标准曲线法相对定量
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qpcr相对定量原理
用标准品与待测样品进行对照,建立标准曲线。
每个样本至少两个平行样,每个样做四个平行样。
按照标准曲线计算得到的结果要用定量方法进行验证,如果标准曲线不能准确地测定出待测样品的浓度,那么用qpcr测定的结果就是不准的。
检测原理
在核酸分子中,每个碱基都有一个固定的结合位点,称为“内含子”。
“内含子”按一定的规律排列起来,组成一段序列(称为“外显子”),外显子之间以非连续方式排列着。
每个外显子都含有一个核苷酸多肽,即:碱基对,具有特定的密码子编码。
由mRNA中编码蛋白质的序列(称为“外显子”)和编码RNA 中翻译的RNA序列(称为“内含子”)组成的两条cDNA分子称为mRNA和cDNA。
mRNA与cDNA之间存在着碱基配对关系(称为“配对密码”),配对密码可以是一个或几个碱基对(例如:tRNA中:1个核苷酸,mRNA中:5个核苷酸)。
—— 1 —1 —。
光谱分析-定量分析在原子放射光谱中,谱线强度I与试样中组分浓度。
之间的定量关系可用罗马金一赛伯阅历式表示: I=acb 式中,a为常数;b为谱线自吸系数,在大多数状况下b≈1。
常用的定量分析办法如下: 1.标准曲线法标准曲线法也称外标法,首先配制一系列不同浓度。
的标准溶液,挑选合适的光谱谱线波长,依次测定各个浓度溶液的谱线强度I,绘制以I作为纵坐标,c作为横坐标,并通过原点的标准工作曲线(图3-31)。
当试液中元素含量不很高时,罗马金公式中自吸系数b≈1,此时I与c成正比,标准工作曲线为向来线,相关系数:r≈0.999。
在相同试验条件下,测定样品溶液的谱线强度,再从标准工作曲线,查出样品溶液所含元素的浓度。
目前,原子放射光谱仪经数据处理软件可挺直打印出测定结果的分析报告。
现因为仪器的稳定性大幅提高,ICP 光源的自汲取较低,部分仪器厂商采纳两点法绘制标准工作曲线,即用一个标准溶液,一个空白溶液校准仪器,就可挺直测定样品的含量。
图3-31 Zn元素的I-c标准工作曲线当被测元素含量较高时,谱线的自吸现象较强,此时可采纳对数坐标(IgI-Igc)来绘制标准工作曲线,此时曲线的线性度获得充实,并扩大了测量的线性范围。
2.标准加入法又称标准增量法,它是一种用于检验仪器精确度的测试办法。
此法对难以制备有代表性的样品,可以抑制基体的影响;此外,对低含量的样品,它可充实测定的精确度。
它还可用于检查基体的纯度,检验试样中是否存在干扰物质,估算系统误差并提高测定的敏捷度。
标准加入法首先要举行样品的半定量测定,了解样品中待测元素的大约含量。
然后向样品中加入已知量待测元素后,再对样品举行其次次测定,可通过光强信号的增强量,作图并计算出样品中待测元素的含量。
设待测元素的浓度为cx,向样品中加入不同浓度(c1、c2、c3)的待测元素的标准溶液,然后在相同测定条件下,分离举行测定激发光谱,因I=acb,且b≈1,则在每种加入的标准溶液的浓度下,测定的谱线强度Ii与加入标准溶液的浓度ci成正比,第1页共3页。
相对定量方法实际操作(三种常用方法)本人用的是相对荧光定量PCR法,在分子水平上比较课题中5 种新基因的表达差异。
实验进行很多次,感受颇深,同时遇到了一些问题:扩增效率、标准品选择(及赋值)、标准曲线、重复性等问题,希望有同行朋友一起探讨和指教。
parative Delta-delta Ct 法定量流程(RG6000 软件设置)1).先对样品中的目的基因与看家基因分别做标准曲线,基因的扩增效率是否一致或接近;将扩增效率优化为一致。
