当前位置：文档之家 › 晶体结构查询

晶体结构查询

  • 格式：ppt
  • 大小：251.00 KB
  • 文档页数：12

下载文档原格式

  / 12

合集下载

主楼165-EBSD数据库信息输入操作(2)

主楼165-EBSD数据库信息输入操作(2)

件。 点击Convert，输入相的信息文件就成功录入NEW PhaseDatabase库中。
EBSD实验时选择NEW PhaseDatabase库，就可以找到自己建立的相信息。
10
4
EBSD数据库信息输入操作
5
Crystallography
打开界面，首先需要命名，并输入晶体结构信息。
6
Atoms
输入相应原子的坐标及占位几率。
确认输入无误后， 请点击Save CRY file， 将文件保存在(E：)盘
New DATA文件夹中。
7
Diffraction
EBSD自建数据库教程
制作人：魏文娟 2013.6.17.
内容提要
1 准备工作
晶体结构信息查询 原子占位信息查询
2 数据库信息输入操作
Crystallography Atoms Diffraction Convert Done
2
晶体结构信息查询
通常在文献中可以查到所要输入相的晶体结构信息——结构 类型，空间群及空间群号，晶格参数等。例如：
首先点击Calculate，之后将HKL文件保存在(E：)盘的 New DATA文件夹中，并关闭当前软件。
8
Convert
任意选择账户进入软件，选择模拟模式（Simulation）。
9
Done
Convert界面中—— Directory选择之前保存文件的 (E：)盘New DATA文件夹， Output选择(C：)盘CHANNEL5文件夹中的NEW PhaseDatabase.CPD文
（nm）
c=0.454
α （°）
90Leabharlann a=b=0.4762 c=2.561
化学网址大全

化学网址大全

查询物质结构性质等的网站：//chemidplus/chemidlite.jsp/cn/psearch.cgi?terms=552-66-9+&sel=dict化工资源网：/fj/上海枫林店/scr/化学论坛：/bbsxp/ShowForum.asp?forumid=16（）中国科学院上海有机所:http://202.127.145.69/chub/chub.htm http://202.127.145.69/index.htm免费图谱网站：www.aist.go.jp/RIODB/SDBS/menu-e.html不同压力条件下的沸点转换工具/magnus/boil.html化合物英文缩写查询网站http://www.chemie.fu-berlin.de/cgi-bin/abbscomp有机合成（org syn）网络版：/1991-2004年J.Mater Chem全文查阅/is/journals/current/jmc/jmcon.htm可以免费查询化合物的物化性质。

合成资料部分收费：CAS和性质等查询：/Chem/ChemMain.htmlSigma公司网站：https:///cgi-bin/hsrun/Suite7/Suite/HAHTpage/Suite.HsAdvanc edSearch.formAction电子期刊：http://210.64.24.31/maillist/maillist_browse.cgi?show_old_epaper=pisa&filename= 20031129014425.html免费有机杂环期刊、杂环数据库。

http://www.heterocycles.jp/heterohtml/JournalMenu.html2000年以后可以直接看到原文。

（很好的英文网站）全部专利连接/sipo/xglj/gwzscqwz/default.htm1997-2004年Angew.Chem.Int.Ed.Engl全文查阅/cgi-bin/jtoc/26737/中国和外国的化学化工网站集合：/hxgcx/service/link_wenzi.htm外文文献服务网首页：/book/化学信息资源：数据库资源1.综合性数据库STN系统, /stn.html, http://www.fiz-karlsruhe.de/DIALOG系统, Entrez系统, /Entrez/中国科学院科学数据库, http://159.226.2.20:1205(上海有机所站点)/lccdb/sjk.htm中国科技信息中心数据库检索服务，http://168.160.24.11/htbin/tripnet2.化学信息数据库剑桥结构数据库(CSD), /布鲁克海文(Brookhaven)蛋白质数据库, or/pdb/Rutgers大学的核酸数据库, :80有机化合物数据库(Organic CompoundsDatabase), /chemistry/cmp/cmp.html化学危险品数据库(Hazardous Cehmicals Database),/erd/纳米技术数据库(Nanotechnology Database), /nanobase/生物大分子晶体结构数据库(The Biological Macromolecule Crystallization Database , BMCD) ,:4400/bmcd/bmcd.html澳大利亚蛇毒和毒素数据库(Australia Venom & ToxinDatabase), .au/~ddbfry/化学结构数据库(The WWW Chemical Structures Database),c.uni-erlangen.de/services/webmol.htm化合物基本性质数据库(CS ChemFinder), /SDBS有机化合物谱图库，http://www.aist.go.jp/RIODB/SDBS/上海有机化学研究所红外光谱数据库，http://202.127.145.67/ows-doc/irdoc/irlogin.htm3.物理化学常数美国国家标准和技术研究所物理实验室主页/物理化学参数搜索或查找/cuu/Constants/index.html/cuu/Constants/links.html(其它数据站点的连接点)http://www.chemie.fu-berlin.de/chemistry/general/constants_en.html/~sanders/constants.h (C语言header file)/~sanders/constants.h (FORTRAN语言参数文件)4.化学元素周期表/chemistry/web-elements//web-elements/web-elements-home.html这个网站物性查找极方便/chemacx/index.asp网上化学资源/istl/98-winter/interne1.html一个查询药物理化性质的网站化学文献网/丁香园论坛：/bbs/中国科学（B辑）(免费,全文) /scienceinchina_b_cn.htm 中国化学快报（英文版）(免费,全文) /ccl.asp美国专利商标局网站/国际网上化学学报(免费,全文，中国编辑) /default.htm中华人民共和国知识产权局：/sipo/default.htmBasic Proton and C-13 NMR：/web1/ocol/spec/NMR.htm美国化学文摘查阅法/book.html中国实验室/安徽药品信息网: /chem-lett 的网站：http://www.chemistry.or.jp/gakujutu/chem-lett/index.html（可以看近几年的全文）j.a.c.s全文（1993年后）：/subscribe/journals/jacsat/supmat/提供一个合成方法的数据库：/1965-2004Chem. Commun全文文献查阅/is/journals/current/chemcomm/cccon.htm/is/journals/j1.htm化学领域多来米站：/weblink.html一个提供各种英文网站：http://www.abc.chemistry.bsu.by/current/fulltextj.htm有机反应机理大全chembio.ethz.ch/links/en/orgchem_reaktionen_lehr.html一个学术论坛ChIN论坛：/ChINBB/index.php论坛地址: 各国新药信息网站USA /cder/approval/index.htmEurope http://www.emea.eu.int/htms/human/epar/a-zepar.htmJapanese http://www.pharmasys.gr.jp/shinyaku/shinyaku_index.html Netherlands http://www.cbg-meb.nl/uk/prodinfo/index.htmSweden http://www.mpa.se/eng/index.shtml奇迹文库/eprint/75/index.htmlInternet网络上有着丰富的化学化工资料，从Internet网络上检索资料方便迅捷。

