HBVDNA荧光定量PCR技术
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乙型肝炎病毒(HBV)实时荧光定量PCR[目的要求]掌握血清中HBV-DNA的提取方法及原理;HBV-DNA实时荧光定量PCR的测定原理;HBV-DNA实时荧光定量PCR实验操作及结果分析了解核酸测定引物设计原理;实时荧光定量PCR仪的工作原理及操作。
[教学时数]讲授2学时,实验6学时。
[讲授内容]血清中病毒DNA的提取方法和原理;实时荧光定量PCR的测定原理;核酸测定引物设计原理;HBV-DNA测定引物设计思路;HBV-DNA荧光定量PCR试剂组成、相应作用及反应混合液配制;实时荧光定量PCR仪的工作原理及操作[实验内容]分组提取血清中HBV-DNA;配制反应液并上机操作,实时观察,结果分析;实验结果讨论;实验总结[自学内容]“感染性疾病的分子诊断”实验指导(自编)实验乙型肝炎病毒(HBV)实时荧光定量PCR【原理】Real time PCR 是普通PCR 的一项改进,使用了针对扩增DNA 的荧光物质,使得DNA 的数量与检测到的荧光强度成线性关系,大致得到DNA 的扩增曲线,最后通过标准曲线对未知模板进行定量分析的方法。
即对DNA靶分子的起始拷贝数进行定量的核酸检测。
该方法精确、灵敏、特异性强、污染途径小、自动化程度高、操作简单。
是国际公认的核酸分子定量的标准方法。
它已逐渐代替了Northern blotting 以及semi RT-PCR技术。
本实验从HBV携带者或者乙型肝炎患者血清中抽提HBV基因组DNA,采用核酸扩增结合TaqMan荧光探针技术, 利用一对乙肝病毒特异性引物和一特异性结合于扩增区另一位点的TaqMan探针, 实现对乙肝病毒模板的扩增和检测。
使用商品化试剂盒:HBV实时荧光定量试剂盒,深圳匹基公司(PG,Biotech.)。
针对表面抗原S基因,设计一对引物和一个探针。
TaqMan荧光探针技术中,两个荧光染料标记在探针上,一个叫报告基团(R),一个叫淬灭基团(Q)。
当两个荧光基团都连在探针上时,报告基团的荧光被淬灭基团抑制。
荧光定量PCR检测血清HBV-DNA含量及在乙型肝炎诊断中的应用摘要:目的:分析和研究荧光定量PCR检测血清HBV-DNA含量在乙型肝炎诊断中的应用价值。
方法:对2021年1月到2022年9月前来我院就诊的乙型肝炎患者122例的血清标本进行监测,应用荧光定量PCR检测HBV-DNA的数量予以对比,并且应用ELISA法监测乙型肝炎标志物,分析检测结果。
结果:不同病型乙型肝炎和其HBV-DNA含量没有显著的相关性;49例HBsAg(+)/HBeAg(+)/HBcAb(+)患者,HBV-DNA检出率100%(49/49);48例HBsAg(+)/HBeAb(+)/HBcAb(+)患者,HBV-DNA检出率是66.67%(32/48);6例HBsAg(+)/HBcAb(+)患者,HBV-DNA检出率是66.67%(4/6)。
结论:乙肝病型和血清HBV-DNA水平没有相关性,和HBV-M表现模式有一定的关联;通过荧光定量PCR能够将HBV实际感染及复制状况检测出来,为诊断及治疗乙型肝炎提高参考依据。
关键词:荧光定量PCR检测;血清HBV-DNA含量;乙型肝炎;诊断价值Abstract: Objective: To analyze and study the value of fluorescence quantitative PCR to detect serum HBV-DNA content in the diagnosis of hepatitis B. Methods: The serum samples of 122 patients with hepatitis B who came to our hospital from January 2021 to September 2022 were monitored, and the amount of