2).同一样品分别进行看家基因和目的基因的扩增,分列在两页中P1 P2公式:通过标准曲线确定两个F=2「待检样品目_待检样品看fJ L的基因平均—家基因平均一Ct值Ct值L对照组目的J基因平均Ct 值对照组看家基因平均Ct 值IComparative Delta-delta Ct 法的特点、注意事项及实际应用1). Comparative Delta-delta Ct法是很常用的一种相对定量方法,其最大特点是,当优化的体系已经建立后,在每次实验中无需再对看家基因和目的基因做标准曲线,而只需对待测样品分别进行PCR扩增即可。
2).其缺点是,每次实验都默认目的基因和看家基因的扩增效率一致,而并非真实扩增情况的反映,这里势必存在一定的误差。
3). Comparative Delta-delta Ct法展开定量实验前,在预实验中,必需对目的基因和看家基因做两组标准曲线。
Rotor-Gene的软件会自动给出两组标准曲线的R值、扩增效率等信息,如果两组标准曲线的斜率,即M值的差小于0.1,那么后续实验中就可以用Comparative Delta-delta Ct法进行相对定量分析。
反之,如果M差值大于0.1,就无法用该方法进行相对定量分析。
此时的解决方法有两种,一是优化实验,使两组标准曲线的斜率差值小于0.1,二是换用其它的相对定量方法。
应用实例:如上图,将标准品进行梯度稀释后,分别对目的基因( Gene of Interest )和看 家基因(Housekeeper Gene )做标准曲线。
qpcr数据处理公式qPCR(实时定量PCR)数据处理的公式包括两个主要部分:相对定量和绝对定量。
下面将分别介绍这两个部分的数据处理公式。
1. 相对定量的数据处理公式相对定量通常是对不同样品之间的基因表达量进行比较。
该方法通过测量目标基因与参考基因(通常是内部控制基因)的相对表达量来确定基因表达量的差异。
以下是相对定量的数据处理公式:- ΔCt法Ct值是实时定量PCR放大到指定阈值的周期数。
ΔCt法通过计算目标基因Ct 值与参考基因Ct值之间的差异来比较基因表达量。
公式如下:ΔCt = Ct (目标基因) –Ct (参考基因)- 2^-ΔΔCt法ΔΔCt法是一种更精确的相对定量方法,它通过计算目标基因与参考基因的ΔCt 值差异来比较基因表达量。
公式如下:ΔΔCt = (Ct (目标基因) –Ct (参考基因))样品A –(Ct (目标基因) –Ct (参考基因))样品BFold Change = 2^-ΔΔCt其中,Fold Change表示目标基因的表达量相对于参考基因的表达量的倍数。
2. 绝对定量的数据处理公式绝对定量是测量目标基因的绝对表达量(例如拷贝数或RNA浓度)。
以下是绝对定量的数据处理公式:- 标准曲线法标准曲线法是一种常用的绝对定量方法,它通过绘制已知拷贝数或RNA浓度的标准曲线来计算未知样品的目标基因拷贝数或RNA浓度。
公式如下:y = mx + b其中,y表示Ct值,x表示已知的目标基因拷贝数或RNA浓度,m表示斜率,b表示截距。
通过将未知样品的Ct值代入该方程,可以计算出相应的目标基因拷贝数或RNA浓度。
- 相对标准曲线法相对标准曲线法是一种更精确的绝对定量方法,它通过绘制已知拷贝数或RNA 浓度的标准曲线和参考基因的Ct值来计算未知样品的目标基因拷贝数或RNA 浓度。
公式如下:y = mx + bΔCt = Ct (目标基因) –Ct (参考基因)ΔΔCt = ΔCt (样品) –ΔCt (标准曲线)Fold Change = 2^-ΔΔCt其中,y表示Ct值,x表示已知的目标基因拷贝数或RNA浓度,m表示斜率,b表示截距,ΔCt表示目标基因与参考基因的Ct值差异,ΔΔCt表示未知样品与标准曲线的ΔCt值差异,Fold Change表示目标基因的表达量相对于参考基因的表达量的倍数。
