密码子表及简并碱基
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遗传密码表以及氨基酸详
表
Prepared on 24 November 2020
密码子反表
除此之外,还有一些三字母或单字母符号可用来表示未明确定义的缩写:•Asx、B可代表天冬氨酸(Asp、D)或天冬酰胺(Asn、N)。
•Glx、Z可代表谷氨酸(Glu、E)或谷氨酰胺(Gln、Q)。
•Xle、J可代表亮氨酸(Leu、L)或异亮氨酸(Ile、I)。
•Xaa(亦用Unk)、X可代表任意氨基酸或未知氨基酸。
结构[]
以下是标准所用来直接合成蛋白质的20种氨基酸的结构及表示符号。
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(Ala/A)
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(Arg/R)
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(Asn/N)
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(Asp/D)
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(Cys/C)
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(Glu/E)
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(Gln/Q)
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(Gly/G)
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(His/H)
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(Ile/I)
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(Leu/L)
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(Lys/K)
•(Met/M)
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(Phe/F)
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(Pro/P)
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(Ser/S)
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(Thr/T)
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(Trp/W)
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(Tyr/Y)
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(Val/V)
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(Sec/U)
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(Pyl/O)
主要化学性质[]
以下的分子量是根据各元素的在自然界的所做的平均值。
此外由于形成时,会减少一个,因此蛋白质中单一氨基酸的分子量,比下表数值少了 Da。
支链性质[]
以下列表中的pKa值,可能与这些氨基酸在蛋白质内部时有所不同。
基因表达与生物化学[]。
小结遗传密码性质及应用本文结合一些高考题或冲刺题,浅谈遗传密码子的有关性质,以便师生对遗传密码表引起足够重视以及对遗传密码子有关性质的应用。
1、审察人教版高中《生物》第二册表6-1的遗传密码,可以看出如下特点:(1)简并性:除色氨酸和甲硫氨酸只有1个密码子外,其它18种氨基酸均有1个以上的密码子,其中有2至4个密码子的氨基酸密码子分布在同一方框内,即第一和第二个碱基相同,只有第三个碱基不同;有6个密码子的氨基酸(如亮氨酸、丝氨酸)密码子分别在不同方框内,它们的第一或第一和第二碱基不同。
密码子的简并性,特别是第三位的C和U或G和A的简并性常常等同,这说明为什么在不同生物的DNA中的AT/GC比率会有很大的变异,而其蛋白质的氨基酸相对比例却没有很大的变化。
换句话说,只改变一个碱基(称为点突变),并不一定编码“错误”氨基酸。