HBV-DNA was detected by fluorescence quantitative PCR to compare, and the hepatitis B markers were monitored by ELISA, and the detection results were analyzed. Results: There was no significant correlation between HBV-DNA content and different hepatitis B types. In 49 HBsAg (+)/HBeAg (+)/HBcAb (+) patients, HBV-DNA detection rate was 100% (49/49). In 48 HBsAg (+)/HBeAb (+)/HBcAb (+) patients, the detection rate of HBV-DNAwas 66.67% (32/48). In 6 HBsAg (+)/HBcAb (+) patients, the detection rate of HBV-DNA was 66.67% (4/6). Conclusion: There is no correlation between hepatitis B type and serum HBV-DNA level, and there is acertain correlation with HBV-M expression pattern. The actualinfection and replication status of HBV can be detected byfluorescence quantitative PCR, which can improve the reference for diagnosis and treatment of hepatitis B.Key words: fluorescence quantitative PCR detection; Serum HBV-DNA content; Hepatitis B; Diagnostic value乙肝属于临床中比较常见的疾病,在感染乙型肝炎病毒(HBV)时候,患者外周血内的HBV DNA属于病毒复制活动非常可靠与直接的标志,血清拷贝量于疾病进展、转归和治疗中有非常重要的作用【1-2】。
两种荧光定量PCR试剂检测HBV-DNA的比较与评价近年来,随着分子生物学和生物技术的发展,PCR(聚合酶链反应)技术日益成为分子生物学和生物医学领域中的重要工具。
特别是在病毒感染的检测和诊断中,PCR技术被广泛应用。
HBV-DNA是乙型肝炎病毒的DNA,而HBV-DNA的检测对于乙型肝炎的诊断和治疗至关重要。
而在PCR技术中,荧光定量PCR是一种常用的方法。
在本文中,我们将比较和评价两种荧光定量PCR试剂检测HBV-DNA的效果,为临床诊断提供参考。
让我们了解一下两种荧光定量PCR试剂的原理和特点。
第一种试剂使用的是探针法,这是一种利用双探针技术测定HBV-DNA含量的方法。
它结合了两种荧光探针技术:TaqMan和MGB(minor groove binder)。
这种试剂可以通过测定DNA探针的荧光信号来定量检测HBV-DNA,具有灵敏度高、特异性好的特点。
第二种试剂则采用SYBR Green I技术,它是一种利用DNA结合荧光染料的方法。
在PCR过程中,SYBR Green I可以结合到双链DNA并发出荧光信号,从而实现对HBV-DNA的定量检测。
这种试剂具有操作简便、成本低廉的特点。
接下来,让我们比较两种试剂在检测HBV-DNA方面的性能差异。
首先是灵敏度方面,探针法的灵敏度相对更高,可以实现对低浓度HBV-DNA的检测。
而SYBR Green I技术在低浓度样本的检测中相对较弱。
其次是特异性方面,探针法由于其双探针技术的特点,对非特异性反应的抑制能力更强,特异性更好。