计算化学相关网址

计算化学相关网址


IUPAC金属络合物稳定常数数据库：
注：需要付费，可免费下载试用版。
√ NIST化学数据库：/chemistry
简介：是美国国家标准与技术研究院NIST的基于Web的物性数据库。输入分子查找条件，可获得分子量、CAS登记号、各种热力学数据、谱图等信息，部分分子包含3D结构。
生物核磁共振数据库：http://bmrb.protein.osaka-u.ac.jp/deposit
CRYSTAL程序基组数据库：/~mdt26/crystal.html
√ 计算化学比较和基准数据库(CCCBDB)：
简介：用于评价蛋白质数据库中晶体结构电子密度。输入pdb ID（比如1cbs）进入后可以对各种内容做图。点击EDS Summary下面的Go按钮可以自动启动基于java的电子密度图可视化程序观看电子密度图，注意不要开启浏览器的弹出窗口过滤。
√ 上海有机所化学专业数据库：http://202.127.145.134/scdb/default.htm
1 在线信息数据库部分
√ SDBS光谱数据库：http://riodb01.ibase.aist.go.jp/sdbs/cgi-bin/direct_frame_top.cgi
简介：很好的有机化合物光谱数据库，包含六类光谱：EI-MS、FT-IR、H-NMR、C13-NMR、ESR、Raman。含3万余个化合物，其中以 商业化学试剂为主，约2/3是6碳至16碳的化合物。数据大部分是其自行测定的，并不断添加。可以通过化合物、分子式、分子量、CAS/SDBS注册号、 元素组成、光谱峰值位置/强度方式搜索。
简介；可以查到精确的计算化学中涉及的物理常数及换算关系，如hartree->eV
基于aflow 的晶体结构检索方法

基于aflow 的晶体结构检索方法

基于aflow 的晶体结构检索方法摘要：一、引言1.背景介绍2.研究目的二、aflow 晶体结构检索方法概述1.aflow 简介2.晶体结构检索方法原理三、方法流程1.数据准备2.构建检索策略3.执行检索4.结果分析与优化四、实验与评估1.实验数据来源2.评估指标3.实验结果分析五、应用案例1.实际应用场景2.案例分析六、结论与展望1.方法优势2.不足与改进方向正文：一、引言1.背景介绍随着科技的发展，晶体材料的种类和应用越来越丰富。

在材料科学领域，研究者需要从大量的晶体结构中筛选出具有特定性质的材料，这就对晶体结构检索方法提出了更高的要求。

aflow 是一款强大的晶体结构数据库，它包含了大量晶体结构信息，为研究者提供了便捷的检索工具。

2.研究目的本文旨在探讨基于aflow的晶体结构检索方法，提高检索效率和准确性，为材料研究者提供实用的检索策略。

二、aflow 晶体结构检索方法概述1.aflow 简介aflow是一款开源的晶体结构数据库，包含了超过2000万种晶体结构。

它提供了高效的检索功能，可以根据用户需求快速找到匹配的晶体结构。

2.晶体结构检索方法原理aflow 晶体结构检索方法基于以下几个步骤：首先，构建查询条件，如元素组成、晶格参数等；然后，将查询条件输入到aflow 数据库中进行检索；最后，获取检索结果并分析。

三、方法流程1.数据准备为了进行晶体结构检索，首先需要准备查询条件，如元素组成、晶格类型、晶格参数等。

2.构建检索策略根据查询条件，构建合适的检索策略，如使用关键词、范围限定等。

3.执行检索将构建好的检索策略输入到aflow 数据库中，执行检索操作。

4.结果分析与优化获取检索结果后，对结果进行分析，如统计命中率、检索时间等指标。

根据分析结果，对检索策略进行优化，提高检索效果。

四、实验与评估1.实验数据来源为验证基于aflow的晶体结构检索方法的有效性，本文使用了公开数据集进行实验。

一些计算化学相关的免费的在线数据库

一些计算化学相关的免费的在线数据库

一些计算化学相关的免费的在线数据库、分子结构库及工具1 在线信息数据库部分ChemSpider小分子信息整合数据库：简介：是当前众多的在线分子数据库的信息整合，便于用户搜索，数据来自200种数据库。

