江苏省260株结核分枝杆菌Spoligotyping基因分型研究
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1.结核分枝杆菌鉴定方法1. 1萋尼氏抗酸染色痰涂片显微镜检查目前萋尼氏抗酸染色痰涂片显微镜检查是我国结核病实验室使用最为普遍的方法,其操作简单快捷,特异性高,设备要求低,但是灵敏度较低,不能及时发现病人。
1.2 发光二极管荧光显微镜(LED荧光显微镜)发光二极管荧光显微镜管利用二极管光源,延长了显微镜使用寿命,不需要暗室,且价格低廉,可以提高涂片的阳性检出率。
目前在国内应用评估结果显示灵敏度较明场显微镜明显提高,已在部分区县开始使用。
1.3 交叉引物恒温扩增结核病诊断技术在恒定温度下,特殊的引物和特异性探针在酶的作用下,反应体系在一个密闭的反应管内反应。
扩增反应一般不超过一个小时,最短半小时。
目前应用玻璃化试剂,稳定性好,便于运输。
目前在国内区县级应用评估。
1.4 夹层杯结核病诊断方法将痰标本(或其它标本)用专用消化灭活液充分消化,完全暴露并保留抗酸杆菌,通过自动离心涂片机(或半自动制片染色机)对消化后的标本进行充分集菌。
直接在夹层杯装置中进行抗酸染色,取出基片或膜片置于普通显微镜进行观察。
夹层杯法操作方便快捷,便于标准化操作,通过消化灭活,安全性改善,阳性检出率也比直接涂片法大大提高。
夹层杯的装置有沉降式和虑过式,适用于不同工作量的医疗机构。
1.5 环介导等温扩增方法采用2对引物在等温条件下即可完成DNA的扩增,扩增结果通过肉眼观察荧光进行判定,诊断是否为结核病。
同时整个反应体系采用封闭系统减少了工作区域扩增子的污染,整个反应过程只需一个小时即可完成,通过肉眼观察荧光判读结果。
2.结核分枝杆菌培养方法2.1 固体培养培养是结核病诊断的精标准,也是获得分离菌株开展耐药检测的前提,我国结核病实验室最常用的是固体罗氏培养法,包括简单法和中和离心法。
虽然培养是诊断的精标准,但是花费时间长,需要4-8周时间。
2.2 液体培养液体培养通过添加生长刺激剂,改变检测方法提高检测灵敏度等方式缩短了阳性报告时间。
基因芯片技术检测结核分枝杆菌耐药性的临床价值杨璟1 王丽玲2 胡荣2 肖杰2 阮小洁2 宋家武2发布时间:2023-05-14T03:07:24.287Z 来源:《中国科技人才》2023年5期作者:杨璟1 王丽玲2 胡荣2 肖杰2 阮小洁2 宋家武2 [导读] 目的:对结核分枝杆菌耐药性检测过程当中应用基因芯片技术的效果以及价值进行分析研究。
方法:从2019年1月至2022年11月在医院接受治疗的疑似患有结核病的患者当中随机无目的性地挑选200名参与到这一次实验研究当中。
结果:200名疑似患者当中阳性患者40名,占比20%,基因芯片检测结果显示结核病38例,非结核病2例,阳性几率为19%,耐药基因检测21例,利福平以及异烟肼基因突变3例,总突变几率为14.3%,其中,有2例为利福平以及异烟肼均耐药,双重基因突变几率为9.5%,另外1例只耐受利福平,利福平总突变几率为14.3%,异烟肼总突变几率为9.5%,耐多药几率为9.5%。
结论:结核分枝杆菌耐药性检测过程当中应用基因芯片技术具有明显的效果,能够有效减少诊断时间,提高工作效率,所以可以进行大范围推广应用。
1.珠海市人民医院呼吸科2.广东省基因芯片工程技术研究中心,珠海赛乐奇生物技术股份有限公司广东珠海 519001摘要:目的:对结核分枝杆菌耐药性检测过程当中应用基因芯片技术的效果以及价值进行分析研究。
方法:从2019年1月至2022年11月在医院接受治疗的疑似患有结核病的患者当中随机无目的性地挑选200名参与到这一次实验研究当中。
结果:200名疑似患者当中阳性患者40名,占比20%,基因芯片检测结果显示结核病38例,非结核病2例,阳性几率为19%,耐药基因检测21例,利福平以及异烟肼基因突变3例,总突变几率为14.3%,其中,有2例为利福平以及异烟肼均耐药,双重基因突变几率为9.5%,另外1例只耐受利福平,利福平总突变几率为14.3%,异烟肼总突变几率为9.5%,耐多药几率为9.5%。
