DNA提取液配方及步骤
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裂解液配方:100mmol Tris-Hcl(PH8.0);25mmol EDTA(PH 8.0);500mmol NaCl;1%SDS母液配制:1.500mmol Tris-Hcl(PH8.0)称取15.1425g Tris,加入150ml 蒸馏水,加入Hcl调PH至8.0,定容至250ml。
2.100mmol EDTA或EDTA-Na2称取7.3062g EDTA或8.455g EDTA-Na2,加入200ml 蒸馏水,调PH至8.0,定容至250ml。
3.5mol NaCl称取29.22g NaCl,加入90ml 蒸馏水,定容至100ml。
4.10% SDS称取10gSDS,加入100ml蒸馏水。
蛋白酶K配置:10mg/ml蛋白酶K溶液。
称取10mg蛋白酶K粉末,加入1ml蒸馏水溶解。
-20度保存。
配制1000ml裂解液:加入溶液1体积为200ml,加入溶液2体积为250ml,加入溶液3体积为100ml,加入溶液4为100ml。
配制500ml裂解液则相应减半。
步骤:1.在1.5ml离心管中加入0.2ml(200ul)裂解液,用配套的研磨棒杵成浆状,加入2ul浓度为10mg/ml的蛋白酶K至终浓度100ug/ml,45度水浴2-4h。
2.加入RNaseA至终浓度20ug/ml,水浴30min。
3.加入0.7ml苯酚:氯仿:异戊醇(25:24:1),轻微颠倒混匀,14000rpm离心5min。
4.中号枪头切去头部,抽取上清,重复抽提一次。
5.取上清,加入等体积氯仿:异戊醇(24:1),14000rpm离心5min。
6.取上清,加入2-2.5倍体积的无水乙醇,颠倒混匀,材料用量较多的昆虫可看到DNA沉淀,材料用量较少或酒精长时间浸泡着的标本可在-70度放置30min,14000rpm离心5min。
7.75%乙醇漂洗沉淀两次,无水乙醇漂洗,室温干燥。
8.根据沉淀量,加入30-50ulddH2O。
方法二:1.在1.5ml离心管中加入0.1ml(100ul)裂解液,用配套的研磨棒杵成浆状,用400ul裂解液冲洗研磨棒,加入5ul浓度为10mg/ml的蛋白酶K至终浓度100ug/ml,45度水浴1-2h。
提取DNA:CTAB法
预先准备:黄枪头、蓝枪头(最好剪去头部),小研钵,2ml离心管,液氮
药品:CTAB、β-巯基乙醇、RNA消化酶、冰冻酒精、NaAc
1 取叶片于研磨中,在磨好的样品中加入1-2ml CTAB,20-40ul的
β-巯基乙醇,等溶化成稀糊状态时倒入2ml离心管。
2 加入1-2ul RNA 消化酶-----可不加
3 放入65℃水浴锅加热30min,每隔五分钟上下颠倒几次
4 离心15min 12000r 温度无要求;
5 取上清夜800-1000ul;加入等体积 24:1的三氯甲烷:异戊醇和
苯酚(未加) 上下颠倒3-5min;离心10min 12000r
6 取上清液800-1000ul;再加入等体积24:1的三氯甲烷溶液,上
下颠倒3-5min;离心10min 12000r
7 取上清液600-800ul;加入1/10上清液体积的 3M NaAc之后上下
颠倒3-5min 一般加入70ul左右的3M NaAc
8 先静置3-5min,后加冰冻酒精,加满为止,摇晃3-5min
9 放在-20℃冰箱过夜(静置12小时)
10弃掉上层液体,加入1ml 的70%酒精,摇晃3-5min,
11离心5min 12000r,去掉上清液,再加1ml的70%酒精,摇晃3-5min,12离心5min 12000r去掉上清液,尽量把离心管内的残留液吸干
13放入超净工作台风干;加入70-100ul的灭菌水。
(1)将小麦叶片(约0.1g)放入研钵中,加入液氮冷冻,快速研成粉末后倒入1.5mL离心管中;(2)每管加入600μL SDS DNA提取液(含2%的巯基乙醇),于65℃水浴30min,其间温和混匀几次;(3)取出离心管,加入60μL 5mol/L KAc,立即上下颠倒温柔混匀(5~6次),冰上放置20min;(4)于12,000 rpm离心10min;(5)将上清液(约600μL)转移至新的离心管中,加入4μL RNase,室温放置5min;(6)加入600μL酚:氯仿:异戊醇(25:24:1);(7)于12,000 rpm离心15min;(8)将上清液转移至新的离心管中,记下体积,加入0.6~0.7倍体积的异丙醇,于-20℃下沉淀10~30min;(9)于10,000 rpm离心5min,弃上清,将沉淀用75%乙醇洗2~3次;(10)挥发干净乙醇,加入50μL ddH2O,-20℃保存;(11)1.0%琼脂糖凝胶电泳检测。
