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微生物分类的基本单位微生物分类是生物学中非常重要的一部分，它涉及到对微生物的分类、命名和鉴定。
微生物分类的基本单位有域、界、门、纲、目、科、属和种等级。
域是微生物分类的最高一级，也是最基本的分类单位。
目前认为有三个域：细菌域、古细菌域和真核生物域。
细菌域包括了细菌，是最简单的单细胞生物；古细菌域包括了古细菌，生存在极端环境下的微生物；真核生物域包括了真核生物，包括了动物、植物、真菌和原生生物等。
在细菌域中，界是微生物分类的第二个级别。
细菌域下面有两个界：厚壁菌界和薄壁菌界。
厚壁菌界包括了革兰氏阳性菌和革兰氏阴性菌等，这些菌的细胞壁具有较厚的层；薄壁菌界包括了微厌氧菌和厌氧菌等，这些菌的细胞壁相对较薄。
在古细菌域中，界是微生物分类的第二个级别。
古细菌域下面有四个界：甲烷古细菌界、极端嗜盐古细菌界、极端嗜热古细菌界和甲烷菌界。
甲烷古细菌界包括了产甲烷的古细菌；极端嗜盐古细菌界包括了生活在高盐环境中的古细菌；极端嗜热古细菌界包括了生活在高温环境中的古细菌；甲烷菌界包括了产甲烷的细菌。
在真核生物域中，门是微生物分类的第二个级别。
真核生物域下面有很多门，包括了动物门、植物门、真菌门和原生生物门等。
动物门包括了脊椎动物和无脊椎动物等；植物门包括了被子植物和蕨类植物等；真菌门包括了子囊菌门和担子菌门等；原生生物门包括了原生动物和原生植物等。
微生物分类的下一个级别是纲，纲是对一类微生物的总称。
在每个门下面都可以进一步划分为不同的纲，比如在动物门下面有哺乳动物纲、鸟纲、爬行动物纲等。
目是微生物分类的下一个级别，目是对纲下面的一类微生物进行划分。
在每个纲下面都可以进一步划分为不同的目，比如在哺乳动物纲下面有灵长目、食肉目、鲸目等。
科是微生物分类的下一个级别，科是对目下面的一类微生物进行划分。
在每个目下面都可以进一步划分为不同的科，比如在灵长目下面有人科、猿科、猴科等。
属是微生物分类的下一个级别，属是对科下面的一类微生物进行划分。
微生物的分类与命名微生物是指以肉眼不可见的微小形态存在的生物体，包括细菌、真菌、病毒等多种类型。
对微生物进行分类与命名是为了方便对其进行研究和了解其特性。
本文将介绍微生物的分类与命名，包括细菌、真菌和病毒的分类方法及相应的命名规范。
一、细菌的分类与命名细菌是最常见的一类微生物，广泛存在于自然环境中。
细菌的分类主要基于形态、生理特性、生长条件、代谢方式等多个方面。
1. 形态分类根据细菌的形态特征，可以将其分为球菌（cocci）、杆菌（bacilli）、弧菌（vibrios）、螺旋菌（spirilla）等类型。
其中，球菌为球状或椭圆状，杆菌为长形或短杆状，弧菌为弧形，螺旋菌为螺旋形。
2. 生理特性分类细菌的生理特性也是分类的重要指标之一。
比如，光合细菌（photosynthetic bacteria）能利用光合作用合成有机物质，厌氧细菌（anaerobic bacteria）能在缺氧条件下生存和繁殖。
3. 生长条件分类根据细菌的生长条件不同，可以将其分为嗜热菌（thermophile）、嗜酸菌（acidophile）、嗜盐菌（halophile）等类型。
嗜热菌适应高温环境，嗜酸菌适应酸性环境，嗜盐菌适应高盐浓度环境。
细菌的命名通常遵循国际细菌命名法规定的规范。
该规范要求使用拉丁文或拉丁化的词根作为细菌的属名（genus），并加上表征特定种类的表名（specific epithet）。
例如，大肠杆菌（Escherichia coli）中，“Escherichia”为属名，“coli”为表名。
二、真菌的分类与命名真菌是一类具有真核细胞结构的微生物，包括酵母菌和霉菌等。
真菌根据其生活方式、营养特性和菌丝形态等进行分类。
1. 营养分类真菌的营养方式主要分为 saprophytes（腐生菌）和 parasites（寄生菌）。
腐生菌通过分解死物质为自己提供营养，寄生菌则寄生于其他寄主生物体上。
2. 菌丝形态分类真菌的菌丝形态也是分类的依据之一。
微生物分类学（microbial taxonomy）是一门按微生物的等级关系把它们安排成条理清楚的各种分类单元或分类群（taxon）的科学。
它具体的任务有三即分类（classificontion）、鉴定（indentification）和命名（namendature）微生物的分类单位。
