四川大学华西医学院 医学微生物学II--教学大纲

《医学微生物学》课程教学大纲课程名称：医学微生物学授课专业：五年制预防医学专业学时与学分：总学时数为66（理论课36学时，实验课30学时），4学分一、课程性质和目的医学微生物学是研究与医学有关的病原微生物学性状，以及病原微生物在一定环境条件下，与人体间相互关系的科学。

医学微生物学是一门重要的医学基础课程，其任务是通过教学使学生掌握和运用这门学科的基础理论、基本知识和基本技能，为学习有关基础医学和临床医学课程及从事由微生物所致疾病的诊断和防治工作奠定基础。

本大纲所列内容都是要求学生学习的，但不是全部在课堂上讲授，可以通过多种方式教学，也可由学生自学。

教学内容的要求分三级，第一级为掌握的内容，要求学生牢记并能口述自由表达，还能应用这些理论解决临床相关问题并应用于后续课程；第三级为了解内容，学生对此内容应有一初步印象；第二级为熟悉内容，介于掌握与了解内容之间。

本大纲适用于我校五年制本科的临床、口腔、预防、检验等专业的教学。

二、理论课教学内容及基本要求绪论学时分配：0.5 学时掌握：微生物的概念。

熟悉：微生物的分类。

了解：微生物的特点及与人类的关系；医学微生物学的概念及发展史。

第一篇细菌学第1章细菌的形态与结构学时分配：1.5 学时掌握：细菌测量单位；细菌的基本形态；细胞壁肽聚糖的结构；革兰阳性和阴性菌细胞壁的不同点及其意义；细菌的特殊结构；荚膜的概念和功能；鞭毛的概念和功能；菌毛的定义、种类和功能；芽胞的概念，形成条件和功能；革兰染色法及其意义。

熟悉：细菌的排列方式；细菌的基本结构：细胞壁、细胞膜、细胞质、核质、核蛋白体、质粒等各种细菌都具有的结构；细菌细胞壁的功能；细菌细胞壁缺陷型（细菌L型）的基本概念及其临床意义；；荚膜的化学组成、形成条件。

了解：细菌的大小；细菌L型的培养；细胞膜的结构与功能；中介体的概念；细胞质内的核蛋白体，质粒，胞质颗粒在医学上的意义；核质的功能；鞭毛菌的分类；芽胞的形状、大小和位置；繁殖体的概念；细菌形态与结构检查法；单染色法；抗酸染色法；特殊染色法。

《微生物学》课程教学大纲课程名称：微生物学课程类型: 必修课总学时： 108 讲课学时： 54 实验学时：54学分：3适用对象: 生物工程专业先修课程：普通生物学，生物化学一、课程性质、目的和任务微生物学是生命科学的一个重要分支，是生物工程专业的一个重要的学科基础必修课。

通过本课程的学习，使学生掌握微生物学在生命科学领域发展中的作用；微生物的主要类群；微生物的生长规律及控制；病毒的结构、复制、防治；了解微生物学的研究方法和手段；培养学生“综合”生物学的科学思想，从而使学生能够运用“综合”思想解决生物学中的问题，为学生学习有关后续课程提供必要的理论基础。

二、教学基本要求通过本课程的学习，要求学生系统掌握微生物学在生命科学领域发展中的作用；微生物的主要类群；微生物的生长规律及控制；了解微生物学的研究方法和手段。

三、教学内容及要求（一）绪论1.教学基本内容：（1）微生物与人类；（2）微生物的发现和微生物学的建立与发展；（3）微生物的类群及特点；（4）微生物学研究对象与任务；（5）本课程的目的、要求及范围。

2.要求：通过教学，引导学生走进微生物世界，了解微生物的概念和作用以及它们与人类的特殊关系；明确微生物学作为一门独立学科在生命科学发展中的重要作用和地位；展望未来，激发学生的学习兴趣和明确肩负的重任。

（二）微生物细胞的结构和功能——原核微生物1.教学基本内容：（1）细菌的形态、结构和繁殖，细菌的群体形态；（2）放线菌的形态、结构和繁殖，放线菌的群体形态；（3）蓝细菌的形态、结构和繁殖；（3～5部分用图表形式概要描述）（4）支原体、立克次氏体和衣原体的形态、结构、功能和繁殖；（5）古生菌的概念、细胞形态和细胞结构。

2.要求：掌握细菌、放线菌的个体形态、细胞结构、化学组成、群体形态特征、繁殖方式。

了解蓝细菌、支原体、立克次氏体、衣原体及古生菌的基本结构特点和生活特性。

（三）微生物细胞的结构和功能——真核微生物1.教学基本内容：（1）真核微生物的概述；（2）酵母菌的形态、结构和繁殖，酵母菌的群体形态；（3）霉菌的形态、结构和繁殖方式，重点以青霉和曲霉为主，霉菌的群体形态；2.要求：掌握酵母菌、霉菌的个体形态、结构、群体形态特征、繁殖方式。

四川大学华西医学院医学微生物学I--教学大纲医学微生物学Ⅰ《教学大纲》一、课程基本信息课程名称：医学微生物学（Medical Microbiology）课程号：501106030课程类别：类级平台课学时：48 学分：3二、教学目的及要求医学微生物学是生命科学中的重要学科，是研究病原微生物的形态、结构、生命活动规律以及与机体相互关系的一门重要的基础医学二级学科。

为医学生学习临床的感染性疾病、传染病、超敏反应性疾病和肿瘤发生等奠定重要的理论基础。

要求学生熟悉微生物学基本理论知识，掌握病原微生物的致病机制及其诊断、预防的主要措施。

三、教学内容本课程主要讲述微生物的基本概念，各类微生物的生物学特性、感染及抗感染免疫的机理、感染性疾病的诊断、预防和治疗原则。

针对五年制医学类本科生，着重介绍与人类疾病相关的各种病原微生物（以常见的病原性细菌和病毒为主）的形态结构、培养特性、生化反应、抗原构造、分类、抵抗力等各种生物学特性，致病机理及所致疾病，病原体的分离培养方法及鉴定原则，相关疾病的预防及治疗原则。