一、实验目的掌握植物总DNA的抽提方法和基本原理。
学习根据不同的植物和实验要求设计和改良植物总DNA抽提方法。
二、实验原理通常采用机械研磨的方法破碎植物的组织和细胞,由于植物细胞匀浆含有多种酶类(尤其是氧化酶类)对DNA的抽提产生不利的影响,在抽提缓冲液中需加入抗氧化剂或强还原剂(如巯基乙醇)以降低这些酶类的活性。
在液氮中研磨,材料易于破碎,并减少研磨过程中各种酶类的作用。
十二烷基肌酸钠(sarkosyl)、十六烷基三甲基溴化铵(hexadyltrimethyl ammomum bromide,简称为CTAB)、十二烷基硫酸钠(sodium dodecyl sulfate,简称SDS)等离子型表面活性剂,能溶解细胞膜和核膜蛋白,使核蛋白解聚,从而使DNA得以游离出来。
再加入苯酚和氯仿等有机溶剂,能使蛋白质变性,并使抽提液分相,因核酸(DNA、RNA)水溶性很强,经离心后即可从抽提液中除去细胞碎片和大部分蛋白质。
CTAB法DNA提取液
2%CTAB 2000ml配方
CTAB 40g
Nacl 163.64g
1M/L Tris-Hcl 200ml
0.5M/L EDTA 80ml
----------------- 定容至2000ml
1M/L Tris-Hcl 500ml配方
Tris 60.6g
加400ml水搅拌溶解
冷却后加浓盐酸调PH至8.0
定容至500ml
0.5M/L EDTA 500ml配方
EDTA 93.06g
加NAOH调PH至8.0
定容至500ml
注:1M/L Tris-Hcl和0.5M/L EDTA配方跟你配TPS一样。
2%CTAB配方可以到Takara或者其他生物公司目录上查询。
提取步骤
该法提取叶片DNA和TPS法稍有不同,简略如下:
1.提取液加800ul,当然也可以修改;
2.水浴温度改为650C,30min;
3.加500ml氯仿,上下震荡几下即可。
不过你的材料可能要死命震荡几分钟看看咋样,最好再重新用氯仿抽提一遍;
4.12000r/min离心10min,吸取上清液(比如200ml);
5.加2.5倍体积的无水酒精(比如500ml);
6.其他步骤就一样啦。
7.如果你想提取更高质量的DNA,可以在倒掉酒精之后,用75%酒精把DNA 再洗几遍。
8.如果以上步骤还不行,那就baidu或者小木虫吧。
酚氯仿法提取DN蛀要步骤和原理酚氯仿法提取DNA 主要步骤:1.将动物组织放在1.5ml 的离心管中,分别用75% 、50% 酒精和纯水梯度脱酒精。
每个梯度脱水时间为5-10min2.将组织放入研钵中,加入适量DNA 裂解液(300a),研磨后再加入300a IDNA裂解液冲洗研磨棒。
3.将研磨好的组织液用移液枪加到 1.5ml 离心管,在管中加10al蛋白酶K,用封口带将离心管封口,放入摇床(56C,5h)。
4.加入等体积的Tris饱和酚(500 a),摇匀(10min)。
5.离心:12000R, 7min, 4C。
离心后分成上中下三层,上层为DNA ,中层为蛋白质,下层为有机质。
6.吸取上层液体加入新的离心管。
7.配制Tris 饱和酚:氯仿:异戊醇=25:24:1 。
8.在含有上清液的离心管中加入Tris 饱和酚、氯仿和异戊醇混合液450 a,摇匀10min。
9.离心:12000R, 7min, 4C。
10.吸取上清液加到新的离心管,加入等体积的氯仿和异戊醇混合液400a 1(氯仿:异戊醇=24:1)。
11.离心:12000R, 7min, 4C。
12.吸取上清液加入新的离心管,加入2.5 倍经过-20 C冷冻的100%的酒精。
-20 C过夜。
13.将样品取出,12000R, 7min, 4C离心。
14.弃上清,留白色沉淀(DNA ),加400卩的75% 的经过-20C冷冻的酒精,反复吹打溶解。
15.重复第14 步骤2 次(用75%酒精洗三次)。
16.提取DNA 完成。
