应用Grapher6制作开发曲线教程
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雷若数Re在前排作为X轴数据,λ在后排作为Y轴数据,选取你的数据然后点击工具栏的‘图标向导’,点击XY散点图,如下
点击下步至步骤之3,添加主次网格线,然后确定,如下
鼠标选中X轴,双击显示坐标轴格式窗口,然后选刻度,修改最小值为1000,交叉于1000,如下
鼠标选中Y轴,双击显示坐标轴格式窗口,然后选刻度,修改最小值为0.01,最大值为0.1,交叉于0.01,如下
点击曲线图中任一点,右键后选窗口中的添加趋势线选对数类型,然后点击选项可以选‘显示公式’显示曲线的方程,如下。
手把手教你用GraphPadPrism绘制生存曲线疾病预后研究中,生存曲线是必不可少的素材之一,其重要性不言而喻。
那么,当获取到生存数据后应该如何绘制一幅对得起读者和编辑的生存曲线呢?在目前的科学绘图界,呈现出Sigmaplot,GraphPad Prism和Origin三分天下的局面。
据笔者估计,目前国际杂志上发表的论文中,80%图片出自这三大软件之手。
这三款软件均可以绘制生存曲线,其中尤以GraphPad Prism的操作最为简单,制图效果也较好。
当然,除了这三款软件外,其它一些常用统计软件(比如SPSS)也能绘制生存曲线,但是总体而言,制图效果明显不如上述三大软件。
本文拟图解如何在GraphPad Prism中绘制生存曲线。
我们假定有以下案例:为研究男女肺癌患者的预后是否相同,某研究者对5名男性肺癌患者和5名女性肺癌患者进行了随访,得到了如下结果:病人编号随访时间(月)结局说明男1101随访10月,患者死于肺癌男2110随访11月,患者未死亡,但是研究终止了男3120随访12月,患者未死亡,但随后失去联系男4130随访13月,患者死于车祸男581随访8月,患者死于肺癌女150随访7月,患者未死亡,但是研究终止了女260随访6月,患者未死亡,但随后失去联系女340随访4月,患者死于与肺癌无关的心脏病女431随访3月,患者死于肺癌女571随访7月,患者死于肺癌需要说明的是,在结局一栏的赋值中,只有0和1是有效数字,不能填写其它数字。
GraphPad Prism默认0为结局事件未发生,1为结局时间已发生。
在上表中,男2,男3,男4分别代表了三种结局,由于这三种结局中都没有观察到肺癌相关死亡时间,所以其结局都标识为0,而不是1,这在随访研究中被称为删失结果。
需要强调的是,本研究的观察终点是肺癌相关死亡事件,所以患者如果死于车祸,其结局应该是0,而不是1。
有了上述数据之后,我们就可以进入GraphPad Prism进行绘图了。
首先我们要画的图的数据存在一个文件中,一般文件为文本文件或者excel文档.此例中将数据存于data.xlsx文件中.打开Grapher软件,执行Graph→2D XY Graphs→Line/Scatter…(如图1)图1在打开的Open Worksheet对话框中选择数据文件,并打开数据文件(如图2)图2然后自动生成一幅折线图,如图3图3在Grapher中,所有的图都是由三部分构成,即X坐标轴、Y坐标轴与图像三部分构成(如图4).图4双击图像部分,则打开图像的属性对话框图5在属性对话框中可以选择Symbol选项卡,先修改Symbol frequency为1;再相修改Symbol,选择想要的一种符号,Size则为图形符号的大小.然后图中的折点处会以符号显示出来(如图5).在Line选项卡中选择Width修改折线的宽度,在Color中修改折线的颜色.再打开坐标轴的属性对话框,1在Axis选项卡中,通过Length修改坐标轴的长度(这里图像也会随着坐标轴的变化而相应变化的);在Axis title下Title中可以添加坐标轴的名称;在Line选项卡中Width中修改坐标轴线的粗细,在Style中修改坐标轴线的线型(如图7).2在Tick Marks选项卡中设置刻度线,分别对主刻度和次刻度的显示,如在Major ticks中勾上Show ticks to bottom就会将主刻度显示在坐标轴的底下,Spacing设置以多少的倍数显示刻度.3,在Tick Labels中设置刻度标记,在Major Labels中设置刻度标记的位置与显示效果,先勾上Show labels,在Angle中设置标注的显示角度,在Label