相对定量pcr标准曲线相对定量PCR标准曲线。
相对定量PCR是一种常用的分子生物学技术,它可以用来比较不同样本中特定基因的表达水平。
在进行相对定量PCR实验时,标准曲线是非常重要的,它可以帮助我们准确地计算出待测样本中目标基因的表达量。
本文将介绍相对定量PCR标准曲线的构建方法和分析步骤,希望能对相关实验人员有所帮助。
1. 标准曲线的构建。
在构建相对定量PCR标准曲线时,首先需要准备一系列已知浓度的标准样品。
这些标准样品中含有目标基因的不同浓度,通常是通过连续稀释的方法得到。
接下来,将这些标准样品进行PCR扩增,并测定其相对荧光强度。
通过荧光强度和标准样品的浓度之间的关系,可以构建出标准曲线的方程式,从而实现对未知样品中目标基因表达量的定量测定。
2. 标准曲线的分析。
一旦标准曲线构建完成,就可以用它来分析待测样品中目标基因的表达量了。
首先,将待测样品进行PCR扩增,并测定其荧光强度。
然后,将得到的荧光强度值代入标准曲线的方程式中,就可以计算出待测样品中目标基因的相对表达量。
需要注意的是,为了保证结果的准确性,每个待测样品都需要进行多次重复实验,以确保数据的可靠性。
3. 实验注意事项。
在进行相对定量PCR实验时,有一些注意事项需要特别关注。
首先,标准曲线的构建需要使用精确的浓度稀释系列,以确保曲线的线性范围和斜率的准确性。
其次,在进行PCR扩增时,需要严格控制反应条件的一致性,包括温度、时间和试剂的使用量等。
最后,在测定荧光强度时,要注意排除任何可能影响测量结果的干扰因素,确保数据的准确性和可靠性。
4. 结语。
相对定量PCR标准曲线的构建和分析是PCR实验中的重要环节,它直接影响到实验结果的准确性和可靠性。
通过本文的介绍,希望读者能够对相对定量PCR 标准曲线有一个清晰的认识,能够在实验中熟练地进行标准曲线的构建和分析,从而获得准确的实验数据。
在实际操作中,要严格按照操作规程进行,确保实验结果的准确性和可重复性,为科研工作提供可靠的数据支持。
定量PCR的原理和应用一、定量PCR的概述定量PCR(Quantitative PCR,简称qPCR)是一种用于精确测定DNA或RNA 在样本中的相对或绝对数量的技术。
相比传统的定性PCR,定量PCR能提供更加准确和可靠的分子生物学定量分析结果。
本文将介绍定量PCR的原理、方法和应用。
二、定量PCR的原理定量PCR基于传统PCR技术,通过测量PCR产物的实时累积情况来确定起始模板的数量。
其主要原理包括:1.设计引物和探针:定量PCR需要使用特异性引物和荧光探针来扩增和检测目标序列,引物的设计应考虑碱基配对的特异性和温度互补性。
2.实时检测:在PCR反应过程中,荧光探针与目标序列发生特异性结合,形成荧光信号。
通过实时监测PCR产物的荧光信号强度,可以确定目标序列的起始数量。
3.标准曲线法:定量PCR通常需要构建标准曲线来确定目标序列的起始数量。
标准曲线是由一系列已知起始数量的标准品制备而成,根据标准曲线上的荧光信号强度和已知起始数量的关系,可以推断出未知样本中目标序列的起始数量。
三、定量PCR的步骤定量PCR通常包括以下步骤:1.样本处理:将待测样本中的DNA或RNA提取和纯化,以获得高质量的核酸模板。
2.引物和探针设计:根据目标序列的特异性和相关基因信息,设计引物和荧光探针。
3.PCR反应体系的配置:根据实验需求和PCR仪器要求,配置PCR反应混合液,包括引物、荧光探针、DNA模板和PCR反应缓冲液等。
