细胞周期分析重要知识
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细胞周期分析偏高注意事项细胞周期分析是用来研究细胞生长和分裂过程的一种实验技术,通过测量细胞在不同细胞周期阶段的比例和持续时间,可以了解细胞周期的调控机制以及细胞增殖的异常情况。
在进行细胞周期分析时,需要注意以下几个方面:1. 细胞处理:在实验开始之前,需要将细胞制备至适宜的生长状态。
通常需要使用细胞培养基培养细胞,不同类型的细胞培养需要根据具体实验要求采取不同的操作方法。
同时,需要注意细胞的数量和密度,以确保细胞可以正常生长和分裂。
2. 细胞收集:细胞周期分析通常使用流式细胞术进行,因此需要先将细胞从培养皿或培养板中收集出来。
收集细胞时,要注意不要使细胞遭受太大的损伤,避免对细胞周期的影响。
可以使用胰酶等酶来进行细胞解聚,也可以使用细胞刮刀轻轻刮取细胞。
收集的细胞应尽可能集中和纯净,以获得准确的结果。
3. 样本处理:在细胞收集完成后,需要对样本进行处理。
通常需要将细胞用PBS 缓冲液洗涤一遍,去除残余的培养基和细胞碎片。
然后,可以使用乙醇等溶剂将细胞固定,以保持其形态结构。
固定时间和温度需要根据不同类型的细胞进行调整。
4. 细胞染色:为了鉴定细胞的不同细胞周期阶段,通常需要对细胞进行染色。
常用的染色剂有荧光素-氨基酸,乙蓝溴化物等。
染色剂浓度和染色时间需要进行优化,以充分显示细胞的染色状态。
5. 流式细胞仪分析:细胞染色完成后,可以通过流式细胞仪对细胞进行分析。
在进行分析之前,需要对流式细胞仪进行校准,以确保测量的准确性。
在设置参数时,需要根据细胞样本的染色状态进行调整,以使流式细胞仪可以准确识别和区分不同细胞周期阶段的细胞。
6. 数据分析:流式细胞仪会生成一系列的图表和数据,需要将这些数据进行统计和分析。
通常,可以使用软件进行细胞周期数据的分析,比如ModFit LT和FlowJo等。
数据分析的目的是了解细胞的增殖速率、细胞周期分布以及细胞周期的调控机制。
在进行细胞周期分析时,还需要注意以下几个技术细节:1. 细胞样本的保存:实验完成后,需要妥善保存细胞样本,以备后续的实验分析。
细胞周期调控中的关键基因分析细胞的生长和分裂是由复杂的基因调控过程控制的。
在细胞分裂的过程中,细胞必须经过一系列的周期来确保细胞分裂的顺利进行。
这个周期被称为细胞周期,而完成这个周期的过程需要一系列关键基因的调控。
细胞周期以G1期为起点,从G1转化到S期,细胞会进入DNA的复制状态。
随后,细胞进入G2期,最后进入M期。
在M期,细胞会经历有丝分裂或减数分裂,进一步分裂成两个或四个新的细胞。
这个过程由一系列重要的基因调控,其中包括一些促分裂基因和一些抑制分裂基因。
一些调控细胞周期的关键基因包括Cdc2、CyclinB等。
Cdc2是一个双组蛋白激酶,其主要功能是促进细胞进入有丝分裂。
与Cdc2密切相关的是CyclinB,该蛋白质在细胞周期过程中起着关键作用。
CyclinB是Cdc2激酶的“信使”,主要功能是调控Cdc2的活性和稳定性。
Cdc2和CyclinB是细胞周期的早期启动因子,在细胞周期的开始阶段将这两种分子的浓度提高,能够促进细胞进入有丝分裂。
除了Cdc2和CyclinB之外,还有其他一些基因在细胞分裂中也发挥着重要的作用。
例如,p53基因在细胞DNA受损时起着关键作用。
p53会使细胞停止分裂,以修复受损的DNA或引发细胞凋亡。
由于p53基因的质量与癌症的发生密切相关,因此这个基因也是研究癌症治疗的热点。
另一个对细胞周期有重要影响的是Anaphase-promoting complex或Cyclosome(APP/Cyclosome)。
APP/Cyclosome负责将CyclinB降解,使得细胞完成有丝分裂的后期阶段。
此外,还有一些其他的基因涉及到细胞周期的调控。