通过学习，使同学牢固树立“有菌观念”并掌握无菌操作的原则，学会保护自己，也为将来专业课的学习奠定良好的基础。

同时，针对八年制学生的特点，不仅讲述上述知识，而且结合目前临床感染的现状，向同学介绍新现和再现的病原微生物、有关细菌的耐药、微生态平衡与失调、医院内感染及肿瘤相关病毒的知识，以适应七年制教学的要求，拓展学生的视野，提高学生的科学研究能力，培养更高层次的学生。

大纲中的英文黑体字内容要求掌握，其他内容要求熟悉。

Outline of Medical MicrobiologyIntroduction （1 h）1. Definition, Classification and Characteristics of Microorganisms.（1）Concept:（2）Classification:1）Non-cellular type: Virus2）Prokaryotic group：Bacteria，Actinomyces，Rikettsia，Chlamydia，Mycoplasma，Spirochete3）Eukaryotic type：Fungi（3）Characteristics.2. Relation between Microbes and Human.Be more beneficial than harmful to Human.3. Developmental history of microbiology（1）Experiential period of microbiology（2）Experimental period of microbiology1) Morphological period2) Physiological period:Louis Pasteur; Robert Koch; Iwanovsky（3）Modern Microbiological period.Chapter 1 Bacterial Morphology (4 h)1. Bacterial Size and Morphology（1）unites of measurement：μm (micron or micrometer)（2）Basic morphology：:Coccus；Bacillus；Spirillar bacterium (Vibrio；Spirillum)（3）Arrangement of bacteria2. Basic structure of bacteria（1）Cell Wall1) Composition.Main component: Peptidoglycan：Backbone，Side chain，peptide cross-bridge : Teichoic acid of Gram+ bacteria Outer membrane of Gram- bacteria2) Cell Wall Comparison between Gram+ and Gram- bacteria.3) Function4) L Type bacteria（2）Cell membrane：Composition；Function；Mesosome （3）Cytoplasma：Ribosomes；Plasmid；Metachromatic granules（4）Nucleus3. Special structures of bacteriaCapsule；Flagellum；Pilus or Fimbriae；Spore4. Examination and Staining:Simple staining:; Complex staining:Gram’s Stain：M e c h a n i s m；Procedure；Result；Practical SignificanceChapter 2 Bacterial Physiology (3 h)1. Chemical Composition and Physical Characteristics of Bacteria.2. Growth and Mutiplication of bacteria（1）Nutritional types of bacteria（2）Mechanism of nutrient intake（3）Basic requirment of bacterial mutiplication1）Nutriention：water；carbon source；nitrogen source；inorganic salt；growth factors (Enzymes，Amino acid)2) Optimal pH：pH 7.2-7.6 for the most pathogen；pH 6.5-6.8 for T.b；pH 8.5-9.0 for vibro3) Proper Temperature：37℃for the most pathogen4) Definite gaseous: O2, CO2, N2Anaerobic principles of anaerobes：Do not possess cytochrome oxidase nor cytochrome；Do not possess hydrogen peroxidase, catalase and superoxide dismutase 3. Methods and speed of bacteria growth.Manner：Simple binary fissionSpeed：one generation/15-20’；one generation/20h. (T.b.)4. Typical growth curve of bacteria.（1）Lag phase：a period of adaptation（2）Logarithmic phase：rapid growth，have typical biological property and higher sensibilityto external factor（3）Stational phase：Gain bacterial metabolite and spore（4）Decline phase5. Cultivation of bacteria（1）Classification of media（2）The phenomenon of bacterial growth6. B a c t e r i a l m e t a b o l i s m（1）Metabolic products and biochemical Testing（2）Synthetic products:Pyrogen ；Exotoxins ；Endotoxins；Antibiotics；Bacteriocin；Vitamin；pigmentChapter 3. Bacterial genetics and variation (4 h )1. Bacterial variation:（1）Morphological and structure change：H-O ；（2）Colonial variation：S-R（3）Lose of virulence：BCG；（4）Antibiotics-resistant variation.2. Genetic basis of bacteria（1）Chromosome：P a t h o g e n i c i t y i s l a n d（2）Plasmid: Concept；Character；F factor；R factor；Col factor（3）Transposable element：I n s e r t i o n s e q u e n c e s；T r a n s p o s o n s（T n）；Integron（In）（4）Bacteriophage1) Concept2）Properties of phage:3）Relation between host cell and phageVirulent phage；T emperate phage (Lysogenic phage)；Prophage；lysogenic bacteium.4) Application of phage3. Mechanism of Bacterial Variation.（1）Mutation（2）Gene transfer and recombination1) Transformation: The Naked DNA derive from one cell is taken up by anotherrecipient and DNA recombination can take place.2) Transduction：Gene transfer mediated by a bacteriophage.i.e. the DNA of one bacterial cell is introduced into another recipient by bacteriophage infection.(a) Generalized transduction -- any of donor genetic information transfer to thechromosome of recipient(b) Restricted transduction -- Bacteriophage can only transfer certain genes from thedonor to recipient cells.3) Lysogenic Conversion: Some bacteria are infected by a temperate phage and theirDNA recombinated together and expressed.4) Conjugation:Many bacteria can transfer genetic information (chromosome,plasmid) through contact of the two cells by way of sex pili 4．Practical Significance of Bacterial Variation（1）Diagnosis & nontypical strain；Prevention &vaccine；Clinical treatment.（2）Apply of auxotroph mutation（3）Use in taxonomy and epidemiology（4）Genetic engineering：Gene therapy.Chapter. 4 Bacterial Drug-Resistance (1 h)Self-learning + Discussion1．IntroductionAntibiotic resistanc in human and animal; mutiple antibiotic resistance, mar2. Mechanisms of anti-bacterial agents：3. Mechanisms of antibiotic resistance（1）Genetic MechanismsR Plasmid ；Transposon；IntegronDrug-resistance could be transmitted by conjugation. transformation and transduction.