一、种以上的分类单位(一)七级分类单位1、界（kingdom）（拉：Regnum）2、门（Phylum）（拉：Phylum）或Division（拉：Divisio）3、纲（class）（拉：classis）4、目（order）（拉：order）5、科（Family）（拉：Family）6、属（Genus）（拉：Genus）7、种（Species）（拉：Species）(二)种的概念1、亚种（Subspecies, subsp., SSP.）2、变种（Variety, Var.）(三)型（form）(四)类群（group）(五)菌株（strain）(六)学名：按照《国际的菌命名法规》命名，国际学术具公认并通用的正式名字。
命名原则：双名法，由瑞典林奈氏（Linnaeus）提出的。
即：学名=属名+种名+首次定名人+现名定名人+定名年份。
1、属名：拉丁词、希腊词或拉丁化学的其它外来词所构成为名词。
表示该属的特征；有时可用人或地名。
2、种名：拉丁语中的形容词，也可用人名或地名表示。
3、亚种或多种：属名+种名+subsp或Var.+ 种（或复种）的加词。
4、某属中一个种或几个种时，属后加sp.或SPP. 微生物的分类系统。
二、原核生物分类系统（细菌、放线菌、蓝细菌，支原体、衣原体、立克次氏体等）《伯杰氏细菌鉴定手册》（Bergey’s Manual of Determinative Bacteriology）（1923-1974的1-8版）《伯杰氏系统细菌学手册》（Bergey’s Manual of systematic Bocteriology, 1984）三、真菌的分类系统（酵母菌、霉菌、食用真菌、原生动物、薄类等）Ainswerth(1973)的分类系统。
一、通用分类单元七级分类单元：界(kingdom)、门(phylum)、纲(class)、目(order)、科(family)、属(genus)、种(species)；必要时可在两级之间添加辅助单元，如亚门。
这七级分类单元的第一个字母必须大写，而且整个名称用正体字表示。
&例：子囊菌纲 Ascomycetes种：一个基本分类单位，是一大群表型特征高度相似、亲缘关系极其接近、与同属内其他种有着明显差异的菌株的总称。
新种：sp. Nov. 或 nov. sp.是species novel 的缩写，附在学名后。
二、学名俗名：普通的、通俗的、地区性的名字。
&例：用“结核杆菌”表示“结核分枝杆菌”。
学名：一个菌种的科学名称，是按照《国际细菌命名法则》命名的，国际学术界公认并通用的正式名字。
学名的命名：采用“双名制”的国际植物命名法则。
“双名制”是瑞典植物学家林奈（Linneaus）于1953年介绍的植物命名原则，该方法已广泛用于植物、动物、微生物的命名。
“双名制”是用两个拉丁文或拉丁化的其他文字组成的一个学名。
三、学名的命名方法学名由属名和种名组成，书写时：属名+种名；翻译时，种名在前，属名在后；印刷时，学名用斜体字；书写时，在学名下加一横线表示斜体字母。
&例：Aspergillusniger 或Aspergillus niger属名（曲霉）种名（黑）前后有两个或数个学名排在一起时，在属名相同的情况下，后一学名中的属名可缩写成一个大写字母加一句号的形式。
&例1：Bacillus（芽孢杆菌属）可缩写成B.&例2：若可能产生混淆，也可写成二至三个字母，如：Bac.属名：表示微生物的主要形态特征、生理特征或以研究者的人名表示。
单数，字首大写。
&例1：根霉属、毛霉属——形态特征&例2：丙酸杆菌属、乳酸杆菌属——生理特征+形态特征&例3：沙门氏杆菌属——研究者的人名 + 形态特征种名：说明微生物的颜色、形状、用途，有时用人名、地名、微生物寄生的宿主名称和致病的性质来表示。
环境工程微生物第一章绪论1、微生物的分类单位：从大到小，按界门纲目科属种等分类。
2、微生物的命名方法：二名法，即用两个拉丁文命名一个微生物的种。
这个种的名称由一个属名和一个种名组成。
（如枯草芽孢杆菌的名称是Bacillus subtilis Cohn 1872、变种Var（Variety））3、微生物的特点：✧体积微小，结构简单（多以μm表示，病毒以nm表示）；✧种类多、分类广（利用该特点，可以使处理系统中的污染物得以迅速降解）；✧代谢类型多，代谢强度大；✧繁殖快，数量多（我们可以将适合于处理各种污染物的微生物加以快速繁殖、增殖，使之达到所需的数量或浓度）；✧变异性强。
第二章环境中常见的微生物类群1、环境微生物三大类群：原核微生物、真核微生物、非细胞结构的病毒（看表2-1）2、原核微生物特点：由单细胞组成，仅有原始核和裸露的DNA，无核膜和核仁，没有与细胞器。
3、细菌四种基本形态：✧球状：直径0.5~2μm；✧杆状：长1~5μm、宽0.5~1μm；✧螺旋状：长5-50μm 、宽0.5~5μm；✧丝状。
影响细菌大小因素：菌龄、环境渗透压、代谢产物的积累、pH等。
4、细菌的基本结构、结构组成、功能基本结构：细胞壁、细胞膜、细胞质、核质体。
特殊结构：荚膜、鞭毛、菌毛、芽孢。