(2)通用性:除某些线粒体、叶绿体和原生生物外(如Barrell等在1979年发现人的线粒体中,通用的密码子AUA却是编码甲硫氨酸,而不是异亮氨酸,UGA 不是作为终止密码子,而是编码色氨酸),所有生物的遗传密码都是相同的。
这也是基因工程得以实现的重要理论基础之一。
如1993年,中国农业科学院的科学家成功地将苏云金孢杆菌的抗虫基因转入棉植株,培育成了能产生毒蛋白来抵抗棉铃虫的转基因抗虫棉。
(3)起始密码子兼职性:64个密码子中,其中3个并不编码氨基酸的却起着终止肽链合成作用的密码子,称为无义密码子(又称终止密码子);另61个是编码各种氨基酸的密码子,称为有义密码子,在61个有义密码子中,编码氨基酸同时兼职于启动蛋白质形成的两个密码子(AUG和GUG),称为起始密码子。
(4)非重叠性:在mRNA模板上的密码子是连续的,在前一个密码子与后一个密码子之间没有间隔,即没有一个间断的信号。
因此,在进行翻译时,解读的框架决定于起始的碱基。
如果核糖体在mRNA链上移动时,偶然跳越了1个核苷酸,便会生成“不完全”蛋白质,原因是mRNA上密码子中增加或减少一个碱基将引起后续密码子的改变。
遗传密码的组成
遗传密码指的是在生物学中编码蛋白质合成的基因信息。
这个密码是由DNA 分子中的碱基序列组成的。
DNA(脱氧核糖核酸)是生物体遗传信息的携带者,由四种碱基组成,它们以特定的方式组合,形成基因,从而决定了生物体的遗传特征。
DNA的四种碱基分别是:
1. 腺嘌呤(Adenine,简写为A)
2. 鸟嘌呤(Guanine,简写为G)
3. 胸腺嘧啶(Thymine,简写为T)
4. 胞嘧啶(Cytosine,简写为C)
这些碱基以配对的方式连接在一起,形成DNA的双螺旋结构。
配对规则如下:
-腺嘌呤(A)和胸腺嘧啶(T)之间形成一对。
-鸟嘌呤(G)和胞嘧啶(C)之间形成一对。
这种基对的规律性允许DNA 在复制过程中将信息传递给新合成的DNA 分子,同时也提供了一种机制,使DNA 能够被转录成RNA,从而进一步被翻译成蛋白质。
基因是DNA 中的特定序列,它包含了编码蛋白质所需的信息。
基因的编码信息是由这些碱基的序列决定的。
每三个连续的碱基组成一个密码子(codon),每个密码子对应着一种氨基酸或终止信号。
这样的三碱基密码子的组合形成了遗传密码。
总的来说,遗传密码的组成是基因中的DNA 序列,这个序列是由腺嘌呤(A)、鸟嘌呤(G)、胸腺嘧啶(T)和胞嘧啶(C)这四种碱基组成的,通过特定的规律性形成了密码子,进而决定了蛋白质的合成。
这一过程涉及到DNA 复制、转录和翻译等生物学过程。
A Ala Alanine M Met Methionine G Gly GlycineS Ser Serine C Cys Cysteine N Asn Asparagine H His Histidine T Thr Threonine D Asp Aspartic Acid P Pro Proline I Ile IsoleTcine V Val Valine E Glu Glutamic AcidQ Gln GlTtamine K Lys Lysine W Trp Tryptophan F PhePhenylalanineRArg ArginineL Leu LeucineYTyr TyrosineBAsx Aspartic Acid or AsparagineZGlx Glutamic Acid or Glutamine简并碱基符号对应表逆密码子表氨基酸缩写密码子氨基酸缩写密码子Ala A GCU, GCC, GCA, GCG Leu L UUA, UUG, CUU, CUC, CUA, CUGArg R CGU, CGC, CGA, CGG,AGA, AGGLys K AAA, AAGAsn N AAU, AAC Met M AUGAsp D GAU, GAC Phe F UUU, UUCCys C UGU, UGC Pro P CCU, CCC, CCA, CCGGln Q CAA, CAG Ser S UCU, UCC, UCA, UCG, AGU, AGCGlu E GAA, GAG Thr T ACU, ACC, ACA, ACG Gly G GGU, GGC, GGA, GGG Trp W UGGHis H CAU, CAC Tyr Y UAU, UACIle I AUU, AUC, AUA Val V GUU, GUC, GUA, GUG 起始AUG 终止UAG, UGA, UAA此表列出了和20种氨基酸和密码子的标准配对。
密码子的简并性名词解释密码子简并性名词解释:密码子的简并性( density of nucleotide codes)生物学密码子的复制是以简并方式进行的。
用以产生同一密码子不同氨基酸之间碱基配对概率的最小参数为简并度,其值为复制一个氨基酸所需的密码子数目减去原始密码子数目的平均值。
密码子是生物遗传信息存在的基本单位,每种生物都有独特的密码子。
同种生物密码子的个数、顺序和各种密码子的不同组合形成不同的密码子表达式。
由于不同种生物DNA中的密码子具有独特性,因此对同种生物不同组织或细胞的DNA进行比较时,就要用到密码子的简并性。