format中设置标注格式;在Major label text中设置标注文本,Label source中可以选择标注文本的来源是日期还是工作表,假如选择了数据来源是数据表时要在WorkSheet中选择数据文件(这里数据文件要提前写好),假如Label source选择了Date/time则要在Date/time settings中设置日期格式;4,在Grid Lines中设置网格线,勾上At major ticks和Major line properties中的At minor ticks后坐标轴的主刻度和次刻度都会显示网格线(如图6)图6图7。
GIMP实用教程---6曲线的调整GIMP软件为一个图像编辑处理程序,结构简单但其功能不输于专业的绘图软件。
对于摄影爱好者可以方便地用它进行照片的后期调整和制作。
它的各种功能和应用将在本系列教程中逐一介绍。
上一篇曲线的调整现在继续讲三. 图像色彩的调整3.曲线的调整在曲线调整中还有一个技巧也应该掌握:如果你想要知道图像上任一点的亮度值,可以把鼠标移动到图像窗口,指针变成吸管模样,在你想要查看的地方点击,在曲线上就会出现和这一点相对应的点。
当你需要改变某个特定地方的亮度值而又不知道它在曲线上的位置时,这个方法就非常有用了。
担心记不住准确位置吗?不用急,GIMP早就为你想到了这一点。
在图像上点击的时候,同时按住Ctrl 键,这个点就会被固定下来。
这个方法常用来加强特定地方的对比,对图像作最优化处理,也就是突出画面的主题。
许多图片都有一个固定的主题,像环境中的人物等,大多数时候,我们对这个主题做的要多于背景画面。
俗话说:有钢要使在刀刃上,要尽可能的把注意力放在最主要的部分,突出中心。
刚才我们已经看到了,曲线陡峭会使图像的对比度增加,现在按住Ctrl,围绕画面重点点击,找到曲线上对应的点。
以下图为例先找到人物脸部的最亮点 :再找到人物脸部的最暗点 :你可能会多取到几个点,留下最上面和最下面的点,将其他的删除。
现在你就知道该对曲线上的那些部分下功夫了。
加大曲线的斜率,会得到更多的细节。
既不要太亮,也不要太暗,多试试,力求和画面平衡。
有时取的范围大一些,那也不是什么坏事,多带进一些背景而已。
下面就是经过曲线调整以后的结果,人物的对比度增加了,也就亮丽了一些:在调节曲线之前,对图片作粗略的分析是很有必要的。
当调节点的位置和曲线的倾斜在你手下改变时,图像也随着你的意思改变。
虽然GIMP允许你放置多个调节点,但一般情况下,两个点就已经足够了,调节的过程将变得快速而有效!当然,这一切的前提是你必须反复练习。
下图为一张夜景的照片,为了提亮最暗的部分,曲线开始处拉得相当陡峭,使暗处的景物显示了出来:下图为一张小行星的照片,原图较灰调整曲线后提高了对比度:需要指出的是:每一条曲线是为一张图片服务的,没有像万金油一样到哪里都能用的曲线。
GRAPHER 软件的使用一、建立数据文件在Grapher 启动后,选择"File"菜单的"New",然后选择"Worksheet"即可得到一个与Excel 非常相似的数据窗口(如下图)。
一般情况下A 列代表x 轴,B 列代表y 轴,用键盘在对应的位置上输入实验数据或者从其它文件导入数据,Grapher 既可以导入普通的文本文件( .DAT,.TXT ),又可以导入Lotus的.WKx,.WRx 以及Excel 各个版本的.XLS(包括Excel97)等多种格式的数据文件。
16对于某一测线上的观测数据,可按以下格式建立其数据文件(文件名后缀为.MCL),为绘制剖面图作准备。
线号点号磁场值温度日期0001 0001 0 17.1 04-06 09:420001 0002 5137 17.2 04-06 09:420001 0003 9715 17.3 04-06 09:43在此数据文件中,点号为二列,数据值为三列。
如有n 条测线,则需建立n 个数据文件,在保存数据文件时可用文件名予以区分。
当然Grapher2 最强大的功能是它的绘图功能,从"File"菜单中选"New",选择"Plot"将建立一个空白的绘图窗口(Plot)。
二、绘制剖面图(一)执行grafwin4.exe(二)在“File”中单击“Preferences”出现Preferences 的对话框,在“Page Units”中,选中“Centimeters”(厘米)(三)在“Graph”中单击“line or symbol”出现Open date 的对话框,从中选择要绘图的剖面数据(如819new.dat)。