『毕业论文社区』优质论文硕博学位论文1/62学校代码10285学号20134221110硕士学位论文学术学位论文题目结核分枝杆菌磷酸酶ptpB抑制巨噬细胞杀伤TB的功能研究题目英文翻译Effect of MptpB on inhibiting the function of macrophage to kill TB研究生姓名樊玲波指导教师姓名董元舒副教授专业名称免疫学研究方向感染免疫病所在院系生物医学研究院论文提交日期2016年3月『毕业论文社区』中文摘要目的:结核病是由结核分枝杆菌(Mtb)感染引起的严重的慢性传染性疾病,世界上有三分之一的人口感染结核分枝杆菌,每年造成约两百万人死亡。
近年来,随着结核分枝杆菌的多重耐药性菌株的出现及与艾滋病的共感染,结核病的控制难度不断加大。
为研发新型的疫苗及治疗药物,我们需要对结核病发病的分子机制做透彻的研究。
MptpB是Mtb分泌的重要毒力因子。
从结构上看MptpB属于酪氨酸磷酸酶,体外实验显示出对酪氨酸,丝氨酸/苏氨酸及磷酸肌醇的磷酸酶活性,体内底物尚不清楚。
MptpB缺失的Mtb感染豚鼠后细菌载量比野生型低越70倍,感染活化的巨噬细胞后细菌载量也比野生型低5到7倍,说明MptpB抑制了巨噬细胞杀伤Mtb的功能,是支持Mtb在体内存活的重要毒力因子。
本研究的目的是探查MptpB在巨噬细胞中的作用,并初步探讨其作用机制。
方法及结果:(1)我们首先克隆了MptpB基因,构建了其真核载体,并建立了过表达MptpB的巨噬细胞系Raw-MptpB。
为检测过表达的MptpB对Mtb存活的影响,我们用H37Rv感染了Raw-MptpB及对照细胞,并分别计数了细菌载量。
结果表明,Raw-MptpB细胞在感染H37Rv2-6天后细菌载量比对照细胞高2-4倍。
(2)为确定MptpB对巨噬细胞免疫功能的影响,我们在用IFN-γ,LPS及H37Rv 刺激Raw-MptpB及对照细胞后,用real time PCR及ELISA检测了多种细胞因子的表达,发现MptpB抑制了IL-1β及IL-6在巨噬细胞中的表达;我们同时用western blot测定iNOS表达量,并检测了其产物NO的含量,发现MptpB抑制了iNOS 的表达并降低了NO在培养液中的浓度;我们用被剪切的caspase3的蛋白量,caspase3的活性及p53蛋白水平来检测Raw-MptpB细胞的凋亡,发现MptpB抑制了IFN-γ及H37Rv诱导的细胞凋亡。
结核分枝杆菌基因分型及其耐药性分析【摘要】探讨四川地区结核患者结核分枝杆菌基因分型及其与耐药性关系。
方法采用PCR和琼脂糖凝胶电泳技术,对124株结核分枝杆菌的6个可变重复位点进行检测,并应用Gel-Pro analyzer 3.0软件和BioNumerics(Version 3.0)软件对检测结果进行基因型分析,同时分析其基因型与耐药之间的关系。
结果 124株结核分枝杆菌共分为37个不同的VNTR类型,成簇基因型占74.19%(92/124),单一基因型占25.81%(32/124)。
耐药菌株在成簇类型和单一类型的分布上存在统计学差异。
结论四川地区结核患者的结核分枝杆菌具有明显的基因多态性,成簇类型是主要流行菌株,应加强流行结核菌株的监控。
【关键词】结核结核分枝杆菌基因分型Abstract:Objective To study on genotyping of Mycobacterium tuberculosis(MTB) isolates and to analysis the relation between drug resistance and genotype of Variable number tandem repeat(VNTR)in Sichuan area.Methods Six tandem repeat loci of the 124 isolates ofM.tuberculosis in Sichuan area were analyzed by PCR and agarose gel electrophoresis.The results of genotyping were analyzed with Gel-Pro analyzer 3.1 software and BioNumerics 3.0 software,and the relation between genetic type and drug resistance was explored.Results A total of 37 