而SYBR Green I技术在某些情况下可能存在非特异性反应。
探针法需要设计特异性探针,成本较高,而SYBR Green I技术只需要通用引物,成本较低。
两种方法在操作难度和实验流程上也有所不同,探针法操作相对繁琐,需要精准的探针设计和合成,而SYBR Green I技术操作相对简单,适合高通量实验。
综合以上比较,我们可以得出结论:两种荧光定量PCR试剂在检测HBV-DNA方面都具有优势和劣势,应根据实际需求选择适合的试剂。
酶联免疫吸附检测HBV与荧光定量PCR检测HBV—DNA目的:探讨并总结比较酶联免疫吸附(ELISA)检测HBV与荧光定量PCR 检测HBV-DNA这两种方法的临床效果及其关系。
方法:从近三年来笔者所在医院就诊的乙肝患者中随机选择150例作为试验组,并选择150例健康人作为对照组。
分别用酶联免疫吸附(ELISA)检测试验对象血清中HBV-DNA的含量和荧光定量PCR检测HBV-DNA的含量,并作对比分析。
结果:酶联免疫吸附试验检测的HBV各种模式的标志物阳性的血清中荧光定量PCR均可检测出HBV-DNA,但是在不同的标志物阳性的血清中所检测出的HBV-DNA的量不一样。
在健康对照组的150例受检者血清中的HBV-DNA的阳性率为0。
结论:酶联免疫吸附试验可以检测乙肝五项指标为乙肝的感染提供间接地证据,荧光定量PCR检测HBV-DNA可以更灵敏、更准确地反应HBV的感染程度、复制以及病程的变化,对乙肝的诊断、治疗以及药效评价有很好的临床意义和推广价值。
标签:酶联免疫吸附试验;HBV;荧光定量PCR技术;HBV-DNA传统诊断乙型肝炎病毒感染的方法为酶联免疫吸附试验,它可以检测患者血清中的特异性抗原和抗体,以此来判断患者有无被感染。
而传统的PCR检测技术可以判断病毒的复制程度,但是不能进行定量的检测[1]。
为了可以对乙型肝炎病毒感染的患者的感染程度进行定性和定量的分析,笔者采用荧光定量PCR 的技术对150例乙型肝炎的患者和健康对照组试验对象的血清标本进行HBV-DNA的测定,并与酶联免疫吸附试验的测定结果进行对比分析研究,现作如下报告。
1 资料与方法1.1 一般资料从近三年笔者所在医院就诊的乙肝患者中随机选择150例为试验组,其中男89例,女61例,年龄10~60岁,平均34.3岁,病程为6个月~25年,平均为15.2年。
对照组的150例患者中男84例,女66例,年龄8~62岁,平均年龄32.3岁,病程为6个月~24年,平均为14.3年。
1 目的规范LightCycler荧光PCR检测仪检测乙型肝炎病毒(HBV-DNA)的检验工作,指导检验人员正确进行乙肝病毒核酸定量的检测,保证检验结果的质量。
2 范围本规程适用于LightCycler荧光PCR检测仪检测乙型肝炎病毒(HBV-DNA)3 试剂中山大学达安基因公司乙肝病毒(HBV)核酸扩增荧光检测试剂盒4 仪器Roche LightCycler荧光PCR检测仪高速台式冷冻离心机微量加样器(覆盖1-1000μl)5 样品处理样品处理按《PCR实验室标本处理规程》进行收集和处理,具体操作见本规程附录1和附录2。
6 测定6.1 PCR扩增6.1.1 打开稳压器电源,再打开计算机电源。
6.1.2 打开扩增仪电源,按仪器操作规程进入扩增循环条件设定。
6.1.3 将循环条件设定为:6.1.4 检查反应管是否盖紧,以免荧光物质泄漏污染仪器。
6.1.5 将待反应的PCR反应管放入扩增仪中,并根据实际情况和仪器操作规程在程序中定好反应孔位置。
6.1.6 关闭扩增仪盖,按仪器操作规程开始循环。
6.1.7 扩增结束后关闭扩增仪电源,取出PCR反应管,密封放入垃圾桶。
6.2 产物分析6.2.1 条件设置:反应结束后自动保存检测数据文件,调整荧光数值为F1/F2。
点击Quantification读取结果。
6.2.2 基线的确定:取3~8个循环的荧光信号。
6.2.3 噪声容限(阈值):调节在阴性质控品以上,要求在Step3:Analysis下相关性r值<-0.97,接近-1.0。
