第14章蛋白质的生物合成与修饰(药学系)
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化学生物学中的蛋白质合成与修饰蛋白质是生物体内最重要的大分子物质之一,参与了生物体内几乎所有的生命过程。
蛋白质的合成与修饰是化学生物学领域的一个重要研究课题。
本文将从蛋白质合成的基本过程入手,探讨蛋白质的合成和修饰在生物学中的重要作用。
一、蛋白质合成的基本过程蛋白质合成是指将氨基酸按照特定的序列连接起来形成多肽链的过程。
蛋白质的合成主要通过翻译过程完成,包括三个主要步骤:转录、转运和翻译。
1. 转录转录是指将DNA模板转录成RNA的过程。
在细胞质中,核糖体RNA(rRNA)和转移RNA(tRNA)起着重要的作用。
在核内,DNA的两条链解旋,其中一个链作为模板合成RNA。
通过与氨基酸配对,RNA链合成一条辅助的RNA链,称为mRNA(信使RNA)。
mRNA包含了氨基酸顺序的编码信息。
2. 转运转运是指将mRNA分子从细胞核转移到细胞质的过程。
mRNA通过核孔复合体运输到细胞质,并在细胞质中定位到核糖体上。
3. 翻译翻译是指通过核糖体将mRNA上的信息转化成氨基酸序列的过程。
翻译过程中,mRNA的信息通过转移RNA(tRNA)上的三个碱基序列(编码子)被翻译成相应的氨基酸。
tRNA携带相应的氨基酸,通过与mRNA的编码子配对,使氨基酸按照指定的顺序连接起来,最终形成多肽链或蛋白质。
二、蛋白质修饰的重要作用蛋白质合成完成后,往往还需要经过多种修饰过程才能发挥其生物学功能。
蛋白质修饰是指通过化学反应在蛋白质分子上加上一些功能团或改变其磷酸化状态、甲基化状态等方式,以改变蛋白质的物理化学性质和功能。
1. 磷酸化修饰磷酸化修饰是蛋白质最常见的一种修饰方式。
通过磷酸化修饰可以改变蛋白质的电荷性质和空间构象,进而调控蛋白质的功能。
蛋白质的磷酸化修饰通常由激酶和磷酸酶等酶催化完成。
2. 甲基化修饰甲基化修饰是指在蛋白质上加上一个甲基团,常常通过甲基转移酶催化完成。
甲基化修饰可以影响蛋白质的稳定性、DNA结合能力和互作能力,对基因表达和细胞生命活动起着重要的调节作用。
蛋白质合成与修饰蛋白质是生命的基石,它们在细胞中承担着各种重要的功能。
蛋白质的合成与修饰是维持生命活动的核心过程之一。
本文将介绍蛋白质合成的过程以及蛋白质修饰的重要性。
一、蛋白质合成过程蛋白质合成是细胞内的一个复杂过程,包括转录和翻译两个关键步骤。
1. 转录转录是指在细胞核中,DNA转录为mRNA的过程。
具体来说,转录是由RNA聚合酶在DNA模板上合成一条mRNA链的过程。
转录的目的是将DNA上的遗传信息转录出来,供下一步的翻译使用。
2. 翻译翻译是指在细胞质中,mRNA上的遗传信息被翻译成蛋白质的过程。
翻译由核糖体进行,它通过读取mRNA上的密码子,将氨基酸按照遗传密码翻译出来,形成多肽链。
最终,多肽链会经过进一步的折叠和修饰,形成功能完整的蛋白质。
二、蛋白质修饰的重要性蛋白质修饰是指蛋白质在合成完成后,经过一系列的化学修饰调节,从而发挥其功能的过程。
蛋白质修饰对于生命活动起着至关重要的作用。
1. 磷酸化修饰磷酸化是一种常见的蛋白质修饰方式,通过在蛋白质中加上磷酸基团,可以改变蛋白质的结构和功能。
磷酸化修饰参与了细胞信号传导、细胞周期调控以及蛋白质激活等过程。
2. 乙酰化修饰乙酰化修饰是通过在蛋白质上加上乙酰基团,调控蛋白质的结构和功能。
乙酰化修饰在细胞核糖体的组装、DNA修复以及基因表达等方面起着重要作用。
3. 糖基化修饰糖基化是一种将糖基团连接到蛋白质上的修饰方式。