different allele profiles were identified by the VNTR for all the 124 isolates,74.19%(92/124)and 25.81%(32/124)belonged to cluster type and single type respectively.Drug resistant M.tuberculosis was significantly associated with cluster type.Conclusion There is obvious genetic polymorphism in the M.tuberculosis isolates in Sichuan area.And the clustering type was perhaps the main epidemic strains.It is suggested that surveillance of the epidemic genotype to be strengthened.Key words:tuberculosis;Mycobacterium tuberculosis;genotyping结核病仍然是一种严重危害人类健康的重大传染性疾病,特别是耐药结核分枝杆菌的发生和流行,给结核病的治疗、预防和控制带来巨大困难。
基因芯片技术及其在结核分枝杆菌检测中的应用荣爱红;赵蓬波;侯晓杰【期刊名称】《中国实验诊断学》【年(卷),期】2012(016)012【总页数】3页(P2347-2349)【作者】荣爱红;赵蓬波;侯晓杰【作者单位】吉林省人民医院,吉林,长春130021;吉林省人民医院,吉林,长春130021;吉林省人民医院,吉林,长春130021【正文语种】中文结核病是由结核分枝杆菌引起的一种慢性传染病,主要侵犯肺脏。
在某些经济欠发达地区,许多结核病患者因为得不到全程,合理的救治而产生结核耐药,这使得控制结核病的发生发展成为世界性问题。
目前,临床实验室采用的检测结核分枝杆菌的方法主要有抗酸染色法和细菌培养法。
抗酸染色法简便、实用、快捷,但非结核性分枝杆菌亦可出现阳性结果;细菌培养作为结核病诊断的金标准,虽优于抗酸染色法,但时间比较长,影响早期用药;荧光染色和PCR是可供选择的检测方法,却可能出现假阳性和假阴性;而依赖于基因芯片的PCR杂交法敏感性和特异性均高,是比较准确的检测方法[1]。
1 基因芯片基因芯片(gene chip)技术是随着“人类基因组计划”(human genome project,HGP)的进展而发展起来的,它是21世纪以来影响最深远的重大科技进展之一,是物理学、微电子学与分子生物学综合交叉形成的高新技术。
1.1 基因芯片的概念基因是指具有遗传效应的DNA片段,位于细胞的染色体上。
我们将大量的基因片段按一定的顺序固定在特定的载体上,即为基因芯片。
在一块约1cm2大小的芯片上,可固定数千甚至上万的基因片段,由此形成一个密集的基因方阵,方便对多个基因进行同步检测[2]。
1.2 基因芯片的优点基因芯片作为一种先进的、大规模、高通量的检测技术,正逐步成为疾病诊断的尖端技术之一[3],其优点主要表现在:一,灵敏性和准确性;二,快捷简便性;三,同步性。
在医学领域,医生针对多种相似病原菌进行鉴别诊断时,若能应用基因芯片技术,则短时间内就能知道病人是哪种微生物感染,这对指导临床合理,及时,准确的用药提供了很大的方便。
扬州市结核分枝杆菌利福平耐药基因突变分析发表时间:2019-05-28T10:05:48.223Z 来源:《医药前沿》2019年9期作者:戴洁1 曾方林1 王金富(通讯作者)1,2 [导读] 目的:了解本地区结核分枝杆菌利福平耐药基因的突变特征。
(1扬州市第三人民医院江苏扬州 225025)(2扬州大学人兽共患病学重点实验室江苏扬州 225002)【摘要】目的:了解本地区结核分枝杆菌利福平耐药基因的突变特征。
方法:利用基因芯片检测346例经鉴定为结核分枝杆菌的菌株利福平耐药基因,分析本地区利福平耐药基因突变特征。
结果:346例结核分枝杆菌中利福平耐药基因发生突变的例数为58例(16.7%)。
利福平rpoB基因耐药位点分布如下:531位点为58.6%,526位点为31.1%,511位点为6.9%,516位点为3.4%。