例如,RB基因能够抑制细胞进入S期。
缺陷的RB基因与癌症的发生有关。
另一个基因是Cdc25,主要功能是调节Cdc2的活性。
当Cdc25被抑制时,Cdc2活性下降,细胞周期扰动,细胞分裂反应被阻止。
这再次表明,许多基因在细胞周期中起着不可或缺的作用。
细胞周期运动学模型的构建与分析细胞是生命的基本单位,它们具有复杂的生物学特征和多变的运动方式。
了解细胞生命周期的运动学模型至关重要,因为这可以帮助我们更好地理解和预测细胞的功能,例如细胞分裂和细胞死亡。
在本文中,我将讨论细胞周期运动学模型的构建和分析的方法和应用。
1. 细胞周期概述细胞周期是细胞从分裂前一次开始到分裂完成的整个过程。
该过程可以分为四个不同阶段:G1期,S期,G2期和M期。
在G1期,细胞增长并制备复制DNA所需的物质。
在S期,细胞合成复制DNA所需的材料,并进一步制备细胞分裂所需的物质。
在G2期,细胞继续增长并进一步制备分裂所需的物质,例如线粒体和微管网络。
在M期,细胞进行有丝分裂或减数分裂,并分裂成两个或四个新的细胞。
2. 细胞周期运动学模型细胞周期的运动学模型描述了细胞从一个状态到另一个状态之间的转变。
该模型可以通过测量不同阶段的细胞数量来建立。
我们可以使用细胞倍增时间(Td)来衡量进入下一个细胞周期阶段所需的时间。
Td是指需要让细胞数量翻倍的时间。
因此,对于细胞数量为N的群体,Td = t log₂(N/No),其中t是时间,No是起始细胞数量。
除了细胞倍增时间,其他重要的生长参数还包括细胞周期长度(Tc)和细胞增殖率(μ)。
Tc是细胞周期的持续时间,μ是细胞增殖的速率。
这些参数可以通过实验来测量,并被纳入到细胞周期运动学模型中。
3. 细胞运动学模型的应用细胞周期运动学模型可以用于细胞生物学和医学中的许多应用。
例如,它可以用于研究癌症细胞的生长动力学,并预测肿瘤的生长速率和治疗方案的效果。
另外,该模型也可以被用于研究神经发育、免疫系统和干细胞等领域。
此外,细胞周期运动学模型还可以用于开发治疗癌症的新方法。
通过测量肿瘤细胞的Td和Tc,我们可以预测哪些治疗方案将对患者最有效。
例如,化疗药物的作用是通过干扰DNA合成和细胞分裂来杀死癌细胞。
由于肿瘤细胞的Td比正常细胞短,这些药物对肿瘤细胞更有效。
《细胞周期》★细胞的最终命运:细胞分裂及生长(相关物质准备)→细胞增殖(受到严密的调控机制所监控)→细胞死亡★标准的细胞周期:(从G1期开始,历经S、G2,到M期结束)一.细胞周期的基本概念:1.细胞周期:细胞周期是细胞增殖周期的简称,指细胞从分裂结束后开始生长,到再次分裂终了所经历的全过程。
2.细胞周期时间(Tc):细胞周期时间因细胞类型、状态和环境而异,变异范围大,从0h~数年都可能。
3.细胞的增殖特性(机体细胞的状态):1)增殖细胞(周期性细胞):能够增殖,不断进入周期完成分裂。
2)暂不增殖细胞(休眠细胞,G0细胞):长期停留在G1晚期(G0期)而不越过限制点,未丧失分裂能力,在适当条件下可恢复到增殖状态。
3)永不增殖细胞(终末分化细胞):始终停留在G1期,失去增殖能力直到衰老死亡。
二.细胞周期的研究方法:★细胞周期模型细胞周期研究中经常使用一些典型的物种和细胞系统,最常用的模型包括酵母、爪蟾胚胎细胞和哺乳动物体外培养细胞。
★细胞周期同步化——由于实验常常需要设法获得时相均一的细胞群,使样品中的细胞都处于大致相同的细胞周期阶段,所以常需要使细胞周期同步化。
同步化的策略:①诱导同步化;②选择同步化同步化常用方法:①细胞分裂收获法②代谢抑制法(加入过量胸苷后清洗)③低温培养法★3H-TdR(氚标记胸苷)有丝分裂标记法(测定细胞周期的时间)——应用3H-TdR短期饲养细胞,数分钟至半小时后,将3H-TdR洗脱,置换新鲜培养液并继续培养。
随后,每隔半小时或1小时定期取样,作放射自显影观察分析,从而确定细胞周期各个时相的长短。
