桑树基因组学研究进展

生物技术学院

课程论文

课程名称： 植物组织培养

学 号： 222012331012032

姓 名： 向亚飞

专业班级： 12级生物技术01班

成 绩：

教师签名： 桑树转基因研究进展

向亚飞

生物技术专业2012级生技一班，222012331012032

摘要：本论文主要探讨了桑树转基因的相关研究应用，转基因的原理和发展前景，为未来的的桑树相关应用提供相关理论基础。

关键词：桑树转基因；再生体系

背景简介

1.1基本信息

桑树是重要的经济植物，有着多种经济用途。桑树基因工程的开展将有效地促进桑树分子育种，进而改良相关性状。近年来桑树已进行多种转基因方法研究，并成功地将抗菌、抗虫等基因导入桑树，为丰富桑树育种素材，推进分子育种在桑树上的应用奠定了良好基础。

1.2转基因技术

植物转基因是有目的地将外源基因或DNA导人目标植物,使之整合、表达并遗传：目前，将外源基因或DNA导人植物组织或细胞的方法，大致可分为直接导人法和间接导人法两大类：直接导人法是利用化学或物理的一些手段等将外源基因直接导人植物组织或细胞。主要有：PEG(聚乙二醇)介导转化法、基因枪转化法(又称微弹射击法)、电击穿孔法(叉称电激法)、显微注射转化法、转座子介导转化法、花粉管通道法等；间接导人法也称农杆菌介导转化法，这种方法普遍应用于植物遗传转化中。这是因为根癌农杆菌在感染许多双子叶植物时，菌体内Ti质粒上的一段含致癌基因的转移DNA(T-DNA)能共价地整台到植物染色体上，并使植物感染部位形成冠状瘿瘤。在根癌农杆菌质粒转基因系统中，对T-DNA转移起关键作用有三个：①T-DNA上一个25bp的末端重复区域，它是转移系统的起始信号，具有识别作用②染色体侵入性基因是农杆菌吸附到植物细胞壁上所必需的③质粒上的侵人性基因，在T-DNA末端重复区域和chw基因作用下农杆菌吸附到植物细胞壁上并穿透细胞膜系统后，基因被植物组织释放出酚类或类黄酮等诱导物诱导而得以表达，完成质粒的侵染过程。利用农杆菌质粒的侵染性，可将改造过的衍生质粒上的外源基因转人植物细胞中，从而获得转基因植株。80年代以来，随着根癌农杆菌致癌(Ti)质粒衍生的嵌台基因表达载体的构建及以各种植物为受体的基因转化方法的建立，使植物基因工程跃上了新的台阶。

骨科２０１５年第６卷第４期Ｏｒｔｈｏｐａｅｄｉｃｓ，Ｊｕｌｙ　２０１５，Ｖｏ１．６，Ｉｓｓ．４　

骨巨细胞瘤基因组学研究进展　

汪翔　杨少岩　张蒙　何安邦　吴松　

【摘要】骨巨细胞瘤（ｇｉａｎｔ　ｃｅｌｌ　ｔｕｍｏｒ　ｏｆ　ｂｏｎｅ，ＧＣＴＢ）通常被认为是一种交界性骨肿瘤，具体发病　

机制不详且易复发，目前除了手术暂无其他有效的治疗方案。但随着快速减法杂交（ｒａｐｉｄ　ｓｕｂｔｒａｃｔｉｖｅ　

ｈｙｂｒｉｄｉｚａｔｉｏｎ，ＲＡＳＨ）和实时定量聚合酶链式反应（ｑｕａｎｔｉｔａｔｉｖｅ　ｒｅａｌ－ｔｉｍｅ　ｐｏｌｙｍｅｒａｓｅ　ｃｈａｉｎ　ｒｅａｃｔｉｏｎ，ｑＲＴ＿　

