whonet5.6使用说明
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WHONET使用手册全球抗微生物药物耐药性监测系统John Stelling布莱根妇女医院世卫组织抗微生物药物耐药性监测合作中心马萨诸塞州波士顿2016年11月缩略语AMR 抗微生物药物耐药性CLSI 临床和实验室标准协会EUCAST 欧洲药敏试验委员会GLASS 全球抗微生物药物耐药性监测系统ID 识别码MIC 最小抑菌浓度WHO 世界卫生组织目录1.序言 (1)2.安装WHONET (2)3.实验室配置 (3)3.1创建新的实验室配置 (3)3.2复制现有实验室配置 (6)3.3修改实验室配置 (7)4. 用于全球耐药监测系统的WHONET数据输入 (8)4.1 通用 (8)4.2 全球耐药监测系统最低配置下各数据域填写说明 (9)4.3查看数据库 (13)5. 国家层面的数据收集 (13)6. 将WHONET 文件导出为全球耐药监测系统交换格式 (14)6.1 合并WHONET文件 (14)6.2汇总WHONET文件 (15)6.3WHONET在全球耐药监测系统交换格式中排除“重复分离株”的规则 (18)7. 全球耐药监测系统数据检查和反馈报告 (19)8. 将全球耐药监测系统格式的数据文件上传到全球耐药监测系统信息技术平台 (21)附件1 – 修改实验室配置 (22)1.一般实验室信息 (22)2.抗生素 (23)3.抗生素断点 (24)4.地点 (27)5.修改数据域配置 (27)附件2 – BacLink简介 (28)1.序言本手册主要为各国全球抗微生物药物耐药性监测系统(GLASS,以下简称“全球耐药监测系统”)数据管理员撰写,也可供为参加该系统的监测点服务的实验室数据管理员使用。
手册描述在为全球耐药监测系统处理数据时如何使用WHONET软件。
WHONET支持将数据输出为全球耐药监测系统交换格式,以便上传到该系统的信息技术平台。
本手册并非描述WHONET全部功能和特征的完整使用手册。
全国细菌耐药监测网信息系统数据上报标准V6.02017年1月1日修订全国细菌耐药监测网通过“全国细菌耐药监测网信息系统” 收集所有成员单位的耐药监测数据,系统具备完善的数据筛选和容错处理功能,支持上传的数据文件格式为WHONET 5.6软件所导出的通用数据文件格式,文件后缀无要求。
除此以外,系统还支持ExceI表格,包括Excel 2003 以下版本生成的(*xls)以及Excel 20072010所生成的*xlsx。
一、科室代码设置监测网成员单位首次登录时须先使用【本院科室管理】功能,登记注册医院临床科室并将其映射至系统所要求的标准科室分类上,该映射关系可随着本院的科室变化随时进行调整(增加、删除、修改),调整之后不影响曾经上传过的文件,仅影响在调整时间点后上传的数据。
而各医院临床科室对应上报数据文件中的WARD字段保存的值,可以为本院临床科室名称或本院临床科室代码,取决于各院在WHONET中是如何管理的,或者是如何从LIS系统导出的。
完成医院科室设置后,在上传本院数据时,系统会自动将已经设置好的本院科室信息与系统标准的科室分类进行映射,并将映射结果直接写入DEPARTMENT?段,不影响WARD 字段中上传的原始值,DEPARTMEN字段实际上可以不填写,甚至是整列都不存在。
建议在上报的数据文件中直接将DEPARTMEN■字段设置成系统内置的标准科室代码(3位字符)。
二、数据文件各字段要求1、来源ORIGIN非必填字段,最长1个字符。
若填写,则其必须为“ h”,若不填写,数据上传后系统会自动补充,若填写值不为“h”,系统将自动替换成“h”。
2、国家COUNTRY_A非必填字段,最长3个字符。
若填写,则其必须为“ CHN,若未填写,数据上传后系统会自动补充。
3、医院INSTITUT非必填字段,为国家卫生计生委统一分配的标准代码,标准6 字符,前两位为国家标准省级代码(如北京为11,福建为35 等),后4位为各省编码(从0001 开始),例如福建省立医院为350001,若未填写,数据上传后系统自动补充已注册的医院标准代码,若填写则必须与本院的代码一致,否则系统会自动替换为正确代码。
ToWhonet使用说明1:设置检验之星数据库连接2:Whonet设置whonet.ini:Whont文件夹下的ini文件数据文件路径:该软件生成的数据文件存放位置,通常应该设置为Whonet目录的Data目录实验室代号:与whont中的实验室代号保持一致,数据文件的后缀缺省为实验室代号实验室配置文件:输入国家代号和实验室代号后会自动生成实验室配置文件whonet中设置的很多信息都保存在实验室配置文件中实验室配置文件必须正确,可以手工调整文件名,路径与whonet.ini路进相同3:字段对应左边是用户在whonet中设置的字段,用户可以在whonet中进行设置右边是检验之星提供的字段左右箭头按钮分别代表:建立对应关系和取消对应关系如果要增加或修改检验之星提供的字段:请调整SysSet目录下的SQL.txt 和FieldsSet.ini下的[Ptech]。
FieldsSet.ini下的[Ptech],左边为字段名,必须正确,右边为说明,可以自己定义。
注:如果需要调整,调整前请先备份。
4:字段与抗生素对应(β-内酰胺酶)(有可能不需要)“对应关系”-“字段与抗生素对应”例如:有的检验科的细菌属性结果(β-内酰胺酶),在检验系统中保存为抗生素结果。
已对应的颜色为蓝色,未对应的为白色,与抗生素对应的为紫色5:细菌选择建立检验之星与Whonet中的细菌的对应关系,由于细菌数量较大,界面出现比较缓慢。
筛选过虑上方的编辑框:用于筛选过虑左右箭头按钮分别代表:建立对应关系和取消对应关系“英文”按钮:从Whonet的细菌中(W名称)查找和筛选与检验之星中(英文名称)匹配的细菌“简称”按钮:从Whonet的细菌中(W代码)查找和筛选与检验之星中(简称)匹配的细菌“快捷”按钮:从Whonet的细菌中(W代码)查找和筛选与检验之星中(快捷码)匹配的细菌“全部对比”选择框:当选中时,程序会将检验之星的所有细菌全部对应一遍,如果很相似,将自动建立对应关系;不选中,则只对应当前选中的细菌点击列表上方Title,将按点击的字段排序。