溴氯仿法提取DNA 的原理:用酚抽提细胞DNA 时,有什么作用?使蛋白质变性,同时抑制了DNase的降解作用。
用苯酚处理匀浆液时,由于蛋白与DNA 联结键已断,蛋白分子表面又含有很多极性基团与苯酚相似相溶。
蛋白分子溶于酚相,而DNA 溶于水相。
使用酚的优点:1. 有效变性蛋白质;2. 抑制了DNase的降解作用。
缺点:1. 能溶解10-15%的水,从而溶解一部分poly(A)RNA。
一、试剂盒打开后需要准备的工作1、ProteinaseK(蛋白酶K)的溶解①取4.5ml双蒸水加入蛋白酶K粉中使其充分溶解②将溶解好的蛋白酶K溶液分装进小离心管,每管100u l〜200ul③将分装好的ProteinaseK放入-20°C冰箱中保存,使用期限为12个月2、组织抑制剂(InhibitorRemovalbfer)的调配加入20ml无水乙醇(absoluteethanol)颠倒混匀并在空白方框处打钩3、洗液(washbuffer)的调配加入80ml无水乙醇(absoluteethanol)颠倒混匀并在空白方框处打钩二、组织DNA提取(试剂盒)1、组织样品处理与消化①将采集来的样品剪碎(WO.lcm)洗净保存液。
②加入组织破解液Tissue-lysis200ul蛋白酶K40ul然后放入55C水浴锅内3个小时使其充分消化。
2、DNA提取①在消化好的组织样品中加入结合液bindingbuffer200ul然后放入70°水浴锅中10分钟。
②再加异丙醇lOOul混合均匀吸取上清液放入柱体中,然后离心8000g—分钟。
③倒掉底液,加500ul组织抑制剂InhibitorRemoval然后离心倒掉底液④加洗液washingbuffer500ul离心(洗液加两次)⑤在70C预热ElutionBuffer,然后将洗好的柱体下部分丢掉,换新的离心管加入ElutionBuffer200ul溶解10分钟离心保留底液放-20C保存。
三、细胞DNA的提取(试剂盒)1、组织样品处理与消化①将带有培养基的样品用PBS清洗干净8000rpm/1min离心,倒掉上清②加PBS200ul振荡摇匀使之样品成为单个细胞的悬浊液③加200ulBindingBuffer,40ul蛋白酶K混合均匀放入70C水浴锅内消化10分钟。
2、DNA提取①加异丙醇lOOul混合均匀吸取上清液放入柱体中,然后离心8000g—分钟。
酚氯仿法提取DNA主要步骤:1.将动物组织放在1.5ml的离心管中,分别用75%、50%酒精和纯水梯度脱酒精。
每个梯度脱水时间为5-10min2.将组织放入研钵中,加入适量DN A裂解液(300μl),研磨后再加入300μl DNA裂解液冲洗研磨棒。
3.将研磨好的组织液用移液枪加到1.5ml离心管,在管中加10μl蛋白酶K,用封口带将离心管封口,放入摇床(56℃,5h)。
4.加入等体积的Tris饱和酚(500μl),摇匀(10min)。
5.离心:12000R,7min,4℃。
离心后分成上中下三层,上层为DNA,中层为蛋白质,下层为有机质。
6.吸取上层液体加入新的离心管。
7.配制Tris饱和酚:氯仿:异戊醇=25:24:1。
8.在含有上清液的离心管中加入Tri s饱和酚、氯仿和异戊醇混合液450μl,摇匀10mi n。
9.离心:12000R,7min,4℃。
10.吸取上清液加到新的离心管,加入等体积的氯仿和异戊醇混合液400μl(氯仿:异戊醇=24:1)。
11.离心:12000R,7min,4℃。
12.吸取上清液加入新的离心管,加入2.5倍经过-20℃冷冻的100%的酒精。
-20℃过夜。
13.将样品取出,12000R,7min,4℃离心。
14.弃上清,留白色沉淀(DNA),加400μl的75%的经过-20℃冷冻的酒精,反复吹打溶解。
15.重复第14步骤2次(用75%酒精洗三次)。
16.提取DNA完成。
溴氯仿法提取DNA的原理:用酚抽提细胞DNA时,有什么作用?使蛋白质变性,同时抑制了D Nase的降解作用。
用苯酚处理匀浆液时,由于蛋白与D NA联结键已断,蛋白分子表面又含有很多极性基团与苯酚相似相溶。
蛋白分子溶于酚相,而DNA 溶于水相。