6.2.4 对照标准:保证阴性质控品的Ct值不出现任何数值(默认为40)。
6.2.5 最后记录仪器自动分析计算出的未知标本数值(M),关闭计算机。
7结果判断7.1 如果Ct值=40,则实验样品的UU DNA含量(基因拷贝数/ml)<1×103。
7.2 如果Ct值<40,则实验样品的UU DNA含量(基因拷贝数/ml)= M7.3 检测样本中核酸阳性时,按实际结果报告;对可疑结果应复查,需要时与临床联系。
高敏 HBV-DNA 实时荧光定量 PCR 检测试剂性能评价【摘要】目的评估实时荧光定量 PCR 法检测乙型肝炎病毒(HBV-DNA)核酸检测试剂的分析性能及结果的临床应用价值。
方法采用咸宁市中心医院收集的高浓度阳性患者标本和国家卫生部临检中心和湖北省临检中心的室间质控样品,对乙型肝炎病毒(HBV-DNA)检测试剂的精密度,正确度,检测限,分析测量范围等性能参数进行性能验证和评估。
结果高浓度(105IU/mL)和低浓度(103IU/mL)的精密度CV均≤5% ,正确度的检测结果符合国家卫生健康委临床检验中心和湖北省临床检验的室间质评要求。
检测下限( 功能灵敏度) 可达到 30I U/ ml,且重复间的 CV 值≤20% ;在在30IU/mL≤HBV DNA≤1.0×108IU/mL,分析测量范围线性关系良好(线性关系系数 R2 = 0. 99)。
结论定量项目检测正式用于检测临床前必须对检测系统的分析性能做充分的评估。
通过实验室验证HBV-DNA实时荧光定量PCR检测试剂可以满足目前乙肝的筛查和临床疗效监测的需求,并且检测过程经济简便,适用于临床的常规检测。
【关键词】乙型肝炎病毒(HBV-DNA);核酸检测;性能验证【关键词】乙型肝炎病毒(HBV-DNA);核酸检测;性能验证中国HBV感染者约9000万例,居于全球之冠[1]。
HBV-DNA检测对乙型肝炎的诊断、治疗过程监测及预后判断都起到重要的指导作用,检测系统性能决定检测结果质量,影响着临床诊断、治疗和预后[2]。
目前各国医学实验室相关法规已将检验方法和检测系统性能验证纳入实验室的管理要求和技术要求的范围内[3]。
传统以检测血清感染标志物来判定HBV感染,无法对患者HBV感染复制作出判断。
乙型肝炎病毒核酸DNA定量检测技术便于对患者体内HBV复制及传染性有更直接的了解。
HBV-DNA阳性作为HBV复制的最可靠指标,也是反映乙肝的感染状态和治疗效果的重要指标,临床上通过直接检测病毒的数量水平真实地反映病毒的感染情况,从而对HBV进行准确诊断、有效治疗、精确预后及新药研制等方面具有重大意义。
一、HBV DNA荧光定量PCR技术(一)标本血清、血浆(其它如组织细胞、乳汁、精子、尿液等体液);标本应封闭保存,特别在夏季,如果标本暴露的过久,开盖保存,很容易出现水分蒸发,检测结果和上一次的检测结果会有较大的差异。
环境条件影响不大,比如保存在-8°、-20°、24°、还是室温,对高中低病毒含量的最后的检测结果影响不是太大,只要封闭保存就可以。
因此可常温运输,但不可泄露。
(二)检测方法国内最常使用PEG (聚乙二醇方法)法进行核酸提取,采用TaqMan 探针进行荧光PCR 扩增。
扩增40 循环进行结果分析,如下图一所示:典型的双S 形的曲线图,越早出现荧光曲线的病毒含量越高,越晚越低。
根据不同的梯度的四个标准品进行定量。
如果血清或标本里面没有病毒,就是一个阴性直线。
最近我们在彻底解决污染问题之后采用扩增50 个循环的方法。
优点是让扩增管里的反应液充分反应,缺点是如果实验室存在一个潜在的污染或操作人员操作习惯不好,很容易出现携带污染,造成假阳性。
对实验室的来说不应该通过减少扩增的循环数来解决污染问题,而应该通过科学的管理,提高试剂的质量,以及养成一个良好的操作习惯,或防污染的习惯来解决假阳性的问题。
增加循环数有利于标本检测结果的判断,这将来可能是实验室发展的一个趋向。
COBAS TaqMan 技术在我们国家已经有好多实验室有这种全自动的核酸提取扩增系统,它的优势重点在于检测病毒含量比较低的血清标本,但是对于病毒含量比较高的,往往出现荧光PCR 竞争的缺点。
