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荧光一、定义荧光（fluorescence ）又作“萤光”，是指一种光致发光的冷发光现象。
当某种常温物质经某种波长的入射光（通常是紫外线或X射线）照射，吸收光能后进入激发态，并且立即退激发并发出比入射光的的波长长的出射光（通常波长在可见光波段）；而且一旦停止入射光，发光现象也随之立即消失。
具有这种性质的出射光就被称之为荧光。
二、原理光照射到某些原子时，光的能量使原子核周围的一些电子由原来的轨道跃迁到了能量更高的轨道，即从基态跃迁到第一激发单线态或第二激发单线态等。
第一激发单线态或第二激发单线态等是不稳定的，所以会恢复基态，当电子由第一激发单线态恢复到基态时，能量会以光的形式释放，所以产生荧光。
荧光是物质吸收光照或者其他电磁辐射后发出的光。
大多数情况下，发光波长比吸收波长较长，能量更低。
但是，当吸收强度较大时，可能发生双光子吸收现象，导致辐射波长短于吸收波长的情况发射。
当辐射波长与吸收波长相等时，既是共荧光强度：荧光强度与该种物质的荧光量子产率、消光系数以及含量等因素有关。
荧光量子产率Q：量子产率表示物质将吸收的光能转化为荧光的本领，是荧光物质发出光子数与吸收光子数的比值。
荧光蛋白分子的亮度由其量子产率与消光系数的乘积决定，与成像检测灵敏度密切相关。
三、荧光蛋白1、绿色荧光蛋白（green fluorescent protein,GFP ）在光谱的绿光区（500nm-525nm）已经发现了多种荧光蛋白，而且来源广泛，包括不同种属的Aequorea 、桡足类动物、文昌鱼以及珊瑚。
然而多数有齐聚反应，即使最好的荧光蛋白与EGFP相比，也没有明显的优点。
或许目前活细胞成像最好的选择是GFP 衍生的Emerald（祖母绿），它与EGFP的特性相似。
Emerald包含F64L 和S65T突变，另外还有四个点突变从而改进了折叠、37℃时的突变率以及亮度。
虽然Emerald比EGFP更有效，但含有快速光漂白成分，可能在某些环境下其定量成像会受到影响。
荧光一、定义荧光（fluorescence ）又作“萤光”，是指一种光致发光的冷发光现象。
当某种常温物质经某种波长的入射光（通常是紫外线或X射线）照射，吸收光能后进入激发态，并且立即退激发并发出比入射光的的波长长的出射光（通常波长在可见光波段）；而且一旦停止入射光，发光现象也随之立即消失。
具有这种性质的出射光就被称之为荧光。
二、原理光照射到某些原子时，光的能量使原子核周围的一些电子由原来的轨道跃迁到了能量更高的轨道，即从基态跃迁到第一激发单线态或第二激发单线态等。
第一激发单线态或第二激发单线态等是不稳定的，所以会恢复基态，当电子由第一激发单线态恢复到基态时，能量会以光的形式释放，所以产生荧光。
荧光是物质吸收光照或者其他电磁辐射后发出的光。
大多数情况下，发光波长比吸收波长较长，能量更低。
但是，当吸收强度较大时，可能发生双光子吸收现象，导致辐射波长短于吸收波长的情况发射。
当辐射波长与吸收波长相等时，既是共振荧光。
荧光强度：荧光强度与该种物质的荧光量子产率、消光系数以及含量等因素有关。
荧光量子产率Q：量子产率表示物质将吸收的光能转化为荧光的本领，是荧光物质发出光子数与吸收光子数的比值。
荧光蛋白分子的亮度由其量子产率与消光系数的乘积决定，与成像检测灵敏度密切相关。