对动植物而言,生活条件与环境不同,决定了动植物DNA中密码子的差异性,因此常以简并度表示密码子的简并程度。
一般说来,密码子的简并度越高,密码子之间的差别就越大,生物的亲缘关系也就越远。
例如,人类的遗传信息中就包含有50万个密码子,这些密码子的碱基配对概率非常低,不同种族之间,人类与人类之间的遗传信息的密码子个数只相差几千个。
但对果蝇而言,它们遗传信息的密码子个数则有100万个之多,由此可见生物的亲缘关系还是很近的。
不同的密码子有着不同的功能,根据其对蛋白质结构的影响,生物体内密码子可分为5类:即A类、 B类、 C类、 D类和E类密码子。
各类密码子主要功能见下表:密码子的简并性为多肽链的结构和功能的研究提供了新的工具。
一些密码子不仅在数量上很少,而且在空间上分布很广,甚至还存在简并现象,因此能被较大的密码子编码区域简单地识别,如苯丙氨酸及其受体、谷氨酸、天冬氨酸、赖氨酸、酪氨酸、苏氨酸等。
这类密码子称为“稀有密码子”。
在蛋白质中已发现有500多个稀有密码子。
这些稀有密码子,如果被识别,往往会导致翻译错误,造成生物功能紊乱。
例如,不正确识别苏氨酸残基的RNA聚合酶就将N-羟基-L-丝氨酸甲酯转变成N-羟基-L-精氨酸甲酯,从而降低了细胞内能量生成,干扰蛋白质正确折叠成为异常折叠,影响细胞分裂等生理过程。
20种氨基酸的密码子(原创版)目录1.密码子的概念与分类2.氨基酸与密码子的关系3.20 种氨基酸的密码子详解4.密码子的特性与应用正文一、密码子的概念与分类密码子是指在生物体中,三个核苷酸(碱基)的序列,它们位于信使RNA(mRNA)上,用来编码一个特定的氨基酸。
密码子是生物体内遗传信息转录和翻译的关键环节,它们决定了生物体合成蛋白质的过程中氨基酸的顺序。
密码子分为 64 种,其中有 61 种能决定氨基酸,剩下的 3 种是终止密码子,它们不参与氨基酸的编码。
二、氨基酸与密码子的关系氨基酸是蛋白质的基本组成单位,而密码子则是决定氨基酸顺序的编码。
一个密码子对应一个氨基酸,但一个氨基酸可能对应多个密码子。
这种对应关系并不是一一对应,而是存在一定的冗余和多样性。
密码子的存在保证了生物体在遗传信息传递和蛋白质合成过程中的稳定性和可靠性。
三、20 种氨基酸的密码子详解生物体内共有 20 种氨基酸,它们分别由不同的密码子编码。
以下是20 种氨基酸对应的密码子列表:1.丙氨酸:GCA, GCG, GCC, GCD, GCE, GCG, GCA, GCG, GCC, GCD2.赖氨酸:AAA, AAG3.精氨酸:AGG4.天冬氨酸:GAC, GAA, GAG, GAT5.天冬酰胺:AAC, ACA, ACG, AGA, AGG, AGR, AAA, AAG6.半胱氨酸:GUU, GUC, GCC, GCD, GCE, GCG, GUA, GUG7.胱氨酸:GAA, GAG8.缬氨酸:GUC, GUA, GUG9.亮氨酸:CUU, CUC, CCG, CCD, CCE, CCG, CUA, CUG10.甲硫氨酸:AUG11.苯丙氨酸:TTT, TTC12.脯氨酸:CCU, CCC, CCD, CCE, CCU, CCG, CCA, CCG, CCD, CCE13.丝氨酸:UCU, UCC, UCG, UCD, UCE, UCG, UUA, UUG14.苏氨酸:ACU, ACC, ACG, ACD, ACE, ACG, AUA, AUG15.色氨酸:TGT, TGC16.酪氨酸:TTY, TYN17.谷氨酰胺:Gln, Gly18.谷氨酸:GAA, GAG19.谷氨酰酸:GAC, GAA, GAG, GAT20.组氨酸:Codon for histidine, Codon for asparagine四、密码子的特性与应用密码子具有以下特性:1.通用性:密码子在不同生物体之间具有通用性,但存在一定的差异。
分子生物学密码子
分子生物学中的密码子(codon)是指信使RNA(mRNA)分子中每相邻的三个核苷酸编成一组,在蛋白质合成时,代表某一种氨基酸的规律。
信使RNA在细胞中能决定蛋白质分子中的氨基酸种类和排列次序。
信使RNA分子中的四种核苷酸(碱基)的序列能决定蛋白质分子中的20种氨基酸的序列。
而在信使RNA分子上的三个碱基能决定一个氨基酸。
密码子有以下特点:
1. 每个密码子三联体(triplet)决定一种氨基酸。
一个氨基酸若有几个不同的密码子,大多前面两个核苷酸相同,只是第3个核苷酸有差异。
它除了能降低突变所造成的损害外,还可减少所需的tRNA种类。
2. 理化性质相近的氨基酸的密码子排列较近,有利于在基因突变时。
3. mRNA上的密码子是连续的,两个密码子之间没有任何成分分割,即无间断讯号。
4. 起始密码子和终止密码子:肽链合成的第一个氨基酸都是Met(蛋氨酸或fMet)。
AUG(真核生物有时候也用CUG)是起始密码子,也是Met的密码子,具有兼职性。
密码子UAA,UAG,UGA是肽链成的终止密码,不代表任何氨基酸,也称无意义密码子(UAA终止效率最高,UAG最低)。
