水稻黄绿叶基因YGL4的遗传分析和分子定位
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水稻基因定位方法
水稻基因定位的方法主要有两种:同工酶法和DNA分子标记定位法。
同工酶法是利用水稻的近等基因系的组织(叶片等)提取的酶经等电聚焦并变色显影后,比较不同的近等基因系之间同工酶的差异,以确定某个基因与何种酶连锁。
例如,研究表明sd-1与Estl-2紧密连锁,其重组值为%。
DNA分子标记定位是上世纪80年代后,随着分子生物学的发展而兴起的一种新的基因定位方法。
即利用实验室构建的覆盖水稻全部12条染色体的RFLP、SSLP等分子标记图谱,运用RFLP、SSLP、RAPD和AFLP等方法,通过构建极端株高(高秆、矮秆)基因池筛选阳性标记,再利用阳性标记检测整个群体,根据群体中各个体的基因型计算交换值,从而定位基因。
基因定位研究中最常用的分子定位方法是RFLP和SSLP。
以上信息仅供参考,如需更多信息,建议查阅专业植物学书籍或文献。
分子标记辅助育种技术分子标记辅助育种技术是在水稻、小麦、玉米、大豆、油菜等重要作物上,通过利用与目标性状紧密连锁的DNA分子标记对目标性状进行间接选择,以在早代就能够对目标基因的转移进行准确、稳定的选择,而且克服隐性基因再度利用时识别的困难,从而加速育种进程,提高育种效率,选育抗病、优质、高产的品种。
(一)发展回顾我国的农作物分子标记辅助育种的研究始于90年代初,在过去的近十年时间里,取得了重要的研究进展:1.构建了水稻等作物的染色体遗传图谱;2.构建了水稻染色体物理图谱;3.利用分子标记对我国作物种质资源遗传多样性进行了初步的研究;4.对一些重要的农艺性状进行了定位、作图与标记,相应的基因克隆已在进行。
在基因组计划开展以来的短短的几年时间内,主要农作物的遗传连锁图的绘制均已完成。
1996年我国用RFLP标记对水稻进行作图,构建了水稻12条染色体的完整连锁图。
此后,又构成了有612个标记的水稻遗传连锁图,较好地满足水稻遗传育种工作的需要。
除水稻之外,还绘制了谷子的RFLP连锁图。
构建了大豆分子标记遗传框架图、小麦野生近缘植物小伞山羊草的连锁图以及小麦的第1、第5、第6染色体部分同源群RFLP连锁图等。
1997年,利用广陆矮4号水稻品种构建的BAC文库,建立了631个长度不同的跨叠群。
用水稻遗传图谱上的RFLP标记及STS标记确定了631个跨叠群在水稻12条染色体上的位置,绘制出了水稻的染色体物理图。
该物理图长为352284Kb,覆盖了水稻基因组的92%。
我国近年来对作物的重要性状,如育性基因、抗性基因及产量性状基因的作图与标记方面开展了大量研究工作。
在育性方面,找到了与光敏核不育水稻的光敏不育基因位点连锁的RFLP标记。
定位了水稻不育系5460F的育性隐性单基因tms1,并找到与之紧密连锁(1.2cM)的RFLP标记。
定位水稻野败不育系恢复基因的两个主效基因Rfi3和Rfi4,初步确定了与其中Rfi3基因紧密连锁(2.7cM)的RFLP标记,并已转化为STS标记。
两个水稻叶色突变体的鉴定和基因定位的开题报告一、研究背景:水稻(Oryza sativa L.)是我国重要粮食作物之一,是我国主要的食品作物之一,也是世界上最重要的粮食作物之一。
随着人口的增加和生活水平的提高,对水稻的需求也在不断增加。
因此,提高水稻产量和品质,以满足人们需求,已成为目前水稻育种的主要研究方向之一。
水稻的叶色是水稻生长发育过程中的一个重要指标,也是水稻叶绿素合成和代谢的反应之一。
然而在育种过程中,有时会出现水稻叶色发生突变的情况,这可能对水稻的生长发育和产量产生负面影响。
因此,对水稻的叶色突变体进行鉴定和基因定位,对于深入了解水稻的叶色形成机理,提高水稻品质和产量具有重要意义。
二、研究目的:本研究旨在对两个水稻叶色突变体进行鉴定和基因定位,以研究其叶色形成机理和对水稻生长发育和产量的影响,为水稻育种提供理论依据和实践经验。
三、研究内容:1. 对两个水稻叶色突变体进行外观观察和鉴定,分析其叶绿素合成和代谢的差异;2. 利用基因组学、遗传学、生物化学等方法对这两个突变体的基因进行定位和功能鉴定,探究其叶色形成机理;3. 对比分析这两个突变体与野生型水稻在形态、植株生长和发育、生理生化特性、农艺性状等方面的异同;4. 在不同生态条件下对这两个突变体的生长发育和产量进行场试,验证其对水稻生长发育和产量的影响;5. 对这两个突变体的遗传育种利用进行探讨,为水稻育种提供理论依据和实践经验。
四、研究意义:1. 探究水稻叶色形成的机理,对水稻育种具有重要意义;2. 鉴定和基因定位水稻叶色突变体,可以为深入了解水稻叶色形成机理提供新的思路和方法;3. 研究水稻叶色突变体对水稻生长发育和产量的影响,可以为水稻育种提供理论基础和实践经验;4. 在育种过程中利用这两个突变体,可以加速水稻优异品种的选育和培育。
