基质金属蛋白酶—7的基因克隆和原核表达
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基质金属蛋白酶识别位点全文共四篇示例,供读者参考第一篇示例:基质金属蛋白酶是一类重要的蛋白水解酶,具有广泛的生物学功能,参与细胞信号传导、细胞凋亡、生长因子的处理等多个生物过程。
基质金属蛋白酶通过特定的识别位点来识别和切割底物蛋白,其活性和底物的结合受到这些识别位点的影响。
本文将探讨基质金属蛋白酶的识别位点的特点及其在蛋白水解中的作用。
基质金属蛋白酶主要分为三个家族,包括MMP家族(基质金属蛋白酶)、ADAM家族(金属蛋白酶,TACE)以及ADAMTS家族(胶原蛋白酶)。
这些家族在底物识别和水解的方式上略有不同,但都需要通过识别位点来与底物蛋白结合并进行水解。
识别位点是一段特定的氨基酸序列,在底物蛋白中具有较强的保守性,基质金属蛋白酶通过与识别位点的结合来确定底物的切割位置。
基质金属蛋白酶的识别位点通常包括一个受氨基酸序列和一个特定的酶切位点。
受氨基酸序列是指位于识别位点周围的氨基酸序列,这些氨基酸在与基质金属蛋白酶结合时起到辅助作用。
酶切位点是指在受氨基酸序列和底物蛋白之间的具有特殊功能的氨基酸,基质金属蛋白酶在识别位点与酶切位点结合后进行切割。
不同的基质金属蛋白酶具有不同的受氨基酸序列和酶切位点,这也决定了它们的底物特异性。
基质金属蛋白酶在识别位点与底物蛋白结合后,通过底物蛋白的构象变化来促进水解反应的进行。
一般来说,底物蛋白在与基质金属蛋白酶结合时会发生构象变化,使得酶切位点更容易被基质金属蛋白酶识别和切割。
这种构象变化是基质金属蛋白酶与底物蛋白结合的关键步骤,也是水解反应进行的前提。
第二篇示例:基质金属蛋白酶(Matrix Metalloproteinase,MMPs)是一类在许多生物学和病理学过程中起关键作用的蛋白酶。
它们参与细胞外基质的降解和重塑,促进组织的发育和修复,同时也在许多疾病的发生和发展中扮演重要角色。
识别基质金属蛋白酶的底物位点对于研究其功能和生物学效应至关重要。
本文将就基质金属蛋白酶的识别位点展开讨论,以帮助读者更好地理解这些重要的酶类的作用机制。
重组表达质粒的构建——原核表达载体选择质粒载体是重组蛋白表达的关键工具,其结构如下图。
重组蛋白表达,我们首先要将基因插入到表达载体上,插入的位置为多克隆位点。
质粒载体上有很多的功能元件,这些元件对于蛋白的表达都是至关重要的。
尽管我们经过系统的分析和预测,但是仍有很多蛋白不能顺利表达、表达量很低或者表达状态不好。
这个时候我们需要尝试构建不同的表达载体以期得到最好的效果,这些载体的主要区别是启动子和融合标签的差异。
蛋白表达优化主要工作也就是尝试构建不同融合表达标签,使用不同的宿主表达菌,测试不同的表达条件,筛选出最优表达体系。
常用的融合标签有GST、MBP、Trx、6His、SUMO等,这些标签主要功能是促表达、促可溶、信号标记或助纯化。
福因德生物可以提供以下系列载体以供科研表达研究。
1)促表达/促溶标签2)信标标签3)纯化标签我们选择表达载体的时候不但要考虑蛋白怎么表达成功,更要考虑蛋白怎么纯化出来,纯化的问题主要是考虑纯化标签和酶切位点的选择,下表我们列举了常见的纯化标签和酶切位点。
4)酶切位点以上为原核表达常用的标签和酶切位点,其性质也都作了简要的介绍,各专业网站或专业书籍已对此做详尽解释,科研工作者可根据具体实验设计方案,组合设计以上标签和酶切位点的使用。
特别值得注意的是,选用和设计蛋白酶切位点的时候首要考虑的是序列内部有没有蛋白酶位点,同时要考虑酶切的效率和蛋白酶试剂成本。
一般商业化载体,在标签蛋白与载体多克隆位点之间都设计有酶切位点。
标签可设计在N-端也可在C-端,设计在N-端的优势是,可通过标签高效翻译起始位点带动插入蛋白的表达,可溶性标签的高效表达更可促进蛋白的可溶性表达;同时,大部分的蛋白内切酶的切割位点在C-端,所以标签设计在N-端可将标签切割完全。
在设计标签序列与酶切位点的时候还要考虑N-端稳定性原则,也就是所谓宿主细胞的N-端规则(N-end rule),这个要避免;同时,还应该检查是否引入了可与别的蛋白相互作用的序列或者蛋白酶切位点。
基质金属蛋白酶在骨关节炎症性疾病中的研究进展发布时间:2022-04-28T04:50:17.945Z 来源:《世界复合医学》2022年2期作者:戴炯华,刘芳通信作者[导读] 基质金属蛋白酶(Matrix metalloproteinases,MMPs)是一类锌依赖性蛋白酶家族,其可通过降解细胞外基质、调控相应信号通路来参与细胞增殖、迁移、和分化等多种生物学过程[1]。
戴炯华,刘芳通信作者南华大学衡阳医学院岳阳市人民医院研究生协作培养基地,湖南衡阳421001【摘要】基质金属蛋白酶(Matrix metalloproteinases,MMPs)是一类锌依赖性蛋白酶家族,其可通过降解细胞外基质、调控相应信号通路来参与细胞增殖、迁移、和分化等多种生物学过程[1]。
MMPs在正常关节组织中低水平表达,而在关节炎症病理状态下表达明显增高,其参与调节炎症反应的各个方面,在骨关节炎、痛风性关节炎、类风湿性关节炎等发挥重要作用,本文对基质金属蛋白酶与骨关节常见炎症性疾病相关性研究进展做一综述,为科研提供便利。
【关键词】基质金属蛋白酶;骨关节炎;痛风性关节炎;类风湿性关节炎Research progress of matrix metalloproteinases in inflammatory diseases of bone and joint[Abstract]Matrix metalloproteinases(MMPs)are a family of zinc-dependent proteases,which can participate in various biological processes such as cell proliferation,migration and differentiation by degrading extracellular Matrix and regulating corresponding signal pathways[1].MMPs low level expression in normal joint tissues,and expressed in joint inflammation pathological condition significantly increased,to participate in the aspects of regulating the inflammatory response,in osteoarthritis,rheumatoid arthritis,gouty arthritis,etc play an important role,in this paper,matrix metalloproteinases and common inflammatory joint disease correlation research progress.[Key words]matrix metalloproteinase;osteoarthritis;gout arthritis;rheumatoid arthritis1.基质金属蛋白酶的概述人体正常的生长发育过程离不开细胞外基质(Extracellular matrix,ECM)适时的降解,ECM是一种大分子网络,其中胶原是ECM中最丰富的蛋白质,MMPs是唯一能够降解胶原的酶。