(1)将小麦叶片(约0.1g)放入研钵中,加入液氮冷冻,快速研成粉末后倒入 1.5mL 离心管中;(2)每管加入 600μL SDS DNA 提取液(含 2%的巯基乙醇),于 65℃水浴 30min,此间平和混匀几次;(3)拿出离心管,加入 60μL 5mol/L KAc ,立刻上下颠倒温柔混匀(5~6 次),冰上搁置20min;(4)于 12,000 rpm 离心 10min;(5)将上清液(约 600μL )转移至新的离心管中,加入4μL RNase,室温搁置 5min;(6)加入 600μL 酚:氯仿:异戊醇( 25:24:1);(7)于 12,000 rpm 离心 15min;(8)将上清液转移至新的离心管中,记下体积,加入0.6~0.7 倍体积的异丙醇,于 -20℃下积淀 10~30min;(9)于 10,000 rpm 离心 5min,弃上清,将积淀用75%乙醇洗 2~3 次;(10)挥发洁净乙醇,加入50μL ddH2O,-20℃保存 ;(11)1.0%琼脂糖凝胶电泳检测。
一、实验目的掌握植物总 DNA 的抽提方法和基根源理。
学习依据不一样的植物和实验要求设计和改进植物总 DNA 抽提方法。
二、实验原理往常采纳机械研磨的方法破裂植物的组织和细胞,因为植物细胞匀浆含有多种酶类(特别是氧化酶类)对DNA 的抽提产生不利的影响,在抽提缓冲液中需加入抗氧化剂或强复原剂(如巯基乙醇)以降低这些酶类的活性。
在液氮中研磨,资料易于破裂,并减少研磨过程中各样酶类的作用。
十二烷基肌酸钠 (sarkosyl) 、十六烷基三甲基溴化铵(hexadyltrimethyl ammomum bromide ,简称为 CTAB) 、十二烷基硫酸钠 (sodium dodecyl sulfate ,简称 SDS)等离子型表面活性剂,能溶解细胞膜和核膜蛋白,使核蛋白解聚,进而使 DNA 得以游离出来。
再加入苯酚和氯仿等有机溶剂,能使蛋白质变性,并使抽提液分相,因核酸 (DNA 、 RNA) 水溶性很强,经离心后即可从抽提液中除掉细胞碎片和大多半蛋白质。
试剂配方1. 0.5M EDTA(pH8.0)溶液:80ml dd H2O中加入18.61g二水乙二胺四乙酸二钠(EDTA-Na·2H2O),在磁力搅拌器上剧烈搅拌,用NaOH调节溶液的pH值至8.0后用dd H2O定容至100ml,121℃高压灭菌20min 备用。
2. 10%SDS溶液:在100ml dd H2O中溶解10g电泳级SDS,加热至68℃助溶,备用(无须灭菌)。
3. 1M Tris溶液在80ml dd H2O中溶解12.191g Tris碱,加入浓HCl调pH值至8.0,加dd H2O定容至100ml,121℃高压灭菌20min(溶液冷至室温后最后再调定一次pH值)。
4. 细胞裂解液组成:1M Tris-Cl(pH=8) 2.5ml0.5M EDTA(pH=8) 50ml dd H2O定容到250ml10%SDS 12.5ml5.TE溶液1M Tris-Cl(pH=8) 1ml0.5M EDTA(pH=8) 0.2ml dd H2O定容至100ml6.70%乙醇66.315ml 95%乙醇,加dd H2O定容至90ml,-20℃保存备用。
7.75%乙醇78.947ml 95%乙醇,加dd H2O定容至100ml,-20℃保存备用。
8.蛋白酶K(20mg/ml)100mg蛋白酶K加5ml 灭菌dd H2O,混匀后,在冰上静止3min左右,分装到灭菌后的EP 管中,每管200 ul到500 ul为宜,存于-20℃保存备用。
9.50×TAE(电泳缓冲储备液)(pH=8.5)在400ml dd H2O中加入121g tris 和18.6g Na2·EDTA·2H2O,充分搅拌混匀,再加入28.55ml 醋酸,充分搅拌,待无沉淀后dd H2O定容至500ml,常温保存备用。
10.1×TAE(电泳缓冲工作液)用量筒量取100ml 50×TAE储备液,倒入5L塑料桶中,加dd H2O至5L刻度线即可。
主要成分是:NaCl,Tris-HCl(PH=7.4),EDTA(PH=8),SDS。
NaCl,Tris-HCl主要是调节溶液的PH,维持一定的离子浓度,提供一个缓冲液的环境,防止核酸被破坏;EDTA主要是二价金属离子的螯合剂,使影响DNA的DNA酶中的钙离子,锰离子,镁离子等和EDTA结合,使酶失去活性,有利于提取完整DNA;SDS主要是和蛋白质结合,使其变形沉淀,从而利于DNA的提取,减少和清除带白质杂质;裂解细胞!配方:每升中加入EDTA 9.3g, SDS 5g, NaCl 14.6g, Tris 24.2g 相当于Tris 200mM PH=7.4 EDTA 25mM PH=8注意:Tris与EDTA 应当分别配好调PH值器材:灭菌的研磨棒,离心管,配好的DNA提取液,1000ul的移液枪,预冷的异丙醇,离心机,75%的乙醇,灭超水拟南芥DNA粗提步骤;1.选取两片适当大小的叶片放入1.5ml离心管(已标记)中,用液氮浸没1—2s,取出立刻磨碎至粉末状。