(四)在选定某一剖面数据后,可弹出“line plot: lineplot 1”的对话框。
在此对话框中:1、worksheet columnsX:A column A 为点号列。
作业一一、实验内容:给定数据文件(作业一数据.dat),练习使用GRAPHER软件,并独立完成绘图,要求绘图结果如下图所示。
二、实现过程:1、绘制点线图:点击工具栏点线图图标或由Graph→New Graph→Line/Symbol,在Open Worksheet窗口选取已建立的数据文件(作业一.dat),出现Line/Symbol 窗口。
在Worksheet Columns中默认选定X、Y坐标轴为X→A,Y→B列。
确定后在主页中出现图。
2、调整坐标轴刻度及标题:在X轴或Y轴双击鼠标左键或单击右键选择属性打开坐标轴编辑对话框。
此处先设置Y轴。
⑴Axis在Scale中选择线性数轴。
在Axis Limits中设置坐标轴的范围,上栏输入-0.51,下栏输入0.35。
在Title中点击Editor,打开Text Editor编辑对话框对坐标轴名称进行编辑,在其中输入Average Temp作为Y轴标题,并调节字体大小为20,填充颜色为红色,并设置字体为粗体,OK确定;后选择Automatic,并在X、Y两个偏移量中设置Y坐标轴名相对于坐标轴中心的位置。
⑵Tick Marks设置坐标轴的刻度。
此处只对主刻度进行设置即可。
在Major中选择Show tickson left,并在Spacing中设置主刻度的间隔大小为0.1,刻度线长度为0.51cm,在Tick range中设置刻度的范围为-0.51。
⑶Tick Labels对坐标轴刻度线进行数值设置,在对话框中,只对主刻度线数值进行设置,选择Show labels→left设置数值在刻度线左边,Frequency设置标记间隔为1,offset设置标记与刻度线之间的偏移距离为0.25cm。
在Format中可对数值的字体格式进行设置。
其它选项不做设置,取默认状态。
⑷Line Properties对坐标轴线进行设置,Width中设置线条的宽度为0.051cm,颜色为黑色。
绘制曲线的工具及使用方法曲线,是绘制图形很重要的元素,要画好图形,首先就要画好曲线。
在Flash8 的绘图工具箱中,【线条工具】、【钢笔工具】和【铅笔工具】是专门用来绘制曲线的,【椭圆工具】、【矩形工具】和【多角星形工具】是专门用来画几何图形的,而【选择工具】、【部分选取工具】和【墨水瓶工具】等则可以用来编辑曲线。
接下来,我们一起来熟悉一下这些工具及其使用方法。
一、绘制曲线专门用来绘制曲线的工具是【线条工具】、【钢笔工具】和【铅笔工具】。
1、用【线条工具】绘制曲线(1)用【线条工具】画任意方向的直线在工具箱中单击选取【线条工具】,在舞台中某一点按下鼠标往外拖动,拖到另一点时松开鼠标,就能在这两点之间画成一条直线段。
(2)用【线条工具】画四条标准线段如果在画直线的同时按住Shift 键不松手,用【线条工具】可以画出水平线、竖直线,以及跟水平线成45 度角的标准倾斜线。
如图1所示。
图 1 按住Shift 键能画出四条特定方向的标准线段(3)【线条工具】的“颜色”设置为了使画出的线条呈现预想的颜色,必须在选取【线条工具】后,在工具箱【颜色区】的【笔触颜色】上设置好颜色。
单击【笔触颜色】按钮右下角的小三角,就会弹出“颜色样本”面板,如图 2 所示。
在你想使用的颜色块上单击,【线条工具】的颜色就设置好了。
今后,不管使用什么工具,只要有关【笔触颜色】设置的,都用上述方法操作。
(4)【线条工具】的选项【线条工具】的【选项】内容如下图所示。
①【对象绘制】在没有选择【对象绘制】选项时,画成交叉的曲线就会贴合在一起;如果选择了【对象绘制】选项,所画线条外围会显示一个蓝色的框,即使交叉的曲线也都是相互独立的,不会贴合。
②【紧贴至对象】在画线条时,如果选择了【紧贴至对象】选项,就能使原有的线条产生一种吸引力,使新画的线条在操作点上显示一个小圆圈,当新线条离原曲线不远处时就会被原线条吸引过去,从而使它们相交。
其它工具,如果带有【对象绘制】及【紧贴至对象】选项,其功能都一样,恕不赘述。