根据分子俗名、系统命名、Smile/InChI字符串、注册号、分子式等方式搜索，会列出分子平面结构、实验测定和实时估算的理化性质（含LogP等）、毒性、分子简介、Smile/InChI/InChIKey字符串、在其它分子数据库中的编号和链接、相关文章及专利、同义词、相关蛋白质、NMR/IR光谱图等，某些分子还可以链入web CSD获得三维结构。

√ SDBS光谱数据库：http://riodb01.ibase.aist.go.jp/sdbs/cgi-bin/direct_frame_top.cgi简介：很好的有机化合物光谱数据库，包含六类光谱：EI-MS、FT-IR、H-NMR、C13-NMR、ESR、Raman。

含3万余个化合物，其中以商业化学试剂为主，约2/3的数据是6碳至16碳的化合物。

数据大部分是其自行测定的，并不断添加。

可以通过化合物、分子式、分子量、CAS/SDBS注册号、元素组成、光谱峰值位置/强度方式搜索。

生物核磁共振数据库：http://bmrb.protein.osaka-u.ac.jp/depositCRYSTAL程序基组数据库：/~mdt26/crystal.htmlTURBOMOLE程序基组数据库：/TURBOMOLE_BASISSET_LIBRARY/tbl.html√ 计算化学比较和基准数据库(CCCBDB)：简介：此数据库包括各种量子化学方法、各种基组下对不同分子的各种属性的计算结果，也包含实验数据。

可用来对比不同方法计算结果优劣，此数据库内容在不断增加。

√ 量化频率计算校正因子：/vibscale.asp简介：实际上就是CCCBDB的一个子页面，比较重要故单独列出。

IUPAC金属络合物稳定常数数据库：注：需要付费，可免费下载试用版。

XRD分析软件使用

XRD分析软件使用

XRD分析软件使用XRD（X射线衍射）分析是一种常用的无损表征材料结构的方法，可用于识别晶体结构和晶格参数以及确定晶体中的晶相组成等。

为了进行XRD分析，通常需要使用专门的XRD分析软件。

1.数据质量评估：XRD软件可以对XRD数据进行质量评估，以判断实验数据的准确性和可靠性。

它可以检查峰的形状和位置，并通过计算峰形参数来评估数据的质量。

2.数据处理和曲线拟合：XRD软件可以对原始XRD数据进行处理和分析，包括背景去除、数据平滑和峰位校正等。

此外，软件还可以对XRD曲线进行拟合，以得到准确的晶格参数、晶体结构和相对含量等信息。

3.晶体结构分析：XRD软件可以通过模拟衍射数据进行晶体结构分析。

用户可以输入晶体结构信息，例如原子类型和位置，软件将模拟出理论衍射图案与实验数据进行对比。

通过优化晶格参数和各原子位置，可以得到最佳的拟合结果。

4.相对含量分析：XRD软件可以用于估计样品中各晶相的相对含量。

它可以通过标准样品进行校准，利用衍射峰的强度或面积与样品中晶相的相对含量之间的关系来计算。

5.相图分析：XRD软件可以绘制相图图谱，以直观地展示不同温度、压力和成分条件下的相变和相平衡情况。

这对于材料研究和材料设计具有重要意义。

6.数据库查询：XRD软件通常与各种晶体结构数据库相结合，以便用户能够查询和获得已知晶体结构的相关信息。

这方面的一些知名数据库包括ICSD（国际晶体结构数据库）和PDF（粉末衍射数据库）等。

在使用XRD分析软件时，首先需要导入实验数据，这可以是从X射线衍射仪器中得到的原始数据文件。

然后，进行数据质量评估，包括检查峰的位置和形状等。

接下来，可以对数据进行背景去除和平滑处理，以提高数据的信噪比和可读性。

然后，可以进行曲线拟合，以获得晶格参数、晶体结构和相对含量等信息。

拟合过程通常使用Rietveld方法进行，该方法可以同时考虑衍射强度、衍射峰形和背景等因素。

通过优化晶格参数和各原子位置，可以得到最佳的拟合结果。

化学工作者网站

化学工作者网站

化学工作者看过来，可以在线查找化学结构式！1./cgi-bin/hsrun/Distributed/HahtShop/HAHTShop.htx;start=HS_SearchCenter中，选择Search Structures，然后，就可以分别根据：Product Name 和CAS登录号，还有Molecular Formula进行查找。