①通过在光镜下定期计算细胞的数目,并记录全部细胞数目增加一倍所需时间,从而估算出细胞周期的总时间②S、M期的时间可以通过添加氚标记胸苷到培养液中进行测定。
★流式细胞技术三.细胞周期检验点(check point):——检查点是指检查和抑制细胞周期进程的一些特定信号通路,可以检查细胞周期事件的完成情况,控制细胞周期的进度,确保基因组复制和染色体分离的时空独立性,并使细胞能够适应环境变化和机体发育的各种需要。
细胞周期调控细胞周期是指生物细胞从一个时期到下一个时期的连续过程,包括细胞生长、DNA复制、细胞分裂等一系列事件。
为了维持细胞的正常功能和正常生长发育,细胞周期需要得到精细的调控。
本文将分析细胞周期调控的机制和重要性。
I. 细胞周期的阶段细胞周期通常分为四个阶段:1. G1期(Gap1期):细胞开始增长,准备进入DNA复制阶段。
2. S期(Synthesis期):细胞进行DNA复制,复制原有的染色体。
3. G2期(Gap2期):细胞再次增长,准备进入细胞分裂阶段。
4. M期(Mitosis期):细胞分裂为两个子细胞,每个子细胞都包含完整的染色体。
II. 细胞周期调控的重要性细胞周期调控对细胞的生长和分裂具有至关重要的作用,不仅关系到单个细胞的正常运作,也关系到整个生物体的发育和生命的延续。
细胞周期调控的失常可能导致多种疾病和异常,如癌症等。
III. 细胞周期调控的分子机制细胞周期调控主要通过细胞周期蛋白激酶(cyclin-dependent kinases,CDKs)和细胞周期蛋白(cyclins)的相互作用来实现。
在细胞周期的不同阶段,特定的细胞周期蛋白会与不同的细胞周期蛋白激酶结合,从而调节细胞周期的进程。
IV. 细胞周期调控的关键调控点细胞周期调控有几个重要的调控点,其中包括:1. G1/S检查点:用于保证细胞在G1期完成所需成长后才能进入S 期进行DNA复制。
2. G2/M检查点:确保细胞在G2期完成DNA复制和准备工作后,才能进入M期进行细胞分裂。
3. M检查点:监测细胞分裂过程中的染色体连接情况,确保子细胞获得完整的基因组。
V. 细胞周期调控的调控因子细胞周期调控还受到许多其他因素的调控,如:1. 细胞周期抑制因子:抑制细胞周期蛋白激酶的活性,控制细胞周期的进程。
2. 细胞周期促进因子:促进细胞周期蛋白激酶的活性,推动细胞周期向前进展。
VI. 细胞周期调控与疾病细胞周期调控的失调与多种疾病相关,例如:1. 癌症:细胞周期的异常调控可能导致癌细胞的无限增殖和进一步的恶化。
《细胞周期》★细胞的最终命运:细胞分裂及生长(相关物质准备)→细胞增殖(受到严密的调控机制所监控)→细胞死亡★标准的细胞周期:(从G1期开始,历经S、G2,到M期结束)一.细胞周期的基本概念:1.细胞周期:细胞周期是细胞增殖周期的简称,指细胞从分裂结束后开始生长,到再次分裂终了所经历的全过程。
2.细胞周期时间(Tc):细胞周期时间因细胞类型、状态和环境而异,变异范围大,从0h~数年都可能。
3.细胞的增殖特性(机体细胞的状态):1)增殖细胞(周期性细胞):能够增殖,不断进入周期完成分裂。
2)暂不增殖细胞(休眠细胞,G0细胞):长期停留在G1晚期( G0期)而不越过限制点,未丧失分裂能力,在适当条件下可恢复到增殖状态。
3)永不增殖细胞(终末分化细胞):始终停留在G1期,失去增殖能力直到衰老死亡。
二.细胞周期的研究方法:★细胞周期模型细胞周期研究中经常使用一些典型的物种和细胞系统,最常用的模型包括酵母、爪蟾胚胎细胞和哺乳动物体外培养细胞。
★细胞周期同步化——由于实验常常需要设法获得时相均一的细胞群,使样品中的细胞都处于大致相同的细胞周期阶段,所以常需要使细胞周期同步化。
同步化的策略:①诱导同步化;②选择同步化同步化常用方法:①细胞分裂收获法②代谢抑制法(加入过量胸苷后清洗)③低温培养法★3H-TdR(氚标记胸苷)有丝分裂标记法(测定细胞周期的时间)——应用3H-TdR短期饲养细胞,数分钟至半小时后,将3H-TdR洗脱,置换新鲜培养液并继续培养。