(2) Biochemical mechanism1）Target site modification: PBPs ; DNA gyrase; gyrA, gyrB gene mutation..2）Modified enzyme：β–lactamase；extended –spectrum β–lactamase；aminoglycoside-modifiled enzymes3）Active efflux pump4）Change of permeability of bacterial cell wall：porin, OmpF; OmpC5）Biofilm4. Common drug-resistant bacteria in hospital infection5. Prevention and treatment principlesChapter . 4 Bacterial infection and Anti-bacteria Immunity (3h) 1. Normal flora and opportunistic pathogens(1) Concept and Physiologic functions of normal flora（2）Conditions of opportunistic infectionConolization changed；Lower immune function；Dysbacteriosis.2. Bacterial Pathogenecity（1）Virulence：LD50(Lethal Dose 50) —the number of microbes that must beadministered to kill 50% of the animals.Invasiveness and T oxin1）Invasiveness：Bacterial related structures（pili，LTA，capsule，microcapsule）；Invasive enzyme（Hyaluronidase；Coagulase:）2）Bacterial toxin：Exotoxin；Endotoxin；Differentiation of exotoxin and endotoxin （2）Number of bacterial entry （3）Portal entry.3. Anti-bacteria Immunity（1）I nnate immunity: Barrier system；Phagocyte；Immune molecule（2）Adapted immunity ：Humoral immunity；Cellular immunity；Mucosal immunity （3）Immunity to extracellular bacterium：Antibody, Phagocyte and Complement （4）Immunity to intracellular bacterium：T cell-mediated immunity （5）Immunity to exotoxin：Antitoxins4. Bacterial infection（1）Infectious sources.1) Exogenous infection：patients；carrier；animal.2) Endogenous infection（2）Infectious types1) Inapparent infection (subclinical infection)2) Apparent infection：Toxemia；Septicemia；Bacteremia；Pyemia；Endotoxemia5. Hospital infection（nosocomial infection）（1）Concept（2）Classification of hospital infection1）According to the sources of pathogens：Endogenous nosocomial infection (self-infection)；Exogenous nosocomial infection (cross-infection) patients2）According to the infection position：urinary drainage infections is most common；surgical infections；skin infection（3）Common properties of pathogenic microbs（4）prevention and control1）Asepsis：sterilization and disinfection.2) Isolation and precaution：patients；drainage-secretion；blood mainpulation.3) Antibiotics application in rationality4) Organization:Chapter . 6 Microbiological Diagnosis &Prevention &Treatment of Bacterial Infection(1.5 h)1. Procedure of detection for pathogenic bacteria（1）Sample collection and treatment; to smear and stain;（2）Isolation and culture；（3）Biological tests;（4）Serological tests. (Identification)；（5）Animal tests（6）Drug sensitive test；（7）Phage typing;（8）Molecular technology: fingerprinting ,DNA hybridization; PCR（9）Serological diagnosis：For detection of Antibodies.2. Prevention (control) of bacterial infection（1）Artificial active immunity：Vaccines；T oxoids（2）Artificial passive immunity：Antiserum；Antitoxins3. Treatment of bacterial infectionAntimicrobial agents include antibiotic and synthetic drugs Chapter . 7 Disinfection and Sterilization (1.5h)1. Introduction of ConceptDisinfection；Sterilization；Asepsis & Aseptic technique；Antisepsis；Sanitation 2. Physical methods of Disinfection and Sterilization（1）High Temperature：Including dry heat and moist heat.1）Dry heat：Incineration；Flame；Hot air sterilizer；Ultra-red ray；Microwave 2）Moist heat：Pasteurization；Boiling water；Autoclaving；Free-flowing steam；Fractional sterilization（2）Radiation：Ultraviolet Radiation；Ionizing Radiation（3）Filtration：Remove bacteria in liquid or gas through mechanical obstruct of filter Filter；Biological Cleaning technology3. Chemical methods of Disinfection and Sterilization4. Affected agents to disinfection5. Usage of disinfection6. BiosafetyChapter. 8 Coccus （3 h）1．Common features and classification2．Comparison between staphylococcus and streptococcus （1）Biological Characterisation :Morphology and staining; Culture; Ag structure;（2）Pathogenic substances and diseases caused.（3）Microbiological diagnosis.1) Stained smear. 2) Isolation and culture：α、β、γ strain（4）Principle of prevention and treatment:Personal hygiene; Carriers; Hospital cross infection; Patients.3. Pneumococcus (streptococcus pneumoniae)Pathogenisis is relate to capsule；Pneumococcal pneumonia4. MeningococcusPathogenisis is related to endotoxin and capsule；Meningitis5. Gonococcus：PathogenisisChapter.9 Enteric bacilli （2.5 h）1. Common properties of Enteric bacilli.2. Escherichia Coli(E. Coli)（1）Basic properties（2）Pathogenisis：Apportunitistic bacilli；Pathogenic E. Coli .1) Pathogenic factors ：Colonization factor (adhesin)；Enterotoxin ()Heat Labile erterotoxin (LT) & Heat stable enterotoxin(ST)2）diseases：Infection in outside of intestinal tract：Pyogenic diseases：peritonitis，cholecystitis，pyelitis.Diarrhea：ETEC，EPEC，EIEC，EHEC，EAggEC（3）Diagnostic tests:For pathogen：1) Specimen: urine, stool , blood, pus.2) isolation and identification:Hygienic tests.3. Shigella（1）Comparison in biological properties.（2）Pathogenesis：1) Pathogenic factors ：adhesin；Endotoxin；Exotoxin2）Infection：Shigellosis(3) Diagnostic laboratory test：Specimens，Procedures（4）Prevention and Control：.3. Salmonella（1）Comparison in biological properties.（2）Pathogenesis：1) Pathogenic factors ：2）Infection：Enteric fever (typhoid fever)；Septicaemia；Enterocolitis.(food poison)；Nonsymptome Carriers(3) Diagnostic laboratory test：Specimens，Procedures，widal test（4）Prevention and Control：.Chapter. 