在这里查到的化合物基本都有一些参数和它的结构式（Structure Image），然后将图片保存成Gif即可！当然，如果你只知道化合物的结构式，不知道叫什么，可以选择下面的Sub Structure Search ，然后 Step 1 Choose a Drawing tool. I want to Download Kekule (requires download of Kekv214.exe) Step 2 Install the plug-in you downloaded in step 1 Close this browser. Return to the directory where you saved the plug-in and double click on the file name given in step 1. Step 3 Return to this page and click the "Structure Search"button. 安装好软件即可将画好的图片粘贴上即可查找，非常方便，我用它查了一些结构式，给了我一大堆，呵呵，本人化学方面英语不是很好，一个个查看才找到，不过还好是宽带，呵呵：－）2./大家去这儿看看，查询非常简单3.【推荐】【原创】能查几万个化合物的NMR IR谱图的网址 [精华]4.能查几万个化合物的NMR IR谱图的网址 SDBS Integrated Spectral Data BaseSystem for Organic Compounds http://www.aist.go.jp/RIODB/SDBS/sdbs/owa/sdbs_sea.cre_frame_sea NIST WebBook /5.美国专利pdf全文下载的好地方 6.免费在线查合成路线/depts/chemistry/courses/toolkits/247/practice/m edialib/data/7.中科院上海有机化学研究所化学专业数据库http://202.127.145.134/tf123456/6543218.中科院上海有机化学研究所数据库（/lccdb/sjk.htm），免费注册使用，现在已经改版，性能提高许多。

ofet结构

ofet结构

ofet结构
OFET (Organic Field Effect Transistor)结构指的是一种基于有机分子材料的场效应晶体管结构。

OFET查询可以分为单晶OFET 和聚合物薄膜OFET两类。

单晶OFET具有优异的电学特性，主要包括源、漏电极、栅极和有机半导体层。

其中，源、漏电极通常采用金属材料，栅极通常采用透明的导电材料，有机半导体层通常采用由有机小分子组成的晶体结构，其主要特点是具有高的载流子迁移率和快的响应速度。

聚合物薄膜OFET结构相对单晶OFET更加简单，其结构由源、漏电极、栅极和聚合物薄膜层组成。

其中，源、漏电极通常采用金属材料，栅极通常采用透明的导电材料，聚合物薄膜层则由高分子材料组成。

聚合物薄膜OFET具有制备成本低、易于大规模制备等优点，但其载流子迁移率和响应速度相对单晶OFET较差。

1。

常用化学数据的查询

常用化学数据的查询

6 有机合成手册数据库
/
简介：Organic Syntheses作为有机化学的重要参考丛书，以标准格式阐述了有机化合物合成的详细实验方法，由John Wiley & Sons, Inc公司出版，至今已有79年度卷和9卷累积合订本。Organic Syntheses中收录的化合物制备方法以及新的反应等，自1921年开始均由Roger Adams of the University of Illinois的科研领域的研究生及化学专业人员进行重复，确保稳定的反应收率。现在Organic Syntheses在网上拥有了对所有化学家免费的数字版本，OS Board of Directors由DataTrace和CambridgeSoft公司资助，摘录已经、现在或是将要出版的Organic Syntheses各卷，制作成网络版的可检索全部记录的累积合订本。用户必须事先在可上网的计算机上安装CambridgeSoft公司的Chemdraw Ulta7.0版，然后登录该网站，经过免费注册，即可通过文本、结构式以及图片来检索所需合成化合物的制备方法。
11 物性、质谱、晶体结构数据库
http://factrio.jst.go.jp/
简介：该数据库收录了有机化合物的物性、质谱、晶体结构等数据，数据主要取自LANGE'S HANDBOOK OF CHEMISTRY 12/e，J PHYS CHEM REF DATA Vol.1,No.4,841-1009(1972)以及Sicherheitstechnische Kennzahlen brennbarer Gase und Daempfe 2.Auflage。截至97年8月，热物理和热化学性质数据库Kelvin收录数据共有61,480条；质谱数据库Dalton收录15,526条以及晶体结构数据库Angstrom收录9,169条。用户经免费注册后即可以检索并下载所需要的数据，但是个人下载的总量不得超过数据库总量的10%。
化合物物性查询网站

化合物物性查询网站

1.物性数据(该数据库是浏览型数据库，含有470多种纯组分的物性数据，如分子量、冰点、沸点、临界温度、临界压力、临界体积、临界压缩、无中心参数、液体密度、偶极矩、气相热容、液相热容、液体粘度、反应标准热、蒸气压、蒸发热等。

2.热力学性质（该站点可查294种组分的热力学性质，还可以根据Peng Robinson状态方程计算纯组分或混合物的性质：包括气液相图、液体与气体密度、焓、热容、临界值、分子量等数据。

3.标准参考数据库化学网上工具书(该数据库是一种检索型数据库，检索方法非常简单，可通过化学物质名称、分子式、部分分子式、CAS 登记号、结构或部分结构、离子能性质、振动与电子能、分子量和作用进行检索，可检索到的数据包括分子式、分子量、化学结构、别名、CAS登记号、气相热化学数据、凝聚相热化学数据、液态常压热容、固态常压热容、相变数据、汽化焓、升华焓、燃烧焓、燃烧熵、各种反应的热化学数据、溶解数据、气相离子能数据、气相红外光谱、质谱、紫外/可见光谱、振动/电子能及其参考文献。

4.美国标准技术研究所物理网上工具书(该站点包括物性常数、原子光谱数据、分子光谱数据、离子化数据、χ-射线、γ-射线数据、放射性计量数据、核物理数据及其它数据库。

手册(该数据库是一种可检索数据库，可通过产品名称、全文、分子式、CAS登记号等进行检索，检索的结果包括产品名称、登记号、分子式、分子量、贮存温度、纯度、安全数据等。

6.美国国立医学图书馆毒性化学物质数据(HSDB)可通过化学物质名称/别名、CAS登记号、化学物质名称的一部分进行检索，检索结果包括化学物质名称、登记号、同义词、分子式、RTECS号、运输方式、所含杂质等数据。