糖基化修饰不仅可以改变蛋白质的物理化学性质,还参与了识别和降解过程。
例如,糖基化参与了抗体的产生过程。
4. 脂肪酰化修饰脂肪酰化修饰是指在蛋白质上加上脂肪酸基团,调控蛋白质的定位和功能。
脂肪酰化修饰在细胞膜的组装、信号转导以及蛋白质-脂质相互作用中起重要作用。
蛋白质修饰的多样性和复杂性为生物体提供了更加多样丰富的功能。
三、蛋白质合成与修饰的调控机制蛋白质合成和修饰是受到细胞内多种调控机制的精确控制的。
1. 转录水平的调控在蛋白质合成过程中,转录水平的调控是重要的一环。
蛋白质合成与修饰的生物化学研究蛋白质是构成生命体的重要组成部分,负责细胞内的生物化学反应和许多生理过程的调控。
蛋白质的合成和修饰是细胞生物化学研究的重要领域之一。
在本文中,我们将简要介绍蛋白质合成、转录和翻译,以及蛋白质修饰中的几种主要反应类型。
1. 蛋白质合成和转录与翻译蛋白质是由氨基酸链组成的,氨基酸是生物体内的基本单元。
对于构建蛋白质,生物体需要获取氨基酸作为材料,并将它们按照一定的顺序组合在一起,形成一个长链。
用于蛋白质合成的氨基酸包括20种不同的类型,它们的特性有所不同。
合成蛋白质需要将氨基酸按照正确的顺序组合在一起,并且进行必要的化学修饰和折叠。
在细胞内,蛋白质的合成是由DNA上特定区域的基因编码的RNA分子进行指导的,这个过程称为转录。
翻译是细胞内合成蛋白质的过程。
在翻译过程中,RNA分子将基因编码的信息转化为氨基酸链,转化的过程需要各种酶参与,并且还需要一系列具有特定特征的蛋白质参与。
2. 蛋白质修饰蛋白质合成是一个复杂的过程,还需要进行必要的修饰,以确保蛋白质能够完成其指定的功能。
蛋白质修饰包括各种磷酸化、甲基化、酰化和糖基化等反应类型。
以下是其中几种重要的类型。
磷酸化是一种由磷酸化酶和去磷酸酶催化的化学反应。
在这个过程中,磷酸基团可以添加到蛋白质上,并且可以被不同的酶去除。
磷酸化可以影响蛋白质的结构和功能以及它们在细胞中的位置。
甲基化是修饰泛素脱氨基酶的一种反应。
在这个过程中,甲基基团被添加到具有特殊序列的蛋白质上。
这种修饰可以影响蛋白质的稳定性和相互之间的相互作用,并且还可以影响它们在细胞中的位置和功能。
酰化是将一个酰基团或烯丙基团添加到蛋白质上的修饰反应。
这种修饰可以通过酰化酶或转移酶来实现。
酰化可以影响蛋白质的结构和功能以及它们在细胞中的位置。
糖基化是将糖分子添加到蛋白质上的修饰反应。
这种修饰可以通过糖基转移酶来实现。
糖基化可以影响蛋白质的结构和功能,并且可以影响它们在细胞中的位置和功能。
蛋⽩质的合成、转运、修饰蛋⽩质的合成蛋⽩质的种类是由基因决定的,也就是说⼈类基因组有多少个基因,⼈体就有多少种蛋⽩质,只是蛋⽩质表达的时期和部位不同.根据⼈类基因组计划分析得知:全部⼈类基因组约有2.91Gbp,约有39000多个基因;也就是说⼈体蛋⽩质的种类有39000多种蛋⽩质⽣物合成可分为五个阶段,氨基酸的活化、多肽链合成的起始、肽链的延长、肽链的终⽌和释放、蛋⽩质合成后的加⼯修饰⼀.氨基酸的活化分散在胞液中的各种氨基酸需经特异的氨基酰-tRNA合成酶催化,ATP供能,并需Mg2+或Mn2+参与在氨基酸的羧基上进⾏活化,⽣成中间复合物()后者再与相应的tRNA作⽤,将氨基酰转移到tRNA分⼦的氨基酸臂上,即3′末端腺苷酸中核糖的3′(或2′)羟基以酯键相结合形成氨基酰-tRNA【氨基酰tRNA的⽣成】tRNA各种tRNA的⼀级结构互不相同,但它们的⼆级结构都呈三叶草形三叶草形结构的主要特征是:含有四个螺旋区、三个环和⼀个附加叉四个螺旋区构成四个臂,其中