随后,每隔半小时或1小时定期取样,作放射自显影观察分析,从而确定细胞周期各个时相的长短。
①通过在光镜下定期计算细胞的数目,并记录全部细胞数目增加一倍所需时间,从而估算出细胞周期的总时间②S、M期的时间可以通过添加氚标记胸苷到培养液中进行测定。
★流式细胞技术三.细胞周期检验点(check point):——检查点是指检查和抑制细胞周期进程的一些特定信号通路,可以检查细胞周期事件的完成情况,控制细胞周期的进度,确保基因组复制和染色体分离的时空独立性,并使细胞能够适应环境变化和机体发育的各种需要。
细胞周期生物学基础细胞的生成依赖于细胞的分裂而产生两个子代细胞的过程。
在分裂过程最需要复制并传递给子代细胞的是细胞核,因为它包含了细胞的遗传信息载体-DNA。
在绝大多数情况下,一个生物体的每个细胞都含有相等的DNA物质和相同成份的染色体。
因此,细胞在分裂前必须复制DNA这样它的子代细胞就能够拥有与父代相同的DNA含量。
细胞由DNA含量增加至分裂,再由它的子代继续复制并分裂,这个过程称之为细胞周期。
在细胞周期中最具特征性的阶段是在分裂前的DNA含量增加并达到2倍量的时候,并在此时细胞开始分裂其自身-有丝分裂期。
细胞周期中这两个循环步骤通常以一字母来表示:S期(合成期)和M期(有丝分裂期)。
当细胞周期中的S期和M期被定义后,我们可观察到在有丝分裂完成后和DNA合成刚开始之时有短暂的停顿或间隙,同样的停顿或间隙存在于DNA合成期后和有丝分裂开始之时。
这两个间隙我们将之命名为G1和G2期。
这样整个细胞周期可划分为G1 →S →G2 →M →G1,如下图所示:图1显示了细胞周期中个环节在流式细胞仪上分析时的图谱特征当细胞没有进入分裂过程时(我们机体中的绝大部分细胞),它们处于细胞周期的G1期的位置上。
因此G1细胞在数量上绝对是居各期细胞之首并在流式图谱上形成最高的信号峰。
在G1期细胞中有一群细胞特别安静并且没有进入细胞循环的任何生物学特征,我们称这些细胞为G0期细胞。
一些发生在G1和G2期细胞内的生物过程现还不完全明了。
处于G1期的细胞已开始为分裂前的DNA的复制和细胞成长准备许多RNA和蛋白分子。
处于G2期的细胞则会修复在DNA复制过程发生的错误并识别出在M期时将DNA平均等分的切割位置。
细胞循环中这些阶段的长度因细胞种类的不同而不同。
典型细胞循环中各期的发展时间为:G1期12小时,S期6小时,G2期4小时及M期0.5小时。
分析和流式细胞术细胞周期分析流式细胞最初的应用之一便是检测细胞的DNA含量,它可快速将细胞循环中的其它阶段与有丝分裂期区别开来。
细胞周期的调控机制及其功能分析细胞周期是指细胞从一个新生命形态到另一个新生命形态的过程。
这个过程是由一系列的生命事件组成的,包括细胞分裂、DNA合成、细胞增殖等。
细胞周期的调控机制是一个十分复杂的过程,其中包括多个分子机制的共同作用,使得生物体的细胞在遵循正常生命规律的前提下能够完成分裂增殖等生命活动。
本文主要从细胞周期调控机制入手,探讨其功能和生物学意义。
一、细胞周期的调控机制细胞周期可以分为四个不同的阶段,包括G1期、S期、G2期和M期。
这四个阶段的特点不同,相关的基因和蛋白质也是千差万别。
在上文中提到了细胞周期的调控机制是多元化的,其中最为关键的机制是蛋白激酶的活化。
蛋白激酶可以被活化并通过调整不同的酶的活性、转录因子的活性、细胞周期关键基因和原始盘相关的基因的表达来控制细胞周期。
当这些基因和蛋白质在正常状态下处于活跃状态时,细胞周期处于正常的调控状态。
但当这些调控基因发生突变、处于高度损伤的状态、或者受到外界刺激时,细胞周期便会因为不同的输出信号的错误调节而失去正常的调控。