7、化学危险品数据库(Hazardous Cehmicals Database),8、一个检索FDA历年批准药品的好网站。

9、有机化合物数据库(Organic Compounds Database),10、查询物质结构性质等的网站：11、化合物基本性质数据库(CS ChemFinder),12、可以免费查询化合物的物化性质。

5 晶体结构查询、绘图及面网间距计算-精选文档

5 晶体结构查询、绘图及面网间距计算-精选文档


x 0 0.3057(7)
y 0 0.3057(7) 0 0
z
SOF 1. 1.
H 0 0
Ti：2a (0,0,0) (½ ½ ½) O: 4f (0.3057,0.3057,0) (0.6943,0.6943,0)(0.6943,0.8057,0.5)(0.8057,0.6943,0.5)
½,½,½ 0.8057,0.6943,0.5
晶胞参数 a b c α βγ 晶胞体积 volume 单位晶胞分子数 空间群 P42/mnm 空间群编号 136 晶系
四方原始格子，单位晶胞6个原子
晶体结构的Pearson符号=晶系(小写)+格子类型(大写)+单位晶胞原子数
晶系 三斜 单斜 斜方 四方 六方 三方 立方
OX
SITE
x
y
0 0
z
Beta12 -.0001(3) -.0001(9) 1. 1. Beta13
SOF
0 0 Beta23 0 0
H
1 +4 2 a 0 0 1 -2 4 f 0.3057(7) 0.3057(7) Type Beta11 Beta22 Beta33 Ti4+ 0.0068(3) 0.0068(3) 0.0175 O2- 0.0075(5) 0.0075(5) 0.0176 for ICSD #9161
等效点系占位 f，a R Value 可信度因子，该结构误差率5.6% (一般小于5-6%即认可) Red Cell (Reduced Cell) 约化晶胞 Trans Red 转换矩阵
该两项在晶体结构测定时 运用
Comments Cell of 2nd reference: 4.5937(3), 2.9581/2), Dm=4.2493(5), at 298 K Stable from 800 to 1800 K (3rd ref., Tomaszewski), 300-800 K: Pbca Compound with mineral name: Rutile The structure has been assigned a PDF number (calculated powder diffraction data): 01-072-1148 The structure has been assigned a PDF number (experimental powder diffraction data): 21-1276 New refinement based on previously measured intensities Structure type : TiO2(tP6) X-ray diffraction from single crystal

晶体结构查询、绘图及面网间距计算


可知： (100)、(010)、(001)、(-100)、(0-10)、(00-1) 等相等； (110)、(101)、(011)、(-110)、(1-10)、 (-101)、(10-1)、(0-11)、(01-1)等相等。
在x射线粉晶衍射中，只能测定出独立的 面网间距，因此对于面网间距相等的面 网，在描述其面网符号时，选用其中的 一个面网符号表示。选符号的规则： a) 尽量采用正指数 b) 数字尽量靠前
（010）
（020）
（030）
（040）
（001）
（002）
（003）
（004）
[001]投影
（110）
（220）
（330）
（210）
（140）
2) 面网间距：描述一组等间距的面网中 相邻面网的垂直距离。记为 dhkl。 在直角坐标并且轴长相等的情况下：
d010=b
d020=b/2
d030=b/3
3.8184 3.1177 2.7000 2.4150 2.2045 1.9092 1.8000 1.7076 1.6282 1.5588
d123 d400 d104 d114 d133 d204 d124 d233 d224 d304
1.4432 1.3500 1.3097 1.2728 1.2388 1.2075 1.1784 1.1513 1.1023 1.0800
c) 斜方(正交)晶系
a≠b≠c
α=β=γ=90
d）单斜晶系 a≠b≠c ；β≠90 e) 三斜晶系 a≠b≠c α≠β≠γ≠90o
f) 三方及六方晶系按六方 指标化） a = b≠c α=β=90o,γ=120o
4) 面网间距含义： (1) 不同面网符号的面网间距有可能彼此相等。 如立方晶系，根据公式

查询化学专业的网站

查询物质结构性质等的网站：//chemidplus/chemidlite.jsp/cn/psear ... -66-9+&sel=dict化工资源网：/fj/上海枫林店/scr/化学论坛：/bbsxp/ShowForum.asp?forumid=16 （）中国科学院上海有机所:http://202.127.145.69/chub/chub.htm http://202.127.145.69/index.htm免费图谱网站：www.aist.go.jp/RIODB/SDBS/menu-e.html不同压力条件下的沸点转换工具/magnus/boil.html化合物英文缩写查询网站http://www.chemie.fu-berlin.de/cgi-bin/abbscomp有机合成（org syn）网络版：/1991-2004年J.Mater Chem全文查阅/is/journals/current/jmc/jmcon.htm可以免费查询化合物的物化性质。