三、荧光蛋白1、绿色荧光蛋白（green fluorescent protein,GFP）在光谱的绿光区（500nm-525nm）已经发现了多种荧光蛋白，而且来源广泛，包括不同种属的Aequorea 、桡足类动物、文昌鱼以及珊瑚。
然而多数有齐聚反应，即使最好的荧光蛋白与EGFP相比，也没有明显的优点。
或许目前活细胞成像最好的选择是GFP衍生的Emerald（祖母绿），它与EGFP的特性相似。
Emerald包含F64L 和S65T突变，另外还有四个点突变从而改进了折叠、37℃时的突变率以及亮度。
虽然Emerald比EGFP更有效，但含有快速光漂白成分，可能在某些环境下其定量成像会受到影响。
多种荧光蛋白荧光蛋白是一种广泛应用于生物学研究的蛋白质，它们能够发出绿色、黄色、橙色、红色等不同颜色的荧光，被广泛应用于生物成像、蛋白质定位、蛋白质相互作用等领域。
本文将按照荧光蛋白的类别进行介绍。
1. 绿色荧光蛋白绿色荧光蛋白（GFP）是最早被发现的荧光蛋白，它能够发出绿色荧光。
GFP的发现和研究为生物学研究提供了一种全新的工具，它可以被用于研究蛋白质的定位、表达、交互等方面。
GFP的应用范围非常广泛，它被广泛应用于生物成像、蛋白质定位、蛋白质相互作用等领域。
2. 黄色荧光蛋白黄色荧光蛋白（YFP）是一种能够发出黄色荧光的荧光蛋白，它是GFP的变种。
YFP的发现和研究为生物学研究提供了一种全新的工具，它可以被用于研究蛋白质的定位、表达、交互等方面。
YFP的应用范围非常广泛，它被广泛应用于生物成像、蛋白质定位、蛋白质相互作用等领域。
3. 橙色荧光蛋白橙色荧光蛋白（OFP）是一种能够发出橙色荧光的荧光蛋白，它是GFP的变种。
OFP的发现和研究为生物学研究提供了一种全新的工具，它可以被用于研究蛋白质的定位、表达、交互等方面。
OFP的应用范围非常广泛，它被广泛应用于生物成像、蛋白质定位、蛋白质相互作用等领域。
4. 红色荧光蛋白红色荧光蛋白（RFP）是一种能够发出红色荧光的荧光蛋白，它是GFP的变种。
RFP的发现和研究为生物学研究提供了一种全新的工具，它可以被用于研究蛋白质的定位、表达、交互等方面。
RFP的应用范围非常广泛，它被广泛应用于生物成像、蛋白质定位、蛋白质相互作用等领域。
总结荧光蛋白是一种广泛应用于生物学研究的蛋白质，它们能够发出绿色、黄色、橙色、红色等不同颜色的荧光。
不同颜色的荧光蛋白在生物学研究中有着不同的应用，它们可以被用于研究蛋白质的定位、表达、交互等方面。
荧光蛋白的应用范围非常广泛，它们被广泛应用于生物成像、蛋白质定位、蛋白质相互作用等领域。
荧光一、定义荧光（fluorescence ）又作“萤光”，是指一种光致发光的冷发光现象。
当某种常温物质经某种波长的入射光（通常是紫外线或X射线）照射，吸收光能后进入激发态，并且立即退激发并发出比入射光的的波长长的出射光（通常波长在可见光波段）；而且一旦停止入射光，发光现象也随之立即消失。
具有这种性质的出射光就被称之为荧光。
二、原理光照射到某些原子时，光的能量使原子核周围的一些电子由原来的轨道跃迁到了能量更高的轨道，即从基态跃迁到第一激发单线态或第二激发单线态等。
第一激发单线态或第二激发单线态等是不稳定的，所以会恢复基态，当电子由第一激发单线态恢复到基态时，能量会以光的形式释放，所以产生荧光。
荧光是物质吸收光照或者其他电磁辐射后发出的光。
大多数情况下，发光波长比吸收波长较长，能量更低。
但是，当吸收强度较大时，可能发生双光子吸收现象，导致辐射波长短于吸收波长的情况发射。
当辐射波长与吸收波长相等时，既是共振荧光。
