诊断试验准确性的Meta分析
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诊断性试验Meta分析报告一、引言诊断性试验在医学领域中具有至关重要的作用,它们帮助医生确定患者是否患有某种疾病,以及评估疾病的严重程度和预后。
然而,单个诊断性试验往往受到样本量、研究人群、研究方法等因素的限制,其结果可能存在偏差。
Meta 分析作为一种系统评价方法,能够综合多个诊断性试验的结果,提供更全面、更准确的诊断信息。
二、目的本 Meta 分析的目的是综合评估某种诊断性试验在特定疾病中的诊断价值,为临床医生的诊断决策提供依据。
三、资料与方法(一)检索策略我们在多个数据库(如 PubMed、Embase、Cochrane Library 等)中进行了系统的检索,检索时间范围为_____至_____。
检索词包括疾病名称、诊断性试验名称以及相关的关键词。
(二)纳入与排除标准纳入标准:①研究对象为疑似患有特定疾病的患者;②使用了所关注的诊断性试验;③报告了诊断准确性的相关指标,如敏感度、特异度、阳性预测值、阴性预测值等。
排除标准:①重复发表的研究;②研究质量差,如样本量过小、方法学存在明显缺陷等;③无法获取全文或关键数据的研究。
(三)数据提取由两名研究者独立提取纳入研究的基本信息(如作者、发表年份、研究地点等)、研究对象的特征(如年龄、性别、疾病严重程度等)、诊断性试验的方法和参数、诊断准确性的指标等。
如有分歧,通过讨论或咨询第三方解决。
(四)质量评估采用 QUADAS-2(Quality Assessment of Diagnostic Accuracy Studies 2)工具对纳入研究的质量进行评估,评估内容包括病例的选择、待评价试验、金标准、病例流程和进展情况等方面。
(五)数据分析使用 Review Manager 53 软件进行数据分析。
对于诊断准确性的指标,计算合并的敏感度、特异度、阳性似然比、阴性似然比和诊断比值比,并绘制森林图和受试者工作特征(ROC)曲线。
采用随机效应模型或固定效应模型进行合并分析,根据异质性检验的结果(I²值)选择合适的模型。
#临床流行病学#诊断试验评价的M eta分析方法刘云霞王洁贞庞春坤刘建平=摘要>目的介绍诊断试验评价的M eta分析方法。
方法以7篇B超诊断脂肪肝的研究为例,运用调整SROC法对其进行综合评价。
结果用调整SROC法求得B超的灵敏度为0.89(95%CI:0.87~0.92),特异度为0.94(95%CI:0.92~0.96),Q值为0.90。
结果表明,B超的诊断价值较高,可作为脂肪肝诊断的有效方法。
结论运用诊断试验评价的M eta分析方法,可对诊断试验的诊断价值做出综合评价,增加研究结论的统计功效,提高结论的可靠性。
=关键词>M eta分析;调整SROC法;诊断试验The use of Meta-analysis in the evaluation on diagnostic tests LI U Yun-x ia*,WA N G Jie-z hen,PA N GChun-kun,LI U Jian-p ing.*I nstitute of Evidence Based M edicine,T he Second H osp ital,School ofM edicine,Shandong Univer sity,Jinan250033,China=Abstract>Objective T o introduce M eta-analysis in evaluating diagnostic tests.Method AdjustedSROC metho d w as used in assessing7diagnostic tests on fatty liver.Results T he pooled sensitivity andspecificit y o f type B ultrasonog raphy were0.89[95%confidence interval(CI):0.87-0.92]and0.94(95%CI:0.92-0.96)respectively while the Q value was0.90by adjusted SROC method.T he results indicatedt hat the diagnostic value of type B ultr asonogr aphy w er e high,thus could be regarded as an effectiv e methodfor fatty liv er diagnosis.C onclusion M eta-analysis on evaluating diagnostic tests could be used to assess thediagnostic test to increase the pow er of conclusion,and to impro veits its reliabilit y.