稻黄单胞菌白叶枯致病变种与寄主水稻互作机制稻黄单胞菌白叶枯致病变种与寄主水稻互作机制研究进展Current Progress in the Research on the Interaction mechanism of Xanthomonas oryzae pv. oryzae with Rice 摘要:由稻黄单胞菌水稻致病变种(Xanthomonas oryzae pv. oryzae, Xoo)引起的水稻白叶枯病是目前水稻最严重的细菌性病害之一,对水稻生产具有极大威胁。
Xoo主要以hrp基因簇编码的三型分泌系统将效应分子注入寄主细胞中,促使其产生抗感病性。
TAL 效应子(Transcription activator Like effector) 作为黄单胞杆菌的蛋白类效应子之一,能够通过三型分泌系统(Type III secretion system,TTSS) 进入植物的细胞核,并与特定基因启动子DNA 结合,类似于真核生物转录因子,启动植物基因的表达,以控制植物的生理生化进程,进而引发抗感病性。
Abstract The Xanthomonas oryzae pv. Oryzae, Xoo cause of Rice Bacterial Blight is at present the most serious bacterial diseases of rice, one of the great threat of rice production has Xoo mainly hrp gene encoding the third Type of the secretion system will effect into host cells of molecules, and urges the produce of feeling sick sexual .Transcription activator Like effector as one kind of Xanthomonas oryzae pv. Oryzae protein effectors , can through the Type III secretion system, TTSS into the nucleus of plants, and And with a particular gene promoter DNA union, similar to the eukaryotes transcription factors, start plant gene expression, to control the plant the physiological and biochemical process and trigger a feeling of disease resistance.水稻是我国重要的粮食作物,种植面积约占粮食作物总面积的30%,而总产占粮食总产的40%。
转录组分析研究不同水稻品种对细菌条斑病的侵染导读细菌性条斑病(BLS)是目前水稻的第四大疾病。
Dular和H359是两种对BLS有明显的水稻品种。
Dular品种抗性较高而H359品种易感。
本研究使用RNA-seq研究接种细菌性条斑菌不同时间后Dular 和H359的抗性反应的早期分子过程。
差异表达基因分析发现,在12和24小时后,Dular中有3031个DEGs和H359中有7161个DEGs。
H359中的差异表达基因明显多于Dular,下调基因明显多于上调基因。
GO和KEGG富集分析显示,Dular品种中的一些上调差异表达基因在苯基丙烷代谢通路中显著富集。
进一步比较和分析表明,两个品种中抗性相关的基因数量在感染BLS24小时后明显下降,抗性相关基因在早期阶段主要包括WRKY转录因子、受体激酶和MAPK信号通路相关基因。
本研究表明,抗性相关基因在感染早期发挥重要作用,本丙烷代谢相关基因可能响应Dular对BLS的抗性,从而为今后水稻BLS抗性的分子机制研究提供重要信息。
实验设计结果1 H359对BLS易感而Dular具有较高抗性B LS病变初期呈很小,深绿色的斑点,很快扩散到叶脉之间的深绿色到黄褐色的小斑点。
病变部位会有大量黄色液体小珠。
在感染严重下,条纹会呈现不规则的黄褐色斑点,类似于细菌性叶枯病。
Dular感染BLS后会表现出较强的抗性,会抑制病变的扩散。
BLS感染10天后,Dular病变长度一般小于0.5cm,然后H359的病变会快速扩散并达到5cm以上(图1)。
图1. Dular和H359表型。
a.两种水稻感染10天后表型。
b.病灶长度统计分析。
误差线表示重复。