酶的克隆与表达 原核表达系统Company Logo优点: 易于生长和控制 用于细菌培养的材料不及哺乳动物细胞系统的材料昂贵 有各种各样的大肠杆菌菌株及与之匹配的具各种特性的 质粒可供选择 缺点: 在大肠杆菌中表达的蛋白由于缺少糖基化修饰等 常形成包涵体Company Logo微生物表达系统3Company LogoCompany Logo选择标 志的编 码序列可控转 录的启 动子转录调控序 列(转录终止 子,核糖体 结合位点)多限制酶切 位点接头宿主体内 自主复制 的序列表达载体表达载体在基因工程中具有十分重要的作 用,原核表达载体通常为质粒,典型的表达 载体应具有以上几种元件Company Logo核糖体结合位点 启动子 转录终止子复制 起点Company LogoCompany Logo外源蛋白高效表达的三要素 基因载体宿主基因是根本,载体是关键,宿主是外因8Company Logo一个合适表达载体(质粒)的构件1. 筛选标记 Amp,Kan,Tet 2. 可控的启动子lac,lacUV5, trp,trc, tac,λPL,T73.翻译起始区 RBS,Met 4.多克隆位点(MCS) NdeI,EcoRI,SalI, SmaI起始子*活性同尾酶t同裂酶Company Logo95.终止子 6.融合标签(分离、分析、质量) AP: 亲和层析 IP: 免疫沉淀 QA: 定量分析 DB: 二硫键形成 PE: 蛋白质输出 SP: 可溶性蛋白 DI: 二硫键异构 PP: 小蛋白/多肽生产 PS: 体外磷酸化 WB: 免疫印迹 IF: 免疫荧光10Company Logo筛选标记Amp(氨苄青霉素抗性基因,bla)启动子结构示意图Promoters recognized by E. coli RNA polymerase containing σ70启动子lac启动子负调控模型示意图双信号调控模型启动子trp色氨酸操纵子结构tac启动子tac由trp和lacUV5杂合而成。
短篇论著MMP ̄7㊁SDC ̄1在炎症性肠病中的表达及其意义∗耿㊀丽#㊀王许平㊀杨贝贝㊀王丹丹㊀高㊀闯㊀杜晓博㊀冯百岁&郑州大学第二附属医院消化内科㊀吴阶平医学基金会中国炎症性肠病联盟㊀河南省炎症性肠病中心(450014)DOI:10.3969/j.issn.1008 ̄7125.2019.03.008∗基金项目:国家自然科学基金(81070288ꎬ81270452)ꎻ河南省卫生计生科技创新型人才特聘学科带头人ꎻ河南省自然科学基金(162300410268)ꎻ河南省医学科技攻关计划项目(201502015)#Email:gengli0421@163.com&本文通信作者ꎬEmail:fbs163@163.com㊀㊀背景:基质金属蛋白酶 ̄7(MMP ̄7)是MMPs家族中的一员ꎬ可表达于多种器官受损的黏膜上皮细胞中ꎮ多配体蛋白聚糖 ̄1(SDC ̄1)是MMP ̄7的作用底物之一ꎬ在促进组织修复㊁维持肠屏障功能等方面发挥重要作用ꎮ目的:探讨MMP ̄7和SDC ̄1在炎症性肠病(IBD)中的表达及其意义ꎮ方法:收集郑州大学第二附属医院2017年1月 2018年1月住院活动期IBD患者的肠组织标本45例和外周血标本50例ꎬ同期非IBD肠组织标本30例和外周血标本35例作为对照组ꎮ采用免疫组化法检测肠组织MMP ̄7㊁SDC ̄1表达ꎬELISA法检测血清SDC ̄1含量ꎮ结果:MMP ̄7在IBD患者的肠组织中呈高表达ꎬ特别是溃疡边缘的肠上皮细胞ꎮ与对照组相比ꎬIBD患者肠组织MMP ̄7表达增高㊁SDC ̄1表达降低ꎬ血清SDC ̄1含量增高ꎬ差异均有统计学意义(P<0.05)ꎮSpearman相关系数分析显示ꎬ肠组织MMP ̄7表达与IBD疾病活动度呈显著正相关(溃疡性结肠炎:rs=0.519ꎬP<0.05ꎻ克罗恩病:rs=0.583ꎬP<0.05)ꎬ与肠组织SDC ̄1表达呈显著负相关(rs=-0.646ꎬP<0.05)ꎮ结论:MMP ̄7在IBD患者肠组织中表达增高ꎬ通过剪切SDC ̄1影响受损肠组织修复ꎬ参与IBD的发生㊁发展ꎮ关键词㊀炎症性肠病ꎻ㊀结肠炎ꎬ溃疡性ꎻ㊀Crohn病ꎻ㊀基质金属蛋白酶7ꎻ㊀多配体蛋白聚糖1ExpressionsandSignificanceofMMP ̄7andSDC ̄1inInflammatoryBowelDisease㊀GENGLiꎬWANGXupingꎬYANGBeibeiꎬWANGDandanꎬGAOChuangꎬDUXiaoboꎬFENGBaisui.DepartmentofGastroenterologyꎬtheSecondAffiliatedHospitalofZhengzhouUniversityꎻWuJiepingMedicalFoundationꎬChinaAllianceofInflammatoryBowelDiseaseꎻHenanInflammatoryBowelDiseaseCenterꎬZhengzhou(450014)Correspondenceto:FENGBaisuiꎬEmail:fbs163@163.com㊀㊀Background:Matrixmetalloproteinase ̄7(MMP ̄7)ꎬamemberoftheMMPsfamilyꎬisexpressedininjuredmucosalepithelialcellsofmanyorgans.Syndecan ̄1(SDC ̄1)ꎬasubstrateofMMP ̄7ꎬplaysanimportantroleintissuerepairandmaintainingintestinalbarrierfunction.Aims:ToinvestigatetheexpressionsandsignificanceofMMP ̄7andSDC ̄1ininflammatoryboweldisease(IBD).Methods:Forty ̄fiveintestinalmucosasamplesandfiftyperipheralbloodsamplesfrominpatientswithactiveIBDwerecollectedduringJan.2017toJan.2018attheSecondAffiliatedHospitalofZhengzhouUniversity.Thirtyintestinalmucosasamplesandthirty ̄fiveperipheralbloodsamplesfromnon ̄IBDsubjectswereservedascontrols.ExpressionsofMMP ̄7andSDC ̄1inintestinalmucosaltissueweredetectedbyimmunohistochemistryꎬandserumSDC ̄1levelwasdeterminedbyELISA.Results:MMP ̄7washighlyexpressedinintestinalmucosaltissueofIBDpatientsꎬespeciallyinmucosalepitheliumborderingtheulcerarea.ComparedwithcontrolgroupꎬtheexpressionofMMP ̄7wassignificantlyincreasedandthatofSDC ̄1wassignificantlyreducedinintestinalmucosaltissueofIBDpatients(P<0.05).IncontrastꎬtheserumlevelofSDC ̄1wassignificantlyincreasedinIBDpatients(P<0.05).SpearmancorrelationcoefficientanalysisrevealedapositivecorrelationbetweenMMP ̄7expressionandthediseaseactivityofIBD(rs=0.519ꎬP<0.05forulcerativecolitisꎻrs=0.583ꎬP<0.05forCrohn sdisease)ꎬandanegativecorrelationbetweenMMP ̄7andSDC ̄1ininflamedmucosa(rs=-0.646ꎬP<0.05).Conclusions:IncreasedMMP ̄7expressioninintestinalmucosaltissuemaycontributetotheinitiationanddevelopmentofIBDviacleavingSDC ̄1andimpairingmucosalhealing.Keywords㊀InflammatoryBowelDiseaseꎻ㊀ColitisꎬUlcerativeꎻ㊀CrohnDiseaseꎻ㊀MatrixMetalloproteinase7ꎻ㊀Syndecan ̄1㊀㊀炎症性肠病(inflammatoryboweldiseaseꎬIBD)是一组病因不明㊁反复发作的慢性肠道炎症性疾病ꎬ主要包括溃疡性结肠炎(ulcerativecolitisꎬUC)和克罗恩病(Crohn sdiseaseꎬCD)ꎬ目前认为其发生主要与遗传易感性㊁肠道内环境以及宿主不恰当的免疫应答有关ꎮ基质金属蛋白酶 ̄7(matrixmetalloproteinase ̄7ꎬMMP ̄7)又称基质溶解素(matrilysin)ꎬ是MMPs家族中相对分子质量最小的一员ꎮMMPs是一类普遍表达的锌依赖性内肽酶ꎬ底物特异性广泛ꎬ除剪切细胞外基质(extracellularmatrixꎬECM)的蛋白质和蛋白多糖组分外ꎬMMPs还可剪切多种非基质底物ꎬ包括细胞因子㊁趋化因子㊁生长因子㊁生长因子受体和细胞表面黏附受体[1]ꎮ生理情况下ꎬECM组分的合成和降解处于平衡状态ꎬ病理状态下ꎬ这一平衡被打破ꎬ可能导致溃疡和纤维化发生[2]ꎮ多配体蛋白聚糖 ̄1(syndecan ̄1ꎬSDC ̄1)属于Ⅰ型跨膜蛋白ꎬ是MMP ̄7的作用底物之一ꎬ在促进组织修复㊁维持肠屏障功能等方面发挥重要作用[3 ̄4]ꎮ本研究通过检测MMP ̄7㊁SDC ̄1在活动期IBD患者肠道和外周血中的表达ꎬ旨在探索两者在IBD发生㊁发展中的作用及其临床意义ꎮ材料与方法一㊁标本来源收集郑州大学第二附属医院2017年1月 2018年1月住院IBD患者的肠组织标本45例(取自病变最明显处)和外周血标本50例ꎮ入组病例诊断符合2018年«炎症性肠病诊断与治疗的共识意见»[5]ꎬUC和CD疾病活动性的评估分别采用改良Mayo评分和简化CD活动指数(CDAI)ꎬ所有病例病情均处于活动期ꎮ收集同期结肠癌术后肠组织标本30例(切缘大体和光学显微镜下均未见癌组织的正常结肠㊁回肠组织)ꎬ以及健康体检者和健康志愿者外周血标本35例作为对照组ꎮ研究方案经医院伦理委员会审核批准ꎬ研究对象对标本采集均知情同意ꎮ二㊁主要试剂兔抗人MMP ̄7多克隆抗体㊁兔抗人SDC ̄1多克隆抗体(北京博奥森生物技术有限公司)ꎻ山羊抗兔二抗㊁DAB显色试剂盒(北京中杉金桥生物技术有限公司)ꎻ人SDC ̄1ELISA试剂盒(武汉优尔生商贸有限公司)ꎮ三㊁方法1.免疫组化法检测肠组织MMP ̄7㊁SDC ̄1表达:肠组织标本4%甲醛固定ꎬ常规石蜡包埋ꎬ2μm厚连续切片ꎮ切片常规脱蜡㊁水化ꎬ枸橼酸盐缓冲液抗原修复ꎬ3%H2O2阻断内源性过氧化物酶ꎬ山羊血清室温封闭30minꎬ加入MMP ̄7抗体(工作浓度1ʒ600)或SDC ̄1抗体(工作浓度1ʒ800)ꎬ4ħ孵育过夜ꎬ反应增强液室温孵育20minꎬ加入HRP标记的二抗室温孵育20minꎬDAB显色ꎬ1%盐酸乙醇分化ꎬ苏木精复染ꎬ梯度乙醇脱水ꎬ二甲苯透明ꎬ封片ꎮ结果判定:光学显微镜下见胞质/胞膜染色为阳性细胞ꎮ在双盲条件下ꎬ由2名医师在200倍视野下随机选取5个清晰无折叠的视野ꎬ计数阳性细胞数ꎬ取均值ꎬ并观察染色强度ꎮ阳性细胞率:ɤ5%ꎬ0分ꎻ6%~25%ꎬ1分ꎻ26%~50%ꎬ2分ꎻ51%~75%ꎬ3分ꎻ>75%ꎬ4分ꎮ染色强度:无染色ꎬ0分ꎻ浅黄色ꎬ1分ꎻ黄色ꎬ2分ꎻ棕黄色ꎬ3分ꎮ免疫组化评分为两项评分的乘积:0分ꎬ阴性(-)ꎻ1~4分ꎬ弱阳性(+)ꎻ5~8分ꎬ阳性(++)ꎻ9~12分ꎬ强阳性(+++)ꎮ2.ELISA法检测血清SDC ̄1含量:外周血标本离心分离血清ꎬ-80ħ保存ꎮ设置标准孔㊁空白孔和待测样品孔ꎬ分别加样ꎬ37ħ温育1hꎬ加入生物素化SDC ̄1抗体ꎬ37ħ温育1hꎬ洗涤ꎬ加入HRP标记的链霉亲和素ꎬ37ħ温育30minꎬ洗涤ꎬ显色后终止反应ꎮ于酶标仪450nm波长处读取各孔吸光度值(A值)ꎬ根据标准曲线得出样品浓度ꎮ四㊁统计学分析应用SPSS17.0统计学软件ꎬ计量资料以 xʃs进行描述ꎬ数据呈正态分布㊁方差齐ꎬ多组间比较采用单因素方差分析ꎬ进一步的两两比较采用LSD ̄t检验ꎻ计量资料以率或构成比进行描述ꎬ组间比较采用χ2检验ꎻ相关性的分析采用Spearman相关系数ꎮP<0.05为差异有统计学意义ꎮ结㊀㊀果一㊁一般情况45例IBD肠组织标本中ꎬUC27例ꎬCD18例ꎻ50例IBD外周血标本中ꎬUC28例ꎬCD22例ꎮ病例组性别构成和年龄与相应对照组间差异无统计学意义(P>0.05)(表1)ꎮ表1㊀采集肠组织和外周血标本IBD患者的一般情况组别肠组织标本例数男/女(n/N)年龄( xʃsꎬ岁)外周血标本例数男/女(n/N)年龄( xʃsꎬ岁)UC组2715/1237.4ʃ13.82816/1237.0ʃ14.5㊀轻度64/273/4㊀中度127/5127/5㊀重度94/596/3CD组1810/833.9ʃ16.222㊀12/10㊀34.2ʃ16.3㊀轻度42/263/3㊀中度95/4127/5㊀重度53/242/2对照组3016/1436.0ʃ14.73519/1635.7ʃ12.6㊀㊀二㊁肠组织MMP ̄7表达免疫组化染色显示ꎬ对照组肠组织中可见极少量MMP ̄7阳性细胞ꎬ染色强度较弱ꎻUC组和CD组肠组织中可见大量胞质黄色或棕黄色染色的MMP ̄7阳性细胞ꎬ主要为肠上皮细胞ꎬ特别是溃疡边缘的肠上皮细胞ꎬ同时黏膜下层浸润的炎性细胞中亦有MMP ̄7表达(图1)ꎮUC组和CD组MMP ̄7免疫组化评分均明显高于对照组ꎬ差异有统计学意义(8.17ʃ1.17㊁8.67ʃ1.97对0.33ʃ0.52ꎬP<0.05)ꎬUC组与CD组间差异则无统计学意义(P>0.05)ꎮSpearman相关系数分析显示ꎬ在IBD患者中ꎬ肠组织MMP ̄7表达与UC和CD疾病活动度均呈显著正相关(UC:rs=0.519ꎬP<0.05ꎻCD:rs=0.583ꎬP<0.05)ꎮ三㊁肠组织SDC ̄1表达免疫组化染色显示ꎬ对照组肠组织中可见较多黄色或棕黄色染色的SDC ̄1阳性细胞ꎬ染色强度较强ꎬ多分布于肠上皮细胞的基底外侧膜ꎻUC组和CD组肠组织中SDC ̄1阳性细胞较少ꎬ染色强度较弱ꎬ呈浅黄色(图1)ꎮUC组和CD组SDC ̄1免疫组化评分均明显低于对照组ꎬ差异有统计学意义(2.17ʃ0.98㊁1.83ʃ0.41对6.50ʃ1.76ꎬP<0.05)ꎬUC组与CD组间差异则无统计学意义(P>0.05)ꎮSpearman相关系数分析显示ꎬIBD患者肠组织中的MMP ̄7表达与SDC ̄1表达呈显著负相关(rs=-0.646ꎬP<0.05)ꎮ四㊁血清SDC ̄1含量IBD肠组织中MMP ̄7的剪切作用使SDC ̄1胞外域脱落增加ꎬ可致外周血游离SDC ̄1含量增高ꎮ本研究进一步以ELISA法检测各组血清SDC ̄1含量ꎬ结果显示UC组和CD组血清SDC ̄1含量均明显高于对照组ꎬ差异有统计学意义[(34.24ʃ10.24)ng/mL㊁(35.78ʃ19.51)ng/mL对(19.44ʃ3.69)ng/mLꎬP<0.05]ꎬCD组略高于UC组ꎬ但组间差异无统计学意义(P>0.05)ꎮSpearman相关系数分析显示ꎬIBD患者肠组织中的SDC ̄1表达与血清SDC ̄1含量呈显著负相关(rs=-0.667ꎬP<0.05)ꎮ讨㊀㊀论IBD是一组以腹痛㊁腹泻㊁黏液脓血便为临床特征的慢性肠道炎症性疾病ꎬ病因和发病机制不明ꎬ病情反复发作ꎬ近年来其发病率在我国乃至全球均呈上升趋势[6]ꎮMMP ̄7为MMPs家族中的一员ꎬ可表达于多种器官受损的黏膜上皮细胞中ꎬ如胃肠道㊁肺㊁肾脏㊁角膜等[7 ̄10]ꎬ参与损伤组织的上皮修复和再生以及肿瘤的发生㊁发展ꎬ但其在IBD中的作用尚未完全明确ꎮ有研究[11]发现ꎬ在UC肠组织中ꎬMMP ̄7主要表达于溃疡边缘上皮细胞ꎬ且其表达与炎症程度相关ꎮ另一项研究[12]显示ꎬMMP ̄7在UC腺上皮中的表达与糜烂发生呈正相关ꎻ在CD肠组织中ꎬMMP ̄7在炎性浸润部位呈强阳性表达ꎮPuthenedam等[13]的研究发现ꎬMMP ̄7可剪切半乳糖凝集素 ̄3ꎬ使其活性降低ꎬ进而影响IBD肠道损伤的修复ꎮ另有研究[14]表明ꎬ野生型急性结肠损伤小鼠的死亡率显著高于MMP ̄7-/-结肠损伤小鼠ꎬ前者肠道损伤的修复(包括上皮细胞增殖㊁隐窝结构重建)虽快于后者ꎬ但中性粒细胞浸润深度和范围亦更大ꎬ导致损伤加重ꎮ上述结果提示了MMP ̄7在肠道损伤修复过程中的双重作用ꎬ组织受损时其表达增加ꎬ一定量的MMP ̄7为损伤修复所必需ꎬ表达过量则不利于损伤修复ꎬ甚至会加重肠道损伤ꎮ本实验发现IBD患者肠组织中的MMP ̄7表达较正常肠组织显著增强ꎬ并与疾病活动度呈显著正相关ꎬ与既往研究结果一致ꎬ提示在IBD中ꎬMMP ̄7过表达不利于肠黏膜上皮修复ꎬ甚至可能诱发溃疡ꎮMMP ̄7是IBD潜在的治疗靶点ꎬ应用其抑制剂或可减缓IBD疾病进程ꎮSDC ̄1又称CD138ꎬ是硫酸乙酰肝素蛋白聚糖家族成员之一ꎬ生理情况下表达于多种细胞的细胞膜ꎬ主要由保守的胞质结构域㊁跨膜结构域和含硫酸乙酰肝素糖胺聚糖链的胞图1㊀MMP ̄7㊁SDC ̄1在IBD患者肠组织中的表达(免疫组化染色ꎬˑ200)外结构域组成ꎮSDC ̄1在促进组织修复㊁调节免疫功能等方面发挥重要作用ꎬ同时还可调节紧密连接的组成并维持黏膜屏障功能[3 ̄4]ꎮFloer等[15]的研究发现ꎬSDC ̄1对小鼠实验性结肠炎具有保护作用ꎮIBD时大量分泌的促炎细胞因子如肿瘤坏死因子 ̄α(TNF ̄α)㊁白细胞介素 ̄1β(IL ̄1β)可下调肠上皮细胞表面的SDC ̄1表达ꎬ其表达下调归因于蛋白胞外域的脱落ꎬ因此IBD患者外周血可溶性SDC ̄1含量显著增加[16 ̄17]ꎮSDC ̄1是MMP ̄7的作用底物之一[18]ꎬIBD患者肠组织中过表达的MMP ̄7剪切SDC ̄1ꎬ使其胞外域脱落并失去活性ꎬ进而使SDC ̄1促进受损肠组织修复的功能降低ꎮ本研究发现IBD患者肠组织中SDC ̄1表达减弱ꎬ并与MMP ̄7表达呈显著负相关ꎬ为理解IBD患者肠组织损伤修复延缓㊁MMP ̄7表达增强㊁SDC ̄1功能下降的现象提供了依据ꎮ本研究同时发现IBD患者血清SDC ̄1含量明显增高ꎬ与肠组织中MMP ̄7剪切SDC ̄1增加相一致ꎬ提示IBD患者的血清游离SDC ̄1可在一定程度上反映其在肠组织中的丢失情况ꎮ综上所述ꎬ本研究主要发现活动期IBD患者肠组织中MMP ̄7表达增高ꎬ并与疾病活动度呈正相关ꎬ提示其可能参与了IBD的发生㊁发展ꎬ在疾病活动度评估以及作为IBD的治疗靶点方面具有潜在应用价值ꎮ肠组织中的MMP ̄7通过剪切SDC ̄1影响受损肠组织修复ꎬ进而引起血清游离SDC ̄1含量增加ꎬ后者可能作为区分IBD与非IBD以及评价IBD药物疗效的生物学标记物ꎮ本实验为单中心观察性研究ꎬ研究样本量较小ꎬ未来拟开展多中心研究以及更深入的基础研究ꎬ进一步阐明MMP ̄7在IBD中的作用机制ꎮ参考文献1㊀NissinenLꎬKähäriVM.Matrixmetalloproteinasesininflammation[J].BiochimBiophysActaꎬ2014ꎬ1840(8):2571 ̄2580.2㊀KovacsEJꎬDiPietroLA.Fibrogeniccytokinesandconnec ̄tivetissueproduction[J].FASEBJꎬ1994ꎬ8(11):854 ̄861.3㊀GötteM.Syndecansininflammation[J].FASEBJꎬ2003ꎬ17(6):575 ̄591.4㊀AlexopoulouANꎬMulthauptHAꎬCouchmanJR.Syndecansinwoundhealingꎬinflammationandvascularbiology[J].IntJBiochemCellBiolꎬ2007ꎬ39(3):505 ̄528.5㊀中华医学会消化病学分会炎症性肠病学组.炎症性肠病诊断与治疗的共识意见(2018年ꎬ北京)[J].