10 Vibrio Cholerae （0.5 h）1. Basic Properties2. Pathogenisis.（1）Pathogenic factors：1）V. Cholerae hibitate only adherence to the intestinal epithelial cellular surface. not enter into cells and blood.2）Cholerae enterotoxin: basic structure and pathogenic mechanism.（2）Infection：Cholera3. Diagnostic laboratory test：Rapid diagnosis；Culture.4. PreventionChapter. 12 Mycobacterium （2 h）1. General characteristicsMorphology；Culture；Resistance2. Pathogenicity：（1）Pathogenic factors：without exotoxin，endotoxin and invasive enzymes，its cell composition (lipid)，capsule and protein (tuberculin protein) related to pathogenicity.（2）Infection：1) lung infection：Primary infection (children) ；Secondary infection (age>25 )2）Out lung infection3. Immunity and-infection immunity（1）Cellular immunity；Infection immunity；hypersensitivity（2）Tuberculin test（OT test）：principle，procedure，results and explanation 4. Baterial diagnosis（1）Specimens：sputum, pus, CSF, stool, urine, etc.（2）Microscopic examination：Acid fast stain.（3）Culture：solid culture media method; slide culture media method.Animal inoculation-guinea pig.5. Prevention：BCG vaccinationChapter. 13 Anaerobic bacteria （1 h）(Clostridium)Cl.Tetani ; Cl.Perfringens ; Cl.Botulinum1．Common characteristicsMorphology and stain: G+ Bacilli; posses spore.Culture；Resistant；Exotoxin；2. Pathogenicity.（1）Pathogenic factors:Cl. Tetani Cl. Perfringens Cl. BotulinumTetanospasmin. Tetanolysin; Exotoxin (12)invasive enzyme;Exotoxin (8)（2）Diseases:3. Diagnostic laboratory tests.4. Prevention and treatment.Chapter. 16 Actinomyces（0.5 h）1. Concept & Characteristicsprocaryotic. Taxonomic position between Fungi and bacteria.2. Important species——A. Israelii3. “sulfur granules”in pus or tissue are diagnostic significanceChapter. 17 Mycoplasma（0.5 h）1. Concept & Characteristicsprocaryotic. smallest (0.2~0.3um) free-living microorganisms, no cell wall, highly pleomorphic, can pass through filtres that retain most bacteria.Colonies minute (<0.2mm), show a “fried-egg appearance”Exist in mouth, respiratory and genito-urinary tracts, common contaminants of tissue-culture.2. lmportant species and infectionM. pneumoniae：primary atypical pneumonia;M. hominis：genito-urinary infections.Ureaplasma urealyticumChapter. 18 Spirochete（0.5 h）1. Concept & Characteristics(1) Procaryotic, slender, flexible, helical, actively motile organisms.(2) Not easily to stain, always use: dark-field microscopy for livingspecimens silver-impregnation for fixed specimens negative stain2. Classification:three genera of pathogenic spirochetes:(1) Leptospira; (2) Treponema; (3) Borrelia.3. lmportant species and infectionLeptospira；T.phllidumChapter. 19 Chlamydia（0.5 h）1. Concept & CharacteristicsA procaryotic organisms of obligate intracellular parasites, have a unique development cycle, can pass through the filters.（1）Both DNA+RNA；Binary fission.（2）Intracellular multiplication.（3）D e v e l o p m e n t a l c y c l eElementaly body—has infectivity；Initial body——No infectious.2. lmportant species and infectionC.trachomatis；C.pneumoniae；Chapter. 20 Rickettsia（0.5 h）1. Concept & CharacteristicsProcaryotic；Obligate intracellular parasites；Most of them infect both human & animals, transmitted by arthropod vectors.2. lmportant species and infection3. Share common antigens with certain strains of proteus (OX19, OX2, OX k).Weil-Felix test is a famous test to help diagnosisChapter. 21 General properties of viruses (3 h) 1．Size and shape:2．Structure and composition:（1）Necleocapsid =Nucleic acid +capsid（2）Virion = Nucleocapsid (Naked virus)= Nucleocapsid + Envelope (envelope virus)（3）Nucleic acids & protein3．Multiplication or Replication;（1）Replicative cycle1) Adsorption and penetration;2) Uncoating:;3) Biosynthesis: dSDNA4) Assembly, maturation and release：release by lysis or budding（2）Growth Curve of virusEclipse phase; Logarithmic phase; cell death phase.（3）Interference（4）Abnormal multiplicationDefective virus；Abortive infection4. Genetics and Variation（1）Viral variation types（2）Viral molecular genetics.（3）Practice significance of viral variatio n：Research in viral pathogenesis；In diagnosis；In treatment；In prevention；In genetic engineering.5. Reaction to physical and chemical agents（1）Physical factors:Temperature：Resistant to cold —be stored -70℃；Susceptible to heatpH（2）Chemical factors6. Classification of viruses（1）Usually according to transmission routes;（2）Subvirus：virusoid；viroid；prion.Chapter. 22 Viral Infection and Anti-viral immunity (3 h)1. Viral Infection（1）Transmission and Entrance1) Horizontal transmission (between individuals):2) Vertical transmission (mother to baby)3）Spreading within the host（2）Viral infectious forms1) Inapparent viral infection (subclinical infection)2) Apparent infection (Dominant infection)Acute infectionPersistent Infection：Chronic infection；Latent infection；Slow virus infection （3）Viral Pathogenesis1) Effect on host cellCytocidal effect；Steady state infection；Cell apoptosis；IntegrationCell transformation；Inclusion body formation (Negribody)2) Effect on hostDirect damage；Immunopathology(Type II、III、IV hypersensitivity)Direct effect on immune system2. Anti-viral immunity（1）Non-Specific Immunity (Innate resistance)Interferon（IFN）（2）Specific ImmunityVirus neutralizing antibody；Cellular immunity（3）Duration of acquired immunityChapter. 