荧光强度：荧光强度与该种物质的荧光量子产率、消光系数以及含量等因素有关。
荧光量子产率Q：量子产率表示物质将吸收的光能转化为荧光的本领，是荧光物质发出光子数与吸收光子数的比值。
荧光蛋白分子的亮度由其量子产率与消光系数的乘积决定，与成像检测灵敏度密切相关。
三、荧光蛋白1、绿色荧光蛋白（green fluorescent protein,GFP）在光谱的绿光区（500nm-525nm）已经发现了多种荧光蛋白，而且来源广泛，包括不同种属的Aequorea 、桡足类动物、文昌鱼以及珊瑚。
然而多数有齐聚反应，即使最好的荧光蛋白与EGFP相比，也没有明显的优点。
或许目前活细胞成像最好的选择是GFP衍生的Emerald（祖母绿），它与EGFP的特性相似。
Emerald包含F64L和S65T突变，另外还有四个点突变从而改进了折叠、37℃时的突变率以及亮度。
虽然Emerald比EGFP更有效，但含有快速光漂白成分，可能在某些环境下其定量成像会受到影响。
荧光蛋白在细胞生物学中的应用荧光蛋白（Fluorescent Protein,简称FP）是一种能够自发发射绿色光的蛋白质，被广泛应用于现代细胞生物学中。
它通过标记蛋白质、表达特定基因等方法，帮助科学家们观察细胞内分子的运动和互动，揭示生命的奥秘。
一、荧光蛋白的发现荧光蛋白最早发现于海葵，由日本科学家上田英寿于1961年发现。
上田利用UV光照射海葵的蛋白质，使其发射出绿色光芒。
这项研究开创了细胞标记的新时代。
后来，科学家发现荧光蛋白并不局限于海葵，许多物种都可以分泌这种神奇的蛋白质。
以青蛙黑脂肪细胞表达重组绿色荧光蛋白（recombinant green fluorescent protein，简称rGFP）为例，可以在细胞内直接观察蛋白质运动以及互相作用的行为。
这一发现在细胞生物学领域引起了巨大的反响，并在细胞物理学、分子生物学和神经生物学等多个领域得到了广泛的应用。
二、荧光蛋白的基本原理荧光蛋白是一种生物发光染料。
它由一个β桶型的结构组成，中心是一个色氨酸残基，周围有11种不同的丙氨酸染色基团。
当光照射到这些染色基团时，它们会吸收光的能量，并释放出一个高能电子。
该电子随后会被传递到色氨酸残基上，释放出一束特定波长的荧光光。
荧光蛋白的行为受许多因素的影响，如环境、 pH值、类似荧光素的色素和其它静电基团的存在。
但是，较为普遍的是，普通的荧光蛋白因环境的不同而发射的光是单一的绿色。
此外，在高温、低氧等恶劣环境下，荧光蛋白的荧光效率会下降。
三、荧光蛋白的应用1. 在体内标记某一分子荧光蛋白可以通过基因工程技术加入到动物或人体细胞内，作为某一个分子的标记。
比如利用绿色荧光蛋白标记肝带状病毒中的核酸，以便直接观察病毒的复制过程。
通过观察荧光信号的强度和时间变化，可以获得关于分子的很多信息，例如空间位置、分布情况和动态变化等。
2. 诊断疾病荧光蛋白在诊断疾病方面也有非常广泛的应用。
例如：可以通过将荧光蛋白与抗体结合，制成检测试剂盒，用于检测蛋白质或病毒的存在与否；或在很小很深的病灶内，通过荧光信号的强度来成像，辅助手术医生进行诊疗。
荧光蛋白发光综述概述荧光蛋白（Fluorescent Protein，简称FP）是一类广泛存在于自然界中的蛋白质分子，是生物体内发光的重要成分。
荧光蛋白因其出色的荧光特性，使其在生物体内作为标记分子被广泛应用于生物成像、生物传感等领域。
本篇文档旨在对荧光蛋白发光的相关原理、特性、应用进行综述。