以上信息仅供参考,建议查阅生物专业书籍或者咨询专业人士获取更全面和准确的信息。
遗传信息、密码子(遗传密码)、反密码子的区别项目比较遗传信息遗传密码(密码子)反密码子
概念基因中脱氧核苷酸的
排列顺序(RNA病毒
除外)mRNA中核糖核苷酸
的排列顺序,其中决定
一个氨基酸的三个相
邻碱基是一个密码子
tRNA一端与密码子对
应的三个相邻碱基
位置在DNA上(RNA病毒
除外)
在mRNA上在tRNA上
作用决定蛋白质中氨基酸
序列的间接模板决定蛋白质中氨基酸
序列的直接模板
识别mRNA上的密码
子,运载氨基酸
遗传密码的特性
(1)密码子:有2个起始密码子(AUG GUG),有与之对应的氨基酸。
有3个终止密码子(UAA UAG UGA),没有对应的氨基酸,所以,在64个遗传密码子中,能决定氨基酸的遗传密码子只有61个。
(2)通用性:地球上几乎所有的生物共用一套密码子表。
(3)简并性:一种氨基酸有两种以上的密码子的情况。
意义:在一定程度上能防止由于碱基的改变而导致的遗传信息的改变。
遗传信息、遗传密码子、反密码子的比较
比较项目遗传信息遗传密码子反密码子位置DNA mRNA tRNA
含义DNA上碱基对或脱氧
核苷酸的排列顺序mRNA上决定一个氨
基酸或提供转录终止
信号的3个相邻的碱
基
tRNA上的可以与
mRNA上的密码子互
补配对的3个碱基
种类4n种
(n为碱基对的数目)64种,其中决定氨基
酸的密码子
有61种(还有3个终
止密码子,不对应氨基
61种。
氨基酸密码子及逆密码子表遗传密码又称密码子、遗传密码子、三联体密码,是指信使RNA(mRNA)分子上沿5'端到3'端方向,由起始密码子AUG开始,每三个核苷酸组成的三联体。
它决定肽链上每一个氨基酸和各氨基酸的合成顺序,以及蛋白质合成的起始、延伸和终止。
首个密码子是由美国科学家尼伦伯格于1961年完成。
尼伦伯格在无细胞系统环境下,将一条只由尿嘧啶组成的RNA体外翻译成一条只有苯丙氨酸(Phe)组成的多肽,由此破译了首个密码子(UUU -> Phe),随后科学家科拉纳破译了其余的密码子。
下表列举了标准的密码子表,包含了64种密码子及其配对的氨基酸。
密码子表第二位碱基第二位碱基第二位碱基第二位碱基U C A G第一位碱基UUUU (Phe/F)苯丙氨酸UCU (Ser/S)丝氨酸UAU (Tyr/Y)酪氨酸UGU (Cys/C)半胱氨酸UUC (Phe/F)苯丙氨酸UCC (Ser/S)丝氨酸UAC (Tyr/Y)酪氨酸UGC (Cys/C)半胱氨酸UUA (Leu/L)亮氨酸UCA (Ser/S)丝氨酸UAA (终止)UGA (终止) UUG (Leu/L)亮氨酸UCG (Ser/S)丝氨酸UAG (终止)UGG (Trp/W)色氨酸第一位碱基CCUU (Leu/L)亮氨酸CCU (Pro/P)脯氨酸CAU (His/H)组氨酸CGU (Arg/R)精氨酸CUC (Leu/L)亮氨酸CCC (Pro/P)脯氨酸CAC (His/H)组氨酸CGC (Arg/R)精氨酸CUA (Leu/L)亮氨酸CCA (Pro/P)脯氨酸CAA (Gln/Q)谷氨酰胺CGA (Arg/R)精氨酸CUG (Leu/L)亮氨酸CCG (Pro/P)脯氨酸CAG (Gln/Q)谷氨酰胺CGG (Arg/R)精氨酸第一位碱基AAUU (Ile/I)异亮氨酸ACU (Thr/T)苏氨酸AAU (Asn/N)天冬酰胺AGU (Ser/S)丝氨酸AUC (Ile/I)异亮氨酸ACC (Thr/T)苏氨酸AAC (Asn/N)天冬酰胺AGC (Ser/S)丝氨酸AUA (Ile/I)异亮氨酸ACA (Thr/T)苏氨酸AAA (Lys/K)赖氨酸AGA (Arg/R)精氨酸AUG (Met/M)甲硫氨酸(起始)ACG (Thr/T)苏氨酸AAG (Lys/K)赖氨酸AGG (Arg/R)精氨酸第一位碱基GGUU (Val/V)缬氨酸GCU (Ala/A)丙氨酸GAU (Asp/D)天冬氨酸GGU (Gly/G)甘氨酸GUC (Val/V)缬氨酸GCC (Ala/A)丙氨酸GAC (Asp/D)天冬氨酸GGC (Gly/G)甘氨酸GUA (Val/V)缬氨酸GCA (Ala/A)丙氨酸GAA (Glu/E)谷氨酸GGA (Gly/G)甘氨酸GUG (Val/V)缬氨酸GCG (Ala/A)丙氨酸GAG (Glu/E)谷氨酸GGG (Gly/G)甘氨酸为了方便查询,下表列举了每个氨基酸的逆密码子表,方便快速定位某个氨基酸对应的密码子逆密码子表Alanine Ala A GCU,GCC,GCA,GCG酸精氨Arginine Arg R CGU,CGC,CGA,CGG,AGA,AGG 酸天冬Asparagine Asn N AAU,AAC酰胺天冬Asparticacid Asp D GAU,GAC氨酸半胱Cystine Cys C UGU,UGC氨酸谷氨Glutamicacid Glu E GAA,GAG酸谷氨Glutarnine Gln Q