=Key words>M eta-analysis;Adjusted SROC method;Diagnostic tests目前,诊断性试验研究的综合评价方法中应用最广泛的是M oses等[1]和Kardaun等[2]提出的固定效应模型(fixed-effects model):估计SROC曲线(summary ROC curve)的方法(SROC法);而适用于该类研究评价的随机效应模型(random-effects model)仍在研究之中。
诊断试验准确性的Meta分析一、问题与数据某肿瘤科大夫希望了解CT对某肿瘤的诊断准确性,他查阅了很多国内外文献,发现文献中各研究样本量都偏小,且对该方法的准确性评价结果不一,因此想通过Meta分析的方法对其准确性进行较为可靠的评价。
通过对相关文献的检索,共获得以下数据:表1 部分研究数据变量意义及赋值情况如下:表2 变量意义与赋值情况二、对问题分析要进行诊断试验准确性的Meta分析,至少应当收集真阳性、假阳性、假阴性与真阴性的人数。
然而,Meta分析并不是简单的进行数据的加权合并,因为各研究结果不同的原因通常不仅仅是因为样本量小造成的结果不稳定,还可能是因为研究的设计、执行等多方面的因素存在差异所导致,因此Meta分析的一个重要的任务便是对可能的因素进行探讨,找出文献结果不一的原因,这也是证据评价的过程。
表1中,是否是前瞻性研究(predesign)、金标准是否是同一个(samemth)、是否详细描述待评价试验(index)、是否详细描述金标准(reftest)和是否详细描述待评价人群(subject)是本研究中研究者认为可能的影响因素。
三、Stata分析1. 安装分析包一般认为,诊断试验准确性的数据异质性比较明显,因此推荐使用随机效应模型进行分析。
Stata中有专门针对诊断试验准确性Meta分析的分析包midas和metandi,均是采用两水平的随机效应模型进行分析。
由于后者不支持meta回归功能,因此本文仅介绍midas包的使用。
在command窗口,依次输入以下命令,安装必需的分析包:ssc install midasssc install mylabels2. 数据录入在Stata窗口点击数据编辑按钮,弹出数据编辑窗口。
在变量名位置双击,弹出新建变量窗口。
如果变量是字符型,则变量类型(Variable type)选择str,是数值型则选择double(小数)或int (整数)。
设定好变量名后,从excel中将数据复制到新建变量窗口中即可,部分数据如下图。
STATA已经有独立的模块(metandi)来做诊断性试验的meta分析,所用方法是拟合了一个两水平的混合logistic回归模型。
虽然该模块还没有与metan模块类似的对话框,但是应该来说已经是一个比较大的进步。
最终的呈现结果不仅能给出基于多水平模型估计得到的南京58信息网ROC曲线下面积(hierarchical summary receiver operating characteristic,hsroc),同时能得到“拐点”信息(summary point),以下摘选该模块的帮助内容来简要介绍该模块。
Titlemetandi -- Meta-analysis of diagnostic accuracySyntaxmetandi tp fp fn tn [if] [in] [, plot gllamm force ip(g|m) nip(#) nobivariate nohsroc nosummarypt detail level(#) trace nolog]by is allowed with metandi; see [D] by.See metandi postestimation for features available after estimation, in particular, the predict command. metandiplot graphs the results from metandi.Descriptionmetandi performs meta-analysis of diagnostic test accuracy studies in which both the index test under