23 Diagnosis, Prevention &Treatment of Viral Infection(1 h) 1. Microbiologic diagnosis for virus（1）Sample collection and treatment（2）Rapid diagnosis：Direct identification of virus；viral nucleic acid or viral Ag；Virus particles — EM or IEM；Inclusion body — microscopy;Immuno-Label techniques; Other Immunoassay: RIA, ELISA, IF;Nucleic acid hybridization technique; Isolation and identification of viruses.（3）Culture method selection and cultivation1）Animal inoculation2）Egg-embryo inoculation；3）Tissue culture (cell culture)：Primary cell ; Cell line ; Blind subculture Recognition of virus growing in cell culture --- CPE Identification：Serological identification；Nucleic acid identification（4）Serologic diagnosis (detect unknown Ab) methods:（5）Quantification of virus：either alive or inactivated virus：Electron microscopy；Hemagglutinationonly for alive virus：Plaque assay；50% Lethal dose (LD50) and 50% infect dose (ID50, TCID50), 2. Prevention (control) of viral infection（1）Artificial active immunity：Vaccines（2）Artificial passive immunity：3. Treatment of viral infectionAnti-viral drugsChapter. 24 Respiratory Viruses (Influenza virus)（2 h）1. Biological properties（1）Morphology and structure：HA & NA Relationship between the antigenic variation and epidemiology （2）Replicative cycle（3）Type and VariationAntigenic drift：median or small epidemicAntigenic shift：large scale epidemicVariation of HA and NA of influenza virus2. Pathogenicity and immunity（1）Source of infection patients and carriers.（2）Pathogenesis3. Laboratory diagnosisIsolation and identification of viruses；Serological diagnosis：HI，NT.4. Prophylaxis and treatmentpersonal hygiene; vaccines.Chapter. 26 Hepatitis Viruses （3 h）In general, heptatitis viruses are composed of HA V, HBV, HDV, HCV, HEV and HGV .1．Hepatitis A virus (HA V)（1）Biological properties（2）Pathogenicity and immunity1）Source and transimssion：acute patients；fecal --oral (mainly)2）Pathogenesis：direct damage and immunopathogenesis.3）Immunity：persistant imunity after recovery2. Hepatitis B virus (HBV)（1）Biological properties1）Morphology and structure：Dane particle ：42nm with double coats; dsDNA.Small spherical particle：22nm with HBsAg only.Tubular or filamentous form：22nm with 100-700nm in length.2）Genetic structureStructural features；4 ORF3）Composition of viral antigensHBsAg：glyco-lipoprotein in viral surface；Pre-S1 Ag；Pre-S2 AgHBcAg：protein, viral core Ag；HBeAg：protein, viral e Ag.（2）Pathogenisis and Immunity.1) Transmission：Sources：Patients，HBV carriersRoutes：Parenteral administration；Human Plasma；Blood products2) Immunopathology:（3）Microbiologic diagnosis:1) Specific Ag & Ab：HBsAg & Anti-HBs；HBeAg & Anti-HBe；Anti-HBc2) HBV DNA:DNA hybridization techniques；PCR3) Dane Particle: IEM;4) DNA polymerase:（4）Prevention and treatment.treatment of patients；Cut off the infectious route；Immunization：Vaccines；HBIg3. HCV ，HDV & HEVChapter. 29 Herpes virus family （1 h）1. Introduction2. Common biological properties（1）dsDNA: Surrounded by protein coat (Nucleo-capsid) icosahedral symmetry. （2）Envelope: (Size 150-220 nm)：Sphericalvirion（3）DNA replication in cellular nucleus, and budding from nuclear membrane （4）produced intranuclear acidophilic inclusion body.3. lmportant species and infectionHSV；VZV4. Microbiolocal diagnosis（1）Isolation of virus:(cell culture)（2）DNA Hybridization（3）Antibody：IF, ELISAChapter . 30 Retrovirus (HIV) （2 h）1. Introduction:（1）Basic Properties（2）Classification: (3 Subfamilies)2.HIV（1）Biological properties1）Morphology and structure：gp120；gp41Genome: SS RNA；Structure genes；Regulatory genes2）Replication：Reverse transcription（2）Pathogenisis and Immunity1）Transmission：Sources：AIDS，HIV carriersRoutes：Sexual transmission route；Blood transmission route；Vertical transmission 2）Pathogenic mechanism CD4 co-recepter：CCR5 & CXCR4T4/T8 <1；Cellular Immunity↓3）Clinical symptoms:Clinical stages；ARC：fever，weight↓，fatique，diarrhea；Kaposi Sarcoma；Opportunistic infection:（3）Diagnosis:1）Anti-HIV：Preliminary screening：ELISA；Confirmatory test：WB2）Isolation of HIV from blood.；3）T4↓. T H/T S <1；4）HIV RNA ：PCR. （4）Treatment and Control:Treatment of patients；Cut off the infectious route；Chapter . 32 Prion （0.5 h）1. Biological properties（1）Nature：Protein（2）Gene（3）PrP c & PrP sc2. PathogenisisMain Prion diseases3. Diagnosis:4. Treatment and Control:Chap. 33-34 Fungi (2 h)1. Biological properties（1）Morphology and structure：Eucaryotic cellUnicellular——yeasts，yeast-like organism，cryptococcus neoformans Multicellular——molds：hyphae；spores （2）CultureSabouraud’s medium；3 types colony（3）Variation and resistance2. Classification and disease（1）Dermatophytes, causing superficial mycoses (skin, hair, nail).（2）Causing opportunistic mycose s1) Candida albicans:2) Cryptococcus neoformans（3）Causing allergy（4）Causing Mycocoxicosis（5）Causing Cancer-related disease.3. Detection:（1）direct observed by microscope: hair; （2）Culture:（3）Animal inoculation: cryptococcus neoformans.四、教材（名称、作者、出版社、出版时间）。