除此之外,细胞周期的调控机制还包括网络反馈环、Cyclin与CDK参与的信号调节系统、负面调节及DNA损伤检查等。
二、细胞周期调节的功能细胞周期调节机制的功能在生命的各个方面都很重要。
涉及了DNA复制、细胞增殖、生殖、修复和生长等过程。
通过细胞周期的调控,生物体的身体和组织可以正常 function。
细胞周期的调控机制可以防止细胞在不当情况下受到损伤。
例如,在细胞DNA受到损伤的情况下,细胞可以暂停周期并检查损伤的部分,以确保正确的修复并防止错误的细胞分裂的发生。
这个周期暂停及修复被称为S和G2/M的核上停顿,它们都是在DNA损伤检查点所发生的。
在细胞周期的各个阶段,能够利用调节机制来确保细胞检查周期,并保护对DNA 的配对是否正确,或检查细胞仲值是否满足规定。
这些检查是非常重要的,以确保细胞在一定的培养条件下正常地增殖并发生分裂。
细胞周期各期的特点与调控例题和知识点总结细胞周期是指细胞从一次分裂完成开始到下一次分裂结束所经历的全过程,通常分为间期和分裂期两个阶段。
间期又包括G1 期(Gap1,DNA 合成前期)、S 期(Synthesis,DNA 合成期)和 G2 期(Gap2,DNA 合成后期),分裂期则包括前期、中期、后期和末期。
下面我们来详细了解一下细胞周期各期的特点以及相关的调控机制,并通过一些例题来加深理解。
一、G1 期G1 期是细胞周期的第一个阶段,也是细胞生长和为 DNA 合成做准备的时期。
特点:1、细胞体积增大,各种细胞器、RNA 和蛋白质等合成增加,为细胞进入 S 期积累物质基础。
2、存在一个关键的限制点(R 点),细胞需要通过一系列检查,决定是否进入 S 期。
调控:1、细胞周期蛋白(Cyclin)和细胞周期蛋白依赖性激酶(CDK)复合物发挥重要作用。
例如,Cyclin D 与 CDK4/6 结合,促进细胞通过R 点。
2、生长因子等外界信号也能影响细胞通过 G1 期。
例题:下列哪种因素能促进细胞从 G1 期进入 S 期?()A 缺乏生长因子B 抑制 Cyclin D 的表达C 增加 CDK4 的活性D 降低细胞内营养物质水平答案:C解析:增加 CDK4 的活性可以促进细胞通过 G1 期的限制点进入 S 期。
缺乏生长因子、抑制 Cyclin D 的表达以及降低细胞内营养物质水平都会抑制细胞从 G1 期进入 S 期。
二、S 期S 期是 DNA 合成的时期。
特点:1、 DNA 进行复制,含量加倍。
2、组蛋白等与 DNA 合成相关的蛋白质大量合成。
调控:1、 DNA 聚合酶等酶的活性受到严格调控,确保 DNA 复制的准确性。
2、细胞周期检查点监控 DNA 复制的进程和质量。
例题:在 S 期,如果 DNA 复制出现错误,细胞会采取以下哪种措施?()A 继续进行细胞周期B 暂停细胞周期并修复错误C 直接进入分裂期D 启动细胞凋亡程序答案:B解析:当 DNA 复制出现错误时,细胞周期检查点会发挥作用,暂停细胞周期,启动修复机制以修复错误,确保遗传信息的准确性。
细胞周期重点知识点总结一、细胞周期的四个阶段1. G1期(前期增殖期):细胞在这一阶段将进行蛋白合成和细胞器的增殖,为DNA复制和细胞的生长做准备。
2. S期(合成期):在S期,细胞对DNA进行复制,从而使得每个染色体都有两份相同的DNA分子。
3. G2期(后期增殖期):在G2期,细胞继续生长,并准备进行有丝分裂。
4. M期(有丝分裂期):在M期,细胞进行有丝分裂,将细胞核和细胞质分裂成两个独立的细胞。
二、细胞周期的调控1. 细胞周期检查点:细胞周期的进程受到一系列的检查点的调控,以确保细胞周期能够正常进行。
主要的检查点包括G1期的检查点、S期的检查点和G2期的检查点。
2. 细胞周期调控蛋白:细胞周期的进程受到许多蛋白激酶的调控,包括细胞周期调控的主要蛋白如CDK(cyclin-dependent kinase)和Cyclin等。