study and the reference test (gold standard) are dichotomous. It takes as input four variables: tp, fp, fn, and tn, giving the number of true positives, false positives, false negatives, and true negatives within each study. It fits a two-level mixed logistic regression model, with independent binomial distributions for the true positives and true negatives conditional on the sensitivity and specificity in each study, and a bivariate normal model for the logit transforms of sensitivity and specificity between studies.In Stata 10, metandi fits the model by using the official Stata command xtmelogit by default. In Stata 8 or 9, metandi uses the user-written command gllamm, which must be installed.To ensure you have the most recent version of gllamm, type ssc install gllamm, replace.metandi does not allow covariates to be fit; i.e., meta-regression of diagnostic accuracy is not supported.。
临床试验Meta分析临床试验Meta分析:揭开医学疗效之谜引言医学研究是为了找到更好的治疗方案,但单个临床试验结果往往无法全面反映治疗效果。
这就引出了Meta分析,一个将多个临床试验的结果进行综合分析的方法。
本文将为您介绍临床试验Meta分析的原理、应用和局限性。
一、Meta分析的原理Meta分析通过整合多个独立的临床试验,利用统计学方法对结果进行综合统计分析。
其核心思想在于将各个试验的效应量进行加权平均,从而提高结果的可信度和准确性。
通常,Meta分析有两种常见的效应量指标:二元变量(如治愈率、死亡率等)和连续变量(如血压、体重等)。
常用的Meta分析模型有固定效应模型和随机效应模型。
二、Meta分析的应用1.评估治疗效果Meta分析在评估不同治疗方法的效果上发挥着重要作用。
例如,在药物治疗方面,比较不同药物的疗效可以帮助临床医生在制定治疗方案时做出更准确的决策。
此外,Meta分析还可以评估手术方法、康复治疗以及其他治疗方案的效果。
2.探究不同因素的影响除了评估治疗效果外,Meta分析还可以探究不同因素对治疗效果的影响。
例如,研究某种药物对不同人群的治疗效果,可以根据Meta分析结果为不同患者群体提供个性化治疗建议。
此外,Meta分析还可以研究不同年龄、性别、民族等因素对治疗效果的影响。
3.发现新的研究方向Meta分析的另一个重要应用是发现新的研究方向。
通过综合分析已有的临床试验结果,可以为未来的研究提供参考,指导研究者选择新的研究方向。
同时,Meta分析还能帮助确定需要进一步研究的问题,从而推动医学科研的发展。
三、Meta分析的局限性尽管Meta分析具有许多优点,但也存在一些局限性。
1.异质性由于临床试验的设计、样本特点和方法等差异,导致试验之间存在异质性。
这种异质性可能影响Meta分析的结果和解释。
为了解决这个问题,Meta分析需要进行亚组分析、敏感性分析和可能的混合效应模型等进一步分析。
诊断性meta分析手把教你做临床Meta 分析——诊断试验性 Meta-Disc分析导读:诊断性meta分析,手把教你做临床 Meta 分析——诊断试验性 Meta-Disc 分析,诊断性meta分析stata,诊断性试验meta,推荐访问:诊断性meta分析stata诊断性试验meta手把教你做临床 Meta 分析——诊断试验性Meta-Disc 分析临床治疗的基础首先是需要准确的诊断,准确诊断性 Meta 分析是 Meta 分析的一个重要部分,本次想向大家推荐的是一款专用于诊断性试验的免费 Meta 分析软件,临床医学、临床检验、临床病理、临床科研人员、临床康复科及临床影像科等工作人员可用它写上一篇高大上的诊断准确性试验的 Meta 分析文章。