图一为:PCR 扩增曲线(三)污染的预防与排除PCR 扩增产物污染是PCR 反应中最主要最常见的污染问题,所以扩增区的仪器如枪头等要注意。
最可能造成PCR 产物污染的形式是气溶胶污染;在空气与液体面摩擦时就可形成气溶胶,在操作时比较剧烈地摇动反应管,开盖时、吸样时及污染进样枪的反复吸样都可形成气溶胶而污染。
据计算一个气溶胶颗粒可含48000 拷贝, 因而由其造成的污染是一个值得特别重视的问题。
乙型肝炎病毒(HBV)核酸定量检测标准操作规程(PCR-荧光探针法)1.目的: 规范乙型肝炎病毒(HBV)核酸定量检测操作流程,保证检测结果的准确性。
2.应用范围: HBV DNA 荧光定量检测。
3.职责:3.1 文件编写:实验室技术员。
3.2 文件审核:实验室主管。
3.3 文件审批:实验室主任。
3.4 执行:PCR实验室所有工作人员。
4. 参考文献:4.1 中山大学达安基因股份有限公司乙型肝炎病毒(HBV)核酸定量检测试剂盒(PCR-荧光探针法)说明书。
4.2 中山大学达安基因股份有限公司核酸扩增荧光检测系统DA7600型使用说明书。
5. 内容:5.1 检测方法:PCR-荧光探针法。
5.2 实验原理:用一对乙型肝炎病毒特异性引物和一条乙型肝炎病毒特异性荧光探针,配以PCR反应液、耐热DNA聚合酶(Taq酶)、核苷酸单体(dNTPs)等成分,通过PCR体外扩增法,即高温变性、低温退火、适温延伸进行DNA扩增,并对PCR全过程进行实时监测,从而定量检测乙型肝炎病毒DNA。
5.3 性能参数:5.3.1 精密度:检测下限为5.0x102IU/ml。
5.3.2 线性范围:1.0x103~1.0x108IU/ml。
5.4 标本采集:由合作单位按照以下要求进行采集5.4.1 标本类型:血清。
5.4.2 标本采集:用一次性无菌注射器抽取受检者静脉血2毫升,注入无菌的干燥玻璃管,室温(22~25℃)放置30~60 min,全血标本可自发完全凝集析出血清,或直接使用水平离心机,1500 rpm离心5min;吸取上层血清,转移至1.5ml灭菌离心管。
5.4.3 标本保存:标本可立即用于测试,也可以保存于-20℃待测,保存期为6个月,应避免反复冻融。
5.4.4 运送条件:标本运送采用0℃冰壶。
5.4.5 标本拒收标准:污染、严重溶血、脂血类或肝素抗凝剂标本。
5.5 设备和试剂:5.5.1 设备: DA7600荧光定量PCR仪、低速水平离心机、生物安全柜、台式高速离心机、移液器、混匀器、恒温水浴箱/干式恒温器、冰箱(4℃、-20℃)、移动/固定紫外灯、冷冻离心机。
两种荧光定量PCR试剂检测HBV-DNA的比较与评价HBV-DNA是指乙型肝炎病毒的DNA,乙型肝炎是一种常见的传染病,严重者可发展为肝硬化和肝癌。
对HBV-DNA进行准确快速的检测对于乙型肝炎的预防和治疗非常重要。
目前,常用的HBV-DNA检测方法之一就是荧光定量PCR法。
本文将对比两种常用的荧光定量PCR试剂对HBV-DNA的检测效果进行评价,以期为临床实验提供参考依据。
一、试剂介绍1. 荧光定量PCR试剂A荧光定量PCR试剂A是一种常用的商业试剂,根据厂家说明书得知,该试剂的检出限为10 IU/ml,检测范围为10-10^8 IU/ml,重现性良好,适用于临床检测。
二、检测原理荧光定量PCR是一种利用PCR技术和荧光探针技术相结合的方法,可以对DNA进行高灵敏度的定量检测。
在HBV-DNA检测中,荧光定量PCR试剂会通过特定的引物和探针对乙型肝炎病毒的DNA进行扩增,并利用荧光信号来定量检测目标DNA的含量。
三、检测结果比较与评价1. 灵敏度比较通过对同一份样本分别使用试剂A和试剂B进行检测,发现试剂A的检出限明显低于试剂B。
在实际应用中,对于低水平的HBV-DNA,试剂A的性能表现更为优越,可以更精准地检测出病毒载量较低的患者。
2. 稳定性比较在长期使用过程中,试剂A和试剂B的稳定性表现出一定的差异。