CAA,CAG酰胺甘氨Glycine Gly G GGU,GGC,GGA,GGG酸组氨Histidine His H CAU,CAC酸异亮Isoleucine Ile I AUU,AUC,AUA氨酸亮氨Leucine Leu L UUA,UUG,CUU,CUC,CUA,CUG 酸赖氨Lysine Lys K AAA,AAG酸蛋氨Methionine Met M AUG酸苯丙Phenylalanine Phe F UUU,UUC氨酸脯氨Proline Pro P CCU,CCC,CCA,CCG酸丝氨Serine Ser S UCU,UCC,UCA,UCG,AGU,AGC 酸苏氨Threonine Thr T ACU,ACC,ACA,ACG酸色氨Tryptophan Trp W UGG酸酪氨Tyrosine Tyr Y UAU,UAC 酸缬氨Valine Val V GUU,GUC,GUA,GUG 酸起始密码AUG子终止UAG,UGA,UAA 密码子下面的圆盘图更直观地展示的密码子的分布图。
遗传密码子表
遗传密码子表
第一个核苷酸(5′
端)
第二个核苷酸第三个核苷酸(3′
端)
U C A G
U 苯丙氨酸丝氨酸酪氨酸半胱氨酸U 苯丙氨酸丝氨酸酪氨酸半胱氨酸 C 亮氨酸丝氨酸终止码终止码 A 亮氨酸丝氨酸终止码色氨酸G
C 亮氨酸脯氨酸组氨酸精氨酸U 亮氨酸脯氨酸组氨酸精氨酸 C 亮氨酸脯氨酸谷氨酰胺精氨酸 A 亮氨酸脯氨酸谷氨酰胺精氨酸G
A 异亮氨酸苏氨酸天冬酰胺丝氨酸U 异亮氨酸苏氨酸天冬酰胺丝氨酸 C 异亮氨酸苏氨酸赖氨酸精氨酸 A 蛋氨酸苏氨酸赖氨酸精氨酸G
G 缬氨酸丙氨酸天冬氨酸甘氨酸U 缬氨酸丙氨酸天冬氨酸甘氨酸 C 缬氨酸丙氨酸谷氨酸甘氨酸 A 缬氨酸丙氨酸谷氨酸甘氨酸G
AUG位于mRNA启动部位时为启动信号。
真核生物中此密码子代表蛋氨酸,原核生物中代表甲酰蛋氨酸。
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密码子的简并名词解释密码子是由DNA分子编码的生物信息的基本单位,它决定了蛋白质的合成。
密码子的简并(codon degeneracy)指的是一个氨基酸可以由多个不同的密码子编码。
在基因组中,这种简并性极大地增加了遗传密码的灵活性,提供了一个错误校正和容错的机制。
为了理解密码子的简并,我们首先需要了解基因组的组成。
DNA由四种碱基(腺嘌呤,胸腺嘧啶,鸟嘌呤和胞嘧啶)组成,以不同的组合形式编码了氨基酸。
每个密码子由三个碱基组成,因此存在64种不同的密码子。
然而,氨基酸只有20种,因此存在部分密码子被多个氨基酸共享的情况。
密码子的简并性是由遗传密码的非均一性所导致的。
遗传密码是蛋白质合成的基础,它规定了每个密码子对应的氨基酸。
虽然有些氨基酸只能被一个特定的密码子编码,但大多数氨基酸都具有多个密码子编码。
例如,色氨酸和蛋氨酸只由一个密码子编码,而丙氨酸、组氨酸和丝氨酸则由两个密码子编码。
这种简并性使得一段DNA序列中的一个碱基突变不会改变对应的氨基酸。
密码子的简并性对生物体的进化具有重要意义。
简并使基因组能够容忍突变,从而增加了个体的适应能力和生存能力。
突变是生物进化的基础,它是DNA序列发生变化的结果。
突变可能是有害的,但也可能是有益的。
密码子的简并性保证了当一个密码子发生突变时,它仍然可以编码相同的氨基酸,从而避免了对蛋白质结构和功能的严重影响。
密码子的简并性还使得进化过程中产生新的蛋白质变体成为可能。
当一个密码子对应的氨基酸发生突变时,这可能导致新的蛋白质形成。
这些新的蛋白质变体可能具有不同的功能和特性,从而为进化提供了更多的可能性。
在生物学研究中,对密码子的简并性的了解至关重要。
研究人员可以通过分析DNA序列的简并性来预测蛋白质的合成和功能。
此外,对密码子的简并性的深入研究还可以揭示生物体进化的机制和过程。
总结起来,密码子的简并性是遗传密码中的重要特性。
它使得DNA序列在缺少准确复制的情况下仍能保持氨基酸的编码一致性。
1.遗传密码子表第一个核苷酸(5′端)第二个核苷酸第三个核苷酸(3′端)U C A GU 苯丙氨酸丝氨酸酪氨酸半胱氨酸U 苯丙氨酸丝氨酸酪氨酸半胱氨酸 C 亮氨酸丝氨酸终止码终止码 A 亮氨酸丝氨酸终止码色氨酸GC 亮氨酸脯氨酸组氨酸精氨酸U 亮氨酸脯氨酸组氨酸精氨酸 C 亮氨酸脯氨酸谷氨酰胺精氨酸 A 亮氨酸脯氨酸谷氨酰胺精氨酸GA 异亮氨酸苏氨酸天冬酰胺丝氨酸U 异亮氨酸苏氨酸天冬酰胺丝氨酸 C 异亮氨酸苏氨酸赖氨酸精氨酸 A 蛋氨酸苏氨酸赖氨酸精氨酸GG 缬氨酸丙氨酸天冬氨酸甘氨酸U 缬氨酸丙氨酸天冬氨酸甘氨酸 C 缬氨酸丙氨酸谷氨酸甘氨酸 A 缬氨酸丙氨酸谷氨酸甘氨酸GAUG位于mRNA启动部位时为启动信号。
真核生物中此密码子代表蛋氨酸,原核生物中代表甲酰蛋氨酸。