或不用液氮,研磨至匀浆状;2.加入DNA提取液800ul溶解,同时再次磨样,使之彻底为匀浆,摇匀;3.在12000rpm条件下,离心10min,取上清至另一新离心管(同标记)中,弃去沉淀,(切记:宁少勿沉淀);4.加入700ul异丙醇(-20℃预冷)至管中,摇晃混匀,然后放置-20℃下1-2h,或者4℃下过夜,析出DNA;5.在12000rpm下,离心10min,弃上清,留沉淀;6.向沉淀中加入700ul、75%的乙醇,进行洗涤,然后在12000rpm下,离心4min,重复三次;7.倒出乙醇,在超净工作台上吹干,加入50ul灭超水溶解,12000rpm下,离心4min,吸取上清液,转至另一新管中备用。
基因组DNA的提取一、从哺乳动物组织提取基因组DNA实验材料:液氮、消化缓冲液、PBS(冰冷)、25:24:1酚/氯仿/异戊醇、7.5M乙酸铵、无水乙醇及70%乙醇、0.1%SDS、RNA酶、TE缓冲液(pH8.0)、离心管、研钵、冷冻离心机。
实验步骤:1.取新鲜或冰冻动物组织块,剪成小块。
置于液氮中冻结。
2.将500mg的组织用预冷的研钵和研杵研碎,或用小锤子将其捣为细粉末,每100mg组织用1.2 mL消化缓冲液悬浮。
3.将6ml样品在盖紧的离心管中于50℃摇荡下温育12~18 h。
4.用6ml酚/氯仿/异戊醇抽提样品,1700g离心10 min。
如果样品溶解得不好,再加6ml不含蛋白酶K的消化缓冲液,并重复离心。
如果在界面上有一层厚的白色物质,重复有机抽提,将上层(水溶液)转移至一个新管中。
5.加入6ml 7.5M乙酸铵和24ml 100%乙醇,1700g离心2 min。
6.用70%乙醇洗涤,晾干,沉淀用TE缓冲液重新溶解,使终浓度在约1mg/mL左右。
7.加入0.1%的SDS和1pg/mL无DNA酶的RNA酶,37℃温育1h,以除去残留的RNA.重复步骤 4~5。
二、从植物组织提取基因组DNA实验材料:液氮/干冰、2-巯基乙醇(2-ME)、 CTAB抽提液、CTAB/NaCl溶液、24:1(v/v)氯仿/异戊醇、CTAB沉淀液、高盐TE缓冲液、80%乙醇、TE缓冲液、抗有机溶剂的试管和烧杯、研钵和研杵、粉碎器/匀浆器、捣碎机、恒温金属浴、冷冻离心机。
实验步骤:1.取1g的鲜叶组织,在3.2ml CTAB抽提液中加入0.8ml 2-巯基乙醇,使终浓度达2%(v/v)。
将此溶液及1ml CTAB/NaCl溶液加热至65℃。
2.用液氮(-196℃)或干冰(一78℃)冷却粉碎器/匀浆器,将植物组织粉碎成为细粉,然后将冷冻的组织转移到一个抗有机溶剂的试管或烧杯中。
3.往粉碎的组织中加入预热的2-ME/CTAB,混合使之充分湿润,65℃温育10~60min,不时混匀:4.用4ml的24:1氯仿/异戊醇抽提匀浆液,颠倒使充分混合,于4℃, 7500g离心5 min(对于小样品,在离心机上以10000 r/min离心),回收上(水)相。
CTAB配方及植物DNA提取方法主要试剂的配制参考(美)萨姆布鲁克(sambrook,j.)等.分子克隆实验指南(下册)配置如下[94]:(1)0.5mo1/ledta(ph8.0):称取edta-na218.61g,提80ml双蒸水,磁力搅拌器上频繁烘烤。
重新加入7ml10mo1/lnaoh调到ph8.0再用双蒸水定容至100ml,在1.03×105pa之下高压杀菌20min。
(2)5mol/lnacl溶液:称取nacl29.22g,溶解于90ml的双蒸水,加热到80℃溶解,冷却,再用双蒸水定容100ml,在高压灭菌20min。
(3)10mol/lnaoh溶液:称取40.00gnaoh溶80ml的双蒸水,烘烤,定容至100ml。
(4)1mol/ltris-hc1溶液(ph8.0):称取12.114gtris碱,溶80ml的双蒸水,重新加入浓hc14.2ml,调整phsuperficial8.0,搅拌定容至100ml,高压杀菌20min。