2 Dular和H359接种BLS不同时间后DEGs的鉴定使用BGISEQ-500平台测序24个样本。
使用Trimmomatic对raw data进行过滤,得到clean reads。
每个样本平均数据量为6.27G,平均比对效率为90.58%(表1)。
颜静宛,陈子强,周淑芬,等.利用CRISPR/Cas9系统创制水稻品种GW2基因的突变体[J].江苏农业科学,2024,52(3):73-78.doi:10.15889/j.issn.1002-1302.2024.03.011利用CRISPR/Cas9系统创制水稻品种GW2基因的突变体颜静宛,陈子强,周淑芬,王 锋(福建省农业科学院生物技术研究所/福建省农业遗传工程重点实验室,福建福州350003) 摘要:培育具有育种价值的GW2基因编辑的水稻优异新品种在水稻育种中具有重要意义,利用CRISPR/Cas9基因编辑技术,以生产上广泛推广应用的13份水稻品种为材料,对粒质量基因(GW2)进行定向性状改良,通过农杆菌转化创制出一批无T-DNA元件的水稻非转基因GW2突变纯合株系。
结果表明:13份T0代水稻转基因中,有28.0%~59.1%植株的GW2基因发生了突变,纯合突变株数量占总突变株数量的35.0%,双等位突变株数量占总突变株数量的14.2%,杂合突变株数量占总突变株数量的50.8%。
此外,不同水稻品种发生的突变类型也略有不同。
对13份T2代非转基因水稻GW2突变纯合株进行千粒质量性状的考种分析。
与对应的野生型亲本品种相比,纯合突变水稻植株的千粒质量显著提高10.81%~58.22%。
本研究结果极大地丰富了GW2的突变类型,为不同水稻品种的高产稳产创造了重要的种质资源,同时也为利用基因编辑提高水稻产量提供了有价值的育种信息。
关键词:水稻;CRISPR/Cas9;基因编辑;粒质量;GW2基因;突变 中图分类号:Q344+.14;S511.01 文献标志码:A 文章编号:1002-1302(2024)03-0073-06收稿日期:2023-04-08基金项目:福建省科技计划———省属公益类科研院所基本科研专项(编号:2020R1027008);福建省农业高质量发展超越“5511”协同创新工程(编号:XTCXGC2021002)。
成都石室中学高2025届2024-2025学年度上期十月月考生物答案及解析1、【答案】B【详解】A、多糖的结构多样性与其单体的数量、排列顺序和多糖的空间结构有关,A错误;B、蛋白质、糖类和脂肪都属于能源物质,其中糖类是主要的能源物质,脂肪是重要的储能物质,B正确;C、真核细胞的RNA也有少量分布在细胞核内,DNA在细胞质内也分布,C错误;D、生物体内能发生水解反应的化合物不一定属于生物大分子,如二糖可以水解成单糖,但二糖不是大分子,D错误。
2、【答案】D【详解】A、多种核仁蛋白会参与rRNA的编辑,核糖体由rRNA和蛋白质组成,因此某些核仁蛋白参与核糖体的形成,A正确;B、NPM1是一种核仁蛋白,可能通过核孔进出细胞核发挥作用,B正确;C、NPM1与中心粒结合后可抑制中心粒的复制,细胞质中的NPM1增多可能会抑制动物细胞分裂,C正确;D、细胞癌变的本质是原癌基因和抑癌基因发生突变,NPM1与抑癌基因P53结合后会增强P53的转录,NPM1基因突变后不能增强P53的转录,可能会促进细胞发生癌变,D错误。
3.【答案】D【详解】A、细菌属于原核生物,其DNA是裸露存在的,无染色体存在,错误。
B、细菌含有细胞壁,细胞壁可以维持细菌形状,故细菌不会吸水张破,错误;C、牙菌斑是由细菌产生的,其成分主要是蛋白质,但细菌只有核糖体一种细胞器,无内质网、高尔基体等,错误;D、由题干可知:牙菌斑“帮助细菌附着在牙釉质”,故附着在牙釉质上的细菌难以清除,正确。
4、【答案】D【详解】A、运输至细胞质基质的ATP参与了细胞代谢中的吸能反应,A错误;B、米酵菌酸与ATP竞争AAC上的A TP结合位点,从而抑制ADP与ATP的交换,可能会造成ATP在线粒体基质积累,细胞质基质严重缺少能量而死亡,B错误;C、磷酸转运体运输速率降低可能会影响Pi进入线粒体基质,从而影响ATP的合成,可能会导致AAC转运速率下降,C错误。
D、线粒体内含有遗传物质DNA,只能编码部分自身所需蛋白质,其余蛋白质依然由核DNA 编码运输而来,故被称之为“半自主细胞器”,D正确。