合成资料部分收费：CAS和性质等查询：/Chem/ChemMain.htmlSigma公司网站：https:///cgi ... edSearch.formAction电子期刊：http://210.64.24.31/maillist/mai ... 20031129014425.html免费有机杂环期刊、杂环数据库。

http://www.heterocycles.jp/heterohtml/JournalMenu.html2000年以后可以直接看到原文。

（很好的英文网站）全部专利连接/sipo/xglj/gwzscqwz/default.htm1997-2004年Angew.Chem.Int.Ed.Engl全文查阅/cgi-bin/jtoc/26737/中国和外国的化学化工网站集合：/hxgcx/service/link_wenzi.htm*** 首页：/book/化学信息资源：数据库资源1.综合性数据库STN系统, /stn.html,http://www.fiz-karlsruhe.de/DIALOG系统, Entrez系统, /Entrez/中国科学院科学数据库, http://159.226.2.20:1205(上海有机所站点)/lccdb/sjk.htm中国科技信息中心数据库检索服务，http://168.160.24.11/htbin/tripnet2.化学信息数据库剑桥结构数据库(CSD), /布鲁克海文(Brookhaven)蛋白质数据库, or /pdb/ Rutgers大学的核酸数据库, :80有机化合物数据库(Organic Compounds Database), /chemistry/cmp/cmp.html化学危险品数据库(Hazardous Cehmicals Database), /erd/纳米技术数据库(Nanotechnology Database), /nanobase/生物大分子晶体结构数据库(The Biological Macromolecule Crystallization Database , BMCD) , :4400/bmcd/bmcd.html澳大利亚蛇毒和毒素数据库(Australia Venom & Toxin Database), .au/~ddbfry/化学结构数据库(The WWW Chemical Structures Database),c.uni-erlangen.de/services/webmol.htm化合物基本性质数据库(CS ChemFinder), /SDBS有机化合物谱图库，http://www.aist.go.jp/RIODB/SDBS/上海有机化学研究所红外光谱数据库，http://202.127.145.67/ows-doc/irdoc/irlogin.htm3.物理化学常数美国国家标准和技术研究所物理实验室主页/物理化学参数搜索或查找/cuu/Constants/index.html/cuu/Constants/links.html(其它数据站点的连接点)http://www.chemie.fu-berlin.de/c ... l/constants_en.html/~sanders/constants.h (C语言header file)/~sanders/constants.h (FORTRAN语言参数文件)4.化学元素周期表/chemistry/web-elements//web-elements/web-elements-home.html这个网站物性查找极方便/chemacx/index.asp网上化学资源/istl/98-winter/interne1.html一个查询药物理化性质的网站化学文献网/丁香园论坛：/bbs/中国科学（B辑）(免费,全文) /scienceinchina_b_cn.htm中国化学快报（英文版）(免费,全文) /ccl.asp美国专利商标局网站/国际网上化学学报(免费,全文，中国编辑) /default.htm中华人民共和国知识产权局：/sipo/default.htmBasic Proton and C-13 NMR：/web1/ocol/spec/NMR.htm美国化学文摘查阅法/book.html中国实验室/安徽药品信息网: /chem-lett 的网站：http://www.chemistry.or.jp/gakujutu/chem-lett/index.html（可以看近几年的全文）j.a.c.s全文（1993年后）：/subscribe/journals/jacsat/supmat/提供一个合成方法的数据库：/1965-2004Chem. Commun全文文献查阅/is/journals/current/chemcomm/cccon.htm/is/journals/j1.htm化学领域多来米站：/weblink.html一个提供各种英文网站：http://www.abc.chemistry.bsu.by/current/fulltextj.htm有机反应机理大全chembio.ethz.ch/l ... eaktionen_lehr.html一个学术论坛ChIN论坛：/ChINBB/index.php论坛地址: 各国新药信息网站USA /cder/approval/index.htmEurope http://www.emea.eu.int/htms/human/epar/a-zepar.htmJapanese http://www.pharmasys.gr.jp/shinyaku/shinyaku_index.htmlNetherlands http://www.cbg-meb.nl/uk/prodinfo/index.htmSweden http://www.mpa.se/eng/index.shtml奇迹文库/eprint/75/index.htmlInternet网络上有着丰富的化学化工资料，从Internet网络上检索资料方便迅捷。

open quantum materials database使用方法

Open Quantum Materials Database 使用方法简介Open Quantum Materials Database（OQMD）是一个用于存储和共享量子材料数据的开放数据库。