中华消化杂志ꎬ2018ꎬ38(5):292 ̄311.6㊀KaplanGG.TheglobalburdenofIBD:from2015to2025[J].NatRevGastroenterolHepatolꎬ2015ꎬ12(12):720 ̄727.7㊀Saarialho ̄KereUKꎬVaalamoMꎬPuolakkainenPꎬetal.Enhancedexpressionofmatrilysinꎬcollagenaseꎬandstromelysin ̄1ingastrointestinalulcers[J].AmJPatholꎬ1996ꎬ148(2):519 ̄526.8㊀McGuireJKꎬLiQꎬParksWC.Matrilysin(matrixmetalloproteinase ̄7)mediatesE ̄cadherinectodomainsheddingininjuredlungepithelium[J].AmJPatholꎬ2003ꎬ162(6):1831 ̄1843.9㊀SurendranKꎬSimonTCꎬLiapisHꎬetal.Matrilysin(MMP ̄7)expressioninrenaltubulardamage:associationwithWnt4[J].KidneyIntꎬ2004ꎬ65(6):2212 ̄2222.10㊀LuPCꎬYeHꎬMaedaMꎬetal.Immunolocalizationandgeneexpressionofmatrilysinduringcornealwoundhealing[J].InvestOphthalmolVisSciꎬ1999ꎬ40(1):20 ̄27.11㊀MatsunoKꎬAdachiYꎬYamamotoHꎬetal.Theexpressionofmatrixmetalloproteinasematrilysinindicatesthedegreeofinflammationinulcerativecolitis[J].JGastroenterolꎬ2003ꎬ38(4):348 ̄354.12㊀JakubowskaKꎬPryczyniczAꎬIwanowiczPꎬetal.ExpressionsofMatrixMetalloproteinases(MMP ̄2ꎬMMP ̄7ꎬandMMP ̄9)andTheirInhibitors(TIMP ̄1ꎬTIMP ̄2)inInflammatoryBowelDiseases[J].GastroenterolResPractꎬ2016ꎬ2016:2456179.13㊀PuthenedamMꎬWuFꎬShetyeAꎬetal.Matrilysin ̄1(MMP ̄7)cleavesgalectin ̄3andinhibitswoundhealinginintestinalepithelialcells[J].InflammBowelDisꎬ2011ꎬ17(1):260 ̄267.14㊀SweeMꎬWilsonCLꎬWangYꎬetal.Matrixmetallo ̄proteinase ̄7(matrilysin)controlsneutrophilegressbygeneratingchemokinegradients[J].JLeukocBiolꎬ2008ꎬ83(6):1404 ̄1412.15㊀FloerMꎬGötteMꎬWildMKꎬetal.Enoxaparinimprovesthecourseofdextransodiumsulfate ̄inducedcolitisinsyndecan ̄1 ̄deficientmice[J].AmJPatholꎬ2010ꎬ176(1):146 ̄157.16㊀DayRMꎬMitchellTJꎬKnightSCꎬetal.Regulationofepithelialsyndecan ̄1expressionbyinflammatorycytokines[J].Cytokineꎬ2003ꎬ21(5):224 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一、DNA提取1、实验原理通常采用机械研磨的方法破碎植物的组织和细胞,由于植物细胞匀浆含有多种酶类(尤其是氧化酶类)对DNA的抽提产生不利的影响,在抽提缓冲液中需加入抗氧化剂或强还原剂(如巯基乙醇)以降低这些酶类的活性。
在液氮中研磨,材料易于破碎,并减少研磨过程中各种酶类的作用。
十二烷基肌酸钠、十六烷基三甲基溴化铵(简称为CTAB)、十二烷基硫酸钠(简称SDS)等离子型表面活性剂,能溶解细胞膜和核膜蛋白,使核蛋白解聚,从而使DNA得以游离出来。
再加入苯酚和氯仿等有机溶剂,能使蛋白质变性,并使抽提液分相,因核酸(DNA、RNA)水溶性很强,经离心后即可从抽提液中除去细胞碎片和大部分蛋白质。
上清液中加入无水乙醇使DNA沉淀,沉淀DNA溶于TE溶液中,即得植物总DNA溶液。
二、RNA提取1、实验原理Trizol试剂是由苯酚和硫氰酸胍配制而成的单相的快速抽提总RNA的试剂,在匀浆和裂解过程中,能在破碎细胞、降解蛋白质和其它成分,使蛋白质与核酸分离,失活RNA酶,同时能保持RNA的完整性。
在氯仿抽提、离心分离后,RNA处于水相中,将水相转管后用异丙醇沉淀RNA2、操作步骤1、取植物嫩叶,液氮研磨,每1.5ml tube分装0.1克样品;2.每管加入0.5ml Trizol液,迅速混匀,注意样品总体积不能超过所用Trizol体积的10%。
3、室温下静置5~10分钟以利于核酸蛋白质复合体的解离4、加入O.5mI的氯仿,盖紧离心管,用手剧烈摇荡离心管15秒,室温静置5分钟5、10000r/min离心10分钟6、取上清液(水相)转入一新的离心管,加入等体积异丙醇,室温放置10分钟,10000r/min离心10分钟。
7、弃去上清液,加入至少1ml的70乙醇,涡旋混匀,4℃下7500r/min离心5分钟。
8、小心弃去上清液,然后室温或真空干燥5—10分钟,注意不要干燥过分,否则会降低RNA的溶解度。
然后将RNA溶于TE或DEPC处理过的水中,必要时可55℃—60℃水溶10分钟。
人TIMP-2基因的克隆及其原核表达徐国强;王伟;孙达权;黄小琼;陈腾祥【摘要】目的构建人TIMP-2重组表达载体,并在大肠杆菌BL21 (DE3)中表达.方法提取人肝癌细胞(Hep G2)总RNA后,经RT-PCR扩增获得目的片段,插入克隆载体pMD18-T;酶切鉴定和测序后将TIMP-2导入原核表达载体pGEX-4T-1中,构建重组质粒pGEX-TIMP-2.将重组质粒转化至大肠杆菌菌株BL21 (DE3)中,IPTG诱导融合蛋白表达后用SDS-PAGE电泳检测并用western blot验证(蛋白质印迹法).结果成功构建原核重组表达载体pGEX-TIMP-2,并在原核宿主BL21中大量表达融合蛋白GST-TIMP-2.结论克隆人TIMP-2基因并在原核生物中大量表达.【期刊名称】《贵州医药》【年(卷),期】2016(040)004【总页数】4页(P344-347)【关键词】基质金属蛋白酶抑制因子2;pGEX-4T 1;原核表达;肝癌【作者】徐国强;王伟;孙达权;黄小琼;陈腾祥【作者单位】贵州医科大学生理学教研室,贵州贵阳550004;贵州医科大学生理学教研室,贵州贵阳550004;贵州医科大学生物化学与分子生物学教研室,贵州贵阳550004;贵州医科大学生理学教研室,贵州贵阳550004;贵州医科大学生理学教研室,贵州贵阳550004【正文语种】中文【中图分类】R329.2+5基质金属蛋白酶抑制因子(TIMPs)是基质金属蛋白酶(MMPs)的天然抑制剂[1]。