(5)10%ctab(m/v):称取ctab10.00g,熔化于80ml的双蒸水,冷却推动熔化,提双蒸水定容至100ml,室温留存。
(6)5mo1/lkac溶液(ph4.8和6.5):分别称取kac晶体49.07g,溶于80ml的双蒸水,再用冰乙酸调至ph4.8和6.5,加双蒸水定容到100ml,在1.03×105pa之下杀菌20min。
4℃留存。
(7)3mo1/lnaac3h2o溶液(ph5.2):称取naac晶体20.412g熔化于约30ml的双蒸水,用冰乙酸调到ph5.2,提双蒸水定容至50ml,高压杀菌20min。
4℃留存。
(8)提取缓冲液(0.4mol/l葡萄糖,3%pvp,2%β-巯基乙醇)250ml:称取葡萄糖19.817g、pvp7.50g,加水溶解并定容到250ml,在1.03×105pa下灭菌20min,β-巯基乙醇现用现加。
附录1:实验程序及所用溶液配方实验程序1:DNA小量提取法(SDS小量提取法)1. 取每个水稻样本新鲜叶片2cm左右于1.5 eppondorf管中,加入液氮磨碎。
2. 加入700ul已预热至650C 的SDS抽取液,迅速搅匀后置于650C水中,温浴30min。
3. 加入200ul 5MKAc混合液,颠倒充分混匀,冰浴30min后,40C 8000转离心5min,将上层液倒入另一新的1.5ml eppondorf管中。
4. 加入等体积的异丙醇,置于-200C 30min,40C 10000转离心4min。
5. 弃上清,加入70% 乙醇清洗,晾干。
6. 将风干的DNA溶于100ul TE溶液中,存于40C备用。
实验程序2:DNA大量提取法(SDS大量提取法)1.准备工作:将DNA提取液放于650C的水浴锅中预热,将异丙醇放于-200C冰箱中预冷,选好50 ml的离心管灭菌。
2.每个水稻样本新鲜叶片取1-3g,剪碎,放入研钵,加入液氮磨碎。
3.将研磨好的叶片转于50ml的离心管中,加入20ml已预热至650C 的SDS抽取液,迅速搅匀后置于650C水中,温浴20min,以使反应充分完全。
4.取出离心管,加入5 ml 5MKAc混合液,颠倒充分混匀,冰浴20min,冰浴期间要将离心管上下颠倒数次。
5.加入15ml氯仿,嫩叶片会起泡沫,老叶片则变成墨绿或变黑。
室温下以3000(10000 rmp的速度离心 3min),将上层液倒入另一新的50 ml离心管中。
6.加入等体积的异丙醇,轻轻摇晃直至形成DNA絮状沉淀。
7.待DNA结块,用玻棒挑出DNA,用75%乙醇清洗两次,将乙醇到掉,晾干。
8. 将风干的DNA溶于500ul TE溶液中,存于40C备用。
SDS抽提液1M Tris-Hcl 100ml Ph 8.00.5MEDTA 100ml pH 8.05MNaCl 100ml10%SDS (十二烷基硫酸钠)) 125ml加蒸馏水定容至1000ml。
DNA提取实验方案
材料与试剂:
1.细胞样本(如血液、组织等)
2.细胞裂解缓冲液(含有蛋白酶K)
3.蛋白酶K
4.乙醇
5.蛋白质沉淀液
6.正丁醇
7.氯仿
8.等离子水
9.TE缓冲液
10.离心管
11.磁珠
12.磁珠悬浊液
13.热拌器
14.离心机
实验步骤:
1.细胞破裂:将细胞样本加入细胞裂解缓冲液中,加入适量蛋白酶K,放入热拌器中破裂细胞,使DNA溶解在缓冲液中。
2.蛋白质沉淀:加入等体积的蛋白质沉淀液,轻轻混匀,离心使蛋白
质沉淀。
3.DNA沉淀:将上清液转移至新的离心管中,加入适量的乙醇,轻轻
混匀,使DNA沉淀。
4.DNA纯化:将DNA沉淀用等离子水悬浊,加入等体积的正丁醇和氯仿,混匀后离心,取上清液,加入等量的等离子水和TE缓冲液。
5.纯化DNA:将上清液转移至带有磁珠的离心管中,加入磁珠悬浊液,混匀后在离心机中进行离心,使DNA和磁珠结合。
6.洗涤DNA:将离心管中的上清液丢弃,加入70%乙醇洗涤DNA,多
次洗涤后去除乙醇,干燥磁珠。
7.溶解DNA:最后用等离子水或TE缓冲液溶解DNA,即可用于后续的
实验。
通过上述步骤,可以从细胞样本中提取出纯净的DNA,用于后续的分
子生物学实验。
DNA提取是一项基础而重要的技术,在分子生物学和遗传
学研究中具有广泛的应用价值。
希望以上方案可以帮助您顺利进行DNA提
取实验。
主要成分是:NaCl,Tris-HCl(PH=7.4),EDTA(PH=8),SDS。