安装软件Meta-DiSc 是一个免费的下载软件,登录http://www.hrc.es/investigacion/metadisc_en.htm,下载安装软件,目前最新版本是 1.4 版。
运行软件在试行此软件之前,必须明确和熟悉准确诊断性 Meta 分析里结果计算的经典四格表(可能不会在您所纳入的文献中出现,需要研究人自己总结并准确的填写在四格表内,不易混淆而且方便分析)。
TP:True positive 表示真阳性的结果,用数字表示;FP:False positive 表示假阳性的结果,用数字表示;FN:False negative 表示假阴性的结果,用数字表示;TN:True negative 表示真阴性的结果,用数字表示。
1打开软件,可以看到如下界面Author:第一作者名 + 文章年限,如 Rachow 2013;StudyID:纳入文献的排序编号,亦可以按照自己理想的排名排序;2数据的输入有三种方法可以输入,我们掌握其中两种就足够运用,一种是当纳入的文献较多的时候,可以按照软件中表格的形式对应写在 Excel 表上,点击复制 Ctrl+c,并点击黏贴 Ctrl+v,便可以 copy 至软件中的表格内;另一种当纳入的文献数量较少时,则可以直接用手动输入到 Meta-disc 数据表内,如下图。
meta分析简介Meta分析的前身源于Fisher1920年“合并P值”的思想,1955年由Beecher首次提出初步的概念,1976年心理学家Glass进一步按照其思想发展为“合并统计量”,称之为Meta分析。
1979年英国临床流行病学家Archie Cochrane提出系统评价(systematic review,SR)的概念,并发表了激素治疗早产孕妇降低新生儿死亡率随机对照试验的系统评价,对循证医学的发展起了举足轻重的作用。
Meta分析国内翻译为“荟萃分析”,定义是“The statistical analysis of large collection of analysis results from individual studies for the purpose of integrating the findings.”亦即“对具备特定条件的、同课题的诸多研究结果进行综合的一类统计方法。
”M eta从字源来说据考证有“Meta logic:a branch of analytic philosophy that deals with the critical examination of the basic concepts of logic”;“Meta mathematics:the philosophy of mathematics,especially,the logical syntax of mathematics.”其中最简洁并且一语中的的是Meta science::a theory or science of science,a theory concerned with the investigation?analysis?or description of theory itself.”意为一种科学中的科学或理论,一种对原理本身进行调查、分析和描述的原理。
Meta分析有广义和狭义两种概念:前者指的是一个科学的临床研究活动,指全面收集所有相关研究并逐个进行严格评价和分析,再用定量合成的方法对资料进行统计学处理得出综合结论的整个过程;后者仅仅是一种单纯的定量合成的统计学方法。
诊断性meta分析手把教你做临床Meta 分析——诊断试验性Meta-Disc 分析导读:诊断性meta分析,手把教你做临床 Meta 分析——诊断试验性 Meta-Disc 分析,诊断性meta分析stata,诊断性验meta手把教你做临床 Meta 分析——诊断试验性 Meta-Disc 分析临床治疗的基础首先是需要准确的诊断,准确诊断性 Meta 分析是 Meta 分析的一个重要部分,本次想向大家推荐的是一款专用于诊断性试验的免费 Meta 分析软件,临床医学、临床检验、临床病理、临床科研人员、临床康复科及临床影像科等工作人员可用它写上一篇高大上的诊断准确性试验的 Meta 分析文章。
安装软件AHA12GAGGAGAGGAFFFFAFAFMeta-DiSc 是一个免费的下载软件,登录http://www.hrc.es/investigacion/metadisc_en.htm,下载安装软件,目前最新版本是 1.4 版。