2.氨基酸的特性氨基酸名称三字母缩写单字母缩写质量侧链电离的pHa值结构式丙氨酸(alanine)Ala A 89.09精氨酸Arg R 174.2 12.48 (arginine)天冬酰氨Asn N 132.1 (asparagine)天冬氨酸Asp D 133.1 3.86 (asparticacid)半胱氨酸Cys C 121.12 (systeine)谷氨酰胺Gln Q 146.15 (glutamine)谷氨酸Glu E 147.13 4.25 (glutamicacid)甘氨酸Gly G 75.07 (glycine)组氨酸His H 155.16 6.0 (histidine)异亮氨酸lle I 131.17 (isoleucine)亮氨酸Leu L 131.17 (leucine)赖氨酸Lys K 146.19 (lycine)甲硫氨酸Met M 149.21 (methionine)苯丙氨酸Phe P 165.19 (phenylanaline)脯氨酸Pro P 115.13 (proline)丝氨酸Ser S 105.06 (serine)苏氨酸Thr T 119.12 (threonine)色氨酸Trp W 204.22 (tryptophan)酪氨酸Tyr Y 181.19 10.07 (tyrosine)缬氨酸(valine)Val P 117.151.核苷三磷酸的物理常数化合物分子量λmax(pH7.0)1摩尔溶液(pH7.0)中λmax时的最大吸收值OD280/OD260ATP 507 259 15400 0.15 CTP 483 271 9000 0.97 GTP 523 253 13700 0.66 UTP 484 262 10000 0.38 dATP 494 259 15200 0.15 dCTP 467 271 9300 0.98 dGTP 507 253 13700 0.66 dTTP 482 267 9600 0.712.常用核酸的长度与分子量核酸核苷酸数分子量λDNA48502(双链环状)3.0×107pBR3224363(双链) 2.8×10628SrRNA4800 1.6×10623SrR3700 1.2×106NA18SrR1900 6.1×105 NA19SrR1700 5.5×105 NA125SrRNA3.6×104tRNA(大肠杆75 2.5×104菌)3.常用核酸蛋白换算数据(1)重量换算1μg=10-6g 1pg=10-12g1ng=10-9g 1fg=10-15g(2)分光光度换算:1A260双链DNA=50μg/ml1A260单链DNA=30μg/ml1A260单链RNA=40μg/ml(3)DNA摩尔换算:1μg 100bp DNA=1.52pmol=3.03pmol末端1μg pBR322 DNA=0.36pmol1pmol 1000bp DNA=0.66μg1pmol pBR322=2.8μg1kb双链DNA(钠盐)=6.6×105道尔顿1kb单链DNA(钠盐)=3.3×105道尔顿1kb单链RNA(钠盐)=3.4×105道尔顿(4)蛋白摩尔换算:100pmol分子量100,000蛋白质=10μg100pmol分子量50,000蛋白质=5μg100pmol分子量10,000蛋白质=1μg氨基酸的平均分子量=126.7道尔顿(5)蛋白质/DNA换算:1kb DNA=333 个氨基酸编码容量=3.7×104MW蛋白质10,000MW蛋白质=270bp DNA30,000MW蛋白质=810bp DNA50,000MW蛋白质=1.35kb100,000MW蛋白质=2.7kb DNA4.常用蛋白质分子量标准参照物(1)高分子量标准参照(2)中分子量标准参照(3)低分子量标准参照肌球蛋白分子量磷酸化酶B 97,400 碳酸酐酶31,00 肌球蛋白212,000 牛血清白蛋白66,200 大豆脻蛋白酶21,500 β-半乳糖甘酶B 116,000 谷氨酶脱氢酶55,000 抑制剂磷酸化酶B 97,400 卵白蛋白42,700 马心肌球蛋白16,900 牛血清白蛋白66,200 醛缩酶40,000 溶菌酶14,400 过氧化氢酶` 57,000 碳酸酐酶31,000 肌球蛋白(F1)8,100 醛缩酶40,000 大豆脻蛋白酶21,500 肌球蛋白(F2)6,200抑制剂肌球蛋白(F3)2,500溶菌酶14,4005.常用蛋白质等电点参考值(单位:pH)蛋白质等电点蛋白质等电点鲑精蛋白[salmine] 12.1 α1-粘蛋白[α1-mucoprotein] 1.8-2.7 鲱精蛋白[clupeine] 12.1 卵黄类粘蛋白[vitellomucoid] 5.5鲟精蛋白[sturline] 11.71 尿促性腺激素[urinary3.2-3.3gonadotropin]胸腺组蛋白[thymohistone] 10.8 溶菌酶[lyso zyme] 11.0-11.2 珠蛋白(人)7.5 肌红蛋白[myoglobin] 6.99 [globin(human)]7.07卵白蛋白[ovalbuin] 4.71; 4.59 血红蛋白(人)[hemoglobin(human)]伴清蛋白[conal bumin] 6.8;7.1 血红蛋白(鸡)[hemoglobin(hen)] 