它提供了丰富的材料性质、结构信息以及计算结果，以帮助科学家和工程师进行材料研究和开发。

本文将介绍如何使用OQMD进行材料数据的查询、分析和下载。

数据查询OQMD提供了多种查询方式，可以根据材料的性质、结构以及元素组成进行查询。

材料性质查询在OQMD的主页上，可以通过点击“Materials Explorer” 进入材料性质查询页面。

在这个页面上，可以根据一系列材料性质的范围来筛选材料。

例如，可以选择希望查询的材料的形成能量、晶体结构类型、电子密度等性质的范围。

通过设置这些范围，可以缩小查询结果的范围，找到符合需求的材料。

结构查询OQMD还提供了结构查询功能，可以根据材料的晶体结构信息进行查询。

在OQMD的主页上，点击“Structure Search” 可以进入结构查询页面。

在这个页面上，可以输入晶体结构的空间群、晶胞参数等信息，进行材料的结构查询。

元素组成查询OQMD还支持根据材料的元素组成进行查询。

在OQMD的主页上，点击“Elemental Search” 可以进入元素组成查询页面。

在这个页面上，可以选择查询材料中包含的元素，可以选择多个元素进行查询。

通过设置元素组成，可以找到包含指定元素的材料。

数据分析OQMD提供了丰富的数据分析工具，可以对材料数据进行可视化和统计分析，帮助用户更好地理解和利用数据。

元素周期表在OQMD的主页上，点击“Periodic Table” 可以进入元素周期表页面。

在这个页面上，可以查看元素的基本信息、周期表的布局以及元素的周期性性质。

用户可以通过点击元素，查看该元素的详细信息和相关数据。

物性图表OQMD还提供了多种物性图表，可以对材料的性质进行可视化展示。

在OQMD的主页上，点击“Property Charts” 可以进入物性图表页面。

晶体结构软件—Mercury

晶体结构软件—Mercury作者：许妙琼来源：《科技创新与应用》2013年第35期摘要：利用Mercury软件可以更好的观察研究晶体结构，有利于晶体结构研究。

文章重点介绍利用Mercury软件研究晶体结构。

关键词：Mercury；晶体；结构在晶体结构研究过程中，研究者往往要展示晶体的微观内部结构单元，虽然有结构模型，但是数量有限，展示的效果不尽如人意。

随着化学软件技术的发展，已经有很多软件可以很好地为晶体结构研究服务。

Mercury是英国剑桥晶体数据中心Cambridge Crystallographic Data Centre制作的剑桥结构数据库系统Cambridge Structural Database System下的一个软件，用来观察研究晶体的三维结构，时有免费的版本和商业版更新。

Mercury运行在Windows（或Unix平台）上。

下面简单介绍一下利用Mercury软件来研究晶体结构。

1 Mercury软件的主窗口Mercury软件的主窗口比较简单，屏幕中间的黑色区域为显示区，所读入的晶体结构数据输出在这里；标题栏显示程序的名称以及当前打开的晶体编号；菜单栏包含一系列菜单命令；工具栏位于菜单栏的下方，列出常用的工具，例如：显示风格、颜色、选择模式和操作方式等等；位于屏幕右侧的空白区域为结构列表区，列出载入文件或数据库所含的结构列表；处于显示区下方的有接触列表区和选项区，前者与分子间或分子内接触作用相关，而后者包含一些常用选项。

此外，在显示区下方还有一个是否进行晶胞堆积的复选框；屏幕最下方为任务栏，包含与当前状态有关的帮助信息。

2 Mercury软件的简单操作2.1 文件调入mercury软件使用.cif结构文件，要求该结构文件所在的路径不能含中文。

2.2 晶体结构位置调整显示窗口中按住鼠标左键或右键拖动可以随意旋转结构和调整结构大小的缩放率，也可以通过快捷菜单中的快捷命令来调整，以得到较好的结构视图。

鲜为人知的化合物物性查询网站,包括查CA号,一些免费的杂志下载网站

1.物性数据(/data.xls)
该数据库是浏览型数据库，含有470多种纯组分的物性数据，如分子量、冰点、沸点、临界温度、临界压力、临界体积、临界压缩、无中心参数、液体密度、偶极矩、气相热容、液相热容、液体粘度、反应标准热、蒸气压、蒸发热等。
2.热力学性质（/～jrm/thermot.html）
期刊检索，可以根据期刊简写，刊号，ISBN等来查询期刊以及所在数据库
44、http://168.160.50.68/searchindex.asp
期刊检索，可以根据期刊简写，刊号，ISBN等来查询期刊以及所在数据库
45、全文免费而且影响因子不低的两个杂志
J.Biol.Chem,全文免费
/
47、/unit-converter/
度量衡的转换
48.有机反应查询网站
/
在这里你能查到所有的常用反应，和一些近期关于那个反应的文献，是学习的好去处
49.合成路线查询网站
/browse.php
http://www.chemie.fu-berlin.de/c ... l/constants_en.html
/~sanders/constants.h
20、化学元素周期表
/chemistry/web-elements/
8、一个检索FDA历年批准药品的好网站。
/patient/drugs/drugls03.html
9、有机化合物数据库(Organic Compounds Database),
/chemistry/cmp/cmp.html
/
12、可以免费查询化合物的物化性质。
13、免费图谱网站：www.aist.go.jp/RIODB/SDBS/menu-e.html
14、化合物英文缩写查询网站：http://www.chemie.fu-berlin.de/cgi-bin/abbscomp

crystal maker使用教程

CrystalMaker绘制晶体结构教程1.先打开CrystalMaker并创建晶体，过程是file——New Crystal，在弹出的窗口中，有一些项目需要填写。