三、DNA复制与细胞分裂1. DNA复制:DNA复制是细胞周期中的重要过程之一,通过DNA复制,细胞可以复制出两份完全一样的DNA,从而进行有丝分裂。
2. 有丝分裂:有丝分裂是细胞周期中的另一个重要过程,包括纺锤体的形成、染色体的对分和细胞质的分裂等关键步骤。
四、细胞周期与疾病1. 细胞周期的异常与肿瘤:细胞周期的异常往往会导致细胞的异常增殖,甚至引起肿瘤等疾病。
2. 细胞周期调控的药物治疗:许多药物都是通过干预细胞周期的进程来进行治疗的,如化疗药物就是通过干预细胞周期从而达到抑制肿瘤生长的目的。
五、细胞周期的应用1. 生物技术中的应用:细胞周期的研究对于生物技术领域有着广泛的应用,如基因工程、生物制药等。
2. 医学中的应用:细胞周期的研究对于了解疾病的发生和治疗具有重要的意义,如药物研发、肿瘤治疗等。
综上所述,细胞周期是生物学研究中的一个重要内容,了解细胞周期的相关知识对于生物学的深入理解和疾病的治疗有着重要的意义。
随着生物学研究的不断深入,相信细胞周期的研究会有着更为丰富的发展和应用。
细胞周期生物学基础细胞的生成依赖于细胞的分裂而产生两个子代细胞的过程。
在分裂过程最需要复制并传递给子代细胞的是细胞核,因为它包含了细胞的遗传信息载体-DNA。
在绝大多数情况下,一个生物体的每个细胞都含有相等的DNA物质和相同成份的染色体。
因此,细胞在分裂前必须复制DNA这样它的子代细胞就能够拥有与父代相同的DNA含量。
细胞由DNA含量增加至分裂,再由它的子代继续复制并分裂,这个过程称之为细胞周期。
在细胞周期中最具特征性的阶段是在分裂前的DNA含量增加并达到2倍量的时候,并在此时细胞开始分裂其自身-有丝分裂期。
细胞周期中这两个循环步骤通常以一字母来表示:S期(合成期)和M期(有丝分裂期)。
当细胞周期中的S期和M期被定义后,我们可观察到在有丝分裂完成后和DNA合成刚开始之时有短暂的停顿或间隙,同样的停顿或间隙存在于DNA合成期后和有丝分裂开始之时。
这两个间隙我们将之命名为G1和G2期。
这样整个细胞周期可划分为G1 →S →G2 →M →G1,如下图所示:图1显示了细胞周期中个环节在流式细胞仪上分析时的图谱特征当细胞没有进入分裂过程时(我们机体中的绝大部分细胞),它们处于细胞周期的G1期的位置上。
因此G1细胞在数量上绝对是居各期细胞之首并在流式图谱上形成最高的信号峰。
在G1期细胞中有一群细胞特别安静并且没有进入细胞循环的任何生物学特征,我们称这些细胞为G0期细胞。
一些发生在G1和G2期细胞内的生物过程现还不完全明了。
处于G1期的细胞已开始为分裂前的DNA的复制和细胞成长准备许多RNA和蛋白分子。
处于G2期的细胞则会修复在DNA复制过程发生的错误并识别出在M期时将DNA平均等分的切割位置。
细胞循环中这些阶段的长度因细胞种类的不同而不同。
典型细胞循环中各期的发展时间为:G1期12小时,S期6小时,G2期4小时及M期0.5小时。
分析和流式细胞术细胞周期分析流式细胞最初的应用之一便是检测细胞的DNA含量,它可快速将细胞循环中的其它阶段与有丝分裂期区别开来。
这些检测是基于对细胞内DNA以化学定量方式的染色(染料着色数量直接与细胞内DNA含量相关)。
有相当多的对DNA有高亲合力的染料可用于此应用。
而不同的染料与DNA分子结合的位点不同。
现用得最多的两种DNA结合染料是蓝光激发的碘化匹啶(PI)(或偶尔也有用EB)和紫外激发的DAPI和Hoechst染料33342和33258。
PI染料是一种插入性的与双链DNA和RNA(当要特异地检测DNA时,经常使用RNAse去除RNA)结合,而DAPI和Hoechst染料仅与DNA的螺旋结构的亚级凹槽结合并与RNA完全没有任何结合。
Hoechst 33342是现唯一令人满意的能对活细胞DNA 时行染色的染料。
其他一些染料在染色前需要破坏细胞膜,故经常使用去污剂或低渗溶液处理或溶剂进行固定(酒精)。