收稿日期:2023-03-09基金项目:广东省重点领域研发计划项目(2022B020*******);广东省农业科学院农业优势产业学科团队建设项目(202101TD);广东省乡村振兴战略专项资金种业振兴项目(2022NPY00005,2022NPY00014);国家水稻产业技术体系专项(CARS-01)广东农业科学2023,50(4):13-21Guangdong Agricultural SciencesDOI:10.16768/j.issn.1004-874X.2023.04.002闫晓霞,朱满山,王丰,柳武革,李金华,霍兴,黄永相,刘迪林.利用高密度遗传图谱定位水稻耐低氧萌发QTL[J].广东农业科学,2023,50(4):13-21.利用高密度遗传图谱定位水稻耐低氧萌发QTL闫晓霞1,2,朱满山2,王 丰2,柳武革2,李金华2,霍 兴2,黄永相1,刘迪林2(1. 广东海洋大学滨海农业学院,广东 湛江 524088;2.广东省农业科学院水稻研究所/广东省育种新技术重点实验室/广东省水稻工程实验室/农业农村部华南优质稻遗传育种重点实验室,广东 广州 510640)摘 要:【目的】耐低氧萌发能力是水稻直播适应性的核心性状之一。
采用直播型温带粳稻品种Francis 和多穗型优质恢复系R998衍生的重组自交系群体开展水稻耐低氧萌发QTL 定位研究,旨在为直播稻品种培育提供新的有价值的基因资源,促进直播稻新品种培育和直播稻生产方式的推广。
【方法】以28 ℃ 淹水10 cm 暗培养 7 d 的水稻胚芽鞘长、芽长和最大根长作为耐低氧萌发能力指标,通过低倍基因组重测序构建含有3 106个bin 标记的高密度遗传图谱,采用WinQTL Cart 2.5进行QTL 扫描。
【结果】低氧萌发条件下,Francis 的胚芽鞘长度和根长显著高于R998,但是两者芽长差异不显著。
构建的遗传图谱总图距为3 646.2 cM,其中12号染色体标记数最少,1号染色体标记数最多,分别为174个和389个。
第46卷第4期2023年7月河北农业大学学报JOURNAL OF HEBEI AGRICULTURAL UNIVERSITYVol.46 No.4Jul.2023黄花菜维生素E含量遗传分析及QTL定位段春宇,熊 雄,景梦岳,高 阳,侯非凡,邢国明,李 森(山西农业大学 园艺学院/大同黄花产业发展研究院,山西 太谷,030801)摘要:维生素E是黄花菜中重要的营养成分。
本研究以黄花菜地方品种‘东庄黄花’和‘冲里花’杂交获得的F1群体为研究对象,对杂交后代连续2年的维生素E含量进行检测分析,结果显示黄花菜F1群体维生素E含量的变异系数为50.44%~54.23%,变异系数较大,整体呈现正态分布趋势,并出现了含量超过双亲的超亲后代个体;遗传分析显示黄花菜维生素E含量符合2对主基因-加性-显性模型(2MG-AD),第1对基因加性效应更为显著,主基因遗传效率高达95%以上;对黄花菜维生素E含量进行QTL定位,共检测到2个与黄花菜维生素E相关的QTL,分布于8号和10号连锁群上,LOD峰值的范围为2.96~3.60,单个QTL贡献率介于10.80%~13.00%。
本研究结果为黄花菜高维生素E含量的新品种选育和品种改良提供了数据基础。
关 键 词:黄花菜;维生素E;遗传分析;QTL定位中图分类号:S644.3 开放科学(资源服务)标识码(OSID):文献标志码:AGenetic analysis and QTL localization of vitamin E content inHemerocallis citrina BaroniDUAN Chunyu, XIONG Xiong, JING Mengyue, GAO Yang, HOU Feifan, XING Guoming, LI Sen(College of Horticulture, Shanxi Agricultural university/Datong Daylily Industrial Development Research Instiute,Datong 037004, China)Abstract: Vitamin E is an important nutrient in Hemerocallis citrina Baroni. In this study, the F1 population obtainedby crossing the local variety of Hemerocallis citrina Baroni ‘Dongzhuang Huanghua’ and ‘Chonglihua’ was usedas the research object, and the vitamin E content of the cross progeny was examined and analyzed for 2 consecutiveyears. The results showed that the vitamin E content in the F1 pulation of Hemerocallis citrina Baroni displayedan normal distribution with a large coefficient of variation