ＰＣＲ）等技术在ＣＧＴＢ研究领域的运用，基因突变、基因表达谱、基因转染及信号通路等基因组学事件在　

ＣＫ；ＴＢ中得到了进一步的探索。这些研究正逐渐揭示了Ｃ￣；ＴＢ的发病机制，同时也改进了这种骨肿瘤　

的早期诊断及治疗方案。本文旨在总结ＯＣＴＢ基因组学研究现状，以期能发现早期特异性诊断指标，并　在此基础上改进治疗方案及减少该病的术后复发率。　

【关键词】骨巨细胞瘤；基因组学；基因表达谱；信号通路；基因转染　

骨巨细胞瘤（ｇｉａｎｔ　ｃｅｌｌ　ｔｕｍｏｒ　ｏｆ　ｔｈｅ　ｂｏｎｅ，ＧＣＴＢ）因病　

变部位有局部侵袭骨质的趋势而通常被认为是一种以局部　

溶骨活动为特征的交界性骨肿瘤［１］。该肿瘤在欧美发病率　

约为５％，而在美国人口中ＣＫ２ＴＢ约占所有良性肿瘤中的　

２Ｏ　，且好发于２０￣４０岁的青壮年人群，女性稍多于男性。　

该肿瘤目前最主要的治疗手段为外科治疗，但原发ＧＣＴＢ　

手术治疗后复发率为１８　～６Ｏ￣／６ｏ，甚至少数病例还会发生　

恶变ｌ＿２Ｉ３＿。国际上根据其侵袭及转移能力的强弱分为良性　

ＧＣＴＢ和恶性ＧＣＴＢ。在所有的ＧＣＴＢ中，恶性ＧＣＴＢ的发　病率小于２　。恶性ＧＣＴＢ分为原发性和继发性两种＿４　］。　

虽然目前临床上对于ＧＣＴＢ的流行病学及临床生物学行为　有一定的研究，但是其发病机制至今仍未研究清楚。以前对　

桑树WRKY转录因子的全基因组鉴定及生物信息学分析

背景:

桑树（Morus）是一种重要的经济性果树和林木树种，在世界范围内广泛种植。获得桑树的基因组信息和功能基因的特性研究能够为其可持续利用和改良提供很好的基础和方向。

WRKY转录因子是参与植物生长发育、逆境适应等多个生物过程的重要转录因子家族。然而，对于桑树WRKY基因家族的鉴定和特性的研究仍相对不足。

方法:

本研究采用生物信息学方法对桑树基因组中的WRKY基因进行鉴定，进一步对其基因结构、保守区域、进化关系和表达模式等方面进行分析。

结果:

在桑树基因组中共鉴定得到117个WRKY基因，其中包括90个单个WRKY结构域的基因和27个多个WRKY结构域的基因。通过系统演化分析和保守区域比对，进一步定义了桑树WRKY基因家族的分类和特性。通过RNA-seq数据和荧光原位杂交等技术，分析了不同组织和不同生长阶段中的WRKY基因表达模式，发现其中许多基因在逆境胁迫下的诱导表达程度显著提高。

结论:

本研究鉴定了桑树基因组中的117个WRKY基因，为后续的桑树分子育种和逆境适应研究提供了依据和资源。通过表达模式分析，还发现了许多逆境适应相关的WRKY基因，可以作为进一步研究植物逆境适应机制的参考。

２００６年第４３卷第２期　《广西蚕业》　Ｇｕａｎｇｘｉ　Ｓｅｒｉｃｕｌｔｕｒｅ　Ｖｏ］．４３　Ｎｏ．２．２００６　

广西桑树品种全基因组ＤＮＡ提取方法研究　

田智得　，赵卫国２，甘丽红１，杜风文３　

（１．广西区蚕业技术推广总站，南宁市５　３０００７；２．中国农科院蚕业研究所：　

３．吉林大安市翰海桑田工程办公窒）　

［摘要］以广西桑树品种芽为材料，以ＣＴＡＢ法提取其基因组ＤＮＡ，并用紫外光谱吸收、　

凝胶电泳、Ｉ　ＳＳＲ等方法进行鉴定。研究结果表明：提取的ＤＮＡ　Ａ２６０／Ａ２８０比值在　

１．８５～１．９８之间，得率约为０．１　６７～０．４３２　ｇ．ｍｇ～，提取的ＤＮＡ可用于ＰＣＲ分析。　

［关键词］桑树；ＤＮＡ提取：ＩＳＳＲ　

［中图分类号］￥８８８．３１；　［文献标识码］Ａ；　［文章编号］ｉ００６—１６５７（２００６）０２—０００７—３　

桑树是重要的经济植物，属桑科桑属，栽培历史悠久，是家蚕的主要饲料。我国栽桑　

面积、产量、质量及品种数量都居世界首位，种质资源非常丰富。　

随着分子生物学的发展，产生了许多直接在ＤＮＡ水平上进行遗传分析的分子生物学实验　

方法，如限制性酶切片段长度多态性（ＲＦＬＰ）、随机扩增多态性ＤＮＡ（ＲＡＰＤ）、串联重复序　列（ｓ　ｓＲ）、扩增酶切片段长度多态性（ＡＦＬＰ）等，这些方法已广泛用于生物学研究的各　

个领域，在这些技术的实验过程中，ＤＮＡ质量是影响实验的关键因素之一。由于桑树组织细胞　

内富含多糖、多酚、单宁、色素等复杂次生化合物，给基因组ＤＮＡ的提取造成极大困难。目　

前已发表多种从植物组织中提取ＤＮＡ的方法，但针对桑树既简便又经济的高纯度ＤＮＡ提取方　

法仍需要进一步探索和改进。　’　

本试验以广西桑树品种的芽为提取材料，采用ＣＴＡＢ法进行ＤＮＡ的提取，结果获得了高　得率、高纯度的ＤＮＡ。在实验过程中，对ＣＴＡＢ法的提取程序也进行了改进，大大简化了实　

验步骤，提高了实验效率。　

１材料与方法