含有3′末端的螺旋区称为氨基酸臂,因为此臂的3′-末端都是C-C-A-OH序列,可与氨基酸连接三个环分别⽤Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ表⽰环Ⅰ含有5,6⼆氢尿嘧啶,称为⼆氢尿嘧啶环(DHU环)环Ⅱ顶端含有由三个碱基组成的反密码⼦,称为反密码⼦环;反密码⼦可识别mRNA分⼦上的密码⼦,在蛋⽩质⽣物合成中起重要的翻译作⽤环Ⅲ含有胸苷(T)、假尿苷(ψ)、胞苷(C),称为假尿嘧啶环(TψC环);此环可能与结合核糖体有关tRNA在⼆级结构的基础上进⼀步折叠成为倒“L”字母形的三级结构起始因⼦原核起始因⼦只有三种(IF1、IF2、IF3)真核起始因⼦(简称为eIF)种类多且复杂,已鉴定的真核起始因⼦共有12种延长因⼦原核⽣物(简称EF)由三部分组成:EF-Tu,EF-Ts,和EF-GEF-Tu它介导氨酰-tRNA进⼊核糖体的空位EF-Ts充当EF-Tu亚基的鸟嘌呤核苷酸交换因⼦,催化EF-Tu释放GDPEF-G催化tRNA的移位和多肽延伸的每个循环后期mRNA从核糖体上掉下来真核⽣物(简称eEF)真核⽣物中分为:eEF-1和eEF-2eEF-1有两个亚基,α和βγα相当于原核⽣物中的EF-Tu亚基,它介导氨酰-tRNA进⼊核糖体的空位Βγ相当于原核⽣物中EF-Ts,核苷酸交换因⼦α,催化GDP从α上释放eEF-2相当于原核⽣物的EF-G,催化tRNA的移位和多肽延伸的每个循环后期mRNA从核糖体上掉下来终⽌因⼦(释放因⼦)原核⽣物细胞的释放因⼦(简称RF):识别终⽌密码⼦引起完整的肽链和核糖体从mRNA 上释放的蛋⽩质释放因⼦1(RF1):能识别终⽌密码⼦UAA和UAG⽽终⽌蛋⽩质合成的细菌释放因⼦释放因⼦2(RF2):能识别终⽌密码⼦UAA和UGA⽽终⽌蛋⽩质合成的细菌释放因⼦释放因⼦3(RF3):与延长因⼦EF-G有关的细菌蛋⽩质合成终⽌因⼦当它终⽌蛋⽩质合成时,它使得因⼦RF1和RF2从核糖体上释放真核⽣物细胞只有⼀种终⽌因⼦(称为eRF)能识别所有的终⽌密码⼦因为它没有与GTP结合的位点,所以它不能帮助完成合成的多肽从P位点的tRNA的释放在真核⽣物内可能还存在能与eRF合作、帮组多肽从核糖体释放的蛋⽩质核糖体的活性部位单个核糖体上存在四个活性部位,在蛋⽩质合成中各有专⼀的识别作⽤1.A部位:氨基酸部位或受位:主要在⼤亚基上,是接受氨酰基-tRNA的部位2.P部位:肽基部位或供位:主要在⼩亚基上,是释放tRNA的部位3.肽基转移酶部位(肽合成酶),简称T因⼦:位于⼤亚基上,催化氨基酸间形成肽键,使肽链延长4.GTP酶部位:即转位酶(EF-G),简称G因⼦,对GTP具有活性,催化肽键从供体部位→受体部位核糖体上还有许多与起始因⼦、延长因⼦、释放因⼦以及各种酶相结合的位点核糖体的⼤⼩是以沉降系数S来表⽰,S数值越⼤、颗粒越⼤、分⼦量越⼤原核细胞与真核细胞核糖体的⼤⼩亚基是不同的⼆.核糖体循环(肽链合成)1.肽链启动阶段在蛋⽩质⽣物合成的启动阶段,核蛋⽩体的⼤、⼩亚基,mRNA与⼀种具有启动作⽤的氨基酸tRNA共同构成启动复合体。