荧光蛋白发光原理荧光蛋白的发光原理来源于其结构上不寻常的芳香族氨基酸残基，即苯环类物质的氧化形成内酰胺环（chromophore）的化学反应过程。
当荧光蛋白被紫外线或蓝光激发时，荧光蛋白内的染色体蛋白分子发生结构变化，使内酰胺环从原来的蓝黄色变成绿色的荧光，从而发生发光现象。
荧光蛋白的特性荧光蛋白具有以下特性：1.光谱性质分布广泛。
荧光蛋白可以通过改变其结构或化学性质来改变其发光的光谱性质，以适应不同种类的生物体内标记。
2.发光强度高。
荧光蛋白发光强度高，因此可以在低浓度下进行检测。
3.可以与其他分子结合。
荧光蛋白可以与其他分子结合，如酶、抗体等，以达到定位、观察等目的。
4.双光子吸收。
荧光蛋白可通过双光子吸收技术，在低波长激发条件下发射绿色荧光，克服了普通荧光染料激发强度过低等问题。
荧光蛋白在生物标记和成像中的应用荧光蛋白因为其特殊的化学结构和强的荧光特性，被广泛应用于生物标记和成像的领域中。
通过利用荧光蛋白将其连接到所需生物物质上，可以进行细胞、组织和器官在生理活动、发育、病理变化中的追踪和观察，同时荧光蛋白还可以用于微量、高通量的系统生物学中。
极大地促进了相关领域的发展。
荧光蛋白因其独特的结构以及优异的荧光特性而被广泛研究和应用。
作为生物标记和成像领域的重要组成部分，荧光蛋白的应用将在未来继续得到广泛的推广和研究。
荧光蛋白在生命科学中的应用荧光蛋白是一种在生物体中普遍存在的分子，其特殊的荧光性质使得它在生命科学中应用广泛。
从基础研究到应用技术，荧光蛋白都扮演着不可或缺的角色。
一、荧光蛋白的发现荧光蛋白最初是在水母中被发现的。
上世纪60年代，美国科学家奥索瓦尔德（Osawa）等人从普通水母中分离出了发光的物质。
经过进一步的研究，他们发现这种物质是一种蛋白质，并具有绿色荧光。
这一发现引起了生命科学界的广泛关注，并成为荧光蛋白研究的开端。
二、荧光蛋白的性质荧光蛋白主要由氨基酸组成，其中最重要的是蛋白质的折叠结构。
荧光蛋白的核心结构是一个环状的肽链，包含环柄和环尾两个区域。
环柄包含了内外摆动的苯丙氨酸（Tyr）和色氨酸（Trp）残基，而环尾则包含了荧光染色团。
荧光蛋白的最大特点是能够发出光。
它的发光机理是通过吸收外界光束，激发荧光染色团电子的激发，产生高能激发态。
激发态电子回到基态，会释放出光子，产生荧光。
三、荧光蛋白的应用荧光蛋白在生命科学中的应用有很多。
下面将介绍其中的一些典型应用方式。
（一）标记生物分子荧光蛋白可以通过分子生物学方法定向结合到各种生物分子上，如蛋白质、核酸或脂质等。
荧光标记的生物分子可以用于观察细胞活动、分子交互作用、蛋白分泌与合成等过程，以及各种生物反应、生物信号传导等方面的研究。
（二）绿色荧光蛋白绿色荧光蛋白（GFP）是一种最常用的荧光蛋白，被广泛用于分子生物学中。
GFP不仅自带荧光，而且可背离其宿主基因组，作为外源物质独立表达。
因此，将GFP结合到生物体内的特定靶点上，可以标记和追踪生命活动，对生物学研究产生了革命性的影响。
（三）荧光共振能量转移荧光共振能量转移（FRET）是一种非常有效的关于分子间距离和分子间作用的技术。
通过将荧光蛋白标记到生物分子上，可以测量基于FRET技术的分子交互作用，如蛋白质复合物形成和生物反应的过程等，这为分子生物学研究提供了强有力的手段。
（四）荧光细胞成像荧光蛋白广泛用于细胞成像研究。
荧光一、定义荧光（fluorescence ）又作“萤光”，是指一种光致发光的冷发光现象。