试剂A在不同存储条件下的试剂稳定性较好,能够保持较长时间的高灵敏度和准确性;而试剂B在长期使用后,可能会出现一定程度的灵敏度下降,需要更频繁地更换试剂批次以保证结果的准确性。
在进行多次重复检测实验后,发现试剂A和试剂B的重现性表现相当,均具有较好的重现性。
这表明无论是试剂A还是试剂B,都可以在不同实验条件下保持较高的结果稳定性,可以满足临床实验的需求。
四、总结与展望通过对试剂A和试剂B的检测结果比较与评价,我们可以得出结论:试剂A相对于试剂B在HBV-DNA定量检测中具有更高的灵敏度和更好的稳定性,能够更准确、更快速地检测出乙型肝炎病毒的DNA含量。
实时荧光PCR定量检测乙型肝炎病毒脱氧核糖核酸的检测及临床意义摘要】目的:探讨乙型肝炎患者体内乙型肝炎病毒(HBV)的实时荧光PCR定量方法及临床意义。
方法:对60例临床血清标本用荧光PCR定量检测的操作方法及临床意义。
结果:乙型肝炎大三阳患者血清HBV DNA检出率为100% ,HBV DNA的对数值为7.2±1.8;小三阳患者血清HBV DNA检出率为64.5% , HBV DNA的对数值为4.9±1.3。
结论:HBV DNA是HBV感染后病毒血症最直接的标志,是判断病毒复制最灵敏的指标,同时也是判断慢性乙型肝炎是否具有活动性的重要指标。
【关键词】实时荧光PCR定量检测;乙型肝炎;病毒脱氧核糖核酸;临床意义【中图分类号】R51 【文献标识码】A 【文章编号】1007-8231(2017)28-0171-02实时荧光PCR定量检测乙型肝炎病毒脱氧核糖核酸(HBV DNA)通常分为二步:首先从标本中提取HBV DNA,然后采用实时荧光PCR扩增 HBV DNA。
目前荧光定量聚合酶链反应(FQ-PCR)检测技术逐渐应用于临床实验诊断[1]。
本实验采用实时荧光定量PCR方法(PCR FQ-PCR)测试了60份临床血清标本结果进行分析。
1.材料与方法1.1 标本来源收集本院住院及门诊收治的乙肝患者血清60份,健康体检者血清60分,其中男40例,女20例,年龄7~80岁。
1.2 标本采集、保存与运送无菌采集静脉血3ml,收集于无菌离心管中(不抗凝或采用EDTA、枸橼酸钠抗凝),室温放置不超过2h,1 600g离心20min,分离血清或血浆,转入无菌离心管中备用。
分离的血浆或血清在4℃保存不应超过24h;-20℃保存不超过3个月;-70℃以下长期保存。
应避免反复冻融。
采用冰壶加冰或泡沫箱加冰密封进行运输。
1.3 方法主反应混合物的配制,从试剂盒中取出HBV PCR反应液、 Taq/UNG酶、HBV荧光探针和MgCl2,室温融化并振荡混匀后,2000r/min离心10s。
一、HBV DNA荧光定量PCR技术(一)标本血清、血浆(其它如组织细胞、乳汁、精子、尿液等体液);标本应封闭保存,特别在夏季,如果标本暴露的过久,开盖保存,很容易出现水分蒸发,检测结果和上一次的检测结果会有较大的差异。
环境条件影响不大,比如保存在-8°、-20°、24°、还是室温,对高中低病毒含量的最后的检测结果影响不是太大,只要封闭保存就可以。
因此可常温运输,但不可泄露。
(二)检测方法国内最常使用PEG(聚乙二醇方法)法进行核酸提取,采用TaqMan探针进行荧光PCR 扩增。
扩增40循环进行结果分析,如下图一所示:典型的双S形的曲线图,越早出现荧光曲线的病毒含量越高,越晚越低。
根据不同的梯度的四个标准品进行定量。
如果血清或标本里面没有病毒,就是一个阴性直线。
最近我们在彻底解决污染问题之后采用扩增50个循环的方法。
优点是让扩增管里的反应液充分反应,缺点是如果实验室存在一个潜在的污染或操作人员操作习惯不好,很容易出现携带污染,造成假阳性。
对实验室的来说不应该通过减少扩增的循环数来解决污染问题,而应该通过科学的管理,提高试剂的质量,以及养成一个良好的操作习惯,或防污染的习惯来解决假阳性的问题。
增加循环数有利于标本检测结果的判断,这将来可能是实验室发展的一个趋向。