4.PCR反应条件的设置:确定PCR反应的温度和时间参数,包括退火温度、延伸时间和扩增周期数等。
5.实时荧光监测:将PCR反应体系加载到实时荧光PCR仪中,监测PCR反应过程中荧光信号的强度变化。
6.数据分析:利用实时荧光PCR仪软件对荧光信号数据进行分析,绘制标准曲线和计算目标序列的起始数量。
四、定量PCR的应用定量PCR在生物学研究和临床诊断中具有广泛的应用。
以下是定量PCR的主要应用领域:1.基因表达分析:通过定量PCR可以测定不同组织或细胞中特定基因的表达水平,揭示基因在生物学过程中的功能和调控机制。
质谱数据定量分析方法概要质谱数据定量分析是一种使用质谱仪获取样品中特定化合物或元素含量的方法。
它能够在短时间内实现对多种目标化合物的分析,具有高灵敏度、准确度和选择性等优点。
下面将概述几种常用的质谱数据定量分析方法,包括标准曲线法、内标法、同位素稀释法和定量结构活性关系分析方法。
1.标准曲线法标准曲线法是质谱数据定量分析中最常用的方法之一、在这种方法中,首先准备一系列已知浓度的标准溶液,并对这些标准溶液进行质谱分析,得到样品中目标化合物的质谱峰面积或峰高度。
然后,根据标准曲线绘制出目标化合物浓度与质谱峰面积或峰高度之间的关系曲线,通过对待测样品的质谱峰进行测定,可以根据标准曲线计算出目标化合物在样品中的浓度。
2.内标法内标法是一种相对比较准确的质谱定量分析方法。
在这种方法中,选择一个与目标化合物具有相似物理化学性质的化合物作为内标物,并将内标物溶液加入待测样品中。
然后,对待测样品进行质谱分析,测定目标化合物和内标物的质谱峰面积或峰高度。
通过计算目标化合物和内标物的峰面积或峰高度比例,并与已知浓度的标准溶液进行比较,可以计算出目标化合物在样品中的浓度。
3.同位素稀释法同位素稀释法是一种用于分析样品中特定元素或化合物含量的高精确度和高灵敏度的质谱定量方法。
在这种方法中,已知浓度的同位素标准物质加入样品中作为内标物,并进行质谱分析。
通过测定目标化合物和同位素标准物质的质谱峰面积或峰高度比例,并与已知浓度的同位素标准物质进行比较,可以计算出目标化合物在样品中的浓度。
同位素稀释法有很高的精确度和准确度,广泛应用于环境分析、食品检测和生命科学研究等领域。
4.定量结构活性关系分析方法定量结构活性关系分析方法是一种基于质谱数据分析化合物结构与活性之间关系的定量分析方法。
在这种方法中,首先通过质谱技术获取样品中一系列化合物的质谱数据,然后将这些质谱数据与已知的化合物结构信息进行比对和分析,建立起化合物结构与特定活性之间的关系模型。
荧光定量PCR中的相对定量和绝对定量绝对定量的⽬的是测定⽬的基因在样本中的分⼦数⽬,即通常所说的拷贝数。
相对定量的⽬的是测定⽬的基因在两个或多
个样本中的含量的相对⽐例,⽽不需要知道它们在每个样本中的拷贝数。
举例来说,如果研究项⽬中包括处理过的和未经处理的对照样本,通常可以将未经处理的样本指定为基准,规定其⽬的基因浓度为100%,将经处理的样本的定量结果除以对照样品的定量结果,就可以计算各个处理样本的基因含量相对于未处理样品的百分⽐。
绝对定量实验必须使⽤已知拷贝数的绝对标准品,必须做标准曲线。
相对定量可以做标准曲线,也可以不做标准曲线。
相对定量实验有两种⽅法:标准曲线法和C T值⽐较法。
如果使⽤标准曲线法,可以使⽤绝对标准品,也可以使⽤相对标准品,⽽且相对标准品在实验操作上更为简便易⾏。
相对标准品是只知道样品中DNA或RNA的稀释⽐例⽽不需要知道其分⼦数⽬的标准品,典型的做法是将⼀个已知pg数的样品做⼀系列梯度稀释。