当某种常温物质经某种波长的入射光（通常是紫外线或X射线）照射，吸收光能后进入激发态，并且立即退激发并发出比入射光的的波长长的出射光（通常波长在可见光波段）；而且一旦停止入射光，发光现象也随之立即消失。
具有这种性质的出射光就被称之为荧光。
二、原理光照射到某些原子时，光的能量使原子核周围的一些电子由原来的轨道跃迁到了能量更高的轨道，即从基态跃迁到第一激发单线态或第二激发单线态等。
第一激发单线态或第二激发单线态等是不稳定的，所以会恢复基态，当电子由第一激发单线态恢复到基态时，能量会以光的形式释放，所以产生荧光。
荧光是物质吸收光照或者其他电磁辐射后发出的光。
大多数情况下，发光波长比吸收波长较长，能量更低。
但是，当吸收强度较大时，可能发生双光子吸收现象，导致辐射波长短于吸收波长的情况发射。
当辐射波长与吸收波长相等时，既是共振荧光。
荧光强度：荧光强度与该种物质的荧光量子产率、消光系数以及含量等因素有关。
荧光量子产率Q：量子产率表示物质将吸收的光能转化为荧光的本领，是荧光物质发出光子数与吸收光子数的比值。
荧光蛋白分子的亮度由其量子产率与消光系数的乘积决定，与成像检测灵敏度密切相关。
三、荧光蛋白1、绿色荧光蛋白（green fluorescent protein,GFP）在光谱的绿光区（500nm-525nm）已经发现了多种荧光蛋白，而且来源广泛，包括不同种属的Aequorea 、桡足类动物、文昌鱼以及珊瑚。
然而多数有齐聚反应，即使最好的荧光蛋白与EGFP相比，也没有明显的优点。
或许目前活细胞成像最好的选择是GFP衍生的Emerald（祖母绿），它与EGFP的特性相似。
Emerald包含F64L 和S65T突变，另外还有四个点突变从而改进了折叠、37℃时的突变率以及亮度。
虽然Emerald比EGFP更有效，但含有快速光漂白成分，可能在某些环境下其定量成像会受到影响。
下面主要介绍GFP及其衍生型荧光蛋白：（1）来源绿色荧光蛋白最早由美籍日裔科学家下村修于1962年在水母中发现。
这种蛋白质在蓝色波长范围的光照激发下发出绿色荧光，其发光过程需要冷光蛋白质Aequorin的帮助，而且，这个冷光蛋白质可与钙离子（Ca2+）相互作用。
在水母中发现的野生型绿色荧光蛋白的分子量较小，仅为27~30kDa，而编码GFP的基因序列也很短，为2.6kb。
（2）性质GFP由238个氨基酸残基组成。
GFP序列中的65-67位残基（Ser65-Tyr66-Gly67）可自发形成荧光发色基团——对羟基苯咪唑啉酮GFP的激发光谱在400nm附近有一个主激发峰，在470nm附近有一个次激发峰。
发射光谱在505nm附近有一尖锐的主发射峰，在540nm附近有一肩峰GFP的化学性质相当稳定，无光漂白现象（Photobleaching），用甲醛固定和石蜡包埋亦不影响其荧光性质。
在细胞生物学与分子生物学领域中，绿色荧光蛋白基因常被用作报告基因。
（3）野生型野生型GFP（wild type GFP, wtGFP）从一开始就引起了人们极大的兴趣，而且被用作新型的简单报告基因及体内标记，但GFP在异源生物体中的表达并非那么简单。
例如，研究人员很早就发现需要在较高的温度下孵育才能在细胞或生物体中表达GFP，并且wtGFP在37℃的热稳定性差。
这些都阻碍了它在转基因中的应用。
这些难题促使人们进一步筛选分离wtGFP的变体。
现在，人们已经找到了荧光强度更强且更耐热的变体。
这些变体多数为经突变的脱辅基蛋白，它们可防止高温导致的错误折叠。