《医学微生物学》课程教学大纲一、课程的作用与目的《医学微生物学》是生物科学与生物技术专业本科生的一门专业选修课，主要研究与医学有关的病原微生物的生物学性状、致病性、免疫性、微生物学检查法、特异性预防和治疗原则等的科学。

通过该课程的学习，使学生掌握与医学有关的病原微生物的形态、结构、代谢活动、遗传和变异、致病机理、消毒与灭菌、机体的抗感染免疫、实验室诊断及特异性预防等。

了解病原微生物的生物学特性与致病性以及常见的病原性细菌、真菌及病毒；认识机体对病原微生物的免疫作用，明确感染与免疫的相互关系及其作用规律；了解感染性疾病的实验室诊断方法及预防原则。

二、课程基本要求1.掌握病原微生物的形态、结构、代谢活动、遗传和变异、致病机理；2.掌握病原微生物的消毒与灭菌方法；3.认识机体对病原微生物的免疫作用，明确感染与免疫的相互关系及其作用规律；4.了解感染性疾病的实验室诊断方法及预防原则；5.能正确观察、记录实验数据和实验现象，正确处理实验数据和书写实验报告。

三、教材及主要参考书1．教材：《医学微生物学》，黄汉菊，高等教育出版社，20092．参考书：[1]《医学微生物学》，严杰，高等教育出版社，2008[2]《医学微生物学》，李凡、谷鸿喜、黄敏，高等教育出版社，2002[3]《医学微生物学》，吴移谋．高等教育出版社，2003[4]《医学微生物学实验指导》，王传恩，中山大学出版社，2002四、教学内容第一章细菌的感染与免疫主要内容：感染、致病菌、非致病菌、条件致病菌的含义；微生态学的含义；正常菌群的含义、分布和生理学意义；成为条件致病菌的条件；菌群失调、菌群失调症、二重感染的含义；医院获得性感染的含义；细菌的致病性；宿主的免疫防御机制；感染的发生与发展。

重点：细菌感染的来源、传播方式与途径、环境因素对感染的影响；感染、致病菌、非致病菌、正常菌群、条件致病菌、医院获得性感染、微生态学的含义；条件致病菌形成的特定条件；细菌致病性的物质基础、抗感染免疫的种类及机制、感染的类型。

医学微生物学Ⅱ《教学大纲》一、课程基本信息课程名称：医学微生物学（Medical Microbiology）课程号：50127620课程类别：类级平台课学时： 34学时学分：2分二、教学目的及要求医学微生物学是重要的医学基础课程之一，通过本课程的学习，主要要求学生掌握与医学相关的微生物（细菌、病毒为主）的基本生物学性状、感染与抗感染免疫的机理、感染性疾病的诊断、预防与治疗原则。

本大纲所规定的内容，都是本科生在学习过程中所必须掌握和熟悉的基本理论和基本知识。

这些内容，主要是通过课堂讲授或自学的形式传授给学生。

课程考核方法为理论考核。

三、教学内容医学微生物学是研究病原微生物的形态、结构、生命活动规律以及与机体相互关系的一门科学。

是基础医学中的一门重要学科。

为学习临床各科的感染性疾病、传染病、超敏反应性疾病和肿瘤等奠定重要的理论基础。

同时，也可运用所学的知识直接控制和消灭感染性疾病。

医学微生物学分为基本原理、细菌学、病毒学和真菌学四篇。

在基本原理中主要叙述微生物的形态结构、新陈代谢、生长繁殖等生物学特征、感染与抗感染免疫的机理、遗传变异的规律、微生物与人体的相互关系，以及微生物学检查法和防治原则等内容。

在细菌学、病毒学和真菌学中主要介绍几种引起较为常见感染性疾病的微生物的基本生物学性状、致病因子、抗感染免疫机理以及所致疾病诊断、预防与治疗原则。

第一章绪论掌握内容：微生物（microorganism）的定义、特点、分类。

非细胞型、原核细胞型及真核细胞型三大类微生物的基本特点。

熟悉内容：微生物在自然界中的分布。

微生物在国民经济中的作用及其对人类健康的影响。

微生物学发展过程学时分配：0.5学时第一篇微生物学的基本原理第二章微生物的生物学性状掌握内容：细菌（bacterium）的大小、形态与排列。

细菌细胞壁的结构和功能，革兰阳性菌和革兰阴性菌细胞壁结构的差异及其在革兰染色中的意义，细胞壁缺陷型细菌——L型细菌的概念、特点及其在医学上的意义。

微生物学》教学大纲学时数：90 专业：临床医学课程的性质、目的和任务微生物学是一门独立的学科，主要特点是与其它的基础学科及临床传染病学等有密切的关系，是培养优秀的临床医生所必不可少的基础学科之一。

培养目标是让学生掌握微生物学的基本理论，并对相关的临床疾病及传染规律有初步的了解，为传染病及感染性疾病的诊断、治疗和预防打下基础。

二．课程教学的基本要求1 ．微生物学理论课：了解微生物学的发展历史，掌握各类微生物的基础知识，并使学生掌握收集相关知识、信息的思路、技能，了解致病性微生物与相应感染的关系。

2 ．微生物学实验：根据微生物学教学改革的发展，实验课容将逐渐减少，形式上以示教为主，动手实验为辅。

主要目的是让学生对微生物的分布、分离、培养及无菌操作技术等有一定的了解。

三．教学容第一章．绪论目的与要求：使学生了解微生物学的发展历史，相关领域的研究进展及微生物学涉及的容、围、微生物与传染病的关系、学习的方法。

学时：2 小时容： 1 、微生物学发展历史与现状2 ．微生物与传染病。

传染病的病原学诊断3 ．新技术对传染病控制的意义和应用方向4 ．微生物的分类第二章．细菌的结构目的与要求：了解细菌的细胞结构，与生物学功能及抗菌感染药物作用的关系。

学时：3 小时容：1 、细菌的进化位置2 ．细菌的基本结构及抗菌药物的作用靶目标3 ．细菌的特殊结构及生物学功能4 ．细菌的形态学检查方法与应用第三章．细菌的生长与代目标与要求：了解细菌生长的必需条件，细菌繁殖的方式、速度及其生物学和临床的意义。