✧细胞壁：在体表最外层，坚韧而带有弹性的薄膜，主要成分为肽聚糖。
功能：①维持细菌的细胞形态；②保护原生质体免受渗透裂解；③阻止大分子物质进入细胞；④为鞭毛提供支点，使鞭毛运动。
革兰染色：革兰氏阳性菌（G+）-紫色，革兰氏阴性菌（G-）-红色（见图2-3）。
✧细胞膜：紧贴在细胞壁内侧，富有弹性的半透性薄膜，主要由磷脂和蛋白质组成。
形成磷脂双分子层。
功能：①控制细胞内外营养物质和代谢产物的运送和交换；②维持细胞内正常渗透压；③合成细胞壁和荚膜的场所；④进行氧化磷酸化或光合磷酸化的产能基地；⑤鞭毛的着生和生长点。
✧细胞质（原生质）及其内含物：细胞质：由蛋白质、核酸、多糖、脂类、无机盐和水组成。
微生物的分类单位及命名
1．微生物的分类单位
传统的微生物分类是按界、门、纲、目、科、属、种分类。
有的在科属之间分族，或在属下分亚属。
(1)种(species)种是微生物分类中最基本的分类单位，是微生物进化的特定阶段。
种代表一群在形态上、生理特性和组成成分上彼此十分相似或彼此性状差异微小的个体。
同
种的生物体由于环境条件的变化，从而在生态特征、生理特性方面发生了一些极微小的差异。
但是他们总的特性还是一致的。
(2)变种(varieties或缩写成var) 变种即同一菌种之间有一定差异的一群个体。
凡一个微生物的某种特性出现了明显改变，与“典型种”所描述的某一特性不同，而其余特性义完全符合，若这一变异特性又是较稳定的，则这种变异了的菌种称变种。
例如有一种芽孢杆菌，除了在酪氨酸培养基上产生黑色素这一特性不同于典型的枯草芽孢杆菌(上bacillus sub-tilis)外，其余特性完全符合。
那么这种芽孢杆菌，即称为枯草芽孢杆菌黑色变种(Bacillus sub-tilis uar．niger)。
(3)小种或亚种(subspecies) 微生物学中把实验室所获得的变异型称为小种或亚种。
例如大肠杆菌(E.coli)野生型的一个品系“K12”，“K12”是不需要某种氨基酸的，通过实验室人工诱变•可以从Kl!中获得必需某种氨基酸的营养缺陷型，这种缺陷型菌种称为Kt 2的亚种或(营养)小种。
(4)型(types) “型”常被用于变种以下的细分类。
在同一种的若干细菌中，他们之间有许多特性难以区分，要区分他们仅反映在某种特殊的形状上。
如根据抗原结构不同可分为不同血清型。
对噬菌体或细菌素敏感性的不同，可分成多种噬菌体型或细菌素型。
(5)菌株或品系(strains) 是指不同来源的相同种(或型)。
因此，从自然界中分离到的每一个微生物纯粹培养都可以称为一个菌株和品系。
为方便起见，菌株常用数字、地名或符号来表示。
例如生产蛋白酶的是枯草杆菌1398，而生产淀粉酶的是枯草杆菌7628。
(6)群(group) 微生物在进化过程中，由一个种变成另外一个种，期间要产生一--系列的过渡类型•所以自然界中有些微生物种类的特征介于两种微生物之间．彼此之间难以严格区分开来，这两种微生物和介于它们之间的种类统称为
4"群”。
如大肠杆菌和产气杆菌两个种的区别是明显的，但自然界还存在着许多介于这两种细菌之间的中间类型，人们就把大肠杆菌和产气杆菌以及介于他们之间的中间类型统称为大肠杆菌群。
2．微生物命名法
微生物的名称有两种：一种是俗名或代号；另一种为学名，即国际名称。
前者反映了同一种微生物在不同地区或国家有不同的名字，即使在同一国家也可以有许多不同的名字，因此，极易造成混乱，不利于国际学术的交流。
而后者是国际统一采用的。
他是按瑞典生物学家林耐(Linnaeus)于1953年所创立的“双名法”(属名在前，种名在后)来定名的。
由两个拉丁字或希腊字或者托丁化的其他文字组成。
有时在种名后还附有命名者的姓，用以消除出现“同物异名”或“同名异物”之类的误解。
属名是拉丁字的名词．字首字母要大写．用以描述微生物的主要特征。
种名用的是一个拉丁字形容词或名称所有格，用以描述次要特征．但有时属名或种名也用人名或地名表示。
在学名之后有时还要附命名人的姓和年代。
如金黄色葡萄球菌的学名Staphylococcus aureus Rosenbach1939。
Staphylococcus是属名，即葡萄球菌属，“ aureus”一是一个拉丁字的形容词，是金黄色的意思，Rosenbach是命名人的姓。
有时只泛指某一属的微生物而不是特指某一具体种或没有种名时，可在属名后面加sp．(species的单数)或spp．(复数)表示。
如果当初所定的学名，后来经人改过．则在学名后括号内注明首先发现该菌的人．然后将改正人的姓写在后面。
如：枯草(芽孢)杆菌应写为Bacillus subyilis(Ehrenbery)Cohn1872.。
为了简明，一般允许只写学名而将人名、年代省略。
在印刷时，属及以下学名要用斜体字。