运行软件AHA12GAGGAGAGGAFFFFAFAF在试行此软件之前,必须明确和熟悉准确诊断性 Meta分析里结果计算的经典四格表(可能不会在您所纳入的文献中出现,需要研究人自己总结并准确的填写在四格表内,不易混淆而且方便分析)。
TP:True positive 表示真阳性的结果,用数字表示;FP:False positive 表示假阳性的结果,用数字表示;FN:False negative 表示假阴性的结果,用数字表示;TN:True negative 表示真阴性的结果,用数字表示。
1打开软件,可以看到如下界面AHA12GAGGAGAGGAFFFFAFAFAuthor:第一作者名 + 文章年限,如 Rachow 2013;StudyID:纳入文献的排序编号,亦可以按照自己理想的排名排序;2数据的输入AHA12GAGGAGAGGAFFFFAFAF有三种方法可以输入,我们掌握其中两种就足够运用,一种是当纳入的文献较多的时候,可以按照软件中表格的形式对应写在 Excel表上,点击复制 Ctrl+c,并点击黏贴Ctrl+v,便可以 copy 至软件中的表格内;另一种当纳入的文献数量较少时,则可以直接用手动输入到 Meta-disc 数据表内,如下图。
诊断试验准确性的Meta分析
一、问题与数据
某肿瘤科大夫希望了解CT对某肿瘤的诊断准确性,他查阅了很多国内外文献,发现文献中各研究样本量都偏小,且对该方法的准确性评价结果不一,因此想通过Meta分析的方法对其准确性进行较为可靠的评价。
通过对相关文献的检索,共获得以下数据:
表1 部分研究数据
变量意义及赋值情况如下:
表2 变量意义与赋值情况
二、对问题分析要进行诊断试验准确性的Meta分析,至少应当收集真阳性、假阳性、假阴性与真
阴性的人数。
然而,Meta分析并不是简单的进行数据的加权合并,因为各研究结果不同的原因通常不仅仅是因为样本量小造成的结果不稳定,还可能是因为研究的设计、执行等多方面的因素存在差异所导致,因此Meta分析的一个重要的任务便是对可能的因素进行探讨,找出文献结果不一的原因,这也是证据评价的过程。
表1中,是否是前瞻性研究(predesign)、金标准是否是同一个(samemth)、是否详细描述待评价试验(index)、是否详细描述金标准(reftest)和是否详细描述待评价人群(subject)是本研究中研究者认为可能的影响因素。
三、Stata分析
1. 安装分析包
一般认为,诊断试验准确性的数据异质性比较明显,因此推荐使用随机效应模型进行分析。
Stata中有专门针对诊断试验准确性Meta分析的分析包midas和metandi,均是采用两水平的随机效应模型进行分析。
由于后者不支持meta回归功能,因此本文仅介绍midas包的使用。
在command窗口,依次输入以下命令,安装必需的分析包:
ssc install midas
ssc install mylabels
2. 数据录入
在Stata窗口点击数据编辑按钮,弹出数据编辑窗口。
在变量名位置双击,弹出新建变量窗口。
如果变量是字符型,则变量类型(Variable type)选择str,是数值型则选择double(小数)或int (整数)。
设定好变量名后,从excel中将数据复制到新建变量窗口中即可,部分数据如下图。
3. 合并点值
点值:点值指的是灵敏度、特异度、阳性似然比、阴性似然比
和诊断比值比。
一般诊断试验判断阳性、阴性的标准变化时,其准确性也会发生变化,因此点值的合并适用于各原始数据都来自于同一阈值的情况。
在command窗口中输入以下命令:
midas tp fp fn tn, res(sum)
回车后,结果界面会输出上述五个指标的合并值及置信区间。
4. 绘制森林图
森林图可以直观地展示纳入的各研究的结果差异情况。
command窗口中输入以下命令:
midas tp fp fn tn, id(author year) ms(0.75) ford fors bfor(dss) 回车后,Stata输出图形如下:
命令中的0.75是设定森林图中黑点大小的,读者可以自己换做其他数值。
从森林图中可以看出,灵敏度的Q检验P<0.01,说明纳入研究间的异质性有统计学意义,I2统计量为78.58%,说明异质性占比较大(I2超过50%即认为异质性较为明显)。
同样特异度的Q检验P=0.01,说明纳入研究间的异质性有统计学意义,而I2统计量为43.57%,说明有轻度的异质性。
(注:Q检验用来从统计学角度说明异质性是否存在,而I2统计量用来衡量异质性的大小,一般Q 检验的P值越小,I2统计量越大。
)除了运用统计学方法对异质性进行描述外,作者还可以直接通过森林图各数值的排列整齐情况进行定性的判断,该方法相对主观,可以与统计学方法相结合。