C T值⽐较法是利⽤C T值与起始DNA浓度的对数成反⽐的数学关系,来计算不同样本之间的相对百分⽐,其计算公式是
绝对定量的数据易于理解,但是绝对标准品的制备和测定其DNA含量⽐较困难。
有许多商业性的标准品试剂盒供选购,可以解决这种困难。
相对定量的标准品容易在实验室⾥⾃⼰制备,但是数据处理⽐较⿇烦,对实验数据的解释有⼀定难度。
xrd计算物相含量方法一、引言X射线衍射是一种常用的非破坏性分析技术,可用于研究晶体结构和物相含量。
物相含量是指样品中各个晶相的相对比例。
通过XRD 技术,可以获取样品的衍射图谱,然后利用定量相分析方法计算出各个晶相的含量。
二、XRD技术原理XRD技术基于布拉格定律,即当入射X射线与晶面发生衍射时,满足2d sinθ = nλ的关系,其中d为晶面间距,θ为衍射角,n为整数,λ为入射X射线的波长。
通过测量衍射角θ和入射X射线波长λ,可以确定晶面间距d。
三、定量相分析方法1. 标准曲线法标准曲线法是一种常用的定量相分析方法。
首先,制备一系列已知物相含量的标准样品,并进行XRD测量,得到它们的衍射图谱。
然后,测量待测样品的衍射图谱,并将其与标准样品的衍射图谱进行比较。
根据衍射峰的强度和位置,可以推算出待测样品中各个物相的含量。
2. RIR法RIR(Rietveld Internal Standard Relative Intensity Ratio)法是一种基于内标法的定量相分析方法。
该方法通过在样品中添加已知物相含量的内标物质,来确定待测样品中各个物相的含量。
内标物质与待测样品的衍射峰强度之比称为相对强度比。
通过测量待测样品和内标物质的衍射图谱,可以计算出相对强度比,从而得到物相含量。
3. Rietveld法Rietveld法是一种基于全谱拟合的定量相分析方法。
该方法通过将样品的整个衍射图谱与已知物相的理论衍射图谱进行拟合,来确定样品中各个物相的含量。
利用最小二乘法,调整各个物相的相对比例和晶体结构参数,使得拟合曲线与实际衍射图谱最为接近。
通过对拟合参数的优化,可以得到物相含量。
四、注意事项1. 样品制备要均匀、细致,以保证测量结果的准确性。
2. XRD测量条件要合适,包括入射X射线波长、衍射角范围等。
3. 在计算物相含量时,要考虑样品的晶体结构、晶胞参数等因素,以提高计算精度。
五、总结XRD技术是一种可靠的方法,用于计算物相含量。
标准曲线法和标准比对法
标准曲线法和标准比对法是化学分析中常用的两种定量分析方法。
它们在分析样品中某种物质的含量时,都需要建立一个标准曲线或者进行标准比对,以便准确地测定样品中物质的含量。
下面将对这两种方法进行详细介绍。
首先,我们来看看标准曲线法。
标准曲线法是通过一系列已知浓度的标准溶液制备出一条曲线,然后利用待测样品与标准溶液相同的操作条件进行测定,根据待测样品的吸光度值在标准曲线上找到对应的浓度,从而计算出待测样品中物质的含量。
这种方法需要仔细地进行标准曲线的制备和测定,以确保曲线的准确性和可靠性。
接下来,我们来介绍标准比对法。
标准比对法是将待测样品与一系列已知含量的标准样品进行比对,通过比对待测样品与标准样品的性质或者含量,来确定待测样品中物质的含量。
这种方法不需要建立标准曲线,而是直接利用标准样品的性质或者含量来进行比对,因此操作相对简单,但需要选择合适的标准样品和合适的比对方法,以确保测定结果的准确性。
在实际应用中,选择标准曲线法还是标准比对法,需要根据具体的分析要求和实验条件来进行综合考虑。
一般来说,如果待测样品与标准样品的性质相似,并且分析条件比较稳定,可以选择标准比对法进行分析;如果待测样品与标准样品的性质差异较大,或者分析条件比较复杂,可以选择标准曲线法进行分析。