结论:本地区MTB对利福平耐药rpoB基因耐药位点以531位点最多,526位点次之。
【关键词】结核分枝杆菌;基因突变;利福平【中图分类号】R96 【文献标识码】A 【文章编号】2095-1752(2019)09-0223-02 利福平(RFP)是从利福霉素B得到的一种半合成抗生素,能抑制细菌DNA转录合成RNA,达到杀菌作用。
绝大多数的RFP耐药相关基因是rpoB(RNA聚合酶 β亚基),rpoB基因的突变会引起RFP与细菌RNA聚合酶的亲和力降低,导致细菌对RFP耐药[1]。
rpoB基因的突变主要是密码子507到533(RNA聚合酶(rpoB)β-亚单位的81-by)热点区域。
514位和533位密码子突变是引起低水平耐药的常见突变位点。
D516V,H526Y, H526D,S531L,这4个位点的突变是引起高水平耐药的常见突变[2]。
某些密码子突变引起的rpoB基因突变并不会导致细菌对RFP耐药。
本研究利用基因芯片技术对扬州地区结核分枝杆菌RFP耐药基因突变位点特征进行了分析,现报道如下。
结核分枝杆菌的研究历史及⽣物学性状!结核分枝杆菌的研究历史及⽣物学性状!!结核分枝杆菌的研究历史及⽣物学性状的研究历史结核分枝杆菌的⼀、⼀、结核分枝杆菌结核分枝杆菌(M. tuberculosis)简称为结核杆菌(tubercle bacilli)。
早在1882年,德国细菌学家柯赫(Robert Koch,1843-1910)就已证明结核分枝杆菌是结核病的病原菌。
本菌可侵犯全⾝各组织器官,但以肺部感染最多见。
随着抗结核药物的不断发展和卫⽣⽣活状况的改善,结核的发病率和死亡率曾⼀度⼤幅下降。
20世纪80年代后,由于艾滋病和结核分枝杆菌耐药菌株的出现、免疫抑制剂的应⽤、吸毒、贫困及⼈⼝流动等因素,全球范围内结核病的疫情骤然恶化。
据WHO统计,全世界约每3个⼈中就有1个⼈感染了结核分枝杆菌,在某些发展中国家成⼈中结核分枝杆菌携带率⾼达80%,其中约5%~10%携带者可发展为活动性结核病。
近⼆⼗年由于艾滋病的流⾏,感染了HIV的结核分枝杆菌携带者,由于病毒破坏了机体的免疫功能,发展为活动性结核病的可能性⽐未感染HIV者⾼30~50倍,且结核的病程发展更快。
此外,在HIV感染的发展进程中,结核是最早发⽣的⼀种机会性感染,结核病加重了HIV感染者或艾滋病⼈的疾病负担,使其更易死亡。
21世纪以来全球每年约出现8百万结核新病例,并导致约3百万⼈死亡。
中国每年死于结核病的⼈约25万之多,是各类传染病死亡⼈数总和的两倍多。
因此,结核病⼜成为了威胁⼈类健康的全球性卫⽣问题,并成为某些发展中国家和地区,特别是艾滋病⾼发区⼈群的⾸要死因。
⼆、结核分枝杆菌⽣物学性状形态与染⾊结核分枝杆菌为细长略带弯曲的杆菌,⼤⼩1~4X0.4µm。
⽜分枝杆菌则⽐较粗短。
分枝杆菌属的细菌细胞壁脂质含量较⾼,约占⼲重的60%,特别是有⼤量分枝菌酸(mycolic acid)包围在肽聚糖层的外⾯,可影响染料的穿⼊。
分枝杆菌⼀般⽤齐尼(Ziehl- Neelsen)抗酸染⾊法,以5% ⽯炭酸复红加温染⾊后可以染上,但⽤3%盐酸⼄醇不易脱⾊。
淮安地区350株痰结核分枝杆菌药敏结果及初复治耐药结果分析纪小亭;孙利华;曾东晓;王莉娟【摘要】目的分析淮安地区住院及门诊随访患者痰标本中分离出的结核分枝杆菌对4种常用抗结核药物的耐药情况,比较初治及复治患者对4种结核药物的敏感度差异,为临床治疗提供用药参考,减少经验用药加强规范合理用药减少结核分枝杆菌耐多药率的发生.方法采用比例法对350株结核分枝杆菌进行两种一线抗结核药(异烟肼,利福平)两种抗结核药(氧氟沙星,卡那霉素)敏感性测定.结果 350株结核分枝杆菌总体耐药率为37.7°(131/350),而初治耐药率为30.4%(71/233),复治耐药率为51.3%(60/117).另外350株结核分枝杆菌的总体耐多药率为15.4%(54/350),而初治耐多药率为11.2%(26/233),复制耐多药率为23.9%(28/117).与全国第五次结核病流行病学调查比较耐药率及耐多药率均有提高.结论复治肺结核患者分离出的结核分枝杆菌耐药率及耐多药率均较初治患者高.加强患者管理,规范治疗对初治患者尤为重要.【期刊名称】《临床荟萃》【年(卷),期】2016(031)011【总页数】4页(P1225-1228)【关键词】分枝杆菌,结核;广泛耐药结核【作者】纪小亭;孙利华;曾东晓;王莉娟【作者单位】淮安市第四人民医院医学检验中心,江苏淮安223002;淮安市第四人民医院医学检验中心,江苏淮安223002;淮安市第四人民医院医学检验中心,江苏淮安223002;淮安市第四人民医院医学检验中心,江苏淮安223002【正文语种】中文【中图分类】R378.911结核病被列为我国重大传染病之一,是严重危害人民群众健康的呼吸道传染病。