两者形成非共价复合物从而抑制MMPS的活性,减少细胞外基质的破坏,保持细胞间连接的完整性,降低肿瘤的转移,改善预后[2]。
细胞外基质(ECM)由基底膜和间质基质构成,基底膜是ECM的关键结构,它不仅为ECM提供物理支撑,同时还为细胞提供代谢支持[3]。
ECM是肿瘤重要的微环境之一,能够影响肿瘤细胞的生物学行为,包括调节细胞间的黏附以及肿瘤的发展和转移[4]。
原核表达步骤总结原核表达步骤原核表达先要将基因克隆到原核表达载体上,然后通过转化到JM109或BL21等菌株中,诱导表达蛋白,然后进行蛋白纯化。
本实验方案的前提是,目的基因已克隆到载体,并已转进入JM109菌株中。
一( 鉴定目的蛋白是否在大肠杆菌JM109或BL21中大量表达制样 (一)1 . 挑取经过双酶切鉴定的单克隆菌落于700ul LB培养基,加入0.7ul Ampo(100mg/mL),37C200r/min摇床培养,过夜活化。
2. 以1:50比例(200ul),将活化的过夜培养物加入10mL LB液体培养基中,o加入10uLAmp(100mg/ml),37C200r/min摇床扩大培养2h-3h,期间取样监控菌液的OD值,控制菌液OD600在0.6-1.0之间,以使大肠杆菌处于最适合表达外源蛋白的生长状态。
(一般3h时,菌液浓度及达到标准,但是不同的基因对菌的影响不同,所以第一次实验时需要确定这个最佳时间)3. 从10ml扩大培养物中取3ml菌液作为不加IPTG的空白对照(CK),其余ul IPTG(储存浓度为0.5mol/l),使IPTG终浓度达到0.5mmol/l。
7ml菌液加入7o以200r/min的转速,37C摇床培养3h。
4. 以5000r/min离心2min收集菌体,倾倒上清,每个离心管收集3ml培养物。
5. 加入1ml dHO,将管底沉淀用振荡器打散以充分洗涤,8000r/min离心2min,2倾倒上清。
6. 重复步骤5。
将离心管中的水倒干净。
(二)菌落SDS-PAGE1. 在收集的菌体中加入200ul 1×SDS PAGE loading buffer(可根据沉淀的量增加或减少loading buffer的量,一般200ul比较合适)。
用漩涡器剧烈震荡,确保将管底沉淀震散。
2. 将样品于100?恒温加热器上开盖加热10min(Marker也要加热)。
样品凉后,12000r/min离心3min,取每管的上清点样。
基质金属蛋白酶细胞外基质和基底膜重塑是癌细胞侵袭转移过程中的关键环节,需借助于蛋白降解酶的表达和激活。
基质蛋白酶主要有以下数种:丝氨酸蛋白酶类,包括血浆酶原激活剂;半胱氨酸蛋白酶类,包括组织蛋白酶D 在内的溶酶体酶;金属蛋白酶类(metalloproteinases)[1]。
金属蛋白酶类在肿瘤侵袭过程中的作用近年来倍受关注,大量证据表明基质金属蛋白酶,特别是基质金属蛋白酶-2(matrixmetalloproteinase-2,MMP-2)在肿瘤细胞介导的细胞外基质降解中起关键作用,临床研究表明,MMP-2活性和表达的增加与人类多种恶性肿瘤侵袭转移潜能及预后密切相关[2~4]。
一. MMP-2基因及其表达和激活的调节MMP-2基因位于人类染色体16q21,由13个外显子和12个内含子所组成,结构基因总长度为27kb,与其他金属蛋白酶不同,MMP-2基因5′旁侧序列促进子区域含有2个GC盒而不是TATA盒[5]。
MMP-2以前酶原的形式由多种细胞分泌,如成纤维细胞、巨噬细胞、内皮细胞和恶性肿瘤细胞等。
与其他金属蛋白酶相似,MMP-2分子含有氨基末端片段、金属结合片段及羧基末端片段,其中带有高度保守序列PRCGV/NPD的氨基末端具有一个不配对的半胱氨酸残基,该残基与激活位点的锌原子相互作用介导着MMP-2的前体状态;金属结合片段是公认的锌结合部位,其含旁侧有2个组氨酸的保守序列HE-GH;羧基末端具有类似凝血酶的片段,该片段的具体功能尚未明确。
此外,MMP-2还具有一个58个氨基酸残基组成的明胶结合片段,此片段与纤维连接素的明胶结合Ⅱ型基元相似[6]。
目前认为,MMP-2表达和功能的调节发生于转录、分泌、前酶原的激活、细胞表面的结合以及与来源于肿瘤或宿主细胞的MMP抑制剂的相互作用等多个不同的水平。
MMP-2的转录调节与其他金属蛋白酶相比具有一定的独特性,如佛波醇酯(phorbolester)通过AP-1位点的介导增加MMP-9和间质胶原酶的表达,而MMP-2基因促进子区域未能测得AP-1位点[5];转化生长因子-β1(TGF-β1)通过其抑制元素TIE抑制间质胶原酶的表达[7],而TGF-β1却能诱导人类细胞株转录出高水平的MMP-2信使核糖核酸(mRNA)[8]。
基质金属蛋白酶mmp7, mmp10基因表达基质金属蛋白酶(Matrix Metalloproteinases,MMPs)是一类参与细胞外基质降解的蛋白酶,它们在生理和病理过程中起着重要作用。
MMP7和MMP10是其中的两个成员,它们的基因表达受到多种因素的调控。
MMP7(基质金属蛋白酶7):
MMP7主要参与消化系统和肺部的生理过程。
其基因表达可能受到炎症、肿瘤和其他病理状态的调控。
例如,在某些癌症中,MMP7的过度表达与肿瘤侵袭和转移相关。
MMP10(基质金属蛋白酶10):
MMP10参与许多组织的重塑和修复过程,同时也与肿瘤发展有关。
其基因表达可能在炎症、创伤和肿瘤中受到调控。
MMP10在炎症过程中可能促进细胞迁移和组织修复。
基质金属蛋白酶的基因表达受到复杂的调控网络的影响,包括细胞信号转导、生长因子、炎症介质等。
在不同的组织和病理状态下,它们的表达水平可能有所不同。
要获取具体的MMP7和MMP10基因表达信息,可以查阅相关的生物医学文献、基因表达数据库或使用实验技术如RT-PCR、Western blot等进行实验研究。
这样的研究有助于更深入地了解这些基因在生理和病理条件下的表达模式。
哺乳动物细胞表达系统按照宿主细胞的类型,可将基因表达系统大致分为原核、酵母、植物、昆虫和哺乳动物细胞表达系统。
与其它系统相比,哺乳动物细胞表达系统的优势在于能够指导蛋白质的正确折叠,提供复杂的N型糖基化和准确的O型糖基化等多种翻译后加工功能,因而表达产物在分子结构、理化特性和生物学功能方面最接近于天然的高等生物蛋白质分子。
从最开始以裸露DNA直接转染哺乳动物细胞至今的30余年间,哺乳动物细胞表达系统不仅已成为多种基因工程药物的生产平台,在新基因的发现、蛋白质的结构和功能研究中亦起了极为重要的作用。
本文主要从表达系统及其两个组成部分一一表达载体和宿主细胞等方面,简要介绍哺乳动物细胞表达系统和相关的研究进展。
研究现状①部分蛋白在哺乳动物细胞中的表达已从实验室研究迈向生产或中试生产阶段。
②已有许多重要的蛋白及糖蛋白利用哺乳动物细胞系统表达和大量制备、生产。
如人组织型血纤蛋白酶原激活因子、凝血因子皿、干扰素、乙肝表面抗原、红血球生成激素、人生长激素、人抗凝血素出,集落刺激因子等。
有些产品已投入临床应用或试用。
③虽然经过多年努力,哺乳动物细胞表达系统的表达水平有大幅度增高,但从整个水平上看仍偏低,一般处在杂交瘤细胞单克隆抗体蛋白产率的下限,即1-30^g/l08细胞/24小时。