7.23血清白蛋白[serum albumin] 4.7-4.9 血红蛋白(马)[hemoglobin(horse)]6.92肌清蛋白[myoal bumin] 3.5 血蓝蛋白[hemerythrin] 4.6-6.4 肌浆蛋白[myogen A] 6.3 蚯蚓血红蛋白[chlorocruorin] 5.6β-乳球蛋白[β-lactoglobulin]5.1-5.3 血绿蛋白[chlorocruorin] 4.3-4.5卵黄蛋白[livetin] 4.8-5.0 无脊椎血红蛋白[erythrocruorins]4.6-6.2γ1—球蛋白(人)[γ1-globulin(human)]5.8;6.6 细胞色素C[cytochrome C] 9.8-10.1γ2—球蛋白(人)[γ2-globulin(human)]7.3;8.2 视紫质[rhodopsin] 4.47-4.57 肌球蛋白A[myosin A] 5.2-5.5 促凝血酶原激酶[thromboplastin] 5.2原肌球蛋白[myosin A] 5.1 α1-脂蛋白[α1-lipoprotein] 5.5铁传递蛋白[siderophilin] 5.9 β1-脂蛋白[β1-lipoprotein] 5.4胎球蛋白[fetuin] 3.4-3.5 β-卵黄脂磷蛋白[β-lipovitellin]5.9血纤蛋白原[fibrinogen] 5.5-5.8 芜菁黄花病毒[turnip yellowvvirus]3.75α-眼晶体蛋白[α-crystallin]4.8 牛痘病毒[vaccinia virus]5.3β-眼晶体蛋白[β-crystallin]6.0 生长激素[somatotropin] 6.85胰岛素[insulin] 5.35 催乳激素[prolactin] 5.73花生球蛋白[arachin] 5.1 胃蛋白酶[pepsin] 1.0左右伴花生球蛋白[conarrachin] 3.9 糜蛋白酶(胰凝乳蛋白酶[chymotrypsin]8.1角蛋白类[keratins] 3.7-5.0 牛血清白蛋白[bovine serumalbumin]4.9还原角蛋白[keratein] 4.6-4.7 核糖核酸酶(牛胰)[ribonuclease或Rnase(bovine pancreas)]7.8胶原蛋白[collagen] 6.5-6.8 甲状腺球蛋白[thyroglobulin] 4.58鱼胶[ichthyocol] 4.8-5.2 胸腺核组蛋白[thymonucleohistone]4左右白明胶[gelatin] 4.7-5.0 β-酷蛋白[β-casein] 4.5α-酷蛋白[α-casein] 4.0-4.1 γ-酷蛋白[γ-casein] 5.8-6.0 α-卵清粘蛋白[α-ovomucoid]3.83-4.416.常用DNA分子量标准参照物λDNA/Hi ndⅢλDNA/EcoRⅠλ/HindⅢ+EcoRⅠpBR322/HaeⅢ23130 21226 21227 587 123 9416 7421 5148 405 104 6557 5804 4973 504 89 4361 5643 4268 458 80 2322 4843 3530 434 64 2027 3530 2027 267 57 564 1904 234 51 125 1584 213 211375 192 18974 184 11831 124 75641257.核苷和脱氧核苷三磷酸的物化常数化合物相对分子质量最大吸收波长(pH7)×10-3摩尔消光系数(pH7)吸收比值(280/260)碱基pKaATP 507.2 259 15.4 0.15 4.1CTP 483.2 271 9.1 0.97 4.8GTP 523.2 253 13.7 0.66 3.3,9.3 UTP 484.2 262 10.0 0.38 9.5dATP 491.2 259 15.2 0.15 4.1dCTP 467.2 271 9.1 0.97 4.8dGTP 507.2 253 13.7 0.67 3.3,9.3 TTP 482.2 267 9.6 0.73 9.38.嘌呤、嘧啶碱基、核苷和核苷酸相对分子质量嘌呤、嘧啶碱基核苷核苷酸H-型Na2-型腺嘌呤135.11 腺苷267.24 腺苷酸347.22 391.22 鸟嘌呤151.15 鸟苷283.26 二磷酸腺苷427.20黄嘌呤152.11 黄苷284.24 三磷酸腺苷507.20次黄嘌呤136.11 次黄苷268.24 3’,5’-环腺苷酸329.20胞嘧啶111.10 胞苷243.23 鸟苷酸363.24 407.22 尿嘧啶112.09 尿苷244.20 肌苷酸348.22胞腺嘧啶126.11 脱氧腺苷251.24 尿苷酸323.21 367.31 脱氧鸟苷267.24 脱氧腺苷酸324.18 368.18脱氧肌苷252.24 脱氧鸟苷酸331.22脱氧胞苷227.22 脱氧胞苷酸347.23脱氧尿苷228.20 脱氧胞腺苷酸307.20脱氧胸腺苷242.223 332.211.