症相关;
MEF2、HIF1与心脏疾病相关;NFκB与炎症相关;PPAR与肥胖相关等等。
怎样用转录因子研究为论文加“分”?
加“分”Step 1
●信号通路以及疾病相关的研究比较容易找到转录因子研究的突破口,已有在
研项目的研究人员根据自身的研究背景,找准转录因子研究突破口。
●对于还没有具体研究思路的科研人员来说,转录因子研究相对来说容易出结
果、容易发文章,也容易进行深入地探索。
加“分”Step 2
●转录因子种类繁多,研究比较多
同时也是比较关键的转录因子
大约有100种。
●可以使用基因芯片,可以同时做
很多目标蛋白的表达,但是相对
来说面比较广,不会专门针对转
录因子,后期数据分析以及后续
目标选择方面比较困难。
●推荐一种专门做转录因子的小
高通量方法——“多重转录因子
微孔板阵列检测试剂”。
这个试
剂专门做转录因子的,以标准
96孔板微为载体,可以同时检
测48/96种转录因子表达情况,
操作过程跟ELISA实验差不多,
结果数值化呈现,判读更直观、
分析更简单。
用这个做就更有针
对性一点,只做常见的转录因子,
后续的实验安排也更有针对性。
加“分”Step 3
●高通量筛查后,通常要对表达差异的转录因子进行验证。
●验证方法很多,包括转录因子滤板法、EMSA、ELISA以及荧光素酶报告载
体等。
●特别推荐一种适用于大量样本检测的“转录因子滤板法检测试剂”,一次实
验可以检测96个样本中的转录因子表达,也可以根据需求灵活调整样本数量。
加“分”Step 4
●到Step 3,就可以出一篇文章了,想发表高“分”文章还需要更多深入研究。
●比如,向上游寻找转录因子差异表达的信号传导途径,或者向下游探索转录
因子靶基因表达变化的影响。
●还可以通过增大样本量、样本种类来提高文章水平。