that ranged from 50.44% to 54.23%. There were super-parental progeny whose content exceeded that of both parents. Genetic analysis showed that the vitamin E contentof Hemerocallis citrina conformed to the additive-dominance model controlled by two major genes(2MG-AD). Thegenetic efficiency of the main genes are over 95%. QTL analysis has identified two locus related to vitamin E inHemerocallis citrina Baroni. The two locus distributed on the linkage group 8 and 10, and the range of LOD peak was收稿日期:2023-01-01基金项目:2021年山西省研究生创新项目(2021Y323);国家重点研发计划项目子课题(2021YFD1600301-2);山西农业大学生物育种工程项目(YZGC122);2021年度大同黄花产业发展研究院科研合作项目(2022QT003-1).第一作者:段春宇(1996-),男,山西朔州人,硕士研究生,主要从事园艺植物种质资源创新与利用.E-mail:****************通信作者:李 森(1982—),男,山西高平人,博士,教授,主要从事园艺植物种质资源创新与生物技术应用研究.E-mail:****************本刊网址:文章编号:1000-1573(2023)04-0038-08DOI:10.13320/ki.jauh.2023.005739第4期2.96-3.60. The contribution rate of individual QTL ranged from 10.80% to 13.00%. The results of this study provide a data base for the selection of new varieties and variety improvement of Hemerocallis citrina Baroni with high vitamin E content.Keywords: Hemerocallis citrina Baroni; vitamin E; genetic analysis; QTL localization位于大豆1、4、9、13、14、15、17以及20号连锁群上[16]。
水稻GUN4基因克隆与功能概述第一章导论1.1黄玉B及其在杂交稻生产中的应用高纯度的杂交稻种子为维持其在生产中的杂交优势起着极其重要的作用,而杂交种制种过程中的环境和气候条件的波动经常会造成雄性不育系malesterility line, MSL)的育性回复,导致商业杂交种批量生产中受MSL自交种子不同程度的污染舒庆亮等,1996)。
两系杂交稻系统对该类波动特别敏感,因为杂交种制种过程中异常的低温能够恢复光温敏雄性核不育系P/TGMS)的育性,所以对于保持种子纯度是个巨大的威胁斯华敏等,2011)。
为了增加、保证和快速检测种子纯度,在杂交稻生产中己将两类标记性状导入MS系。
第一类包括各类隐性的非绿叶性状,如失绿(董凤高等,1995)、黄叶(Zhou etal., 2006a)、白化转绿Wuetal.,2003和2011)和紫叶牟同敏等,1995);第二类为条件性隐性致死,如苯达松敏感突变Zhang etal.,2002; Wang etal., 2012)。
携带有这些标记性状的MS系配制的杂交稻品种已被广泛应用于商业生产中曹立勇等,1999;余新桥等,2000;鲍正发等,2006;沈圣泉等,2004和2007; HYB的黄叶表型(xantha)由60Co y福照诱变细胞质雄性不育系cytoplasmicmale sterility, CMS)龙特甫A的保持系——龙特甫B (L TB)获得Zhou etal.,2006a)。
与L TB相比,HYB中叶绿素a、b和类胡萝卜素的含量显著降低,但Chi a/b和Car/Chi的比率则更高Zhou et al., 2006b)。
//TB还可保持高光合速率Zhou et al., 2006b)和充足的光能利用率武立权等,2007)。
该黄叶表型己相继被引入黄玉A(Zhou etal.,2006a;沈圣泉等,2007)和嘉浙91A (富昊伟等,私人通讯)等CMS系中。