根据世界卫生组织的统计,我国是全球22个结核病流行严重的国家之一,同时也是全球27个耐多药流行严重的国家之一[1-2]。
耐药结核病尤其是耐多药结核病(multidrug resistance tuberculosis,MDR-TB)的出现给结核病的防治工作带来了极大的困难使结核病的发病率和病死率不断提高。
江苏省260株结核分枝杆菌Spoligotyping基因分型研究刘巧许卫国万康林王建明杨丹丹吕冰邵燕汪华 [摘要] 目的 研究江苏省结核分枝杆菌DNA指纹图谱的分布特征,分析北京家族株与结核分枝杆菌耐药的关联性。
方法 江苏省30个耐药监测点收集260株结核分枝杆菌分离株,应用比例法检测分离株对于一线抗结核药物(异烟肼、链霉素、利福平和乙胺丁醇)的耐药性,应用间隔区寡核苷酸分型( Spoligotyping)方法进行基因分型,使用BioNumerics 5.0软件进行聚类分析,并与SpolDB4数据库比对。
结果 260株结核分枝杆菌分离株可分为34个基因型(27个独特基因型和7个共享基因型),菌株经聚类分析分为两个家族:北京家族(80.4%,209/260)和非北京家族(19.6%,51/260)。
logistic回归分析显示,北京家族株能增加结核分枝杆菌耐多药的发生风险(OR= 11.07,95%CI:1.45~84.50)。
非北京家族包括T1、T2、H3、H4、CAS、LAM、U和MANU2,其中CAS、LAM和MANU2家族在中国比较罕见,在江苏省是首次报道。
结论 江苏省结核分枝杆菌流行株具有明显的基因多态性,其主要流行型为北京家族,且该家族可能与结核分枝杆菌耐多药之间存在关联。
结核分枝杆菌;基因分型;北京家族Study on the genotypes of 260 Mycobacterium tuberculosis isolates by Spoligotyping method in Jiangsu province, China LIU Qiao1XU Wei-guo2WAN Kang-lin3WANG Jian-ming1YANG Dan-danLV Bing3SHAO Yan2, WANG Hua11 Department of Epidemiology and Biostatistics, School of Public Health, Nanjing Medical University, Nanjing 210029, China; 2 Department of Chronic Communicable Disease, Jiangsu Provincial Center for Disease Control and Prevention; 3 State Key Laboratory for Infectious Disease Prevention and Control, National Institute for Communicable Disease Control and Prevention, Chinese Center for Disease Control and Prevention This work was supported by grants from the National Science and Technology Key Program of Mega Infectious Diseases (No. 2008ZX10003-010) and National Science and Technology Major Project of China (No. 2009ZX 10004-904 ). [Abstract] Objective To study the genotypes of Mycobacterium