近年来出现的新型wtGFP基因突变体的激发和发射谱发生了改变，热稳定性和荧光强度得到了提高，GFP报告基因在小鼠中的应用就是以这些变体作为基础的。
（4）增强型绿色荧光蛋白（EGFP）现在，应用最为广泛的是红移变体增强型GFP（EGFP）。
诸如EGFP这些红移变体的最大激发峰发生红向移动，大约为490nm，这一波长也恰好是多数分光设备、流式细胞仪及共聚焦显微镜的常用波长。
EGFP有两个氨基酸突变，当被蓝光激发时，它发出的荧光要比wtGFP亮30-40倍。
wtGFP和包括EGFP在内的多数变体半衰期长，所以不适合精确追踪表达的减少或损耗。
（5）不稳定增强型绿色荧光蛋白（dEGFP）为克服这一问题，人们在1998年构建了不稳定增强型绿色荧光蛋白（dEGFP）。
原理就是将EGFP的cDNA融合到小鼠鸟氨酸脱羧酶（Ornithine decarboxylase, ODC）基因的C-末端。
ODC含有一个PEST序列，这个序列可促进该蛋白在细胞内的降解。
虽然，目前这些不稳定变体还没有在小鼠中应用，但这些变体有利于实时追踪基因表达动力学的研究。
（6）增强型黄色荧光蛋白（EYFP）另一种红移变体是增强型黄色荧光蛋白（EYFP），该变体有四个氨基酸突变。
在527nm时，EYFP的发射光从绿色变为黄绿色。
EYFP荧光的亮度水平与EGFP相当。
EYFP 抗酸性差、对卤化物敏感，使它的应用受到限制。
在EYFP 基础上改进的突变体mCitrine[21]和mVenus[22]是目前应用最多的黄色荧光蛋白。
（7）增强型蓝色荧光蛋白（EBFP）在光谱的另一端是蓝色/蓝绿色变体，包括增强型蓝色荧光蛋白（EBFP）变体。
它有四个氨基酸突变，激发波长和发射波长分别为380nm和440nm。
由于这些突变改进了蛋白折叠和发色团形成的效率，所以也增强了所发出荧光的亮度（与蓝色变体相比）和蛋白溶解性。
但唯一的不足之处，就是EBFP产生的荧光信号大致与wtGFP相当。
蓝色荧光蛋白发光较弱，抗光漂白和抗酸性较差，用于细胞成像时背景信号高。
针对EBFP开发的3个更亮的突变体：Azurite (亮度是EBFP 的1.6 倍)、EBFP2(亮度是EBFP的2倍，mTagBFP(亮度是EBFP的3.7倍)。
最亮的蓝色荧光蛋白。
mTagBFP 是由红色荧光蛋白TagRFP突变而来。
（8）增强型蓝绿色（青色）荧光蛋白（ECFP）增强型蓝绿色荧光蛋白（ECFP）是发出蓝色/蓝绿色荧光的另一种变体，产生的荧光信号要比wtGFP强。
ECFP有六个氨基酸突变（表3），发射光谱从绿色迁移到蓝绿色，最大激波长在433nm（主峰）和453nm（次峰），最大发射在475nm，于510nm处有一肩峰（图11）。
ECFP另一特点是比其它蓝色/蓝绿色变体光漂白效应弱，而且比EBFP的亮度强。
值得一提的是，wtGFP的主要绿色荧光变体，如EGFP等已经在ES细胞、基因打靶和转基因小鼠研究中得到充分应用。
2、蓝色及蓝绿色荧光蛋白虽然EBFP是Aequorea GFP来源的最早的光谱变体之一，但其亮度低、光稳定性差，使其很久以来没有引起多数研究者的注意。
最近，有三个研究小组报道指出，改进的蓝色Aequorea 荧光蛋白变体与EBFP相比，亮度和光敏感性有明显增强。
这些新的变体被命名为Azurite（石青或蓝铜矿）、强力增强型蓝色荧光蛋白2（strongly enhanced blue fluorescent protein 2, SBFP2）及EBFP2，它们第一次使得活细胞在蓝色光谱区域成功地长时间成像成为可能。