掌握细菌在人体的分布及意义，培养基的主要种类和应用。

了解细菌代产物在临床疾病及诊 断中的意义。

3 小时1、细菌的生长方式、生长曲线2 ．细菌生长的条件：营养物、 ph 值、温度、气体环境。

“定植”的概念3 ．细菌的代特点4 ．代产物及其生物学的意义5 ．培养基的制备与应用第四章． 细菌的遗传与变异了解细菌的基因结构、遗传规律。

从分子、细胞及生物群三个层次上理解变异的机制、 生物学的意义。

课程编号：《微生物学》授课大纲学时数： 72讲课：72学制：四年制本科适合专业：生物科学有关专业一、本课程的性质和任务（一）课程的性质微生物学是生命科学中一门理论与实践性较强的重要基础课程，是一门对现代生命科学的发展发挥着不可以取代的重要作用的学科，故本课程分为理论解说和实践授课两大部分（实验部分还有授课大纲）。

理论课授课主要解说微生物发展的历史、微生物的形态构造、营养和代谢特点、遗传规律、生态、传染与免疫和系统分类等内容。

（二）课程的任务：本课程主要面对生物科学专业的本科学生讲课，是专业必修课。

经过学习微生物的形态构造、生理生化、生长生殖、遗传变异、生态分布、传染免疫、分类判断以及微生物与其他生物的互有关系及其多样性，在工、农、医等方面的应用，认识该学科的发展前沿、热点和问题，使学生牢固掌握微生物学的基本理论和基础知识，认识微生物的基本特点及其生命活动规律，为学生今后的学习及工作实践打下宽厚的基础。

二、本课程与其他课程的联系：微生物学是一门专业基础课，与好多课程关系亲近，应在生物化学、遗传学、生理学等课程的基础进步行学习，并为今后专业课，如遗传学、生物化学等课程的学习确定基础。

三、授课内容（一）第一章绪论一、本学期的授课安排二、微生物和你三、微生物学四、微生物的发现和微生物学的发展五、 20 世纪的微生物学六、 21 世纪微生物学发展的特点和趋势授课基本要求：学习微生物学这门课程，必定第一认识什么是微生物、主要种类、特点、发展情况、研究意义等等。

本章要修业生在联系本质的情况下掌握微生物的见解、特点，并提起学生学习微生物的兴趣。

主要知识点与重点：微生物的见解、类群及特点。

（二）第二章微生物的纯培养和显微技术第一节微生物的分别和纯培养一、无菌技术二、用固体培养基获得纯培养三、用液体培养基获得纯培养四、单细胞（孢子）分别五、选择培养分别六、微生物的珍藏技术第二节显微镜和显微技术一、显微镜的种类及原理二、显微观察样品的制备第三节显微镜下的微生物一、细菌和古菌二、真菌三、藻类四、原生动物授课基本要求：掌握微生物学研究的基本技术，即无菌技术、纯种分别技术、培养技术及显微镜技术。

医学微生物学教学大纲一、课程简介医学微生物学是研究医学中各种微生物及其与人类（及动植物宿主）关系的科学。

它对医学、健康科学等生命科学领域具有广泛的应用，是广大医学院校学生必学课程之一。

本课程旨在让学生掌握传染病的基本概念和传染病的形成与发展的机制，为学生提高传染病的预防及控制能力以及提供有效的应对措施奠定良好的基础。

课程内容涵盖的领域包括医学微生物学的基础和临床应用，包括凝聚态质的物种、细菌学、传染病学、免疫学等。

二、教学目标本课程旨在使学生掌握微生物学基础理论，熟悉细菌学、传染病学及免疫学等医学生物学基本知识；能够根据某种疾病特征诊断微生物性病，同时能够综合运用微生物学理论技能，能够有效地进行抗感染药物的治疗和使用，掌握各种免疫技术等。

有针对性地翻译和应用微生物学的经典原理和相关方法，为从事医学微生物学相关工作或从事其他对医学微生物有关联的工作打基础。

三、教学内容及形式（1）教学内容：包括有微生物学概论（历史发展史、分类系统、微生物的组成、微生物的生殖及耐药性）、细菌学（各种形态细菌的分类、发生、繁殖、检测及特性）、病原生物学、病原微生物的病理生理（病原特性、传播、潜伏期、病因、发病机理、诊断、治疗）、传染病预防、抗感染（免疫学的概念、免疫机制、免疫抗药性、疫苗原理及应用）等。

（2）教学形式：课堂讲授（包括教师讲授、展示教学）、实验操作、案例分析讨论及实践实验（观察、文献检索论文计划、实验设计及研究）。

四、课程考核1. 课堂考试：本课程为选考，考查学生在理论知识积累方面的程度，主要以问答形式为主，并结合小测验形式进行考查。

2. 理论与实践结合的考核：课程侧重实践操作，要求学生在讲授的理论基础上，加强实践练习，能够对病原微生物性病进行识别、分类、鉴定、细菌的分离等实验操作，遵守实验安全要求。

评价学生实操能力及适应医学实践需要的水平，主要以竞赛形式考试。

五、课程备考提示1. 掌握课程基础知识：要认真学习课程教材内容，熟悉传染病理论基础，熟练掌握各类病原体的解剖结构、功能产物、培养基的特性及整个传染病的发病机制。

医学微生物学教学大纲医学微生物学是医学生必修课程之一，旨在教授学生有关微生物的基本知识和技能。

本教学大纲旨在明确课程目标、内容、教学方法、评估和参考书目，以帮助教师和学生更好地开展学习和教学活动。

二、课程目标1. 掌握微生物学的基本概念和分类体系；2. 理解微生物的形态结构、生长特性和病原机制；3. 学习微生物感染与抗感染的免疫学机制；4. 掌握微生物检测方法和常见微生物致病原理；5. 培养学生的实验技能和科学研究能力。