当然,在实际应用中,也可以根据需要结合两种方法进行分析,以获得更加准确的分析结果。
总之,标准曲线法和标准比对法是化学分析中常用的两种定量分析方法,它们各自有着特定的优势和适用范围。
在选择使用哪种方法时,需要根据具体的分析要求和实验条件进行综合考虑,以确保获得准确可靠的分析结果。
QPCR 算法(相对定量,相对标准曲线法)算法:1待测样品Ct 值-对照样品Ct 值,2 差值的取对数,3目的基因的对数除以内参基因的对数值。
公式:RQ = )()()()(ref ref targ targ Ct - Ct -refCt - Ct -targ 1E 1E Cont Sample Cont Sample ++AssayACTBTNF1-ACTB 1-TNF 2-ACTB 2-TNF 3.00 sample1 16.21 20.26 0.00 0.00 1.00 1.00 1.00 sample2 18.38 21.26 2.17 1.00 0.25 0.51 2.06 sample3 15.18 20.49 -1.03 0.23 1.94 0.86 0.44 sample418.3122.402.102.140.260.240.921 待测样品Ct 值-对照样品Ct 值,对照样品为sample1,1-ACTB 为减去样品sample1基因ACTB 的Ct 值(16.21),1-TNF 为减去样品sample1基因TNF 的Ct 值(20.26)2 差值的负数取对数,如ACTB 扩增效率为90%,则取以1.9为底的对数,Excel 函数为“=power (1.9,-0.00)”。
TNF 扩增效率为95%,则取以1.95为底的对数,Excel 函数为“=power (1.95,-0.00)”。
3 以2-TNF 除以2-ACTB 。
备注:1 本算法应用范围,选择1个样品,2倍或5倍梯度稀释5个点,分别检测目的基因和内参基因的Ct 值,取两者的差值拟合直线方程,如果直线方程的斜率的绝对值大于等于0.1,可以用该方法计算。
如果小于0.1,也可以使用2-ΔΔCt 法。
2 由于考虑不同引物之间的扩增效率,本方法比2-ΔΔCt法算出的结果更准确,如果需要比较不同基因之间的表达差异,可以参照本方法,建议使用绝对定量,计算不同基因的拷贝数,然后进行比较。
标准曲线法相对定量
标准曲线法是一种相对定量的分析方法,常用于测定样品中的目标物质含量。
该方法基于样品与已知浓度的标准品之间的比较,通过建立标准曲线来推断未知样品中的目标物质含量。
实施标准曲线法的步骤如下:
1. 准备一系列已知浓度的标准品溶液。
这些标准品的浓度应当覆盖待测物质的预计浓度范围。
2. 使用适当的分析方法(如吸光光度法、荧光法等)测定每个标准品的信号强度,例如吸光度或荧光强度。
3. 绘制标准曲线。
将标准品的浓度作为横坐标,对应的信号强度作为纵坐标,在坐标图上绘制出标准曲线。
通常使用线性回归或其他拟合方法对标准曲线进行拟合。
4. 测定待测样品的信号强度。
使用同样的分析方法测定待测样品的信号强度。
5. 使用标准曲线推断待测样品中目标物质的浓度。
根据待测样品的信号强度,在标准曲线上找到对应的浓度值。
相对定量是指通过比较待测样品与标准品之间的信号强度或峰面积来推断待测样品中目标物质的相对含量,而不是直接给出绝对浓度值。
这是因为标准曲线法无法消除实验中的误差和变异性,因此只能提供相对的结果。
需要注意的是,标准曲线法的准确性和可靠性取决于标准品的准确性、分析方法的精确性以及实验条件的控制等因素。
在使用标准曲
线法进行定量分析时,应当严格按照标准操作程序和质控要求进行实验,以获得可靠的结果。