另外,Stata输出的图形可以进入编辑模式进行详细设置(如插入标题,调节字体等)。
5. 合并ROC曲线
当各研究诊断试验阳性、阴性判断标准存在差异时(判断阈值不同),对点值直接合并来衡量诊断试验的准确性大小并不合适,此时可以计算ROC曲线下面积(AUC)来衡量准确性在所有可能阈值下的平均水平。
但在实际情况下,各原始研究有时不会明确告知其采用的判断阈值,故阈值是否一致有时很难判断,即便是各研究明确说明采用了某同一阈值,由于实际操作时的客观或主观差异,实际阈值也可能不同。
因此ROC曲线还可以用来判断各纳入研究实际阈值是否存在明显差异(是否存在明显阈值效应)。
所谓阈值,是指判断诊断结果阳性还是阴性的标准。
标准不同时,实验的灵敏度和特异度会发生变化。
通常标准越宽松,灵敏度越高,特异度越低,(1-特异度)则越高。
所以,当综合考察纳入的各个诊断试验原始研究时,如果随着灵敏度增大,1-特异度也增大,可以提示这些诊断试验原始研究采用了多个标准。
存在多个标准则称为存在阈值效应。
在command窗口中输入以下命令:
midas tp fp fn tn, plot sroc(both)
首先从ROC图来看,灵敏度的变异程度更大,而特异度要小一些。
森林图及I2统计量也能说明此特征。
另外ROC图中,各数据点呈现“肩臂”状,提示纳入的各研究可能存在阈值效应。
所谓“肩臂”状,是指灵敏度随着(1-特异度)增大而增大,各点呈曲线趋势,类似于人的肩膀。
Stata结果显示,曲线下面积(AUC)大小为0.88。
需要注意的是,如果从纳入的研究中无法明确得知各研究的判断阈值是否不同,一般点值和ROC曲线都要进行合并。
此时的ROC曲线用于探索是否存在此种效应,以确定合并的点值所代表的意义,并给出整体上的准确性衡量指标(AUC)。
如果可以明确得知存在阈值效应,那么合并的点值仅是各纳入研究所采用的阈值下灵敏度、特异度或其他点值指标的平均值,此时如果通过点值进行两种诊断试验准确性的比较就会存在可比性的问题。
6. Meta回归
Meta回归是用来探究异质性来源的重要手段。
Stata可对分类型或连续型自变量进行单因素的回归
分析(实际上就是亚组分析)。
command中输入如下命令:
midas tp fp fn tn, reg(prodesign samemth index reftest subject)
reg后的括号中为要回归的自变量。
Stata会分别给出灵敏度和特异度的单因素回归结果:
结果给出的是每个自变量所分成的亚组单独合并的结果,以及亚组间差异的统计学检验P值。
同时给出图形:
从结果看出,对于灵敏度,仅有subject变量有统计学意义(P=0.01),说明对待评价人群特征描述详细的和不详细的研究得到的灵敏度结果存在统计学的显著不同,而对于特异度,五个自变量均有统计学意义。
7. 发表偏倚评价
已发表的研究结果可能和未能发表的研究结果存在差异,可以对此进行发表偏倚的检验。
在command窗口输入以下命令:
midas tp fp fn tn, pubbias
Stata会给出漏斗图,且不对称检验结果P<0.01,说明发表偏倚检验结果显著。
注意,对于诊断试验准确性的Meta分析,发表偏倚的检测方法仅限于Deek’s法,其他方法假阳性率太高(如干预类研究常用的Egger、Begg、Harbord和Peters检验)。
四、结果解释
CT诊断某肿瘤灵敏度合并值为0.73,95%CI(0.64-0.80),特异度合并值为0.85,95%CI(0.82-0.88),AUC为0.88,95%CI(0.85-0.91)。
五、延伸阅读
1. 诊断试验准确性的Meta分析过程与其他Meta分析过程一致,但具体的分析模型存在明显不同。
2. 诊断试验准确性的Meta分析模型比较多,相应软件也比较多,各有优缺点。
Meta-disc软件操作非常简单,但其功能也较为有限。
Stata中midas的meta回归无法同时调整多个变量,若要实现此功能,需使用SAS软件nlmixed过程,具体程序可以参考Cochrane官网发布的诊断试验Meta 分析指南第十章(/sdt/handbook-dta-reviews)。
要进行高质量的
诊断试验准确性Meta分析,推荐阅读该Cochrane指南。
六、更多阅读
举例说明近10种常见类型的Meta分析
Meta分析有很多种类型,常见的几种如:个体数据Meta分析,单组率的Meta分析,诊断试验Meta分析,剂量反应关系Meta分析,网状Meta分析等。
Meta分析的几种图形示例和绘图建议
图形对结果展示具有独特的优势,其在Meta分析的结果展示中发挥着重要作用。
本文将介绍几种Meta分析中常用的图。