NaCl,Tris-HCl主要是调节溶液的PH,维持一定的离子浓度,提供一个缓冲液的环境,防止核酸被破坏;EDTA主要是二价金属离子的螯合剂,使影响DNA的DNA酶中的钙离子,锰离子,镁离子等和EDTA结合,使酶失去活性,有利于提取完整DNA;SDS主要是和蛋白质结合,使其变形沉淀,从而利于DNA的提取,减少和清除带白质杂质;裂解细胞!配方:每升中加入EDTA 9.3g, SDS 5g, NaCl 14.6g, Tris 24.2g 相当于Tris 200mM PH=7.4 EDTA 25mM PH=8注意:Tris与EDTA 应当分别配好调PH值器材:灭菌的研磨棒,离心管,配好的DNA提取液,1000ul的移液枪,预冷的异丙醇,离心机,75%的乙醇,灭超水拟南芥DNA粗提步骤;1.选取两片适当大小的叶片放入1.5ml离心管(已标记)中,用液氮浸没1—2s,取出立刻磨碎至粉末状。
或不用液氮,研磨至匀浆状;2.加入DNA提取液800ul溶解,同时再次磨样,使之彻底为匀浆,摇匀;3.在12000rpm条件下,离心10min,取上清至另一新离心管(同标记)中,弃去沉淀,(切记:宁少勿沉淀);4.加入700ul异丙醇(-20℃预冷)至管中,摇晃混匀,然后放置-20℃下1-2h,或者4℃下过夜,析出DNA;5.在12000rpm下,离心10min,弃上清,留沉淀;6.向沉淀中加入700ul、75%的乙醇,进行洗涤,然后在12000rpm下,离心4min,重复三次;7.倒出乙醇,在超净工作台上吹干,加入50ul灭超水溶解,12000rpm下,离心4min,吸取上清液,转至另一新管中备用。
DNA提取实验步骤:(1)取1g左右幼叶,放入研磨小管然后放入钢珠,研磨前放入盛有液氮的保温桶冷冻一段时间,然后利用研磨机器研磨成粉末,-70℃冰柜保存;(2)65℃水浴锅中预热裂解缓冲液(加入Vitc和β-巯基乙醇);(3)从-70℃冰柜拿出带有粉末的离心管,将800ul体积的裂解液(水浴锅中预热)倒入管中并摇至均匀,然后放于65℃水浴槽中水浴35min,每隔10min摇一次;(4)向管中加入800ul氯仿-异戊醇(24:1)抽提液,并摇至均匀。
放入离心机内,4℃以12000r/s离心20min;(5)吸取上清置于另一个1.5ml离心管中,重复步骤4一次(再次抽提一次);(6)吸取上清置于新的离心管中,加入500ul的冰冻异丙醇,并缓慢摇至絮状DNA沉淀析出,于-20℃中放置15min;(7)钩出沉淀,置于1.5离心管中,用70%酒精洗至酒精无色,利用无水乙醇再次漂洗一遍,弃去无水乙醇,将装有DNA的离心管放于真空抽干机内风干45minDNA提取各溶液配方:(1)500ml 1M Tris母液(PH8.0)Tris碱60.55g 浓HCl 21ml 超纯水400ml因Tris溶液的PH值受温度影响较大,绪冷却至室温后用浓HCl调节PH至8.0,然后用超纯水定溶至500ml,灭菌后使用(2)500ml 0.5M EDTA母液(PH8.0)Na2EDTA 93.05g NaOH 10g 超纯水400ml边搅拌边加入NaOH颗粒,但PH接近8.0时,溶液由浑浊变清澈,最终调节至PH8.0,用超纯水定溶至500ml,灭菌后使用(3)500ml 1x TE (PH8.0)1M Tris-HCl 5ml 0.5M EDTA 1ml 超纯水480ml加超纯水定溶至500ml,灭菌后使用。
棉花DNA提取-裂解缓冲液配方:试剂终浓度每升用量1M Tris母液0.1M 100ml0.5M EDTA 0.025M 32mlNaCl 1.5M 87.6gCTAB 2% 20gPVP 40 2% 20gVITC(使用前加)0.3% 3gΒ-巯基乙醇(使用前加)3% 30mlPCR反应体系----10ulddH20 6.2ul Taq酶0.1ul模板DNA 1.2ul Buffer 1.0uldNTP 0.5ul 正向引物0.5ul反向引物0.5ul。
试验步骤:1、贴壁细胞用胰酶消化,离心收集。
2、细胞重悬于冰冷的PBS漂洗一次,离心收集。
试验步骤2再重新作一边。
3、加入5mlDNA提取缓冲液,(10mmol/LTris-cl,0.1mol/LEDTA,o.5%SDS),混匀。