COBAS TaqMan技术在我们国家已经有好多实验室有这种全自动的核酸提取扩增系统,它的优势重点在于检测病毒含量比较低的血清标本,但是对于病毒含量比较高的,往往出现荧光PCR竞争的缺点。
图一为:PCR扩增曲线(三)污染的预防与排除PCR扩增产物污染是PCR反应中最主要最常见的污染问题,所以扩增区的仪器如枪头等要注意。
最可能造成PCR产物污染的形式是气溶胶污染;在空气与液体面摩擦时就可形成气溶胶,在操作时比较剧烈地摇动反应管,开盖时、吸样时及污染进样枪的反复吸样都可形成气溶胶而污染。
据计算一个气溶胶颗粒可含48000拷贝,因而由其造成的污染是一个值得特别重视的问题。
标本处理区,包括扩增摸板的制备;PCR扩增区,包括反应液的配制和PCR扩增;产物分析区,凝胶电泳分析,产物拍照及重组克隆的制备。
各工作区要有一定的隔离,操作器材专用,要有一定的方向性。
如:标本制备→PCR扩增→产物分析→产物处理。
切记:产物分析区的产物及器材不要拿到其他两个工作区。
使用一次性吸头,严禁与PCR产物分析室的吸头混用,吸头不要长时间暴露于空气中,避免气溶胶的污染。
(四)常用仪器常用的PCR仪器:ABI系列、罗氏系列、安捷伦系列、国产SLAN等。
(五)临床意义检测血清或血浆HBV DNA阳性有什么临床意义?1.判断血清中是否有HBV DNA的存在我们检测到的HBV DNA包括完整HBV病毒和DNA片段。
目前我们用的HBV DNA荧光PCR法,还不能区分是完整病毒还是片段。
只要检测到的病毒载量在检测线以上就可以定为标本含有HBV DNA。
2.判断抗病毒疗效的评估指标细胞内HBV DNA和HBV DNA确认方法。
病人采用各种抗病毒药物,比如拉米夫定、阿德福韦、恩替卡韦或替米夫定等抗病毒药物,因为这些药可以有效的抑制病毒复制,用药之前或用药之后,病人的血清里或外周血白细胞里是不是还有病毒的存在?病毒下降了多少?是不是有病毒的反弹?这是临床医生关心的问题。
随着抗病毒药物用药时间的延长,有些病人血清里面的HBV DNA一直处于检测线以下。
因此目前临床医生有一些新的需求,就是能不能确认病人血清里究竟有没有HBV DNA。
不同的实验室报告检测低限值不一样,有的实验室报<1000IU,有的实验室报<100IU,COBAS TaqMan<12个,<12个还是有病毒,血清里究竟有多少个?是临床急需的一种HBV DNA确认方法。
即确认血清里面究竟有没有病毒。
现在已经提出一种检测方法。
3.HBV DNA阳性与传染性感染乙肝病毒必须达到一定的量,突破各种屏障(血液里的补体、细胞因子、抗体等),进入肝细胞复制,才能达到传染性的要求,因此并不是接触到病毒都会被感染。
HBeAg的产生与意义→HBeAg与HBV DNA清除的不平衡带来的异常模式→HBsAg的包裹与剪切(完整HBV形成)→不同形式HBsAg的产生与意义。
抗HBc、抗HBe和抗HBs的产生。
四,HBV DNA定量与乙肝血清学模式不同组合的意义。
大三阳(表面抗原、E抗原和核心抗体阳性)并抗HBs阳性:HBsAg/IgM。
E抗原阳性说明病人体内的乙肝病毒处于一种活跃性的复制状态。
这时有的病人合并表面抗体的阳性,是不是获得一定的抵抗力?不是。
表面抗体往往是病毒复制时诱发了机体免疫答应而产生相应的抗体,这个抗体是针对表面抗原的IgM大蛋白抗体。
因此它是机体对乙肝病毒复制免疫反抗的结果。
这时要提高病人或保持病人的免疫功能;小三阳并抗HBs阳性:病毒活动性复制、不同型病毒的感染等;抗HBs或抗HBc与HBV DNA同时阳性:细胞内HBV的释放。
4.血清游离和细胞内HBV检测与抗病毒治疗的关系乙肝病人体内的病毒分成两个病毒状态,一个是游离的病毒,一个是细胞内的病毒,包括肝细胞和血细胞。
游离的病毒意味着要被清除掉的病毒,除了个别的病毒再进入肝细胞,进行感染肝细胞。
而细胞内的病毒与抗病毒治疗的效果更有直接的关系,如果要彻底清除乙肝病毒,最终检测肝脏细胞里病毒是阴性。
但是肝穿只能局限于肝穿的组织,不能代表整个肝脏。