因为是自动生成晶体的，所以你先得告诉计算机绘制晶体所需要的参数。

在这里从上到下依次要填写的是空间群、晶胞参数和原子坐标。

2.所以我们先到晶体数据库Findit中进行查询。

因为我用的Findit是09年试用非破解版的，所以我先把系统时间调到09年再打开它。

这里我们要绘制的晶体是尖晶石型的ZnCo2O4，在选择好左下的筛选方式后，分别点击Zn、Co、O，然后Search。

3.在结果中我们看到没有我们要的整数比的物质，但是明显这里只是部分Co代替了Zn的位置，因此原子坐标和空间群并没有改变，只是晶胞参数不能使用。

这里空间群是fd3m。

4.回到CrystalMaker，点Browse手动添加空间群。

5.输入晶胞参数，由于空间群已经选定了，所以软件只会让你填你能填的部分。

6.继续在Findit里面找到原子坐标。

在这里SOF是原子占位率，意思就是出现在该位置的原子的比率，显然这里Co和Zn有重叠，但我们画的是完美晶体，所以我们Zn取占位率0.79，而Co取0.9的那个。

7.用add添加项，把所有原子都输入进去，然后点ok。

8.结果是这个样子。

9.不好看就把原子半径调一下。

10.然后我们要告诉软件原子之间是怎么作用的，点Edit——Bonding，并用add添加项，改成Co-O键和Zn-O键。

11.键长请查手册，但是这里我们只是画图，所以可以随便指定，只要满足配位关系就可以了。

这里Co应该6配位，Zn应该4配位，把Info勾上，满足了配位关系，点ok。

12.键被加上去了。

13.但是这是球棍图，我们要的结果是立方体堆积的，所以点Model——Polyhedrel。

这样键就消失了。

14.然后把Co和Zn的模型改成半透明的立方块。

点apply确认。

15.之后是这个样子。

  1. 1、下载文档前请自行甄别文档内容的完整性，平台不提供额外的编辑、内容补充、找答案等附加服务。
  2. 2、"仅部分预览"的文档,不可在线预览部分如存在完整性等问题,可反馈申请退款(可完整预览的文档不适用该条件!)。
  3. 3、如文档侵犯您的权益，请联系客服反馈,我们会尽快为您处理(人工客服工作时间：9:00-18:30)。

9
Halite Cryst Sys Cubic SG F m -3 m(225) Unit Cell 5.4533(9) 5.4533(9) 5.4533(9) 90 90 90 Vol 162.17 Z=8 Formula：NaCl Na 4a (0 0 0) Cl 4b (½, ½, ½ ) In the halite structure, one kind of ion occur s at the points of a face-centered cubic lattice and the other kind of ion occurs midway between each pair of the first kind along [100] directions. Each ion is in octahedral coordination with six ions of the opposite kind, rather than linked to one ion in particular.
8
晶体结构描述 Diamond
Cryst Sys Cubic SG F d -3 m(227) Unit Cell 3.56679(9) 3.56679(9) 3.56679(9) 90 90 90 Vol 45.38 Z=8 Formula：C C 8a (0 0 0) Diamond is isometric, with each carbon atom linked tetrahrally to four neighboring carbon atoms. The close three-dimensional covalent linking completely the outer eletron shell for each atpm by sharing of electrons is manifested in the great hardness of diamond.
10
Spinel Cryst Sys Cubic SG F d -3 m(225) Unit Cell 8.186(1) 8.186(1) 8.186(1) 90 90 90 Vol 548.55 Z=8 Formula: MgAl2O4 Mg 8a (0 0 0) Al 16d (0.625,0.625,0.625) O 32e (0.3860(1), 0.3860(1), 0.3860(1)) In the structure, the oxygen atoms lie in appromimately cubic closest packing. The 8A posiotion, which have the arrangement as the carbon atoms in diamond, are in fourfold coordination between a tetrthedral group of oxygen atoms; the 16B atoms are in sixfold coordination between octehedral groups of oxygen. In turn, each oxygen is linked to one A and three B atoms. In most minerals, the B metal ions are smaller then the A ions. MgAl2O4, LiMn2O4, MgFe2O4, Ti(Fe,Mg)2O4, FeFe2O4 MnMn2O4, BeAl2O4, FeCr2O4
7
Space Group P n m a SG Number 62 Cryst Sys orthorhombic Pearson oP20 Wyckoff d c2 b R Value .0309 Red Cell P 5.377 5.440 7.637 89.999 89.999 90 223.445 Trans Red 1.000 0.000 0.000 / 0.000 0.000 1.000 / 0.000 -1.000 0.000 Comments Rietveld profile refinement applied X-ray diffraction (powder) At least one temperature factor missing in the paper. Atom # OX SITE x y z SOF H Ca 1 +2 4 c 0 0.25 0.0167 1. 0 Ti 1 +4 4 b 0 0 0.5 1. 0 O 1 -2 4 c 0.4176 0.25 0.0038 1. 0 O 2 -2 8 d 0.2783 0.0422 0.2098 1. 0 *end for ICSD #50364
晶体结构数据查寻
http://icsdweb.fiz-karlsruhe.de/index.php
1
2
பைடு நூலகம் 3
4
5
6
*data for ICSD #50364 Coll Code 50364 Rec Date 1999/11/30 Chem Name Calcium Titanate Structured Ca (Ti O3) Sum Ca1 O3 Ti1 ANX ABX3 D(calc) 4.04 Title Synthesis and crystal structure refinement of (1-x)Ca Ti O3 (x)(La1/3Nd1/3) Ti O3 Author(s) Cho, N.W.;Sung, K.P.;Chang, S.-C. Reference RIST Yongu Nonmun (RIST Research Papers) (1998), 12, 116-123 Unit Cell 5.3779 7.6375 5.4401 90. 90. 90. Vol 223.45 Z 4
12
11
Muscovite-1M Cryst Sys monoclinic SG C 1 2/m 1(12) Unit Cell 5.199 9.005 10.164 90. 101.3 90. Vol 466.62 Z=2 (K0.80 Na0.02 Ca0.01) (Al1.66 Fe0.06 Fe0.02 Mg0.28) (Si3.41 Al0.59) O10 (O H)2 Two sheets of linked SiO4 tetrhedra are juxtaposed with the vertices of the tetrahedra pointing inward; these vertices are cross-linked with Al; hrdoxyl groups, which are also present, complete the six-coordination of the Al. A firmly bound layer is thus produced with the base of the silica tetrahedra on both of its outer sides. The layer has a negative charge because Al is substituting for Si in some of the tetrahedra. This negative charge is compensated by potasium, or less commonly by sodium or calcium, ions that are located between the layers and serve to link the layers together.