tuberculosis (M. tuberculosis) strains isolated from Jiangsu province and to explore the relationship between the 'Beijing family' and the drug resistance of M. tuberculosis. Methods Two hundred and sixty M. tuberculosis strains were isolated from 30 drug surveillance sites in Jiangsu province. Susceptibility of the isolates to the first-line antituberculosis drugs (isoniazid, streptomycin, rifampicin and ethambutol) was tested by using the proportion method. Molecular typing of M. tuberculosis strains was determined by Spoligotyping and analyzed with BioNumerics software. Results Based on Spoligotyping fingerprint, 260 strains showed 34 different genotypes, including 27 exclusive genotypes and 7 shared genotypes. These strains could be clustered into two groups:the Beijing family (80.4%, 209/260) and the Non-Beijing family ( 19.6%, 51/260). Data from logistic regression analysis revealed that infection by the Beijing family was related to an increased risk of multi-drug resistant M. tuberculosis, with the OR (95% CI) of 11.07 (1.45-84.50). Non-Beijing families including T1, T2, H3, H4, CAS, LAM, U and MANU2 families were also found. Among them, the CAS, LAM and MANU2 families were first reported in Jiangsu province. Conclusion It was revealed that the marked gene polymorphisms did exist in M. tuberculosis strains. The Beijing family had been the predominant strain circulating in Jiangsu province,which might be related to multi-drug resistant M. tuberculosis strains. Mycobacterium tuberculosis; Genotyping; Beijing family 10.3760/cma.j .issn.0254-6450.2011.12.016国家科技重大传染病专项( 2008ZX 10003-010);国家科技重大专项(2009ZX10004-904)作者单位:210029 南京医科大学公共卫生学院流行病与卫生统计学系(刘巧、王建明、汪华);江苏省疾病预防控制中心慢性非传染病防治所(许卫国、杨丹丹、邵燕);中国疾病预防控制中心传染病预防控制所传染病预防控制国家重点实验室(万康林、吕冰)结 果讨 论・1253・@@[ 1 ] Wan KL. 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