*注意:使用溶剂进行固定(如酒精)经常会引起细胞聚集,详情见分析细胞聚集。
当运用DNA结合荧光染料后,可观察到一个有特征的图谱,那就是由各种细胞组成的一个细胞周期分布图。
当二倍体细胞被化学定量式DNA染料着色后并在流式细胞仪上分析,会观察到一个很“窄”荧光峰。
它将出现在以荧光强度为X轴、细胞数量为Y轴的坐标上。
因为种种原因G1期细胞具有相同的DNA含量,理论上G1期细胞的DNA含量荧光强度应当一致,并在直方图上的一个通道上出现信号(如图2.2A中,在直方图上出现一条G1期细胞的荧光直线)。
图2.2分别显示了一个理想状态中一台完美的流式细胞仪无偏差检测的直方图(A)和实际分析得到的呈高斯分布的直方图(B)。
在B图中,使用Dean 和Jett 多项式S期分析模型进行分析识别出的G1、G2和S期细胞分布。
如果流式细胞仪十分完美且DNA染料的特异性绝对专一,这种情况将会发生。
而在实际中,流式细胞仪本身存在着许多变异性,此外DNA染料的着色也存在生物学的变异。
因此,检测得出的G1期细胞的荧光分布正常的是呈高斯曲线分布。
这种“钟”型分布与检测的变异相关(图2.2B)。
检测中的变异越大,高斯曲线的宽度越宽。
有一个名为“变异系数”(CV)的指标用于描述峰的宽度。
CV是一种规格化的标准差,定义为CV=100*标准差/平均值。
相类似,G2和M期细胞它们拥有两部的正常G1期细胞的DNA含量,从而在直方图上形成一个两倍于G1信号峰D.I.2.0的高斯峰(见图2.2)。
实际上,G2/G1的比值常小于2.0,可能是因为G2期细胞的DNA-蛋白(染色质)聚集得更紧密或更浓缩。
从而DNA染料着色时与DNA位点的结合能力被削弱。
最常见的G2/G1的比值是1.97。
在理论上的完美流式细胞仪上检测时,S期细胞将分布自所有G1期细胞直方图右侧并一至延伸到所有G2期细胞直方图的左侧。
因为细胞一旦开始进入S期便会开始合成DNA,并紧帖着G1期细胞开始向外延伸。
而后DNA含量不断增加直至完成S期阶段进入G2期。
不幸的是,实际中的直方图分布并不是如此简单,这是因为G1、G2期的DNA峰分布并直线,而是有宽度的高斯分布,而S期分布则更宽。
所形成的结果是早期S期细胞与G1期细胞相互叠加,而后期S期细胞与G2期细胞相互叠加。
区分这些叠加细胞而计算出正确的G1、S和G2期细胞是以下章节讨论的内容。
二倍与异倍体细胞的DNA含量正如前面介绍的那样,机体所有的G1期细胞,极少例外,都具有相同的DNA含量和染色质结构。
在哺乳动物中,每个染色体具有两条构成。
这在细胞遗传学者认为是具有“双重DNA含量”(根据实际观察到的染色体数量)的细胞,并且定义了“2N”来描述它们(N是指单个染色数量,单倍染色体的DNA含量)。
而流式细胞仪通常也有相关的术语来描述:“DNA指数(D.I.)1.0”来指代这些G1期细胞的DNA含量。
具有其他DNA含量的细胞并意味着一定是属于异常,如以上介绍的S期和G2细胞和仅有单倍染色体生殖细胞,及一些在体内具有四倍DNA含量(D.I.2.0)的细胞(其他例外情况,如存在少数多核细胞)。
所有这些细胞的DNA都具有“整倍”关系,它们之间的差别都是以完整的染色体组为单位的,而这些染色体组中的各染色体都拥有其自身的完整性。
任何DNA含量异常的细胞其染色体组首先发生的异变或致少染色体的结构发生了改变,这们将这些细胞称为“异倍”DNA含量(针对于整倍体之言)。
因为整个细胞或细胞核DNA流式细胞仪无法确切检测出染色体数量,流式细胞仪无法确定哪些是DNA指数为1.0的正常细胞,所以要使用已知样本来事先定义二倍体细胞。
同样的,当细胞的DNA指数为2.0时我们称之为G2期细胞,或四倍体细胞或一个拥有异常DNA 含量的异倍体细胞。
在流式细胞仪进行检测时,它的位置事先也要精确地进行定义。
流式细胞仪通过观察DNA指数为非1.0整倍的细胞而能检测出染色体的变化,但这些细胞的染色体的结构和数量必须发生了改变。