三、课程内容1. 微生物学概述1.1 微生物的定义和分类1.2 微生物的形态结构和生长特性1.3 微生物与人类的关系2. 微生物的传播和感染2.1 微生物的传播途径2.2 微生物的感染机制2.3 感染性疾病的预防和控制3. 免疫学与微生物3.1 免疫系统的基本概念3.2 免疫系统对微生物感染的免疫机制3.3 免疫学在微生物感染治疗中的应用4. 微生物检测和致病原理4.1 常见微生物检测方法4.2 微生物致病原理及相关疾病的防治措施四、教学方法1. 授课讲解：通过教师的讲解，学生掌握微生物学知识和相关概念；2. 实验教学：开展微生物实验，培养学生的实验技能；3. 讨论与案例分析：通过小组讨论和案例分析，提高学生的问题解决能力；4. 学科竞赛和学术研讨：组织学科竞赛和学术研讨活动，培养学生的创新思维和科学研究能力。

五、评估与考核1. 平时成绩：包括课堂参与、实验报告、小组讨论等；2. 期中考试：考核学生对课程内容的掌握情况；3. 期末考试：综合考核学生对整个课程的理解和能力。

六、参考书目1. 《医学微生物学》李华主编2. 《微生物学导论》刘伟主编3. 《医学微生物学实验教程》张明等编著最后，希望通过本教学大纲的制定和实施，学生能够全面了解和掌握医学微生物学的基本知识和技能，为未来的医学实践奠定坚实的基础。

同时，鼓励学生在学习过程中积极思考和探索，培养其创新能力和科学精神，为推动医学领域的发展作出贡献。

微生物学教学大纲一、引言微生物学是生物学的一个重要分支，研究微生物的结构、功能、分类、生理特性、遗传和进化等内容。

本教学大纲旨在为学生提供全面的微生物学知识，并培养学生的实验技能、科学思维和创新能力。

二、教学目标1. 熟悉微生物学的基本概念和研究方法；2. 理解微生物的结构和功能；3. 掌握常见微生物的分类和特征；4. 了解微生物的生理特性和代谢过程；5. 理解微生物的遗传和进化；6. 培养实验技能和科学思维；7. 培养创新能力和团队合作精神。

三、教学内容1. 微生物学的概念和发展历史1.1 微生物学的定义1.2 微生物学的发展历史2. 微生物的结构和功能2.1 细菌的结构和功能2.2 真菌的结构和功能2.3 病毒的结构和功能2.4 寄生虫的结构和功能3. 微生物的分类和特征3.1 细菌的分类和特征3.2 真菌的分类和特征3.3 病毒的分类和特征3.4 寄生虫的分类和特征4. 微生物的生理特性和代谢4.1 细菌的生理特性和代谢 4.2 真菌的生理特性和代谢 4.3 病毒的生理特性和代谢4.4 寄生虫的生理特性和代谢5. 微生物的遗传和进化5.1 微生物的遗传特性5.2 微生物的进化过程5.3 微生物的基因工程应用6. 微生物实验技术和方法6.1 纯培养和鉴定方法6.2 微生物生长曲线的测定6.3 微生物的染色与观察技术6.4 分子生物学技术在微生物学中的应用7. 微生物学在生物工程中的应用7.1 微生物在发酵工业中的应用7.2 微生物在制药工业中的应用7.3 微生物在环境工程中的应用7.4 微生物在食品工业中的应用四、教学方法1. 授课：讲授微生物学的基本概念和理论知识；2. 实验：安排微生物实验，培养学生的实验技能；3. 讨论：引导学生进行讨论和思考，培养科学思维和创新能力；4. 小组活动：组织小组活动，培养学生的团队合作精神；5. 报告和展示：要求学生撰写报告并进行展示。

五、评价方式1. 平时成绩：包括课堂表现、作业质量和实验报告等；2. 期中考试：考察学生对微生物学知识的掌握情况；3. 期末考试：综合考察学生对微生物学的全面理解和应用能力；4. 实验评价：评估学生的实验操作技能和实验报告质量。

医学微生物学教学大纲（供五年制临床医学本科用）大纲说明一、性质、研究对象和任务医学微生物学是研究与医学有关的病原微生物的性状，以及病原微生物在一定环境条件下，与人体间相互关系(感染与免疫的机理), 特异性诊断和预防的科学。

医学微生物学是一门重要的医学基础课程，其任务是通过教学使学生掌握和运用这门学科的基础理论、基本知识和基本技能，为学习有关基础医学和临床医学课程及从事由微生物所致疾病的诊断和防治工作奠定基础。

二、教学目的与要求医学微生物学研究范围广、发展速度快，既包括微生物的形态结构及其机能，又涉及它与人体的相互作用，内容丰富，机理复杂，它不仅为病理学、药理学、预防医学等基础课打基础，也与临床各学科紧密联系。

因此，要求学生掌握微生物学的基本理论、基本知识和基本技能，重点掌握引起常见病、多发病的微生物的生物学特征、致病性、微生物学检查与防治原则。

在学习中要注意把所学的免疫学知识及其他基础知识与微生物学有机地联系起来，学会用辩证唯物主义观点分析问题。

三、教学方法、手段和特点本课程采用多媒体课堂理论讲授，应用声像图表，能直观、形象生动的展示相关内容，使学生学习时能正确理解、掌握所学的内容，教师通过多媒体教学能更好地编写教案，理论与实际相结合，提高教学质量。

四、大纲使用说明：本大纲主要根据第五版医学微生物学本科教材的内容要求，结合我院实际情况而进行编写。

今就其中若干主要问题说明如下：1、本大纲所列内容，多指医学本科（五年制）学生学习过程中所必须掌握、熟悉和了解的内容，也是讲课的依据。

为使学生便于掌握重点，分三级提出要求：即掌握、熟悉和了解。

2、教师在完成教学大纲所规定内容的前提下，可根据各自特点、专长及对象的不同适当机动掌握，充分利用各种教学手段，作某些修改，以达到更好的教学效果。

3、教学内容的段落按二000年全国统编医学微生物学教材第五版，其大体次序是：细菌学、真菌学、病毒学。

在实际教学时，各章节的顺序也可以按照实际需要适当进行调整。