有人认为其限速步骤可嚣是在工程细胞中(对于重组蛋白来讲,常是异源的),重组蛋白的分泌效率较低。
1表达载体1. 1表达栽体的类型哺乳动物细胞表达外源重组蛋白可利用质粒转染和病毒载体的感染。
利用质粒转染获得稳定的转染细胞需几周甚至几个月时间,而利用病毒表达系统则可快速感染细胞,在几天内使外源基因整合到病毒载体中,尤其适用于从大量表达产物中检测出目的蛋白。
根据进入宿主细胞的方式,可将表达载体分为病毒载体与质粒载体。
病毒载体是以病毒颗粒的方式,通过病毒包膜蛋白与宿主细胞膜的相互作用使外源基因进入到细胞内。
常用的病毒载体有腺病毒、腺相关病毒、逆转录病毒、semliki森林病毒(sFv)载体等。
基质金属蛋白酶8-概述说明以及解释1.引言1.1 概述基质金属蛋白酶8(MMP-8)是一种属于基质金属蛋白酶家族的酶类。
基质金属蛋白酶是一类负责细胞外基质降解的蛋白酶,在细胞外基质的合成和降解过程中发挥重要作用。
MMP-8主要由中性粒细胞产生,并且在炎症反应和组织修复过程中起关键作用。
基质金属蛋白酶8具有多种生物学功能。
它可促进胶原蛋白、弹力蛋白和其他基质蛋白的降解,参与细胞外基质的重建和重塑。
同时,MMP-8还能够调节细胞外基质的合成,调控细胞迁移和增殖,以及参与细胞凋亡的过程。
除了在正常生理过程中的作用外,研究发现基质金属蛋白酶8在多种疾病的发展中扮演重要角色。
例如,在炎症性疾病中,MMP-8的过度激活和表达会导致细胞外基质的大量降解,损伤组织结构,加重疾病的进展。
此外,MMP-8还与肿瘤的侵袭和转移相关,研究人员发现抑制MMP-8的表达或活性可以有效抑制肿瘤的扩散和转移。
综上所述,基质金属蛋白酶8是一种重要的酶类,在细胞外基质代谢和疾病发展中具有关键作用。
研究基质金属蛋白酶8的功能和调控机制,以及开发针对该酶的治疗策略,对于疾病的诊断和治疗具有重要意义。
未来的研究应着重深入探究基质金属蛋白酶8的生物学功能和信号传导机制,以期为其靶向治疗提供更多有力的证据。
1.2 文章结构本文分为引言、正文和结论三部分。
在引言部分,首先概述了基质金属蛋白酶8的重要性和作用,接着介绍了本文的结构和目的。
正文部分主要包括了基质金属蛋白酶8的定义、功能以及在疾病中的作用。
结论部分总结了基质金属蛋白酶8的重要性,并展望了未来研究的方向。
最后,给出了结论部分的总结。
整篇文章将全面介绍基质金属蛋白酶8的研究进展和意义,希望能够对相关领域的研究者和读者提供有价值的参考。
目的部分的内容可能如下所示:1.3 目的本文旨在探讨基质金属蛋白酶8(matrix metalloproteinase-8,MMP-8)在生物体内的功能及其在疾病中的作用。
生物化学试题及答案(14)第十四章基因重组与基因工程[测试题]一、名词解释:1. 基因工程(genetic engineering)。
2. 接合作用(conjugation )。
3. 转化作用(transforation )。
4. 转导作用(transduction )。
5. 转座(transposition )。
6. 转座子(transposons )。
7. 同源重组(homologous recombination )。
8. 基本重组(general recombination )。
9. DNA克隆(DNA cloning )。
10. 复制子( replicon )。
11. 限制性核酸内切酶(restriction endonuclease )。
12. 回文结构(palindrome )。
13. 配伍末端(compatible end )。
14. 目的DNA (target DNA)。
15. 互补DNA (complementary DNA;cDNA )。
16. 克隆载体(cloning vector )。
17. 表达载体(expression vector )。
18. 质粒(plasmid )。
19. α—互补(alpha complementation )。
20. 基因组DNA文库( genomic DNA library )。
21. 标志补救(marker rescue )。
22. 转染(transfection )。
23. 基因组DNA (genomic DNA)。
24. 感受态细胞(competent cell )。
25. 聚合酶链反应(polymerase chain reaction )。
26. cDNA文库(cDNA library )。
27. 保守性转座(conservative transposition )。
28. 复制性转座(duplicative transposition )。
基质金属蛋白酶—7的基因克隆和原核表达作者:刘继科等来源:《安徽农学通报》2013年第07期摘要:研究构建人基质金属蛋白酶7(MMP-7)的原核表达载体,并进行原核表达获得重组蛋白MMP-7。
以人肾肿瘤组织总RNA为模板,PCR方法获得MMP-7成熟蛋白的基因序列,构建含10xhis标签的原核表达载体,转化大肠杆菌BL21(DE3),并经异丙基-β-D-硫代吡喃半乳糖苷(IPTG)诱导表达,获得重组蛋白,并经十二烷基磺酸钠-聚丙烯酰胺凝胶电泳(SDS-PAGE),检测其表达情况。
最终得到pET24a(+)-MMP-7-10his重组质粒,诱导表达后重组蛋白占总蛋白的41%左右,获得21.2kD大小蛋白,与目的蛋白大小一致,纯度大于90%,为进一步研究奠定基础。
关键词:基质金属蛋白酶-7;基因克隆;原核表达中图分类号 Q55 文献标识码 A 文章编号 1007-7731(2013)07-31-04基质金属蛋白酶(matrix metalloproteinases,MMPs)是一类依赖Zn2+的参与ECM降解的蛋白水解酶,可降解基底膜和细胞外基质(extracellar matrix, ECM)的大多数蛋白质,并参与调节ECM动态平衡,是维持ECM稳态最重要的一类酶,其与机体许多病理过程密切相关[1-2]。
在血管形成、炎症、风湿活动、胚胎发生、纤维化及肿瘤侵袭转移等生物体内的生理及病理过程中的研究显示,这些生理及病理过程中伴随有MMPs的表达量上升[3-7]。
自1962年,Gross和Lapiere在蝌蚪尾巴组织发现间质胶原酶(即MMP-1)[8],其后陆续发现的MMPs被依次按发现时间顺序命名,至今至少已发现人源MMP23种,包括胶原酶、明胶酶、基质降解素、膜型MMPs和其他共五大类。
其中基质金属蛋白酶7(MMP-7)属基质溶解素(Matrilysin),与肿瘤发生、细胞凋亡和血管形成等病理过程联系密切[9],是近年来的研究热点。
本研究利用基因工程技术,通过基因克隆,构建基质金属蛋白酶7成熟蛋白原核表达载体,并进行原核表达以获得高纯度重组蛋白,可以为进一步研究MMP及各种机体的病理相关性提供基础。
1 材料与方法1.1 材料1.1.1 菌种与质粒载体pET24a(+),菌株E.coli DH5a和BL21(DE3)均为本实验室保存。