因为名词“异倍体”实际是指通过染色体来确认的,当我们通过流式细胞仪检测DNA含量来发现它们时,要以“DNA-异倍体”来形容它们。
DNA异倍体细胞通常,但非绝对,与恶性组织有关系。
但一些例外情况必须注意,如一些良性肿瘤(如内分泌腺肿瘤)和恶变前的上皮细胞。
当一个恶性肿瘤通过流式细胞仪DNA-异倍体峰检测出来时,直方图分析时会发现在肿瘤中异倍体细胞与二倍体细胞相互混合。
二倍体细胞包括淋巴细胞、内皮细胞、纤维原细胞和一些基质成份,它们经常在样本中占一定的数量。
肿瘤和基质细胞都会有部分细胞正在进行细胞循环过程,经历着G1 →S →G2 →M期(基质细胞的S和G2期细胞数量通常比恶性细胞的要少得多),所以此时得到的DNA直方图通常是由两个细胞循环相互叠加构成的,但MultiCycle和ModFit都有专门的模型对它们进行分析。
细胞周期分析和DNA含量直方图DNA直方图要求数学方法来进行分析目的是精确地识别出被覆盖的G1、S和G2期细胞的分布;这些分析方法已经历了过去二十多年的发展与完善。
从DNA含量直方图中提炼出细胞周期图的方法也从简单的图形识别发展到更为复杂的曲线拟合。
所有简单分析方法都是基于G1和G2期细胞与S期之间叠加很少,G1和G2期细胞数量与直方图上检测到的G1、G2期数量接近的假设。
有两种具体计算方法。
第一种是通过计算G1期曲线的左半部分和G2期曲线的右半部分,然后翻倍后得出G1、G2期细胞,而剩余部分便是S期细胞。
第二种方法是只利用最中间的S期细胞分布,并向左侧G1期平均荧光强度和右侧G2期平均强度延伸而计算出S期细胞。
而左、右侧剩余部分便分别是G1和G2期细胞。
这些方法仅在只有一个细胞循环周期的直方图上才能得出比较准的结果。
以上两种方法都假设G1和G2峰是左右对称的(实际上不同组织染色后并不形成这种对称峰)并且两峰的中间点能够被精确地识别出来。
然而由于G1和G2峰与S期峰总是相互叠加的,所以这些峰的平均值往往并不在它们的最高点上,特别是G2峰。
如果存在第二个细胞周期时,两种周期的细胞相互叠加从而使这种分析方式变得很不可靠。
此外,在这种简单的图形分析方法通常不对细胞碎片和细胞聚集建立模型进行排除。
更具柔性和精确的细胞周期分析方法是基于用数学方法构造出的DNA含量分布图,然后使用曲线拟合方法将这些模型与数据进行匹配。
建立得最好的模型是由Dean和Jett在1974年通过预言细胞周期直方图是呈高斯分布的理论而建立的。
相互叠加的G1、G2峰和S峰可用高斯曲线重新被描述出来。
在最初的提议中,增宽的S期分布是由一个光滑的二次幂抛物线方程来描述的(抛物线的一个部分,y = a + bx + cx2)。
这个模型可以被简化为一次幂曲线(一个增宽的梯型,如以一条直线方程,y = a + bx)或零度斜线(一个增宽的矩型,直线模型,y = a)来拟合。
当直方图的质量与理想中相差太大时,特别是G1或G2峰不呈高斯曲线分布时(底部增宽,倾斜或存在肩峰),简化模型可减少引起G1、S、G2峰叠加的影响。
正如下面章节将要讨论的那样,这种情况经常出现在临床样本中。
在这种情况下,建意使用保守的零次幂或一次幂来拟后S期,除非对直方图的质量高度可靠可选用二次幂。
有些实验驱动形成的S期(通常是培养细胞)分布将会更复杂些,一些可选的分析模型可运用于这些分布。
最为适合的模型是将S期切割成一系列的高斯曲线,然后计算这些曲线的和。
在这个模型中,每个高斯曲线都可达到任意高度。
因此S期可被完全地描述出来,故此模型适用于一些复杂的S期图型。
以上这些模型的优点也是在实践中的主要缺点。
相当灵活的描述S期峰型时会将任何人为造成的假数据也描述出来,并且还会增加近G1、G2期端的S期区域模糊性。
一个比较折中的解决办法是由Fox (1980)提出的,他在Dean和Jett的多项式S期模型中再增加了一个高斯曲线。