即使这三种荧光蛋白在高浓度的微环境中表现出很弱的二聚体特性，但是它们能够在与亚细胞定位的靶蛋白融合中有效地发挥作用，并且它们能够很容易地通过滤光片设备与标准的BFP及4', 6-二脒基-2-苯基吲哚（4',6-diamidino-2-phenylindole, DAPI）一起成像。
所有这些BFP变体都可以通过A206K突变改造成真正的单体，而且这种突变不会影响它们的特性。
更重要的是，亮度最强、光稳定性最强的蓝色荧光蛋白EBFP2，是EGFP在活细胞中FRET的很好的供体。
3、黄色荧光蛋白荧光蛋白的改造遵循这样一个宗旨，那就是越红越好.普遍认为，长波长光子的激发对细胞和组织的光毒性小，且自体荧光和动物组织的光吸收都是最小。
这些因素意味着红色的荧光基团对比度提高（因为背景应该降低），且更适合于体内成像。
于是，荧光蛋白的改造慢慢向红色偏移。
黄色荧光蛋白最早的变体EYFP（表6）虽然仍被广泛应用，但由于其pK a值高、对卤化物敏感，导致EYFP的应用还很不理想。
单体形式的变体柠檬黄（mCitrine）和维纳斯（mVenus）是目前应用最多的黄色荧光蛋白探针，但二者都还没有商业化。
然而与之相似的，来源于Aequorea 被命名为诞生石Topaz（黄玉）的变体可从Invitrogen公司买到。
另一种很有应用潜力的黄色荧光蛋白是能量转移黄色荧光蛋白（yellow fluorescent protein for energy transfer, YPet），它经合成的DNA重排获得，与荧光激活的细胞分选术结合能够增强FRET中蓝绿色荧光蛋白和黄色荧光蛋白的配对。
YPet是已经开发的亮度最强的黄色荧光蛋白，并且有很好的光稳定性。
YPet对酸性环境的耐受性要比mVenus及其它黄色荧光蛋白变体强。
4、橙色荧光蛋白在橙色和红色波长（约560nm到650nm）光谱区仅仅开发了几种探针。
尽管如此，现有的这几种光谱型的蛋白都是从珊瑚中分离得到的，并且在多种成像情景中显现出应用潜力，但在对橙色区域荧光蛋白的命名中存在混乱。
通常被命名为红色荧光蛋白RFP的探针如DsRed、TagRFP及tdTomato，实际上具有明显的橙色多于红色的发射谱。
不考虑颜色的指示，用标准的四甲基罗丹明异硫氰酸脂（tetramethyl-rhodamine isothiocyanate, TRITC）滤光片设备，橙色光谱型的蛋白在多种颜色，如蓝绿色、绿色和红色情景中更易于成像。
5、红色荧光蛋白红色荧光蛋白(drFP583 )是人们从珊瑚虫Discosoma gen。
中克隆的一种与绿色荧光蛋白(GFP)同源的荧光蛋白，在紫外光的照射下可发射红色荧光，有着广泛的应用前景;但它自身的缺点如寡聚化、成熟缓慢等限制了它的进一步应用。
因此，人们对它进行了一系列修饰和改进，得到了寡聚化程度低(甚至单体)和成熟速率快的突变体，Clontech公司已将一种突变体商业化，命名为DsRed。
与GFP 相比，DsRed的激发和发射波长较长，其发射峰位于培养基、组织培养器材及细胞成分等产生的荧光背景范围之外，具有较高的信噪比;而且在细胞内荧光转换效率高，更易检测。
较早报道的红色荧光蛋白(DsRed) 的突变体有mBanana、mOrange、dTomato、mTangerine、mStrawberry 和mCherry。
在活细胞及动物全身成像中需要表现较好的红色荧光蛋白，主要是由于在多种颜色成像实验中需要红色探针，另外基于较长的激发波长产生的光毒性较小，可以用来探测较深的生物组织。