1.1.2 主要试剂人肾肿瘤组织总RNA购自Biochain,内切酶Nde I、BamH I、T4 DNA连接酶、Taq DNA聚合酶以及T载体pMD18-T simple购自TaKaRa公司,反转录第一链cDNA合成试剂盒购自罗氏,引物合成和测序由英骏生物技术有限公司提供,其他试剂均为进口或国产分析纯。
1.2 方法1.2.1 MMP-7基因克隆根据GeneBank中MMP-7成熟蛋白的基因编码序列信息,采用软件Primer Premier5设计引物S1/A1(引物序列见表1)。
以人肾肿瘤组织总RNA为模板,按罗氏的反转录第一链cDNA合成试剂盒说明进行反转录实验,合成cDNA,并以其为模板扩增目的基因。
RT-PCR程序为:65℃,10min、55℃,30min、85℃,5min。
PCR程序为:94℃预变性5min;以94℃,30s、52℃,30s、72℃,1min为循环条件,30个循环;72℃,10min。
1%凝胶电泳鉴定条带大小,应为519bp,PCR鉴定为阳性的话,纯化回收PCR产物,连接到pMD18-T simple载体中得到pMD-MMP-7质粒,转化到E.coli DH5a克隆菌株中,提取转化质粒,PCR鉴定,结果为阳性后送测序。
1.2.2 pET24a(+)-MMP-7-10his原核表达载体的构建设计引物A2/A3和引物S2(引物序列见表1),上游引物S2的5’端携带Nde I酶切位点,下游引物A3的5’端引物携带BamH I 酶切位点,和编码10xhis标签和两个终止密码子的序列。
以pMD-MMP-7质粒为模板,S2/A2为引物进行PCR应得到551bp片段,再将其纯化后作为模板,以S2/A3为引物进行PCR应得到578bp片段。
1%凝胶电泳鉴定条带大小,应为578bp,PCR鉴定为阳性的话,纯化回收PCR产物,连接到pMD18-T simple载体中,转化到E.coli DH5a克隆菌株中,提取转化质粒,PCR鉴定,结果为阳性后送测序。
PCR程序分别为:94℃预变性5min;以94℃,30s、55℃,30s、72℃,1min为循环条件,30个循环;72℃,10min。
94℃预变性5min;以94℃,30s、60℃,30s、72℃,1min为循环条件,30个循环;72℃,10min。
用Nde I和BamH I分别酶切MMP-7的578bp目的片段和pET24a(+)表达载体,产物凝胶纯化回收,用T4连接酶做连接反应,得到pET24a(+)-MMP-7-10his原核表达载体,将其转化E.coli DH5a菌株,提取转化质粒,PCR鉴定,结果为阳性后送测序。
原核表达载体pET24a(+)-MMP-7-10his的构建如图1所示。
1.2.3 pET24a(+)-MMP-7-10his/BL21(DE3)重组表达菌的构建及鉴定将测序结果正确的阳性重组质粒pET24a(+)-MMP-7-10his转化E.coli BL21(DE3)感受态,得到重组表达菌pET24a(+)-MMP-7-10his/BL21(DE3),将转化的重组表达菌株pET24a(+)-MMP-7-10his/BL21(DE3)涂固体培养平板(卡那抗性),37℃培养过夜,挑5个单克隆,分别接种到5mL TB液体培养基(卡那抗性),37℃,250rpm/min条件下培养6h,使菌液OD600=0.6~0.8,加入IPTG诱导剂至终浓度为0.4mmol/L诱导,37℃,200rpm/min条件下培养4h,4℃,6 000rpm/min离心5min,收集菌体,菌体加入2×SDS上样缓冲液,煮沸10min,15%SDS-PAGE检测各菌株表达情况。
1.2.4 MMP-7蛋白诱导表达、可溶性分析活化高表达菌株,按1:50转接到10mL TB液体培养基中(卡那抗性),摇床培养2h,加入IPTG至终浓度0.4mmol/L,在37℃条件下,250rpm/min培养4h,诱导目的蛋白的表达。
取1mL表达菌液,12 000rpm,5min离心,收集菌体,PBS洗涤两次后,1mL PBS重悬,做冰浴超声3min(200W,超声5s,间歇5s),破碎细胞,澄清液于4℃、12 000rpm/min离心5min,SDS-PAGE电泳分析上清和沉淀。
2 结果与分析2.1 MMP-7基因克隆与重组表达载体构建以人肾总RNA为模板反转录后,PCR获得目的基因片段,此研究中分别以S1/A1、S2/A2和S2/A3为引物经多次PCR,最终得到的PCR产物片段为578bp,与预测大小一致,包含测序正确的MMP-7基因序列,以及设计的10xhis标签序列,经双酶切后连接构建正确的重组表达载体pET24a(+)-MMP-7-10his,PCR及测序结果显示其构建正确(图1、2)。
测序结果如图4,其中下划线序列为酶切位点序列,粗体部分为10xHis序列及双终止子,方框内为载体序列,其余序列是MMP7序列,与目标序列完全重合。
2.2 重组表达菌的构建及鉴定表达菌株的表达量可能存在差异,所以在表达时,选取高表达菌株有利于后面的表达。
阳性克隆转化BL21(DE3)后涂卡那抗性抗性平板筛选,挑5个克隆与液体抗性培养基诱导表达,并经15%SDS-PAGE检测各菌株重组蛋白表达显示,结果显示,各菌株在预期蛋白大小带处均有表达,且其菌株表达量大致相当(图5)。
2.3 MMP-7蛋白诱导表达、可溶性分析菌株经液体抗性培养基诱导表达,取菌液离心,收集菌体,破碎细胞,澄清液离心后,SDS-PAGE电泳分析上清和沉淀以鉴定MMP-7蛋白表达和得到可溶性分析结果。
结果显示诱导表达后重组蛋白占总蛋白的41%左右,获得21.2kD大小蛋白,与目的蛋白大小一致,纯度大于90%,为进一步研究奠定基础(图6)。
3 讨论基质金属蛋白酶广泛参与机体的生理病理过程,尤其是关于基质金属蛋白酶与各类肿瘤发生及演变的关系的研究显示,在肿瘤发生演变过程中,往往伴随基质金属蛋白酶的过量表达并参与肿瘤侵袭转移等演变进程。
而基质金属蛋白酶抑制剂的研究显示其具有抗肿瘤、治疗心血管疾病、治疗炎症等生物活性。
其中在抗肿瘤领域,相对于细胞毒试剂治疗等传统方法,以基质金属蛋白酶为药物靶点,选择其拮抗药物成为新型的理想抗肿瘤方法。
原核表达系统具有操作简单、表达量高、成本低等优点,构建重组蛋白原核表达载体,利用原核表达系统表达,可快速获得较大量的重组蛋白。
本研究采用原核表达系统,同时为了更有利于后期的纯化,通过引物设计,在表达载体中设计加入10xhis序列和双终止子序列,10xhis序列的加入使得重组蛋白带有高亲和标签,有利于蛋白纯化,且标签分子量小,对蛋白结构功能影响小,而加入的双终止子序列则保证在加入标签时MMP-7重组蛋白更接近原始大小,利于后期的研究,最终经高表达的原核表达后,获得了高蛋白表达量和高纯度的重组人MMP-7蛋白。
但原核表达也存在表达蛋白易以包涵体形式存在的缺点,本研究表达的MMP-7重组蛋白即为包涵体,笔者尝试多次复性,均不是很理想,有待于进一步的研究。
本研究有利于MMP-7和各种机体病理相关性的进一步研究,而MMP及其抑制剂的研究也日趋热门,相信随着相关研究的不断深入,人们将在肿瘤生物学和肿瘤治疗等一些方面做出更大的成就。
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