蛋白质的合成蛋白质的种类是由基因决定的,也就是说人类基因组有多少个基因,人体就有多少种蛋白质,只是蛋白质表达的时期和部位不同.根据人类基因组计划分析得知:全部人类基因组约有2.91Gbp,约有39000多个基因;也就是说人体蛋白质的种类有39000多种蛋白质生物合成可分为五个阶段,氨基酸的活化、多肽链合成的起始、肽链的延长、肽链的终止和释放、蛋白质合成后的加工修饰一.氨基酸的活化分散在胞液中的各种氨基酸需经特异的氨基酰-tRNA合成酶催化,ATP供能,并需Mg2+或Mn2+参与在氨基酸的羧基上进行活化,生成中间复合物()后者再与相应的tRNA作用,将氨基酰转移到tRNA分子的氨基酸臂上,即3′末端腺苷酸中核糖的3′(或2′)羟基以酯键相结合形成氨基酰-tRNA【氨基酰tRNA的生成】tRNA各种tRNA的一级结构互不相同,但它们的二级结构都呈三叶草形三叶草形结构的主要特征是:含有四个螺旋区、三个环和一个附加叉四个螺旋区构成四个臂,其中含有3′末端的螺旋区称为氨基酸臂,因为此臂的3′-末端都是C-C-A-OH序列,可与氨基酸连接三个环分别用Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ表示环Ⅰ含有5,6二氢尿嘧啶,称为二氢尿嘧啶环(DHU环)环Ⅱ顶端含有由三个碱基组成的反密码子,称为反密码子环;反密码子可识别mRNA分子上的密码子,在蛋白质生物合成中起重要的翻译作用环Ⅲ含有胸苷(T)、假尿苷(ψ)、胞苷(C),称为假尿嘧啶环(TψC环);此环可能与结合核糖体有关tRNA在二级结构的基础上进一步折叠成为倒“L”字母形的三级结构起始因子原核起始因子只有三种(IF1、IF2、IF3)真核起始因子(简称为eIF)种类多且复杂,已鉴定的真核起始因子共有12种延长因子原核生物(简称EF)由三部分组成:EF-Tu,EF-Ts,和EF-GEF-Tu它介导氨酰-tRNA进入核糖体的空位EF-Ts充当EF-Tu亚基的鸟嘌呤核苷酸交换因子,催化EF-Tu释放GDPEF-G催化tRNA的移位和多肽延伸的每个循环后期mRNA从核糖体上掉下来真核生物(简称eEF)真核生物中分为:eEF-1和eEF-2eEF-1有两个亚基,α和βγα相当于原核生物中的EF-Tu亚基,它介导氨酰-tRNA进入核糖体的空位Βγ相当于原核生物中EF-Ts,核苷酸交换因子α,催化GDP从α上释放eEF-2相当于原核生物的EF-G,催化tRNA的移位和多肽延伸的每个循环后期mRNA从核糖体上掉下来终止因子(释放因子)原核生物细胞的释放因子(简称RF):识别终止密码子引起完整的肽链和核糖体从mRNA 上释放的蛋白质释放因子1(RF1):能识别终止密码子UAA和UAG而终止蛋白质合成的细菌释放因子释放因子2(RF2):能识别终止密码子UAA和UGA而终止蛋白质合成的细菌释放因子释放因子3(RF3):与延长因子EF-G有关的细菌蛋白质合成终止因子当它终止蛋白质合成时,它使得因子RF1和RF2从核糖体上释放真核生物细胞只有一种终止因子(称为eRF)能识别所有的终止密码子因为它没有与GTP结合的位点,所以它不能帮助完成合成的多肽从P位点的tRNA的释放在真核生物内可能还存在能与eRF合作、帮组多肽从核糖体释放的蛋白质核糖体的活性部位单个核糖体上存在四个活性部位,在蛋白质合成中各有专一的识别作用1.A部位:氨基酸部位或受位:主要在大亚基上,是接受氨酰基-tRNA的部位2.P部位:肽基部位或供位:主要在小亚基上,是释放tRNA的部位3.肽基转移酶部位(肽合成酶),简称T因子:位于大亚基上,催化氨基酸间形成肽键,使肽链延长4.GTP酶部位:即转位酶(EF-G),简称G因子,对GTP具有活性,催化肽键从供体部位→受体部位核糖体上还有许多与起始因子、延长因子、释放因子以及各种酶相结合的位点核糖体的大小是以沉降系数S来表示,S数值越大、颗粒越大、分子量越大原核细胞与真核细胞核糖体的大小亚基是不同的二.核糖体循环(肽链合成)1.肽链启动阶段在蛋白质生物合成的启动阶段,核蛋白体的大、小亚基,mRNA与一种具有启动作用的氨基酸tRNA共同构成启动复合体。