4、加入25ul蛋白酶K,使终浓度达到100ug/ml,混匀,50℃水浴3h,5、用等体积的酚抽提一次,2500rpm离心收集水相,用等体积的(酚,氯仿,异戊醇)混合物抽提一次,2500r/min离心收集水相6、用等体积的氯仿,异戊醇抽提一次。
加入等体积的5mol/L的LiCL,混匀,冰浴,10min.。
7、2500rpm离心10min.转上清于一离心管中。
加入等体积的异丙醇。
室温10min。
2500rpm,离心10min。
弃上清。
8、加入0.1倍体积3mol/L乙酸钠(PH5.2)与2倍体积-20℃预冷无水乙醇。
-20℃20min。
9、12000r/min,室温离心5min。
弃上清。
将DNA溶于适量TE中。
外周血DNA提取技术分离外周血白细胞提取方法:试验步骤:1、取人肘静脉血5ml,EDTA抗凝,2500rpm离心10min。
2、小心吸取上层血浆,分装到3个0.5ml离心管中。
3、在血细胞中加入3倍体积的溶血液,摇匀,冰浴15min。
4、2500rpm离心10min,弃上清。
5、加入10ml溶血液,摇匀,冰浴15min。
6、3000rpm离心10min,弃上清。
7、倒置离心管,去掉残液。
8、得白细胞,-80?C冻存。
试验要求:血至分离白细胞之间隔时间在室温下放置不超过2h,4℃放置不超过5h,以防白细胞自溶。
氯仿法抽提外周血白细胞基因组DNA:试验试剂:Ligsisbuffer:133mMNH4ClNHCl7.12g0.9mMNH4HCO3NH4HCO30.071g0.1mMEDTA0.5mMEDTA0.2ml;最后加灭菌去离子水至1000ml,高压灭菌。
ACD抗凝剂:柠檬酸1.68g柠檬酸钠4.62g葡萄糖 5.15g;最后加灭菌去离子水至350ml,高压灭菌。
裂解液配方:100mmol Tris-Hcl(PH8.0);
25mmol EDTA(PH 8.0);
500mmol NaCl;
1%SDS
母液配制:
1.500mmol Tris-Hcl(PH8.0)
称取15.1425g Tris,加入150ml 蒸馏水,加入Hcl调PH至8.0,定容至250ml。
2.100mmol EDTA或EDTA-Na2
称取7.3062g EDTA或8.455g EDTA-Na2,加入200ml 蒸馏水,调PH至8.0,定容至250ml。
3.5mol NaCl
称取29.22g NaCl,加入90ml 蒸馏水,定容至100ml。
4.10% SDS
称取10gSDS,加入100ml蒸馏水。
蛋白酶K配置:10mg/ml蛋白酶K溶液。
称取10mg蛋白酶K粉末,加入1ml蒸馏水溶解。
-20度保存。
配制1000ml裂解液:加入溶液1体积为200ml,加入溶液2体积为250ml,加入溶液3体积为100ml,加入溶液4为100ml。
配制500ml裂解液则相应减半。
步骤:
1.在1.5ml离心管中加入0.2ml(200ul)裂解液,用配套的研磨棒杵成浆状,加入2ul浓度为10mg/ml的蛋白酶K至终浓度100ug/ml,45度水浴2-4h。
2.加入RNaseA至终浓度20ug/ml,水浴30min。
3.加入0.7ml苯酚:氯仿:异戊醇(25:24:1),轻微颠倒混匀,14000rpm离心5min。
4.中号枪头切去头部,抽取上清,重复抽提一次。
5.取上清,加入等体积氯仿:异戊醇(24:1),14000rpm离心5min。
6.取上清,加入2-2.5倍体积的无水乙醇,颠倒混匀,材料用量较多的昆虫可看到DNA沉淀,材料用量较少或酒精长时间浸泡着的标本可在-70度放置30min,14000rpm离心5min。
7.75%乙醇漂洗沉淀两次,无水乙醇漂洗,室温干燥。
8.根据沉淀量,加入30-50ulddH2O。
方法二:
1.在1.5ml离心管中加入0.1ml(100ul)裂解液,用配套的研磨棒杵成浆状,用400ul裂解液冲洗研磨棒,加入5ul浓度为10mg/ml的蛋白酶K至终浓度100ug/ml,45度水浴1-2h。
2.加入RNaseA至终浓度20ug/ml,水浴15min。
3.加入等体积苯酚:氯仿:异戊醇(25:24:1),轻微颠倒混匀,14000rpm离心5min。
4.取上清,加入等体积氯仿:异戊醇(24:1),14000rpm离心5min。
5.取上清,加入2-2.5倍体积的无水乙醇,14000rpm离心10min。
6.75%乙醇漂洗沉淀两次,无水乙醇漂洗,室温干燥。
7根据沉淀量,加入30-50ulddH2O。