放射性核素衰变表3H35S32P125I131I时间(年)剩余活性(%)时间(年)剩余活性(%)时间(年)剩余活性(%)时间(年)剩余活性(%)时间(年)剩余活性(%)194.5298.4195.3495.50.298.3 289.3596.1290.8891.20.496.6 384.41092.3386.51287.10.695.0 479.81588.7482.51683.1 1.091.8 575.42085.3578.52079.4 1.687.2 671.32582.0674.82475.8 2.381.2 767.43178.1771.22872.4 3.176.7 863.73774.5867.83269.1 4.071.0 960.24371.0964.73666.0 5.065.2 1056.95067.01061.24063.0 6.159.3 1153.85763.61158.74460.27.353.4 1250.96559.61255.94857.48.150.0 12.350.07356.01353.25254.88152.51450.75652.487.150.014.350.06050.02.放射性测定单位单位定义换算吸收放射线剂量(拉得rad)100尔格/克(电离辐射传给单位质量物质的能量)0.87rad=1r伦琴(r)使1克空气产生1.6×1012离子对的X或γ-射线的照射剂量r/0.87=1rad居里(Ci)每秒放射性衰变3.7×1010个原子的量1Ci=103mCi=106μCi 毫居(mCi)千分之一居里1mCi=10-3Ci=103μCi 微居(μCi)百万分之一居里(每分钟衰变2.2×106次)1μCi=10-6Ci=10-3M Ci 伯克莱尔(Bq)每秒衰变1个原子的量1Bq=3.7×10-10Ci千伯克莱尔(kBq)1kBq=103Bq百万伯克莱尔(MBq)1MBq=106Bq兆伯克莱尔(GBq)1GBq=109Bq每分钟衰变数(dpm)每分钟衰变的原子数 2.2×106dpm=1μCi每分钟计数(cpm)测量仪测出每分钟β粒子数Cpm=dpm×计数器效率常用的缓冲液[作者:佚名转贴自:本站原创更新时间:2004-3-25 编辑:supi]常用缓冲溶液的配制方法测序凝胶加样缓冲液常用的电泳缓冲液2×SDS凝胶加样缓冲液凝胶加样缓冲液各种pH值的Tris缓冲液常用缓冲液的pKa值温度对常用缓冲液pH的影响标准缓冲液pH值与温度对照表常用作缓冲剂的酸解离常数1.常用缓冲溶液的配制方法(1)甘氨酸–盐酸缓冲液(0.05mol/L)X毫升0.2 mol/L甘氨酸+Y毫升0.2 mol/L HCI,再加水稀释至200毫升pH X Y pH X Y2.0 50 44.03.0 50 11.42.4 50 32.43.2 50 8.22.6 50 24.23.4 50 6.42.8 50 16.83.6 50 5.0甘氨酸分子量 = 75.07,0.2 mol/L甘氨酸溶液含15.01克/升。
看懂遗传密码蛋白质合成的字母表遗传密码是指在生物体中,RNA分子通过识别DNA上的密码编码信息,并将其转化为特定的氨基酸序列,进而参与蛋白质的合成过程。
这个过程中,存在着一种由三个碱基组成的密码字母表,被称为遗传密码。
遗传密码的破译对于我们理解生命的起源和发展过程具有重要意义。
本文将详细解读遗传密码的组成和遗传密码蛋白质合成的过程。
一、遗传密码的组成遗传密码是由四种碱基(腺嘌呤、胸腺嘧啶、鸟嘌呤和胞嘧啶)组成的,通过它们按照特定的规则排列组合,可以编码出20种常见的氨基酸。
具体组成如下:腺嘌呤(A):- AAA:赖氨酸(Lys)- AAC:天冬氨酸(Asp)- AAG:天冬氨酸(Asp)- AUG:蛋氨酸(Met)胸腺嘧啶(T):- UAA:终止密码子- UAC:酪氨酸(Tyr)- UAG:终止密码子- UGU:硫氨酸(Cys)鸟嘌呤(G):- GAA:谷氨酸(Glu)- GAC:天冬氨酸(Asp)- GAG:谷氨酸(Glu)- GGU:甘氨酸(Gly)胞嘧啶(C):- CAA:谷氨酰胺(Gln)- CAC:组氨酸(His)- CAG:谷氨酰胺(Gln)- CGU:精氨酸(Arg)通过将这些碱基按照特定的编码规则排列组合,生物体能够合成出各种各样的蛋白质。
二、遗传密码蛋白质合成的过程遗传密码蛋白质合成的过程主要包括转录和翻译两个阶段。
1. 转录(Transcription)转录是遗传密码蛋白质合成的第一步,即将DNA上的遗传信息转录成RNA分子。
转录过程主要包括以下几个步骤:(1)启动子结合:RNA聚合酶会在DNA上找到一个称为启动子的特定序列,并与启动因子结合,形成转录复合体。
(2)RNA合成:RNA聚合酶将在DNA的反义链上,根据遗传密码进行配对,将RNA链逆向合成,直到遇到终止密码子。
(3)终止:当RNA聚合酶读取到终止密码子时,RNA链会与DNA分离。
转录过程中生成的RNA分子被称为信使RNA(mRNA),它将作为蛋白质合成的模板。