近几年对外周血HBV DNA的研究越来越多,外周血HBV DNA先消失,然后肝细胞游离的DNA再消失。
即通过检测外周血HBV DNA来间接反应肝脏细胞里DNA是不是存在。
虽然不能相互代替,但比血浆里面的DNA更进了一步。
重性肝炎发生胆酶分离,检测不到血清里的病毒,但是外周血里面的HBV DNA反而和胆酶分离之前的水平一致。
有的临床研究数据报道,如果外周血里的HBV DNA逐渐下降或消失,病人基本上得以康复。
外周血HBV DNA的检测对重性肝炎患者的预后判断有重要的意义。
5.血清cccDNA与肝脏组织内cccDNA的不同意义最早的观点认为cccDNA是双价闭环环状DNA,它只在肝细胞里存在。
后来越来越多的研究者发现,血清里不但有cccDNA,而且也有肝组织内的cccDNA。
因为血清里的cccDNA 是从坏死的肝细胞释放出来的,并且它是环状的,不易被蛋白结合,也不易被消化,因此与肝组织内的HBV DNA有着不同的意义。
目前认为血清里的cccDNA存在是病毒启动复制的标志,即病毒正处在复制的上升期,而肝组织内的cccDNA是病毒慢性化的标志。
如果判断抗病毒药物效果,检测血清里的cccDNA没有太多的意义,而肝组织内的cccDNA反而有意义。
即如果外周血HBV DNA已经转移到检测线以下,判断病毒是不是彻底清除?我们要检测肝组织内的cccDNA。
血清cccDNA阳性代表病毒复制处在上升期。
(六)生物暴露与措施1.无损伤暴露部位的清洗方法不同,如果血清溅到衣服上,通过有效的消毒液进行浸泡、清洗,一般浸泡的时间不能低于半个小时;如果溅到皮肤上,直接用洗涤液来洗,不要用力搓,要轻搓,然后用流水冲掉;如果溅到眼睛上,最忌讳的是用力来揉搓眼睛,用清水冲洗,一般病毒很难通过皮肤黏膜。
也要对溅到你眼睛的血浆里做一个鉴定,看看它是不是含有病毒,病毒含量高低。
2.创伤暴露确定污染源HBV含量状态,如果高于104以上,感染的可能性很大,如果低于104以下,感染的可能性非常小。
要在最短时间内要注射有效的高效价免疫球蛋白。
3.特殊人群的讨论孕妇和儿童。
如果孕妇在怀孕以前是乙肝,尽可能建议孕妇通过干扰素或核苷类似物把体内的病毒降到检测线以下,停药3个月再怀孕。
有的孕妇怀孕7、8个月发现自己感染了乙肝,这时不主张终止妊娠,应该保持自身良好的免疫状态和良好的精神状态,在孩子出生以后要第一时间使孩子和母亲的血液脱离,同时对孩子注射高效价免疫球蛋白。
可以对脐血进行检测,脐血里HBV DNA是阴性,孩子就没被感染。
1、HCV RNA(+)和抗HCV(—)是(B)A既往感染B感染的初期C慢性化感染的过程D肝癌的早期2、COBAS TaqMAN技术的优势是(C)A重复性好B灵敏度高C检测病毒含量比较低的血清标本D检测病毒含量比较高的血清标本3、关于HCV RNA核酸提取的注意事项说法错误的是(D)A核酸裂解时间不应太长,避免72℃温育处理B过柱离心时间和速度应均一C洗脱液应加到层析柱中间D配置好的试剂剧烈震荡混均4、下列哪种疾病属于慢性病毒感染(D)A HAVB HEVC SARSD HCV5、国内最常使用的HCV核酸提取方法是(D)A PEGB煮沸法C磁珠吸附法D层析柱法6、PCR反应中最主要最常见的污染问题是(A)A PCR扩增产物污染B标本交叉污染C大片段核酸的污染D反应液污染7、如果抗HBS抗体水平和抗HBV DNA同时很高,应考虑是(A)A不同HBsAg亚型病毒的双重感染B机体免疫清除的重要信息C血清转换的标记D HBV感染急性期8、大三阳并抗HBs阳性说明(D)A细胞内HBV的释放B病毒活动性复制C不同型病毒的感染D抗体是针对表面抗原的IgM大蛋白抗体9、血清游离和细胞内HBV检测与抗病毒治疗的关系说法错误的是(C)A游离的病毒意味着要被清除掉的病毒B细胞内的病毒与抗病毒治疗的效果更有直接关系C肝细胞游离的DNA先消失,然后外周血HBV DNA再消失D检测外周血HBV DNA来间接反应肝脏细胞里DNA是不是存在10、目前临床最常见的ELISA酶标记物是(A)A HRPB APC葡萄糖氧化酶。